单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32055 篇文献，本页显示第 32021 - 32040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 32021 | 2024-08-09 |
Single cell analysis of lymph node tissue from HIV-1 infected patients reveals that the majority of CD4+ T-cells contain one HIV-1 DNA molecule
2013, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1003432
PMID:23818847
|
研究论文 | 本研究使用单细胞测序技术分析了来自HIV-1感染患者的淋巴结组织中的单个HIV-1 DNA分子，发现大多数CD4+ T细胞仅含有一个HIV-1 DNA分子。 | 本研究首次详细分析了感染细胞中前病毒的数量及其遗传关系，揭示了HIV-1重组、遗传多样性和感染动态的机制。 | 研究样本仅来自五名未经治疗的慢性感染患者，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨HIV-1重组、遗传多样性和感染动态的机制。 | 来自HIV-1感染患者的淋巴结组织和外周血中的CD4+ T细胞。 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞测序 | NA | DNA | 五名未经治疗的慢性HIV-1感染患者 | NA | NA | NA | NA |
| 32022 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics for drug target discovery
2013-Oct, Current opinion in pharmacology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.coph.2013.04.011
PMID:23725882
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组测序技术在药物靶点发现中的应用 | 介绍了新的样本制备技术、测序平台和生物信息学工具，提高了数据的数量和质量 | 单细胞测序技术仍处于相对初级阶段 | 探索单细胞测序技术在识别新药物靶点中的应用 | 单细胞转录组测序技术及其在药物靶点发现中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 32023 | 2024-08-09 |
Investigating evolutionary perspective of carcinogenesis with single-cell transcriptome analysis
2013-Dec, Chinese journal of cancer
DOI:10.5732/cjc.012.10291
PMID:23706768
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研究论文 | 本文开发了相变微流控装置用于大量单细胞的分子谱分析，并探讨了单细胞转录组分析技术在从进化角度研究白血病中耐药性发展中的应用。 | 本文采用单细胞技术克服了传统细胞裂解物中基因表达测量的细胞异质性问题，能够获取大量单细胞转录组数据，从而从进化角度研究癌症发生。 | NA | 研究癌症发生的进化视角以及白血病中耐药性的发展。 | 单细胞转录组数据及其在癌症治疗中的应用。 | 数字病理学 | 白血病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 大量单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 32024 | 2024-08-09 |
Rapid bacterial genome sequencing: methods and applications in clinical microbiology
2013-Sep, Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
IF:10.9Q1
DOI:10.1111/1469-0691.12217
PMID:23601179
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综述 | 本文综述了高通量测序技术在临床微生物学中的应用及其革命性影响 | 高通量测序技术降低了测序成本并缩短了结果时间，使其在研究和诊断中更具吸引力 | NA | 探讨高通量测序技术如何革新临床微生物学及其未来潜力 | 包括目标DNA序列和抗原的快速鉴定、流行病学分型和病原体监测、以及抗生素抗性和毒力因子的研究 | NA | NA | 高通量测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32025 | 2024-08-09 |
Quartz-Seq: a highly reproducible and sensitive single-cell RNA sequencing method, reveals non-genetic gene-expression heterogeneity
2013-Apr-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/gb-2013-14-4-r31
PMID:23594475
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为Quartz-Seq的新型单细胞RNA测序方法，该方法具有更简单的实验流程和更高的重复性和灵敏度 | Quartz-Seq方法比现有方法更简单，重复性和灵敏度更高，能够定量检测各种非遗传细胞异质性 | NA | 开发一种高度可重复且敏感的单细胞RNA测序方法，以促进对非遗传细胞异质性的生物学角色和潜在机制的理解 | 单细胞RNA测序方法的开发及其在检测非遗传细胞异质性中的应用 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 32026 | 2024-08-09 |
Nearly finished genomes produced using gel microdroplet culturing reveal substantial intraspecies genomic diversity within the human microbiome
2013-May, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.142208.112
PMID:23493677
|
研究论文 | 本文通过凝胶微滴培养技术揭示了人类微生物组中物种内基因组多样性 | 使用凝胶微滴培养技术减少了MDA反应中的偏差，并显著提高了基因组测序和组装的准确性 | MDA技术从单个染色体拷贝中存在放大偏差和大量特异性损失的问题 | 探索微生物基因组多样性，并改进基因组测序技术 | 人类口腔和粪便微生物组样本中的两种细菌物种 | NA | NA | 多重置换扩增(MDA) | NA | 基因组数据 | 数百至数千个遗传上相同的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 32027 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing in its prime
2013-Mar, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.2523
PMID:23471069
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32028 | 2024-08-09 |
Inferring the kinetics of stochastic gene expression from single-cell RNA-sequencing data
2013-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/gb-2013-14-1-r7
PMID:23360624
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research paper | 本文开发了一种统计框架，用于从单细胞RNA测序数据中研究随机基因表达的动力学 | 提出了一个新的统计模型，能够从单细胞RNA测序数据中推断基因表达的动力学参数，并发现组蛋白修饰对转录爆发的影响 | NA | 研究基因表达的动力学特性 | 单细胞RNA测序数据 | digital pathology | NA | RNA-seq | 统计模型 | 数据 | 小鼠胚胎干细胞的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 32029 | 2024-08-09 |
High-throughput sequencing for biology and medicine
2013, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/msb.2012.61
PMID:23340846
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综述 | 本文综述了高通量测序技术在生物学和医学领域的广泛应用及其带来的新见解 | 介绍了高通量测序技术在转录组动态、基因组结构和基因组变异分析方面的创新方法 | 讨论了高通量测序在生物学和健康领域未来可能面临的障碍 | 探讨高通量测序技术在生物学和医学领域的新应用及其对复杂生物系统的洞察 | 涉及转录组、基因组结构、基因组变异、单细胞测序等多个生物学和医学研究对象 | 基因组学 | NA | 高通量测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32030 | 2024-08-09 |
BayesHammer: Bayesian clustering for error correction in single-cell sequencing
2013, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/1471-2164-14-S1-S7
PMID:23368723
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于汉明图和贝叶斯子聚类的新型错误校正工具BAYESHAMMER，用于单细胞测序中的错误校正 | 引入了基于汉明图和贝叶斯子聚类的新算法，这些算法在单细胞测序项目中表现出色，并且比现有的多细胞测序错误校正工具更快 | NA | 开发一种适用于单细胞测序的错误校正工具，并验证其在多细胞测序数据中的性能 | 单细胞测序数据和多细胞测序数据的错误校正 | 测序技术 | NA | 单细胞测序 | 贝叶斯聚类 | 测序读取数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32031 | 2024-08-09 |
Molecular characterization of heterogeneous mesenchymal stem cells with single-cell transcriptomes
2013 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2012.12.003
PMID:23266308
|
综述 | 本文综述了间充质干细胞（MSC）的潜在治疗应用，并讨论了使用单细胞转录组分析对异质细胞群进行分子表征的系统方法 | 提出了一种基于单细胞转录组分析的系统方法，用于在没有已知生物标志物的情况下对异质细胞群进行分子表征 | NA | 探讨间充质干细胞的分子表征及其在再生医学中的治疗应用 | 间充质干细胞及其在不同临床情况下的治疗价值 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32032 | 2024-08-09 |
Genome-wide detection of single-nucleotide and copy-number variations of a single human cell
2012-Dec-21, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1229164
PMID:23258894
|
研究论文 | 本文报道了一种新的扩增方法——多次退火和循环扩增环（MALBAC），用于单细胞全基因组测序，实现了高均匀性的基因组覆盖 | 提出了MALBAC扩增方法，提高了单细胞全基因组测序的覆盖率和均匀性 | NA | 开发和验证一种新的单细胞全基因组扩增方法，用于检测单细胞中的单核苷酸变异和拷贝数变异 | 单个人类细胞的基因组 | 基因组学 | 癌症 | MALBAC | NA | DNA | 三个相关细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 32033 | 2024-08-09 |
Cancer genome sequencing: understanding malignancy as a disease of the genome, its conformation, and its evolution
2013-Nov-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2012.10.018
PMID:23111104
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研究论文 | 本文探讨了癌症基因组测序技术的发展及其在理解癌症基因组结构和进化中的应用 | 介绍了高通量测序技术在癌症基因组和转录组变异分析中的新化学和计算技术，以及单细胞测序在研究肿瘤进化中的潜力 | NA | 研究癌症基因组测序技术，以更好地理解癌症作为基因组、其结构和进化的疾病 | 癌症基因组及其结构和进化 | 数字病理学 | NA | 高通量测序 | NA | 基因组数据 | 涉及多种恶性肿瘤 | NA | NA | NA | NA |
| 32034 | 2024-08-09 |
CEL-Seq: single-cell RNA-Seq by multiplexed linear amplification
2012-Sep-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2012.08.003
PMID:22939981
|
research paper | 本文介绍了一种名为CEL-Seq的单细胞RNA测序方法，通过条形码和样本池化，使用体外转录进行线性扩增，以克服RNA起始量小的限制。 | CEL-Seq方法比基于PCR的扩增方法提供更可重复、线性和敏感的结果。 | NA | 开发一种高效的单细胞RNA测序方法，以实现对复杂组织中多样细胞群体的转录组分析。 | C. elegans早期胚胎发育的单细胞分辨率研究。 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | text | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32035 | 2024-08-09 |
Genomic sequencing of uncultured microorganisms from single cells
2012-Sep, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/nrmicro2857
PMID:22890147
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综述 | 本文综述了单细胞基因组测序技术的发展及其在微生物研究中的应用 | 单细胞测序技术使得无需培养方法即可直接从环境样本或临床标本中测序细菌物种，且近期技术改进常能从这些难以接触的物种中近乎完整地组装基因组 | NA | 探讨单细胞测序技术的发展及其在微生物研究中的应用 | 微生物基因组 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA | 单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 32036 | 2024-08-09 |
An automated microfluidic device for assessment of mammalian cell genetic stability
2012-Oct-21, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/c2lc40437k
PMID:22814625
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研究论文 | 本文报道了一种集成微流控方法，用于快速测量单个细胞中的基因表达，以评估细胞群体的遗传稳定性 | 开发了一种集成系统，具有单独的控制器，用于有效的单细胞转录组分析，能够高回收率地将单个细胞操纵到纳升反应器中 | NA | 解决现有微流控平台无法有效处理单细胞进行常规分子分析的问题 | 单细胞转录组分析，遗传稳定性评估 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | 基因表达数据 | 大量HeLa细胞和293T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 32037 | 2024-08-09 |
Metagenome, metatranscriptome and single-cell sequencing reveal microbial response to Deepwater Horizon oil spill
2012-Sep, The ISME journal
DOI:10.1038/ismej.2012.59
PMID:22717885
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研究论文 | 本研究通过宏基因组、宏转录组和单细胞测序技术，揭示了深水地平线石油泄漏事件中微生物群落对石油的响应 | 首次揭示了Oceanospirillales在石油降解中的功能角色，并通过单细胞测序技术阐明了其降解环己烷的完整途径 | 研究主要集中在石油泄漏初期的微生物响应，未涉及长期生态影响 | 确定Oceanospirillales和其他本地微生物群落成员在石油泄漏中的功能角色 | 深水地平线石油泄漏事件中的微生物群落 | 宏基因组学 | NA | 宏基因组测序、宏转录组测序、单细胞测序 | NA | DNA、RNA | 涉及石油泄漏区域的样本和未受污染的海水样本 | NA | NA | NA | NA |
| 32038 | 2024-08-09 |
The biology of genomes. Single-cell sequencing tackles basic and biomedical questions
2012-May-25, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.336.6084.976
PMID:22628633
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32039 | 2024-08-09 |
IDBA-UD: a de novo assembler for single-cell and metagenomic sequencing data with highly uneven depth
2012-Jun-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bts174
PMID:22495754
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研究论文 | 介绍了一种基于de Bruijn图方法的IDBA-UD算法，用于组装来自单细胞测序或宏基因组测序技术的不均匀测序深度的读取数据 | 采用了多种非平凡技术来解决不均匀测序深度的问题，包括使用多个深度相关阈值来去除错误k-mer，以及使用配对端信息的局部组装技术来解决低深度短重复区域的分支问题 | NA | 开发一种能够处理不均匀测序深度的基因组组装算法 | 单细胞测序和宏基因组测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞测序，宏基因组测序 | de Bruijn图 | 测序读取数据 | 不同数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 32040 | 2024-08-09 |
SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing
2012-May, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2012.0021
PMID:22506599
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的基因组装算法SPAdes，并展示了其在单细胞测序中的应用 | SPAdes算法在单细胞和标准（多细胞）组装中均表现优异，超过了E+V-SC和流行的Velvet及SoapDeNovo组装器 | NA | 旨在通过单细胞基因组学补充基于基因的元基因组数据，提供无法培养的生物的完整基因组信息 | 无法在实验室中克隆的细菌基因组 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |