单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27967 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-05-17 |
CENPF as a Potential Biomarker Associated with the Immune Microenvironment of Renal Cancer
2025 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338251330791
PMID:40165474
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研究论文 | 本研究探讨了CENPF作为肾癌潜在预后生物标志物的作用及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 首次将CENPF与肾癌免疫微环境调控联系起来，并验证其作为预后生物标志物的潜力 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性分析，需要进一步前瞻性研究验证 | 寻找肾癌预后生物标志物并探索其与免疫微环境的关系 | 肾癌患者（包括KIRC、KICH和KIRP亚型） | 肿瘤免疫学 | 肾癌 | qPCR、单细胞测序、CIBERSORT算法 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | TCGA数据库样本及GSE159115单细胞数据集 |
| 322 | 2025-05-17 |
T-cell receptors identified by a personalized antigen-agnostic screening approach target shared neoantigen KRAS Q61H
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1509855
PMID:40165973
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研究论文 | 提出了一种个性化抗原无关筛选方法，识别针对共享新抗原KRAS Q61H的T细胞受体 | 开发了一种不依赖已知抗原的肿瘤特异性T细胞克隆型识别方法，并验证了其针对KRAS Q61H突变的治疗效果 | 样本量较小（7名NSCLC患者），且仅验证了部分预测的肿瘤特异性克隆型 | 开发一种抗原无关的方法来识别肿瘤特异性T细胞受体，以推进实体瘤的过继性细胞治疗 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者的肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）和邻近组织驻留淋巴细胞 | 免疫治疗 | 非小细胞肺癌 | scRNA-Seq, TCRβ-chain repertoire分析, TCR-T细胞工程 | NA | 基因表达数据, TCR序列数据 | 7名NSCLC患者 |
| 323 | 2025-05-17 |
Enhancing pancreatic cancer treatment: the role of H101 oncolytic virus in irreversible electroporation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1546242
PMID:40170848
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研究论文 | 本研究探讨了H101溶瘤病毒与不可逆电穿孔（IRE）联合治疗胰腺癌的效果及其机制 | 首次提出将H101溶瘤病毒作为IRE治疗的补充手段，通过激活JNK-MAPK通路增强治疗效果 | 研究主要基于细胞实验和小鼠模型，尚未进行人体临床试验 | 提高胰腺癌治疗效果 | 胰腺癌细胞和小鼠皮下肿瘤模型 | 肿瘤治疗 | 胰腺癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | 小鼠皮下肿瘤模型 | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量 |
| 324 | 2025-05-17 |
Single-cell sequencing in non-obstructive azoospermia: insights from primary and re-analysis studies
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1539063
PMID:40177631
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综述 | 本文系统评价了10项原发性研究和22项二次研究，探讨单细胞测序在非梗阻性无精子症中的应用及其分子机制 | 整合了原发性与二次分析研究，揭示了转录调控因子、RNA转录、内分泌干扰物和微管细胞骨架在精子发生障碍中的新作用 | 缺乏将单细胞研究成果转化为临床应用的深入讨论 | 探讨单细胞测序在非梗阻性无精子症研究中的应用及其分子机制 | 人类睾丸组织中的生殖细胞、支持细胞和间质细胞 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 10项原发性研究和22项二次研究的数据 |
| 325 | 2025-05-17 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing reveals SH3D21 promotes hepatocellular carcinoma progression by activating the PI3K/AKT/mTOR pathway
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0302766
PMID:40179068
|
研究论文 | 本研究通过整合大量和单细胞RNA测序数据，揭示了SH3D21通过激活PI3K/AKT/mTOR通路促进肝细胞癌进展的机制 | 首次揭示了SH3D21作为新型遗传生物标志物在肝细胞癌中的表达和功能，并阐明其通过PI3K/AKT/mTOR通路促进肿瘤进展的机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探究SH3D21在肝细胞癌中的表达特征、临床意义及其促癌机制 | 肝细胞癌患者样本和癌细胞系 | 癌症基因组学 | 肝细胞癌 | RNA测序（bulk和单细胞）、qRT-PCR、CCK-8实验、集落形成实验、Western blot | NA | RNA测序数据、实验数据 | 来自TCGA、ICGC和GEO数据库的样本数据 |
| 326 | 2025-05-17 |
Predicting and comparing transcription start sites in single cell populations
2025, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012878
PMID:40179341
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研究论文 | 该研究开发了一个名为scTSS的计算流程，用于预测和比较单细胞群体中的转录起始位点（TSS） | scTSS能够同时处理配对端和单端5'单细胞RNA测序数据，并进行差异TSS使用分析 | 当前方法主要针对配对端数据，对单端数据的潜力开发不足 | 开发一个计算流程来预测和比较单细胞群体中的转录起始位点 | 单细胞RNA测序数据中的转录起始位点 | 生物信息学 | NA | 5'单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Binomial广义线性混合模型 | RNA测序数据 | 两种不同疾病的单细胞数据 |
| 327 | 2025-05-17 |
Unraveling the spatial and signaling dynamics and splicing kinetics of immune infiltration in osteoarthritis synovium
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1521038
PMID:40181977
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示了骨关节炎滑膜中免疫浸润的空间动态、剪接动力学和信号通路 | 首次构建了骨关节炎滑膜的空间和转录图谱，鉴定了驱动免疫浸润的关键基因和转录因子，并提出了潜在的治疗药物 | 样本量相对较小（8例OA和4例健康样本），需要在更大队列中验证发现 | 解析骨关节炎滑膜中免疫浸润的空间动态和分子机制 | 骨关节炎患者和健康对照的滑膜组织 | 数字病理 | 骨关节炎 | scRNA-seq, 空间转录组学, Spatrio, STT分析, NMF, CellPhoneDB, pyLIGER | 空间转移张量(STT), 非负矩阵分解(NMF) | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 12例样本（8例OA患者和4例健康对照） |
| 328 | 2025-05-17 |
Comprehensive sequencing of the lung neuroimmune landscape in response to asthmatic induction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1518771
PMID:40181989
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序技术探索了哮喘诱导对肺神经免疫转录组的影响 | 首次全面测序了哮喘诱导后肺神经免疫景观的变化，并揭示了特定神经元簇和空间分布模式 | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类样本 | 探究哮喘诱导如何改变肺神经免疫转录组 | 小鼠的迷走神经节(结状/颈静脉神经节)和肺组织 | 神经免疫学 | 哮喘 | 标准RNA测序、单核RNA测序、空间RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量，使用naïve小鼠和经链格孢属诱导的哮喘小鼠 |
| 329 | 2025-05-17 |
Temporal and spatial distribution of histone acetylation in mouse molar development
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19215
PMID:40183048
|
研究论文 | 本研究通过小鼠磨牙模型，揭示了组蛋白乙酰化修饰在牙齿发育过程中的时空分布及其作用机制 | 首次系统地描绘了组蛋白H3和H4及其乙酰化位点在牙齿形成过程中的分布模式，并鉴定了关键组蛋白乙酰转移酶和去乙酰化酶 | 研究仅基于小鼠模型，人类牙齿发育中的组蛋白乙酰化机制仍需进一步验证 | 揭示组蛋白乙酰化修饰与牙齿发育之间的关联 | 小鼠磨牙发育过程中的组蛋白乙酰化修饰 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 组织切片图像 | 小鼠磨牙发育不同阶段的样本 |
| 330 | 2025-05-17 |
Characterizing macrophage diversity in colorectal malignancies through single-cell genomics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1526668
PMID:40191203
|
review | 本文综述了单细胞基因组学在结直肠恶性肿瘤中巨噬细胞多样性研究中的应用 | 通过单细胞RNA测序技术揭示肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其潜在功能分类 | 缺乏对巨噬细胞多样性命名和分子特征的统一解释 | 探讨结直肠恶性肿瘤中巨噬细胞多样性的特征及其在肿瘤微环境中的作用 | 结直肠恶性肿瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞基因组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 331 | 2025-05-17 |
Successful cryopreservation of marine invertebrates immune cells enables long-term studies of common octopus, Octopus vulgaris Cuvier 1797, hemocyte immune functions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1543587
PMID:40191212
|
研究论文 | 本文研究了普通章鱼血细胞的冷冻保存技术，以支持其免疫功能的长期研究 | 首次展示了冷冻保存的章鱼血细胞的功能性结果，并确定了最佳的冷冻保存介质和程序 | 研究仅针对普通章鱼，未涵盖其他软体动物物种 | 开发冷冻保存技术以支持章鱼免疫细胞的长期功能研究 | 普通章鱼（Octopus vulgaris）的血细胞 | 细胞生物学 | NA | 冷冻保存技术，单细胞测序 | NA | 细胞功能数据，基因表达数据 | 冷冻保存15周后的章鱼血细胞样本 |
| 332 | 2025-05-17 |
Molecular biology of the deadliest cancer - glioblastoma: what do we know?
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530305
PMID:40191211
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review | 本文综述了胶质母细胞瘤的分子生物学特性及其微环境，强调了其生物特性和分子通讯模式 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了胶质母细胞瘤微环境的新见解，提出了个性化多免疫疗法的必要性 | NA | 总结当前关于胶质母细胞瘤及其微环境的知识，探讨个性化治疗的可能性 | 胶质母细胞瘤细胞及其微环境 | 分子生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 333 | 2025-05-17 |
Single-cell transcriptomics reveals immunosuppressive microenvironment and highlights tumor-promoting macrophage cells in Glioblastoma
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0312764
PMID:40193323
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research paper | 通过单细胞转录组学揭示胶质母细胞瘤中的免疫抑制微环境，并突出肿瘤促进性巨噬细胞的作用 | 鉴定了五种不同的肿瘤相关巨噬细胞亚型，并发现TAM_MRC1亚型具有明显的M2极化特征，同时发现了一种具有耗竭表型的NK细胞亚型CD56dim_DNAJB1 | 样本量相对较小（24名患者的48个肿瘤片段），可能影响结果的普遍性 | 揭示胶质母细胞瘤微环境中的细胞异质性和复杂性，为免疫治疗提供潜在靶点 | 胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织 | digital pathology | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 24名患者的48个肿瘤片段 |
| 334 | 2025-05-17 |
Single-cell analysis reveals potential therapeutic markers of peripheral blood mononuclear cells from bladder cancer patients
2025, Brazilian journal of medical and biological research = Revista brasileira de pesquisas medicas e biologicas
DOI:10.1590/1414-431X2025e14002
PMID:40367012
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析膀胱癌患者外周血单个核细胞，揭示潜在的治疗标志物 | 首次在膀胱癌患者外周血单个核细胞中鉴定出LAG-3和TIM-3等新型潜在免疫检查点抑制剂靶点，并发现多个与肿瘤进展相关的细胞亚群及其特征基因 | 样本量相对较小（仅包括患者和一名健康供体），且未进行功能验证实验 | 探索膀胱癌免疫治疗的潜在新靶点和生物标志物 | 膀胱癌患者和健康供体的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 44,022个细胞（来自膀胱癌患者和一名健康供体的外周血单个核细胞样本） |
| 335 | 2025-05-17 |
The CD38+HLA-DR+ T cells with activation and exhaustion characteristics as predictors of severity and mortality in COVID-19 patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577803
PMID:40370439
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研究论文 | 该研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序技术，分析了COVID-19患者外周免疫细胞的特征，发现CD38+HLA-DR+ T细胞的扩增与疾病严重程度和死亡率相关 | 首次将CD38+HLA-DR+ T细胞确定为COVID-19预后的新型生物标志物，并揭示了其独特的激活-耗竭表型及对NAD+代谢的影响 | 样本来源仅限于外周血，未评估组织中的免疫细胞特征；研究人群的多样性可能有限 | 寻找COVID-19的新型治疗靶点和早期预测生物标志物 | 健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者的外周免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，但包括健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者三类人群 |
| 336 | 2025-05-17 |
Single-cell transcriptome reveals potential mechanisms for gout in children
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577109
PMID:40370447
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了儿童痛风的分子机制 | 揭示了CD14+单核细胞和DN T细胞在儿童痛风中的关键作用，以及与成人痛风的异同 | 样本来源仅限于外周血，未涉及痛风关节组织 | 探索儿童痛风的分子机制 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本 | 生物医学 | 痛风 | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本（具体数量未说明） |
| 337 | 2025-05-17 |
Exploration the role of pro-inflammatory fibroblasts and related markers in periodontitis: combing with scRNA-seq and bulk-seq data
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1537046
PMID:40370461
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组数据分析，探索了促炎性牙龈成纤维细胞（PIGFs）在牙周炎中的作用及其相关分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与牙周炎发展密切相关的促炎性牙龈成纤维细胞亚群，并发现MME和TSPAN11两个基因作为潜在治疗靶点 | 研究样本量有限，且未在更大人群中验证MME和TSPAN11的临床效果 | 探索促炎性牙龈成纤维细胞在牙周炎发病机制中的作用及其分子机制 | 牙龈成纤维细胞（GFs）及其亚群促炎性牙龈成纤维细胞（PIGFs） | 数字病理学 | 牙周炎 | scRNA-seq, bulk-seq, qPCR, 免疫荧光染色 | 多种机器学习算法 | RNA测序数据 | 来自正常和牙周炎患者的scRNA-seq数据 |
| 338 | 2025-05-17 |
Unraveling the role of histone acetylation in sepsis biomarker discovery
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1582181
PMID:40370519
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序数据，结合机器学习算法，发现了与组蛋白乙酰化相关的脓毒症生物标志物 | 首次将组蛋白乙酰化与脓毒症生物标志物发现联系起来，并利用多种机器学习算法和孟德尔随机化方法进行验证 | 研究样本量未明确说明，且需要进一步临床验证 | 发现脓毒症早期诊断和预后的有效生物标志物 | 脓毒症患者（具体样本信息未提供） | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化 | LASSO, SVM-RFE, Boruta | 基因表达数据 | NA |
| 339 | 2025-05-17 |
Resveratrol targeting MDM2/P53/PUMA axis to inhibit colonocyte apoptosis in DSS-induced ulcerative colitis mice
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1572906
PMID:40371345
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research paper | 该研究探讨了白藜芦醇通过调节MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡，从而治疗DSS诱导的溃疡性结肠炎的潜力 | 揭示了白藜芦醇通过MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡的新机制，并验证了MDM2作为溃疡性结肠炎治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中进行验证 | 研究白藜芦醇在溃疡性结肠炎治疗中的作用机制和疗效 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型和体外培养的结肠细胞 | 生物医学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序、免疫荧光染色、腺相关病毒系统 | 小鼠溃疡性结肠炎模型 | 实验数据 | 未明确说明样本数量 |
| 340 | 2025-05-17 |
Detecting global and local hierarchical structures in cell-cell communication using CrossChat
2024-12-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54821-x
PMID:39627184
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研究论文 | 开发了一个名为CrossChat的计算框架，用于检测和分析细胞间通讯的全局和局部层次结构 | 提出了一个新颖的计算框架CrossChat，能够通过多分辨率聚类方法和树检测方法，全面分析细胞间通讯的层次结构 | NA | 理解和分析细胞间通讯的层次结构及其对复杂组织功能的调控作用 | 细胞间通讯的层次结构 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学（Spatial Transcriptomics） | 多分辨率聚类方法、树检测方法 | scRNA-seq数据、空间转录组数据 | 两个来自COVID-19患者的非空间scRNA-seq数据集、两个来自小鼠胚胎皮肤的空间转录组数据集 |