单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
3221	2025-03-23	A prognostic molecular signature of hepatic steatosis is spatially heterogeneous and dynamic in human liver 2024-Dec-17, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101871 PMID:39657669	研究论文	本文通过整合临床表型、循环蛋白质组学和组织转录组学，识别了肝脂肪变性的动态功能生物标志物	使用多模态成像和广泛的蛋白质组分析，识别了与肝脂肪变性进展相关的蛋白质，并通过空间转录组学揭示了这些转录本在脂肪变性区域中的差异表达	NA	识别肝脂肪变性的动态功能生物标志物，并探索其在脂肪肝疾病和多系统代谢结果中的关联	人类肝脏	生物医学	脂肪肝	多模态成像、蛋白质组分析、空间转录组学	NA	蛋白质组数据、转录组数据	NA
3222	2025-03-23	Safety and reactogenicity of a controlled human infection model of sand fly-transmitted cutaneous leishmaniasis 2024-Nov, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/s41591-024-03146-9 PMID:39095597	研究论文	本文介绍了一项关于沙蝇传播的皮肤利什曼病的受控人类感染模型（CHIM）的安全性和反应原性的研究	首次提供了人类皮肤利什曼病病变中免疫细胞分布和细胞因子/趋化因子表达的综合图谱，揭示了离散的免疫生态位	由于CL和活检程序的结合，疤痕明显	促进疫苗开发，建立沙蝇传播的皮肤利什曼病的受控人类感染模型	14名暴露于L. major感染的Phlebotomus duboscqi的参与者	传染病学	皮肤利什曼病	免疫组织化学和空间转录组学	受控人类感染模型（CHIM）	临床数据	14名参与者
3223	2025-03-23	Neoadjuvant nivolumab or nivolumab plus ipilimumab in early-stage triple-negative breast cancer: a phase 2 adaptive trial 2024-Nov, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/s41591-024-03249-3 PMID:39284953	研究论文	本研究探讨了在早期三阴性乳腺癌患者中，使用纳武利尤单抗或纳武利尤单抗联合伊匹木单抗进行新辅助免疫治疗的潜在疗效	研究首次在早期三阴性乳腺癌患者中探索了不联合化疗的免疫检查点抑制剂新辅助治疗的疗效，并通过单细胞RNA测序揭示了与治疗反应相关的免疫细胞特征	样本量较小（每组15例患者），且研究仅针对早期三阴性乳腺癌患者，结果可能不适用于其他类型乳腺癌或晚期患者	评估不联合化疗的免疫检查点抑制剂新辅助治疗在早期三阴性乳腺癌患者中的疗效和安全性	早期三阴性乳腺癌患者	肿瘤免疫治疗	乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	临床数据、RNA测序数据	45例患者（3个队列，每组15例）
3224	2025-03-23	Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-associated platelet bias are evolutionarily conserved 2024-08-23, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adk3469 PMID:39178276	研究论文	本文通过高通量单细胞RNA测序技术，研究了人类骨髓造血干细胞（HSCs）的功能和转录谱系偏向性，特别是血小板偏向性HSCs及其在衰老过程中的变化	首次在人类骨髓HSCs中证实了功能和转录谱系偏向性，并发现血小板偏向性HSCs在衰老过程中比例和转录血小板启动水平增加	研究主要基于小鼠模型和人类骨髓HSCs的异种移植，可能不完全反映人类体内HSCs的真实情况	研究人类骨髓HSCs的功能和转录谱系偏向性，特别是血小板偏向性HSCs及其在衰老过程中的变化	人类骨髓造血干细胞（HSCs）	生物医学	血液系统疾病	高通量单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	年轻和年老小鼠的骨髓HSCs
3225	2025-03-23	Timing and location dictate monocyte fate and their transition to tumor-associated macrophages 2024-07-26, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adk3981 PMID:39058763	研究论文	本文探讨了肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的来源、演化及其在胰腺导管腺癌（PDAC）中的作用	揭示了单核细胞在肿瘤发展过程中如何分化为具有不同基因表达谱、表型和肿瘤内定位的终末分化TAMs	研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步研究	研究TAMs在PDAC中的来源和演化过程	胰腺导管腺癌（PDAC）中的单核细胞和肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）	肿瘤免疫学	胰腺癌	单细胞转录组学和高维流式细胞术	NA	单细胞转录组数据和高维流式细胞数据	诱导性单核细胞命运映射小鼠和PDAC患者肿瘤样本
3226	2025-03-23	Age-associated CD4+ T cells with B cell-promoting functions are regulated by ZEB2 in autoimmunity 2024-03-29, Science immunology IF:17.6Q1 DOI:10.1126/sciimmunol.adk1643 PMID:38330141	研究论文	本文通过流式细胞术和批量RNA测序分析了354名自身免疫性疾病患者和健康对照的CD4 T细胞亚群，发现了一种随着年龄增长而扩增的CXCR3CD4效应记忆T细胞亚群，命名为'年龄相关T辅助细胞（TA细胞）'	发现了一种新的年龄相关T细胞亚群（TA细胞），并揭示了其在自身免疫性疾病中的作用及其调控机制	研究主要基于流式细胞术和RNA测序，未涉及功能验证实验	探讨年龄与自身免疫性疾病之间的关系	354名自身免疫性疾病患者和健康对照的CD4 T细胞亚群	免疫学	自身免疫性疾病	流式细胞术，批量RNA测序，单细胞RNA测序	NA	细胞数据，RNA测序数据	354名患者和健康对照
3227	2025-03-23	Increased Chemokine Production is a Hallmark of Rhesus Macaque Natural Killer Cells Mediating Robust Anti-HIV Envelope-Specific Antibody-Dependent Cell-Mediated Cytotoxicity 2024, Pathogens & immunity DOI:10.20411/pai.v10i1.734 PMID:39911143	研究论文	本文研究了恒河猴自然杀伤细胞（RMNK）在介导抗HIV包膜特异性抗体依赖性细胞介导的细胞毒性（ADCC）反应中的异质性及其功能子集	通过单细胞RNA测序分析，发现CD107a+ RMNK细胞亚群产生更多的趋化因子，表明这些细胞不仅清除感染细胞，还提供免疫调节信号并可能抑制HIV-1复制	研究中使用的抗CD16抗体与ADCC抗体的结合效果存在显著差异，导致脱颗粒和趋化因子产生的幅度减少了6至30倍	探讨恒河猴自然杀伤细胞在抗HIV ADCC反应中的功能异质性及其对HIV-1复制的潜在抑制作用	恒河猴自然杀伤细胞（RMNK）	免疫学	HIV感染	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
3228	2025-03-23	Clonally expanded memory CD8+ T cells accumulate in atherosclerotic plaques and are pro-atherogenic in aged mice 2023-Dec, Nature aging IF:17.0Q1 DOI:10.1038/s43587-023-00515-w PMID:37996758	研究论文	本研究探讨了老化对CD8 T细胞在动脉粥样硬化中的作用，发现老化小鼠中CD8 T细胞的耗竭能减轻动脉粥样硬化	首次发现老化相关的CD8 T细胞在动脉粥样硬化斑块中的克隆扩增及其转录组特征	研究仅使用雌性小鼠，未涉及人类样本	探讨老化对CD8 T细胞在动脉粥样硬化中的作用	老化小鼠和年轻小鼠的CD8 T细胞	免疫学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	雌性小鼠
3229	2025-03-23	APOE deficiency impacts neural differentiation and cholesterol biosynthesis in human iPSC-derived cerebral organoids 2023-08-21, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-023-03444-y PMID:37605285	研究论文	本研究探讨了APOE基因缺失对人类iPSC来源的脑类器官中神经分化和胆固醇生物合成的影响	首次在人类iPSC来源的脑类器官中揭示了APOE缺失对脑脂质稳态的影响，并发现了APOE4与APOE3在神经发生和胆固醇代谢上的差异	研究仅限于体外模型，未涉及体内环境的影响	探讨APOE基因在脑稳态中的作用及其与阿尔茨海默病的关系	人类iPSC来源的脑类器官	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	人类iPSC来源的脑类器官，包括APOE缺失和未缺失的样本
3230	2025-03-22	Hydrogen sulfide improves depression-like behaviors in CUMS-induced mice by regulating autophagy 2025-May, Psychoneuroendocrinology IF:3.4Q2 DOI:10.1016/j.psyneuen.2025.107418 PMID:40023886	研究论文	本研究探讨了硫化氢通过调节自噬改善慢性不可预测轻度应激（CUMS）诱导的小鼠抑郁样行为的机制	首次揭示了硫化氢通过激活PI3K/AKT/mTOR信号通路抑制自噬并改善突触可塑性损伤的抗抑郁机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探讨硫化氢在抑郁症中的抗抑郁机制及其治疗潜力	慢性不可预测轻度应激（CUMS）诱导的抑郁小鼠	神经科学	抑郁症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	CUMS诱导的抑郁小鼠
3231	2025-03-22	Cancer-associated fibroblasts in breast cancer in the single-cell era: Opportunities and challenges 2025-Apr, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189291 PMID:40024607	综述	本文探讨了乳腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其在肿瘤微环境中的作用，并强调了单细胞RNA测序技术在分析CAF亚群中的应用	利用单细胞RNA测序技术对CAFs进行高分辨率分析，揭示了CAFs的异质性及其在乳腺癌进展中的具体作用	主要集中于乳腺癌中的CAFs，未涉及其他类型癌症或更广泛的肿瘤微环境研究	探讨CAFs在乳腺癌中的异质性及其在肿瘤微环境中的作用，为靶向治疗提供潜在方向	乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	NA
3232	2025-03-22	Microvascular aberrations found in human polycystic kidneys are an early feature in a Pkd1 mutant mouse model 2025-Mar-21, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1 DOI:10.1242/dmm.052024 PMID:40114603	研究论文	本文研究了常染色体显性多囊肾病（ADPKD）中肾脏微血管异常的特征及其在Pkd1突变小鼠模型中的早期表现	通过单细胞转录组学、三维成像及多模态磁共振成像技术，首次在ADPKD肾脏中识别出分子特征独特的微血管亚群，并在Pkd1突变小鼠模型中验证了这些异常特征的早期存在	研究主要依赖于小鼠模型，人类样本仅来自晚期ADPKD患者，可能限制了早期病理特征的全面理解	探讨ADPKD中肾脏微血管异常的起始和性质，为治疗策略提供依据	人类ADPKD肾脏及Pkd1突变小鼠肾脏	数字病理学	多囊肾病	单细胞转录组学、三维成像、多模态磁共振成像	Pkd1突变小鼠模型	图像、转录组数据	人类ADPKD肾脏样本及Pkd1突变小鼠肾脏样本
3233	2025-03-22	Screening Therapeutic Core Genes in Sepsis Using Network Pharmacology and Single-Cell RNA Sequencing 2025-Mar-20, Biochemical genetics IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s10528-025-11075-6 PMID:40113718	研究论文	本研究采用网络药理学和单细胞RNA测序技术，筛选脓毒症中的核心治疗基因，并探讨金银花的潜在治疗机制	结合网络药理学和单细胞RNA测序技术，首次系统性地筛选并验证了脓毒症中的核心治疗基因及其与金银花成分的潜在相互作用	研究结果需要进一步的实验验证，特别是金银花成分与核心基因的具体作用机制尚未明确	阐明金银花在脓毒症中的潜在治疗机制，并筛选核心治疗基因	脓毒症患者和健康对照者的血液样本	生物信息学	脓毒症	RNA测序、单细胞RNA测序、网络药理学	NA	RNA测序数据	22名脓毒症患者和10名健康对照者
3234	2025-03-22	The Role of Coagulation-Related Genes in Glioblastoma: A Comprehensive Analysis of the Tumor Microenvironment, Prognosis, and Treatment 2025-Mar-20, Biochemical genetics IF:2.1Q3 DOI:10.1007/s10528-025-11086-3 PMID:40113719	研究论文	本研究全面分析了凝血相关基因在胶质母细胞瘤（GBM）中的作用，包括肿瘤微环境、预后和治疗反应	首次从肿瘤微环境、凝血功能差异、治疗和预后等多个角度全面探讨了凝血相关基因在GBM中的作用，并构建了基于五个CRGs的风险特征模型	研究主要依赖于公开数据集和体外实验，缺乏大规模的临床验证	探讨凝血相关基因在GBM中的作用及其对预后和治疗的影响	胶质母细胞瘤（GBM）患者及其肿瘤微环境	数字病理学	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序、免疫组化、CCK8实验、伤口愈合实验、克隆形成实验	LASSO回归、随机生存森林分析	SNP、拷贝数变异数据、单细胞RNA测序数据	461例GBM患者（TCGA队列）和CGGA693队列
3235	2025-03-22	SPARROW reveals microenvironment-zone-specific cell states in healthy and diseased tissues 2025-Mar-19, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2025.101235 PMID:40112778	研究论文	SPARROW是一种计算框架，用于在健康和疾病组织中揭示微环境区域特定的细胞状态	SPARROW通过联合学习细胞类型和细胞组织的潜在嵌入和软聚类，解决了当前分析工具在细胞类型推断和细胞邻域识别方面的局限性	NA	提供跨尺度、样本和条件的组织特征的全面表征	人类和小鼠组织	数字病理学	NA	空间分辨转录组学和单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
3236	2025-03-22	Downregulated STAT3 and STAT5B are prognostic biomarkers for colorectal cancer and are associated with immune infiltration 2025-Mar-18, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-02085-2 PMID:40100436	研究论文	本研究探讨了STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能，发现STAT3和STAT5B在结直肠癌中显著下调，并与较好的预后相关	首次系统地评估了STAT家族在结直肠癌中的表达水平和预后价值，并探索了其与免疫功能和免疫浸润水平的关系	研究主要依赖于公共数据库和有限的临床样本，可能影响结果的普遍性	研究STAT家族在结直肠癌中的表达、预后价值及免疫功能	结直肠癌样本	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序、空间转录组学技术	NA	基因表达数据、临床数据	TCGA数据库644样本、GTEx数据库308样本、中国临床样本30样本
3237	2025-03-22	AI-Driven Analysis Unveils Functional Dynamics of Müller Cells in Retinal Autoimmune Inflammation 2025-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.02.28.640907 PMID:40093069	研究论文	本文通过AI驱动的单细胞RNA测序分析，揭示了在视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能动态	利用AI辅助的单细胞分析工具SCassist，首次识别了九种不同的Müller细胞亚群和五种T细胞亚群，并揭示了激活的Müller细胞在炎症视网膜中的主要功能	研究主要基于Aire-/-小鼠模型，可能不完全适用于人类视网膜炎症的情况	探索在视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能和动态变化	Müller细胞和T细胞	数字病理学	视网膜自身免疫炎症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	AI辅助分析工具SCassist	单细胞RNA测序数据	Aire-/-小鼠的视网膜样本
3238	2025-03-22	[Comprehensive analysis of the structural phenotypes and functional characteristics of B cells in oral lichen planus and oral lichenoid lesions through single-cell and spatial transcriptomics] 2025-Mar-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology DOI:10.3760/cma.j.cn112144-20241220-00500 PMID:40015701	研究论文	本文通过单细胞和空间转录组学技术，全面分析了口腔扁平苔藓（OLP）和口腔苔藓样病变（OLL）中B细胞的结构表型和功能特征	首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，深入探讨了OLP/OLL中B细胞的表型和功能，揭示了B细胞在口腔黏膜微环境中的免疫调节机制	样本量较小，仅包括2例侵蚀性OLP、3例非侵蚀性OLP和1例健康对照，且功能机制尚需进一步研究	揭示B细胞在OLP/OLL中的表型和功能特征，探讨其在口腔黏膜微环境中的免疫调节机制	口腔扁平苔藓（OLP）和口腔苔藓样病变（OLL）患者及健康对照	数字病理学	口腔疾病	单细胞RNA测序、空间转录组学	NA	基因表达数据、空间转录组数据	2例侵蚀性OLP、3例非侵蚀性OLP、1例健康对照，以及3例OLP/OLL患者和3例健康对照的病理标本
3239	2025-03-22	[Nafamostat Mesylate Alleviates Renal Ischemia-Reperfusion Injury in a Rat Model Through HMGB1 Modulation: An Omics Analysis -Based Study of the Protective Effect and the Mechanisms Involved] 2025-Jan-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition DOI:10.12182/20250160506 PMID:40109453	研究论文	本研究探讨了甲磺酸萘莫司他（NM）在肾缺血再灌注损伤（RIRI）模型中的器官保护作用及其潜在机制	通过单细胞RNA测序技术分析了NM对RIRI模型中HMGB1介导的巨噬细胞功能异常的调节作用	研究仅使用了雄性SD大鼠，未考虑性别差异对结果的影响	探讨NM在RIRI模型中的保护作用及其机制	21只健康雄性Sprague-Dawley（SD）大鼠	生物医学	肾脏疾病	单细胞RNA测序、免疫荧光、Western blotting	NA	血清样本、肾组织样本	21只SD大鼠，分为3组，每组7只
3240	2025-03-22	Identification of a Subpopulation of Astrocyte Progenitor Cells in the Neonatal Subventricular Zone: Evidence that Migration is Regulated by Glutamate Signaling 2025-Jan-09, Neurochemical research IF:3.7Q2 DOI:10.1007/s11064-024-04326-2 PMID:39789409	研究论文	本研究通过基因工程小鼠模型，探索了新生儿脑室下区星形胶质细胞前体细胞的亚群及其迁移机制，特别是谷氨酸信号在其中的调控作用	首次发现并描述了新生儿脑室下区星形胶质细胞前体细胞的亚群，并提供了谷氨酸信号调控这些细胞迁移的新证据	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探索新生儿脑室下区星形胶质细胞前体细胞的亚群及其迁移机制	基因工程小鼠模型中的星形胶质细胞前体细胞	神经科学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光、器官型切片培养	NA	基因表达数据、荧光成像数据	1-3天大的小鼠皮质星形胶质细胞培养物