单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 37403 篇文献,本页显示第 3301 - 3320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3301 2026-01-27
Identification of NK cell marker genes based on single-cell sequencing to establish a prognostic signature in breast cancer
2025-Dec-19, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究基于单细胞测序数据识别NK细胞标志基因,构建了一个用于乳腺癌预后预测的模型 首次结合单细胞测序数据识别NK细胞标志基因,并利用机器学习构建乳腺癌预后模型,揭示了NK细胞在乳腺癌免疫浸润中的关键作用 研究依赖于公共数据库(TCGA和GEO)的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列验证 阐明NK细胞在乳腺癌预后和免疫浸润中的作用,并构建预测模型 乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 机器学习模型 基因表达数据 TCGA和GEO数据库中的乳腺癌样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3302 2026-01-27
Celastrol suppresses bone destruction in rheumatoid arthritis by inhibiting ALOX5 expression in macrophages via the NF-κB pathway
2025-Dec-17, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了中药活性成分雷公藤红素通过抑制巨噬细胞中ALOX5基因表达,进而抑制NF-κB通路活化,从而减轻类风湿关节炎骨破坏的分子机制 首次系统性地结合多组学数据(GEO数据库、单细胞RNA测序)和分子对接技术,鉴定出雷公藤红素在RA中的13个潜在靶点,并明确了ALOX5在巨噬细胞中的关键作用及其通过TNF-NFκB通路调控MMP3的机制 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型或临床样本的直接验证;单细胞分析的数据来源和样本量未具体说明 阐明雷公藤红素(Celastrol)在类风湿关节炎(RA)中抑制骨破坏的具体分子机制 类风湿关节炎(RA)相关的基因表达数据、雷公藤红素的分子靶点、巨噬细胞 生物信息学 类风湿关节炎 基因集变异分析(GSVA)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、分子对接、免疫浸润分析、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据(微阵列/RNA-seq)、单细胞转录组数据 基于三个GEO数据集(GSE55235, GSE93777, GSE200815),具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3303 2026-01-27
DNMT1 modulation of RASSF1A methylation enhances breast cancer brain metastasis
2025-Dec-11, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究探讨了DNMT1通过调控RASSF1A甲基化促进乳腺癌脑转移的机制 首次在单细胞水平利用循环肿瘤细胞(CTCs)的转录组测序,揭示了DNMT1作为乳腺癌细胞存活、迁移和侵袭的关键促进因子,并证实了RASSF1A是其直接甲基化靶点 研究主要基于原位乳腺癌模型,临床样本验证尚不充分;未探讨其他DNA甲基转移酶(如DNMT3A/B)的可能作用 阐明DNMT1调控RASSF1A甲基化在乳腺癌脑转移中的分子机制 乳腺癌细胞、循环肿瘤细胞(CTCs) 数字病理学 乳腺癌 单细胞转录组测序、DNA甲基化测序、甲基化特异性PCR、染色质免疫沉淀 NA 测序数据 未明确说明(基于原位乳腺癌模型) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3304 2026-01-27
RNASEH2C enhances TRAF3IP1 to degrade RAI14 in lysosomes thus hindering macrophage antigen presentation and advancing liver cancer
2025-Dec-08, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了RNASEH2C通过增强TRAF3IP1表达,促进RAI14在溶酶体中的降解,从而抑制巨噬细胞抗原呈递,进而促进肝癌进展的分子机制 首次阐明了RNASEH2C在非极化巨噬细胞中通过调控RAI14的溶酶体降解来抑制抗原呈递,从而促进肝癌发展的新机制,并发现了HSC70和CMTM6在RAI14降解中的相反作用 研究主要基于体外细胞模型和小鼠肿瘤模型,尚未在临床样本中进行大规模验证;对RNASEH2C调控TRAF3IP1表达的具体分子机制阐述不够深入 探究RNASEH2C如何影响巨噬细胞抗原呈递功能及其在肝细胞癌进展中的作用 巨噬细胞(特别是非极化巨噬细胞)、肝细胞癌(HCC)细胞、小鼠肿瘤模型 肿瘤免疫学 肝癌 单细胞RNA测序、免疫印迹、免疫荧光、免疫沉淀、流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据、细胞图像数据 未明确说明具体样本数量,使用了体外细胞模型和小鼠肿瘤模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3305 2026-01-27
A decreased proportion of naïve MAIT cells is associated with the incomplete immune reconstitution in antiretroviral therapy-treated HIV-1 patients
2025-Dec, Virologica Sinica IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体谱分析,揭示了在抗逆转录病毒治疗后的HIV-1患者中,幼稚MAIT细胞比例降低与不完全免疫重建之间的关联 首次通过单细胞测序技术比较分析免疫无应答者、免疫应答者和健康对照的免疫谱,并识别出幼稚MAIT细胞比例降低作为不完全免疫重建的关键细胞亚群 研究样本量有限,且主要基于外周血单核细胞分析,未涉及组织特异性免疫反应 探究抗逆转录病毒治疗后HIV-1患者不完全免疫重建的免疫学机制 HIV-1感染患者(包括免疫无应答者和免疫应答者)以及健康对照个体的外周血单核细胞 免疫学 HIV感染 单细胞RNA测序,单细胞T细胞受体谱测序 NA 单细胞转录组数据,T细胞受体序列数据 未明确指定样本数量,但包括HIV患者和健康对照 NA 单细胞RNA-seq,单细胞TCR测序 NA NA
3306 2026-01-27
Targeting the ApoB100-ENO1 interaction with engineered peptides attenuates atherosclerotic inflammation and plaque progression
2025 Nov-Dec, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine IF:6.4Q1
研究论文 本研究开发了一种名为PP3m的工程化肽,通过靶向抑制ApoB100与ENO1的相互作用,有效减轻动脉粥样硬化炎症和斑块进展 首次发现并靶向ApoB100-ENO1相互作用轴,开发了稳定的肽抑制剂PP3m,该疗法在不影响血脂水平的情况下独立减轻炎症和斑块进展 研究主要基于小鼠模型(Ldlr-/-小鼠),其临床转化效果尚需在人体中进一步验证;体外模型可能无法完全模拟体内复杂的炎症微环境 开发一种通过靶向ApoB100-ENO1相互作用来减轻动脉粥样硬化炎症和斑块进展的新型治疗策略 人类动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞、体外培养的巨噬细胞模型、以及喂食致动脉粥样硬化饮食的Ldlr-/-小鼠 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据、细胞表型数据、组织病理学数据 人类动脉粥样硬化斑块的scRNA-seq数据(具体数量未明确说明)、Ldlr-/-小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3307 2026-01-27
DeepDeconUQ estimates malignant cell fraction prediction intervals in bulk RNA-seq tissue
2025-Jun, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了一种名为DeepDeconUQ的深度神经网络模型,用于基于bulk RNA-seq数据估计恶性细胞分数的预测区间 DeepDeconUQ首次将不确定性量化整合到恶性细胞分数预测中,利用单细胞RNA测序数据和保形化分位数回归生成可靠的预测区间 未明确提及具体局限性,但可能依赖于scRNA-seq数据的质量和可用性 开发一种能够量化预测不确定性的恶性细胞分数估计方法,以改进癌症诊断、预后和治疗决策 癌症组织中的恶性细胞分数 机器学习 癌症 bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 深度神经网络, 分位数回归神经网络 基因表达数据 模拟和真实癌症数据集,具体数量未明确 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
3308 2026-01-27
Evaluating genetic-ancestry inference from single-cell RNA-seq data
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一个评估从单细胞RNA测序数据推断遗传祖先方法的框架 首次系统评估了从scRNA-seq数据推断遗传祖先的准确性,并证明了现有工具(如ADMIXTURE)在此类稀疏数据上的有效性 研究依赖于有限的scRNA-seq数据集(4个),且变异检测受限于测序覆盖度和准确性 评估从单细胞RNA测序数据中推断遗传祖先的方法,以提高数据集的遗传多样性表征和减少分析偏差 单细胞RNA测序数据中的遗传多态性 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 ADMIXTURE scRNA-seq测序数据 196名捐赠者,来自人类细胞图谱的4个scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3309 2026-01-27
Transcriptomic Approaches to Cardiomyocyte-Biomaterial Interactions: A Review
2024-07-08, ACS biomaterials science & engineering IF:5.4Q2
综述 本文综述了转录组学方法在心肌细胞与生物材料相互作用研究中的应用,强调了其在心脏生物工程和再生医学中的重要性 聚焦于转录组学技术(如bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、单核RNA-seq和空间转录组学)在解析心肌细胞-生物材料相互作用网络中的创新应用,并探讨了纵向研究、通路分析和机器学习等方法的整合潜力 存在成本高、细胞尺寸限制、样本差异以及分析流程复杂等挑战 旨在通过转录组学方法深入理解心肌细胞与生物材料的相互作用机制,以促进心脏健康相关研究 心肌细胞与生物材料的相互作用 数字病理学 心血管疾病 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 机器学习 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
3310 2026-01-26
Gsx2 regulates oligodendrocyte precursor formation in the zebrafish spinal cord
2026-Mar, Developmental biology IF:2.5Q2
研究论文 本研究利用斑马鱼模型,通过单细胞RNA测序和单核ATAC测序技术,揭示了Gsx2在调控脊髓中少突胶质前体细胞形成时间中的作用 首次在斑马鱼中识别出pre-OPCs亚群,并发现Gsx2通过调控基因网络影响OPC形成的时机,而非分化过程 研究主要基于斑马鱼模型,结果在哺乳动物中的普适性需进一步验证 探究脊髓中神经祖细胞向少突胶质细胞谱系分化的机制 斑马鱼脊髓中的神经祖细胞、pre-OPCs和少突胶质前体细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, CRISPR/Cas9基因组编辑 NA 单细胞转录组数据, 单核染色质可及性数据 斑马鱼胚胎样本 NA 单细胞RNA-seq, 单核ATAC-seq NA NA
3311 2026-01-26
Single-cell dissection of CD8+ T cell-driven immune dysregulation in type 1 diabetes mellitus: Mechanistic links to diabetic foot pathogenesis
2026-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了1型糖尿病患者外周血单个核细胞中CD8+ T细胞驱动的免疫失调机制,并探讨了其与糖尿病足等并发症的潜在联系 首次在1型糖尿病患者中发现了一个新的耗竭性CD4+ T细胞亚群(PDCD1+, LAG3+),并揭示了GALECTIN-CD44信号轴在驱动单核细胞/树突状细胞与CD8+ T/NK细胞间促炎性串扰中的核心作用 研究样本量相对有限(共77例),且为横断面研究,无法确定观察到的免疫失调是疾病的原因还是结果 阐明1型糖尿病进展的细胞网络及其与糖尿病并发症的潜在联系 1型糖尿病(T1DM)患者的外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞组学 1型糖尿病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 无监督聚类分析,细胞间通讯分析 单细胞转录组数据 46名3期1型糖尿病患者和31名匹配对照者的外周血单个核细胞,共87,542个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3312 2026-01-26
Single-cell sequencing reveals APOE deletion alleviates adipose wasting in cancer cachexia via macrophage repolarization
2026-Feb, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 本研究通过单细胞测序揭示了载脂蛋白E(ApoE)缺失通过巨噬细胞重编程缓解癌症恶病质中脂肪组织消耗的机制 首次在癌症恶病质背景下,通过单细胞测序技术揭示了ApoE调控脂肪组织稳态的新机制,特别是发现了Cbr2+巨噬细胞亚群向M2表型转化的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;未深入探讨ApoE调控巨噬细胞极化的具体分子通路 探究ApoE在癌症恶病质脂肪组织重塑中的作用机制 癌症恶病质患者样本、小鼠模型、脂肪细胞 单细胞组学 癌症恶病质 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、免疫荧光图像 未明确样本数量,包括恶病质患者血浆/皮下脂肪样本、小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3313 2026-01-26
Research progress on immunotherapeutics for triple-negative breast cancer from a single-cell perspective
2026-Feb, Critical reviews in oncology/hematology
综述 本文从单细胞视角综述了三阴性乳腺癌免疫治疗的研究进展,整合了单细胞多组学技术与药理学的最新发现 从单细胞多组学(scRNA-seq、scATAC-seq、空间转录组学)的独特视角,系统整合了肿瘤微环境重塑机制与免疫治疗开发,提出了单细胞指导的免疫治疗创新策略 作为综述文章,主要基于现有文献进行总结,未涉及原始实验数据验证 总结三阴性乳腺癌免疫治疗的最新进展,探讨肿瘤微环境对免疫治疗耐药性的影响,并展望单细胞技术指导下的精准治疗策略 三阴性乳腺癌及其肿瘤微环境 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、空间转录组学 NA 单细胞多组学数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
3314 2026-01-26
A PNPLA3-NACC1-RIPK3 pathway mediates macrophage necroptosis and inflammation in MASLD
2026-Feb-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本研究揭示PNPLA3 148M变异通过巨噬细胞特异性NF-κB-NACC1-RIPK3轴促进巨噬细胞坏死性凋亡和炎症信号,从而加剧肝细胞脂肪变性和肝星状细胞活化 首次阐明PNPLA3 148M变异在巨噬细胞中的特异性作用机制,并发现NACC1作为RIPK3的关键转录调节因子 研究主要基于体外诱导多能干细胞衍生的多细胞肝脏培养模型,体内验证和临床转化仍需进一步研究 探究PNPLA3 148M变异如何改变巨噬细胞行为及多细胞肝脏病理在脂毒性应激下的作用 人诱导多能干细胞衍生的多细胞肝脏培养(包含肝细胞、肝星状细胞和同基因巨噬细胞) 代谢功能障碍相关脂肪肝病 代谢功能障碍相关脂肪肝病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3315 2026-01-26
Exploring key genes in NAFLD linked to glutamine metabolism: A comprehensive analysis combining multi-omics, machine learning and SHAP
2026-Feb, Asia Pacific journal of clinical nutrition IF:1.3Q4
研究论文 本研究通过整合多组学、机器学习和SHAP分析,探索与非酒精性脂肪肝病相关的谷氨酰胺代谢关键基因 结合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和多种机器学习算法,识别与NAFLD风险相关的代谢物和基因,并利用SHAP方法解释模型贡献 未明确说明样本来源和具体数量,可能限制结果的普适性 探索NAFLD的发病机制,寻找新的诊断和治疗靶点 非酒精性脂肪肝病相关的血清代谢物和基因 机器学习 非酒精性脂肪肝病 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、GO和KEGG富集分析、LASSO回归、机器学习算法(Catboost、NGboost、XGboost)、SHAP分析 Catboost、NGboost、XGboost 多组学数据(包括代谢组和转录组) 涉及1,400种血清代谢物和两个NAFLD数据集,具体样本数量未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3316 2026-01-26
Spatial Profiling Reveals Distinct Molecular and Immune Evolution of Mouse Lung Adenocarcinoma Precancers with or Without Carcinogen Exposure
2026-Jan-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究整合全外显子组测序、成像质谱流式细胞术和空间转录组学,探究了两种小鼠肺腺癌前体模型的分子演化和免疫反应 首次结合空间技术与遗传分析,系统比较了遗传工程和致癌物诱导的肺腺癌前体模型在分子和免疫演化上的差异 研究基于小鼠模型,结果向人类癌症的转化需进一步验证 探究肺腺癌前体在有无致癌物暴露下的分子和免疫演化差异 小鼠肺腺癌前体模型(129S4 K 遗传工程模型和 129S4 U 致癌物诱导模型) 数字病理学 肺癌 全外显子组测序, 成像质谱流式细胞术, 空间转录组学 NA 空间单细胞数据, 空间转录组数据, 基因组数据 141只小鼠中的156个病灶,包括284个IMC感兴趣区域和51,531个空间转录组点 NA 空间转录组学, 成像质谱流式细胞术 NA NA
3317 2026-01-26
Bimekizumab long-term response in psoriasis: Mechanistic insights into efficacy level and durability
2026-Jan-22, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1
研究论文 本文评估了bimekizumab在银屑病患者中长达4年的临床反应持久性,并探讨了其分子机制 通过单细胞RNA测序揭示了病变皮肤中表达IL17A和/或IL17F的组织驻留记忆T细胞亚群,并发现其与bimekizumab疗效持久性相关 研究基于回顾性临床数据整合和转录组分析,可能受样本选择和测序技术限制 评估bimekizumab治疗银屑病的长期疗效持久性并探究其分子机制 银屑病患者 数字病理学 银屑病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA 转录组数据 503名患者(来自临床试验),另加三个独立单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
3318 2026-01-26
A Nanovesicle-Sericin-Based Hydrogel Scaffold for RGC Survival in Glaucoma via Regulation of Microglial Polarization
2026-Jan-21, ACS applied materials & interfaces IF:8.3Q1
研究论文 本研究开发了一种负载干细胞和纳米囊泡的丝胶基水凝胶支架,旨在通过调节小胶质细胞极化来促进青光眼模型中视网膜神经节细胞的存活 开发了一种新型的、集成了源自牙周膜干细胞的纳米囊泡(负载原花青素)的丝胶基光交联水凝胶支架,用于协同调节神经炎症微环境 NA 开发一种生物材料支架,以改善青光眼病理条件下视网膜神经节细胞的存活 视网膜神经节细胞、小胶质细胞、牙周膜干细胞 生物材料与组织工程 青光眼 单细胞RNA测序、RNA测序、超速离心、脂质体挤出 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3319 2026-01-26
Integrative transcriptomic profiling reveals subtype-specific therapeutic vulnerabilities and resistance mechanisms in prostate cancer
2026-Jan-21, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过整合转录组数据和临床分析,揭示了前列腺癌中雄激素受体依赖性的异质性,并识别了与治疗抵抗相关的分子亚型及关键耐药驱动因子MCL1 结合CRISPR-Cas9筛选、多队列转录组整合及空间与单细胞测序,系统解析了前列腺癌的AR依赖性和耐药机制,并发现了具有独立预后价值的侵袭性分子亚型(Cluster 3) 研究主要基于细胞系和回顾性队列数据,缺乏前瞻性临床验证,且样本来源可能受限于特定平台或技术 解析前列腺癌中雄激素受体依赖性和耐药机制,以识别亚型特异性治疗靶点 前列腺癌细胞系(如VCaP、LNCaP、DU145等)、TCGA-PRAD、Changhai和DKFZ队列的临床样本、原发性和转移性肿瘤组织 数字病理学 前列腺癌 CRISPR-Cas9筛选、RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 共识聚类、模糊聚类 转录组数据、临床数据 多个细胞系及TCGA-PRAD、Changhai、DKFZ队列的样本(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
3320 2026-01-23
Single-cell transcriptome analysis reveals mechanisms by which hippocampal deep brain stimulation promotes neurorepair and microglial subpopulation remodeling in ischemic stroke
2026-Jan-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
回到顶部