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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3301 | 2025-10-06 |
Myeloid-specific deficiency of ribosomal protein L13a alters macrophage polarity and diversity during differentiation from bone marrow
2025-Jul-09, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf102
PMID:40631353
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研究论文 | 本研究揭示了核糖体蛋白L13a在骨髓来源巨噬细胞分化和极化过程中的新作用 | 首次发现核糖体蛋白L13a通过新型中间效应因子调控巨噬细胞极化和多样性,超越了传统的M1-M2二元概念 | 研究主要基于体外骨髓来源巨噬细胞分化模型,体内验证尚不充分 | 探究核糖体蛋白L13a在巨噬细胞极化和多样性调控中的作用机制 | 骨髓来源巨噬细胞和CD4+ T细胞 | 免疫学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 体外分化模型 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 对照组和髓系特异性L13a敲除小鼠的骨髓细胞 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
3302 | 2025-10-06 |
Cholinergic neuron-to-glioblastoma synapses in a human iPSC-derived co-culture model
2025-Jul-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102534
PMID:40541171
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研究论文 | 本研究利用人源iPSC衍生的胆碱能神经元与胶质母细胞瘤类器官共培养系统,揭示了胆碱能神经元通过突触连接促进胶质母细胞瘤进展的机制 | 首次在完全人源细胞系统中证明胆碱能神经元与胶质母细胞瘤之间形成功能性突触连接,并发现这种相互作用通过胆固醇生物合成途径促进肿瘤增殖 | 研究基于体外共培养模型,尚未在体内环境中验证;主要关注胆碱能神经元,未全面比较其他神经递质系统 | 探究胆碱能神经回路在胶质母细胞瘤生物学中的作用机制 | 患者来源的胶质母细胞瘤类器官和人iPSC衍生的胆碱能神经元 | 癌症神经科学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 钙成像, 跨单突触追踪, 电子显微镜 | 共培养模型 | 基因表达数据, 影像数据, 超微结构数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3303 | 2025-10-06 |
Metabolic reprogramming in astrocytes prevents neuronal death through a UCHL1/PFKFB3/H4K8la positive feedback loop
2025-Jul, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01467-x
PMID:40016338
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研究论文 | 本研究揭示了星形胶质细胞通过UCHL1/PFKFB3/H4K8la正反馈环路进行代谢重编程以保护神经元免于死亡的机制 | 首次发现UCHL1/PFKFB3/H4K8la正反馈环路在星形胶质细胞代谢重编程中的关键作用 | 研究主要聚焦于脊髓损伤模型,其他神经系统疾病中的适用性需进一步验证 | 探究星形胶质细胞代谢重编程在脊髓损伤后神经元保护中的作用机制 | 星形胶质细胞、神经元、脊髓损伤模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
3304 | 2025-10-06 |
De novo TANC2 variants caused developmental and epileptic encephalopathy and epilepsy
2025-Jul, Epilepsia
IF:6.6Q1
DOI:10.1111/epi.18358
PMID:40110879
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研究论文 | 本研究通过外显子测序和功能实验证实TANC2基因是癫痫和发育性癫痫性脑病的致病基因 | 首次系统揭示TANC2基因变异与癫痫表型的关联,并建立基因型-表型相关性 | 样本量较小(仅6个病例),需要更大队列验证 | 探索TANC2基因与癫痫的关联及其表型变异机制 | 癫痫患者和果蝇模型 | 神经遗传学 | 癫痫 | 外显子测序,单细胞RNA测序 | 果蝇模型,脑类器官 | 基因组数据,转录组数据 | 6个无关病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3305 | 2025-10-06 |
Identification of Crosstalk Genes Between Primary Sjögren's Syndrome and Primary Biliary Cirrhosis by Transcriptome Analysis
2025-Jul, Digestive diseases and sciences
IF:2.5Q2
DOI:10.1007/s10620-025-08917-z
PMID:40199818
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研究论文 | 通过转录组分析识别原发性干燥综合征与原发性胆汁性胆管炎之间的串扰基因 | 首次通过整合差异表达分析、WGCNA和LASSO回归识别出pSS和PBC之间的7个关键串扰基因 | 研究基于公共数据库的转录组数据,需要进一步实验验证 | 探索原发性干燥综合征与原发性胆汁性胆管炎之间的分子关联机制 | 原发性干燥综合征和原发性胆汁性胆管炎患者的转录组数据 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 转录组分析, 差异表达分析, WGCNA, LASSO回归, ssGSEA, 单细胞转录组分析 | LASSO回归模型, 多元逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的两个数据集(GSE66795和GSE119600) | NA | 转录组测序, 单细胞转录组测序 | NA | NA |
3306 | 2025-10-06 |
Mobilizing antigen-presenting mast cells in anti-PD-1-refractory triple-negative breast cancer: a phase 2 trial
2025-Jul, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03776-7
PMID:40563015
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现抗原呈递肥大细胞(apMCs)与PD-1抑制剂疗效的关联,并开展二期临床试验验证色甘酸钠联合抗PD-1治疗对难治性三阴性乳腺癌的疗效 | 首次揭示肥大细胞在肿瘤免疫调控中的关键作用,发现色甘酸钠可动员apMCs增强T细胞免疫,为克服抗PD-1耐药提供新策略 | 样本量有限(44例单细胞分析,484例验证),研究聚焦三阴性乳腺癌,结果可能不适用于其他癌症类型 | 探索克服三阴性乳腺癌抗PD-1治疗耐药的新机制和临床策略 | 三阴性乳腺癌患者(初治44例,验证队列484例,临床试验为难治性转移性三阴性乳腺癌女性患者) | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 44例初治患者单细胞分析,484例独立验证,二期临床试验患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3307 | 2025-10-06 |
A novel subset of inflammation-related liver NK cells modulates immune responses in a murine model of primary biliary cholangitis
2025-Jul, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2025.103454
PMID:40609234
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研究论文 | 本研究在原发性胆汁性胆管炎中发现并鉴定了一类新型炎症相关自然杀伤细胞亚群 | 首次鉴定出具有CD49aCXCR6特征的新型炎症相关NK细胞亚群,并阐明其从常规NK细胞分化及通过TNF-α调控免疫反应的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分 | 探究原发性胆汁性胆管炎中新型免疫细胞亚群的功能机制 | 小鼠PBC模型(ARE-Del小鼠)和PBC患者肝脏样本 | 免疫学 | 自身免疫性肝病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | PBC小鼠模型和患者肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
3308 | 2025-10-06 |
Guard cells on the adaxial and abaxial leaf surfaces use different compositions of potassium ion channels to drive light-induced stomatal opening
2025-Jul, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02026-5
PMID:40634560
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研究论文 | 本研究揭示了植物叶片上下表皮保卫细胞通过不同钾离子通道组成驱动光诱导气孔开放的分子机制 | 首次发现植物上下表皮保卫细胞利用不同钾离子通道控制气孔光响应 | 研究主要基于拟南芥和烟草模型植物,在其他植物中的普适性需进一步验证 | 探究植物叶片上下表皮气孔对光响应差异的分子机制 | 拟南芥和烟草的保卫细胞 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序,计算机模拟 | OnGuard模拟 | 基因表达数据 | 拟南芥和烟草的保卫细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
3309 | 2025-10-06 |
OM-85, a Bacterial Lysate, Reduces Pulmonary Nodule Malignant Probability: A Retrospective Study
2025-Jul, The clinical respiratory journal
DOI:10.1111/crj.70109
PMID:40692186
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研究论文 | 回顾性研究评估细菌裂解物OM-85对慢性支气管炎患者高危肺结节的干预效果 | 首次发现OM-85可通过提升NK细胞比例降低肺结节恶性概率 | 回顾性研究设计,样本量有限(72例治疗组/90例对照组) | 评估OM-85对高危肺结节的干预效果 | 慢性支气管炎伴高危肺结节患者 | 临床医学 | 肺癌 | 流式细胞术, 多重免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 医学影像, 分子生物学数据 | 162例患者(204个肺结节) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3310 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals Shen-Bai-Jie-Du decoction retards colorectal tumorigenesis by regulating the TMEM131-TNF signaling pathway-mediated differentiation of immunosuppressive dendritic cells
2025-Jul, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.05.013
PMID:40698132
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示参白解毒汤通过调控TMEM131-TNF信号通路介导的免疫抑制性树突细胞分化延缓结直肠肿瘤发生 | 首次构建小鼠和临床患者相互验证的单细胞转录组图谱,发现CCL22树突细胞的积累及其免疫抑制功能,并揭示参白解毒汤和黄连素通过TMEM131-TNF信号通路逆转这一过程 | 机制研究仍需进一步验证,特别是TMEM131作为黄连素潜在靶点的具体作用机制 | 探究参白解毒汤延缓结直肠肿瘤发生的分子机制 | 结直肠肿瘤微环境中的树突细胞 | 单细胞测序分析 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化, 流式细胞术, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 蛋白质表达数据 | 小鼠模型和临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
3311 | 2025-10-06 |
IDENTIFICATION OF DISEASE-SPECIFIC VULNERABILITY STATES AT THE SINGLE-CELL LEVEL
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.04.626873
PMID:40661457
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研究论文 | 本研究开发了一种计算流程,通过整合单细胞转录组数据和功能缺失筛选数据来识别胶质母细胞瘤中的疾病特异性脆弱状态 | 首次将单细胞分辨率转录组数据与CRISPR功能缺失筛选数据整合,识别出三种特征不同的单细胞脆弱状态 | 研究主要基于体外实验数据,需要进一步体内验证 | 识别胶质母细胞瘤中最关键的靶向细胞类型 | 胶质母细胞瘤肿瘤细胞 | 单细胞分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CRISPR筛选 | 迭代层次聚类 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 49个胶质母细胞瘤肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
3312 | 2025-10-06 |
Cell simulation as cell segmentation
2025-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02697-0
PMID:40404994
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研究论文 | 本研究开发了一种名为Proseg的概率分割方法,通过细胞模拟技术改进单细胞空间转录组数据的细胞分割精度 | 采用从头细胞模拟方法推断形态学上合理的细胞边界,在多个商业平台上表现出优越性能和计算效率 | NA | 提高单细胞空间转录组数据中细胞分割的准确性 | 肾细胞癌患者样本中的肿瘤浸润免疫细胞(中性粒细胞和T细胞) | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞空间转录组学 | 概率分割模型 | 空间转录组数据 | NA | 多个商业平台(具体未指明) | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
3313 | 2025-10-06 |
CDKN1A as a potential target for Eltrombopag treatment in ITP and its regulation of the communication between macrophages and transitional B cells in ITP
2025-Jun, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06436-5
PMID:40515824
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,发现CDKN1A是影响ITP患者对Eltrombopag治疗反应的关键基因,并揭示了其在巨噬细胞与过渡B细胞通讯中的作用 | 首次发现CDKN1A作为Eltrombopag治疗ITP的关键调控因子,揭示了巨噬细胞通过TGFβ信号通路与过渡B细胞通讯的新机制 | 研究主要基于细胞系实验和生物信息学分析,需要进一步在临床样本中验证 | 鉴定ITP患者对Eltrombopag治疗反应的新型生物标志物,研究巨噬细胞和过渡B细胞在ITP发病机制中的作用 | 免疫性血小板减少症(ITP)患者、RAW264.7巨噬细胞系 | 生物信息学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA-seq、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、分子对接、siRNA敲低、质粒过表达 | Seurat | 基因表达数据、单细胞测序数据 | GSE112278和GSE196676数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3314 | 2025-10-06 |
GUIDING CLUSTERING AND ANNOTATION IN SINGLE-CELL RNA SEQUENCING USING THE AVERAGE OVERLAP METRIC
2025-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.06.652497
PMID:40654835
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研究论文 | 提出使用平均重叠度量来比较单细胞RNA测序中差异表达基因的排名列表,以指导细胞聚类和注释 | 首次将平均重叠度量应用于单细胞RNA测序数据分析,通过比较差异表达基因的排名来评估细胞簇之间的相似性 | NA | 开发一种能够稳健比较和注释单细胞RNA测序推断簇的方法 | T细胞群体和未分选的小鼠胸腺细胞 | 单细胞RNA测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类算法 | 单细胞转录组数据 | 包含高度相似但不同的T细胞群体数据集和未分选小鼠胸腺细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3315 | 2025-10-06 |
A human and mouse subpopulation of senescent β-cells induces pathologic dysfunction through targetable paracrine signaling
2025-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.07.648438
PMID:40654723
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研究论文 | 本研究通过鉴定人和小鼠衰老β细胞亚群,揭示其通过可靶向的旁分泌信号诱导病理功能障碍的机制 | 首次在人和小鼠中鉴定出表达特定标志物的衰老β细胞亚群,并证明其分泌的SASP因子可诱导继发性衰老和β细胞功能障碍 | NA | 研究衰老β细胞亚群的异质性及其在糖尿病病理过程中的作用 | 人和小鼠的胰腺β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 高脂饮食喂养的小鼠和来自2型糖尿病供体的人类胰岛 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
3316 | 2025-10-06 |
EZH2 coordinates memory B-cell programming and recall responses
2025-May-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf004
PMID:40073167
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研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶EZH2在记忆B细胞编程和回忆应答中的关键调控作用 | 首次系统阐明EZH2通过表观遗传机制调控记忆B细胞分化和功能潜能的分子机制 | EZH2敲除不完全,存在选择性压力维持其甲基转移酶活性,可能影响表型分析的准确性 | 探究表观遗传酶EZH2在记忆B细胞形成和功能调控中的作用机制 | 小鼠记忆B细胞 | 免疫学 | 流感感染 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3317 | 2025-10-06 |
USP4 depletion-driven RAB7A ubiquitylation impairs autophagosome-lysosome fusion and aggravates periodontitis
2025-04, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2024.2429371
PMID:39663592
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研究论文 | 本研究揭示了USP4缺失通过介导RAB7A泛素化破坏自噬体-溶酶体融合,从而加剧牙周炎发病机制 | 首次发现USP4通过调控RAB7A泛素化状态影响自噬体-溶酶体融合在牙周炎中的作用机制 | NA | 阐明自噬与牙周炎发病机制之间的分子调控网络 | 临床牙龈组织样本、实验性牙周炎小鼠模型、巨噬细胞 | 分子生物学 | 牙周炎 | 基因组学分析、组织学分析、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、组织学数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3318 | 2025-10-06 |
Individualized therapy guided by single-cell sequencing in anti-GABAAR encephalitis
2025-Mar-08, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-025-03300-y
PMID:40057475
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研究论文 | 通过单细胞测序指导抗GABAAR脑炎的个体化治疗 | 首次在抗GABAAR脑炎中发现单克隆CD8 T细胞群和异常JAK-STAT信号通路,并鉴定出LMO5蛋白作为交叉反应抗原 | 仅基于单个病例研究,样本量有限 | 探索抗GABAAR脑炎的发病机制并指导个体化治疗 | 一名难治性抗GABAAR脑炎患者和四名健康志愿者的PBMCs及脑脊液细胞 | 单细胞测序 | 自身免疫性脑炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1名患者和4名健康志愿者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3319 | 2025-10-06 |
Evolution of SARS-CoV-2 T cell responses as a function of multiple COVID-19 boosters
2025-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.08.631842
PMID:39829792
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研究论文 | 通过三年纵向研究分析多次COVID-19加强疫苗接种对T细胞和抗体反应的长期影响 | 首次系统揭示重复疫苗接种后T细胞反应的动态变化规律,发现T细胞反应快速达到平台期并保持稳定 | 样本量相对有限(78人),且无法完全排除无症状感染对结果的潜在影响 | 研究重复COVID-19疫苗接种对适应性免疫的长期影响 | 78名无报告症状感染的疫苗接种者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫学数据、基因表达数据 | 78名疫苗接种者,为期三年的纵向研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3320 | 2025-10-06 |
Reversal of inflammatory reprogramming by vasodilator agents in pulmonary hypertension
2025-Jan, ERJ open research
IF:4.3Q1
DOI:10.1183/23120541.00486-2024
PMID:39811555
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析肺动脉高压患者外周血单核细胞,揭示血管扩张剂对炎症重编程的逆转作用 | 首次在单细胞水平定义肺动脉高压患者血液中的炎症重编程特征,并证明血管扩张剂具有抗炎活性 | 样本量较小(总样本数20),且仅观察了3个月的治疗效果 | 探究血管扩张剂是否逆转肺动脉高压患者的炎症激活状态 | 肺动脉高压患者(特发性PAH和系统性硬化相关PAH)和非PAH对照的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 网络分析 | 系统生物学方法 | 单细胞转录组数据 | 20个样本(3对照,4未治疗PAH,7 PDE5i治疗,6 PDE5i+macitentan治疗) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |