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当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-06-09 |
Trainable clustering framework for spatial transcriptomics
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag133
PMID:42254590
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研究论文 | 介绍了一种用于空间转录组学的可训练聚类框架，结合自编码器与聚类层实现空间域识别 | 提出了一种统一四种互补策略（ACT、FACT、Scatter和Ensemble）的可训练聚类框架，通过自编码器驱动特征学习与Mclust辅助聚类层的联合优化实现端到端训练 | 未明确讨论模型在大规模数据集上的计算效率或对高度噪声数据的鲁棒性 | 开发一种用于空间转录组空间域识别的可训练聚类框架 | 人类DLPFC、小鼠前脑、人类乳腺癌样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 自编码器、Mclust | 空间转录组数据 | 人类DLPFC、小鼠前脑和人类乳腺癌数据集，以及Stereo-seq和Slide-seq数据集 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq, Slide-seq | NA |
| 322 | 2026-06-09 |
Integrated transcriptomic identification and validation reveal key autophagy-associated biomarkers in sleep deprivation
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.21426
PMID:42254657
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研究论文 | 通过整合转录组数据分析和实验验证，识别睡眠剥夺相关的关键自噬生物标志物 | 首次综合运用机器学习和单细胞RNA测序技术，发现CDKN1A、HSPA5和NR4A1作为睡眠剥夺相关自噬关键基因，并探讨其在免疫微环境和不同细胞亚群中的作用 | 本研究主要基于小鼠模型和公共数据集，人类样本仅为外周血，缺乏直接的人类脑组织验证；样本量有限，功能性验证尚不充分 | 识别与睡眠剥夺相关的自噬基因，为阐明睡眠剥夺发病机制和治疗靶点提供依据 | 小鼠脑组织、大鼠脑组织（前额叶皮层和海马）、人外周血样本 | 机器学习 | 睡眠剥夺相关疾病 | 转录组测序、RT-qPCR、单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个转录组数据集（GSE33302、GSE9442、GSE9441、GSE3767、GSE37665），包括小鼠脑组织、大鼠脑组织和人外周血样本；大鼠模型（雄性Sprague-Dawley大鼠，连续7天睡眠剥夺） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 323 | 2026-06-09 |
Myeloid HDAC7 drives liver inflammation and systemic glucose dysregulation during diet-induced obesity
2026, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70100
PMID:42255101
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研究论文 | 该研究探讨了髓系HDAC7在饮食诱导的肥胖过程中驱动肝脏炎症和全身性葡萄糖失调的作用 | 首次通过遗传功能获得和缺失实验在小鼠中明确证实髓系HDAC7在肥胖驱动的代谢疾病中促进肝脏炎症和全身性葡萄糖失调，并与人类晚期慢性肝病特征相关 | 主要基于小鼠模型，尚未完全阐明HDAC7在人类代谢疾病中的具体机制和临床转化价值 | 研究髓系HDAC7在肥胖驱动的代谢疾病中的功能，特别是在肝脏炎症和葡萄糖代谢中的作用 | 小鼠模型及人类晚期慢性肝病患者肝脏样本 | 机器学习 | 代谢性疾病、慢性肝病 | 空间转录组学、基因敲除和过表达技术 | NA | 基因表达数据、空间转录组学数据 | 小鼠模型（包括转基因和敲除小鼠）及人类晚期慢性肝病患者肝脏样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 324 | 2026-06-09 |
Single-cell and repertoire profiling reveals immune remodelling in paediatric upper airway: insights from adenoid hypertrophy
2026, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70101
PMID:42255100
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和配对B/T细胞受体分析揭示了儿童腺样体肥大中的免疫重塑特征 | 首次在单细胞分辨率下联合分析腺样体肥大中B细胞和T细胞受体库，发现免疫细胞组成和功能改变 | 样本量较小（每组4例），且未进行功能性验证实验 | 解析儿童腺样体肥大中的免疫细胞景观和配对B/T细胞受体谱系变化 | 儿童腺样体组织（肥大组和对照组各4例） | 数字病理学 | 儿科疾病 | 10x Genomics 5'单细胞RNA测序，配对VDJ分析 | NA | 单细胞转录组和免疫受体库数据 | 8例腺样体组织（4例肥大，4例对照），共72,076个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，单细胞VDJ分析 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 5'试剂盒，含配对V(D)J分析 |
| 325 | 2026-06-09 |
Pathogenic Implications of the THY1/NF-κB Feedback Relationship in Osteoarthritis and Its Potential as a Therapeutic Target
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S597277
PMID:42255174
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研究论文 | 本研究通过整合差异表达分析、WGCNA和PPI网络分析等方法，鉴定出THY1作为骨关节炎的诊断标志物，并探讨其与NF-κB信号通路的反馈关系及作为治疗靶点的潜力 | 首次通过多种机器学习算法整合单细胞测序和分子动力学模拟，揭示THY1在骨关节炎软骨细胞发育中的动态表达，并预测小檗碱与THY1的结合作用 | 研究主要基于计算模拟和初步实验验证，THY1/NF-κB反馈关系的临床意义和分子机制仍需进一步验证；小檗碱与THY1的相互作用仅提供结构预测，缺乏体内药理学证据 | 鉴定骨关节炎的潜在治疗靶点并探索相关分子机制 | 骨关节炎患者和动物模型的软骨细胞及组织样本 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞测序、分子动力学模拟、WGCNA、PPI网络分析 | RF, LASSO, SVM-RFE | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 326 | 2026-06-09 |
Immune-excluded and immune-suppressive tumor microenvironments: mechanisms, spatial biomarkers, and therapeutic rewiring
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1855429
PMID:42255212
|
综述 | 综述了免疫排斥和免疫抑制肿瘤微环境的机制、空间生物标志物及治疗重塑策略 | 整合空间转录组学、多重成像、空间蛋白质组学等新兴技术，系统阐述耐药性TME的空间组织特征和动态演化机制，提出空间生物标志物可优化患者分层和治疗决策 | 前瞻性临床验证仍有限，空间生物标志物系统的临床应用尚未成熟 | 阐明免疫排斥和免疫抑制肿瘤微环境的生物学机制、空间标志物的潜在价值及治疗重塑方向 | 肿瘤微环境中的基质重塑、癌相关成纤维细胞、髓系细胞主导、细胞因子和趋化因子网络、血管功能障碍、代谢应激及器官特异性微环境效应 | 数字病理学 | 恶性肿瘤（多种实体瘤） | 空间转录组学、多重成像、空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据、多重成像数据、空间蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 327 | 2026-06-09 |
BIRC5 drives cell-cycle dysregulation and represents a novel molecular target in retinoblastoma
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1854143
PMID:42255235
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和功能验证，确定BIRC5（survivin）是视网膜母细胞瘤恶性增殖的细胞状态特异性调节因子，并可作为新型分子靶点 | 首次在单细胞水平上鉴定BIRC5为视网膜母细胞瘤MKI67+增殖亚群的细胞状态特异性驱动因子，揭示了其通过CCND1/CDK4激活和CHEK2-p21检查点抑制促进细胞周期紊乱的机制 | 研究主要在细胞系中进行功能验证，缺乏体内动物模型的进一步验证；样本量相对有限（13个肿瘤和3个正常样本） | 识别视网膜母细胞瘤恶性增殖的分子调节因子和潜在治疗靶点 | 视网膜母细胞瘤肿瘤细胞和正常胎儿视网膜细胞 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, siRNA敲低, 过表达 | NA | 单细胞转录组数据 | 13个视网膜母细胞瘤肿瘤和3个正常胎儿视网膜样本，共189431个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 328 | 2026-06-09 |
A cell death program-based tumor signature stratifies prognosis, immune landscape, and therapeutic response in glioma
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1824504
PMID:42255240
|
研究论文 | 基于细胞死亡程序构建胶质瘤预后特征，揭示其与免疫微环境和治疗响应的关联 | 首次构建整合焦亡与凋亡相关基因的预后特征（PA.Sig），从单细胞水平揭示恶性细胞状态与免疫微环境的动态互作 | 未提及具体限制 | 开发一种基于细胞死亡信号的预后特征，并阐明其在胶质瘤中的生物学和临床相关性 | 胶质瘤患者样本及细胞系 | 机器学习 | 胶质瘤 | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据，临床数据 | TCGA-GBMLGG及外部验证队列 | NA | bulk RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 329 | 2026-06-09 |
Transplantation immunology: paradigm shift from systemic suppression to microenvironment remodeling and precision modulation
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1835561
PMID:42255472
|
综述 | 系统阐述了移植免疫学从系统性免疫抑制向微环境重塑与精准调节的范式转变，重点介绍了四种前沿治疗策略 | 整合高维技术（单细胞测序、表观基因组学、代谢组学）与人工智能，提出从“广谱抑制”转向“精准调节”的免疫管理新框架 | 未提供临床试验证据，缺乏对具体策略效果的定量比较 | 推动移植免疫学从系统性免疫抑制向精准免疫微环境调节的范式转变 | 同种异体移植排斥反应中的免疫细胞、细胞因子及微环境组分 | 机器学习 | 终末期器官衰竭 | 单细胞测序、表观基因组学、代谢组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 330 | 2026-06-09 |
Deciphering skeletal muscle development: cellular heterogeneity and molecular regulatory networks from single-cell and spatial transcriptomic perspectives
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1827120
PMID:42255477
|
综述 | 从单细胞和空间转录组学角度解析骨骼肌发育过程中的细胞异质性和分子调控网络 | 系统总结了单细胞RNA测序和空间转录组学在骨骼肌发育研究中的最新进展，揭示了跨物种保守机制与物种特异性调控特征，并强调了微环境作为肌肉干细胞行为空间调节因子的作用 | 未提及具体技术局限或研究空白 | 综述单细胞和空间转录组学在骨骼肌发育研究中的应用，揭示细胞异质性和分子调控网络 | 骨骼肌发育过程中的细胞和分子事件 | NA | 肌肉相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（ST） | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、多模态数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 331 | 2026-06-09 |
Integrative Transcriptomic and Single-Cell Analyses Identify ATP1A1 as a Prognostic and Immune-Associated Factor in Esophageal Cancer
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/1461834
PMID:42255487
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研究论文 | 通过整合转录组和单细胞分析，确定ATP1A1是食管癌中一个与预后和免疫相关的因子 | 首次通过LASSO Cox回归和单细胞RNA测序数据，鉴定了ATP1A1作为食管癌预后和免疫相关因子，并揭示了其在肿瘤微环境中的表达模式和功能相关性 | 研究主要基于公共数据库，缺乏大规模临床样本验证，且ATP1A1的机制机制仍需进一步实验验证 | 识别食管癌中与线粒体应激相关的预后标志物，并分析其与免疫微环境的相互作用 | 食管癌患者的转录组数据、临床数据以及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 食管癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO Cox回归模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE160269队列中的单细胞RNA测序数据 |
| 332 | 2026-06-09 |
Single Cell and Machine Learning-Based Analysis of Lysosome Mediated Cell Death Reveals Novel Prognostic Biomarkers and Therapeutic Targets in Cervical Cancer
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/8487184
PMID:42255486
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序与机器学习整合分析，揭示溶酶体介导的细胞死亡在宫颈癌中的预后生物标志物和治疗靶点 | 首次在单细胞分辨率下结合15种机器学习算法系统分析LDCD在宫颈癌中的作用，并识别出六个新的预后相关枢纽基因 | 研究依赖公开数据集，可能缺乏多中心验证；未进行体外或体内功能实验验证 | 探索宫颈癌中溶酶体介导的细胞死亡的分子机制及其与肿瘤微环境的相互作用，并开发预后模型 | 宫颈癌患者的单细胞和转录组数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | CoxBoost, RFSurvival, Lasso-Cox | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多队列转录组数据来自TCGA和GEO数据库，单细胞数据来自GSE138080数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 333 | 2026-06-09 |
The miR-30c-5p/SOCS3 axis is a potential driver of inflammation and metabolic imbalance in Duchenne muscular dystrophy
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1841851
PMID:42255483
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据鉴定miR-30c-5p/SOCS3轴在杜氏肌营养不良症中驱动炎症和代谢失衡的作用 | 首次通过整合bulk RNA-seq、small RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，系统鉴定并验证miR-30c-5p/SOCS3轴在DMD中驱动炎症和代谢失衡的关键作用 | 未提供明确的局限性信息 | 探究miRNA-mRNA调控网络在DMD发病机制中的关键驱动因子 | DMD患者肌肉组织、mdx小鼠、C2C12肌母细胞和原代骨骼肌细胞 | 机器学习 | 杜氏肌营养不良症 | RNA-seq, 小RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 差异表达分析, 靶基因预测, 功能通路富集, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 双荧光素酶报告基因实验 | NA | 基因表达数据 | 整合GSE38417、GSE109178、GSE157668和GSE213925数据集，具体样本量未明确 | NA | bulk RNA-seq, small RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 334 | 2026-06-09 |
Network Pharmacology and Single-Cell Transcriptomic Investigation of Molecular Mechanisms Underlying Erigeron breviscapus Treatment in Acute Myocardial Infarction
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/7715750
PMID:42255489
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研究论文 | 结合网络药理学和单细胞转录组学，建立预测性计算框架，探究灯盏细辛治疗急性心肌梗死的分子机制 | 首次将网络药理学与单细胞转录组学系统整合，构建多组分、多靶点、多通路机制的计算建模框架，揭示灯盏细辛在急性心肌梗死中的细胞特异性靶向作用 | 研究基于计算预测和公共数据库数据，缺乏大规模临床试验验证；单细胞转录组数据来源有限，可能无法完全反映人体复杂性；结论需要进一步实验验证 | 建立预测性计算框架，阐明灯盏细辛治疗急性心肌梗死的多靶点分子机制 | 灯盏细辛的活性化合物及其治疗靶点、急性心肌梗死相关基因、心脏细胞群（心肌细胞、心脏成纤维细胞、内皮细胞、巨噬细胞和T淋巴细胞） | 生物信息学、网络药理学、单细胞转录组学 | 急性心肌梗死、心血管疾病 | 网络药理学、单细胞RNA测序、UMAP降维、Monocle 3拟时序分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 小鼠AMI模型样本、公共数据库基因集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 335 | 2026-06-09 |
Identification of genes associated with smell dysfunction in Parkinson's disease
2026, Clinical parkinsonism & related disorders
IF:1.9Q3
DOI:10.1016/j.prdoa.2026.100453
PMID:42255497
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研究论文 | 整合临床和转录组数据分析帕金森病嗅觉功能障碍相关基因 | 通过机器学习特征排序确定嗅觉功能丧失是区分帕金森病与健康对照的最有价值临床指标，并整合WGCNA、DNA甲基化和单细胞RNA测序数据揭示其分子机制 | 研究主要依赖外周血转录组数据，可能无法完全反映大脑嗅觉区域的分子变化；缺乏独立队列验证 | 探究帕金森病中嗅觉功能障碍的遗传基础及其作为早期诊断标志物的潜力 | 帕金森病患者和健康对照个体 | 机器学习 | 帕金森病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析 | 加权基因共表达网络分析 (WGCNA) | 临床数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | 来自PPMI数据库的外周血样本及独立单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 336 | 2026-06-09 |
Integrative Analysis of Genetic Risk Factors for Acute Myeloid Leukemia Using Mendelian Randomization and Single-Cell RNA Sequencing Validation
2026, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5584620
PMID:42255490
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序验证，综合分析急性髓系白血病的遗传风险因素 | 将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序验证相结合，全面评估遗传暴露与AML风险之间的因果关系，并揭示风险基因在造血谱系中的细胞特异性表达模式 | 未明确提及，但基于描述，可能受限于MR分析中的潜在混杂因素和单细胞测序样本量有限 | 评估遗传因素与急性髓系白血病风险之间的因果关系，并验证基因表达模式 | 急性髓系白血病相关的遗传因素和造血细胞群体 | 机器学习和计算生物学 | 急性髓系白血病 | 孟德尔随机化分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据和遗传变异数据 | NA（未明确说明样本量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 337 | 2026-06-09 |
Correction: Detection of differentially expressed genes in spatial transcriptomics data by spatial analysis of spatial transcriptomics: A novel method based on spatial statistics
2026, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2026.1867303
PMID:42255936
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更正 | 对前期发表的关于通过空间转录组学数据的空间分析检测差异表达基因的文章进行更正 | 更正本身不具备创新性 | 更正内容局限于对原文错误的修正 | 修正空间转录组学数据中差异表达基因检测方法的错误 | 更正通知本身无研究对象 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 338 | 2026-06-09 |
Immunoengineering in the field of tendon and bone regeneration: immunomodulatory biomaterials, delivery platforms, and preclinical models for chronic diseases
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1844904
PMID:42256713
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综述 | 系统总结了旨在克服肌腱-骨界面再生挑战的“骨免疫工程”最新范式转变 | 提出下一代智能生物物理和化学干预策略，包括压电纳米水凝胶、Janus不对称微流体接口和精准空间递送平台，并强调闭环动态自适应生物材料与人工智能的深度融合 | NA | 综述骨免疫工程在肌腱和骨再生中的最新进展，旨在克服慢性疾病导致的再生微环境破坏问题 | 肌腱-骨界面及其在慢性退行性病变（如衰老、糖尿病和类风湿关节炎）下的再生 | 机器学习 | 肌腱和骨损伤 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 339 | 2026-06-08 |
Age-associated differences in XBB.1.5 trivalent booster vaccine-induced adaptive responses revealed by single-cell RNA sequencing
2026-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2026.2627067
PMID:41631690
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示XBB.1.5三价加强疫苗诱导的适应性反应中与年龄相关的差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统比较老年人和年轻人在接种XBB.1.5三价重组蛋白加强疫苗后免疫反应的年龄相关差异，揭示了B细胞和T细胞转录轨迹的年龄特异性变化 | 需要进一步的纵向和功能研究来阐明这些观察结果的机制基础和临床意义 | 表征老年人对更新版COVID-19加强疫苗免疫反应的年龄相关差异 | 22名年轻个体（<38岁）和20名老年个体（≥73岁），均曾接种过2-3剂灭活COVID-19疫苗 | 机器学习 | 新型冠状病毒肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 42名个体（22名年轻和20名老年）的外周血单核细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 340 | 2026-06-08 |
Molecular Characterization and Immune Modulation of Schwann Cells in Vestibular Schwannoma
2026-Aug, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70179
PMID:42226390
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研究论文 | 利用单细胞转录组测序研究前庭神经鞘瘤中施万细胞的分子特征及其免疫调控作用 | 鉴定出一个新的施万细胞亚群Schwann 4，该亚群高表达MHC II类分子且富集PI3K信号通路，并发现CTSZ基因通过PVR-TIGIT通路与调节性T细胞功能标志物相关，揭示了施万细胞介导免疫调控的新机制 | YM201636和AT7867等候选药物对前庭神经鞘瘤的适用性尚需专门验证 | 探究前庭神经鞘瘤中施万细胞的分子特征及其在肿瘤微环境中的免疫调控作用 | 前庭神经鞘瘤中的施万细胞亚群 | 机器学习 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞转录组测序 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |