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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-06-18 |
Novel Approaches for Investigating Host Responses to HIV Infection in Ex Vivo Human Genital Tissues
2026-05, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70240
PMID:42053961
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综述 | 综述利用离体人类生殖组织研究HIV感染宿主反应的新方法 | 聚焦空间转录组学与多重成像技术在生殖组织免疫微环境分析中的创新应用,开发定制化计算流程以整合转录组与成像数据 | 现有空间转录组学与生物成像平台仍存在分辨率限制和高成本等问题 | 揭示生殖黏膜免疫反应与结构完整性对HIV性传播易感性和慢性感染的作用机制 | 离体人类生殖组织 | 数字病理学 | 艾滋病 | 空间转录组学,多重成像 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 322 | 2026-06-18 |
Single-Cell Transcriptome-Wide Mendelian Randomization and Colocalization Uncover Potential Immunocytes-Related Therapeutic Targets for Obesity
2026-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71185
PMID:42117609
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研究论文 | 通过单细胞转录组全基因组孟德尔随机化和共定位分析,揭示免疫细胞相关肥胖治疗靶点 | 首次将单细胞RNA测序数据与孟德尔随机化和共定位分析结合,系统性识别免疫细胞中与肥胖相关的因果基因,并利用Tier系统优先排序药物靶点 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、功能验证不足或因果推断的潜在偏倚 | 鉴定免疫细胞中与肥胖相关的潜在治疗靶点基因 | 14种免疫细胞(如CD4 naive/中央记忆T细胞、单核细胞、T细胞、B细胞)及肥胖相关性状(肥胖、体重指数、体脂百分比) | 机器学习 | 肥胖 | NA | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确说明样本数量,但涉及14种免疫细胞的eQTL数据和单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 323 | 2026-06-18 |
Single-Cell Characterization of Terminal States and State-Specific Transcriptional Regulatory Networks in Hepatocellular Carcinoma
2026-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71214
PMID:42186138
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据揭示肝细胞癌的终端细胞状态及其特异性转录调控网络 | 首次构建连接细胞命运动态与转录调控网络的整合框架,识别出肝细胞癌的三种终端细胞状态(免疫激活型、代谢型和增殖型),并发现每种状态由特定核心调控因子(IRF3、PPARA和JUN)调控 | 基于公开数据且主要依赖计算预测,缺乏体外或体内实验验证 | 阐明肝细胞癌肿瘤细胞沿命运轨迹状态的涌现及其转录调控机制 | 肝细胞癌中的恶性细胞及其细胞状态和转录调控网络 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | CellRank、SCENIC | 单细胞转录组数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据(具体样本量未在标题和摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 324 | 2026-06-18 |
Integrated single-cell and bulk RNA-seq analysis identifies BCAA metabolism-related prognostic signatures in head and neck squamous cell carcinoma
2026-May, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2026.153200
PMID:42263482
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研究论文 | 整合单细胞与批量RNA-seq分析,识别头颈部鳞状细胞癌中支链氨基酸代谢相关预后特征 | 首次从单细胞分辨率识别了支链氨基酸代谢相关的四基因预后特征,揭示了代谢与免疫在特定细胞类型中的交互作用 | 结论主要基于计算预测,RT-qPCR验证队列小,限制了实验验证的力度 | 识别头颈部鳞状细胞癌中与支链氨基酸代谢相关的预后基因并阐明其功能角色 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)样本 | 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), RT-qPCR | Cox回归, LASSO回归 | 转录组数据(批量与单细胞) | 包含TCGA-HNSCC、GSE65858、GSE41613、GSE103322、GSE140042多个数据集 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 325 | 2026-06-18 |
RUNX2 drives adenoma-to-carcinoma transition in colon cancer
2026-Apr-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08801-2
PMID:42056097
|
研究论文 | 揭示RUNX2在结肠癌腺瘤-癌转变中的驱动作用及其分子机制 | 通过单细胞RNA测序首次发现CD8耗竭T细胞通过TNF-α/TNFRSF1A通路激活恶性上皮细胞中的RUNX2,驱动腺瘤向癌转变,并鉴定RUNX2抑制剂CADD522可阻断该过程 | 研究主要基于体外细胞实验和AOM/DSS小鼠模型,缺乏大规模临床队列验证及RUNX2抑制剂在体内的长期安全性评估 | 阐明结肠腺瘤向腺癌转变的分子机制,寻找早期干预靶点 | 结肠腺瘤组织和癌组织中的CD8耗竭T细胞、恶性上皮细胞,以及HCT116和HCT15细胞系 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | 包含结肠腺瘤、癌及癌旁正常组织的患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒 |
| 326 | 2026-06-18 |
Therapeutic effects of mesenchymal stem cell-derived extracellular vesicles from different tissue sources on diminished ovarian reserve and the related mechanisms
2026-Apr-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04403-4
PMID:42057118
|
研究论文 | 比较脂肪来源和脐带来源间充质干细胞胞外囊泡对卵巢储备功能减退小鼠的治疗效果及机制 | 首次系统比较不同组织来源间充质干细胞胞外囊泡在卵巢储备功能减退模型中的疗效差异,并揭示脐带来源囊泡具有更广泛的调控作用和更持久的生殖益处 | 未提及具体局限性 | 比较脂肪和脐带来源间充质干细胞胞外囊泡对卵巢储备功能减退的治疗效果及机制,为临床选择最优囊泡来源提供实验证据 | 环磷酰胺诱导的卵巢储备功能减退小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢储备功能减退 | 蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 环磷酰胺诱导的卵巢储备功能减退小鼠,未明确样本数 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 327 | 2026-06-18 |
Spatial transcriptomic atlas of murine neurotoxocariasis reveals region-specific host responses and dysfunction in the brain
2026-Apr-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72114-3
PMID:41997914
|
研究论文 | 结合空间转录组学、单核RNA测序、脂质组学和行为学分析,在小鼠模型中绘制犬弓首蛔虫幼虫引起神经弓首蛔虫病的宿主-寄生虫界面图谱,揭示区域特异性脑损伤和功能障碍机制 | 首次使用空间转录组学技术系统解析神经弓首蛔虫病中脑区域特异性宿主反应和寄生虫转录程序,结合多组学和行为学分析揭示运动学习和记忆障碍的分子机制 | NA | 阐明神经弓首蛔虫病的病理机制,特别是脑区域特异性神经损伤、免疫反应和功能障碍的分子机制 | 感染犬弓首蛔虫的小鼠模型脑组织 | 数字病理学 | 神经弓首蛔虫病 | 空间转录组学、单核RNA测序、脂质组学 | NA | 转录组数据、脂质组数据、行为学数据 | 小鼠模型(具体样本量未在摘要中提及) | NA | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | NA |
| 328 | 2026-06-18 |
Tumor cell-derived IFN spatially reprograms osteopontin-enriched macrophage niches to promote PARP inhibitor resistance
2026-04-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199035
PMID:41734034
|
研究论文 | 该研究整合空间转录组学与单细胞RNA测序,揭示了肿瘤细胞衍生的IFN通过SPP1通路重塑巨噬细胞微环境导致PARP抑制剂耐药的新机制 | 首次发现肿瘤细胞来源的IFN通过STAT信号诱导TAM中骨桥蛋白(SPP1)表达形成免疫抑制生态位,并验证SPP1阻断可恢复PARP抑制剂敏感性 | 未明确说明样本量及长期随访数据 | 阐明PARP抑制剂耐药的空间免疫微环境机制并探索新治疗靶点 | 高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤标本及HRD小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | PhenoCycler-Fusion空间分析, 单细胞RNA测序, 多重免疫组化 | NA | 图像, 转录组数据 | 前瞻性新辅助尼拉帕利单药治疗试验的肿瘤标本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | PhenoCycler-Fusion | PhenoCycler-Fusion空间分析平台配合10x单细胞RNA测序 |
| 329 | 2026-06-18 |
GSDME-IL-18 pyroptotic axis prevents myosteatosis by expanding tissue-resident macrophages to promote muscle regeneration
2026-04-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198076
PMID:41701674
|
研究论文 | 揭示GSDME依赖性细胞焦亡通过IL-18信号轴扩张组织驻留巨噬细胞,促进肌肉再生并抑制肌脂肪变性 | 首次发现GSDME依赖的细胞焦亡信号在肌肉损伤中发挥保护作用,通过IL-18激活组织驻留巨噬细胞的KLF4/JUN信号通路,维持脂质稳态,而非传统认为的加重无菌性炎症 | 未明确说明具体局限性 | 探究GSDME依赖性细胞焦亡在肌肉损伤修复和肌脂肪变性中的作用机制 | 人类术后肌肉损伤样本和鼠类损伤模型 | 数字病理学 | 肌肉疾病、老年性疾病 | 单细胞RNA测序、多组学流式细胞术、脂质组学 | NA | 基因表达数据、脂质组学数据、单细胞转录组数据 | 人类术后肌肉样本和多种鼠类损伤模型(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 330 | 2026-06-18 |
Genomic characterization of sub-populations in human pluripotent stem cell-derived retinal progenitor cells driving retinal lamination
2026-04-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.102831
PMID:41791386
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究人类胚胎干细胞来源的视网膜祖细胞亚群驱动视网膜分层的基因组特征 | 发现WNT2B-FZD7经典信号通路与非经典WNT5A信号通路顺序调控视网膜早期形态发生,并揭示移植后宿主视网膜环境对光感受器排列和功能整合的关键驱动作用 | 仅基于体外视网膜类器官模型和一种视网膜退化大鼠模型,可能无法完全模拟人类发育和疾病状态 | 探究人类多能干细胞来源的视网膜祖细胞亚群驱动视网膜分层的机制 | Rax::GFP阳性视网膜祖细胞及其亚群 | 数字病理学 | 视网膜退化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量,涉及分化和移植实验的视网膜类器官及大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 331 | 2026-06-18 |
Cytotoxic T cell recognition of α-synuclein drives pathogenic immune responses in multiple system atrophy
2026-Apr-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2537271123
PMID:41911451
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研究论文 | 研究多系统萎缩症中α-突触核蛋白驱动的细胞毒性T细胞免疫应答 | 首次揭示α-突触核蛋白特异性细胞毒性T细胞在多系统萎缩症中驱动致病性免疫应答 | 研究基于相对较小的样本量,且仅聚焦于外周和中枢T细胞反应,未来需进一步验证该免疫轴在疾病进展中的具体作用 | 探索适应性免疫机制在多系统萎缩症神经炎症中的贡献 | 多系统萎缩症患者、帕金森病患者和健康对照组的外周和中枢T细胞反应 | 免疫学 | 多系统萎缩症 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、抗原特异性功能检测数据 | 多系统萎缩症患者、帕金森病患者和健康对照组的样本,具体未提及数量 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 332 | 2026-06-18 |
Single-cell RNA-seq reveals trans-sialidase-like superfamily gene expression heterogeneity in Trypanosoma cruzi populations
2026-Apr-07, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.105822
PMID:41945382
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research paper | 使用单细胞RNA测序技术分析克氏锥虫无鞭毛体和锥鞭毛体阶段的细胞特异性转录组,揭示跨唾液酸酶样超家族基因表达的异质性 | 首次在单细胞水平揭示克氏锥虫群体中跨唾液酸酶样超家族基因表达的异质性,并发现核心基因组区域编码的TcS mRNA更频繁检测到,而破坏性基因组区域编码的TcS mRNA检测频率较低 | 未提及 | 研究克氏锥虫在哺乳动物感染过程中细胞表面蛋白表达的阶段性特异性及异质性 | 克氏锥虫的无鞭毛体和锥鞭毛体细胞 | single-cell transcriptomics | Chagas disease | single-cell RNA sequencing | NA | single-cell transcriptome | 无鞭毛体和锥鞭毛体细胞群体 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 333 | 2026-06-18 |
Metabolic surgery mitigates early kidney injury in obese youth with diabetes by suppressing mTORC1/JAK/STAT signaling
2026-04-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198545
PMID:41665972
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研究论文 | 探究代谢手术(垂直袖状胃切除术)对肥胖2型糖尿病青少年早期肾损伤的缓解作用及其分子机制 | 首次通过配对肾活检样本结合单细胞RNA测序和循环蛋白质组学,揭示代谢手术通过抑制mTORC1/JAK/STAT信号通路改善肾脏结构和分子变化 | 样本量较小(仅5例配对活检),且缺乏长期随访数据 | 阐明垂直袖状胃切除术减轻青少年肥胖2型糖尿病患者早期糖尿病肾病的分子机制 | 肥胖合并2型糖尿病的青少年患者 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、循环蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据、组织病理图像 | 5例配对肾活检样本(治疗前后),64例独立队列血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 334 | 2026-06-18 |
Inflammasome adaptor ASC promotes sustained neuroinflammation and mild cognitive impairment in a closed-head injury model
2026-04-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199818
PMID:41734021
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探讨了炎症小体适配器ASC在闭合性脑损伤模型中促进持续性神经炎症和轻度认知障碍的作用 | 首次在轻度闭合性脑损伤模型中,通过单细胞RNA测序分析揭示ASC主要在小胶质细胞簇中表达,并证明ASC在维持神经炎症和导致认知缺陷中的关键作用 | NA | 研究炎症小体适配器ASC在轻度闭合性脑损伤后的神经炎症和认知障碍中的作用 | 小鼠闭合性脑损伤模型中的皮质组织 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型,具体样本数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 335 | 2026-06-18 |
Score Matching for Differential Abundance Testing of Compositional High-Throughput Sequencing Data
2026-Apr, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.70534
PMID:41944570
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研究论文 | 提出了一种名为cosmoDA的差异丰度检测方法,用于处理高维稀疏测序数据中的特征相关性和零值问题 | 将a-b幂交互模型扩展至包含协变量信息,结合惩罚广义评分匹配实现稀疏建模,显著降低由相关特征引起的假阳性率 | NA | 开发一种能够处理单细胞RNA测序和微生物扩增子数据中零值和特征相关性问题的差异丰度检测方法 | 高维稀疏成分数据中的差异丰度检测 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 扩增子测序 | a-b幂交互模型 | 测序计数数据 | 模拟数据和真实单细胞/扩增子数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 扩增子测序 | NA | NA |
| 336 | 2026-06-18 |
Single-Cell Transcriptomics Reveal Human Skin Aging Pathways
2026-Apr, Journal of cosmetic dermatology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/jocd.70708
PMID:41944719
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2026-06-18 |
Identification and Validation of Oxidative Stress-Related Candidate Biomarkers for Preeclampsia via WGCNA and Single-Cell Transcriptomics
2026-04, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70241
PMID:42030320
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research paper | 通过整合单细胞和批量转录组数据及WGCNA分析,识别并验证了与氧化应激相关的子痫前期候选生物标志物 | 结合单细胞转录组学与多种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)筛选关键基因,并构建诊断模型,揭示了SPP1、CTSC和SLC9A9在巨噬细胞中的高表达及其与免疫细胞的关联 | 未提及具体局限性,可能包括样本量有限或需要进一步功能验证 | 探索氧化应激相关基因对子痫前期的诊断价值 | 子痫前期患者与对照样本 | machine learning | 子痫前期 | RNA-seq, qRT-PCR | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | 转录组数据 | 多个数据集中的子痫前期和对照样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 338 | 2026-06-18 |
ADAMTS7 promotes smooth muscle foam cell expansion in atherosclerosis
2026-03-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI187451
PMID:41609669
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研究论文 | 研究ADAMTS7通过AP-1/PU.1/CD36调控轴促进平滑肌泡沫细胞形成,从而加剧动脉粥样硬化 | 首次揭示ADAMTS7在平滑肌细胞中的促动脉粥样硬化作用依赖于AP-1/PU.1/CD36调控轴,并利用单细胞RNA测序和条件性基因敲除/转基因小鼠模型阐明细胞特异性机制 | 未明确说明本研究的局限性 | 探究ADAMTS7在动脉粥样硬化中促进平滑肌泡沫细胞形成的细胞特异性机制 | 人类颈动脉粥样硬化组织及平滑肌细胞、内皮细胞特异性Adamts7条件性敲除和转基因小鼠 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,ATAC测序 | NA | 基因表达数据,染色质可及性数据 | 人类动脉粥样硬化样本(数量未明确)及小鼠模型 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序,ATAC测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA测序,Illumina NovaSeq平台进行RNA测序和ATAC测序 |
| 339 | 2026-06-18 |
MAP4K2 suppresses antitumor immunity in a pancreatic cancer model by promoting Treg differentiation
2026-03-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196379
PMID:41615953
|
研究论文 | 该研究揭示了MAP4K2通过DDX39B促进调节性T细胞分化,从而抑制抗肿瘤免疫的机制 | 首次发现MAP4K2通过磷酸化DDX39B诱导FOXP3表达促进Treg分化,并在胰腺癌模型中证实靶向MAP4K2可增强抗PD-1免疫治疗效果 | 主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本分析仅使用单细胞RNA测序数据,缺乏大规模临床验证 | 阐明MAP4K2在免疫调节中的体内功能及其在胰腺癌免疫治疗中的潜在作用 | T细胞特异性Map4k2条件敲除小鼠、EAE自身免疫疾病模型小鼠、胰腺癌小鼠模型及胰腺癌患者 | 免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、质谱分析、条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(T-Map4k2 cKO小鼠、Treg特异性Map4k2缺陷小鼠等)及胰腺癌患者的scRNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 340 | 2026-06-18 |
Comparison with Ezh2 reveals the PRC2-dependent functions of Jarid2 in hematopoietic stem Cell lineage commitment
2026-03-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.102793
PMID:41650958
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研究论文 | 通过比较Jarid2和Ezh2的缺失,揭示Jarid2在造血干细胞谱系定植中依赖PRC2的功能 | 首次通过遗传学比较Jarid2和Ezh2缺失的造血干细胞和祖细胞,区分Jarid2依赖PRC2与非依赖PRC2的功能,并发现其在限制髓系分化潜能中的核心作用 | 仅研究了小鼠模型,可能不完全适用于人类造血系统;未完全阐明Jarid2的非经典PRC2独立功能 | 解析Jarid2在造血干细胞谱系定植中的PRC2依赖功能 | Jarid2或Ezh2基因缺陷的小鼠造血干细胞和祖细胞 | 机器学习和生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Jarid2和Ezh2缺陷小鼠的骨髓祖细胞群体 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序 |