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当前共找到 38417 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 321 | 2026-04-13 |
Deacetylation of PRDX1 contributes to alleviating acute liver injury through Dihydromyricetin-mediated SIRT1 upregulation
2026-Apr-04, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158160
PMID:41966029
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研究论文 | 本研究探讨了天然黄酮类化合物二氢杨梅素通过上调SIRT1，进而去乙酰化PRDX1，从而缓解急性肝损伤的分子机制 | 首次通过定量乙酰化组学与单细胞RNA测序相结合的方法，揭示了DMY通过SIRT1-PRDX1轴调控巨噬细胞极化，从而发挥肝保护作用的免疫调节新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，其结论在人体中的普适性仍需进一步临床验证 | 阐明二氢杨梅素在急性肝损伤中的肝保护功效及其从氧化应激到炎症反应的免疫调节机制 | d-半乳糖胺/脂多糖诱导的小鼠急性肝损伤模型、巨噬细胞系 | NA | 急性肝损伤 | 定量乙酰化组学分析，单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 322 | 2026-04-13 |
Depletion of Fibrinogen Suppresses Growth of Primary Tumors and Metastasis of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2026-Apr, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.09.024
PMID:41432649
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研究论文 | 本文研究了纤维蛋白原在胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤生长和转移中的作用，通过临床测试中的技术平台（反义寡核苷酸或含小干扰RNA的脂质纳米颗粒）在PDAC患者来源的异种移植模型中耗竭纤维蛋白原，并监测肿瘤生长和转移 | 首次在PDAC模型中利用临床测试中的技术平台（如反义寡核苷酸或siRNA脂质纳米颗粒）耗竭纤维蛋白原，并系统评估其对原发肿瘤生长和转移的影响，结合蛋白质组学和空间转录组学揭示其机制 | 研究未涉及纤维蛋白原耗竭对晚期转移阶段（如肝定植）的影响，且模型可能不完全反映人类PDAC的复杂性 | 探究纤维蛋白原在PDAC肿瘤进展和转移中的作用，评估靶向纤维蛋白原作为临床治疗策略的潜力 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者来源的异种移植模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | 3个PDAC患者来源的异种移植模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 323 | 2026-04-13 |
ENPP1-Regulated Extracellular Purine Metabolism Drives Pancreatitis-Mediated Pancreatic Cancer
2026-Apr, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.09.032
PMID:41553309
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了ENPP1调控的细胞外嘌呤代谢在胰腺炎介导的胰腺癌发生中的关键作用 | 首次将ENPP1调控的细胞外嘌呤代谢与胰腺炎向胰腺癌转化联系起来，并阐明其通过激活胰腺星状细胞和招募免疫抑制细胞促进肿瘤发生的机制 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本，临床转化仍需进一步验证 | 探究胰腺炎促进胰腺癌发生的分子机制 | 慢性胰腺炎患者和胰腺炎相关胰腺癌患者样本，以及基因工程小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞测序 | NA | 多组学数据 | 人类胰腺样本和小鼠模型组织 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 324 | 2026-04-13 |
NK Cell Activation by Platinum Boosts Immunotherapy in HR+/HER2- Breast Cancer
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518978
PMID:41691453
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研究论文 | 本研究通过大规模多组学和单细胞RNA测序揭示了NK细胞在HR+/HER2-乳腺癌中对免疫治疗反应的关键作用，并发现铂类药物通过增强NK细胞毒性来提升免疫治疗效果 | 首次在HR+/HER2-乳腺癌中系统阐明NK细胞介导免疫治疗反应的机制，并发现铂类药物通过NF-κB通路增强NK细胞功能的新协同作用 | 临床队列分析样本量有限，铂类药物增强NK细胞的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究HR+/HER2-乳腺癌中免疫治疗响应机制及增效策略 | HR+/HER2-乳腺癌肿瘤微环境中的NK细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据，临床队列数据 | 临床队列样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 325 | 2026-04-13 |
Single-Cell Analysis of Chemotherapy-induced Remodeling Reveals CD276-driven Basal-like Chemoresistance in Pancreatic Cancer
2026-Apr, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.09.043
PMID:41701125
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胰腺癌化疗前后肿瘤细胞可塑性和肿瘤微环境的重塑，揭示了CD276/B7-H3在驱动基底样化疗耐药中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率上表征了化疗诱导的恶性状态和免疫微环境的动态重塑，并识别出由SNCG+基底样肿瘤细胞、SPP1+肿瘤相关巨噬细胞和耗竭T细胞组成的化疗耐药生态位，同时发现CD276/B7-H3作为双重功能免疫检查点 | 样本量相对有限（28例患者），且研究主要基于特定化疗方案（abraxane加吉西他滨），可能不适用于其他治疗方案 | 探究化疗如何重塑胰腺导管腺癌的肿瘤细胞可塑性和肿瘤微环境，以影响临床结局 | 胰腺导管腺癌患者（28例）的配对治疗前后肿瘤活检样本和外周血单个核细胞，以及KPC小鼠模型和裸鼠异种移植瘤 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光，空间转录组学，CRISPR-Cas9敲除，肿瘤杀伤实验 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组学数据，免疫荧光图像 | 28例胰腺导管腺癌患者的配对样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10X Visium HD | 10X Visium HD空间转录组学平台，分辨率达2微米 |
| 326 | 2026-04-13 |
Overcoming CXCR4-Mediated T-Cell Exclusion Potentiates Antitumor Cytotoxicity in Fibrolamellar Carcinoma
2026-Apr, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.10.006
PMID:41701126
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研究论文 | 本研究探讨了纤维板层肝细胞癌中CXCR4介导的T细胞排斥如何限制抗肿瘤免疫，并通过联合CXCR4和PD-1阻断在人类肿瘤切片培养模型中增强抗肿瘤细胞毒性 | 首次在纤维板层肝细胞癌中利用单核RNA测序和肿瘤切片培养系统揭示CXCL12+肌成纤维细胞与CXCR4+淋巴细胞间的相互作用是T细胞排斥的关键机制，并证明联合CXCR4和PD-1阻断能协同克服免疫抵抗 | 研究基于人类肿瘤切片培养模型，可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性；样本量可能受限于这种罕见癌症的稀缺性 | 探究纤维板层肝细胞癌对免疫疗法缺乏反应的机制，并开发有效的联合免疫治疗策略 | 纤维板层肝细胞癌患者的肿瘤组织及肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 单核RNA测序, 多重免疫组织化学, 活体成像, 单细胞测序, 空间蛋白质组学 | 人类肿瘤切片培养模型 | RNA测序数据, 图像数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 单细胞测序, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 327 | 2026-04-13 |
Using cell-specific late-phase asthma mRNA biomarkers to repurpose drugs that concurrently reverse disease signatures across multiple immune cell-types
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014081
PMID:41931526
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研究论文 | 本研究利用过敏原诱导的晚期哮喘反应（LAR）mRNA生物标志物，预测哮喘急性发作和严重程度，并通过单细胞RNA测序分析细胞特异性变化，识别潜在治疗药物 | 结合基线血液mRNA生物标志物与LAR相关标志物，形成109个LAR-mRNA生物标志物组合，首次在多个公共基因表达数据集中验证其预测能力，并利用单细胞扰动数据集进行药物签名匹配，识别出能逆转细胞特异性转录变化的化合物 | 生物标志物在男性中的预测性能优于女性，且样本主要来自轻度过敏性哮喘患者，可能无法完全代表所有哮喘亚型 | 研究晚期哮喘反应（LAR）的mRNA生物标志物在预测哮喘急性发作和严重程度中的作用，并探索潜在的治疗策略 | 轻度过敏性哮喘患者，以及公共基因表达数据集中的血液、气道、支气管肺泡灌洗液（BALF）和诱导痰样本 | 自然语言处理 | 哮喘 | mRNA基因表达分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | mRNA表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 328 | 2026-04-13 |
Integrative Single-Cell and Machine Learning Analysis Identifies an EMT-Associated Prognostic Signature for Papillary Thyroid Cancer
2026-Apr, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71766
PMID:41957879
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习分析，识别了与上皮-间质转化相关的八个预后基因，并构建了用于甲状腺乳头状癌预后评估的风险模型 | 首次将单细胞RNA测序与101种机器学习算法组合相结合，系统识别甲状腺乳头状癌中与上皮-间质转化相关的预后基因，并构建了综合性的预后风险模型 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，缺乏体内实验和更大规模的前瞻性临床队列验证 | 探究甲状腺乳头状癌中上皮-间质转化的分子机制，并开发预后评估的生物标志物 | 甲状腺乳头状癌患者组织样本和正常甲状腺组织 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型和多种机器学习算法组合 | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量，涉及内部验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 329 | 2026-04-13 |
The Mechanism of Gut Microbiota in Breast Cancer Based on the Bulk Transcriptome, Mendelian Randomization Analysis and Single Cell RNA Sequencing
2026-Apr, MicrobiologyOpen
IF:3.9Q2
DOI:10.1002/mbo3.70284
PMID:41960682
|
研究论文 | 本研究通过整合批量转录组、孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序，揭示了肠道微生物群在乳腺癌发病机制中的作用机制，并识别出MCM6和NR3C1作为生物标志物 | 首次将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合，重新定义乳腺癌为微生物群调控的网络，并识别出MCM6/NR3C1生物标志物对用于早期诊断和微生物靶向干预 | 研究依赖于公共数据集，可能受样本异质性限制；孟德尔随机化分析假设需进一步验证；单细胞RNA测序数据可能未覆盖所有细胞类型 | 阐明肠道微生物群在乳腺癌发病机制中的具体作用机制，并寻找早期诊断生物标志物 | 乳腺癌患者与对照样本的转录组数据、肠道微生物群全基因组关联研究数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 批量转录组分析、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、基因集富集分析、免疫浸润分析、药物筛选与分子对接 | 机器学习 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 330 | 2026-04-13 |
Enhanced endocrine-metabolic support and axonemal assembly in high-sperm-motility geese: insights from testicular cellular heterogeneity by scRNA-seq
2026-Mar-21, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106840
PMID:41916058
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了高精子活力鹅睾丸细胞异质性，并发现其与增强的内分泌-代谢支持及轴丝组装程序相关 | 首次在鹅中应用单细胞RNA测序技术，系统解析了精子活力差异的睾丸细胞分子基础，并关联了内分泌、代谢与精子结构成熟过程 | 样本量较小（每组仅3只鹅用于单细胞测序），且研究仅针对早期成熟公鹅，未涵盖其他发育阶段或品种 | 探究鹅精子活力差异的细胞与分子机制 | 高精子活力与低精子活力的公鹅 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 60只公鹅（筛选后高、低活力组各6只，其中每组3只用于单细胞测序） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 331 | 2026-04-13 |
Spatial and cellular composition of lung fibrosis induced by multi-walled carbon nanotubes
2026-Mar-04, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04135-5
PMID:41782027
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探究了多壁碳纳米管暴露如何通过Slamf7介导的巨噬细胞超活化诱导肺纤维化，并揭示了其对肠道稳态的影响 | 首次整合空间转录组学、代谢组学和微生物组学，系统揭示了吸入多壁碳纳米管通过Slamf7-Slamf7相互作用驱动巨噬细胞超活化的分子机制，为中医肺-肠相关理论提供了现代生物学证据 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证；机制研究主要集中于巨噬细胞，其他免疫细胞的作用可能未完全阐明 | 探究多壁碳纳米管暴露对肺免疫反应和肠道稳态的影响机制 | 小鼠肺组织和肠道组织 | 空间转录组学 | 肺纤维化 | 空间转录组学, mRNA-seq, 代谢组学, 16S rRNA微生物组分析, 体外验证 | NA | 空间转录组数据, RNA-seq数据, 代谢组数据, 微生物组数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学, 批量RNA测序, 代谢组学, 微生物组分析 | NA | NA |
| 332 | 2026-04-13 |
iAODE for benchmarking and continuum modeling of single-cell chromatin accessibility
2026-Mar-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09768-8
PMID:41775921
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为iAODE的变分自编码器，用于单细胞染色质可及性数据的基准测试和连续建模，以学习生成性、时间连续的潜在空间 | iAODE结合了零膨胀负二项似然、潜在神经ODE、低权重KL正则化和可解释重构瓶颈，首次在模型中编码时间连续性并提供针对性度量标准 | NA | 开发一种用于单细胞染色质可及性数据维度降维和轨迹分析的方法，以优化连续发育轨迹的建模 | 单细胞染色质可及性数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq | 变分自编码器, 神经ODE | 单细胞测序数据 | 248个scATAC-seq数据集和123个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 333 | 2026-04-13 |
Pharmacological stabilization of hypoxia-inducible factor 1-α dampens the interferon response and promotes glycolysis in Aicardi-Goutières syndrome
2026-Mar-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69979-9
PMID:41776196
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和靶向代谢组学分析Aicardi-Goutières综合征患者外周血样本，揭示HIF-1α表达缺失导致代谢转换，并通过药物稳定HIF-1α逆转代谢异常并减轻炎症反应 | 首次在Aicardi-Goutières综合征中结合单细胞转录组学与代谢组学，识别HIF-1α介导的代谢转换机制，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外细胞模型，缺乏体内实验验证；样本量可能有限，且未涵盖所有AGS突变类型 | 探究Aicardi-Goutières综合征中代谢异常与慢性炎症的关联，并评估靶向HIF-1α的治疗策略 | 携带ADAR1、RNASEH2B或SAMHD1突变的Aicardi-Goutières综合征患者外周血样本及体外细胞模型 | 单细胞组学 | 遗传性自身免疫性疾病 | 单细胞转录组学，靶向代谢组学，机器学习，差异基因表达分析 | 机器学习方法 | 单细胞RNA-seq数据，代谢物数据 | AGS患者外周血样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 334 | 2026-04-13 |
Epitope-spanning antigenic variation reprograms immunodominance and broadens immunity in sequential influenza vaccination
2026-Mar-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70202-y
PMID:41771913
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研究论文 | 本研究探讨了通过靶向改变流感疫苗中的多个血凝素头部位点来重塑表位层级，从而增强免疫应答的广度和保护效果 | 提出“表位层级重塑”概念，通过靶向抗原变异重编程免疫优势，引导回忆应答转向保守表位，并首次在雪貂模型中验证其对中和抗体诱导、交叉保护及病毒脱落的改善作用 | 研究基于雪貂模型，其在人类中的直接适用性需进一步验证；且主要针对A(H3N2)流感病毒，对其他快速进化病毒的普适性有待探索 | 研究如何通过靶向抗原变异克服免疫印记限制，以增强流感疫苗的广谱性和持久性保护 | A(H3N2)流感病毒的血凝素（HA）蛋白及其在雪貂模型中的免疫应答 | 免疫学 | 流感 | 表位作图、结构分析、单细胞转录组学、ELISpot检测 | NA | 生物分子数据、转录组数据、免疫学数据 | 雪貂模型（具体数量未在摘要中说明） | NA | NA | NA | NA |
| 335 | 2026-04-13 |
M[Formula: see text]DGAT: Multi-view multi-scale dynamic graph attention network(GAT) based prediction of Parkinson's disease(PD) progression using whole-blood RNA sequencing data
2026-Mar-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-40636-x
PMID:41771960
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研究论文 | 本文提出了一种基于全血RNA测序数据的多视图多尺度动态图注意力网络（M[Formula: see text]DGAT），用于预测帕金森病的疾病进展轨迹 | 该方法整合了时空视图，通过计数草图双线性融合策略构建联合视图表示，并利用动态图注意力网络（DGAT）作为主干，相比静态图能更好地编码疾病进展的动态信息 | 仅基于全血RNA测序数据，可能未充分利用其他生物标志物或临床信息；方法在复杂人脑疾病分析中的通用性有待进一步验证 | 预测帕金森病（PD）等神经退行性疾病的疾病进展轨迹 | 人类全血样本的RNA测序数据 | 机器学习 | 帕金森病 | RNA测序 | 动态图注意力网络（DGAT） | RNA测序数据 | PPMI和PDBP队列的样本（具体数量未在摘要中提供） | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 336 | 2026-04-13 |
A benchmark of semi-supervised scRNA-seq integration methods in real-world scenarios
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014008
PMID:41838767
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研究论文 | 本文系统性地比较了半监督与无监督单细胞RNA-seq整合方法在真实世界场景下的性能 | 首次在真实条件下系统性地基准测试半监督单细胞RNA-seq整合方法，并考虑了多种不完美标签场景 | 研究仅基于六个数据集，且半监督方法在标签质量不确定时优势有限 | 评估半监督单细胞RNA-seq整合方法在真实世界场景中的性能和鲁棒性 | 单细胞RNA-seq数据整合方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | scANVI, ssSTACAS | 单细胞RNA-seq数据 | 六个多样化数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 337 | 2026-04-13 |
Role of CTGF-LRP1 in impaired healing of cesarean section incisions
2026-Feb-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69747-9
PMID:41764198
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了剖宫产切口愈合不良（niche）的细胞微环境，揭示了LRP1缺陷在成纤维细胞中的作用及其与细胞外基质合成减少的关联 | 首次在单细胞水平上剖析了剖宫产切口愈合不良的微环境，并确定了LRP1缺陷在成纤维细胞中的关键作用，以及CTGF-LRP1轴通过ERK和WNT信号通路影响愈合的机制 | 研究样本量相对有限，且主要基于观察性数据和动物模型，需要进一步临床验证 | 探究剖宫产切口愈合不良（niche）的发病机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 剖宫产切口愈合不良（niche）组织、邻近子宫肌层组织以及愈合良好的剖宫产瘢痕组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 135,793个单细胞（来自48,587个邻近组织细胞、47,653个对照组细胞和39,553个niche组织细胞），以及60个组织样本（30个非愈合组和30个愈合组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 338 | 2026-04-13 |
BrainConnect: processing brain connectivity and spatial transcriptomics data for integrative analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag120
PMID:41808453
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研究论文 | 开发了一个名为BrainConnect的软件，用于处理小鼠大脑连接数据和空间转录组学数据，以进行整合分析并预测连接强度 | 首次提出一个方法，将不同类型的大脑连接数据与空间转录组学数据在一致的大脑区域格式下处理，利用LSTM网络从空间转录组学预测连接强度，并识别潜在的重要基因 | 方法目前仅应用于小鼠大脑数据，未在其他物种或更广泛的数据集上验证 | 整合大脑连接数据和空间转录组学数据，以预测和理解大脑连接性及其分子基础 | 小鼠大脑连接数据和空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | LSTM | 空间转录组学数据和大脑连接数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 339 | 2026-04-13 |
A tumor-promoting inflammatory SPP1+ macrophage-IL-6-CRP axis drives immune dysfunction in bladder cancer
2026-Feb-27, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1774
PMID:41747249
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研究论文 | 本研究揭示了膀胱癌中SPP1+巨噬细胞通过IL-6-CRP轴驱动免疫功能障碍的机制 | 首次将系统性炎症标志物（血浆IL-6和CRP）与肿瘤微环境中SPP1+巨噬细胞的免疫抑制功能联系起来，并定义了与免疫检查点阻断耐药相关的巨噬细胞驱动轴 | 未明确说明样本的具体数量或来源细节，且机制研究可能需进一步体内验证 | 探究膀胱癌中炎症如何通过巨噬细胞介导免疫功能障碍和免疫治疗耐药 | 膀胱癌（尿路上皮癌）患者及其肿瘤微环境中的巨噬细胞和T细胞 | 单细胞组学与空间转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，空间分析 | NA | RNA测序数据，空间转录组数据 | 多个免疫检查点阻断治疗队列的患者样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 340 | 2026-04-13 |
Reconstructing single-cell resolution from spatial transcriptomics with CellRefiner
2026-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70090-2
PMID:41760664
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellRefiner的物理模型方法，通过整合单细胞数据集与配对的空间数据集，在空间数据中重建单细胞分辨率 | CellRefiner创新性地将细胞建模为通过力连接的粒子，并利用空间邻近约束、基因表达相似性和细胞间配体-受体相互作用来优化细胞位置，从而从非单细胞分辨率空间数据中恢复单细胞分辨率 | NA | 开发一种方法以从空间转录组数据中重建单细胞分辨率，以支持需要个体细胞分辨率和空间信息的下游分析 | 空间转录组数据，包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据集，以及小鼠皮层和淋巴结组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 物理模型 | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 多种模拟和真实数据集，包括Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2和STARmap数据集，以及小鼠皮层和淋巴结组织 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组平台，用于生成空间数据集 |