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当前共找到 38610 篇文献,本页显示第 3301 - 3320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3301 2026-03-06
Spatial atlas of the mouse central nervous system at molecular resolution
2023-10, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究利用STARmap PLUS原位测序技术,在三维空间中以单细胞分辨率绘制了小鼠中枢神经系统的分子细胞类型图谱 开发了STARmap PLUS原位测序方法,首次在三维尺度上以高分辨率(194×194×345 nm体素)同时分析1,022个基因,实现了对小鼠全脑和脊髓的全面空间转录组分析 NA 绘制小鼠中枢神经系统在分子分辨率下的空间图谱,以揭示大脑解剖结构和功能的分子基础 成年小鼠的大脑和脊髓组织 数字病理学 NA 原位测序 NA 空间转录组数据 109万个高质量细胞 NA 空间转录组学 STARmap PLUS STARmap PLUS原位测序技术,体素尺寸为194×194×345 nm
3302 2026-03-06
Spatial transcriptomics analysis of neoadjuvant cabozantinib and nivolumab in advanced hepatocellular carcinoma identifies independent mechanisms of resistance and recurrence
2023-09-18, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学分析肝细胞癌新辅助卡博替尼和纳武利尤单抗治疗后的肿瘤微环境,揭示了响应与非响应肿瘤的异质性机制 首次应用空间转录组学技术系统性描绘肝细胞癌新辅助联合治疗下的肿瘤微环境异质性,识别出PAX5模块激活和B细胞成熟在治疗响应中的关键作用,以及癌症相关成纤维细胞介导的细胞外基质重塑机制 样本量较小(仅15例患者),且仅基于单中心前瞻性试验数据,需要更大规模验证 探究肝细胞癌对现代系统性治疗(卡博替尼联合纳武利尤单抗)响应差异的分子和细胞机制 肝细胞癌患者的肿瘤切除标本 空间转录组学 肝细胞癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据 15例肝细胞癌患者(其中5例有病理响应) NA 空间转录组学 NA NA
3303 2026-03-06
An integrated genomic approach identifies follistatin as a target of the p63-epidermal growth factor receptor oncogenic network in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Sep, NAR cancer IF:3.4Q2
研究论文 本文通过整合基因组学方法,识别了头颈鳞状细胞癌中p63-表皮生长因子受体致癌网络的关键靶点卵泡抑素 首次将卵泡抑素确定为p63的直接转录靶点,并揭示了其在连接TGF-β和EGFR通路中的功能作用,同时通过单细胞RNA测序数据明确了癌细胞是肿瘤微环境中卵泡抑素的主要来源 未详细探讨卵泡抑素在肿瘤微环境中与免疫细胞相互作用的分子机制 阐明头颈鳞状细胞癌中致癌基因及其下游靶点介导肿瘤进展的机制 头颈鳞状细胞癌患者样本和代表性细胞系模型 基因组学 头颈鳞状细胞癌 整合基因组学分析、单细胞RNA测序 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 来自头颈鳞状细胞癌患者和细胞系模型的多个转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3304 2026-03-06
Transcriptomic forecasting with neural ordinary differential equations
2023-Aug-11, Patterns (New York, N.Y.)
研究论文 本文开发了一种基于神经常微分方程的方法RNAForecaster,用于预测单细胞中多个未来时间步的基因表达状态 提出了一种嵌入无关的方法,能够从具有时间信息的高通量数据集中短期预测未来表达状态 NA 解决从细胞状态快照推断轨迹到估计细胞基因表达时间变化的挑战 单细胞转录组数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 神经常微分方程 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3305 2026-03-06
Cellular barcoding tracks heterogeneous clones through selective pressures and phenotypic transitions
2023-07, Trends in cancer IF:14.3Q1
综述 本文综述了细胞条形码技术在追踪异质性癌症克隆亚群命运中的应用,特别是与单细胞转录组学结合,以克隆级分辨率分析分子机制 结合细胞条形码与单细胞转录组学,实现克隆水平的高分辨率纵向分析,为研究肿瘤异质性起源和贡献提供了新工具 NA 探讨肿瘤细胞异质性的起源和贡献,以及选择和表型可塑性在疾病进展和治疗中的作用 异质性癌症细胞群体中的克隆亚群 单细胞组学 癌症 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3306 2026-03-06
Spatial Single-Cell Technologies for Exploring Gastrointestinal Tissue Transcriptome
2023-06-26, Comprehensive Physiology IF:4.2Q1
综述 本文总结了空间单细胞转录组技术在探索胃肠道组织转录组方面的最新进展及其对理解胃肠道生理学的促进作用 系统综述了新兴的空间单细胞技术如何通过提供全基因组水平的基因表达空间信息,弥补传统方法在解析胃肠道组织结构和细胞异质性方面的不足 作为一篇小型综述,未涉及具体实验数据或技术细节的深入分析,主要聚焦于技术概述和应用前景讨论 探讨空间单细胞转录组技术在胃肠道组织研究中的应用价值和发展前景 胃肠道组织及其多层次结构和异质性细胞群体 空间转录组学 NA 空间单细胞转录组技术 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
3307 2026-03-06
TFAP2 paralogs regulate midfacial development in part through a conserved ALX genetic pathway
2023-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了TFAP2旁系同源物通过调控ALX基因表达,在脊椎动物中面部发育中发挥关键作用 首次通过联合失活TFAP2A和TFAP2B,结合bulk和单细胞RNA-seq分析,揭示了TFAP2在调控中面部基因调控网络中的核心作用,并证实了TFAP2-ALX调控轴在脊椎动物间的保守性 研究主要基于小鼠和斑马鱼模型,在人类或其他哺乳动物中的直接验证尚需进一步探索 探究TFAP2旁系同源物在中面部发育中的调控机制 小鼠和斑马鱼的颅神经嵴细胞及中面部发育过程 发育生物学 面部畸形 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, ChIP-seq NA 基因表达数据, 染色质免疫沉淀数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3308 2026-03-06
Activation of Angiopoietin-Tie2 Signaling Protects the Kidney from Ischemic Injury by Modulation of Endothelial-Specific Pathways
2023-06-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究探讨了通过激活Angiopoietin-Tie2信号通路来保护肾脏免受缺血性损伤的分子机制,并测试了一种新型angiopoietin模拟物Hepta-ANG1的治疗潜力 揭示了VE-PTP在缺血再灌注损伤中上调并抑制Tie2的机制,首次展示了Hepta-ANG1作为新型治疗生物制剂在单细胞水平上促进肾脏内皮细胞新亚群出现的能力 研究基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证Hepta-ANG1的安全性和有效性 探究Angiopoietin-Tie2信号通路在缺血再灌注急性肾损伤中的保护作用及分子机制 小鼠肾脏内皮细胞及缺血再灌注损伤模型 单细胞组学 急性肾损伤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 使用VE-PTP野生型或敲除小鼠及C57BL/6J小鼠进行实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3309 2026-03-06
RhoA GEF Mcf2lb regulates rosette integrity during collective cell migration
2023-Apr-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用斑马鱼后侧线原基作为模型系统,发现RhoA鸟嘌呤核苷酸交换因子Mcf2lb通过调控顶端收缩来维持集体细胞迁移过程中多细胞玫瑰花结结构的完整性 首次鉴定出Mcf2lb作为RhoA特异性GEF在调控多细胞玫瑰花结结构完整性中的关键作用,并揭示了其通过RhoA-Rock-2a-非肌肉肌球蛋白II信号轴调控顶端收缩的分子机制 研究主要基于斑马鱼模型系统,在哺乳动物系统中的保守性有待进一步验证;对Mcf2lb调控RhoA活性的具体生化机制尚未深入解析 探究多细胞玫瑰花结结构形成和维持的分子调控机制 斑马鱼后侧线原基中的多细胞玫瑰花结结构 发育生物学 NA 单细胞RNA测序,整体原位杂交,活体成像,3D分析 NA 基因表达数据,成像数据 斑马鱼后侧线原基细胞群(约150个细胞) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3310 2026-03-06
Impaired Reorganization of Centrosome Structure Underlies Human Infantile Dilated Cardiomyopathy
2023-04-25, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究首次揭示人类婴儿扩张型心肌病由中心体结构重组缺陷引起,并发现RTTN基因在围产期心脏发育中的新作用 首次将中心体缺陷与非综合征性扩张型心肌病联系起来,并发现RTTN基因在心脏发育中的关键作用 研究基于单一罕见病例,未来需要更多样本验证;动物模型与人类疾病存在差异 探究中心体重组过程在心肌细胞生物学中的作用及其缺陷与人类心脏疾病的关系 婴儿扩张型心肌病患者、诱导多能干细胞、斑马鱼、果蝇模型 心血管疾病研究 扩张型心肌病 全外显子组测序、CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 NA 基因组数据、转录组数据、图像数据 1名iDCM患者及其父母 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3311 2026-03-06
APOE modulates microglial immunometabolism in response to age, amyloid pathology, and inflammatory challenge
2023-03-28, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究探讨了APOE基因型如何通过免疫代谢机制影响小胶质细胞的功能,特别是在衰老、神经炎症和阿尔茨海默病病理背景下 结合了bulk、单细胞和空间转录组学,以及细胞特异性和空间分辨的代谢分析,系统性地揭示了APOE4在小胶质细胞免疫代谢调控中的核心作用 研究基于小鼠模型表达人类APOE,可能无法完全模拟人类疾病的所有复杂性 探究APOE基因型对小胶质细胞免疫代谢的调控作用及其在衰老、神经炎症和阿尔茨海默病病理中的影响 表达人类APOE的小鼠模型中的小胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 质谱成像 NA 转录组数据, 代谢数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
3312 2026-03-06
Compressed phenotypic screens for complex multicellular models and high-content assays
2023-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种通过合并扰动和计算反卷积来压缩高通量表型筛选的方法,以提高复杂多细胞模型和高内涵检测的筛选效率 建立了压缩筛选方法,通过合并扰动和计算反卷积,显著提高了复杂多细胞模型和高内涵检测的筛选效率,并证明了其在药物发现和基础生物学中的通用性 未明确说明方法在更广泛生物模型或不同扰动类型中的适用性限制,也未讨论计算反卷积算法的潜在误差来源 开发一种高效的压缩表型筛选方法,以克服传统高通量筛选在复杂多细胞模型和高内涵检测中的规模限制 小分子化合物库、患者来源的胰腺癌类器官、肿瘤微环境相关的重组蛋白配体库 计算生物学 胰腺癌 单细胞RNA测序、高内涵成像 计算反卷积模型 图像数据、转录组数据 未明确指定具体样本数量,涉及小分子库和重组蛋白配体库的筛选 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3313 2026-03-06
Multi-omic analyses of changes in the tumor microenvironment of pancreatic adenocarcinoma following neoadjuvant treatment with anti-PD-1 therapy
2022-11-14, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)在接受抗PD-1疗法新辅助治疗后肿瘤微环境的变化 首次前瞻性收集并应用多组学分析配对治疗前后的PDAC样本,揭示了GVAX疫苗联合nivolumab治疗中三级淋巴聚集体的免疫调节作用、肿瘤相关中性粒细胞密度与生存率的关系,以及CD137表达在T细胞激活中的关键作用 研究样本量有限,且为单中心平台研究,可能影响结果的普遍适用性 优化PDAC免疫治疗策略,探索抗PD-1疗法(nivolumab)联合GVAX疫苗的敏感性和耐药机制 胰腺导管腺癌(PDAC)患者治疗前后的肿瘤标本 数字病理学 胰腺癌 多组学分析,包括bulk RNA测序和单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 配对治疗前后的PDAC标本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3314 2026-03-06
Comprehensive multi-omics single-cell data integration reveals greater heterogeneity in the human immune system
2022-Oct-21, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文介绍了一种名为SuPERR的新型分析工作流程,用于整合多组学单细胞数据,以提高人类免疫系统中细胞类型识别的分辨率和准确性 开发了SuPERR工作流程,通过整合转录组、蛋白质组和细胞受体库信息,首次实现了更精确的细胞聚类和隐藏细胞亚群的发现,同时有效去除细胞双联体和防止细胞类型误分类 NA 提高多组学单细胞数据集中细胞类型识别的分辨率和分类准确性,以揭示人类免疫系统中更大的异质性 人类免疫系统细胞,包括骨髓中的抗体分泌细胞稀有亚群 机器学习 NA 单细胞转录组学、蛋白质组学、细胞受体库分析 NA 单细胞多组学数据(转录组、蛋白质组、细胞受体库) NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
3315 2026-03-06
Early life stress exacerbates obesity in adult female mice via mineralocorticoid receptor-dependent increases in adipocyte triglyceride and glycerol content
2022-Sep-01, Life sciences IF:5.2Q1
研究论文 本研究探讨了早期生活压力通过盐皮质激素受体依赖机制加剧成年雌性小鼠肥胖,特别是通过增加脂肪细胞甘油三酯和甘油含量 揭示了早期生活压力(MSEW)通过盐皮质激素受体(MR)介导的机制,影响脂肪细胞甘油外流和甘油三酯储存,从而加剧肥胖的新途径 研究仅针对雌性小鼠,未涉及雄性;且主要关注内脏脂肪(gWAT),其他脂肪库的影响未明确 探究早期生活压力对脂肪组织稳态功能的具体影响,以及盐皮质激素受体在介导肥胖反应中的作用 雌性小鼠的性腺白色脂肪组织(gWAT) NA 肥胖 脂质组学、转录组学、单细胞RNA测序、体外脂解实验 NA 脂质组学数据、转录组学数据、单细胞RNA测序数据 未明确具体样本数量,但涉及肥胖雌性MSEW小鼠与对照组的比较 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3316 2026-03-06
NFkB-signaling promotes glial reactivity and suppresses Müller glia-mediated neuron regeneration in the mammalian retina
2022-07, Glia IF:5.4Q1
研究论文 本研究探讨了NFkB信号通路在哺乳动物视网膜中如何影响胶质细胞对损伤的反应以及Müller胶质细胞向神经元重编程的过程 揭示了NFkB信号在损伤后Müller胶质细胞中的激活作用,并证明抑制NFkB能增强Ascl1过表达的Müller胶质细胞向神经元样细胞的重编程 研究主要基于啮齿动物视网膜模型,可能无法完全反映人类视网膜的再生机制 探究NFkB信号通路在调节哺乳动物视网膜Müller胶质细胞介导的神经元再生中的作用 啮齿动物视网膜中的Müller胶质细胞 神经再生 视网膜损伤 scRNA-seq NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
3317 2026-03-06
Fetal vs adult megakaryopoiesis
2022-06-02, Blood IF:21.0Q1
综述 本文综述了胎儿与成人巨核细胞生成的差异,探讨其分子机制、发育调控及临床意义 挑战传统观念,提出胎儿和新生儿巨核细胞生成具有发育独特的增殖、多倍体化和细胞质成熟解耦特征,而非“不成熟”,并强调单细胞RNA测序技术对巨核细胞亚群功能分化的新见解 NA 比较胎儿与成人巨核细胞生成的生物学差异,并探讨其分子机制和临床相关性 胎儿、新生儿和成人的巨核细胞及其前体细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3318 2026-03-06
Decoding the pathogenesis of Diamond-Blackfan anemia using single-cell RNA-seq
2022-May-10, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA-seq技术分析了Diamond-Blackfan贫血(DBA)患者的纯化红细胞祖细胞转录组,揭示了红细胞祖细胞周期异常与DBA发病机制的关联,并发现干扰素介导的细胞周期控制是糖皮质激素临床疗效的基础 首次在单细胞水平上解码DBA的发病机制,揭示了红细胞祖细胞在S期进入时面临复制压力并激活P53信号通路,同时发现干扰素通路在治疗响应中的作用,为DBA提供了新的替代治疗策略 研究样本量有限,且主要基于转录组分析,未深入探讨蛋白质水平或体内验证,可能影响结论的普适性 解码Diamond-Blackfan贫血的发病机制,并探索新的治疗策略 DBA患者的纯化红细胞祖细胞,分为未治疗、糖皮质激素响应和非响应三组 数字病理学 贫血 单细胞RNA-seq NA 转录组数据 来自DBA患者骨髓的纯化红细胞祖细胞样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3319 2026-03-06
Where Are They Now: Spatial and Molecular Diversity of Tissue-Resident Macrophages in the Kidney
2022-05, Seminars in nephrology IF:2.8Q2
综述 本文综述了肾脏驻留巨噬细胞(KRMs)在肾脏中的空间和分子多样性,及其在稳态、疾病和修复中的作用 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示了KRMs的异质性,识别了分子、功能和空间上不同的亚群及其在肾损伤后的动态变化 NA 探讨肾脏驻留巨噬细胞的多样性和功能,以促进肾脏疾病的治疗和肾脏健康 肾脏驻留巨噬细胞(KRMs) 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
3320 2026-03-06
Urine Single-Cell RNA Sequencing in Focal Segmental Glomerulosclerosis Reveals Inflammatory Signatures
2022-Feb, Kidney international reports IF:5.7Q1
研究论文 本研究利用尿液单细胞RNA测序技术,揭示了局灶节段性肾小球硬化症患者尿液细胞中的炎症特征和足细胞上皮-间质转化特征 首次在FSGS患者尿液中进行单细胞RNA测序分析,识别出单细胞亚型和足细胞特异性表达特征,并验证了这些特征在肾活检组织中的表达差异 样本量较小(12名患者,17份尿液样本),且为横断面研究,无法追踪疾病进展过程中的动态变化 探索FSGS患者尿液细胞中的疾病相关分子特征,评估尿液细胞分析作为诊断和预后工具的潜力 局灶节段性肾小球硬化症患者的尿液细胞 单细胞组学 肾脏疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 12名FSGS患者,共17份尿液样本,捕获为23个尿液细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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