单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3261 - 3280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3261 | 2025-10-06 |
Investigating intestinal farnesoid X receptor functions at the intestinal mucosal barrier and in the intestinal microbiota in a biliary obstruction mouse model
2025-Aug-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00223.2024
PMID:40623002
|
研究论文 | 本研究通过肠道特异性敲除小鼠和胆道梗阻模型，探讨法尼醇X受体在肠道黏膜屏障和微生物群中的功能 | 首次阐明FXR在生理和胆道梗阻条件下对肠道屏障功能和微生物群的调节作用，并发现其可能通过调控Reg3γ影响肠道功能 | 研究机制尚未完全阐明，需要进一步验证FXR与Reg3γ的直接调控关系 | 研究法尼醇X受体在胆道梗阻疾病中肠道屏障功能和微生物群调节的作用机制 | 肠道特异性敲除小鼠和胆道梗阻小鼠模型 | 分子生物学 | 胆道梗阻疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3262 | 2025-10-06 |
Idiopathic Subglottic Stenosis and the Epithelial Interface of Host and Environment
2025-Aug-01, Journal of the American College of Surgeons
IF:3.8Q1
DOI:10.1097/XCS.0000000000001340
PMID:39902917
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究特发性声门下狭窄的发病机制，揭示上皮细胞异常与微生物群移位在纤维化过程中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术对iSGS患者队列进行无偏倚分析，发现上皮祖细胞缺失和微生物群移位的病理机制 | 疾病罕见性和患者地理分布广泛可能限制样本规模，动物模型结果向人类转化的有效性需进一步验证 | 阐明特发性声门下狭窄的发病机制和病理过程 | 国际iSGS患者队列的病变黏膜组织和动物模型 | 单细胞基因组学 | 特发性声门下狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 国际iSGS患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3263 | 2025-10-06 |
Decrypting cancer's spatial code: from single cells to tissue niches
2025-Jul-25, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70100
PMID:40711978
|
综述 | 探讨空间转录组学在解密癌症空间结构中的应用与分析方法 | 提出整合空间数据与多模态分析的新框架，将癌症概念化为相互连接的生态位演化系统 | 未涉及具体实验验证，主要聚焦方法论讨论 | 开发空间信息分析框架以揭示癌症组织的复杂结构 | 癌症组织中的细胞状态和肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学 | 经典生物统计学、地理空间分析、人工智能方法 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3264 | 2025-10-06 |
Transcriptomic disruption and hypoactivity in DYT-SGCE medial ganglionic eminence-patterned inhibitory neurons
2025-Jul-25, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf272
PMID:40711998
|
研究论文 | 本研究通过患者来源的干细胞模型探究SGCE基因突变对内侧神经节隆起来源的抑制性神经元的影响 | 首次在人类干细胞衍生的抑制性GABA能神经元中系统评估SGCE突变对神经元功能和形态的影响 | 研究基于体外细胞模型，可能与体内真实情况存在差异 | 探究肌阵挛性肌张力障碍的神经病理机制 | SGCE基因突变患者来源的诱导多能干细胞和基因编辑胚胎干细胞 | 神经科学 | 肌阵挛性肌张力障碍 | 单细胞RNA测序，钙成像，多电极阵列，膜片钳 | 干细胞分化模型 | 转录组数据，电生理数据，形态学数据 | 患者来源的干细胞系及其同基因野生型对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3265 | 2025-10-06 |
Ki-67 in meningioma: distribution and implications
2025-Jul-25, Journal of neurosurgery
IF:3.5Q1
DOI:10.3171/2025.4.JNS25438
PMID:40712166
|
研究论文 | 通过单细胞技术解析脑膜瘤中Ki-67表达的细胞来源及其临床意义 | 首次通过单细胞质谱流式和单细胞RNA测序技术系统揭示Ki-67在脑膜瘤微环境中不同细胞谱系的表达分布 | 样本量相对有限（32例），需更大规模研究验证 | 探究Ki-67在脑膜瘤微环境中的细胞来源分布及其临床基因组学关联 | 32例手术切除的脑膜瘤样本及448例验证队列样本 | 数字病理 | 脑膜瘤 | 单细胞质谱流式(CyTOF), 单细胞RNA测序(scRNAseq), 免疫组化 | NA | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 组织病理图像 | 32例主要研究样本+448例验证样本 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式 | NA | NA |
| 3266 | 2025-10-06 |
Metabolic reprogramming through histone lactylation in microglia and macrophages recruits CD8+ T lymphocytes and aggravates spinal cord injury
2025-Jul-23, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.04.003
PMID:40328251
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现脊髓损伤中CD8+T淋巴细胞的积累机制，揭示代谢重编程通过组蛋白乳酸化调控CXCL16趋化因子表达 | 首次发现糖代谢重编程通过组蛋白乳酸化调控小胶质细胞/巨噬细胞中CXCL16转录，从而招募CD8+T细胞加重脊髓损伤的新机制 | 研究主要聚焦于CXCL16-CXCR6轴，可能还存在其他未被发现的免疫调节机制 | 探究脊髓损伤后先天免疫与适应性免疫之间的相互作用机制 | 脊髓损伤患者和小鼠模型中的小胶质细胞、巨噬细胞和CD8+T淋巴细胞 | 单细胞组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 脊髓损伤患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3267 | 2025-10-06 |
Resolving microenvironment complexity and cellular heterogeneity in osteoarthritis via spatial transcriptomics
2025-Jul-14, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.07.007
PMID:40669534
|
综述 | 本文探讨空间转录组学技术在解析骨关节炎微环境复杂性和细胞异质性中的应用与进展 | 系统阐述空间转录组学如何揭示骨关节炎中分区基因表达模式、致病细胞状态及细胞间相互作用 | 当前技术存在分辨率限制，需要与其他组学和成像技术整合 | 探索空间转录组学在骨关节炎研究中的应用潜力 | 骨关节炎关节组织（软骨、滑膜、软骨下骨、关节周围组织） | 空间转录组学 | 骨关节炎 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3268 | 2025-10-06 |
Multimodal single-cell analyses reveal molecular markers of neuronal senescence in human drug-resistant epilepsy
2025-Mar-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI188942
PMID:40026248
|
研究论文 | 通过整合全细胞膜片钳记录和单细胞RNA测序方法，揭示耐药性癫痫中神经元衰老的分子标记 | 首次在耐药性癫痫患者脑组织中鉴定出具有衰老特征的皮质锥体神经元亚群，并发现其表达特定的衰老标记基因 | 研究样本量有限，且主要关注皮质锥体神经元，未全面评估其他神经元类型 | 探索耐药性癫痫患者脑组织中神经元的分子特征和病理机制 | 耐药性癫痫患者脑组织中的皮质锥体神经元和小鼠癫痫模型 | 神经科学 | 耐药性癫痫 | 全细胞膜片钳记录, 单细胞RNA测序 | NA | 电生理记录数据, 基因表达数据 | 耐药性癫痫患者脑组织样本和小鼠癫痫模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3269 | 2025-10-06 |
Sitravatinib in combination with nivolumab plus ipilimumab in patients with advanced clear cell renal cell carcinoma: a phase 1 trial
2025-Jan-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55642-8
PMID:39794332
|
研究论文 | 评估sitravatinib联合nivolumab和ipilimumab三药疗法在晚期透明细胞肾细胞癌患者中的安全性和疗效 | 首次在晚期肾透明细胞癌中探索TKI抑制剂sitravatinib与双免疫检查点抑制剂联合治疗的安全性和初步疗效 | 样本量较小（22例患者），单臂I期试验设计缺乏对照组 | 确定sitravatinib联合nivolumab和ipilimumab三药疗法在晚期透明细胞肾细胞癌患者中的最佳剂量和安全性 | 22例先前未经治疗的晚期透明细胞肾细胞癌患者 | NA | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，基因表达数据 | 22例患者（其中12例进行了纵向肿瘤活检单细胞RNA测序分析） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3270 | 2025-10-06 |
SNRPB2 in the pan-cancer landscape: A bioinformatics exploration and validation in hepatocellular carcinoma
2024-12, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111445
PMID:39366532
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证探讨SNRPB2在泛癌景观中的作用及其在肝细胞癌中的功能 | 首次系统研究SNRPB2在多种癌症类型中的表达模式及其与预后的关联，并通过实验验证其在肝癌细胞增殖和迁移中的功能 | 需要进一步探索其潜在机制和临床治疗潜力 | 研究SNRPB2在癌症发生发展中的作用及其作为预后生物标志物的潜力 | 多种癌症类型和肝细胞癌细胞 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析，基因表达分析，基因组和表观基因组分析，基因集富集分析，免疫细胞浸润评估，单细胞测序 | NA | 基因表达数据，基因组数据，表观基因组数据，单细胞测序数据 | 来自TCGA、CPTAC和GEO等多个公共数据库的多种癌症样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 3271 | 2025-10-06 |
SINGLE CELL DISSECTION OF DEVELOPMENTAL ORIGINS AND TRANSCRIPTIONAL HETEROGENEITY IN B-CELL ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA
2023-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.04.569954
PMID:38106088
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析B细胞急性淋巴细胞白血病的发育起源和转录异质性 | 首次使用单细胞RNA测序系统分析B-ALL样本，并与正常B细胞发育参考图谱比较，揭示白血病细胞起源和瘤内异质性 | 样本数量相对有限（89个B-ALL样本），部分亚型样本可能代表性不足 | 解析B-ALL的发育起源和转录异质性，改进临床和基因组分类 | B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）患者样本 | 单细胞组学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 89个B-ALL样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3272 | 2025-10-06 |
SpatialCVGAE: Consensus Clustering Improves Spatial Domain Identification of Spatial Transcriptomics Using VGAE
2025-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00676-1
PMID:39680300
|
研究论文 | 提出一种用于空间转录组数据分析的共识聚类框架SpatialCVGAE，通过整合多个变分图自编码器的聚类结果提高空间域识别的稳定性 | 首次将共识聚类方法与变分图自编码器相结合用于空间转录组数据，通过整合多个潜在表示的聚类结果提高模型稳定性 | 未明确说明方法在超大型数据集上的计算效率，也未与其他集成学习方法进行系统比较 | 解决空间转录组数据聚类分析中的不稳定性和噪声问题 | 空间转录组数据中的空间域识别 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | VGAE（变分图自编码器）, 共识聚类 | 空间转录组数据，基因表达矩阵，空间图数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3273 | 2025-10-06 |
Self-Supervised Graph Representation Learning for Single-Cell Classification
2025-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00700-y
PMID:40180773
|
研究论文 | 提出一种名为scSSGC的自监督图表示学习框架用于单细胞分类 | 采用多K-means聚类任务进行自监督预训练，并引入局部增强图神经网络解决细胞图中邻居较少节点的信息聚合问题 | 未明确说明模型在极大规模数据集上的计算效率 | 开发计算生物学方法用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络(GNN), 自监督学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3274 | 2025-10-06 |
ScAGCN: Graph Convolutional Network with Adaptive Aggregation Mechanism for scRNA-seq Data Dimensionality Reduction
2025-Sep, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00702-w
PMID:40281370
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据降维的自适应聚合图卷积网络方法 | 设计了基于节点分布和相似性箱线图的邻域选择策略，并通过定义邻域节点与中心节点的相似性度量优化了聚合函数 | NA | 解决单细胞RNA测序数据的大规模、高维度、高噪声和高稀疏性带来的分析挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络(GCN) | 基因表达数据 | 15个真实单细胞RNA测序数据集，包括10个大规模数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3275 | 2025-10-06 |
Advances in single-cell omics: Transformative applications in basic and clinical research
2025-Aug, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2025.102548
PMID:40517461
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术的最新进展及其在基础和临床研究中的变革性应用 | 强调单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学整合技术在解析复杂组织和识别独特细胞群体方面的突破性能力 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据和研究方法的具体局限性 | 探讨单细胞组学技术在生物学研究和临床应用中的重要作用 | 复杂组织、细胞群体、细胞功能状态 | 生物信息学 | 癌症、神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合、计算模型 | 计算模型 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 3276 | 2025-10-06 |
Insights into chondrocyte populations in cartilaginous tissues at the single-cell level
2025-Aug, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-025-01275-0
PMID:40640375
|
综述 | 通过单细胞多组学技术揭示软骨组织中软骨细胞群体的异质性及其在疾病中的作用 | 利用单细胞转录组学实现对软骨细胞亚型更精细的功能注释分类 | 需要将先进单细胞技术与计算建模相结合以解析软骨细胞群体的动态相互作用 | 研究软骨细胞亚型在软骨形成、维持和疾病进展中的作用 | 软骨组织中的软骨细胞群体 | 单细胞生物学 | 骨关节炎、椎间盘疾病 | 单细胞多组学、单细胞转录组学 | 计算建模 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学、单细胞转录组学 | NA | NA |
| 3277 | 2025-10-06 |
Bioinspired 3D hydrogel scaffold to mimic tumor microenvironment for investigating into the anoikis resistance mechanisms in colorectal cancer
2025-Aug, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102061
PMID:40697318
|
研究论文 | 开发了一种仿生复合水凝胶支架模拟肿瘤微环境，用于研究结直肠癌中的失巢凋亡抵抗机制 | 创建了由4-arm-PEGDA、明胶甲基丙烯酰和透明质酸甲基丙烯酰组成的仿生复合水凝胶，能形成紧凑的3D细胞球体模拟肿瘤微环境 | NA | 研究结直肠癌中失巢凋亡抵抗机制 | 结直肠癌细胞系Caco-2 | 生物医学工程 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，放射组学分析 | 3D水凝胶支架模型 | 基因表达数据，影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3278 | 2025-10-06 |
Activation of S1PR1 by Ponesimod for Multiple Sclerosis Therapy: Uncovering MAPK and PI3K Pathway Mechanisms and Repurposing Potential
2025-Jul-25, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202404742
PMID:40708468
|
研究论文 | 本研究揭示了ponesimod通过激活S1PR1受体调控MAPK/ERK和PI3K-Akt通路治疗多发性硬化的分子机制 | 结合元动力学、单细胞转录组学和药物重定位方法，首次发现ponesimod引起S1PR1受体W269氨基酸构象变化并阐明其下游信号通路 | 未明确说明研究样本量，动物研究结果需进一步临床验证 | 阐明ponesimod治疗多发性硬化的分子机制并探索药物重定位策略 | S1PR1受体及其信号通路，多发性硬化治疗 | 计算生物学 | 多发性硬化 | 元动力学模拟，单细胞转录组学，药物重定位 | 分子动力学模拟 | 分子模拟数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3279 | 2025-10-06 |
Circulating Immune Cell Signature Analysis in HFpEF Across Species
2025-Jul-25, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326249
PMID:40709473
|
研究论文 | 通过跨物种分析揭示HFpEF患者循环免疫细胞的独特转录特征 | 首次在HFpEF中识别肥胖相关和肥胖非依赖的免疫细胞特征，并在小鼠模型中验证抗炎治疗的改善效果 | 样本量较小（人类n=21），需要更大规模研究验证 | 探究HFpEF中系统性免疫反应的分子机制 | HFpEF患者、HFrEF患者、健康对照者及HFpEF小鼠模型 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类21例（HFpEF 6例，HFrEF 8例，健康对照7例）+ HFpEF小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3280 | 2025-10-06 |
Unraveling the Role of MDK-SDC4 Interaction in Pancreatic Cancer-Associated New-Onset Diabetes by Single-Cell Transcriptomic Analysis
2025-Jul-25, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409987
PMID:40709672
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示MDK-SDC4相互作用在胰腺癌相关新发糖尿病中的机制 | 首次通过单细胞RNA测序系统阐明MDK作为肿瘤细胞与β细胞间相互作用的关键介质，并发现其通过SDC4受体下调Ras信号通路损害胰岛素分泌的新机制 | 研究样本量有限，需要更大规模的临床验证 | 探索胰腺癌相关新发糖尿病(PCAND)的发病机制并寻找区分PCAND与2型糖尿病的生物标志物 | 胰腺癌细胞、β细胞、PCAND患者、T2DM患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PCAND患者和T2DM患者血浆样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |