单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32540 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-11-11 |
CXCR6 sustains TRM-driven psoriasis relapse by CXCL16 chemotaxis and curcumol targeting
2025-Nov-01, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.066
PMID:41177431
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研究论文 | 本研究揭示CXCR6/CXCL16轴通过调控组织驻留记忆T细胞（TRM）介导银屑病复发，并证实姜黄醇可通过靶向该轴抑制疾病复发 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和CXCR6基因敲除模型，系统阐明CXCR6/CXCL16轴在TRM细胞维持和银屑病复发中的核心调控机制，并发现姜黄醇的靶向治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证相对有限，姜黄醇的临床转化效果需进一步验证 | 阐明CXCR6/CXCL16轴在银屑病复发中的作用机制并探索靶向治疗策略 | 银屑病患者临床样本、imiquimod诱导的小鼠银屑病模型、TRM细胞 | 单细胞生物学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, 免疫荧光, 基因敲除 | CXCR6基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 细胞表型数据 | 未明确样本数量，包含临床样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 322 | 2025-11-11 |
Spatial Transcriptomics Reveals Injured Cells, Signature Genes, and Communication Patterns in the Cyst Microenvironment of Polycystic Kidney Disease
2025-Oct-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000894
PMID:41071604
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 323 | 2025-11-11 |
Single-cell sequencing analysis and multiple machine learning methods identified immune-associated SERPINB1 and CPEB4 as novel biomarkers for COVID-19-induced ARDS
2025-Sep-02, Die Naturwissenschaften
DOI:10.1007/s00114-025-02016-9
PMID:40892227
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研究论文 | 通过单细胞测序分析和多种机器学习方法鉴定SERPINB1和CPEB4作为COVID-19诱发ARDS的新型免疫相关生物标志物 | 首次通过整合单细胞RNA测序和三种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)识别出COVID-19诱发ARDS的新型免疫相关生物标志物 | 研究基于公共数据集，需要进一步实验验证 | 识别COVID-19诱发急性呼吸窘迫综合征的有效分子生物标志物 | COVID-19诱发的急性呼吸窘迫综合征患者 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 加权基因共表达网络分析 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | RNA测序数据 | 来自三个公共数据集(GSE172114、GSE149878、GSE213313)的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 324 | 2025-11-11 |
Progress and new challenges in image-based profiling
2025-Aug-07, ArXiv
PMID:40799808
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综述 | 回顾基于图像的细胞表型分析领域的技术进展与新兴挑战 | 深度学习彻底重塑了基于图像的细胞表型分析，改进了特征提取、可扩展性和多模态数据整合能力 | 该领域仍面临需要创新解决方案的重大挑战 | 为研究人员提供导航这一快速发展领域进展和新挑战的路线图 | 基于图像的细胞表型分析技术 | 计算机视觉 | NA | 显微镜成像技术 | 深度学习 | 图像 | NA | NA | 单细胞分析 | NA | NA |
| 325 | 2025-11-11 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组技术解码HepaRG细胞在多种化学物质暴露下的细胞应激状态 | 应用TempO-LINC平台系统分析多种化学物质诱导的细胞应激反应通路，揭示细胞亚群异质性应激表型 | 仅使用HepaRG细胞系，未涉及原代细胞或体内模型 | 开发基于单细胞转录组学的毒理学细胞应激状态解码方法 | HepaRG肝细胞系 | 单细胞组学 | 毒理学 | 单细胞转录组测序 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 约40,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC | TempO-LINC单细胞转录组平台 |
| 326 | 2025-11-11 |
Correction: Exposing the cellular situation: findings from single-cell RNA sequencing in breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1709624
PMID:41208986
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correction | 对乳腺癌单细胞RNA测序研究文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | breast cancer | single-cell RNA sequencing | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 327 | 2025-11-11 |
CORTADO: Hill Climbing Optimization for Cell-Type Specific Marker Gene Discovery
2024-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.23.630040
PMID:39763976
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研究论文 | 本文介绍了一种基于爬山优化算法的计算框架CORTADO，用于高效发现细胞类型特异性标记基因 | CORTADO通过优化差异表达、基因表达谱独特性和稀疏性三个关键特性，克服了传统方法仅依赖p值排序的局限性 | NA | 开发高效发现细胞类型特异性标记基因的计算方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群和标记基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 爬山优化算法 | 基因表达数据 | 多个数据集（包括DLPFC 151507、Zeisel小鼠脑数据集和外周血单核细胞数据集） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 328 | 2025-11-11 |
Wnt 3a-Modified Scaffolds Improve Nerve Regeneration by Boosting Schwann Cell Function
2024-Nov-20, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c15013
PMID:39520323
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析发现Wnt信号通路激活可促进修复性雪旺细胞转化，并开发了Wnt3a修饰的聚合物支架以改善周围神经再生 | 首次将Wnt3a蛋白整合到电纺纤维支架表面，并通过单细胞测序揭示了Wnt通路在促进雪旺细胞修复功能中的作用机制 | 研究仅在大鼠坐骨神经缺损模型中进行验证，尚未在更大型动物或临床环境中测试 | 探索Wnt信号通路在周围神经再生中的作用，并开发新型神经支架材料 | 雪旺细胞和大鼠坐骨神经缺损模型 | 组织工程 | 周围神经损伤 | 单细胞测序，电纺丝技术，氨化处理 | NA | 单细胞测序数据，组织学数据，神经电生理数据 | 大鼠坐骨神经缺损模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 329 | 2025-11-11 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
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研究论文 | 评估Element Biosciences的亲和性测序技术在单细胞RNA-seq中准确测序通过同聚物引物区域的能力及其对多聚腺苷酸化位点分析的影响 | 首次系统评估亲和性测序技术对单细胞RNA-seq中同聚物引物区域的测序能力，并开发改进的接头修剪和比对流程 | 与单端比对相比并未持续提高读段比对率，且未排除其他新兴平台可能具有类似性能 | 改进单细胞RNA-seq文库的表征方法，特别是多聚腺苷酸化位点的精确分析 | 单细胞RNA-seq文库 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA-seq, 亲和性测序 | NA | 测序数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq, DNA测序 | Element Aviti, Illumina测序平台 | Element Aviti亲和性测序平台，标准单细胞RNA-seq |
| 330 | 2025-11-10 |
Exploring the therapeutic role of thiabendazole in lung adenocarcinoma via network pharmacology and single-cell analysis
2025-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102548
PMID:41130017
|
研究论文 | 通过网络药理学和单细胞分析探索噻苯达唑在肺腺癌中的治疗作用 | 首次结合网络药理学和单细胞RNA测序技术系统研究抗寄生虫药物噻苯达唑在肺腺癌中的抗癌机制 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索噻苯达唑在肺腺癌治疗中的作用机制 | 肺腺癌相关基因和免疫细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 网络药理学, 分子对接 | LASSO回归, 支持向量机, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 多个GEO数据集(GSE136103, GSE10072, GSE19188, GSE19804, GSE30219, GSE40791) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 331 | 2025-11-10 |
HMOX1 expression influence the role of macrophage in EGFR-TKI resistance of lung adenocarcinoma
2025-Nov-07, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115795
PMID:41205382
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了HMOX1巨噬细胞在肺腺癌EGFR-TKI耐药中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序系统分析EGFR-TKI敏感与耐药肿瘤微环境的差异，发现HMOX1巨噬细胞在耐药肿瘤中富集并参与细胞间通讯 | 样本量相对有限（12例患者），需要更大规模研究验证发现 | 探究肿瘤微环境中非肿瘤细胞，特别是巨噬细胞在EGFR-TKI耐药中的作用 | 肺腺癌患者肿瘤组织中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 单细胞生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12例患者的7458个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 332 | 2025-11-10 |
Functional characterization of a calcium-dependent bacterial-binding C-type lectin from amphioxus
2025-Nov-07, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115777
PMID:41205384
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研究论文 | 本研究功能表征了文昌鱼中一种新型钙依赖性细菌结合C型凝集素AmphiCTL6 | 首次在文昌鱼中发现具有串联EGF样结构域和CTLD独特架构的C型凝集素，并证明其作为广谱模式识别受体的功能 | 仅对AmphiCTL6进行了体外功能验证，缺乏体内免疫功能研究的直接证据 | 研究基础脊索动物中C型凝集素的免疫功能多样性 | 日本文昌鱼(Branchiostoma japonicum)的C型凝集素AmphiCTL6 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 蛋白质重组表达, 结构域截断分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质结合数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 333 | 2025-11-10 |
Single-cell to pre-clinical evaluation of Trem2, Folr2, and Slc7a7 as macrophage-associated biomarkers for atherosclerosis
2025-Nov-07, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf210
PMID:41206594
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TRAP测序技术，评估Trem2、Folr2和Slc7a7作为动脉粥样硬化巨噬细胞相关生物标志物的潜力 | 首次系统评估Trem2作为循环生物标志物的潜力，并探索Folr2和Slc7a7作为PET示踪剂靶点的可能性，揭示了Slc7a7在泡沫细胞形成中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；PET示踪剂的应用潜力仍需进一步临床验证 | 阐明动脉粥样硬化中巨噬细胞驱动的机制，识别可用于诊断和治疗的生物标志物 | 动脉粥样硬化小鼠模型中的巨噬细胞，涉及主动脉、脂肪组织和肝脏 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,TRAP测序,PET成像 | NA | 基因表达数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录omics | NA | NA |
| 334 | 2025-11-10 |
Recent advances in reproductive biology: European innovations in embryo development and research†
2025-Nov-07, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf245
PMID:41206649
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综述 | 本文综述欧洲在生殖生物学领域的创新贡献，重点关注胚胎发育研究和单细胞转录组学技术的应用 | 开发合成胚胎模型展示多能细胞自组织能力，并利用高通量单细胞RNA测序揭示早期胚胎发育的分子通路 | 在实现模型可重复性和建立更稳健的植入模型方面仍存在挑战 | 推进生殖生物学和胚胎学研究，改善人类和动物的生育结果 | 哺乳动物早期胚胎发育过程和多能干细胞 | 生殖生物学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序，干细胞技术，生物工程技术 | 合成胚胎模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 335 | 2025-11-10 |
Human heart-macrophage assembloids mimic immune-cardiac interactions and enable arrhythmia disease modeling
2025-Nov-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.09.011
PMID:41151577
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研究论文 | 开发人类心脏-巨噬细胞组装体模型，模拟免疫-心脏相互作用并实现心律失常疾病建模 | 首次构建人类心脏-巨噬细胞组装体模型，整合自体人多能干细胞来源的胚胎单核细胞生成生理相关的心脏组织驻留巨噬细胞 | NA | 研究免疫-心脏相互作用机制，建立人类心脏发育和炎症驱动心律失常的体外模型 | 人类心脏-巨噬细胞组装体模型 | 疾病建模 | 心律失常 | 单细胞转录组学, 活体成像, 蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 图像数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 336 | 2025-11-10 |
3D-generation of high-purity midbrain dopaminergic progenitors and lineage-guided refinement of grafts supports Parkinson's disease cell therapy
2025-Nov-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.001
PMID:41151578
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研究论文 | 开发了一种三维分化方法SphereDiff，用于生成高纯度中脑多巴胺能祖细胞，并通过谱系引导优化提高帕金森病细胞治疗的安全性和有效性 | 开发了SphereDiff三维分化方法生成高纯度mDA祖细胞；利用单细胞空间转录组学揭示移植后细胞分布模式；采用交叉移植单细胞分裂条形码技术解析供体细胞克隆谱系命运 | 研究主要在PD模型小鼠中进行，尚未进行人体临床试验 | 提高帕金森病细胞治疗中中脑多巴胺能神经元的分化效率和移植后存活率 | 人类多能干细胞、中脑多巴胺能祖细胞、PD模型小鼠 | 再生医学 | 帕金森病 | 三维分化、单细胞空间转录组学、交叉移植单细胞分裂条形码 | NA | 转录组数据、空间分布数据 | PD模型小鼠 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 337 | 2025-11-10 |
Venetoclax plus gilteritinib is effective in preclinical models of FLT3-mutant BCL11B-a lineage-ambiguous leukemia
2025-Nov-06, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025028985
PMID:40811853
|
研究论文 | 本研究评估维奈托克联合吉列替尼在BCL11B-a谱系不明白血病临床前模型中的疗效 | 首次证明BCL-2抑制剂维奈托克与FLT3抑制剂吉列替尼联合治疗对BCL11B-a谱系不明白血病具有协同作用 | 研究仅限于临床前模型，尚未进行临床试验验证 | 探索BCL11B-a谱系不明白血病的靶向治疗策略 | BCL11B-a谱系不明白血病临床前模型 | 血液肿瘤学 | 白血病 | 单细胞RNA测序，BH3分析 | 临床前疾病模型 | 基因表达数据 | 多个临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 338 | 2025-11-10 |
Mapping CMV-related immune signatures in blood, aorta and perivascular mediastinal adipose tissue
2025-Nov-06, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0401
PMID:41194668
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研究论文 | 本研究通过分析心脏手术患者的血液、主动脉和血管周围纵隔脂肪组织，揭示了巨细胞病毒感染对免疫特征的系统性影响 | 首次在人类主动脉组织中揭示CMV感染导致HLA-C表达下降和干扰素-α信号通路抑制，同时发现表达CD57、GPR56和CX3CR1的CD8 T细胞在血液中增加 | 样本量较小（仅11名参与者），属于初步研究，需要更大规模研究验证 | 探究巨细胞病毒感染如何驱动系统性和组织特异性免疫变化，及其与心血管疾病的潜在关联 | 心脏手术患者的血液、主动脉组织和血管周围纵隔脂肪组织 | 免疫学 | 心血管疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、ELISA、MiloR分析、差异基因表达分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、血清学数据 | 11名心脏手术患者（4名CMV阴性，7名CMV阳性） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 339 | 2025-11-10 |
Molecular profiling of ex vivo prostate cancer CAF models captures stromal heterogeneity and drug vulnerabilities
2025-Nov-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02792-3
PMID:41198614
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研究论文 | 通过对前列腺癌相关成纤维细胞进行多组学分析，揭示其转录异质性并识别药物敏感性靶点 | 首次对初治前列腺癌患者来源的原代CAFs进行整合性单细胞多组学分析，发现SOX/FOX/STAT3转录因子网络调控促肿瘤CAF状态，并通过高通量药物筛选鉴定出靶向基质细胞的候选药物 | 仅纳入7例初治患者样本，样本量有限；研究局限于体外模型，未进行体内验证 | 探索前列腺癌相关成纤维细胞的表型异质性和药物敏感性 | 7例初治前列腺癌患者来源的原代癌症相关成纤维细胞 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，高通量药物敏感性检测 | NA | 单细胞转录组数据，药物筛选数据 | 7例初治前列腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 340 | 2025-11-10 |
Integration of Single-cell and bulk RNA sequencing data uncovers lymphatic metastasis-related prognostic genes and a predictive model in bladder cancer
2025-Nov-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22803-8
PMID:41198839
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，揭示了膀胱癌淋巴转移相关的预后基因并建立了预测模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据识别膀胱癌淋巴转移关键基因亚群，并构建了九基因预后模型 | NA | 识别膀胱癌关键预后基因和免疫微环境因子以提升临床评估能力 | 膀胱癌患者的原发肿瘤和淋巴结转移样本 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |