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当前共找到 34720 篇文献，本页显示第 3281 - 3300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3281 | 2025-11-10 |
Branch-specific gene discovery in cell differentiation using multi-omics graph attention
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013664
PMID:41183107
|
研究论文 | 提出基于异构图注意力机制的BranchKGN框架，用于识别细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 | 开发了基于异构图变换器的多组学整合方法，能够识别细胞分化分支点及其后代谱系中持续提供信息的关键基因 | NA | 解析细胞分化过程中的基因调控机制 | 细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | 图变换器, 注意力机制 | 单细胞多组学数据 | 三个独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 3282 | 2025-11-10 |
A comprehensive molecular atlas of the mesenchymal cell types in the mouse liver
2025-Nov, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00580-9
PMID:40954217
|
研究论文 | 通过深度单细胞RNA测序构建了成年小鼠肝脏主要细胞类型的全面分子图谱 | 首次系统揭示肝脏内皮细胞和间充质细胞的多样性，发现门静脉区具有混合动静脉表型，识别出纤维化疾病中扩张的先前未知的被膜肝星状细胞群 | 研究仅限于小鼠模型，人类肝脏的适用性需要进一步验证 | 解析肝脏细胞分子结构，为肝病治疗提供理论基础 | 成年小鼠肝脏细胞 | 单细胞组学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年小鼠肝脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3283 | 2025-11-10 |
Cationic nanoparticle targets cGAS-STING axis to drive functional orofacial muscle regeneration
2025-Nov-01, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究开发了阳离子纳米颗粒MSN-PEI用于清除细胞游离DNA，通过调控cGAS-STING轴促进口面部肌肉功能性再生 | 首次利用阳离子纳米颗粒靶向清除cfDNA调控肌肉再生微环境，揭示cfDNA通过TLR9和cGAS-STING信号通路影响巨噬细胞-肌肉卫星细胞交互作用的新机制 | 研究仅使用小鼠冷冻损伤模型，尚未在更大型动物或临床环境中验证 | 探究cfDNA清除如何促进口面部肌肉再生及影响微环境与肌肉卫星细胞的相互作用 | 小鼠口面部肌肉（咬肌）损伤模型 | 再生医学 | 肌肉纤维化 | 单细胞RNA测序，组织学分析，功能分析，分子分析，转录组分析 | NA | 基因表达数据，组织图像数据，功能测量数据 | 小鼠肌肉损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3284 | 2025-11-10 |
scMapNet: Marker-based cell type annotation of scRNA-seq data via vision transfer learning with tabular-to-image transformations
2025-Oct-27, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.056
PMID:41161490
|
研究论文 | 提出一种基于视觉迁移学习和表格到图像转换的标记基因细胞类型注释方法scMapNet | 结合掩码自编码器和视觉变换器，通过树状图转换利用细胞标记基因信息，并在大量未标记数据上进行预训练 | NA | 开发能够充分学习细胞标记基因知识和未标记数据信息的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 掩码自编码器(MAE), 视觉变换器(ViT) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3285 | 2025-11-10 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal Keratinocytes as Key Players in Vulvar Lichen Sclerosus Pathogenesis
2025-Aug-29, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.022
PMID:40886965
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学技术揭示角化细胞在外阴硬化性苔藓发病机制中的核心作用 | 首次整合空间和单细胞转录组学技术系统揭示外阴硬化性苔藓中角化细胞的双重角色及多细胞类型的统一分子变化 | 未明确说明样本量大小和研究人群特征 | 阐明外阴硬化性苔藓的分子发病机制 | 外阴硬化性苔藓病变组织、非病变组织和健康外阴皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3286 | 2025-11-10 |
Circadian clock-gated cell renewal controls time-dependent changes in taste sensitivity
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2421421122
PMID:40339128
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠舌上皮细胞类型的昼夜节律变化，发现生物钟调控的细胞周期进程驱动味觉细胞群体的时间依赖性变化 | 首次发现味觉细胞群体存在昼夜节律性变化，并证明这种变化由生物钟调控的细胞周期进程驱动，且影响味觉敏感性的时间依赖性变化 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究生物钟如何通过调控细胞更新影响味觉敏感性的时间依赖性变化 | 小鼠舌上皮细胞，特别是II型味觉细胞和味蕾干细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，味蕾类器官培养，基因敲低，味觉测试 | NA | 单细胞RNA测序数据，行为学数据 | 小鼠舌上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3287 | 2025-11-10 |
Single-cell sequencing reveals the response mechanisms of vascular endothelial cells to glucocorticoids in diabetic retinopathy
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0334230
PMID:41196918
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示糖皮质激素在糖尿病视网膜病变中对血管内皮细胞的响应机制 | 首次在单细胞水平系统分析糖皮质激素活性在糖尿病视网膜病变血管内皮细胞中的变化特征 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 探究糖皮质激素在糖尿病视网膜病变发病机制中的作用 | 糖尿病视网膜病变组织中的血管内皮细胞 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析、转录因子分析、细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | GEO数据库数据集GSE178121 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3288 | 2025-11-10 |
Single-cell transcriptomics in metastatic breast cancer: mapping tumor evolution and therapeutic resistance
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1669741
PMID:41199747
|
综述 | 本文综述单细胞转录组学在转移性乳腺癌研究中的应用，重点阐述其在描绘肿瘤进化、揭示治疗抵抗机制方面的作用 | 采用单细胞转录组学技术高分辨率解析转移性乳腺癌的肿瘤异质性、细胞进化轨迹和治疗抵抗机制，整合空间转录组学和多组学平台提供肿瘤生态系统全景视图 | 存在技术挑战，临床应用的标准化和推广仍需进一步研究 | 探讨单细胞转录组学如何重塑对转移性乳腺癌生物学特性的理解并指导精准治疗 | 转移性乳腺癌肿瘤细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞、基质细胞和内皮细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 3289 | 2025-11-10 |
Integrative multi-omics identifies MEIS3 as a diagnostic biomarker and immune modulator in hypertrophic cardiomyopathy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1675467
PMID:41200169
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析鉴定MEIS3作为肥厚型心肌病的诊断生物标志物和免疫调节因子 | 首次发现MEIS3在HCM中作为基质中心免疫调节因子的关键作用，并构建了lncRNA-miRNA-MEIS3调控网络 | 样本量较小（HCM患者n=4，健康对照n=3），需要更大规模研究验证 | 表征转录因子MEIS3在肥厚型心肌病中的临床和免疫学作用 | 肥厚型心肌病患者和健康对照的外周血样本及心肌组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序,单细胞RNA测序,机器学习算法 | LASSO,随机森林 | 基因表达数据,单细胞数据 | 7个样本（4例HCM患者，3例健康对照） | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3290 | 2025-11-10 |
Identification and validation of plasma protein biomarkers as therapeutic targets in acute myeloid leukemia: an integrative multi-omics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659811
PMID:41200167
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法识别并验证了急性髓系白血病中具有因果作用的新型循环蛋白生物标志物 | 首次提供TNFAIP8、TCL1A、WFDC1和TNFSF8在AML中因果作用的遗传证据，并发现13种靶向这些蛋白的候选药物 | 研究主要基于欧洲人群数据（deCODE、UK Biobank、FinnGen），可能限制结果在其他人群的普适性 | 识别和验证AML中具有因果作用的循环蛋白生物标志物，为靶向治疗开发和疾病监测提供新见解 | 急性髓系白血病患者和健康对照 | 多组学整合分析 | 急性髓系白血病 | 蛋白质组范围孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、ELISA、药物重定位分析、全表型关联研究 | 孟德尔随机化模型 | 蛋白质定量性状位点数据、全基因组关联研究数据、单细胞RNA测序数据、血浆蛋白水平数据 | 来自deCODE、UK Biobank Pharma Proteomics Project、FinnGen和UK Biobank四个大型队列的数据，包含AML患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 基因组关联分析 | NA | NA |
| 3291 | 2025-11-10 |
Differential gene expression profiling and machine learning-based discovery of key genetic markers in VTE and CKD
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1654673
PMID:41200172
|
研究论文 | 通过转录组学和机器学习分析识别静脉血栓栓塞和慢性肾脏病共享的关键基因标记 | 首次结合三种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)识别VTE和CKD共享的关键基因，并构建诊断列线图 | 研究依赖公共数据集，需要进一步实验验证基因功能机制 | 揭示静脉血栓栓塞和慢性肾脏病之间的遗传特征和分子通路联系 | VTE和CKD患者的基因表达谱数据 | 机器学习 | 静脉血栓栓塞,慢性肾脏病 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | LASSO,SVM-RFE,随机森林 | 基因表达数据 | 使用多个数据集(GSE37171和GSE48000)的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | NA |
| 3292 | 2025-11-10 |
Identification of immunogenic cell death signature genes in hepatocellular carcinoma: from single-cell transcriptomics to in vitro mechanistic validation and comprehensive prognostic modeling with hundreds of machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1649618
PMID:41200185
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和多组学数据，识别肝细胞癌中的免疫原性细胞死亡特征基因，并构建预后模型 | 首次在肝细胞癌中系统表征免疫原性细胞死亡特征，整合单细胞和批量转录组数据，并通过数百种机器学习算法优化预后模型 | 研究样本量相对有限，需要前瞻性临床验证 | 开发肝细胞癌免疫治疗的可靠预后生物标志物和精准分层模型 | 肝细胞癌患者样本和HepG2细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 机器学习, 功能验证实验 | 多种机器学习算法, ssGSEA, WGCNA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 7个HCC样本(44,461个细胞), 三个独立队列(TCGA-HCC 371例, GSE14520 242例, ICGC 445例) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3293 | 2025-11-10 |
CD44 and CLDN3 as immune-metabolic regulators in acute pancreatitis: a multi-modal transcriptomics study and experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1665200
PMID:41200201
|
研究论文 | 本研究通过多模态转录组学分析和实验验证，揭示了CD44和CLDN3作为急性胰腺炎中免疫代谢调控关键生物标志物的作用 | 首次发现CD44和CLDN3是胰腺腺泡细胞与免疫细胞间免疫代谢失调的关键生物标志物，并揭示了CLDN3在mRNA和蛋白水平表达不一致的现象 | 研究样本量有限，主要基于公共数据集和动物模型验证，需要进一步临床研究确认 | 探索急性胰腺炎中免疫代谢调控的关键分子机制 | 急性胰腺炎小鼠模型和公共转录组数据集 | 生物信息学 | 急性胰腺炎 | 转录组测序，单细胞RNA测序，机器学习算法，免疫组织化学 | 三种机器学习算法，单样本基因集富集分析 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 多个公共数据集（GSE65146，GSE109227，GSE279876）和动物模型 | NA | 转录组测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3294 | 2025-11-10 |
DOCK3 orchestrates metastasis and immune microenvironment in prostate cancer
2025, Frontiers in urology
DOI:10.3389/fruro.2025.1662692
PMID:41200217
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了DOCK3在前列腺癌转移和肿瘤免疫微环境重塑中的关键作用 | 首次系统阐明DOCK3在前列腺癌中协调转移和免疫微环境的双重功能，发现其与肿瘤突变负荷和细胞毒性免疫细胞浸润的显著关联 | 研究主要基于计算分析和现有数据库，缺乏实验验证DOCK3功能机制 | 探究DOCK3在前列腺癌转移和肿瘤免疫微环境中的作用 | 前列腺癌患者样本和细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因组分析 | DESeq2, CIBERSORT, ssGSEA, xCell, WGCNA, Harmony, UMAP | 基因表达数据, 单细胞数据, 基因组数据 | TCGA-PRAD: 499个肿瘤/52个正常样本; GEO单细胞数据: 45,325个细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3295 | 2025-11-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Potential Mechanism of RUNX3 Reshaping Tumor Microenvironment in Non-small-cell Lung Cancer
2025-Dec, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-18034-w
PMID:40916017
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了RUNX3在非小细胞肺癌中重塑肿瘤微环境的潜在机制 | 首次在单细胞水平上系统分析RUNX3表达状态对非小细胞肺癌肿瘤微环境的影响 | 样本量较小（仅7例患者），需要更大规模研究验证 | 探索RUNX3在非小细胞肺癌中调控肿瘤微环境的具体生物学机制 | 非小细胞肺癌患者的癌组织和癌旁组织 | 单细胞测序分析 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学染色 | Seurat分析流程 | 单细胞转录组数据 | 7例非小细胞肺癌患者，包含3对癌和癌旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3296 | 2025-11-09 |
Tumor-derived CCL5 recruits CCR1+ macrophages to suppress apoptosis and drive proliferation in duodenal adenocarcinoma
2025-Dec-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218064
PMID:41015267
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了十二指肠腺癌中肿瘤细胞通过CCL5/CCR1轴招募巨噬细胞抑制细胞凋亡并促进增殖的机制 | 首次在十二指肠腺癌中发现肿瘤细胞通过CCL5/CCR1轴招募巨噬细胞并抑制凋亡的免疫逃逸机制 | 研究样本量有限且为罕见胃肠道恶性肿瘤 | 阐明十二指肠腺癌肿瘤微环境中肿瘤细胞与巨噬细胞的相互作用机制 | 十二指肠腺癌患者原发肿瘤组织及匹配的癌旁正常组织 | 单细胞测序分析 | 十二指肠腺癌 | 单细胞RNA测序, 患者来源类器官培养, 功能实验, 批量转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | 十二指肠腺癌患者原发肿瘤和匹配正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3297 | 2025-11-09 |
scRNA-Seq Reveals Sustained Pro-Inflammation by Innate Immune Activation in In Utero HBV-Exposed Neonates of High HBsAg Mothers
2025-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70405
PMID:41204708
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析高HBsAg母亲所生新生儿在乙肝疫苗接种前后的免疫状态 | 首次揭示高HBsAg母亲所生新生儿存在持续的先天免疫激活和促炎症状态，即使疫苗接种后产生抗体反应 | 样本量有限，仅比较了高和低HBsAg两组母亲的新生儿 | 研究母体HBsAg水平对新生儿免疫发育和乙肝疫苗接种反应的影响 | 高和低HBsAg母亲所生新生儿的PBMCs | 单细胞组学 | 乙型肝炎 | 单细胞多组学测序,免疫表型分析 | Seurat R包 | 单细胞转录组数据,表面标志物表达数据 | 两组新生儿（低HBsAg组和高HBsAg组） | NA | 单细胞多组学测序 | NA | NA |
| 3298 | 2025-11-09 |
Integrative single-cell and bulk RNA-seq analysis identifies glycosyltransferases-related signature in triple negative breast cancer
2025-Nov-08, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01729-4
PMID:41203941
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA-seq分析识别三阴性乳腺癌中糖基转移酶相关特征 | 首次结合单细胞和bulk RNA-seq数据构建糖基转移酶相关基因特征，并验证其在肿瘤微环境中的作用 | 使用公开数据集，缺乏独立验证队列 | 识别三阴性乳腺癌中糖基转移酶的分子靶点，提高预后准确性和免疫治疗效果 | 三阴性乳腺癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,CCK-8细胞活力检测,划痕愈合实验,Transwell迁移侵袭实验 | 风险模型,基因特征模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3299 | 2025-11-09 |
Interplay of Molecular Subtypes Associated with Butyrate Metabolism Elucidates Clinical Characteristics and Tumor Microenvironment in Prostate Cancer
2025-Nov-08, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05476-x
PMID:41205043
|
研究论文 | 本研究通过分析前列腺癌患者的分子亚型与丁酸盐代谢的相互作用，揭示了其与临床特征和肿瘤微环境的关联 | 首次基于丁酸盐代谢相关基因将前列腺癌分为两个分子亚型，并发现FOS-miR-27b轴在肿瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 阐明丁酸盐代谢在前列腺癌发生发展中的分子机制及其临床意义 | 前列腺癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组分析,机器学习,荧光素酶报告实验,qRT-PCR,FISH | RSF+GBM集成学习模型 | 转录组数据,临床数据 | TCGA和GEO数据库中的前列腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 3300 | 2025-11-09 |
Vascular Niches Are the Primary Hotspots in Cardiac Aging
2025-Nov-07, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.327060
PMID:41090219
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了血管微环境是心脏衰老过程中的主要热点区域 | 首次通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术系统描绘了心脏衰老过程中的微环境变化，并识别出血管相关细胞生态位作为衰老的关键热点 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类心脏组织中验证 | 探究心脏组织中驱动年龄相关变化的微环境特征 | 3月龄和18月龄小鼠的心脏组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 衰老细胞清除治疗 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 不同年龄阶段的小鼠心脏组织 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |