单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-10-05 |
Single-cell multi-omics analysis reveals the mechanism of action of a novel antioxidant polyphenol nanoparticle loaded with STAT3 agonist in mediating cardiomyocyte ferroptosis to ameliorate age-related heart failure
2025-Mar-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03317-x
PMID:40158134
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析探讨了负载STAT3激动剂的抗氧化多酚纳米颗粒通过调控心肌细胞铁死亡改善年龄相关性心力衰竭的作用机制 | 开发了新型抗氧化多酚纳米颗粒PN@Col，首次结合单细胞多组学分析揭示其通过STAT3通路调控心肌细胞铁死亡的作用机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验，尚未进行临床试验验证 | 探究新型纳米颗粒PN@Col在年龄相关性心力衰竭治疗中的作用机制 | 心肌细胞、老年心力衰竭小鼠模型 | 单细胞多组学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序、AUCell分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年心力衰竭小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 322 | 2025-10-05 |
Chronic inflammation deters natural killer cell fitness and cytotoxicity in myeloid leukemia
2025-Feb-25, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014592
PMID:39571169
|
研究论文 | 本研究探讨慢性炎症如何通过TNFα信号通路损害自然杀伤细胞功能，从而影响慢性髓系白血病的免疫监视 | 首次在CML模型中系统揭示TNFα诱导的炎症信号通过上调Cish等检查点基因抑制NK细胞功能的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限，需要进一步临床研究确认治疗潜力 | 阐明慢性髓系白血病微环境中NK细胞功能受损的分子机制 | 慢性髓系白血病小鼠模型、健康供体NK细胞、CML患者样本 | 免疫学 | 慢性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、体外功能实验 | 嵌合BCR::ABL1+ CML小鼠模型 | 基因表达数据、功能实验数据 | CML小鼠模型、健康供体NK细胞、未治疗CML患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 323 | 2025-10-05 |
Identifying differentiation markers between dermal fibroblasts and adipose-derived mesenchymal stromal cells (AD-MSCs) in human visceral and subcutaneous tissues using single-cell transcriptomics
2025-Feb-11, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04185-w
PMID:39934849
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学鉴定人内脏和皮下组织中真皮成纤维细胞与脂肪来源间充质基质细胞的区分标志物 | 首次使用单细胞RNA测序技术在同一供体的不同组织中系统比较AD-MSCs和成纤维细胞的转录组差异 | 样本来源相对有限，所有组织样本来自同一批供体 | 鉴定能够区分脂肪来源间充质基质细胞和成纤维细胞的分子标志物 | 人皮下和内脏脂肪组织中的AD-MSCs以及皮肤成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 定量PCR | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, qPCR数据 | 来自同一供体的皮下脂肪组织、内脏脂肪组织和皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 324 | 2025-10-05 |
Mechanism of enhancing chemotherapy efficacy in pancreatic ductal adenocarcinoma with paricalcitol and hydroxychloroquine
2025-Jan-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101881
PMID:39730001
|
研究论文 | 本研究探讨帕立骨化醇和羟氯喹联合治疗增强胰腺导管腺癌化疗效果的分子机制 | 首次揭示帕立骨化醇和羟氯喹联合吉西他滨通过调节自噬和ER应激通路增强胰腺癌化疗敏感性的机制 | 研究样本量有限，需要更大规模的临床试验验证 | 阐明帕立骨化醇和羟氯喹联合治疗增强胰腺导管腺癌对吉西他滨化疗敏感性的分子机制 | 胰腺导管腺癌细胞、原位小鼠模型、患者来源异种移植模型和临床试验患者样本 | 肿瘤学研究 | 胰腺癌 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、细胞表型数据 | 体外细胞模型、动物模型和临床试验配对活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 325 | 2025-10-05 |
Function value of basement membrane-related genes in odontogenic keratocyst by bioinformatics analysis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1658125
PMID:41018070
|
研究论文 | 通过生物信息学分析基底膜相关基因在牙源性角化囊肿中的功能价值 | 首次通过单细胞RNA测序定位SPARC基因在牙源性角化囊肿基质成纤维细胞中的特异性高表达，并揭示其与免疫微环境的相互作用 | 样本量较小（12例OKC和4例正常对照），需要更大规模研究验证 | 探讨基底膜相关基因在牙源性角化囊肿发病机制中的作用 | 牙源性角化囊肿组织和正常口腔黏膜组织 | 生物信息学 | 牙源性角化囊肿 | 转录组测序，单细胞RNA测序，免疫组织化学，免疫荧光 | 生物信息学分析 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 12例非综合征性牙源性角化囊肿和4例正常口腔黏膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 326 | 2025-10-05 |
GADD45G as a novel prognostic biomarker and therapeutic target in glioma: integrative analysis of bulk and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1608710
PMID:41018072
|
研究论文 | 本研究通过整合分析bulk和单细胞RNA测序数据，探讨GADD45G在胶质瘤中的预后价值及其作为治疗靶点的潜力 | 首次系统性地整合多组学数据揭示GADD45G在胶质瘤中的预后价值，并通过单细胞分辨率分析其在胶质母细胞瘤细胞亚群中的表达模式 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证GADD45G的具体作用机制 | 探索GADD45G在胶质瘤中的预后意义和治疗潜力 | 胶质瘤患者样本和胶质瘤细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, Western blot | Cox回归模型, Kaplan-Meier生存分析, Spearman相关分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA、TARGET、GTEx、CGGA和GEO等多个数据库的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 327 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA profiling of colorectal granular-type laterally spreading tumor uncovers progression trajectory toward carcinoma and transcriptional signatures favoring lateral morphogenesis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1552841
PMID:41018078
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤的转录特征及其向癌变的进展轨迹 | 首次在单细胞水平揭示LST-Gs的化生分化特征及其与肿瘤进展的关联，发现Arp2/3复合物在高度分化细胞中的显著上调 | 样本量有限，研究主要关注转录组层面，缺乏功能性验证实验 | 阐明结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤的形态发生机制和向癌发展的进化轨迹 | 结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤、突起型腺瘤和正常黏膜组织 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 328 | 2025-10-05 |
Predicting the prognosis of hepatocellular carcinoma based on genes related to polyamine metabolism
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19985
PMID:41018906
|
研究论文 | 基于多胺代谢相关基因构建肝细胞癌预后预测模型 | 首次基于多胺代谢相关基因对肝细胞癌进行分子分型并构建预后预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发肝细胞癌预后预测模型并探索潜在治疗靶点 | 肝细胞癌患者和HuH-7细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, CCK8实验, 伤口愈合实验, Transwell实验 | Cox回归, Lasso回归, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 公共数据库中的肝细胞癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 329 | 2025-10-05 |
Characterization of cancer-related fibroblasts in bladder cancer and construction of CAFs-based bladder cancer classification: insights from single-cell and multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1580986
PMID:41019085
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学分析表征膀胱癌中癌症相关成纤维细胞并构建基于CAFs的膀胱癌分类 | 首次系统鉴定膀胱癌中10个不同的CAF亚群，并建立基于pCAFs的膀胱癌分子分型系统 | 样本量有限，需要进一步实验验证各亚型的临床适用性 | 探索膀胱癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 膀胱癌组织和其中的癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 330 | 2025-10-05 |
PLK2 as a key regulator of glycolysis and immune dysregulation in polycystic ovary syndrome
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610713
PMID:41019094
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，发现PLK2是多囊卵巢综合征中糖酵解和免疫失调的关键调控因子 | 首次将PLK2确立为PCOS中内皮细胞糖酵解的核心调控基因，并揭示其通过NF-κB和IL-17信号通路促进慢性炎症和卵巢纤维化的机制 | 研究主要基于动物模型和生物信息学分析，需要进一步临床验证 | 阐明多囊卵巢综合征中卵巢基质细胞糖酵解失调的分子机制 | 多囊卵巢综合征患者和DHEA诱导的PCOS大鼠模型 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫浸润分析, 功能富集分析 | Seurat, CellChat, CIBERSORT, ESTIMATE, ssGSEA | 基因表达数据 | 三个独立的批量RNA-seq数据集和DHEA诱导的PCOS大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 331 | 2025-10-05 |
A splicing-based multitissue association study of joint transcriptomes identified susceptibility genes for osteoarthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1590008
PMID:41019096
|
研究论文 | 通过跨组织和单组织转录组关联分析结合单细胞测序技术，鉴定骨关节炎易感基因LTBP1及其在软骨细胞分化中的调控作用 | 首次整合跨组织/单组织TWAS分析与单细胞测序数据，系统揭示LTBP1基因通过TGF-β和Notch信号通路参与骨关节炎发病的新机制 | 未明确说明样本规模及具体测序平台技术细节 | 鉴定骨关节炎的易感基因并阐明其功能机制 | 骨关节炎相关遗传位点及LTBP1基因 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞测序, 转录组关联分析(TWAS), 全基因组关联研究(GWAS) | UTMOST, FUSION, MAGMA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 332 | 2025-10-05 |
Spatial and single-cell transcriptomics capture two distinct cell states in soybean defense response to Phakopsora pachyrhizi infection
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1637176
PMID:41019740
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组技术揭示大豆对亚洲大豆锈病病原体感染的两种不同细胞状态及其空间分布模式 | 首次结合空间转录组和单核转录组技术揭示植物免疫反应的空间协调性，发现感染区域与周边区域存在不同的防御反应状态 | 仅针对大豆-Phakopsora pachyrhizi互作系统，其他植物-病原体系统的普适性有待验证 | 解析植物对病原体感染的空间防御反应机制 | 大豆植株及其对Phakopsora pachyrhizi病原体感染的响应 | 植物生物学 | 植物病害 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 基因共表达网络分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 333 | 2025-10-05 |
Dissecting and validation the biomarker of heart failure progression in patients with atherosclerosis by single-cell sequencing, bioinformatics, and machine learning
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1587274
PMID:41019764
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组数据，结合机器学习方法鉴定动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物 | 首次整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，结合三种机器学习算法鉴定CD48作为AS向HF进展的潜在生物标志物 | 研究基于公共数据库数据，需要实验验证；样本来源和数量有限 | 识别动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物及潜在机制 | 动脉粥样硬化患者向心力衰竭进展的转录组数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | LASSO, Random Forest, SVM-RFE | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE28829, GSE57345等)，包含2828个心脏相关基因 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 人类细胞图谱(HCL)平台 |
| 334 | 2025-10-05 |
Widespread transposable element dysregulation in human aging brains with Alzheimer's disease
2024-Nov, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14164
PMID:39356058
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了人类阿尔茨海默病衰老大脑中转座元件的广泛失调，并利用CRISPR干扰实验验证了特定转座元件对炎症基因的调控作用 | 首次在人类阿尔茨海默病衰老大脑中系统鉴定转座元件表达数量性状位点(teQTL)，并通过CRISPRi实验验证了神经元特异性转座元件调控机制 | 研究主要基于三个脑组织生物样本库，样本来源和数量可能存在限制 | 探究人类阿尔茨海默病衰老大脑中转座元件失调的遗传调控机制 | 人类阿尔茨海默病患者的脑组织样本和iPSC来源的神经元 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序,全基因组测序,CRISPR干扰,xQTL分析 | 数量性状位点分析,共定位分析 | 基因组数据,转录组数据 | 三个大型人类AD脑组织生物样本库的样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 335 | 2025-10-05 |
Mouse blood cells types and aging prediction using penalized Latent Dirichlet Allocation
2024-Sep-18, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-024-10763-8
PMID:39294566
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于惩罚性潜在狄利克雷分配(pLDA)的统计方法，用于分析小鼠血液单细胞RNA测序数据以预测细胞类型和衰老状态 | 提出了惩罚性潜在狄利克雷分配(pLDA)这一新型统计方法，用于单细胞RNA测序数据的降维表示学习 | 仅使用小鼠血液数据进行验证，未在其他组织或物种中进行测试 | 开发计算方法来分析单细胞RNA测序数据，以理解衰老过程中的转录组变化 | 小鼠血液细胞 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | 惩罚性潜在狄利克雷分配(pLDA) | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 336 | 2025-10-05 |
scRNA-seq identifies unique macrophage population in murine model of ozone induced asthma exacerbation
2024-Jul-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604740
PMID:39211080
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了臭氧诱导哮喘加重小鼠模型中独特的巨噬细胞群体 | 首次在臭氧诱导哮喘加重模型中鉴定出独特的肺泡巨噬细胞和单核细胞亚群，并揭示了其特异性基因表达通路 | 研究仅限于小鼠模型，结果向人类转化需要进一步验证 | 探究臭氧暴露导致哮喘气道高反应性的免疫细胞机制 | 尘螨、豚草和臭氧暴露的小鼠肺部免疫细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 暴露于DRA、臭氧或DRA+臭氧的小鼠肺部免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 337 | 2025-10-05 |
Comparative single-cell analysis reveals IFN-γ as a driver of respiratory sequelae after acute COVID-19
2024-07-17, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adn0136
PMID:39018367
|
研究论文 | 通过比较临床样本和动物模型的单细胞RNA测序数据，揭示IFN-γ是急性COVID-19后呼吸系统后遗症的驱动因素 | 首次在人类和小鼠模型中同时发现促纤维化单核源性巨噬细胞反应及肺巨噬细胞与呼吸系统常驻T细胞的异常相互作用 | 主要关注呼吸系统后遗症，未涉及PASC其他临床表现 | 探究SARS-CoV-2感染后急性后遗症(PASC)的病因机制 | 人类PASC临床样本和小鼠PASC模型 | 单细胞组学 | COVID-19后遗症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 临床PASC样本和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 338 | 2025-10-05 |
Reusability report: Leveraging supervised learning to uncover phenotype-relevant biology from single-cell RNA sequencing data
2024-Mar, Nature machine intelligence
IF:18.8Q1
DOI:10.1038/s42256-024-00804-y
PMID:41020135
|
研究论文 | 评估PENCIL监督学习框架在单细胞RNA测序数据中识别表型相关细胞的可重复性和可转移性 | 通过基因集变异分析增强PENCIL的细胞亚群识别能力，创建了预测皮肤癌免疫检查点阻断反应的细胞毒性T细胞免疫治疗反应特征 | 对输入扰动敏感，原始版本存在可重复性问题 | 评估和改进监督学习框架在单细胞RNA测序数据中识别表型相关细胞的性能 | 12个单细胞RNA测序数据集，代表四种不同表型 | 机器学习 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序，监督学习，基因集变异分析 | PENCIL框架 | 单细胞RNA测序数据 | 12个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 339 | 2025-10-05 |
A high-throughput single-cell RNA expression profiling method identifies human pericyte markers
2023-12, Neuropathology and applied neurobiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1111/nan.12942
PMID:37812061
|
研究论文 | 通过高通量单细胞RNA测序方法鉴定人脑周细胞特异性标志物 | 首次使用EasySci单细胞转录组测序技术系统鉴定人脑周细胞特异性基因标志物SLC6A12和SLC19A1 | 在其他人体器官（肾、肺、肝、肌肉）中未观察到相同的周细胞染色模式，组织特异性较强 | 鉴定和优化人脑周细胞的通用组织学标志物 | 人和小鼠不同脑区的周细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 免疫印迹 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 多个人和小鼠脑区样本，以及肾、肺、肝、肌肉等器官探索性样本 | NA | 单细胞RNA-seq | EasySci | 高通量低成本单细胞转录组测序方法 |
| 340 | 2025-10-05 |
Spatial atlas of the mouse central nervous system at molecular resolution
2023-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06569-5
PMID:37758947
|
研究论文 | 本研究使用STARmap PLUS原位测序技术构建了小鼠中枢神经系统的分子分辨率空间图谱 | 开发了STARmap PLUS原位测序方法，首次在三维空间中以单细胞分辨率绘制了全脑分子细胞类型图谱 | 仅检测了1,022个基因，需要通过整合其他数据来推断全转录组表达谱 | 构建小鼠中枢神经系统的分子分辨率空间图谱 | 成年小鼠大脑和脊髓 | 空间转录组学 | NA | 原位测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，空间位置数据 | 109万个高质量细胞 | NA | 原位测序，单细胞RNA测序 | STARmap PLUS | STARmap PLUS原位测序技术，体素尺寸194×194×345纳米 |