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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-05-29 |
RBAD: The first database dedicated alterations of blood RNA in individuals with Alzheimer's disease and their clinical relevance
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01165
PMID:40145964
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研究论文 | 开发了首个专注于阿尔茨海默病患者血液RNA变化的数据库RBAD,并分析了其临床相关性 | 首次构建了基于1468例血样、涵盖多种RNA测序数据的阿尔茨海默病血液RNA数据库,并整合了超过11百万次比较与关联分析 | 未在摘要中明确说明局限性 | 探究阿尔茨海默病患者血液RNA变化及其临床意义 | 阿尔茨海默病患者及小鼠模型的血液样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, microRNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 1468例血液样本(来自人类和小鼠研究) | NA | bulk RNA-seq, microRNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 322 | 2026-05-29 |
Single-cell RNA sequencing of the post-spinal cord injury dorsal root ganglia in cynomolgus monkeys: Elucidation of the cellular immune microenvironment of the central nervous system
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00974
PMID:40145972
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术对食蟹猴脊髓损伤后背根神经节的细胞免疫微环境进行全面分析 | 首次对食蟹猴脊髓损伤后背根神经节进行全面的转录组分析,涵盖几乎所有细胞类型,并揭示了巨噬细胞亚群在轴突再生中的调控作用 | 研究基于食蟹猴模型,可能不完全适用于人类;部分细胞亚群的功能仍需进一步实验验证 | 阐明脊髓损伤后背根神经节免疫细胞微环境的变化及其对轴突再生的影响机制 | 食蟹猴中胸段挫伤模型后的背根神经节和脊髓组织 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA-seq | 降维聚类分析、细胞轨迹分析、伪时间分析、配体-受体对分析 | 单细胞转录组数据 | 食蟹猴中胸段挫伤模型(具体样本数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 323 | 2026-05-29 |
Modulation of mitochondrial dysfunction: Mechanisms and strategies for the use of natural products to treat stroke
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-25-00016
PMID:40618255
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综述 | 系统综述了天然产物通过调控线粒体功能障碍治疗脑卒中的机制与策略 | 首次系统总结了天然产物通过多靶点调控线粒体生物合成、动力学平衡、自噬、凋亡、氧化应激及细胞间线粒体转运等机制发挥神经保护作用的证据,并提出结合单细胞测序和类器官模型等新技术的研究方向 | 成分复杂性导致标准化困难、跨区域临床数据不足、缺乏长期安全性评估,临床转化面临挑战 | 阐明天然产物通过靶向线粒体功能障碍治疗脑卒中的分子机制,为开发新型抗卒中药提供理论支持 | 线粒体功能障碍的动态调控过程(包括线粒体生物合成、融合/分裂、线粒体自噬、凋亡、氧化应激及细胞间线粒体转运)及天然产物(如虫草、羟基红花黄色素A、人参皂苷Rb3、绞股蓝皂苷XVII、银杏内酯K、灯盏花素、大黄酚) | 自然语言处理 | 脑卒中 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 324 | 2026-05-29 |
scIMGCN: an Automatic Single-Cell Type Annotation Method Based on Interpretable Graph Convolutional Network
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00738-y
PMID:40682757
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研究论文 | 提出一种基于可解释图卷积网络的单细胞类型自动注释方法scIMGCN | 通过网络增强技术提升图结构表示,使用改进的Transformer模块解决长程依赖问题,基于KAN的GCN变体增强特征表示和非线性,以及引入可解释性掩码机制提高模型透明度 | 未提供明显局限性说明 | 开发一种自动、高精度且可解释的单细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据集中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络、Transformer、KAN | 基因表达数据 | 十个真实数据集(未具体说明样本量) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 325 | 2026-05-29 |
Clustering Single-Cell RNA-Seq Data with Low-Rank Matrix Factorization and Local Graph Regularization
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00762-y
PMID:40897868
|
研究论文 | 提出一种结合低秩矩阵分解与局部图正则化的单细胞RNA测序数据聚类算法 | 采用三分解策略得到对齐核心矩阵,并通过局部流形正则化项在低维空间中表征细胞间距离,使用Schatten p-范数替代核范数以增强对噪声和异常值的鲁棒性,最后应用角度对齐策略获得相似矩阵 | 未明确提及局限性 | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性和鲁棒性,以准确识别细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 低秩矩阵分解、局部图正则化 | 基因表达数据 | 多个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 326 | 2026-05-29 |
Interpretable Multi-task Analysis of Single-Cell RNA-seq Data Through Topological Structure Preservation and Data Denoising
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00765-9
PMID:41023370
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研究论文 | 提出一个名为scIMTA的可解释多任务分析框架,用于单细胞RNA-seq数据的拓扑结构保持和数据降噪 | scIMTA实现了稀疏高噪声基因表达数据的协同多任务分析,通过生物学基础增强可解释性,并在保持数据完整性的同时稳健处理丢失事件 | 未提及具体局限 | 开发一个可解释的多任务分析框架,解决单细胞RNA-seq数据中的拓扑结构保持和丢失事件问题 | 乳腺癌单细胞RNA-seq数据集 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 327 | 2026-05-29 |
scRNA-Seq reveals anti-lymphoma immune responses in mogamulizumab-associated skin eruptions
2026-Jun, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.70154
PMID:41195968
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示mogamulizumab相关皮肤疹中的抗淋巴瘤免疫反应 | 首次对mogamulizumab相关皮疹进行全面的分子表征,发现残余恶性克隆呈现沉默免疫表型,并伴随潜在的抗肿瘤免疫反应 | 样本量较小(仅4例MAR患者),未明确说明机制验证实验 | 阐明mogamulizumab相关皮疹的分子特征及其与更好总生存期的关联机制 | mogamulizumab相关皮疹患者的皮肤活检组织 | 单细胞测序 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4例MAR患者,6例未治疗红皮病性CTCL患者,4例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 328 | 2026-05-29 |
Heterogeneity of the adult mammalian forebrain neurogenic ependyma: A comprehensive cellular map
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00789
PMID:40819302
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建成年小鼠前脑室管膜表面的完整细胞图谱,揭示其细胞异质性 | 首次通过全组织单细胞RNA测序系统鉴定成年小鼠前脑室管膜表面的12种不同细胞亚型,并精细刻画了CD133+与CD133-细胞的分子特征分类 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;未探讨不同细胞亚型的功能差异及神经干细胞潜能的具体机制 | 阐明成年哺乳动物前脑室管膜细胞的组成异质性,为解决神经干细胞存在争议提供新视角 | 成年小鼠前脑侧脑室侧壁的室管膜表面细胞 | 单细胞组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠的侧脑室侧壁整体组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 329 | 2026-05-29 |
Characterization of p16-positive stromal cells in age-related cardiac disorders
2026-Jun-01, Journal of biochemistry
IF:2.1Q4
DOI:10.1093/jb/mvag013
PMID:41705475
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析衰老心脏中p16阳性基质细胞的特征及其在心脏纤维化中的作用 | 首次利用p16-Tom小鼠模型在单细胞水平上表征p16阳性成纤维细胞在年龄相关心脏纤维化中的转录组特征,并证明选择性清除这些细胞可减轻纤维化 | 未提供 | 探究p16阳性基质细胞在年龄相关心脏疾病中的功能与机制 | 衰老p16-Tom小鼠和p16-Col1a2-LRTD小鼠的心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年p16-Tom小鼠和p16-Col1a2-LRTD小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 330 | 2026-05-29 |
Enhanced endocrine-metabolic support and axonemal assembly in high-sperm-motility geese: insights from testicular cellular heterogeneity by scRNA-seq
2026-Jun, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106840
PMID:41916058
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示高精子运动能力鹅的睾丸细胞异质性,发现内分泌-代谢支持及轴丝组装增强与精子运动能力相关 | 首次在鹅中利用单细胞转录组学解析精子运动能力差异的细胞基础,发现支持细胞和间质细胞的内分泌-代谢增强及圆形精子的轴丝组装程序上调 | 样本量较小(每组3只),且仅关注生理范围内的精子运动能力差异,未涉及极端低活力情况 | 探究鹅精子运动能力差异的睾丸细胞和分子基础 | 60只鹅中精子运动能力最高和最低的10%各6只,其中3只用于单细胞RNA测序 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 12只鹅用于表型比较,6只用于单细胞测序 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 331 | 2026-05-29 |
stGNN: Spatially Informed Cell-Type Deconvolution Based on Deep Graph Learning and Statistical Modeling
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00728-0
PMID:40571903
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研究论文 | 提出基于深度图学习和统计建模的stGNN方法,用于空间转录组数据的细胞类型反卷积 | 创新性地结合图卷积网络与自编码器的双编码模块,以及自适应注意力机制,从低阶到高阶捕捉多尺度空间结构;采用负对数似然损失函数对齐ST与scRNA-seq参考数据的分布 | 依赖性于高质量scRNA-seq参考数据;未明确讨论计算效率或大规模数据扩展性 | 开发利用空间信息的细胞类型反卷积方法,提升空间转录组数据中细胞类型组成预测准确性 | 10x Visium、Slide-seqV2、Visium HD等多个平台的六套空间转录组数据集,以及小鼠脑组织样本 | 机器学习 | NA | 空间转录组测序 | 图卷积网络、自编码器 | 空间转录组基因表达数据 | 六套来自多种平台的空间转录组数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Slide-seqV2, Visium HD | 10x Visium、Slide-seqV2、Visium HD等不同分辨率的空间转录组平台 |
| 332 | 2026-05-29 |
A Novel Dual-Level Momentum Distillation Method with Extreme Thresholding for Imputing Single-Cell RNA Sequencing Data
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00754-y
PMID:40841490
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研究论文 | 提出了一种名为MoDET的新方法,用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值,以提高数据质量和后续分析准确性 | 提出双重水平动量蒸馏与极端阈值机制相结合的方法,有效提升了细胞表征学习能力和对稀有细胞类型的识别精度 | 未提及跨平台或更大规模数据集验证,且对极端阈值机制的普适性未作深入讨论 | 解决单细胞RNA测序数据因缺失现象导致的稀疏性问题,提升下游聚类分析和稀有细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 双重水平动量蒸馏模型 | 基因表达矩阵 | 七个真实世界数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 333 | 2026-05-29 |
Joint Low Rank Representation with Symmetric Orthogonal Decomposition for Clustering of scRNA-seq Data
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00767-7
PMID:41131369
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研究论文 | 提出一种结合低秩表示与对称正交分解的单细胞RNA测序数据聚类新方法LRRS | 引入新的正交对称分解策略,无需预设聚类数量,通过测量正交空间下的加权距离自适应表征局部特性 | 未在更大规模或更复杂的数据集上验证,且迭代优化方法可能增加计算复杂度 | 开发高效的单细胞RNA测序数据聚类方法以准确识别细胞类型,揭示复杂疾病分子机制 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型组成 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示与对称正交分解模型 | 基因表达数据 | 11个基准数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 334 | 2026-05-29 |
Monocyte-derived IL-1β predicts and promotes HBsAg decline in chronic hepatitis B patients under nucleoside analogue therapy
2026-Jun-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000957
PMID:42190271
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示单核细胞来源的IL-1β在核苷类似物治疗的慢性乙型肝炎患者中预测和促进HBsAg下降 | 首次发现单核细胞来源的IL-1β与NA治疗中的HBsAg下降相关,并可作为功能性治愈的预测生物标志物和潜在治疗靶点 | NA | 探究NA治疗中HBsAg下降的免疫相关因素 | NA治疗的慢性乙型肝炎患者 | 机器学习 | 慢性乙型肝炎 | 单细胞RNA测序、转录组学、功能性检测 | NA | 单细胞转录组数据、血清IL-1β数据 | 多个队列,包括单细胞RNA测序队列、独立多中心验证队列和回顾性队列 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 335 | 2026-05-29 |
Implications of the Cuproptosis Protein SLC31A1 for the Immune Microenvironment and Temozolomide Sensitivity in Glioblastoma
2026-Jun, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.18188
PMID:42203322
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研究论文 | 探究铜死亡相关蛋白SLC31A1在胶质母细胞瘤免疫微环境中的作用及其对替莫唑胺敏感性的影响 | 首次揭示铜死亡关键蛋白SLC31A1在胶质母细胞瘤免疫微环境中的分布及其与免疫细胞浸润的关联,并评估铜死亡激动剂联合替莫唑胺的协同抗肿瘤效应 | 仅基于转录组和单细胞测序数据的生物信息学分析,缺乏多中心临床样本验证,且未深入探讨SLC31A1调控免疫微环境的分子机制 | 研究铜死亡通路关键蛋白SLC31A1在胶质母细胞瘤免疫微环境中的分布及其对化疗敏感性的影响 | 胶质母细胞瘤组织样本、GBM细胞系及异种移植瘤模型 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序, 单细胞测序, 免疫组化, 蛋白质印迹, 定量荧光PCR, 细胞增殖实验, 划痕愈合实验 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据, 图像数据(免疫组化), 蛋白质表达数据 | 未明确样本量,涉及GBM肿瘤组织、细胞系及小鼠异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 336 | 2026-05-29 |
Multi-omics reveals a novel Cxcr4+ subpopulation of alveolar macrophages and therapeutic effect of AMD3100 in mice with advanced silicosis
2026-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70705
PMID:42204838
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research paper | 通过整合单细胞RNA测序与空间转录组学,揭示了小鼠晚期矽肺中Cxcr4+肺泡巨噬细胞亚群的特征及AMD3100的治疗效果 | 首次鉴定出Cxcr4+巨噬细胞与Cxcl12+成纤维细胞在矽肺纤维化中的空间共定位模式,并揭示其通过正反馈环路驱动纤维化进展 | 研究基于小鼠模型,需进一步在人体样本中验证;AMD3100的长期疗效和安全性有待评估 | 探索矽肺纤维化进展中Cxcr4+巨噬细胞的作用机制及AMD3100的潜在治疗价值 | 小鼠矽肺模型肺组织样本及MH-S巨噬细胞系 | machine learning | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, Robust Cell Type Decomposition算法 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 矽肺小鼠模型肺组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 337 | 2026-05-29 |
Beyond Suppression: The Plasticity, Dysfunction, and Therapeutic Reprogramming of Regulatory T Cells in Inflammatory Bowel Disease
2026-May-28, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag067
PMID:42203202
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综述 | 系统性阐述调节性T细胞在炎症性肠病中的可塑性、功能缺陷及治疗性重编程策略 | 提出以谱系缺陷性ex-Tregs和耗竭性效应Tregs(eTregs)的关键区分为核心的新概念框架,并整合多组学见解重新定义IBD中Treg的功能衰竭 | 未提及具体局限性 | 阐述Treg在IBD中的复杂生物学特性、异常变化及新兴治疗策略 | 调节性T细胞(Tregs) | 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 338 | 2026-05-29 |
scFAST-seq reveals a wide diversity of transcripts, CNV events, and regulatory activity in adrenocortical tumor
2026-May-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44117-z
PMID:42203806
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研究论文 | 比较10X Chromium 3' scRNA-seq和SeekGene scFAST-seq在肾上腺皮质肿瘤配对样本中的表现,发现scFAST-seq检测到更多长链非编码RNA、基因和转录本 | 首次系统比较scFAST-seq与主流10X Chromium 3' scRNA-seq技术在肾上腺皮质肿瘤单细胞转录组分析中的差异,揭示了scFAST-seq在检测长链非编码RNA、基因和转录本方面的优势 | 仅使用两个配对样本,样本量较小;未对不同肿瘤类型的适用性进行验证;对RNA动态和拷贝数变异检测差异的机制解释不够深入 | 比较两种高通量液滴式单细胞RNA测序技术在肾上腺皮质肿瘤研究中的性能差异 | 来自肾上腺皮质肿瘤的两个配对样本 | 单细胞转录组学 | 肾上腺皮质肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个肾上腺皮质肿瘤配对样本 | 10x Genomics, SeekGene | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium 3', SeekGene scFAST-seq | 10x Chromium 3' 单细胞RNA测序, SeekGene scFAST-seq单细胞RNA测序 |
| 339 | 2026-05-29 |
Flowerbed-Inspired Mg-Loaded Scaffold Accelerates Critical-Sized Bone-Defect Repair by Reprogramming the Microenvironment
2026-May-28, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c02723
PMID:42204979
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研究论文 | 受花坛启发,开发了一种镁负载仿生复合支架,通过重编程微环境加速临界尺寸骨缺损修复 | 创新性地将镁离子负载水凝胶嵌入三周期极小曲面多孔钛合金框架,模拟花坛结构构建成骨微环境;发现并鉴定出CCN3间充质干细胞亚群在镁富集微环境中的招募及其通过Wnt/β-catenin信号通路参与早期成骨、通过分泌PTN因子调控巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要基于大鼠和比格犬动物模型,尚需进一步验证在人体内的效果和安全性 | 开发一种能够加速临界尺寸骨缺损修复的仿生支架材料 | 临界尺寸骨缺损的大鼠颅骨缺损模型和比格犬股骨髁缺损模型 | 机器学习 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 大鼠颅骨缺损模型和比格犬股骨髁缺损模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 340 | 2026-05-29 |
Microplastic Exposure Aggravates Cardiomyopathy Under Hemodynamic Stress Through the Gut-Heart Axis
2026-May-28, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了双酚F通过肠道微生物代谢产物N-乙酰腐胺经肠心轴加重心肌病的机制 | 首次阐明双酚F通过肠道菌群依赖的Sat1-NAP途径引发心脏毒性的分子机制,并发现Akkermansia muciniphila及其代谢产物色醇可缓解该毒性 | 未明确讨论样本量大小及模型代表性等潜在局限性 | 探究双酚F对心血管系统及肠道屏障的毒性作用及其机制 | 双酚F对小鼠心血管及肠道系统的影响,以及人体样本验证 | 机器学习和生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、非靶向代谢组学、空间代谢组学、粪便微生物移植 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、临床尿液数据 | 285例人尿液样本 | NA | 单细胞RNA测序、代谢组学 | NA | NA |