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当前共找到 38530 篇文献，本页显示第 3301 - 3320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3301 | 2026-03-04 |
Single-cell DNA methylation analysis tool Amethyst reveals distinct noncanonical methylation patterns in human glial cells
2024-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.13.607670
PMID:39211069
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研究论文 | 本文介绍了一个名为Amethyst的综合性R软件包，用于处理和分析图谱规模的单细胞甲基化测序数据 | 开发了首个用于图谱规模单细胞甲基化测序数据分析的综合性R软件包Amethyst，并利用该工具在人类大脑数据集中发现并描述了星形胶质细胞和少突胶质细胞中存在非典型甲基化模式，挑战了该甲基化形式主要与大脑神经元相关的传统观点 | 未明确提及具体局限性 | 开发单细胞甲基化测序数据分析工具，并探索人类胶质细胞中的甲基化模式 | 人类外周血单个核细胞（PBMC）、人类大脑皮层细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞甲基化测序 | NA | 甲基化测序数据 | NA | NA | 单细胞甲基化测序 | NA | NA |
| 3302 | 2026-03-04 |
Single-cell profile reveals the landscape of cardiac immunity and identifies a cardio-protective Ym-1hi neutrophil in myocardial ischemia-reperfusion injury
2024-04-15, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2024.02.003
PMID:38395651
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了心肌缺血再灌注损伤中免疫细胞的动态变化，并鉴定出一种具有心脏保护作用的Ym-1hi中性粒细胞亚型 | 首次在MIRI中通过单细胞测序系统描绘了心脏免疫细胞景观，并发现了一种新型的Ym-1hi中性粒细胞亚型，该亚型具有心脏保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证相对有限 | 探究心肌缺血再灌注损伤中免疫细胞亚型及其动态变化，并鉴定具有保护作用的细胞亚型 | 小鼠心肌组织中的CD45阳性免疫细胞，以及临床患者样本 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠心肌组织在六个时间点采集的CD45细胞，以及临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3303 | 2026-03-04 |
Integrating spatial and single-nucleus transcriptomic data elucidates microglial-specific responses in female cynomolgus macaques with depressive-like behaviors
2023-08, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01379-4
PMID:37443281
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，揭示了雌性食蟹猴在抑郁样行为中特定于小胶质细胞的反应 | 首次在雌性非人灵长类动物中结合空间转录组学和单核RNA测序，识别出与抑郁样行为相关的小胶质细胞亚群及其在皮质层中的特异性分布 | 研究仅针对雌性食蟹猴，样本可能有限，且结果可能无法直接推广到人类或其他物种 | 探究重度抑郁障碍的细胞和分子机制，特别是在小胶质细胞中的特异性反应 | 雌性食蟹猴的背外侧前额叶皮质 | 数字病理学 | 重度抑郁障碍 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 雌性食蟹猴样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3304 | 2026-03-04 |
Atlas-scale single-cell chromatin accessibility using nanowell-based combinatorial indexing
2023-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276655.122
PMID:36792372
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研究论文 | 本文介绍了基于纳米孔芯片的单细胞组合索引染色质可及性测定技术的进展，实现了大规模细胞通量（>10^5个细胞）的低成本测量 | 利用5184纳米孔芯片在PCR索引阶段实现规模提升52倍并降低单细胞制备成本，优化工作流程获得高比例峰值内读数（>80%）和低细胞双联率 | NA | 开发低成本、高通量的单细胞染色质可及性测定技术 | 小鼠脑组织样本 | 表观遗传学 | NA | 单细胞组合索引ATAC-seq | NA | 染色质可及性数据 | >10^5个细胞 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | 基于纳米孔芯片的sciATAC平台 |
| 3305 | 2026-03-04 |
V-SVA: an R Shiny application for detecting and annotating hidden sources of variation in single-cell RNA-seq data
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa128
PMID:32119082
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研究论文 | 本文介绍了一个名为V-SVA的R Shiny应用，用于检测和注释单细胞RNA测序数据中的隐藏变异源 | 开发了一个交互式网络浏览器界面，结合了基因关联发现、公开数据库注释和数据可视化工具，以辅助解释单细胞RNA测序中的变异源 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 促进单细胞RNA测序数据中隐藏变异源的识别和注释，以区分技术变异和生物变异 | 单细胞RNA测序数据及其中的变异源 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | IA-SVA, SVA, ZINB-WaVE | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3306 | 2026-03-04 |
M3S: a comprehensive model selection for multi-modal single-cell RNA sequencing data
2019-Dec-20, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-019-3243-1
PMID:31861972
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研究论文 | 本文介绍了一个名为M3S的R包，用于单细胞RNA测序数据的多模态模型选择和下游分析 | 开发了首个能针对不同实验设计和平台生成的表达数据，从11种常用统计模型中基因水平选择最合适多模态模型的工具 | NA | 为单细胞RNA测序数据提供多模态统计模型选择方法，以改进基因表达分布拟合和差异表达分析 | 单细胞RNA测序表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多模态统计模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3307 | 2026-03-04 |
Insights from deconvolution of cell subtype proportions enhance the interpretation of functional genomic data
2019, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0215987
PMID:31022271
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研究论文 | 本研究探讨了如何通过解卷积细胞亚型比例从功能基因组学数据中获取与表型相关的细胞变化信息 | 展示了细胞亚型比例变化对功能基因组学特性的贡献可能是疾病特异性的，并利用单细胞RNA-seq参考数据集成功估算了缺乏纯化样本参考数据的组织（如小鼠肾脏）中的细胞亚型比例 | 研究仅聚焦于人类血液和小鼠肾脏两种混合细胞群体，且对于大多数缺乏参考数据集的组织，细胞类型预测方法尚不成熟 | 增强功能基因组学数据的解释，通过分析细胞亚型比例变化来理解其与表型的关联 | 人类血液和小鼠肾脏组织样本 | 功能基因组学 | 哮喘和系统性红斑狼疮 | 解卷积分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达和DNA甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3308 | 2026-03-03 |
Nerandomilast, a PDE4B inhibitor, alleviates silica-induced lung inflammation and fibrosis by inhibition of NLRP3 inflammasome and TGF-β/Smad signalling
2026-Apr, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70240
PMID:41255094
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研究论文 | 本研究评估了PDE4B抑制剂nerandomilast在矽肺模型中的治疗效果及其机制，发现其通过抑制NLRP3炎症小体和TGF-β/Smad信号通路减轻炎症和纤维化 | 首次在矽肺模型中评估nerandomilast的疗效，并利用单细胞RNA测序识别PDE4B作为关键调控靶点 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，未涉及人类临床试验，且机制探索可能未覆盖所有相关通路 | 探究PDE4B抑制剂nerandomilast在矽肺中的治疗潜力及其分子机制 | 雄性C57BL/6N小鼠、THP-1巨噬细胞和MRC-5细胞 | NA | 矽肺 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、转录组分析 | NA | RNA测序数据 | 未明确样本数量，涉及小鼠模型和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3309 | 2026-03-03 |
Intratumoral heterogeneity in microsatellite instability status at single-cell resolution
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114860
PMID:41767255
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据，揭示了肿瘤内微卫星不稳定性状态的异质性，挑战了MSI作为二元生物标志物的传统观点 | 首次在单细胞分辨率下量化肿瘤内MSI状态的异质性，发现MSI-H和MSS亚克隆共存现象 | 样本量有限（49例），需要更大规模研究验证异质性频率及临床意义 | 探究微卫星不稳定性在肿瘤内的异质性现象及其对生物标志物应用的影响 | 癌症患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 计算分析流程 | 单细胞RNA测序数据 | 49例个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3310 | 2026-03-03 |
Differentiation of mesenchymal stem/stromal cells into CD45+ macrophage-like cells: expanding insights into MSC plasticity
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114906
PMID:41767265
|
研究论文 | 本研究探讨了间充质干细胞/基质细胞（MSCs）分化为CD45+巨噬细胞样细胞的潜力，揭示了MSCs的塑性及其在免疫调节和组织修复中的潜在作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了新鲜分离的MSCs中存在巨噬细胞样群体，证实了MSCs在体内外均可分化为M2型巨噬细胞，扩展了对MSCs塑性的理解 | 研究主要基于小鼠模型，人类MSCs的验证相对有限，且具体分化机制和体内功能影响需进一步探究 | 探究MSCs、纤维细胞和巨噬细胞之间的关系，特别是MSCs直接分化为巨噬细胞样细胞的可能性 | 小鼠PαS细胞（一种新鲜分离的MSC群体）和人类MSCs | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个小鼠品系和人类MSCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3311 | 2026-03-03 |
The non-metabolic role of MTHFD2 in regulating mitochondrial fission-dependent mitophagy via stabilizing TOP2A mRNA in glioblastoma
2026-Mar-16, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究揭示了代谢酶MTHFD2在胶质母细胞瘤中通过稳定TOP2A mRNA来调控线粒体分裂依赖性线粒体自噬的非代谢功能 | 首次发现代谢酶MTHFD2具有RNA结合功能，通过稳定TOP2A mRNA调控线粒体动力学，揭示了其非经典功能 | NA | 探究MTHFD2在胶质母细胞瘤中线粒体完整性和动力学中的非代谢功能 | 胶质母细胞瘤细胞及小鼠原位模型 | 分子生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、mt-Keima线粒体自噬流检测、RNA免疫沉淀测序、荧光素酶报告基因检测 | NA | RNA测序数据、荧光成像数据、报告基因数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3312 | 2026-03-03 |
P16+ Cells Drive Adverse Postischemic Cardiac Remodeling Through CCL8-Mediated Recruitment of Cytotoxic Lymphocytes
2026-Mar-02, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后表达P16的细胞通过分泌CCL8招募细胞毒性淋巴细胞，从而驱动不良心脏重塑的机制 | 首次利用p16-CreER;R26-tdT报告小鼠系统性地绘制了心肌梗死后P16+细胞的异质性图谱，并明确了P16+成纤维细胞和巨噬细胞通过CCL8依赖的方式招募细胞毒性淋巴细胞（特别是CD8+ T细胞）是驱动不良重塑的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类疾病中的直接适用性尚需验证；此外，研究聚焦于CCL8通路，可能还有其他P16+细胞分泌的因子参与该过程 | 阐明心肌梗死后表达衰老标志物P16的细胞在心脏不良重塑中的具体作用机制 | p16-CreER;R26-tdT报告小鼠、心肌梗死后心脏组织中的P16+细胞（包括成纤维细胞、巨噬细胞、冠状动脉内皮细胞和心肌细胞） | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、定量聚合酶链反应、细胞通讯分析、遗传学消融、药物处理 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 使用p16-CreER;R26-tdT等多种遗传工程小鼠模型进行研究，具体样本数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3313 | 2026-03-03 |
Direct Cardiac Reprogramming in the Omics Era: Advances, Mechanisms, and Applications
2026-Mar-02, Cellular reprogramming
IF:1.2Q4
DOI:10.1177/21524971261427184
PMID:41766575
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综述 | 本文综述了基于多组学方法在直接心脏重编程领域的最新进展、机制和应用 | 整合了单细胞转录组学、表观基因组学、转录后分析、蛋白质组学和代谢研究等多组学数据，为理解成纤维细胞向诱导心肌样细胞转化的障碍和促进因素提供了一个综合框架 | 本文是一篇综述，未报告原始实验数据，其局限性在于依赖现有文献的总结和整合 | 探讨如何利用多组学方法推进直接心脏重编程的机制理解并促进其临床应用 | 成纤维细胞向诱导心肌样细胞的转化过程 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学，表观基因组学（染色质可及性、组蛋白修饰、DNA甲基化分析），转录后分析，蛋白质组学，代谢研究 | NA | 多组学数据（转录组、表观基因组、蛋白质组、代谢组） | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3314 | 2026-03-03 |
GeneExt: a gene model extension tool for enhanced single-cell RNA-seq analysis
2026-Mar-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag094
PMID:41769841
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研究论文 | 本文介绍了GeneExt工具，该工具利用单细胞RNA-seq数据优化基因注释，以改进非模式物种中的基因表达量化 | GeneExt通过扩展和统一基因注释，特别是针对非模式物种中不准确的3'端注释，提高了单细胞RNA-seq分析的准确性和跨物种比较能力 | NA | 开发一个工具以改进单细胞RNA-seq分析中的基因表达量化，特别是在非模式物种中 | 八个非模式生物的单细胞图谱 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3315 | 2026-03-03 |
Stereo-cell deciphers the spatial and functional heterogeneity of polyploid hepatocytes
2026-Mar-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag023
PMID:41770024
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研究论文 | 本研究利用空间分辨单细胞测序技术Stereo-cell，结合SCIPI技术流程，解析了多倍体肝细胞的转录组和功能异质性 | 开发了SCIPI技术流程，整合细胞轮廓识别、核面积与数量量化及单细胞转录组学，首次精确识别六种核心肝细胞多倍体亚型 | 未在摘要中明确提及研究的局限性 | 探究不同倍体肝细胞（二倍体、四倍体、八倍体）的功能差异和空间异质性 | 肝细胞，特别是多倍体肝细胞亚型 | 数字病理学 | NA | 空间分辨单细胞测序，单细胞转录组学 | NA | 图像，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | Stereo-cell | Stereo-cell空间分辨单细胞测序技术 |
| 3316 | 2026-03-03 |
Integrated Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Mitochondrial Transporter Gene Programs in Human Spermatogonial Stem Cells
2026-Mar-02, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-026-11092-x
PMID:41770292
|
研究论文 | 本研究通过整合批量微阵列分析和单细胞RNA测序数据，揭示了人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因程序的独特表达模式 | 首次在人类精原干细胞中系统性地描述了线粒体转位酶复合物和转运蛋白基因的转录架构，并识别了关键的调控网络和miRNA-mRNA相互作用 | 研究样本量较小（每组3个生物学重复），且主要依赖于转录组数据，功能验证不足 | 探究人类精原干细胞中线粒体转运蛋白基因的转录调控网络及其在干细胞维持中的作用 | 人类精原干细胞富集群体和成纤维细胞 | 单细胞组学 | NA | 批量微阵列分析, 单细胞RNA测序 | limma, WGCNA, STRING/cytoHubba | 转录组数据 | 每组3个生物学重复的人类精原干细胞富集群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3317 | 2026-03-03 |
Spatially resolved airway niches: mapping epithelial-immune microenvironments in asthma
2026-Mar, Expert review of respiratory medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/17476348.2025.2582244
PMID:41146609
|
综述 | 本文综述了空间组学技术在哮喘研究中的应用，揭示了气道壁中上皮-免疫微环境的分子特征及其在疾病异质性和治疗反应中的作用 | 整合了多种空间组学技术（如Visium-HD、Xenium、CosMx SMI等）的数据，首次系统性地绘制了哮喘气道中IL-13富集的杯状细胞中心、肥大细胞-平滑肌环路等特定微环境，并强调了这些空间信息在传统解离分析中被忽略 | 临床广泛应用仍需降低检测成本、减少RNA扩散、统一FFPE工作流程，并需要在全球队列中进行多组学整合以提高可重复性和临床可操作性 | 通过空间组学技术解析哮喘气道中上皮-免疫微环境的分子构成与空间分布，以推动精准医疗发展 | 人类气道活检样本、离体肺切片以及小鼠哮喘模型 | 空间转录组学 | 哮喘 | 空间转录组学、多重成像蛋白质组学、空间代谢组学 | NA | 空间组学数据（转录组、蛋白质组、代谢组） | NA | 10x Genomics, NanoString, Bruker, Fluidigm, Ionpath | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 空间代谢组学 | Visium-HD, Xenium, CosMx SMI, MERFISH, Imaging Mass Cytometry, MIBI, MALDI-MSI | Visium-HD（空间转录组学）, Xenium（原位基因表达）, CosMx SMI（单分子成像）, MERFISH（多重误差鲁棒荧光原位杂交）, Imaging Mass Cytometry（成像质谱流式）, MIBI（多重离子束成像）, 高分辨率MALDI-MSI（基质辅助激光解吸电离质谱成像） |
| 3318 | 2026-03-03 |
Single cell RNA-seq characterization of non-fibrotic stromal wound repopulation in the rabbit
2026-Mar, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110816
PMID:41421445
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在兔模型中探究了非纤维化角膜基质伤口愈合过程中的转录变化 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了角膜基质细胞在非纤维化伤口愈合中的异质性及从静止态到成纤维细胞的连续转录轨迹 | 研究仅基于兔模型，结果可能不完全适用于人类；且仅关注了特定时间点（第7天和第28天）的转录变化 | 探究非纤维化角膜伤口愈合的分子机制，以预防角膜手术或损伤后的瘢痕形成 | 兔角膜基质细胞（包括静止态角膜细胞和伤口愈合过程中的成纤维细胞） | 单细胞转录组学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 兔角膜组织样本（包括对照组和损伤后第7天、第28天的时间点） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3319 | 2026-03-03 |
Synovial fibroblast responses to different types of injury resulting in cartilage repair or osteoarthritis
2026-Mar, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.12.023
PMID:41490604
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研究论文 | 本研究通过整合分析小鼠关节损伤模型的单细胞RNA测序数据，比较了滑膜成纤维细胞对不同类型和持续时间关节损伤的响应 | 揭示了滑膜成纤维细胞在关节表面损伤和创伤后骨关节炎模型中的异质性响应，包括谱系特异性转录因子的共表达特征 | 基于已发表的scRNA-seq数据，可能受原始实验设计和样本量的限制 | 比较不同关节损伤模型中滑膜成纤维细胞的响应机制，以指导关节修复和骨关节炎的未来研究 | 小鼠滑膜成纤维细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个小鼠关节损伤模型的数据集（JSI、DMM、ACLR模型，包含不同时间点） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3320 | 2026-03-03 |
Experimental study of tumor-associated macrophage-derived SPP1 inhibit CD8+ T cells to promote Colorectal cancer progression
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101276
PMID:41633116
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了肿瘤相关巨噬细胞（TAM）来源的分泌磷蛋白1（SPP1）通过抑制CD8⁺ T细胞向Tc1细胞分化，从而促进结直肠癌进展的机制 | 首次在结直肠癌中鉴定出一个高表达SPP1的独特TAM亚群，并阐明了TAM来源的SPP1通过CD44介导的信号通路抑制CD8⁺ T细胞功能的具体分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，其在人类结直肠癌患者中的临床相关性及转化潜力仍需进一步验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞在结直肠癌免疫微环境中的调控作用及其分子机制 | 结直肠癌（CRC）肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞（TAM）和CD8⁺ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学分析，体外共培养实验 | 小鼠结直肠癌模型（MC38细胞） | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |