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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3201 | 2025-10-06 |
Mechanism exploration and model construction for small cell transformation in EGFR-mutant lung adenocarcinomas
2024-10-02, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01981-3
PMID:39353908
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研究论文 | 探索EGFR突变肺腺癌小细胞转化的分子机制并构建预测模型 | 首次系统比较转化前后肿瘤的转录组特征,发现表观遗传改变驱动转化过程,并构建了高准确度的4标志物预测模型 | 样本量相对有限,需要更大规模验证 | 阐明EGFR突变肺腺癌小细胞转化的分子机制并开发预测方法 | 肺腺癌患者样本(包括未转化、转化前和转化后)以及原发性小细胞肺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析,多重免疫荧光 | 预测模型 | 转录组数据,免疫组织化学数据 | 训练队列和测试队列(具体数量未明确说明) | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
3202 | 2025-10-06 |
Single-cell exome sequencing reveals polyclonal seeding and TRPS1 mutations in colon cancer metastasis
2024-09-23, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01960-8
PMID:39307879
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研究论文 | 通过单细胞外显子测序揭示结肠癌转移中的多克隆播散和TRPS1基因突变机制 | 首次在单细胞水平证明结肠癌肝转移和淋巴转移均来源于多克隆循环肿瘤细胞,并发现TRPS1 R544Q突变通过TRPS1/ZEB1轴促进癌症侵袭转移 | 研究仅基于一例IV期结肠癌患者,样本量有限 | 探索结肠癌转移的克隆演化和遗传异质性机制 | 结肠癌患者的原发肿瘤、肝转移灶和淋巴转移灶 | 癌症基因组学 | 结肠癌 | 单细胞外显子测序,单细胞转录组分析 | NA | 基因组测序数据,转录组数据 | 来自1例IV期结肠癌患者的150个单细胞(包括原发肿瘤、肝转移和淋巴转移) | NA | 单细胞外显子测序,单细胞转录组测序 | NA | NA |
3203 | 2025-10-06 |
A new paradigm for generating high-quality cardiac pacemaker cells from mouse pluripotent stem cells
2024-09-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01942-w
PMID:39237509
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研究论文 | 本研究开发了一种通过双起搏细胞标记物和模拟发育路径从小鼠多能干细胞生成高质量心脏起搏细胞的新方法 | 采用双标记物Shox2和Hcn4建立报告细胞系,并通过FSK方法显著提高起搏细胞产量,同时通过单细胞RNA测序绘制分化轨迹并鉴定关键调控因子ZFP503 | 研究仅使用小鼠多能干细胞,尚未在人类细胞中验证 | 开发高质量心脏起搏细胞的分化策略以推进心脏生物起搏技术 | 小鼠多能干细胞及其分化的心脏起搏细胞 | 干细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,干细胞分化 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3204 | 2025-10-06 |
FGF Signaling Regulates Development of the Anterior Fontanelle
2024-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.14.603452
PMID:39071418
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研究论文 | 本研究通过小鼠遗传学和单细胞转录组学揭示了FGF信号通过调控WNT信号通路调节前囟门闭合和额缝形成的机制 | 首次在前囟门中发现FGF-WNT信号回路,揭示了SCX+细胞区域选择性分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究FGF信号如何调控前囟门闭合和额缝形成的发育过程 | 小鼠前囟门发育过程中的细胞分化和信号通路 | 发育生物学 | 颅缝早闭症 | 单细胞转录组学,小鼠遗传学 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3205 | 2025-10-06 |
NDC80/HEC1 promotes macrophage polarization and predicts glioma prognosis via single-cell RNA-seq and in vitro experiment
2024-07, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14850
PMID:39021287
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外实验探讨NDC80/HEC1在胶质瘤中的作用机制及其预后价值 | 首次发现HEC1通过促进巨噬细胞从M1向M2表型转化来调控肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索HEC1在胶质瘤发生发展中的功能及其作为预后标志物的潜力 | 胶质瘤组织和细胞系 | 单细胞测序分析 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 体外实验, 共培养实验 | NA | RNA测序数据, 实验数据 | 人类胶质瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
3206 | 2025-10-06 |
Targeting MS4A4A: A novel pathway to improve immunotherapy responses in glioblastoma
2024-07, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14791
PMID:38997808
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研究论文 | 本研究探索通过抑制MS4A4A驱动M2巨噬细胞向M1表型极化,以增强胶质母细胞瘤对PD-1免疫疗法的反应 | 首次揭示MS4A4A通过铁死亡途径调控巨噬细胞极化的新机制,并提出联合免疫检查点阻断治疗的新策略 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索MS4A4A抑制在改善胶质母细胞瘤免疫治疗反应中的作用 | 胶质母细胞瘤相关的肿瘤相关巨噬细胞,特别是M2表型巨噬细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组分析,流式细胞术,Western blot | NA | 基因表达数据,空间分布数据,蛋白质数据 | 小鼠皮下和原位移植模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
3207 | 2025-10-06 |
Evidences of neurological injury caused by COVID-19 from glioma tissues and glioma organoids
2024-06, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14822
PMID:38923860
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研究论文 | 本研究通过神经胶质瘤组织和类器官证实COVID-19可导致神经系统损伤 | 首次发现神经胶质瘤组织具有易感SARS-CoV-2感染的固有特性,并建立神经胶质瘤类器官作为中枢神经系统SARS-CoV-2感染的研究模型 | 样本来源仅限于神经胶质瘤患者,缺乏其他神经系统疾病的对照研究 | 探究SARS-CoV-2侵入中枢神经系统的机制及COVID-19导致的神经损伤 | 神经胶质瘤患者的组织样本和神经胶质瘤类器官 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 空间转录组分析,单细胞测序 | 类器官模型 | 组织样本,转录组数据 | 神经胶质瘤患者组织样本及衍生类器官 | NA | 空间转录组,单细胞测序 | NA | NA |
3208 | 2025-10-06 |
Unraveling molecular advancements in chordoma tumorigenesis and treatment response: a review of scientific discoveries and clinical implications
2024-05, Neurosurgical focus
IF:3.3Q1
DOI:10.3171/2024.2.FOCUS2417
PMID:38691860
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综述 | 本文系统回顾了脊索瘤分子发病机制的科学发现及其临床治疗意义 | 整合单细胞转录组分析、空间转录组学和游离DNA等新兴技术,揭示脊索瘤异质性分子通路 | NA | 总结脊索瘤分子发病机制的最新进展及其对神经外科治疗的增强作用 | 脊索瘤肿瘤发生机制与治疗反应 | 数字病理 | 脊索瘤 | 单细胞转录组分析, 空间转录组学, 游离DNA分析, 基因组学, 转录组学, 表观基因组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
3209 | 2025-10-06 |
Exploring the potential relationship between short sleep risks and cognitive function from the perspective of inflammatory biomarkers and cellular pathways: Insights from population-based and mice studies
2024-05, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14783
PMID:38797980
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研究论文 | 通过人群和动物研究探讨短睡眠风险与认知功能的关系及其炎症机制 | 结合人群流行病学数据与单细胞转录组学分析,揭示短睡眠通过炎症通路影响认知功能的细胞机制 | 观察性研究设计无法确定因果关系,小鼠模型结果向人类外推需谨慎 | 研究短睡眠对认知功能的影响及其分子机制 | 美国NHANES人群数据(2011-2014)和实验小鼠 | 生物医学研究 | 认知功能障碍 | 生物信息学分析, 单细胞转录组测序, GO和KEGG富集分析 | NA | 血液检测数据, 认知测试数据, 基因表达数据 | NHANES人群数据(2011-2014)和小鼠实验数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析 | NA | GSE137665单细胞转录组数据集 |
3210 | 2025-10-06 |
Circulating cancer-specific CD8 T cell frequency is associated with response to PD-1 blockade in Merkel cell carcinoma
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101412
PMID:38340723
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研究论文 | 本研究通过检测默克尔细胞癌患者血液中MCPyV特异性CD8 T细胞频率,发现其与PD-1抑制剂治疗反应密切相关 | 首次系统鉴定病毒驱动型癌症特异性T细胞,并揭示循环癌症特异性CD8 T细胞频率与免疫治疗疗效的强关联性 | 样本量有限(27例患者),且主要针对病毒相关默克尔细胞癌 | 探究癌症特异性T细胞在PD-1阻断治疗应答中的作用机制 | 默克尔细胞癌患者 | 癌症免疫学 | 默克尔细胞癌 | 多肽-HLA-I多聚体技术,26色流式细胞术,单细胞转录组测序,T细胞受体测序 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据,TCR序列数据 | 27例默克尔细胞癌患者 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
3211 | 2025-10-06 |
An alternative splicing signature defines the basal-like phenotype and predicts worse clinical outcome in pancreatic cancer
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101411
PMID:38325381
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研究论文 | 本研究发现了胰腺癌基底样亚型的特异性剪接特征及其与预后的关联 | 首次鉴定出QKI剪接因子作为基底样亚型决定因子,揭示了剪接调控在胰腺癌亚型分化中的新机制 | 未明确说明样本量大小和研究人群特征 | 探索剪接失调在胰腺癌亚型分化中的作用机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的分子亚型 | 分子生物学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
3212 | 2025-10-06 |
Surface CD52, CD84, and PTGER2 mark mature PMN-MDSCs from cancer patients and G-CSF-treated donors
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101380
PMID:38242120
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研究论文 | 本研究通过RNA测序技术识别了成熟PMN-MDSCs的特异性基因标记,并发现CD52、CD84和PTGER2可作为其潜在表面标志物 | 首次聚焦于成熟PMN-MDSCs的分子特征,发现了跨癌症类型和G-CSF处理供体的共享基因标记,并识别出三个新型表面标志物 | 研究样本来源包括癌症患者和G-CSF处理供体,但未明确样本规模及癌症类型的全面覆盖程度 | 精确分子表征循环多形核髓源性抑制细胞(PMN-MDSCs),特别是成熟亚群的特异性标志物 | 癌症患者和G-CSF处理的健康供体的成熟PMN-MDSCs及肿瘤相关中性粒细胞 | 免疫学 | 癌症 | RNA测序(RNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3213 | 2025-10-06 |
Lineage and ecology define liver tumor evolution in response to treatment
2024-02-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101394
PMID:38280378
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析构建了肝细胞癌在治疗过程中的谱系与生态演化模型 | 提出基于谱系与生态评分的联合动态分析框架,首次在单细胞水平揭示肝癌治疗响应的演化轨迹 | 研究样本量有限,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 建立监测肿瘤治疗响应演化的分析框架 | 肝细胞癌患者肿瘤样本 | 单细胞组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 谱系-生态评分系统 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 纵向肿瘤活检样本+716例肝癌患者验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3214 | 2025-10-06 |
Tobacco smoke exposure recruits inflammatory airspace monocytes that establish permissive lung niches for Mycobacterium tuberculosis
2023-12-06, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg3451
PMID:38055798
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术揭示了烟草烟雾暴露如何通过招募炎性单核细胞建立有利于结核分枝杆菌生长的肺部微环境 | 首次发现吸烟者肺部存在未成熟炎性单核细胞的富集,并鉴定CD93作为这些新招募单核细胞的标志物,阐明了CCR2信号通路在单核细胞招募中的作用机制 | 研究样本量有限,主要基于支气管肺泡灌洗细胞,未涵盖更广泛的肺部组织样本 | 探究吸烟如何促进肺部微环境对结核分枝杆菌生长的易感性 | 当前吸烟者和从不吸烟者的原发性支气管肺泡灌洗细胞 | 免疫学 | 结核病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术, 功能分析 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 当前吸烟者和从不吸烟者的支气管肺泡灌洗细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3215 | 2025-10-06 |
Exploring the comorbidity mechanisms of ITGB2 in rheumatoid arthritis and membranous nephropathy through integrated bioinformatics analysis
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2536730
PMID:40697036
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析探索ITGB2在类风湿关节炎和膜性肾病共病机制中的作用 | 首次通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据系统分析RA和MN的共病机制,发现ITGB2是关键的共享致病基因 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步的实验验证 | 探索类风湿关节炎和膜性肾病的共同发病机制 | 类风湿关节炎和膜性肾病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎, 膜性肾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | 随机森林算法, Monocle3, CellChat | 基因表达数据 | 从GEO和ImmPort数据库获取的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
3216 | 2025-10-06 |
Potential regulatory mechanism of overexpression of phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U on the glycolytic pathway in hepatocellular carcinoma
2025-Sep-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149603
PMID:40473062
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研究论文 | 本研究探讨PIGU在肝细胞癌糖酵解通路中的潜在分子调控机制 | 首次综合运用多组学数据和CRISPR筛选技术揭示PIGU通过调控糖酵解关键步骤促进肝癌发展的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索PIGU在肝细胞癌糖酵解通路中的分子调控机制 | 肝细胞癌组织样本和SMMC-7721、Huh7细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | CRISPR基因编辑, 免疫组化, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 细胞功能实验 | NA | RNA测序数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 实验数据 | 3773例HCC样本(RNA), 234例HCC样本(IHC和蛋白质组), 22861个HCC细胞(单细胞测序) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 微阵列, 蛋白质组学 | NA | NA |
3217 | 2025-10-06 |
Identification of inflammation-related biomarkers and therapeutic targets for neurogenic bladder fibrosis via multi-omics analysis
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110721
PMID:40618693
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研究论文 | 通过多组学分析识别神经源性膀胱纤维化的炎症相关生物标志物和治疗靶点 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,结合机器学习方法鉴定出HIF-1α等四个诊断标志物,并发现MEK抑制剂PD-0325901的治疗潜力 | 研究样本量有限,主要基于动物模型,临床验证需要进一步扩大 | 识别神经源性膀胱纤维化的诊断生物标志物并探索潜在治疗药物 | 神经源性膀胱纤维化大鼠模型和患者膀胱组织 | 生物信息学 | 神经源性膀胱疾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习,分子对接 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
3218 | 2025-10-06 |
Leveraging machine learning and single-cell RNA sequencing strategies to develop a risk prognosis scoring based on liquid-liquid phase separation feature genes in pediatric hepatoblastoma
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110685
PMID:40618698
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研究论文 | 本研究整合机器学习与单细胞RNA测序技术,基于液-液相分离特征基因开发了儿童肝母细胞瘤风险预后评分系统 | 首次系统分析液-液相分离在肝母细胞瘤中的作用,并建立了首个基于液-液相分离的肝母细胞瘤预后预测模型 | 研究依赖于公共数据库的RNA测序数据,需要进一步实验验证 | 开发基于液-液相分离特征基因的肝母细胞瘤风险预后评分系统 | 儿童肝母细胞瘤患者 | 机器学习 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 机器学习算法 | 随机森林, SVM-RFE, Lasso回归 | RNA测序数据 | 多个GEO数据集(GSE133039, GSE75271, GSE81928, GSE132037, GSE186975) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
3219 | 2025-10-06 |
PANoptosis-driven molecular stratification in esophageal squamous cell carcinoma: A multi-omics prognostic model and FGFR-Targeted therapeutic validation
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110688
PMID:40628169
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研究论文 | 本研究基于PANoptosis构建了食管鳞状细胞癌的多组学预后模型,并验证了FGFR靶向治疗的疗效 | 首次基于PANoptosis构建ESCC预后模型,发现FGFR抑制剂可通过抑制EMT和调控MYC/E2F通路发挥治疗作用 | 模型验证队列有限,需要更多前瞻性研究验证临床适用性 | 阐明PANoptosis在ESCC预后和治疗中的作用机制 | 食管鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 单变量Cox回归, LASSO Cox回归, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | 预后风险模型 | 多组学数据, 微阵列数据, RNA-seq数据 | 多个队列的ESCC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
3220 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional landscape of peripheral myeloid cells in autoimmune diseases
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113026
PMID:40703454
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析自身免疫疾病中外周髓系细胞的转录景观 | 首次在14种自身免疫疾病中对351,905个髓系细胞进行大规模单细胞转录组分析,识别出13个具有独特免疫特征的髓系细胞亚群 | 研究主要关注外周髓系细胞,未涉及组织驻留髓系细胞或其他免疫细胞类型 | 揭示自身免疫疾病中髓系细胞的异质性和功能状态 | 375个单细胞RNA测序样本中的351,905个外周髓系细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序,伪时间分析,全基因组关联研究 | NA | 单细胞转录组数据,遗传数据 | 351,905个髓系细胞,来自375个样本,覆盖14种自身免疫疾病 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |