单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 31780 篇文献,本页显示第 3341 - 3360 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3341 2025-10-06
Resolving microenvironment complexity and cellular heterogeneity in osteoarthritis via spatial transcriptomics
2025-Jul-14, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1
综述 本文探讨空间转录组学技术在解析骨关节炎微环境复杂性和细胞异质性中的应用与进展 系统阐述空间转录组学如何揭示骨关节炎中分区基因表达模式、致病细胞状态及细胞间相互作用 当前技术存在分辨率限制,需要与其他组学和成像技术整合 探索空间转录组学在骨关节炎研究中的应用潜力 骨关节炎关节组织(软骨、滑膜、软骨下骨、关节周围组织) 空间转录组学 骨关节炎 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3342 2025-10-06
Multimodal single-cell analyses reveal molecular markers of neuronal senescence in human drug-resistant epilepsy
2025-Mar-03, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 通过整合全细胞膜片钳记录和单细胞RNA测序方法,揭示耐药性癫痫中神经元衰老的分子标记 首次在耐药性癫痫患者脑组织中鉴定出具有衰老特征的皮质锥体神经元亚群,并发现其表达特定的衰老标记基因 研究样本量有限,且主要关注皮质锥体神经元,未全面评估其他神经元类型 探索耐药性癫痫患者脑组织中神经元的分子特征和病理机制 耐药性癫痫患者脑组织中的皮质锥体神经元和小鼠癫痫模型 神经科学 耐药性癫痫 全细胞膜片钳记录, 单细胞RNA测序 NA 电生理记录数据, 基因表达数据 耐药性癫痫患者脑组织样本和小鼠癫痫模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3343 2025-10-06
Sitravatinib in combination with nivolumab plus ipilimumab in patients with advanced clear cell renal cell carcinoma: a phase 1 trial
2025-Jan-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 评估sitravatinib联合nivolumab和ipilimumab三药疗法在晚期透明细胞肾细胞癌患者中的安全性和疗效 首次在晚期肾透明细胞癌中探索TKI抑制剂sitravatinib与双免疫检查点抑制剂联合治疗的安全性和初步疗效 样本量较小(22例患者),单臂I期试验设计缺乏对照组 确定sitravatinib联合nivolumab和ipilimumab三药疗法在晚期透明细胞肾细胞癌患者中的最佳剂量和安全性 22例先前未经治疗的晚期透明细胞肾细胞癌患者 NA 肾细胞癌 单细胞RNA测序 NA 临床数据,基因表达数据 22例患者(其中12例进行了纵向肿瘤活检单细胞RNA测序分析) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3344 2025-10-06
SNRPB2 in the pan-cancer landscape: A bioinformatics exploration and validation in hepatocellular carcinoma
2024-12, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 通过生物信息学分析和实验验证探讨SNRPB2在泛癌景观中的作用及其在肝细胞癌中的功能 首次系统研究SNRPB2在多种癌症类型中的表达模式及其与预后的关联,并通过实验验证其在肝癌细胞增殖和迁移中的功能 需要进一步探索其潜在机制和临床治疗潜力 研究SNRPB2在癌症发生发展中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 多种癌症类型和肝细胞癌细胞 生物信息学 肝癌 生物信息学分析,基因表达分析,基因组和表观基因组分析,基因集富集分析,免疫细胞浸润评估,单细胞测序 NA 基因表达数据,基因组数据,表观基因组数据,单细胞测序数据 来自TCGA、CPTAC和GEO等多个公共数据库的多种癌症样本 NA 单细胞测序 NA NA
3345 2025-10-06
SINGLE CELL DISSECTION OF DEVELOPMENTAL ORIGINS AND TRANSCRIPTIONAL HETEROGENEITY IN B-CELL ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA
2023-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞RNA测序分析B细胞急性淋巴细胞白血病的发育起源和转录异质性 首次使用单细胞RNA测序系统分析B-ALL样本,并与正常B细胞发育参考图谱比较,揭示白血病细胞起源和瘤内异质性 样本数量相对有限(89个B-ALL样本),部分亚型样本可能代表性不足 解析B-ALL的发育起源和转录异质性,改进临床和基因组分类 B细胞急性淋巴细胞白血病(B-ALL)患者样本 单细胞组学 B细胞急性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 89个B-ALL样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3346 2025-10-06
SpatialCVGAE: Consensus Clustering Improves Spatial Domain Identification of Spatial Transcriptomics Using VGAE
2025-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 提出一种用于空间转录组数据分析的共识聚类框架SpatialCVGAE,通过整合多个变分图自编码器的聚类结果提高空间域识别的稳定性 首次将共识聚类方法与变分图自编码器相结合用于空间转录组数据,通过整合多个潜在表示的聚类结果提高模型稳定性 未明确说明方法在超大型数据集上的计算效率,也未与其他集成学习方法进行系统比较 解决空间转录组数据聚类分析中的不稳定性和噪声问题 空间转录组数据中的空间域识别 空间转录组学 NA 空间转录组测序 VGAE(变分图自编码器), 共识聚类 空间转录组数据,基因表达矩阵,空间图数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3347 2025-10-06
Self-Supervised Graph Representation Learning for Single-Cell Classification
2025-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 提出一种名为scSSGC的自监督图表示学习框架用于单细胞分类 采用多K-means聚类任务进行自监督预训练,并引入局部增强图神经网络解决细胞图中邻居较少节点的信息聚合问题 未明确说明模型在极大规模数据集上的计算效率 开发计算生物学方法用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 单细胞RNA测序数据中的细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 图神经网络(GNN), 自监督学习 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3348 2025-10-06
ScAGCN: Graph Convolutional Network with Adaptive Aggregation Mechanism for scRNA-seq Data Dimensionality Reduction
2025-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 提出一种用于单细胞RNA测序数据降维的自适应聚合图卷积网络方法 设计了基于节点分布和相似性箱线图的邻域选择策略,并通过定义邻域节点与中心节点的相似性度量优化了聚合函数 NA 解决单细胞RNA测序数据的大规模、高维度、高噪声和高稀疏性带来的分析挑战 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 图卷积网络(GCN) 基因表达数据 15个真实单细胞RNA测序数据集,包括10个大规模数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3349 2025-10-06
Advances in single-cell omics: Transformative applications in basic and clinical research
2025-Aug, Current opinion in cell biology IF:6.0Q1
综述 本文综述了单细胞组学技术的最新进展及其在基础和临床研究中的变革性应用 强调单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学整合技术在解析复杂组织和识别独特细胞群体方面的突破性能力 作为综述文章,未涉及原始实验数据和研究方法的具体局限性 探讨单细胞组学技术在生物学研究和临床应用中的重要作用 复杂组织、细胞群体、细胞功能状态 生物信息学 癌症、神经发育障碍 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合、计算模型 计算模型 单细胞组学数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 NA NA
3350 2025-10-06
Insights into chondrocyte populations in cartilaginous tissues at the single-cell level
2025-Aug, Nature reviews. Rheumatology
综述 通过单细胞多组学技术揭示软骨组织中软骨细胞群体的异质性及其在疾病中的作用 利用单细胞转录组学实现对软骨细胞亚型更精细的功能注释分类 需要将先进单细胞技术与计算建模相结合以解析软骨细胞群体的动态相互作用 研究软骨细胞亚型在软骨形成、维持和疾病进展中的作用 软骨组织中的软骨细胞群体 单细胞生物学 骨关节炎、椎间盘疾病 单细胞多组学、单细胞转录组学 计算建模 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞多组学、单细胞转录组学 NA NA
3351 2025-10-06
Bioinspired 3D hydrogel scaffold to mimic tumor microenvironment for investigating into the anoikis resistance mechanisms in colorectal cancer
2025-Aug, Materials today. Bio
研究论文 开发了一种仿生复合水凝胶支架模拟肿瘤微环境,用于研究结直肠癌中的失巢凋亡抵抗机制 创建了由4-arm-PEGDA、明胶甲基丙烯酰和透明质酸甲基丙烯酰组成的仿生复合水凝胶,能形成紧凑的3D细胞球体模拟肿瘤微环境 NA 研究结直肠癌中失巢凋亡抵抗机制 结直肠癌细胞系Caco-2 生物医学工程 结直肠癌 单细胞RNA测序,放射组学分析 3D水凝胶支架模型 基因表达数据,影像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3352 2025-10-06
Activation of S1PR1 by Ponesimod for Multiple Sclerosis Therapy: Uncovering MAPK and PI3K Pathway Mechanisms and Repurposing Potential
2025-Jul-25, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
研究论文 本研究揭示了ponesimod通过激活S1PR1受体调控MAPK/ERK和PI3K-Akt通路治疗多发性硬化的分子机制 结合元动力学、单细胞转录组学和药物重定位方法,首次发现ponesimod引起S1PR1受体W269氨基酸构象变化并阐明其下游信号通路 未明确说明研究样本量,动物研究结果需进一步临床验证 阐明ponesimod治疗多发性硬化的分子机制并探索药物重定位策略 S1PR1受体及其信号通路,多发性硬化治疗 计算生物学 多发性硬化 元动力学模拟,单细胞转录组学,药物重定位 分子动力学模拟 分子模拟数据,转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3353 2025-10-06
Circulating Immune Cell Signature Analysis in HFpEF Across Species
2025-Jul-25, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 通过跨物种分析揭示HFpEF患者循环免疫细胞的独特转录特征 首次在HFpEF中识别肥胖相关和肥胖非依赖的免疫细胞特征,并在小鼠模型中验证抗炎治疗的改善效果 样本量较小(人类n=21),需要更大规模研究验证 探究HFpEF中系统性免疫反应的分子机制 HFpEF患者、HFrEF患者、健康对照者及HFpEF小鼠模型 单细胞基因组学 心血管疾病 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA RNA测序数据 人类21例(HFpEF 6例,HFrEF 8例,健康对照7例)+ HFpEF小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3354 2025-10-06
Single-Cell Sequencing Identifies the Crucial Role of Mitochondrial Fission-Fusion Imbalance in Heart Failure Progression
2025-Jul-25, Journal of cardiovascular translational research IF:2.4Q3
研究论文 本研究通过单细胞测序比较病理性和生理性心脏肥大的分子机制,发现线粒体分裂-融合失衡在心力衰竭进展中起关键作用 首次在单细胞水平揭示线粒体分裂-融合动态平衡在心脏肥大类型转换中的时间依赖性变化规律 研究仅基于动物模型,需要进一步验证在人类心脏组织中的适用性 阐明病理性和生理性心脏肥大的分子机制差异及其与心力衰竭发展的关系 TAC诱导的病理性心脏肥大和运动诱导的生理性心脏肥大小鼠模型 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3355 2025-10-06
NKG2D-mediated cytotoxicity of CD4 cytotoxic T cells in multiple myeloma
2025-Jul-24, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序技术揭示了多发性骨髓瘤中CD4+细胞毒性T细胞通过NKG2D介导的细胞毒性作用机制 首次在多发性骨髓瘤中系统鉴定CD4+细胞毒性T细胞亚群,并证明其通过NKG2D介导的直接杀伤功能与患者生存改善相关 研究样本仅来源于骨髓,未涉及其他组织部位;机制研究主要基于体外实验 探究多发性骨髓瘤中CD4+ T细胞的具体抗肿瘤作用机制 多发性骨髓瘤患者的骨髓CD4+ T细胞 免疫学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 NA 单细胞转录组数据, TCR序列数据 多发性骨髓瘤不同疾病阶段患者的骨髓样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3356 2025-07-26
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular Origin and Pathogenesis of Myofibroma in a Neonate: Case Report
2025-Jul-24, Pediatric blood & cancer IF:2.4Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3357 2025-10-06
Subtypes and proliferation patterns of small intestine neuroendocrine tumors revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Jul-23, eLife IF:6.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示小肠神经内分泌肿瘤的亚型和增殖模式 首次通过单细胞或单核RNA测序识别出小肠神经内分泌肿瘤的两个不同亚型,并发现神经内分泌细胞本身基本不增殖而其他非恶性细胞类型高度增殖的反常现象 样本量较小(仅10例小肠神经内分泌肿瘤和1例混合型肺肿瘤),需要更大规模研究验证 探究神经内分泌肿瘤的肿瘤发生机制、肿瘤组成和混合型神经内分泌非神经内分泌肿瘤现象 低级别小肠神经内分泌肿瘤和混合型肺肿瘤样本 数字病理学 神经内分泌肿瘤 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 NA 单细胞转录组数据 10例小肠神经内分泌肿瘤和1例混合型肺肿瘤 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3358 2025-10-06
Multi-omic Data Integration Reveals Drug Targets of Skin Fibrosis
2025-Jul-23, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过多组学数据整合和孟德尔随机化分析,识别了不同类型皮肤瘢痕的潜在药物靶点 首次在系统性、局部组织和单细胞水平上整合多组学数据,识别瘢痕亚型特异性药物靶点 需要多民族队列研究验证靶点的普遍性 识别不同类型皮肤瘢痕的潜在药物靶点 正常瘢痕(NS)、增生性瘢痕(HS)和瘢痕疙瘩 生物信息学 皮肤纤维化疾病 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 两样本孟德尔随机化 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 基于DECODE、EQTLGen、GTEx、ScQTLbase和FinnGen数据库的多个队列 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3359 2025-10-06
BMP-2 generates a functional bone marrow niche by inducing the differentiation of local mesenchymal cells into CAR cells
2025-Jul-22, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 本研究证实BMP-2通过诱导局部间充质细胞分化为CAR细胞,能够生成功能性骨髓微环境 首次证明BMP-2诱导的异位骨髓具有与天然骨髓相似的结构和功能,并鉴定出原位脂肪组织来源的CD51highCxcl12-GFP+细胞是CAR细胞的主要来源 未明确BMP-2诱导骨髓微环境形成的具体分子机制 验证BMP-2诱导的异位骨髓是否具有功能性骨髓微环境 小鼠骨髓微环境、造血干细胞、CAR细胞 干细胞与再生医学 骨髓相关疾病 单细胞RNA测序、移植模型、联体共生实验 NA 基因表达数据、移植实验数据 辐射处理的小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3360 2025-10-06
Single cell sequencing deciphering the heterogeneous landscape of blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasm with novel MYB-ZFAT fusion gene
2025-Jul-21, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 通过单细胞测序技术解析母细胞性浆细胞样树突状细胞肿瘤的异质性景观并发现新型MYB-ZFAT融合基因 首次在BPDCN患者中发现MYB-ZFAT基因融合,并揭示该疾病存在多样化的细胞群体,挑战了单一细胞类型的理论 研究基于单个BPDCN患者的临床样本,样本量有限,需要更多病例验证 探索BPDCN的分子基础和细胞异质性 母细胞性浆细胞样树突状细胞肿瘤患者 数字病理学 血液肿瘤 单细胞测序, FACS免疫分型, 核型分析, 转录组分析, 蛋白质结构分析 NA 单细胞测序数据, 临床样本, 组织学数据 1例BPDCN患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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