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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3241 | 2026-01-28 |
Single-cell sequencing and network pharmacology coupled with molecular docking and experimental validation reveal the effects of YPFS on macrophages in stage I non-small cell lung cancer
2026-Jan-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04305-2
PMID:41591571
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序、网络药理学、分子对接和实验验证,揭示了玉屏风散(YPFS)对I期非小细胞肺癌中巨噬细胞的影响 | 首次将单细胞测序、网络药理学、分子对接和实验验证相结合,系统研究传统中药玉屏风散对肺癌微环境中巨噬细胞极化的调控作用,并发现AHSA1是关键调控因子,槲皮素是潜在治疗候选物 | 研究主要聚焦于I期非小细胞肺癌,未涵盖更晚期或其他亚型;分子对接和网络药理学的预测结果需进一步体内外实验验证 | 探究I期非小细胞肺癌肿瘤微环境中巨噬细胞的异质性,并评估传统中药玉屏风散及其活性成分对巨噬细胞极化的调控作用 | I期非小细胞肺癌患者的肿瘤组织(单细胞测序数据)、巨噬细胞亚群、AHSA1蛋白、玉屏风散活性成分(汉黄芩素、山奈酚、槲皮素) | 单细胞组学与网络药理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、网络药理学、分子对接、实验验证 | NA | 单细胞转录组数据、化合物结构数据 | 未明确提及具体样本数量,但基于I期非小细胞肺癌患者构建单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3242 | 2026-01-28 |
Prediction of tumor-infiltrating lymphocytes through habitat radiomics and exploration of response mechanisms in neoadjuvant immunochemotherapy-treated lung cancer
2026-Jan-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04291-x
PMID:41591567
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种基于栖息地放射组学的方法,用于无创预测肿瘤浸润淋巴细胞状态,以评估非小细胞肺癌新辅助免疫化疗的疗效 | 首次结合栖息地放射组学与单细胞RNA测序分析,通过K-means聚类识别肿瘤亚区域进行特征提取,并利用SHAP分析增强模型可解释性 | 研究为回顾性设计,样本量有限(201例用于放射组学分析),且仅基于CT影像,可能未涵盖所有肿瘤微环境特征 | 评估非小细胞肺癌新辅助免疫化疗后的治疗反应,通过预测肿瘤浸润淋巴细胞状态进行预后分层 | 非小细胞肺癌患者,特别是接受新辅助免疫化疗的个体 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),K-means聚类,SHAP分析 | 随机森林(Random Forest),并评估了七种机器学习算法 | CT图像,单细胞RNA测序数据 | 238例非小细胞肺癌患者(其中201例符合放射组学分析标准) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3243 | 2026-01-28 |
FAP expression as a marker of malignant transformation enabling in vivo characterization in peripheral nerve sheath tumors: a multimodal and translational study
2026-Jan-27, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-026-02979-7
PMID:41591566
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研究论文 | 本研究探讨了成纤维细胞活化蛋白α(FAP)作为恶性外周神经鞘瘤(MPNST)的生物标志物和治疗诊断靶点的潜力 | 首次通过整合多组学数据(批量转录组、空间转录组、单细胞RNA测序)和临床成像(FAP靶向PET/CT),系统性地验证了FAP在MPNST恶性转化中的特异性表达及其与高风险肿瘤细胞状态的关联 | 研究样本量有限,特别是临床成像部分仅基于单个NF-1患者;需要在更大队列中进一步验证FAP-PET的诊断特异性 | 开发能够区分恶性外周神经鞘瘤与良性神经纤维瘤的生物标志物和诊断方法 | 外周神经鞘肿瘤(包括MPNST和神经纤维瘤) | 数字病理学 | 神经纤维瘤病1型相关肿瘤 | 批量转录组学、空间转录组学、单细胞RNA测序、免疫组织化学、PET/CT成像 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、单细胞数据、图像数据 | 多个独立数据集(包括TCGA肉瘤数据集)和独立存档样本,临床成像涉及1名NF-1患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 3244 | 2026-01-28 |
GATA1 N-terminus coordinates metabolic reprogramming in erythropoiesis
2026-Jan-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030464
PMID:41587073
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序等技术,揭示了GATA1 N端在红细胞生成中调控代谢重编程的关键作用 | 首次发现GATA1 N端通过直接调控PKM表达和组蛋白乳酸化,协调红细胞生成中的糖酵解代谢重编程 | 研究主要基于小鼠胚胎肝细胞模型,在人类疾病中的直接验证仍需进一步探索 | 阐明GATA1 N端在红细胞生成中的分子功能及其与代谢调控的关系 | Gata1突变胚胎的胎儿肝细胞、红细胞前体细胞 | 单细胞组学 | 骨髓增生异常综合征、Diamond-Blackfan贫血 | 单细胞RNA测序、精度核运行测序、CUT&RUN | NA | 单细胞转录组数据、表观基因组数据 | Gata1突变胚胎的胎儿肝细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3245 | 2026-01-28 |
Sex-Based Differences in Cell Types and Gene Expression within the Anterior Cruciate Ligament
2026-Jan-26, The Journal of bone and joint surgery. American volume
DOI:10.2106/JBJS.25.00860
PMID:41587266
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前交叉韧带中细胞类型和基因表达的性别差异 | 首次在单细胞水平上系统比较了男性和女性前交叉韧带中所有原生细胞类型的基因表达差异,并识别出具有性别依赖性表达特征的韧带祖细胞群 | 样本量较小(4名男性,5名女性),且仅针对前交叉韧带,结论的普适性有待进一步验证 | 探究性别差异在前交叉韧带损伤风险和严重程度中的作用机制 | 人类前交叉韧带样本 | 单细胞组学 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,组织切片图像 | 9名患者(4名男性,5名女性)的前交叉韧带样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3246 | 2026-01-28 |
Early Unloading After ACL Rupture and Prior to Surgical Restabilization in Mice Slows Post-Traumatic Osteoarthritis Progression
2026-Jan-26, Cartilage
IF:2.7Q1
DOI:10.1177/19476035251411505
PMID:41587748
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研究论文 | 本研究探讨了小鼠前交叉韧带(ACL)损伤后早期卸载对创伤后骨关节炎(PTOA)进展的影响 | 首次在小鼠模型中证明ACL损伤后一周的卸载能有效减缓PTOA进展,并揭示了中性粒细胞和单核-巨噬细胞在其中的调节作用 | 研究基于小鼠模型,结果可能无法直接外推至人类;后续关节稳定手术增加了炎症蛋白酶活性并加剧了骨丢失,但未显著改善OA评分或滑膜炎 | 确定ACL损伤后至手术稳定期间卸载对PTOA进展的影响 | 小鼠(ACL损伤模型) | NA | 创伤后骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3247 | 2026-01-28 |
Spatially resolved molecular signatures of Lewy body dementia
2026-Jan-26, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-026-02981-z
PMID:41588135
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,解析了路易体痴呆患者大脑皮层中基因表达的空间分布特征,揭示了SNCA基因剂量和APOE4基因型如何影响疾病的区域病理机制 | 首次在完整的大脑皮层结构中,结合SNCA三倍体和APOE4基因型,系统地绘制了路易体痴呆的空间分子图谱,并识别出皮层第5层为易感区域,以及Reelin信号通路的核心作用 | 研究基于死后脑组织样本,无法动态观察疾病进程;样本量相对有限;空间转录组学的分辨率可能不足以解析所有细胞亚型的细微变化 | 探究SNCA基因剂量和APOE4基因型如何影响路易体痴呆的神经元易感性和区域病理机制 | 死后颞叶皮层组织(来自路易体痴呆患者及年龄、性别匹配的对照) | 空间转录组学 | 路易体痴呆 | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 空间基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 路易体痴呆病例(含SNCA三倍体或不同APOE基因型)及对照的死后脑组织样本 | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | NA |
| 3248 | 2026-01-28 |
Immunosuppressive immune microenvironment landscapes in VISTA-high gastric cancer
2026-Jan-26, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03290-0
PMID:41588173
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了VISTA在胃癌中的表达模式及其在肿瘤微环境中的免疫抑制作用 | 首次系统性地结合多色免疫组化、单细胞RNA测序和空间转录组学技术,全面解析了VISTA高表达胃癌的免疫微环境特征,并发现了VISTA+单核-巨噬细胞通过LGALS9-PTPRC信号轴促进T细胞耗竭的新机制 | 样本量相对有限(单细胞测序n=17,空间转录组学n=3),且为观察性研究,需要进一步的功能实验验证机制 | 探究VISTA在胃癌中的表达模式及其在肿瘤免疫微环境中的功能特性 | 胃癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 多色免疫组化,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 图像,单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 172例患者(多色免疫组化),17例(单细胞RNA测序),3例(空间转录组学) | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 3249 | 2026-01-28 |
International workshop report on "Animal resilience and organismal response to environmental change: insights from basal metazoans", Tutzing (Germany), 22-25 September 2025
2026-Jan-25, Frontiers in zoology
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12983-025-00592-0
PMID:41580841
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会议报告 | 本文是关于2025年在德国图青举行的“动物恢复力与生物对环境变化的反应:来自基础后生动物的见解”国际研讨会的报告 | 汇集了来自全球的最新研究成果,涵盖了从分子进化、功能基因组学到生态学、发育生物学和共生等多个领域,并重点关注利用基础后生动物来研究多细胞性起源、组织再生机制和环境适应等基本问题 | NA | 探讨动物恢复力与生物对环境变化的反应机制,并利用基础后生动物模型来研究多细胞性起源、组织再生和环境适应等基本生物学问题 | 基础后生动物,包括刺胞动物(水螅、海葵、水母、珊瑚)、海绵和栉水母 | NA | NA | 单细胞转录组学、基因组组装、表观遗传调控分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3250 | 2026-01-23 |
Building consensus: construction of a juvenile and adult scRNA-seq meta-atlas for dataset comparisons and harmonizing transcriptomic definitions of enteric neuron subtypes
2026-Jan-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12283-5
PMID:41566221
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3251 | 2026-01-28 |
Immunomodulatory role of megakaryocytes in the hematopoietic niche of myeloproliferative neoplasms
2026-Jan-22, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.288948
PMID:41568522
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研究论文 | 本研究探讨了巨核细胞在骨髓增殖性肿瘤造血微环境中的免疫调节作用 | 首次揭示了JAK2V617F突变巨核细胞通过激活LINE-1逆转录转座子驱动慢性骨髓炎症的新机制 | 主要基于小鼠模型,人类样本验证数量有限(13例患者) | 阐明突变巨核细胞在骨髓增殖性肿瘤发展中的免疫调节功能 | 骨髓增殖性肿瘤(MPN)中的巨核细胞和造血干细胞 | 血液肿瘤学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,蛋白质检测数据 | 小鼠模型和13例MPN患者骨髓样本,5例骨科对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3252 | 2026-01-28 |
Microbial single-cell omics in situ
2026-Jan-22, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101128
PMID:41576946
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研究论文 | 本文介绍了一种利用激光诱导前向转移技术,在复杂样本中获取高质量微生物单细胞基因组或转录组的方法 | 开发了基于激光诱导前向转移技术的单细胞方法,可直接分析复杂样本中邻近的细菌细胞或与宿主细胞相邻的细菌细胞,并支持荧光标记后的单细胞可视化收集 | 未明确说明该方法在通量、成本或特定样本类型中的具体限制 | 开发一种能够在复杂环境中对微生物进行原位单细胞多组学分析的技术 | 小鼠肠道、人类唾液和肿瘤切片等复杂样本中的微生物单细胞 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞基因组学、单细胞转录组学、激光诱导前向转移 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及小鼠肠道、人类唾液和肿瘤切片等多种样本类型 | NA | 单细胞基因组学、单细胞转录组学 | 激光诱导前向转移系统 | 基于激光诱导前向转移技术的单细胞采集与分析平台 |
| 3253 | 2026-01-28 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2026-Jan-21, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0424
PMID:41563441
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研究论文 | 本研究优化了胰腺胰岛单细胞长读长测序方案,以改善读长和转录本检测,从而增强异构体识别能力 | 通过比较5'和3'文库制备方案,发现5'方案在转录本识别上更优,并展示了靶向去除胰岛素转录本策略可提升信息性读段的检测,实现了异构体特异性基因表达分析 | 长读长测序技术仍面临读长不足和错误率较高的技术挑战,且高表达单一转录本的细胞类型可能掩盖低丰度转录本的识别 | 优化单细胞长读长测序协议,以提升胰腺胰岛中异构体检测的准确性和效率 | 胰腺胰岛中的各种细胞类型,特别是胰岛内分泌细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞长读长RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3254 | 2026-01-28 |
The Role of Cancer-Associated Fibroblasts and Tumor-Associated Macrophages in the Tumor Microenvironment and Their Impact on Ovarian Cancer Survival and Therapy
2026-Jan-19, Current oncology (Toronto, Ont.)
DOI:10.3390/curroncol33010059
PMID:41590379
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综述 | 本文综述了癌症相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞在卵巢癌肿瘤微环境中的作用及其对生存和治疗的影响 | 整合了单细胞测序和空间转录组学等先进技术来精确识别CAF和TAM亚型,并探讨了针对这些细胞的新型靶向治疗策略 | NA | 探讨CAFs和TAMs在卵巢癌肿瘤微环境中的作用及其对治疗抵抗和预后的影响 | 卵巢癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 3255 | 2026-01-28 |
Protocol for dual spatial transcriptomic profiling of infected tissues
2026-Jan-13, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104282
PMID:41538322
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研究论文 | 本文介绍了一种用于感染组织的双重空间转录组分析协议,旨在同时分析宿主和病原体的转录模式 | 开发了一种双重空间转录组分析协议,能够同时分析宿主和病原体的转录模式,以建立病原适应特征并预测感染结果 | NA | 建立一种用于感染组织的双重空间转录组分析协议,以研究宿主-病原体相互作用 | 感染组织 | 空间转录组学 | 感染性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3256 | 2026-01-28 |
Itaconate Promotes Cold Adaptation and Myocardial Protection by Enhancing Brown Adipose Tissue Metabolism
2026-Jan-12, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo16010066
PMID:41590674
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研究论文 | 本研究揭示了免疫代谢物衣康酸在棕色脂肪组织中的表达模式及其通过增强棕色脂肪代谢功能促进冷适应和心肌保护的作用 | 首次阐明了衣康酸合成关键基因Irg1在棕色脂肪组织不同发育阶段的细胞特异性表达,并证明了外源性衣康酸通过依赖棕色脂肪组织的机制增强产热和改善心脏损伤 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;衣康酸的具体作用机制和信号通路仍需进一步探索 | 揭示衣康酸在棕色脂肪组织中的表达模式及其对冷适应和心肌保护的影响 | 小鼠棕色脂肪组织、心肌组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、气相色谱-三重四极杆质谱 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢物数据 | P7新生小鼠和成年小鼠的棕色脂肪组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3257 | 2026-01-28 |
Stack: In-Context Learning of Single-Cell Biology
2026-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.09.698608
PMID:41542582
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研究论文 | 本文提出了一种名为Stack的单细胞生物学基础模型,该模型利用上下文中的细胞信息来生成细胞表征,并在零样本设置下显著提升了多种下游任务的性能 | 提出了一种利用表格注意力机制、基于1.49亿个统一预处理的人类单细胞训练的基础模型,能够进行上下文学习,无需针对特定数据进行微调即可预测条件对目标细胞群的影响 | 模型主要基于人类单细胞转录组数据训练,其泛化能力到其他物种或数据类型尚未验证;技术局限性可能影响单细胞水平的测量精度 | 开发一个能够进行上下文学习的单细胞生物学基础模型,以更好地捕捉细胞表型多样性并预测生物条件的影响 | 人类单细胞,特别是跨28种组织、40种细胞类别和201种扰动条件下的细胞 | 单细胞生物学,机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 基础模型,表格注意力机制 | 单细胞转录组数据 | 1.49亿个统一预处理的人类单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3258 | 2026-01-28 |
Mapping kinase-dependent tumor immune adaptation with multiplexed single-cell CRISPR screens
2026-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.08.698516
PMID:41542636
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研究论文 | 本文介绍了一个集成的高通量单细胞CRISPR筛选框架,用于绘制胶质母细胞瘤中T细胞驱动免疫压力的肿瘤内在调控图谱 | 结合了CRISPR干扰/激活、免疫匹配的肿瘤-T细胞共培养以及大规模单细胞转录组学,系统量化遗传扰动如何重塑肿瘤状态和适应性反应 | 研究主要针对胶质母细胞瘤,可能不适用于其他癌症类型;依赖于体外共培养模型,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境 | 绘制肿瘤内在调控T细胞驱动免疫压力的遗传图谱,识别免疫逃逸的关键激酶靶点 | 胶质母细胞瘤细胞和NY-ESO-1抗原特异性T细胞 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞CRISPR筛选、单细胞转录组学、CRISPR干扰/激活 | 深度生成模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 3259 | 2026-01-28 |
Proteotranscriptomic Dissection of Breast Cancer T Cell States Identifies CD103+ Tfh-derived Cytotoxic Cells Linked to Immunotherapy Response
2026-Jan-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8394722/v1
PMID:41542042
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和多重蛋白表位分析,解析了乳腺癌中免疫细胞状态,特别是CD4 T滤泡辅助样细胞的亚群及其与免疫治疗反应的关系 | 首次在乳腺癌中识别出CD103+ Tfh样细胞亚群,该亚群具有细胞毒性特征,并与抗PD-1免疫治疗反应相关,超越了传统耗竭CD8 T细胞的预测价值 | NA | 探究乳腺癌肿瘤微环境中免疫细胞状态,特别是CD4 T细胞亚群在抗肿瘤免疫和免疫治疗反应中的作用 | 乳腺癌样本中的免疫细胞,特别是CD4 T滤泡辅助样细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重蛋白表位分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3260 | 2026-01-28 |
Loss of Ribosomal Protein L22 (RPL22) Expression Identifies a Transcriptional Subset of MLH1-Deficient Endometrial Cancers With Lower Numbers of Tumor-Associated Lymphocytes
2026-Jan, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100899
PMID:41005533
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研究论文 | 本研究通过免疫组化与空间转录组学技术,首次揭示了RPL22蛋白缺失可识别MLH1缺陷型子宫内膜癌中一个独特的免疫低活性亚群 | 首次发现RPL22缺失可作为MLH1缺陷型子宫内膜癌免疫低活性亚群的生物标志物,并证明其与肿瘤微环境中CD8+ T淋巴细胞减少及β-2微球蛋白表达下调相关 | 未明确RPL22缺失影响免疫微环境的具体分子机制,且样本队列规模有限 | 探究RPL22蛋白缺失在MLH1缺陷型子宫内膜癌中的临床意义及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 子宫内膜癌组织样本及细胞系 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 免疫组化、数字空间转录组学、基因敲低 | NA | 组织图像、转录组数据 | 未明确具体数量的子宫内膜癌队列样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |