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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3241 | 2026-02-06 |
Dissecting the development of bovine testicular tissue using spatial transcriptomics
2026-Feb-05, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01340-4
PMID:41639718
|
研究论文 | 本研究首次构建了牛睾丸组织的空间转录图谱,系统描述了精子发生过程中的动态转录变化 | 首次利用Stereo-seq技术构建牛睾丸组织的空间转录图谱,揭示了牛生殖细胞群体的动态转录过程 | NA | 研究牛睾丸组织的发育过程,特别是精子发生期间的转录动态 | 牛睾丸组织,包括两个年龄段的样本(小牛和成年公牛) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 两个年龄段的牛睾丸组织样本(小牛和成年公牛) | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 3242 | 2026-02-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and microenvironment of temporal bone squamous cell carcinoma
2026-Feb-05, Clinical and experimental otorhinolaryngology
IF:2.9Q1
DOI:10.21053/ceo.2025-00324
PMID:41639753
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研究论文 | 本研究首次利用单细胞RNA测序技术揭示了颞骨鳞状细胞癌的肿瘤异质性和微环境特征 | 首次报道了颞骨鳞状细胞癌的单细胞RNA测序数据,揭示了其肿瘤异质性、细胞分化轨迹以及免疫细胞间通讯特征 | 样本量较小(仅6名患者),且为罕见疾病,限制了结果的普适性 | 揭示颞骨鳞状细胞癌的肿瘤异质性和微环境特征,以寻找诊断和治疗生物标志物 | 颞骨鳞状细胞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 颞骨鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6名患者的9个样本(5个癌组织,4个癌旁正常组织),共计113,344个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3243 | 2026-02-06 |
XCR1+ Conventional type 1 dendritic cells exacerbate the inflammation in osteogenic arthritis through IL-17A+CD8+ T cells
2026-Feb-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70069
PMID:41640334
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TCR分析,揭示了XCR1+传统1型树突状细胞通过IL-17A+CD8+ T细胞加剧骨性关节炎炎症的机制 | 首次发现cDC1s在骨性关节炎中通过MHC I抗原呈递与CD8+ T细胞相互作用,并利用versican衍生肽建立新型AS小鼠模型 | 样本量较小(33例患者标本),且小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 探究强直性脊柱炎和附着点炎相关关节炎的病理机制,特别是免疫细胞在骨重塑关节炎中的作用 | 早期类风湿关节炎和强直性脊柱炎患者的病变组织,以及新型AS小鼠模型 | 数字病理学 | 骨性关节炎 | 单细胞RNA-seq, TCR分析, 流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | RNA序列数据, 图像数据 | 33例患者标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3244 | 2026-02-06 |
Single-Cell Sequencing Reveals Varying Cell-Mediated Immunity Profiles in Individuals with Distinct Antibody Responses Following Ad5-nCoV Booster
2026-Feb-05, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiag078
PMID:41640352
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术,分析了Ad5-nCoV加强针接种后不同抗体反应个体的细胞介导免疫特征,揭示了细胞免疫在疫苗免疫应答中的关键作用 | 首次在Ad5-nCoV加强针接种背景下,结合单细胞测序技术系统比较了高、低抗体滴度个体的细胞动态、转录组谱、免疫受体库和细胞通讯差异,为疫苗效力评估提供了整合体液和细胞免疫的新视角 | 研究样本仅基于PBMC,未涉及组织特异性免疫反应;队列规模为144人,可能限制了对罕见细胞亚群的检测;研究为观察性设计,未进行机制验证实验 | 探究Ad5-nCoV加强针接种后个体间免疫应答差异的细胞和分子机制,以完善疫苗效力评估框架 | 144名Ad5-nCoV加强针接种者的外周血单个核细胞(PBMC)样本,按抗体滴度分为高反应组和低反应组 | 单细胞组学 | 传染病(COVID-19) | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据、免疫受体序列数据 | 144名参与者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3245 | 2026-02-06 |
Novel insights into the mechanism of formaldehyde-induced lung cancer: a network toxicology and molecular docking approach
2026-Feb-05, Toxicology mechanisms and methods
IF:2.8Q2
DOI:10.1080/15376516.2026.2621747
PMID:41641566
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研究论文 | 本研究通过网络毒理学和分子对接技术,探索甲醛对肺癌的复杂影响,揭示其分子机制 | 结合网络毒理学、分子对接和单细胞RNA测序数据挖掘,从生物网络角度系统分析甲醛致肺癌的分子机制,发现传统毒理学方法难以揭示的复杂关系 | 研究主要基于数据库信息和计算模拟,缺乏实验验证,且样本来源和具体技术细节未明确说明 | 理解甲醛影响肺癌的分子机制,为预防甲醛暴露引起的肺癌提供策略见解 | 甲醛与肺癌相关的潜在靶点基因及信号通路 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络毒理学、分子对接、单细胞RNA测序数据挖掘 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3246 | 2026-02-06 |
HPV Integration in Head and Neck Cancer: Downstream Splicing Events and Expression Ratios Linked with Poor Outcomes
2026-Feb-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0645
PMID:41269209
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研究论文 | 本研究通过分析头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的HPV整合事件,揭示了其与致癌基因网络、RNA剪接事件及临床预后的关联 | 首次基于大规模HNSCC队列,通过RNA而非DNA分析HPV整合,识别了致癌基因网络和HPV RNA特征(如剪接融合转录本和基因表达比)作为预后生物标志物 | HPV整合与临床结局的关系先前未确认,且研究可能受样本异质性或队列差异影响 | 探究HPV整合在HPV相关头颈癌中对人类和HPV基因表达及临床结局(复发和总生存)的影响 | 261个HPV相关HNSCC的bulk和单细胞RNA测序样本,包括来自五个队列的数据,其中62个来自新密歇根大学队列 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA测序(包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 261个HPV相关HNSCC样本(包括bulk和单细胞RNA-seq),以及102个HPV阳性HNSCC参与者的DNA HPV整合事件数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3247 | 2026-02-06 |
Electroacupuncture in Combination with Bevacizumab Hydrogel Provides a Therapeutic Strategy for Bladder Cancer
2026-Feb-04, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.6c00404
PMID:41572812
|
研究论文 | 本研究评估了电针联合贝伐单抗水凝胶对膀胱癌的治疗效果,并探讨了其潜在机制 | 首次将电针疗法与抗血管生成药物贝伐单抗的水凝胶递送系统相结合,用于膀胱癌治疗,并通过单细胞RNA测序揭示了电针调节肿瘤免疫微环境的机制 | 研究主要在动物模型中进行,其临床转化效果仍需进一步验证;电针的作用机制仍需更深入探索 | 探索电针联合抗血管生成药物治疗膀胱癌的疗效及机制,为癌症综合治疗提供新策略 | 膀胱癌小鼠模型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 网络药理学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3248 | 2026-02-06 |
Mechanical Strain-Programmed SDC1+ Sheath Fibroblasts Trigger CXCR4hi Neutrophil-Mediated Enthesitis in Ankylosing Spondylitis
2026-Feb-04, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520617
PMID:41637585
|
研究论文 | 本研究通过构建小鼠模型和单细胞RNA测序图谱,揭示了机械应力如何通过SDC1+鞘成纤维细胞和CXCR4hi中性粒细胞之间的相互作用,驱动强直性脊柱炎附着点炎的分子机制 | 首次在机械应力相关的强直性脊柱炎附着点炎中,鉴定出疾病特异性的SDC1+鞘成纤维细胞亚群,并阐明其通过分泌CXCL5招募和激活CXCR4hi中性粒细胞,进而加剧炎症的细胞互作新机制 | 研究主要基于SKG小鼠模型,其病理过程与人类强直性脊柱炎可能存在差异;临床转化潜力有待进一步验证 | 探究机械应力在强直性脊柱炎附着点炎发生发展中的细胞互作与分子机制 | 实验性脊柱关节炎SKG小鼠的附着点组织 | 单细胞组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 基于SKG小鼠模型构建的单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3249 | 2026-02-06 |
A HIF1A variant impacts long-term disability and smoldering inflammation in multiple sclerosis
2026-Feb-04, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-026-02984-w
PMID:41639279
|
研究论文 | 本研究通过遗传分析发现HIF1A基因的一个变异与多发性硬化症更有利的长期病程和减少的慢性炎症相关 | 首次在多发性硬化症中鉴定出HIF1A基因的保护性变异,并通过多组学方法揭示了其在细胞类型特异性中的动态调控作用 | 研究主要基于观察性数据,需要进一步实验验证该变异的因果机制 | 探究遗传变异在多发性硬化症慢性炎症和疾病进展中的作用 | 多发性硬化症患者 | 自然语言处理 | 多发性硬化症 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 遗传数据, 影像数据, 生物标志物数据, 组织学数据 | 2,817名患者(来自多个独立队列) | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3250 | 2026-02-06 |
Joint modeling of cellular heterogeneity and condition effects with scPCA in single-cell RNA-seq
2026-Feb-04, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09651-6
PMID:41639368
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scPCA的灵活降维框架,用于联合建模单细胞RNA测序数据中的细胞异质性和条件效应 | scPCA能够在线性降维框架中整合研究协变量,恢复集成的因子表示,并揭示跨条件和分解组分的转录变化 | NA | 开发一种能够同时处理细胞异质性和条件效应的降维方法,以改善单细胞RNA测序数据的分析 | 单细胞RNA测序数据,包括未刺激和IFNß处理的PBMCs、啮齿动物肺细胞群、去极化视觉皮层神经元以及CRISPR-Cas9 chordin敲除斑马鱼数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA | 基因表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3251 | 2026-02-06 |
FAM135B Deficiency Inhibits Cytotoxic T-cell Activity in Triple-Negative Breast Cancer by Blocking the IFI16-Dependent STING Pathway
2026-Feb-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0310
PMID:41218197
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研究论文 | 本研究揭示了FAM135B通过调控IFI16依赖性STING通路激活细胞毒性T细胞,从而影响三阴性乳腺癌免疫治疗效果的机制 | 首次发现FAM135B作为三阴性乳腺癌抗肿瘤免疫的调控因子,阐明其通过竞争性阻断TRIM21介导的IFI16泛素化降解来激活STING通路的新机制 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据,缺乏大规模临床队列验证;未探讨FAM135B在其他癌症类型中的普适性 | 探究三阴性乳腺癌患者对免疫检查点阻断治疗响应差异的分子机制 | 三阴性乳腺癌细胞、细胞毒性T细胞、FAM135B蛋白、IFI16蛋白、STING信号通路 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、蛋白质相互作用分析、泛素化修饰检测 | NA | 单细胞测序数据、蛋白质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3252 | 2026-02-06 |
Pan-Cancer Single-Cell RNA Sequencing Analysis Refines Multi-Origin Monocyte and Macrophage Lineages
2026-Feb-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-1255
PMID:41231218
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学构建了健康和泛癌组织中的髓系细胞图谱,揭示了肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的异质性及其双重起源模型 | 提出了TAM的双重起源模型,区分了源自组织驻留巨噬细胞的C1QC+ TAM和源自循环单核细胞的SPP1+/ISG15+ TAM,并明确了THBS1+ MDSC-SPP1+ TAM谱系与不良预后及免疫治疗反应不佳的关联 | 研究主要基于转录组数据,功能验证和机制探索有待进一步实验证实 | 阐明肿瘤相关巨噬细胞(TAM)的异质性、起源及其在肿瘤微环境中的作用 | 健康和多种癌症组织中的髓系细胞,特别是单核细胞和巨噬细胞谱系 | 单细胞组学 | 泛癌分析 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3253 | 2026-02-06 |
Phenotypic Characterization and Prognostic Impact of CD103+ Tissue-Resident Memory T Cells in Diffuse Large B-cell Lymphoma
2026-Feb-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0445
PMID:41270222
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研究论文 | 本研究通过免疫荧光、流式细胞术和单细胞RNA测序等方法,表征了弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中CD103+组织驻留记忆T细胞的表型、功能及其与临床预后的关系 | 首次在DLBCL中系统表征CD103+ TRM细胞的表型、转录特征和功能活性,并揭示其与良好预后的相关性 | 研究样本量有限,且主要基于回顾性分析,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究DLBCL中CD103+组织驻留记忆T细胞的表型特征、功能及其对患者预后的影响 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者组织样本中的CD103+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 免疫荧光染色、流式细胞术、单细胞RNA测序、CITEseq、共培养实验 | NA | 组织切片图像、流式细胞数据、单细胞转录组数据 | 两个患者队列的DLBCL样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3254 | 2026-02-06 |
Transcription and potential functions of a novel XIST isoform in male peripheral glia
2026-Feb-03, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280832.125
PMID:41386982
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研究论文 | 本研究通过整合分析多个人体组织和器官的单细胞RNA-seq数据,发现XIST在男性外周神经胶质细胞中表达,并揭示了一种新型XIST转录本在施万细胞中的潜在功能 | 首次报道XIST在男性外周神经胶质细胞中的表达,并识别出一种由替代启动子驱动的较短转录本,暗示XIST在X染色体失活之外的新作用 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏直接的实验验证来确认XIST转录本的功能机制 | 探索XIST在男性外周神经胶质细胞中的表达模式及其潜在的非X染色体失活功能 | 人类外周神经胶质细胞,特别是施万细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞表观基因组学,批量转录组学,批量表观基因组学 | NA | RNA-seq数据,表观基因组数据 | 多个人体组织和器官的单细胞数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞表观基因组学 | NA | NA |
| 3255 | 2026-02-06 |
CARD9-dependent macrophage plasticity regulates effective fungal clearance
2026-Feb-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI188827
PMID:41329515
|
研究论文 | 本研究揭示了CARD9通过调控巨噬细胞可塑性在慢性暗色丝孢霉真菌感染中的关键作用及其机制 | 首次利用单细胞RNA-seq技术结合小鼠和人类样本,系统阐明了CARD9缺陷通过NF-κB/CREB/C/EBPβ轴调控TREM2hi巨噬细胞分化,从而损害抗真菌免疫的新机制 | 研究主要聚焦于皮肤病变的免疫细胞,未涉及其他器官或系统性感染;靶向TREM2的治疗策略尚未进行临床试验验证 | 探究CARD9缺陷在慢性真菌感染发病机制中的具体细胞机制 | 小鼠和人类皮肤病变样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 真菌感染 | 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | 小鼠和人类皮肤病变样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3256 | 2026-02-06 |
Vinculin influences essential processes in enteric nervous system development and Hirschsprung disease pathogenesis
2026-Feb-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198531
PMID:41364504
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研究论文 | 本研究探讨了黏着斑蛋白在肠神经系统发育和先天性巨结肠症发病机制中的关键作用 | 首次将VCL基因突变与先天性巨结肠症联系起来,并通过单细胞和空间转录组学揭示了VCL通过调控PTN通路影响ENS-间充质细胞互作的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本中的突变验证和功能研究有待进一步深入 | 阐明VCL在肠神经系统发育和先天性巨结肠症发病中的分子机制 | VCL基因、肠神经系统、先天性巨结肠症患者、神经嵴特异性Vcl敲除小鼠 | 发育生物学与疾病机制 | 先天性巨结肠症 | 全基因组测序、单细胞转录组测序、空间RNA-seq、体外功能实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因组序列数据、转录组数据、空间转录组数据 | 未明确说明患者和小鼠的具体数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3257 | 2026-02-06 |
A single-cell-resolution spatial transcriptomic atlas decodes wheat spike development and yield potential
2026-Feb-02, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.12.020
PMID:41437568
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研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率空间转录组分析,全面绘制了小麦穗发育五个关键阶段的时空转录组图谱,揭示了穗发育的分子调控机制 | 首次在小麦中应用单细胞分辨率空间转录组技术,构建了穗发育的时空转录组图谱,识别了关键细胞类型和基因调控网络,并开发了公开在线平台用于数据查询和可视化 | 研究主要关注早期穗发育阶段,对后期籽粒灌浆和成熟过程的分子机制覆盖有限,且依赖于特定小麦品种,可能无法完全代表所有遗传背景 | 解析小麦穗发育的分子调控机制,以优化穗结构并提高谷物产量潜力 | 小麦(Triticum aestivum)穗发育过程中的细胞和组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组分析,单核RNA测序,假时间分析,RNA速度分析,GWAS数据整合 | NA | 空间转录组数据,单核RNA测序数据,GWAS数据 | 覆盖小麦穗发育五个关键阶段的样本,具体细胞类型包括九种不同细胞类型 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3258 | 2026-02-06 |
Single-nucleus transcriptional and chromatin accessibility analyses of maturing mouse Achilles tendon uncover the molecular landscape of tendon stem/progenitor cells
2026-Feb-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104768
PMID:41627310
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和染色质可及性分析,揭示了小鼠跟腱成熟过程中肌腱干细胞/祖细胞的分子特征 | 首次鉴定出CD55和CD248作为肌腱干细胞/祖细胞的新型表面抗原标记物,并结合多组学分析确认其功能特性 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;样本年龄范围有限(仅2周和6周) | 探索肌腱干细胞/祖细胞的分子特征及其在肌腱修复中的作用 | 小鼠跟腱细胞 | 单细胞组学 | 肌腱损伤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 2周龄和6周龄小鼠的跟腱细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 3259 | 2026-02-06 |
Depletion of Sorcs3 Activates Totipotency in Mouse Embryonic Stem Cells by Modulating Key Signaling Pathways
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509151
PMID:41178446
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研究论文 | 本研究通过敲除小鼠胚胎干细胞中的Sorcs3基因,成功诱导了类全能性状态,并揭示了Tfap2c基因及相关信号通路在其中的关键作用 | 首次发现Sorcs3基因缺失可激活小鼠胚胎干细胞的类全能性,并建立了通过抑制TGF-β、PI3K-AKT和溶酶体通路在确定培养基中获得全能性干细胞的通用平台 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类细胞中验证;类全能性状态的长期维持和功能完整性需进一步评估 | 探索建立可持续全能性干细胞的方法并研究其调控机制 | 小鼠胚胎干细胞(ESCs) | 发育生物学 | NA | 基因敲除、单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3260 | 2026-02-06 |
CELLama: Foundation Model for Single Cell and Spatial Transcriptomics by Cell Embedding Leveraging Language Model Abilities
2026-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513210
PMID:41243712
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研究论文 | 本文提出了一种名为CELLama的基础模型,通过利用语言模型能力将单细胞和空间转录组数据转化为句子,实现通用细胞嵌入,以解决数据分析和整合的挑战 | 开发了一个基于语言模型的框架,将细胞数据转化为包含基因表达和元数据的句子,从而支持从细胞分型到空间背景分析的灵活应用,无需复杂的数据集特定分析流程 | NA | 解决大规模单细胞RNA测序和空间转录组学数据分析中的复杂性挑战,特别是细胞分型、整合和空间关系理解 | 单细胞RNA测序和空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 语言模型 | 基因表达数据, 元数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |