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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3321 | 2026-02-16 |
Myd88 and Sqstm1 as novel biomarkers for pyroptosis-driven immune checkpoint inhibitors-related myocarditis
2026-Mar-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116336
PMID:41653556
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,鉴定并验证了Myd88和Sqstm1作为免疫检查点抑制剂相关心肌炎中焦亡的关键基因和潜在生物标志物 | 首次在单细胞水平上揭示了焦亡在免疫检查点抑制剂相关心肌炎发病机制中的作用,并鉴定出Myd88和Sqstm1两个新型生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证,尚未在临床患者样本中进行大规模验证 | 阐明免疫检查点抑制剂相关心肌炎的发病机制,并寻找可用于临床诊断的生物标志物 | 免疫检查点抑制剂相关心肌炎 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 实时定量PCR, 蛋白质印迹分析 | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量,但使用了小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3322 | 2026-02-16 |
ResiDUBs: A deubiquitinating enzyme-based prognostic model identifies UBXN1 driving sorafenib resistance in liver cancer
2026-Mar-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116290
PMID:41605053
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研究论文 | 本研究构建了一个基于去泛素化酶的预后模型ResiDUBs,用于预测肝癌对索拉非尼的耐药性,并鉴定出UBXN1是驱动耐药的关键基因 | 首次构建了基于去泛素化酶的肝癌索拉非尼耐药预测模型,并通过多组学分析鉴定出UBXN1的关键作用及其通过PI3K/AKT通路和巨噬细胞极化介导耐药的机制 | 模型仅在回顾性数据中验证,需要前瞻性临床研究进一步确认;UBXN1的具体作用机制仍需深入探索 | 探究去泛素化酶在肝癌索拉非尼耐药中的作用,并构建预后预测模型 | 肝癌细胞、肝癌患者样本 | 生物信息学与计算生物学 | 肝癌 | 加权基因共表达网络分析、差异表达分析、多变量Cox回归分析、单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序、体内实验 | 预后预测模型(基于多变量Cox回归) | 基因表达数据、转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及患者分组和细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3323 | 2026-02-16 |
SARS-CoV-2 E protein reduces PPARA activity in colonic and pulmonary epithelial cells, driving diarrhea and pneumonia in COVID-19
2026-Mar-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116291
PMID:41628511
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研究论文 | 本研究通过临床数据和单细胞RNA测序,揭示了SARS-CoV-2 E蛋白通过抑制PPARA活性,导致结肠和肺上皮细胞中膜转运蛋白表达下调,从而引发COVID-19相关腹泻和肺炎的机制 | 首次发现SARS-CoV-2 E蛋白通过抑制PPARA活性,在结肠和肺上皮细胞中共同驱动腹泻和肺炎,并提出了PPARA激动剂作为潜在治疗策略 | 单细胞RNA测序仅基于一名死亡COVID-19腹泻患者的结肠组织样本,样本量较小,且体外细胞模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明SARS-CoV-2诱导腹泻和肺炎的分子机制,并探索潜在治疗靶点 | COVID-19患者(临床数据)及结肠和肺上皮细胞(体外模型) | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、基因调控网络分析、体外细胞培养实验 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据、体外实验数据 | 3023名患者的临床数据,以及一名死亡COVID-19腹泻患者的结肠组织进行scRNA-seq | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3324 | 2026-02-16 |
Autophagy-driven CCL7+ monocyte terminal differentiation program fuels CD8+ T cell-mediated cardiac injury in Sepsis
2026-Mar-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116265
PMID:41628512
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研究论文 | 本研究揭示了自噬驱动的CCL7+单核细胞终末分化程序通过CCL7介导的免疫激活促进CD8+ T细胞介导的心脏损伤,为脓毒症心肌病提供了新的免疫代谢机制 | 首次鉴定出具有高自噬通量和CCL7表达的C6单核细胞亚群,并阐明了其通过CCL7-CCR1/CCR2-PI3K-AKT信号轴促进CD8+ T细胞活化和心肌损伤的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型,临床验证有限,且未深入探讨其他免疫细胞亚群的具体作用 | 揭示自噬依赖性单核细胞重编程在脓毒症心肌病中的作用及其通过CCL7介导的免疫激活机制 | 脓毒症患者样本、LPS诱导的脓毒症小鼠模型、体外共培养系统 | 单细胞转录组学 | 脓毒症心肌病 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、WGCNA、伪时间轨迹推断、CellChat通讯分析、流式细胞术、ELISA、Western blot | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自公共数据库GSE65682、GSE152363、GSE167363的脓毒症患者数据,以及LPS诱导的脓毒症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 3325 | 2026-02-16 |
Multi-omics profiling of intercellular immunometabolic heterogeneity highlights in lung cancer: Crosstalk mechanisms and resistance in the tumor-immune interface
2026-Mar, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.105094
PMID:41453552
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综述 | 本文综述了肺癌肿瘤微环境中恶性细胞与免疫细胞之间的代谢串扰机制,及其如何驱动免疫逃逸、异质性和免疫治疗耐药,并整合多组学数据定义了相关的免疫代谢表型和治疗策略 | 独特地整合了2009-2025年的最新文献,利用多组学数据(单细胞转录组学、蛋白质组学、代谢组学、空间分析)来定义肺癌中的免疫代谢表型(如LM-high、CD73^high、KEAP1/NRF2突变)和相关通路,并强调了靶向这些通路的治疗策略 | 本文为综述性文章,未进行原始数据研究,其结论基于对现有文献的综合分析 | 阐明肺癌肿瘤微环境中肿瘤细胞与免疫细胞之间的免疫代谢串扰机制,及其对免疫治疗耐药的影响,并探索基于多组学分析的精准治疗策略 | 肺癌的肿瘤微环境,特别是其中的恶性细胞和免疫细胞(如细胞毒性T细胞、树突状细胞、调节性和抑制性免疫亚群) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,代谢组学,空间分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3326 | 2026-02-16 |
Interpretable Aging Signatures in Human Retinal Cell Types Revealed by Single-Cell RNA Sequencing and Sparse Logistic Regression
2026-Mar, Ophthalmology science
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.xops.2025.101062
PMID:41684508
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和稀疏逻辑回归,揭示了中国人群视网膜细胞类型中可解释的衰老特征 | 首次在中国人群中利用机器学习模型推导出细胞类型特异性的视网膜衰老特征,揭示了保守的分子标志和独特的细胞脆弱性 | 样本量相对较小(18个视网膜,12名捐赠者),且为横断面研究,无法追踪个体衰老动态 | 表征人类视网膜衰老过程中的细胞类型特异性转录变化,并开发用于细胞年龄判别的机器学习模型 | 人类视网膜细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | L1正则化逻辑回归加递归特征消除 | 单细胞转录组数据 | 18个未冷冻视网膜,来自12名中国捐赠者(9名年轻,34-55岁;9名老年,68-92岁),共223,612个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' v3.1 |
| 3327 | 2026-02-16 |
Developing a Single-Cell Spatial Transcriptomics Workflow for In Vivo Evaluation of Implanted Biomaterials
2026-Feb-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513242
PMID:41691505
|
研究论文 | 本文开发了一个用于Xenium平台的空间转录组学工作流程,以评估植入生物材料的体内反应 | 开发了一个新的生物信息学工作流程,将空间转录组学应用于生物材料评估,揭示了传统组织学无法检测的细胞动态和空间组织 | 工作流程目前仅应用于小鼠皮下植入的PCL支架,可能需进一步验证于其他生物材料或体内模型 | 评估植入生物材料的体内反应,以促进基于生物学的生物材料设计 | 植入小鼠皮下的电纺聚己内酯支架 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium平台用于高分辨率空间转录组学分析 |
| 3328 | 2026-02-16 |
DSG2+ Cancer Stem Cells Co-Located With FAP+ Myofibroblasts in the Tumor Boundary That Determines the Efficacy of Immunotherapy in Non-Small Cell Lung Cancer
2026-Feb-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514543
PMID:41691490
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统定义了非小细胞肺癌中与癌症干细胞相关的表型,并揭示了DSG2+癌症干细胞与FAP+肌成纤维细胞在肿瘤边界共定位的空间生态位对治疗抵抗的作用 | 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学系统定义NSCLC中的CSC表型;发现DSG2作为主导标志物;揭示了DSG2+CSC与FAP+肌成纤维细胞在肿瘤边界共定位的空间组织模式及其通过MMP依赖机制增强CSC表型的功能 | 未明确提及 | 阐明非小细胞肺癌中癌症干细胞的转录程序和空间组织,及其对治疗抵抗的影响 | 非小细胞肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 加权基因共表达网络分析, 多重免疫荧光, 功能共培养实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床蛋白质组数据集, 免疫荧光图像 | 未明确提及 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3329 | 2026-02-16 |
Gut-Heart Axis in Myocardial Repair: Mechanisms, Cross-Organ Networks, and Therapeutic Opportunities
2026-Feb-13, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326978
PMID:41678593
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综述 | 本文综述了肠道微生物群通过多器官网络(如肠-脑-心轴)调节心肌损伤、修复和再生的机制,并探讨了其作为疾病驱动因素和治疗靶点的潜力 | 整合了肠道微生物群在心肌修复和再生中的新兴作用,强调了跨器官网络(如肠-脑-心轴)和免疫代谢信号,并提出了结合多组学与机制模型用于精准心血管医学的新策略 | NA | 探讨肠道微生物群在心肌损伤、修复和再生中的作用机制,以及其作为治疗靶点的潜力 | 肠道微生物群及其代谢物,以及它们与心肌健康相关的跨器官网络 | NA | 心血管疾病 | 宏基因组学、代谢组学、单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3330 | 2026-02-16 |
COPD reshapes the tumor microenvironment of NSCLC and enhances anti-PD-1 therapy response
2026-Feb-13, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2025.100996
PMID:41690302
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研究论文 | 本研究探讨了慢性阻塞性肺疾病(COPD)如何重塑非小细胞肺癌(NSCLC)的肿瘤微环境并增强抗PD-1疗法的疗效 | 揭示了COPD通过诱导上皮重塑,扩增具有祖细胞特征的基底样肿瘤细胞群,并激活CXCL14-CXCR4信号轴招募产生CXCL9的巨噬细胞,从而建立有利于细胞毒性T细胞浸润的局部微环境,这为COPD增强PD-1阻断疗效提供了机制性解释 | 研究主要基于临床队列和体外功能验证,缺乏体内模型的直接验证,且样本来源可能受限于特定患者群体 | 探究COPD作为NSCLC共病如何影响肿瘤微环境并增强抗PD-1免疫疗法的反应 | 非小细胞肺癌(NSCLC)患者,特别是伴有COPD的患者,以及新鲜手术肿瘤标本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 三个临床队列,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3331 | 2026-02-16 |
RMzyme: regulations of RNA-modifying enzymes in humans
2026-Feb-12, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02568-2
PMID:41672979
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研究论文 | 本研究通过大规模多组学数据集,系统表征了人类RNA修饰酶的调控机制及其在急性髓系白血病等疾病中的功能 | 首次整合378个多组学数据集,涵盖63个人体组织,系统解析RNA修饰酶的动态调控网络,并开发了RMzyme平台整合研究发现 | 研究主要基于现有数据集的分析,需要进一步实验验证特定调控机制在疾病中的具体作用 | 探究RNA修饰酶在人类基因表达调控和疾病发生中的关键作用 | 人类RNA修饰蛋白及其在63个人体组织中的多组学数据 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 多组学整合分析,包括基因组学、转录组学、表观转录组学、蛋白质组学和翻译后修饰分析 | 非负矩阵分解 | 多组学数据 | 378个多组学数据集,涵盖63个人体组织 | NA | 单细胞转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 3332 | 2026-02-16 |
A dual-action nanoparticle approach for spinal cord injury treatment: ferroptosis inhibition, inflammation control, and Myelin preservation
2026-Feb-12, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04114-w
PMID:41673859
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研究论文 | 本研究开发了一种基于黄精来源果聚糖包被的硒纳米颗粒(PRP@SeNPs),用于通过抑制铁死亡、控制炎症和保存髓鞘来治疗脊髓损伤。 | 首次从黄精中提取果聚糖并用于包被硒纳米颗粒,创造了一种新型的、无药物的、生物相容性纳米治疗策略,其释放曲线与单细胞RNA测序确定的治疗窗口相匹配。 | 研究仅在体外和小鼠模型中进行,尚未在大型动物或人体中进行验证。 | 开发一种针对脊髓损伤继发性损伤机制(铁死亡和神经炎症)的治疗策略,以促进神经保护和髓鞘再生。 | 脊髓损伤后的神经元、少突胶质细胞和小胶质细胞。 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3333 | 2026-02-16 |
Metabolic reprogramming in lacrimal gland GVHD: Stage-specific shifts in acinar cells as drivers of disease progression
2026-Feb-10, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2026.02.003
PMID:41679650
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠泪腺在急性与慢性移植物抗宿主病(oGVHD)阶段的细胞生态系统动态变化,重点关注腺泡细胞的代谢重编程 | 首次在oGVHD中定义了阶段特异性细胞重编程机制,识别了急性期与慢性期不同的驱动细胞类型和代谢通路,并计算预测了新的配体-受体对 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类oGVHD,且样本时间点有限 | 阐明oGVHD发病机制中阶段特异性细胞变化,以揭示疾病进展的驱动因素 | 小鼠泪腺组织 | 单细胞组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光验证 | 伪时间轨迹分析,细胞间通讯网络推断 | 单细胞转录组数据,图像数据 | 小鼠泪腺在急性(7天)和慢性(28天)GVHD阶段的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3334 | 2026-02-16 |
Multiomics Analyses Reveal an Essential Role of Tryptophan in Treatment of csDMARDs in Rheumatoid Arthritis
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413170
PMID:40985320
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了色氨酸在类风湿关节炎患者对传统合成改善病情抗风湿药治疗反应中的关键调节作用 | 首次通过整合代谢组学、微生物组学、转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学等多组学数据,并结合体外/体内实验及临床试验,系统阐明了色氨酸在csDMARDs治疗反应中的调控机制 | 样本量相对有限,且主要关注色氨酸通路,其他潜在代谢通路可能未被充分探索 | 阐明类风湿关节炎患者对传统合成改善病情抗风湿药治疗反应差异的分子机制 | 类风湿关节炎患者(采集血浆、粪便和外周血单个核细胞)、MH7A细胞系、小鼠模型 | 多组学整合分析 | 类风湿关节炎 | 代谢组学、微生物组学、转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学 | NA | 多组学数据(代谢物、微生物、基因表达、蛋白质、磷酸化) | 类风湿关节炎患者的血浆、粪便和PBMC样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学, 微生物组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 3335 | 2026-02-16 |
Characterizing Stage-Specific Cellular Dynamics and Microenvironmental Remodeling in Lung Adenocarcinoma by Single-Cell RNA Sequencing
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510847
PMID:41313751
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序,系统描绘了肺腺癌不同进展阶段的细胞组成和转录状态,揭示了肿瘤微环境从早期免疫激活到晚期免疫抑制的动态重塑过程 | 整合早期患者样本与公共晚期数据集,系统揭示了肺腺癌进展中阶段特异性的肿瘤微环境重塑;鉴定出具有转移和缺氧特征的C5肿瘤细胞亚群、免疫抑制性LGMN⁺巨噬细胞、STAT1驱动的耗竭CD8⁺ T细胞、FKBP11⁺浆B细胞及POSTN⁺ CAFs等关键细胞亚群,提出了缺氧驱动的功能趋同模型 | 未明确说明样本的具体数量及来源的详细信息;研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质或功能层面的验证;整合的公共数据集可能存在批次效应 | 阐明肺腺癌进展过程中阶段特异性的细胞动态和肿瘤微环境重塑机制 | 肺腺癌患者肿瘤组织(涵盖早期和晚期阶段) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3336 | 2026-02-16 |
Inferring Gene Regulatory Networks From Single-Cell RNA Sequencing Data by Dual-Role Graph Contrastive Learning
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518277
PMID:41317402
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研究论文 | 本文提出了一种名为RegGAIN的新型深度学习模型,用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 | 提出了一种基于双重角色图对比学习的自监督方法,通过单独的编码器同时学习每个基因的调控者和靶标双重角色表示,以捕获调控方向性和不同的调控模式 | NA | 从单细胞转录组数据中准确重建细胞类型特异性的基因调控网络 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习,对比学习 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3337 | 2026-02-16 |
Type I Interferon Pathway Activation Disrupts Monocyte Maturation and Enhances Immune Evasion in Multiple Myeloma
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510816
PMID:41319279
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了多发性骨髓瘤中I型干扰素通路激活破坏单核细胞成熟并促进免疫逃逸的机制 | 首次在多发性骨髓瘤中系统描绘了I型干扰素通路如何破坏单核细胞分化轨迹,并证明其直接促进肿瘤细胞增殖 | 研究主要基于转录组分析,功能验证实验可进一步扩展;样本量相对有限,需更大队列验证 | 探究多发性骨髓瘤中单核细胞功能障碍与免疫逃逸之间的机制联系 | 健康供者和多发性骨髓瘤患者的外周血和骨髓单核细胞 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康供者和多发性骨髓瘤患者的外周血与骨髓样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3338 | 2026-02-16 |
Three-Year Follow-Up of Neoadjuvant Tislelizumab with Chemotherapy in Locally Advanced Gastric and Gastroesophageal Junction Adenocarcinoma: Revealing Cancer-Associated Fibroblast Heterogeneity Corresponding to PD-1 Blockade Efficacy
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508433
PMID:41327861
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研究论文 | 本研究报道了局部晚期胃癌患者接受新辅助替雷利珠单抗联合SOX化疗的3年随访数据,并通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了癌症相关成纤维细胞异质性对PD-1阻断疗效的影响 | 首次在局部晚期胃癌新辅助免疫化疗的长期随访中,结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,系统鉴定了三种癌症相关成纤维细胞表型,并发现炎症性CAFs与免疫治疗疗效负相关 | 单臂II期试验设计,样本量有限(49例患者),且单细胞测序仅来自7例患者的肿瘤样本,需要更大规模随机对照试验验证 | 评估局部晚期胃癌患者接受新辅助替雷利珠单抗联合SOX化疗的长期疗效,并探索肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞异质性对PD-1阻断治疗反应的影响 | 局部晚期胃腺癌和胃食管结合部腺癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Cox回归模型, Kaplan-Meier分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据, 临床随访数据 | 49例患者(其中7例患者肿瘤样本进行单细胞RNA测序,包含22,248个细胞) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3339 | 2026-02-16 |
Targeting Itga8 Mitigates Neurogenic Bladder Fibrosis Driven by Trem2⁺ Macrophage-Derived Fn1 via FAK/RhoA/ROCK Signaling
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510631
PMID:41355531
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了神经源性膀胱纤维化的细胞图谱,发现Itga8⁺成纤维细胞在纤维化中的关键作用,并阐明其通过FAK/RhoA/ROCK信号通路被Trem2⁺巨噬细胞来源的Fn1激活的机制 | 首次在神经源性膀胱纤维化中鉴定出Itga8⁺成纤维细胞亚群,并揭示其与Trem2⁺巨噬细胞通过Fn1-Itga8轴形成促纤维化炎症循环的新机制 | 研究主要基于动物模型,临床转化效果需进一步验证;Itga8靶向治疗的具体给药方式和长期安全性尚未评估 | 探究神经源性膀胱纤维化的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 神经源性膀胱纤维化模型中的成纤维细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 神经源性膀胱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3340 | 2026-02-16 |
BiCLUM: Bilateral contrastive learning for unpaired single-cell multi-omics integration
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013932
PMID:41632825
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研究论文 | 本文提出了一种名为BiCLUM的双边对比学习方法,用于整合未配对的单细胞多组学数据 | BiCLUM通过结合细胞水平和特征水平的对比学习损失,同时实现跨模态的细胞和基因嵌入对齐,并利用先验基因组知识将一种模态(如scATAC-seq)转换到另一种模态(如scRNA-seq)的数据空间 | NA | 开发一种有效的单细胞多组学数据整合方法,以理解不同分子模态(如RNA表达、染色质可及性和蛋白质丰度)之间的复杂相互作用 | 单细胞多组学数据,包括scRNA-seq、scATAC-seq和CITE-seq等 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、CITE-seq | 对比学习 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |