单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28527 篇文献，本页显示第 3241 - 3260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3241 | 2025-05-01 |
Investigation into the Spatial Heterogeneity of Lung Composite Large-Cell Neuroendocrine Carcinoma Spatial Transcriptomic Analysis of Combined Large-Cell Neuroendocrine Carcinoma
2025-Apr-30, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2025.0043
PMID:40304569
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research paper | 本研究探讨了肺复合大细胞神经内分泌癌（CoLCNEC）的空间转录组表达模式，并识别了关键基因 | 利用空间转录组技术（ST）分析了CoLCNEC患者的样本，发现了基因SMC1A在肿瘤区域的显著上调及其在癌细胞迁移、侵袭和细胞周期中的作用 | 研究仅基于一个CoLCNEC患者的样本，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探索CoLCNEC的空间转录组表达模式，识别关键基因并验证其作为治疗靶点的潜力 | 肺复合大细胞神经内分泌癌（CoLCNEC）患者的肿瘤组织 | digital pathology | lung cancer | 空间转录组技术（ST）、高通量测序、免疫组化、RT-qPCR、Western blot、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、空间位置数据 | 一个CoLCNEC患者的样本，包含三种不同成分（LCNEC、腺癌和鳞状细胞癌） |
| 3242 | 2025-05-01 |
Decoding Alzheimer's Disease: Single-Cell Sequencing Uncovers Brain Cell Heterogeneity and Pathogenesis
2025-Apr-30, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04997-0
PMID:40304967
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综述 | 本文系统总结了单细胞转录组和表观基因组方法在阿尔茨海默病研究中的应用，重点关注细胞类型和亚型特异性转录组变化的表征 | 利用单细胞测序技术揭示了阿尔茨海默病大脑的细胞和分子异质性，并整合多种组学技术阐明疾病轨迹和细胞通讯网络 | NA | 增强对阿尔茨海默病发病机制的理解，并为精准医学识别新的治疗靶点和生物标志物 | 阿尔茨海默病患者大脑中的神经元和胶质细胞亚群 | 数字病理学 | 老年病 | scRNA-seq, ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 3243 | 2025-05-01 |
Integrative Analysis of Lactylation-Associated Features in Abdominal Aortic Aneurysm and Its Immune Microenvironment Utilizing scRNA-seq and Bulk RNA Sequencing
2025-Apr-29, Circulation journal : official journal of the Japanese Circulation Society
IF:3.1Q2
DOI:10.1253/circj.CJ-24-0892
PMID:40301103
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据，研究腹部主动脉瘤（AAA）中乳酰化与免疫微环境的关系 | 首次揭示了乳酰化在不同免疫细胞类型中的异质性及其与免疫反应的关联，并鉴定了8个与乳酰化相关的核心基因 | 研究结果需要进一步的实验验证，特别是在人类样本中的应用 | 阐明乳酰化与AAA免疫反应之间的相互关系 | 腹部主动脉瘤（AAA）患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, Bulk RNA测序 | 机器学习算法（113种组合） | RNA测序数据 | NA |
| 3244 | 2025-05-01 |
Broad rim lesions are a new pathological and imaging biomarker for rapid disease progression in multiple sclerosis
2025-Apr-29, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03625-7
PMID:40301560
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research paper | 该研究通过分析多发性硬化症（MS）尸检队列，发现了一种新型病变类型——宽边缘病变，可作为疾病快速进展的生物标志物 | 首次揭示了宽边缘病变作为MS快速进展的新型病理和影像学生物标志物，并验证了其与疾病进展的关联 | 研究样本来自尸检队列，可能无法完全反映活体患者的动态病理过程 | 探索多发性硬化症疾病进展的潜在机制并寻找相关生物标志物 | 多发性硬化症患者尸检脑组织样本和独立PET研究队列 | digital pathology | multiple sclerosis | 空间转录组学、PET成像 | NA | 组织病理学图像、转录组数据、PET影像数据 | 尸检队列186例，PET研究队列114例 |
| 3245 | 2025-05-01 |
Clinical Diagnosis and Treatment System for Neurological Psychological Gastrointestinal Diseases Based on Multimodal Artificial Intelligence and Immunology
2025-Apr-29, Current pharmaceutical biotechnology
IF:2.2Q3
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research paper | 开发了一种基于多模态人工智能和免疫学的神经系统心理胃肠疾病临床诊疗系统，用于预测和辅助治疗结直肠癌 | 结合神经免疫基因调控设计人工智能多模态胃肠疾病临床信息系统，利用单细胞测序技术和分子模拟技术深入分析生存预测系统中的特征选择生物机制 | 未提及具体样本量及模型在更广泛人群中的适用性验证 | 优化结直肠癌的诊疗策略，满足临床定价机构的需求 | 结直肠癌患者 | digital pathology | colorectal cancer | single-cell sequencing, molecular simulation | AI multimodal system | gene expression levels, immune cell status, living habits data | NA |
| 3246 | 2025-05-01 |
Autosomal dominant SLURP1 variants cause palmoplantar keratoderma and progressive symmetric erythrokeratoderma
2025-Apr-28, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf049
PMID:39913669
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研究论文 | 该研究通过全外显子测序发现了导致掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症的SLURP1基因新变异 | 首次发现常染色体显性遗传的SLURP1变异会导致掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症，并揭示了其作用机制 | 研究样本量较小（仅3个无亲缘关系的家系） | 鉴定导致掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症的新遗传变异 | 表皮分化障碍患者（包括掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症表型） | 遗传学 | 皮肤疾病 | 全外显子测序、计算机模拟预测、患者角质形成细胞实验、高分辨率空间转录组学、定量细胞因子分析 | NA | 基因序列数据、细胞实验数据 | 3个无亲缘关系的家系 |
| 3247 | 2025-05-01 |
LAMA4+ CD90+ eCAFs provide immunosuppressive microenvironment for liver cancer through induction of CD8+ T cell senescence
2025-Apr-28, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02162-7
PMID:40289085
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research paper | 该研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，鉴定了与肝细胞癌预后不良相关的CD90 eCAFs亚型，并揭示了其通过LAMA4诱导CD8+ T细胞衰老的机制 | 首次鉴定了LAMA4+ CD90+ eCAFs亚型，揭示了其通过ITGA6受体介导的DNA损伤信号通路诱导CD8+ T细胞衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证不足 | 探究肝细胞癌中肿瘤微环境与免疫系统的相互作用机制 | 肝细胞癌中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组、siRNA转染、Western blot、流式细胞术 | 自发小鼠肝细胞癌模型(DEN+CCL4诱导) | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、流式细胞数据 | 未明确说明样本数量，包含人类肝细胞癌样本和小鼠模型 |
| 3248 | 2025-05-01 |
Transcriptomic characterization of transitioning cell types in the skin of Atlantic salmon
2025-Apr-28, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02196-w
PMID:40289111
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research paper | 本研究通过单核测序和空间转录组学技术，描述了健康大西洋鲑鱼组织中及伤口愈合过程中间充质基质细胞的转录组特征 | 首次绘制了伤口愈合过程中潜在分化间充质基质细胞亚群的转录组活性，揭示了不同亚群的空间生态位 | 研究仅针对大西洋鲑鱼，结果可能不适用于其他物种 | 探究大西洋鲑鱼皮肤伤口愈合过程中细胞转录组的变化 | 大西洋鲑鱼的间充质基质细胞（成纤维细胞样成体干细胞） | 转录组学 | NA | 单核测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 3249 | 2025-05-01 |
InSituCor: exploring spatially correlated genes conditional on the cell type landscape
2025-Apr-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03554-1
PMID:40275395
|
research paper | 介绍了一个名为InSituCor的工具包，用于发现空间转录组数据中与细胞类型景观无关的空间相关基因模块 | InSituCor能够识别不受已知因素（如细胞类型分布）影响的空间相关基因，从而揭示更有意义的生物学关系 | 未明确提及具体的技术限制或数据适用范围 | 探索空间转录组数据中与细胞类型景观无关的空间相关基因 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 3250 | 2025-05-01 |
Intratumoral microbiota predicts the response to neoadjuvant chemoimmunotherapy in triple-negative breast cancer
2025-Apr-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010365
PMID:40280564
|
research paper | 该研究探讨了肿瘤内微生物群在三阴性乳腺癌新辅助化疗免疫治疗反应预测中的作用 | 首次证实肿瘤内微生物群可作为预测三阴性乳腺癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应的生物标志物 | 样本量相对较小(89例患者)，且仅针对早期三阴性乳腺癌患者 | 探索肿瘤内微生物群在预测三阴性乳腺癌新辅助化疗免疫治疗反应中的作用 | 89例早期三阴性乳腺癌女性患者 | digital pathology | triple-negative breast cancer | 16S rDNA sequencing, scRNA-seq | machine-learning models | genomic sequencing data, transcriptome data | 89例早期三阴性乳腺癌女性患者 |
| 3251 | 2025-05-01 |
Novel diagnostic biomarkers regulating macrophages autophagy in ischemic cardiomyopathy: An analysis integrating bulk RNA sequencing with single-cell RNA sequencing
2025-Apr-24, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152907
PMID:40300424
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，探索了缺血性心肌病(ICM)中巨噬细胞自噬相关的新型诊断生物标志物 | 首次整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别出6个具有诊断意义的枢纽基因，并验证了其在ICM中的表达 | 研究结果需要在更大规模的临床样本中进行验证 | 探索缺血性心肌病中巨噬细胞自噬相关的生物标志物及其相关通路 | 缺血性心肌病患者组织和ICM大鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序(包括批量RNA测序和单细胞RNA测序)，RT-qPCR | WGCNA, PPI网络分析 | 基因表达数据 | 使用了GSE46224和GSE116250两个数据集，以及ICM大鼠模型 |
| 3252 | 2025-05-01 |
Semaphorin 6A phase separation sustains a histone lactylation-dependent lactate buildup in pathological angiogenesis
2025-Apr-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2423677122
PMID:40244673
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研究论文 | 本文研究了Semaphorin 6A通过相分离机制维持组蛋白乳酸化依赖的乳酸积累在病理性血管生成中的作用 | 揭示了SEMA6A通过相分离机制招募RHOA和P300，促进P300磷酸化和组蛋白乳酸化循环的新机制 | 研究主要聚焦于视网膜缺血性疾病中的血管生成，可能不适用于其他类型的血管疾病 | 探究病理性血管生成中组蛋白乳酸化修饰的调控机制 | 内皮细胞(ECs)和视网膜病理性血管生成 | 分子生物学 | 视网膜缺血性疾病 | CUT&Tag, scRNA-seq | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA |
| 3253 | 2025-05-01 |
St3gal5-mediated sialylation of glyco-CD177 on neutrophils restricts neuroinflammation following CNS injury
2025-Apr-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426187122
PMID:40244680
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研究论文 | 本研究揭示了St3gal5介导的中性粒细胞CD177糖基化在限制中枢神经系统损伤后神经炎症中的作用 | 首次发现CD177中性粒细胞作为抗炎亚群在中枢神经系统损伤后的作用，并鉴定St3gal5作为调控CD177糖基化的关键酶 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探索中性粒细胞CD177糖基化在中枢神经系统损伤后神经炎症中的调控机制 | 人类和小鼠的中性粒细胞 | 免疫学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序、糖蛋白组学 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据、蛋白质组学数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及人类和小鼠样本 |
| 3254 | 2025-05-01 |
Cross-Species Multi-Omics Analysis Reveals Myeloid-Driven Endothelial Oxidative Stress in Ischemic Stroke
2025-Apr-16, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL37429
PMID:40302336
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研究论文 | 通过跨物种多组学分析揭示缺血性中风中的髓系细胞驱动的内皮氧化应激 | 整合了bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学和流式细胞术数据，揭示了髓系细胞在中风后如何通过炎症和代谢机制影响血脑屏障的破坏 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证可能有限 | 探索缺血性中风中外周和中枢免疫反应的相互作用及其对血脑屏障的影响 | 人类和小鼠模型中的缺血性中风 | 生物医学研究 | 缺血性中风 | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学、流式细胞术 | 小鼠tMCAO模型 | RNA-seq数据、流式细胞数据、空间转录组数据 | 人类和小鼠模型中的缺血性中风样本 |
| 3255 | 2025-05-01 |
Multiomics Analysis Reveals Neuroblastoma Molecular Signature Predicting Risk Stratification and Tumor Microenvironment Differences
2025-Apr-04, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.4c00882
PMID:39762147
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research paper | 通过多组学分析揭示神经母细胞瘤的分子特征，预测风险分层和肿瘤微环境差异 | 构建了一个新的恶性亚群1相关特征（MSRS），作为独立的预后因素，并优于其他临床特征和已发表的特征 | 未提及具体样本量，可能限制了结果的普遍性 | 探索神经母细胞瘤的分子标志物，以指导临床分类和个体化治疗 | 神经母细胞瘤（NB）患者 | digital pathology | neuroblastoma | multiomics profiling, single-cell transcriptome sequencing | MSRS | multiomics data, single-cell transcriptome data | NA |
| 3256 | 2025-05-01 |
Impaired megakaryopoiesis due to aberrant macrophage polarization via BTK/Rap1/NF-κB pathway in sepsis-induced thrombocytopenia
2025-Apr-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.12.048
PMID:39741411
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research paper | 本研究揭示了脓毒症诱导的血小板减少症（SIT）中巨噬细胞通过BTK/Rap1/NF-κB通路影响巨核细胞生成的机制 | 首次发现BTK抑制剂BGB-3111通过调节巨噬细胞极化和Rap1/NF-κB信号通路改善SIT | 研究主要基于小鼠模型，人类患者中的验证仍需进一步研究 | 探究脓毒症诱导血小板减少症的发病机制及潜在治疗靶点 | 脓毒症患者和小鼠模型中的巨噬细胞与巨核细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据 | SIT患者和小鼠模型 |
| 3257 | 2025-05-01 |
Endogenous CD4+ T Cells That Recognize ALK and the NPM1::ALK Fusion Protein Can Be Expanded from Human Peripheral Blood
2025-Apr-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0445
PMID:39774774
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research paper | 该研究探讨了人类外周血中识别ALK和NPM1::ALK融合蛋白的内源性CD4+ T细胞的扩展情况 | 首次在人类外周血中检测到ALK特异性CD4+ T细胞，并鉴定了NPM1::ALK融合新抗原特异性T细胞受体 | 样本量较小，仅包括10名ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤患者和6名健康供者 | 研究ALK特异性CD4+ T细胞在癌症免疫治疗中的潜在作用 | ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤患者和健康供者的外周血CD4+ T细胞 | 免疫学 | 间变性大细胞淋巴瘤 | TCRαβ单细胞测序 | NA | 细胞反应数据 | 10名患者和6名健康供者 |
| 3258 | 2025-05-01 |
Spatially Resolved Tumor Ecosystems and Cell States in Gastric Adenocarcinoma Progression and Evolution
2025-Apr-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-0605
PMID:39774838
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research paper | 通过整合空间转录组和单细胞RNA测序数据，研究胃腺癌进展和演化中的空间分辨肿瘤生态系统和细胞状态 | 揭示了与特定分子亚型、临床预后、基质微环境和遗传驱动因素相关的两种独立进化轨迹，并发现肿瘤-基质界面是肿瘤生态的一个独特状态 | NA | 研究胃腺癌进展和演化中的空间分辨肿瘤生态系统和细胞状态 | 胃腺癌 | digital pathology | gastric adenocarcinoma | spatial transcriptomic (GeoMx Digital Spatial Profiler), single-cell RNA sequencing | NA | spatial transcriptomic data, single-cell RNA sequencing data | multiple gastric cancers |
| 3259 | 2025-05-01 |
Single-cell RNA sequencing identifies endothelial-derived HBEGF as promoting pancreatic beta cell proliferation in mice via the EGFR-Kmt5a-H4K20me pathway
2025-Apr, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06341-y
PMID:39694915
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了内皮细胞衍生的HBEGF通过EGFR-Kmt5a-H4K20me通路促进小鼠胰腺β细胞增殖的机制 | 首次发现内皮细胞衍生的HBEGF通过Kmt5a-H4K20me信号通路调控β细胞增殖，为糖尿病治疗提供了新的潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究调控β细胞生理性增殖的细胞内和细胞外信号通路 | 小鼠胰腺β细胞 | digital pathology | diabetes | scRNA-seq, RNA-seq | NA | RNA sequencing data | 43,724个内分泌和非内分泌细胞（其中15,569个β细胞） |
| 3260 | 2025-05-01 |
Restorative Effects of Short-Chain Fatty Acids on Corneal Homeostasis Disrupted by Antibiotic-Induced Gut Dysbiosis
2025-Apr, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.010
PMID:39732390
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研究论文 | 研究抗生素诱导的肠道菌群失调对小鼠角膜稳态的影响及短链脂肪酸的修复作用 | 首次揭示了肠道菌群通过调节昼夜节律基因表达和维持屏障功能对角膜生理的关键作用，并发现短链脂肪酸可修复角膜完整性 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究肠道菌群对角膜稳态的调控机制及短链脂肪酸的治疗潜力 | 小鼠角膜 | 微生物组学 | 角膜功能障碍 | RNA测序、单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明小鼠数量 |