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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3361 | 2025-10-06 |
MeCP2 dysregulation inhibits mitophagy and impairs neural development in cortical organoids
2025-Jul-19, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.07.035
PMID:40691988
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研究论文 | 本研究探讨MeCP2通过调控BNIP3L表达调节线粒体自噬的分子机制及其在神经发育异常中的作用 | 首次在皮质类器官模型中揭示MeCP2通过占据BNIP3L转录起始位点调控线粒体自噬的新机制 | 研究主要基于体外类器官模型,需要进一步在体实验验证 | 探索MeCP2调控线粒体自噬的分子机制及其在神经发育障碍中的作用 | MeCP2突变诱导多能干细胞分化的皮质类器官 | 神经发育生物学 | 神经发育障碍 | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | 皮质类器官模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | MeCP2突变诱导多能干细胞分化的皮质类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3362 | 2025-10-06 |
Recreating pathophysiology of CLN2 disease and demonstrating reversion by TPP1 gene therapy in hiPSC-derived retinal organoids and retina-on-chip
2025-Jul-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102244
PMID:40706588
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研究论文 | 本研究利用hiPSC来源的视网膜类器官和视网膜芯片系统重建CLN2疾病病理生理学,并证明TPP1基因治疗的逆转效果 | 首次建立人类相关的微生理视网膜疾病模型,揭示CLN2病理生理学新机制,并证明AAV介导的TPP1基因治疗的潜力 | 研究主要基于体外模型,需要进一步体内验证 | 重建CLN2疾病病理生理学并评估基因治疗效果 | hiPSC来源的视网膜类器官、视网膜色素上皮细胞和视网膜芯片系统 | 数字病理学 | 神经元蜡样脂褐质沉积症2型 | 单细胞RNA测序,基因治疗 | 视网膜类器官模型,视网膜芯片系统 | 基因表达数据,组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3363 | 2025-10-06 |
Interferon-responsive HEVs drive tumor tertiary lymphoid structure formation and predict immunotherapy response in nasopharyngeal carcinoma
2025-Jul-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102200
PMID:40543508
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和泛癌单细胞图谱,揭示了鼻咽癌中三级淋巴结构的特征,并发现干扰素应答性高内皮微静脉通过分泌CXCL9驱动TLS形成并预测免疫治疗反应 | 首次发现干扰素应答性高内皮微静脉(IFN-HEVs)亚群在肿瘤TLS形成中的关键作用,并开发了CXCL9-TLS反应预测评分系统(CTRscore) | 研究主要聚焦于鼻咽癌,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探究肿瘤三级淋巴结构形成的驱动因素及其在免疫检查点阻断治疗反应预测中的作用 | 鼻咽癌患者样本 | 空间转录组学 | 鼻咽癌 | 空间转录组学, 单细胞测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞数据 | 三个独立的鼻咽癌队列 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3364 | 2025-10-06 |
Cardiolipin-mimic lipid nanoparticles without antibody modification delivered senolytic in vivo CAR-T therapy for inflamm-aging
2025-Jul-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102209
PMID:40602406
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研究论文 | 开发了一种基于心磷脂模拟脂质纳米颗粒的体内CAR-T细胞疗法,用于治疗衰老相关炎症疾病 | 首次使用无需抗体修饰的心磷脂类似二磷酰胺脂质实现T细胞靶向递送,并利用环状RNA延长mRNA表达时间 | NA | 开发新型体内CAR-T细胞疗法治疗衰老相关炎症疾病 | T细胞、肝脏纤维化、类风湿性关节炎 | 免疫治疗 | 肝脏纤维化、类风湿性关节炎 | mRNA递送、单细胞测序、scFv人源化筛选 | CAR-T细胞疗法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3365 | 2025-10-06 |
Exploring the role of neutrophil extracellular traps in colorectal cancer: Insights from single-cell sequencing
2025-Jul-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i7.107589
PMID:40697221
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综述 | 探讨中性粒细胞胞外诱捕网在结直肠癌中的生物学功能、分子机制及单细胞测序技术在该领域的应用 | 整合单细胞测序技术研究NETs在结直肠癌中的作用机制,为开发新型诊断标志物和靶向治疗策略提供新视角 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究的理论分析 | 阐明NETs在结直肠癌肿瘤微环境中的作用机制及治疗潜力 | 结直肠癌肿瘤微环境中的中性粒细胞胞外诱捕网 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3366 | 2025-10-06 |
Myeloid-specific deficiency of ribosomal protein L13a alters macrophage polarity and diversity during differentiation from bone marrow
2025-Jul-09, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf102
PMID:40631353
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研究论文 | 本研究揭示了核糖体蛋白L13a在骨髓来源巨噬细胞分化和极化过程中的新作用 | 首次发现核糖体蛋白L13a通过新型中间效应因子调控巨噬细胞极化和多样性,超越了传统的M1-M2二元概念 | 研究主要基于体外骨髓来源巨噬细胞分化模型,体内验证尚不充分 | 探究核糖体蛋白L13a在巨噬细胞极化和多样性调控中的作用机制 | 骨髓来源巨噬细胞和CD4+ T细胞 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 体外分化模型 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 对照组和髓系特异性L13a敲除小鼠的骨髓细胞 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
3367 | 2025-10-06 |
Cholinergic neuron-to-glioblastoma synapses in a human iPSC-derived co-culture model
2025-Jul-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102534
PMID:40541171
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研究论文 | 本研究利用人源iPSC衍生的胆碱能神经元与胶质母细胞瘤类器官共培养系统,揭示了胆碱能神经元通过突触连接促进胶质母细胞瘤进展的机制 | 首次在完全人源细胞系统中证明胆碱能神经元与胶质母细胞瘤之间形成功能性突触连接,并发现这种相互作用通过胆固醇生物合成途径促进肿瘤增殖 | 研究基于体外共培养模型,尚未在体内环境中验证;主要关注胆碱能神经元,未全面比较其他神经递质系统 | 探究胆碱能神经回路在胶质母细胞瘤生物学中的作用机制 | 患者来源的胶质母细胞瘤类器官和人iPSC衍生的胆碱能神经元 | 癌症神经科学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 钙成像, 跨单突触追踪, 电子显微镜 | 共培养模型 | 基因表达数据, 影像数据, 超微结构数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3368 | 2025-10-06 |
Metabolic reprogramming in astrocytes prevents neuronal death through a UCHL1/PFKFB3/H4K8la positive feedback loop
2025-Jul, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01467-x
PMID:40016338
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研究论文 | 本研究揭示了星形胶质细胞通过UCHL1/PFKFB3/H4K8la正反馈环路进行代谢重编程以保护神经元免于死亡的机制 | 首次发现UCHL1/PFKFB3/H4K8la正反馈环路在星形胶质细胞代谢重编程中的关键作用 | 研究主要聚焦于脊髓损伤模型,其他神经系统疾病中的适用性需进一步验证 | 探究星形胶质细胞代谢重编程在脊髓损伤后神经元保护中的作用机制 | 星形胶质细胞、神经元、脊髓损伤模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
3369 | 2025-10-06 |
De novo TANC2 variants caused developmental and epileptic encephalopathy and epilepsy
2025-Jul, Epilepsia
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/epi.18358
PMID:40110879
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研究论文 | 本研究通过外显子测序和功能实验证实TANC2基因是癫痫和发育性癫痫性脑病的致病基因 | 首次系统揭示TANC2基因变异与癫痫表型的关联,并建立基因型-表型相关性 | 样本量较小(仅6个病例),需要更大队列验证 | 探索TANC2基因与癫痫的关联及其表型变异机制 | 癫痫患者和果蝇模型 | 神经遗传学 | 癫痫 | 外显子测序,单细胞RNA测序 | 果蝇模型,脑类器官 | 基因组数据,转录组数据 | 6个无关病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3370 | 2025-10-06 |
Identification of Crosstalk Genes Between Primary Sjögren's Syndrome and Primary Biliary Cirrhosis by Transcriptome Analysis
2025-Jul, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-025-08917-z
PMID:40199818
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研究论文 | 通过转录组分析识别原发性干燥综合征与原发性胆汁性胆管炎之间的串扰基因 | 首次通过整合差异表达分析、WGCNA和LASSO回归识别出pSS和PBC之间的7个关键串扰基因 | 研究基于公共数据库的转录组数据,需要进一步实验验证 | 探索原发性干燥综合征与原发性胆汁性胆管炎之间的分子关联机制 | 原发性干燥综合征和原发性胆汁性胆管炎患者的转录组数据 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 转录组分析, 差异表达分析, WGCNA, LASSO回归, ssGSEA, 单细胞转录组分析 | LASSO回归模型, 多元逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的两个数据集(GSE66795和GSE119600) | NA | 转录组测序, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
3371 | 2025-10-06 |
Mobilizing antigen-presenting mast cells in anti-PD-1-refractory triple-negative breast cancer: a phase 2 trial
2025-Jul, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03776-7
PMID:40563015
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现抗原呈递肥大细胞(apMCs)与PD-1抑制剂疗效的关联,并开展二期临床试验验证色甘酸钠联合抗PD-1治疗对难治性三阴性乳腺癌的疗效 | 首次揭示肥大细胞在肿瘤免疫调控中的关键作用,发现色甘酸钠可动员apMCs增强T细胞免疫,为克服抗PD-1耐药提供新策略 | 样本量有限(44例单细胞分析,484例验证),研究聚焦三阴性乳腺癌,结果可能不适用于其他癌症类型 | 探索克服三阴性乳腺癌抗PD-1治疗耐药的新机制和临床策略 | 三阴性乳腺癌患者(初治44例,验证队列484例,临床试验为难治性转移性三阴性乳腺癌女性患者) | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 44例初治患者单细胞分析,484例独立验证,二期临床试验患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3372 | 2025-10-06 |
A novel subset of inflammation-related liver NK cells modulates immune responses in a murine model of primary biliary cholangitis
2025-Jul, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2025.103454
PMID:40609234
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研究论文 | 本研究在原发性胆汁性胆管炎中发现并鉴定了一类新型炎症相关自然杀伤细胞亚群 | 首次鉴定出具有CD49aCXCR6特征的新型炎症相关NK细胞亚群,并阐明其从常规NK细胞分化及通过TNF-α调控免疫反应的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分 | 探究原发性胆汁性胆管炎中新型免疫细胞亚群的功能机制 | 小鼠PBC模型(ARE-Del小鼠)和PBC患者肝脏样本 | 免疫学 | 自身免疫性肝病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | PBC小鼠模型和患者肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
3373 | 2025-10-06 |
Guard cells on the adaxial and abaxial leaf surfaces use different compositions of potassium ion channels to drive light-induced stomatal opening
2025-Jul, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02026-5
PMID:40634560
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研究论文 | 本研究揭示了植物叶片上下表皮保卫细胞通过不同钾离子通道组成驱动光诱导气孔开放的分子机制 | 首次发现植物上下表皮保卫细胞利用不同钾离子通道控制气孔光响应 | 研究主要基于拟南芥和烟草模型植物,在其他植物中的普适性需进一步验证 | 探究植物叶片上下表皮气孔对光响应差异的分子机制 | 拟南芥和烟草的保卫细胞 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序,计算机模拟 | OnGuard模拟 | 基因表达数据 | 拟南芥和烟草的保卫细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
3374 | 2025-10-06 |
OM-85, a Bacterial Lysate, Reduces Pulmonary Nodule Malignant Probability: A Retrospective Study
2025-Jul, The clinical respiratory journal
DOI:10.1111/crj.70109
PMID:40692186
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研究论文 | 回顾性研究评估细菌裂解物OM-85对慢性支气管炎患者高危肺结节的干预效果 | 首次发现OM-85可通过提升NK细胞比例降低肺结节恶性概率 | 回顾性研究设计,样本量有限(72例治疗组/90例对照组) | 评估OM-85对高危肺结节的干预效果 | 慢性支气管炎伴高危肺结节患者 | 临床医学 | 肺癌 | 流式细胞术, 多重免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 医学影像, 分子生物学数据 | 162例患者(204个肺结节) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3375 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals Shen-Bai-Jie-Du decoction retards colorectal tumorigenesis by regulating the TMEM131-TNF signaling pathway-mediated differentiation of immunosuppressive dendritic cells
2025-Jul, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.05.013
PMID:40698132
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示参白解毒汤通过调控TMEM131-TNF信号通路介导的免疫抑制性树突细胞分化延缓结直肠肿瘤发生 | 首次构建小鼠和临床患者相互验证的单细胞转录组图谱,发现CCL22树突细胞的积累及其免疫抑制功能,并揭示参白解毒汤和黄连素通过TMEM131-TNF信号通路逆转这一过程 | 机制研究仍需进一步验证,特别是TMEM131作为黄连素潜在靶点的具体作用机制 | 探究参白解毒汤延缓结直肠肿瘤发生的分子机制 | 结直肠肿瘤微环境中的树突细胞 | 单细胞测序分析 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化, 流式细胞术, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 蛋白质表达数据 | 小鼠模型和临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
3376 | 2025-10-06 |
IDENTIFICATION OF DISEASE-SPECIFIC VULNERABILITY STATES AT THE SINGLE-CELL LEVEL
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.04.626873
PMID:40661457
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研究论文 | 本研究开发了一种计算流程,通过整合单细胞转录组数据和功能缺失筛选数据来识别胶质母细胞瘤中的疾病特异性脆弱状态 | 首次将单细胞分辨率转录组数据与CRISPR功能缺失筛选数据整合,识别出三种特征不同的单细胞脆弱状态 | 研究主要基于体外实验数据,需要进一步体内验证 | 识别胶质母细胞瘤中最关键的靶向细胞类型 | 胶质母细胞瘤肿瘤细胞 | 单细胞分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CRISPR筛选 | 迭代层次聚类 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 49个胶质母细胞瘤肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
3377 | 2025-10-06 |
Cell simulation as cell segmentation
2025-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02697-0
PMID:40404994
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Proseg的概率分割方法,通过细胞模拟技术改进单细胞空间转录组数据的细胞分割精度 | 采用从头细胞模拟方法推断形态学上合理的细胞边界,在多个商业平台上表现出优越性能和计算效率 | NA | 提高单细胞空间转录组数据中细胞分割的准确性 | 肾细胞癌患者样本中的肿瘤浸润免疫细胞(中性粒细胞和T细胞) | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞空间转录组学 | 概率分割模型 | 空间转录组数据 | NA | 多个商业平台(具体未指明) | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
3378 | 2025-10-06 |
CDKN1A as a potential target for Eltrombopag treatment in ITP and its regulation of the communication between macrophages and transitional B cells in ITP
2025-Jun, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06436-5
PMID:40515824
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,发现CDKN1A是影响ITP患者对Eltrombopag治疗反应的关键基因,并揭示了其在巨噬细胞与过渡B细胞通讯中的作用 | 首次发现CDKN1A作为Eltrombopag治疗ITP的关键调控因子,揭示了巨噬细胞通过TGFβ信号通路与过渡B细胞通讯的新机制 | 研究主要基于细胞系实验和生物信息学分析,需要进一步在临床样本中验证 | 鉴定ITP患者对Eltrombopag治疗反应的新型生物标志物,研究巨噬细胞和过渡B细胞在ITP发病机制中的作用 | 免疫性血小板减少症(ITP)患者、RAW264.7巨噬细胞系 | 生物信息学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA-seq、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、分子对接、siRNA敲低、质粒过表达 | Seurat | 基因表达数据、单细胞测序数据 | GSE112278和GSE196676数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3379 | 2025-10-06 |
GUIDING CLUSTERING AND ANNOTATION IN SINGLE-CELL RNA SEQUENCING USING THE AVERAGE OVERLAP METRIC
2025-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.06.652497
PMID:40654835
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研究论文 | 提出使用平均重叠度量来比较单细胞RNA测序中差异表达基因的排名列表,以指导细胞聚类和注释 | 首次将平均重叠度量应用于单细胞RNA测序数据分析,通过比较差异表达基因的排名来评估细胞簇之间的相似性 | NA | 开发一种能够稳健比较和注释单细胞RNA测序推断簇的方法 | T细胞群体和未分选的小鼠胸腺细胞 | 单细胞RNA测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类算法 | 单细胞转录组数据 | 包含高度相似但不同的T细胞群体数据集和未分选小鼠胸腺细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3380 | 2025-10-06 |
A human and mouse subpopulation of senescent β-cells induces pathologic dysfunction through targetable paracrine signaling
2025-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.07.648438
PMID:40654723
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研究论文 | 本研究通过鉴定人和小鼠衰老β细胞亚群,揭示其通过可靶向的旁分泌信号诱导病理功能障碍的机制 | 首次在人和小鼠中鉴定出表达特定标志物的衰老β细胞亚群,并证明其分泌的SASP因子可诱导继发性衰老和β细胞功能障碍 | NA | 研究衰老β细胞亚群的异质性及其在糖尿病病理过程中的作用 | 人和小鼠的胰腺β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 高脂饮食喂养的小鼠和来自2型糖尿病供体的人类胰岛 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |