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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3281 | 2025-10-06 |
ScAGCN: Graph Convolutional Network with Adaptive Aggregation Mechanism for scRNA-seq Data Dimensionality Reduction
2025-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00702-w
PMID:40281370
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据降维的自适应聚合图卷积网络方法 | 设计了基于节点分布和相似性箱线图的邻域选择策略,并通过定义邻域节点与中心节点的相似性度量优化了聚合函数 | NA | 解决单细胞RNA测序数据的大规模、高维度、高噪声和高稀疏性带来的分析挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络(GCN) | 基因表达数据 | 15个真实单细胞RNA测序数据集,包括10个大规模数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3282 | 2025-10-06 |
Advances in single-cell omics: Transformative applications in basic and clinical research
2025-Aug, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2025.102548
PMID:40517461
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术的最新进展及其在基础和临床研究中的变革性应用 | 强调单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学整合技术在解析复杂组织和识别独特细胞群体方面的突破性能力 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据和研究方法的具体局限性 | 探讨单细胞组学技术在生物学研究和临床应用中的重要作用 | 复杂组织、细胞群体、细胞功能状态 | 生物信息学 | 癌症、神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合、计算模型 | 计算模型 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
3283 | 2025-10-06 |
Insights into chondrocyte populations in cartilaginous tissues at the single-cell level
2025-Aug, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-025-01275-0
PMID:40640375
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综述 | 通过单细胞多组学技术揭示软骨组织中软骨细胞群体的异质性及其在疾病中的作用 | 利用单细胞转录组学实现对软骨细胞亚型更精细的功能注释分类 | 需要将先进单细胞技术与计算建模相结合以解析软骨细胞群体的动态相互作用 | 研究软骨细胞亚型在软骨形成、维持和疾病进展中的作用 | 软骨组织中的软骨细胞群体 | 单细胞生物学 | 骨关节炎、椎间盘疾病 | 单细胞多组学、单细胞转录组学 | 计算建模 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学、单细胞转录组学 | NA | NA |
3284 | 2025-10-06 |
Bioinspired 3D hydrogel scaffold to mimic tumor microenvironment for investigating into the anoikis resistance mechanisms in colorectal cancer
2025-Aug, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102061
PMID:40697318
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研究论文 | 开发了一种仿生复合水凝胶支架模拟肿瘤微环境,用于研究结直肠癌中的失巢凋亡抵抗机制 | 创建了由4-arm-PEGDA、明胶甲基丙烯酰和透明质酸甲基丙烯酰组成的仿生复合水凝胶,能形成紧凑的3D细胞球体模拟肿瘤微环境 | NA | 研究结直肠癌中失巢凋亡抵抗机制 | 结直肠癌细胞系Caco-2 | 生物医学工程 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,放射组学分析 | 3D水凝胶支架模型 | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3285 | 2025-10-06 |
Activation of S1PR1 by Ponesimod for Multiple Sclerosis Therapy: Uncovering MAPK and PI3K Pathway Mechanisms and Repurposing Potential
2025-Jul-25, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202404742
PMID:40708468
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研究论文 | 本研究揭示了ponesimod通过激活S1PR1受体调控MAPK/ERK和PI3K-Akt通路治疗多发性硬化的分子机制 | 结合元动力学、单细胞转录组学和药物重定位方法,首次发现ponesimod引起S1PR1受体W269氨基酸构象变化并阐明其下游信号通路 | 未明确说明研究样本量,动物研究结果需进一步临床验证 | 阐明ponesimod治疗多发性硬化的分子机制并探索药物重定位策略 | S1PR1受体及其信号通路,多发性硬化治疗 | 计算生物学 | 多发性硬化 | 元动力学模拟,单细胞转录组学,药物重定位 | 分子动力学模拟 | 分子模拟数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3286 | 2025-10-06 |
Circulating Immune Cell Signature Analysis in HFpEF Across Species
2025-Jul-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326249
PMID:40709473
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研究论文 | 通过跨物种分析揭示HFpEF患者循环免疫细胞的独特转录特征 | 首次在HFpEF中识别肥胖相关和肥胖非依赖的免疫细胞特征,并在小鼠模型中验证抗炎治疗的改善效果 | 样本量较小(人类n=21),需要更大规模研究验证 | 探究HFpEF中系统性免疫反应的分子机制 | HFpEF患者、HFrEF患者、健康对照者及HFpEF小鼠模型 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类21例(HFpEF 6例,HFrEF 8例,健康对照7例)+ HFpEF小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
3287 | 2025-10-06 |
Unraveling the Role of MDK-SDC4 Interaction in Pancreatic Cancer-Associated New-Onset Diabetes by Single-Cell Transcriptomic Analysis
2025-Jul-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409987
PMID:40709672
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示MDK-SDC4相互作用在胰腺癌相关新发糖尿病中的机制 | 首次通过单细胞RNA测序系统阐明MDK作为肿瘤细胞与β细胞间相互作用的关键介质,并发现其通过SDC4受体下调Ras信号通路损害胰岛素分泌的新机制 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床验证 | 探索胰腺癌相关新发糖尿病(PCAND)的发病机制并寻找区分PCAND与2型糖尿病的生物标志物 | 胰腺癌细胞、β细胞、PCAND患者、T2DM患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PCAND患者和T2DM患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3288 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing Identifies the Crucial Role of Mitochondrial Fission-Fusion Imbalance in Heart Failure Progression
2025-Jul-25, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-025-10662-7
PMID:40711504
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序比较病理性和生理性心脏肥大的分子机制,发现线粒体分裂-融合失衡在心力衰竭进展中起关键作用 | 首次在单细胞水平揭示线粒体分裂-融合动态平衡在心脏肥大类型转换中的时间依赖性变化规律 | 研究仅基于动物模型,需要进一步验证在人类心脏组织中的适用性 | 阐明病理性和生理性心脏肥大的分子机制差异及其与心力衰竭发展的关系 | TAC诱导的病理性心脏肥大和运动诱导的生理性心脏肥大小鼠模型 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
3289 | 2025-10-06 |
NKG2D-mediated cytotoxicity of CD4 cytotoxic T cells in multiple myeloma
2025-Jul-24, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025875
PMID:40106762
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了多发性骨髓瘤中CD4+细胞毒性T细胞通过NKG2D介导的细胞毒性作用机制 | 首次在多发性骨髓瘤中系统鉴定CD4+细胞毒性T细胞亚群,并证明其通过NKG2D介导的直接杀伤功能与患者生存改善相关 | 研究样本仅来源于骨髓,未涉及其他组织部位;机制研究主要基于体外实验 | 探究多发性骨髓瘤中CD4+ T细胞的具体抗肿瘤作用机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓CD4+ T细胞 | 免疫学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 多发性骨髓瘤不同疾病阶段患者的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3290 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics redefines focal neuroendocrine differentiation as a distinct prostate cancer pathology
2025-Jul-24, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70099
PMID:40705968
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研究论文 | 通过单细胞转录组学重新定义局灶性神经内分泌分化作为独特的前列腺癌病理类型 | 首次在单细胞水平揭示不同神经内分泌前列腺癌病理亚型的转录异质性,发现局灶性神经内分泌分化具有独特的信号通路特征和克隆进化模式 | 研究样本量有限(9个患者来源的异种移植模型),需要更大规模验证 | 探索神经内分泌前列腺癌不同病理亚型的转录特征差异 | 前列腺癌神经内分泌肿瘤细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18,632个肿瘤细胞,来自9个患者来源的异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3291 | 2025-07-26 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular Origin and Pathogenesis of Myofibroma in a Neonate: Case Report
2025-Jul-24, Pediatric blood & cancer
IF:2.4Q1
DOI:10.1002/pbc.31924
PMID:40708206
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
3292 | 2025-10-06 |
Subtypes and proliferation patterns of small intestine neuroendocrine tumors revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Jul-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.101153
PMID:40699214
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小肠神经内分泌肿瘤的亚型和增殖模式 | 首次通过单细胞或单核RNA测序识别出小肠神经内分泌肿瘤的两个不同亚型,并发现神经内分泌细胞本身基本不增殖而其他非恶性细胞类型高度增殖的反常现象 | 样本量较小(仅10例小肠神经内分泌肿瘤和1例混合型肺肿瘤),需要更大规模研究验证 | 探究神经内分泌肿瘤的肿瘤发生机制、肿瘤组成和混合型神经内分泌非神经内分泌肿瘤现象 | 低级别小肠神经内分泌肿瘤和混合型肺肿瘤样本 | 数字病理学 | 神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例小肠神经内分泌肿瘤和1例混合型肺肿瘤 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3293 | 2025-10-06 |
Multi-omic Data Integration Reveals Drug Targets of Skin Fibrosis
2025-Jul-23, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过多组学数据整合和孟德尔随机化分析,识别了不同类型皮肤瘢痕的潜在药物靶点 | 首次在系统性、局部组织和单细胞水平上整合多组学数据,识别瘢痕亚型特异性药物靶点 | 需要多民族队列研究验证靶点的普遍性 | 识别不同类型皮肤瘢痕的潜在药物靶点 | 正常瘢痕(NS)、增生性瘢痕(HS)和瘢痕疙瘩 | 生物信息学 | 皮肤纤维化疾病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | 两样本孟德尔随机化 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 基于DECODE、EQTLGen、GTEx、ScQTLbase和FinnGen数据库的多个队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
3294 | 2025-10-06 |
BMP-2 generates a functional bone marrow niche by inducing the differentiation of local mesenchymal cells into CAR cells
2025-Jul-22, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014062
PMID:40080674
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研究论文 | 本研究证实BMP-2通过诱导局部间充质细胞分化为CAR细胞,能够生成功能性骨髓微环境 | 首次证明BMP-2诱导的异位骨髓具有与天然骨髓相似的结构和功能,并鉴定出原位脂肪组织来源的CD51highCxcl12-GFP+细胞是CAR细胞的主要来源 | 未明确BMP-2诱导骨髓微环境形成的具体分子机制 | 验证BMP-2诱导的异位骨髓是否具有功能性骨髓微环境 | 小鼠骨髓微环境、造血干细胞、CAR细胞 | 干细胞与再生医学 | 骨髓相关疾病 | 单细胞RNA测序、移植模型、联体共生实验 | NA | 基因表达数据、移植实验数据 | 辐射处理的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3295 | 2025-10-06 |
Single cell sequencing deciphering the heterogeneous landscape of blastic plasmacytoid dendritic cell neoplasm with novel MYB-ZFAT fusion gene
2025-Jul-21, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03899-4
PMID:40691845
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研究论文 | 通过单细胞测序技术解析母细胞性浆细胞样树突状细胞肿瘤的异质性景观并发现新型MYB-ZFAT融合基因 | 首次在BPDCN患者中发现MYB-ZFAT基因融合,并揭示该疾病存在多样化的细胞群体,挑战了单一细胞类型的理论 | 研究基于单个BPDCN患者的临床样本,样本量有限,需要更多病例验证 | 探索BPDCN的分子基础和细胞异质性 | 母细胞性浆细胞样树突状细胞肿瘤患者 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞测序, FACS免疫分型, 核型分析, 转录组分析, 蛋白质结构分析 | NA | 单细胞测序数据, 临床样本, 组织学数据 | 1例BPDCN患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3296 | 2025-10-06 |
MeCP2 dysregulation inhibits mitophagy and impairs neural development in cortical organoids
2025-Jul-19, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.07.035
PMID:40691988
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研究论文 | 本研究探讨MeCP2通过调控BNIP3L表达调节线粒体自噬的分子机制及其在神经发育异常中的作用 | 首次在皮质类器官模型中揭示MeCP2通过占据BNIP3L转录起始位点调控线粒体自噬的新机制 | 研究主要基于体外类器官模型,需要进一步在体实验验证 | 探索MeCP2调控线粒体自噬的分子机制及其在神经发育障碍中的作用 | MeCP2突变诱导多能干细胞分化的皮质类器官 | 神经发育生物学 | 神经发育障碍 | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | 皮质类器官模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | MeCP2突变诱导多能干细胞分化的皮质类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3297 | 2025-10-06 |
Recreating pathophysiology of CLN2 disease and demonstrating reversion by TPP1 gene therapy in hiPSC-derived retinal organoids and retina-on-chip
2025-Jul-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102244
PMID:40706588
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研究论文 | 本研究利用hiPSC来源的视网膜类器官和视网膜芯片系统重建CLN2疾病病理生理学,并证明TPP1基因治疗的逆转效果 | 首次建立人类相关的微生理视网膜疾病模型,揭示CLN2病理生理学新机制,并证明AAV介导的TPP1基因治疗的潜力 | 研究主要基于体外模型,需要进一步体内验证 | 重建CLN2疾病病理生理学并评估基因治疗效果 | hiPSC来源的视网膜类器官、视网膜色素上皮细胞和视网膜芯片系统 | 数字病理学 | 神经元蜡样脂褐质沉积症2型 | 单细胞RNA测序,基因治疗 | 视网膜类器官模型,视网膜芯片系统 | 基因表达数据,组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3298 | 2025-10-06 |
Interferon-responsive HEVs drive tumor tertiary lymphoid structure formation and predict immunotherapy response in nasopharyngeal carcinoma
2025-Jul-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102200
PMID:40543508
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和泛癌单细胞图谱,揭示了鼻咽癌中三级淋巴结构的特征,并发现干扰素应答性高内皮微静脉通过分泌CXCL9驱动TLS形成并预测免疫治疗反应 | 首次发现干扰素应答性高内皮微静脉(IFN-HEVs)亚群在肿瘤TLS形成中的关键作用,并开发了CXCL9-TLS反应预测评分系统(CTRscore) | 研究主要聚焦于鼻咽癌,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探究肿瘤三级淋巴结构形成的驱动因素及其在免疫检查点阻断治疗反应预测中的作用 | 鼻咽癌患者样本 | 空间转录组学 | 鼻咽癌 | 空间转录组学, 单细胞测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞数据 | 三个独立的鼻咽癌队列 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3299 | 2025-10-06 |
Cardiolipin-mimic lipid nanoparticles without antibody modification delivered senolytic in vivo CAR-T therapy for inflamm-aging
2025-Jul-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102209
PMID:40602406
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研究论文 | 开发了一种基于心磷脂模拟脂质纳米颗粒的体内CAR-T细胞疗法,用于治疗衰老相关炎症疾病 | 首次使用无需抗体修饰的心磷脂类似二磷酰胺脂质实现T细胞靶向递送,并利用环状RNA延长mRNA表达时间 | NA | 开发新型体内CAR-T细胞疗法治疗衰老相关炎症疾病 | T细胞、肝脏纤维化、类风湿性关节炎 | 免疫治疗 | 肝脏纤维化、类风湿性关节炎 | mRNA递送、单细胞测序、scFv人源化筛选 | CAR-T细胞疗法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3300 | 2025-10-06 |
Exploring the role of neutrophil extracellular traps in colorectal cancer: Insights from single-cell sequencing
2025-Jul-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i7.107589
PMID:40697221
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综述 | 探讨中性粒细胞胞外诱捕网在结直肠癌中的生物学功能、分子机制及单细胞测序技术在该领域的应用 | 整合单细胞测序技术研究NETs在结直肠癌中的作用机制,为开发新型诊断标志物和靶向治疗策略提供新视角 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究的理论分析 | 阐明NETs在结直肠癌肿瘤微环境中的作用机制及治疗潜力 | 结直肠癌肿瘤微环境中的中性粒细胞胞外诱捕网 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |