单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 39972 篇文献,本页显示第 3321 - 3340 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3321 2026-04-24
Integrated spatial and single‑cell transcriptomics maps disulfidptosis in renal cell carcinoma and reveals PDLIM1 as a prognostic biomarker and potential therapeutic target
2026-Apr-14, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 整合空间和单细胞转录组学绘制肾细胞癌中二硫下垂的图谱,并揭示PDLIM1作为预后生物标志物和潜在治疗靶点 首次在肾细胞癌中综合空间转录组学和单细胞RNA测序,系统绘制二硫下垂的异质性图谱,并鉴定PDLIM1作为新的预后生物标志物和治疗靶点 尚未在独立大样本队列中验证PDLIM1的临床价值,缺乏体内功能验证实验 阐明肾细胞癌中二硫下垂的组织分布及其临床相关性,并鉴定潜在生物标志物和治疗靶点 肾细胞癌组织样本(6例空间转录组学样本、4个单细胞RNA测序队列)和肾癌细胞系 机器学习 肾细胞癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序, RCTD反卷积, CytoTRACE分析, sh-RNA敲降 NA 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 6个肾癌切片的空间转录组数据和4个单细胞RNA测序队列 NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
3322 2026-04-24
STC2-mediated calcium homeostasis dysregulation in the osteosarcoma microenvironment: Insights from single-cell sequencing and machine learning
2026-Apr-14, Translational oncology IF:4.5Q1
研究论文 通过单细胞测序和机器学习分析,揭示STC2介导的钙稳态失调在骨肉瘤微环境中的作用 首次结合单细胞测序和多种机器学习算法,识别STC2作为骨肉瘤中钙稳态失调的关键预后基因,并探讨其在免疫治疗反应中的潜在预测价值 STC2与免疫检查点抑制剂反应之间的关联仍需要进一步验证 探究钙稳态失调在骨肉瘤进展中的作用,并识别关键预后基因 骨肉瘤细胞系(U2OS和143B)以及骨肉瘤微环境中的内皮细胞、成纤维细胞和恶性细胞 机器学习和数字病理学 骨肉瘤 单细胞测序 机器学习算法 单细胞表达谱数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3323 2026-04-24
[Preliminary study on the role of IL-1β+ neutrophils in bone regulation of periodontitis mice]
2026-Apr-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
研究论文 本研究探讨白细胞介素-1β阳性中性粒细胞在牙周炎小鼠骨调控中的作用及机制 首次揭示IL-1β+中性粒细胞通过TLR4-NF-κB信号通路抑制MC3T3-E1细胞成骨分化,为牙周炎骨再生免疫治疗提供新靶点 未提及明显局限性 探究IL-1β+中性粒细胞在牙周炎小鼠骨调控中的作用及机制 牙周炎小鼠模型及MC3T3-E1细胞 数字病理学 牙周炎 单细胞转录组测序, Micro-CT, 流式细胞术 NA 图像, 文本 20只8周龄雄性C57BL/6J小鼠 Illumina 单细胞RNA测序 NA NA
3324 2026-04-24
Substantially Altered Local and Systemic Immunity in Ischemia-Free Versus Conventional Liver Transplantation
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究比较了无缺血肝移植与传统肝移植对局部和全身免疫的影响,发现无缺血肝移植可通过减少中性粒细胞浸润、受体来源单核细胞浸润以及调节免疫细胞群体来减轻缺血再灌注损伤 通过构建免疫细胞嵌合图谱,首次揭示了无缺血肝移植通过抑制ANXA1-FPR1信号通路(经STAT3-HIF-1α途径)减少受体来源单核细胞浸润,并发现HMOX1在单核/巨噬细胞中的上调可提供移植物保护 未明确说明,但可能包括样本量有限、缺乏长期随访数据或机制验证不完全等 探究无缺血肝移植相比传统肝移植如何影响局部和全身免疫,以揭示其在减轻缺血再灌注损伤和潜在移植物排斥中的作用机制 肝移植受体(无缺血肝移植组与传统肝移植组)及其移植物和外周血样本 数字病理学 肝脏疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫组织化学,免疫荧光染色,多重细胞因子检测 NA 图像,文本 未明确说明,但涉及无缺血肝移植和传统肝移植受体组的移植物和外周血样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
3325 2026-04-24
Bufalin Inhibits the PI3K/AKT Pathway by Targeting GTF3C4 to Impede Breast Cancer Progression
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究揭示蟾蜍灵通过靶向GTF3C4抑制PI3K/AKT通路阻碍乳腺癌进展 首次鉴定GTF3C4为蟾蜍灵的直接作用靶点,并阐明其通过调控PI3K/AKT通路和肿瘤微环境发挥抗乳腺癌作用 摘要中未提及具体局限性 探索蟾蜍灵抑制乳腺癌进展的分子机制 乳腺癌细胞系MDA-MB-231和MCF-7,以及小鼠乳腺癌模型 机器学习 乳腺癌 RNA测序,单细胞RNA测序,限制性蛋白酶解-质谱分析,细胞热位移分析,药物亲和反应靶标稳定性分析,表面等离子体共振 NA RNA测序数据 MDA-MB-231和MCF-7细胞系,小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq,RNA-seq NA NA
3326 2026-04-24
Fibroblast Activation Protein Promotes Thoracic Aortic Dissection via PLAUR/ITGB1-Mediated Pro-inflammatory Macrophage Polarization
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究了成纤维细胞激活蛋白通过PLAUR/ITGB1介导的促炎性巨噬细胞极化促进胸主动脉夹层的机制 首次发现FAP通过非酶活性区域与巨噬细胞PLAUR直接结合,激活ITGB1/FAK信号通路,促进巨噬细胞促炎表型,驱动胸主动脉夹层进展 研究主要基于动物模型和小样本人类标本,缺乏大规模临床验证;且未深入探讨FAP在其他细胞类型中的作用 阐明FAP在胸主动脉夹层发病机制中的具体作用和分子机制,为开发靶向治疗策略提供依据 人胸主动脉夹层组织标本、β-氨基丙腈诱导的胸主动脉夹层小鼠模型、成纤维细胞特异性Fap基因敲除小鼠 机器学习 心血管疾病 NA NA 测序数据 人类胸主动脉夹层标本(具体数目未提及)和小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
3327 2026-04-24
DSG2+ Cancer Stem Cells Co-Located With FAP+ Myofibroblasts in the Tumor Boundary That Determines the Efficacy of Immunotherapy in Non-Small Cell Lung Cancer
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 整合单细胞RNA测序与空间转录组学,揭示非小细胞肺癌中DSG2+癌症干细胞与FAP+肌成纤维细胞在肿瘤边界的共定位关系及其对免疫治疗疗效的影响 首次通过空间转录组学定位DSG2+癌症干细胞在肿瘤边界的富集,并阐明其与FAP+肌成纤维细胞形成特定微环境,以MMP依赖方式促进肿瘤干细胞表型和治疗耐药 未明确提及研究局限性 解析非小细胞肺癌中癌症干细胞的转录程序与空间组织,及其对治疗耐药的影响 非小细胞肺癌组织和细胞系中的癌症干细胞与肌成纤维细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光, 共培养实验 加权基因共表达网络分析 基因表达数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 独立临床蛋白质组数据集(未具体说明样本数量) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'试剂盒, 10x Visium FFPE空间基因表达试剂盒, Illumina NovaSeq测序平台
3328 2026-04-24
PDZK1-ULK1 Axis Triggers Lipophagy to Inhibit Tumor Progression and Sunitinib Resistance in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 揭示PDZK1-ULK1轴通过诱导脂噬抑制透明细胞肾细胞癌进展和舒尼替尼耐药 发现PDZK1-ULK1轴通过调控脂噬维持脂滴稳态,并首次提出ULK1作为舒尼替尼疗效预测生物标志物 未明确阐明PDZK1与LEF1相互作用的详细结构基础,且临床样本量可能有限 阐明PDZK1-ULK1轴在透明细胞肾细胞癌脂滴积累和舒尼替尼耐药中的作用机制 透明细胞肾细胞癌患者肿瘤组织、细胞系及异种移植模型 数字病理学 肾细胞癌 单细胞RNA测序, CUT&Tag分析 NA 基因表达数据 透明细胞肾细胞癌患者临床样本(具体数量未提供) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序 10x Chromium, Illumina测序平台 10x Chromium单细胞RNA测序用于scRNA-seq分析;Illumina平台用于CUT&Tag测序
3329 2026-04-24
RIPK3 Orchestrates Scar-Associated Macrophage Dysfunction to Drive Pulmonary Fibrosis
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了RIPK3通过非坏死性凋亡的免疫代谢功能调控肺纤维化,并靶向疤痕相关巨噬细胞(SAMs)发挥促纤维化作用 首次发现RIPK3通过非坏死性凋亡的免疫代谢功能调控肺纤维化,并明确其在疤痕相关巨噬细胞(SAMs)中的关键作用 NA 探究RIPK3在特发性肺纤维化(IPF)中的非经典功能及其分子机制 特发性肺纤维化患者及小鼠模型中的巨噬细胞,特别是疤痕相关巨噬细胞(SAMs) 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 IPF患者及小鼠样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析巨噬细胞亚群
3330 2026-04-24
Single-Cell RNA Analysis of Murine Osteosarcoma Uncovers Skp2 Function in Metastasis, Genomic Instability, and Immune Activation and Reveals Additional Target Pathways
2026-Apr-01, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序分析小鼠骨肉瘤,揭示Skp2在转移、基因组不稳定性和免疫激活中的作用,并发现其他靶向通路 首次在免疫健全的转基因小鼠骨肉瘤模型中应用单细胞RNA测序,系统揭示Skp2基因敲除对肿瘤异质性、微环境复杂性、T细胞耗竭减少、干扰素信号上调及转移抑制的多维度影响,并发现潜在逃逸机制 研究基于小鼠模型,结论向人类骨肉瘤的转化需要进一步验证;未详细说明单细胞分析的细胞数量或测序深度等具体数据 探索Skp2在骨肉瘤转移、基因组不稳定性及免疫激活中的功能,并识别新的治疗靶点 Osx-Cre条件性Rb1/Trp53敲除小鼠的原发性骨肉瘤肿瘤细胞,以及Skp2敲除或Skp2-p27相互作用破坏的模型 数字病理学 骨肉瘤 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 NA 基因表达数据, 蛋白质组数据 未明确具体样本数量,涉及多种基因型小鼠模型的肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3331 2026-04-24
Single-cell analysis of the human immune system reveals sex-specific dynamics of immunosenescence
2026-Apr, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析人类免疫系统,揭示免疫衰老的性别特异性特征 首次在单细胞水平上系统揭示免疫衰老的性别二态性,发现女性免疫重塑更强且具有特定细胞亚群变化,男性则与慢性淋巴细胞白血病前驱状态相关的B细胞扩增 未提供具体局限性,但可能包括样本来源为外周血单核细胞,无法反映组织驻留免疫细胞的变化;横断面研究设计限制因果推断 探究生物学性别如何影响免疫系统在细胞水平的衰老过程 982名成年雌性和雄性捐赠者的外周血单核细胞 计算生物学, 单细胞组学 免疫衰老, 慢性淋巴细胞白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 982名捐赠者(包括女性和男性) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3332 2026-04-24
Re-analysis of single-cell transcriptomics reveals a critical role of TNS1 gene in driving contractile VSMC transdifferentiation into macrophage-like SMC and atherosclerotic plaque instability
2026-Apr, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 通过重新分析单细胞转录组数据,发现TNS1基因在驱动收缩型血管平滑肌细胞转分化为巨噬细胞样平滑肌细胞及动脉粥样硬化斑块不稳定中起关键作用 首次揭示TNS1基因在血管平滑肌细胞表型转换中的调控作用,并验证其通过促进巨噬细胞样平滑肌细胞转分化加剧斑块不稳定的机制 未提及具体局限性 探究血管平滑肌细胞转分化亚型对动脉粥样硬化进展和斑块不稳定的影响 动脉粥样硬化斑块中的血管平滑肌细胞 单细胞转录组学 动脉粥样硬化 单细胞RNA测序、基因集富集分析、加权基因共表达网络分析 NA 单细胞转录组数据 GSE155513和GSE253903数据集以及三个不稳定斑块转录组数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3333 2026-04-24
The landscape of responses to neoadjuvant immunotherapy in resectable Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog-mutant lung adenocarcinoma: Clinical heterogeneity and correlative immunologic analysis
2026-Apr, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 通过整合临床结果与单细胞RNA测序,分析KRAS突变肺腺癌对新辅助免疫治疗反应的异质性和免疫特征 首次在KRAS突变肺腺癌中结合临床预后与单细胞转录组,发现免疫抑制性CD4T_Treg_TNFRSF4亚群和新型耗竭样B细胞(Bex)与Th1细胞的协同网络,并阐明Treg与Th1/Bex平衡决定治疗疗效 单细胞RNA测序样本量较小(13例KRAS突变),且未进行功能验证实验 阐明KRAS突变肺腺癌对新辅助免疫治疗反应差异的免疫决定因素 可切除肺腺癌患者(143例临床队列,48例单细胞测序样本) 数字病理学 肺腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 143例患者(106例KRAS野生型,37例KRAS突变型);单细胞测序48例(13例KRAS突变,35例野生型) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3334 2026-04-24
Single-cell RNA sequencing and high-dimensional flow cytometry reveal distinct peripheral immune landscapes of type 1 autoimmune pancreatitis and pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和高维流式细胞术揭示1型自身免疫性胰腺炎与胰腺导管腺癌的外周免疫景观差异 首次利用单细胞RNA/BCR测序结合流式细胞术,鉴定了AIP患者PBMC中三种新型免疫细胞亚群(IgG4高表达转换记忆B细胞、Tfh细胞、TREM2上调中间单核细胞),并建立了基于这些亚群的诊断列线图 未明确说明,但可能涉及样本量较小(10例AIP患者)及外部验证队列的局限性 阐明AIP的外周免疫特征,区分其与PDAC的免疫差异,并寻找新的生物标志物用于疾病鉴别诊断 1型AIP患者、PDAC患者和健康志愿者的外周血单核细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA/BCR测序(scRNA/BCR-seq),高维流式细胞术 Boruta算法 基因表达数据 10例AIP患者(scRNA/BCR-seq)、13例PDAC患者和11例健康志愿者(公共数据) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3335 2026-04-24
Acupuncture inhibits astrocytic hyperactivationthe p38 mitogen-activated protein kinase/mitogen- and stress-activated protein kinase 1 signaling pathway in cerebral ischemia-reperfusion injury
2026-Apr, Journal of traditional Chinese medicine = Chung i tsa chih ying wen pan
研究论文 本研究通过转录组和单细胞测序分析,探究针刺通过p38 MAPK/MSK1信号通路抑制脑缺血再灌注损伤后星形胶质细胞过度活化的机制 首次揭示针刺通过调控p38 MAPK/MSK1通路促进星形胶质细胞从促炎A1型向修复A2型转化的新机制 研究仅在大鼠模型中进行,未涉及人体临床试验验证 阐明针刺治疗脑缺血再灌注损伤的分子机制 大脑中动脉闭塞诱导的脑缺血大鼠模型 数字病理学 脑缺血再灌注损伤 转录组测序、单细胞测序、免疫印迹、免疫组化 NA 基因表达数据、图像数据 大鼠模型,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3336 2026-04-24
Zishen Huoxue Decoction alleviates myocardial ischemia-reperfusion injury through dysregulation of endoplasmic reticulum-mitochondria homeostasis mediated by DUSP1-NDUFS4
2026-Apr, Chinese journal of natural medicines IF:4.0Q1
研究论文 研究滋肾活血方通过DUSP1-NDUFS4通路调控内质网-线粒体稳态缓解心肌缺血再灌注损伤的机制 首次揭示滋肾活血方通过DUSP1-NDUFS4轴调控内质网-线粒体稳态缓解心肌缺血再灌注损伤的新机制,并鉴定了其主要活性成分山奈酚的保护作用 未明确说明研究的局限性 探索滋肾活血方调控缺血再灌注心肌线粒体蛋白稳态及代谢活动的新分子靶点 心肌缺血再灌注损伤的动物模型和细胞模型 自然语言处理 心血管疾病 单细胞测序,代谢组学,网络药理学 NA 单细胞转录组数据,代谢组数据 涉及动物和细胞模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3337 2026-04-24
[Advances in tumor-associated macrophage research driven by single-cell sequencing and spatial omics technologies]
2026-Apr, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:42020332
综述 本文综述了单细胞测序和空间组学技术在肿瘤相关巨噬细胞研究中的进展 利用单细胞RNA测序和空间组学技术识别多种转录上不同、功能特化的TAM亚群,超越了传统的M1/M2极化框架 NA 探讨单细胞和空间组学技术如何推动肿瘤相关巨噬细胞研究及精准免疫治疗策略开发 肿瘤相关巨噬细胞(TAM)在各种实体肿瘤(包括胶质瘤、肝癌和乳腺癌)中的亚群 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间组学 NA NA
3338 2026-04-24
TAZ alleviates ischemic stroke injury by activating Foxo1: Usp1-mediated deubiquitination is the pivotal mechanism
2026-Mar-30, Free radical biology & medicine
研究论文 本文揭示了转录共激活因子TAZ通过Usp1介导的去泛素化稳定自身并激活Foxo1,从而减轻缺血性脑卒中氧化损伤和神经元凋亡的机制 首次发现Usp1-TAZ-Foxo1轴是缺血性脑卒中抗氧化防御和神经元存活的關鍵调控通路,并阐明了TAZ通过去泛素化稳定的分子机制 仅使用了小鼠模型和体外神经元损伤模型,研究结果尚需在临床样本中验证;机制细节如Usp1对TAZ的特异性调控仍需进一步探索 阐明转录共激活因子TAZ在缺血性脑卒中中调控氧化损伤的作用及其分子机制 缺血性脑卒中小鼠模型及氧糖剥夺/复氧神经元损伤模型 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠脑组织样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3339 2026-04-24
Integrated single-cell and spatial mapping coupled with machine learning unveils core stemness landscapes and regulatory drivers in triple-negative breast cancer
2026-Mar-23, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 整合单细胞和空间转录组数据,结合机器学习构建三阴性乳腺癌干细胞性景观及调控驱动因子模型 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习技术相结合,构建基于五个核心干性相关基因(CALD1, ANP32B, FIS1, CD82, APLP2)的预测模型,并揭示了高干性评分与不良预后及免疫逃逸的关联 研究主要基于公开数据集,缺乏独立的临床队列验证;虚拟敲除实验尚未在体内或体外模型中进行功能验证 解析三阴性乳腺癌中癌症干细胞相关干性特征的分子调控机制,并构建预测模型以指导个性化治疗 三阴性乳腺癌患者的单细胞、空间转录组和批量转录组数据 机器学习, 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学 XGBoost, 机器学习 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
3340 2026-03-19
Dissecting the immunosuppressive microenvironment of LAMA3 + malignant cells and SPP1 + macrophages in esophageal squamous cell carcinoma using single-cell and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
回到顶部