单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38047 篇文献,本页显示第 3181 - 3200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
3181 2026-02-20
Patient-derived organoid biobank identifies epigenetic dysregulation of intestinal epithelial MHC-I as a novel mechanism in severe Crohn's Disease
2024-Aug-08, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究通过构建患者来源的肠道上皮类器官生物库,揭示了克罗恩病中肠道上皮MHC-I表观遗传失调的新机制 首次在克罗恩病中鉴定出肠道上皮MHC-I的表观遗传调控机制,并开发了基于机器学习的疾病预后表观遗传分子标志物 研究样本量相对有限(168名患者),且主要基于类器官模型,需进一步在人体内验证 探究肠道上皮DNA甲基化在克罗恩病发病机制中的作用 克罗恩病、溃疡性结肠炎患者及健康对照的肠道黏膜活检样本 表观遗传学 克罗恩病 DNA甲基化分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、基因编辑、类器官-淋巴细胞共培养、小鼠模型 机器学习 表观遗传数据、转录组数据 168名患者(72名克罗恩病、23名溃疡性结肠炎、73名健康对照),共生成312个肠道上皮类器官 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
3182 2026-02-20
Perivascular cells induce microglial phagocytic states and synaptic engulfment via SPP1 in mouse models of Alzheimer's disease
2023-03, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 本研究揭示了在阿尔茨海默病小鼠模型中,血管周围细胞通过分泌SPP1诱导小胶质细胞的吞噬状态并促进突触吞噬的机制 首次发现血管周围细胞分泌的SPP1是驱动小胶质细胞异常吞噬突触的关键信号分子,并阐明了其在AD病理中的作用机制 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类AD患者中得到验证 探究阿尔茨海默病中驱动小胶质细胞异常吞噬突触的分子信号 阿尔茨海默病小鼠模型中的血管周围细胞、小胶质细胞和突触 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序、细胞间相互作用分析 小鼠疾病模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3183 2026-02-20
LIM-Nebulette Reinforces Podocyte Structural Integrity by Linking Actin and Vimentin Filaments
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 LIM-nebulette通过连接肌动蛋白和波形蛋白丝来增强足细胞结构完整性 揭示了LIM-nebulette在足细胞中作为多功能细胞骨架蛋白的新作用,通过主动重组黏着斑、肌动蛋白细胞骨架和中间丝来维持结构完整性 NA 研究足细胞结构完整性的细胞骨架机制 大鼠、小鼠和人类的足细胞 数字病理学 肾脏疾病 单细胞RNA测序、免疫金标记、高内涵成像、超分辨率显微镜、原子力显微镜、活细胞钙成像 NA 图像、文本、视频 大鼠、小鼠和人类细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
3184 2026-02-20
Integrative analyses of single-cell transcriptome and regulome using MAESTRO
2020-08-07, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 本文介绍了MAESTRO,一个用于整合分析单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据的开源计算工作流程 通过建模单细胞水平的染色质可及性来预测基因调控潜力,在整合scRNA-seq和scATAC-seq细胞聚类方面优于现有方法 NA 开发一个综合性的计算工作流程,用于整合分析来自多个平台的单细胞转录组和调控组数据 单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据 生物信息学 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA 基因表达数据, 染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
3185 2026-02-19
Targeting perilipin 5 ameliorates diabetic cardiomyopathy via regulating glycolysis and mitochondrial dynamics
2026-Mar-11, Clinical science (London, England : 1979)
研究论文 本研究探讨了脂滴相关蛋白perilipin 5在高糖条件下如何调节糖酵解、细胞凋亡和线粒体功能,并评估其在糖尿病心肌病中的治疗潜力 首次系统揭示了Plin5在糖尿病心肌病中调节糖酵解和细胞凋亡的双重作用,并利用单细胞RNA测序技术明确了其在心肌细胞中的特异性表达 研究主要基于细胞和小鼠模型,尚未在人体中进行验证;高糖条件下对成纤维细胞的作用机制仍需进一步阐明 探究Plin5在糖尿病心肌病发病机制中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 AC16人心肌细胞、人心脏成纤维细胞、野生型和Plin5敲除小鼠 分子生物学与心血管疾病研究 糖尿病心肌病 单细胞RNA测序、分子生物学技术、心脏超声、免疫染色 NA 基因表达数据、影像数据、蛋白质检测数据 细胞系(AC16和HCFs)及小鼠模型(野生型和Plin5敲除型) NA 单细胞RNA测序 NA NA
3186 2026-02-19
Mendelian randomization analysis identifies HLA-A and AP2M1 as genetic biomarkers linked to immune-endocytic crosstalk in intervertebral disc degeneration
2026-Mar, Journal of cell communication and signaling IF:3.6Q3
研究论文 本研究通过整合转录组数据、单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,系统研究了与椎间盘退变相关的内吞作用相关基因,并确定了HLA-A和AP2M1作为潜在的生物标志物 首次通过整合孟德尔随机化分析、单细胞测序和功能实验,系统性地揭示了HLA-A和AP2M1在椎间盘退变中连接免疫失调与内吞功能障碍的作用 NA 探究内吞作用在椎间盘退变发病机制中的作用,并识别相关的遗传生物标志物 椎间盘退变 生物信息学 椎间盘退变 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 差异表达分析, 功能富集分析, 免疫浸润分析 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
3187 2026-02-19
Soluble urokinase plasminogen activator receptor is a prognostic biomarker in decompensated cirrhosis
2026-Mar, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1
研究论文 本研究评估了可溶性尿激酶纤溶酶原激活物受体(suPAR)作为失代偿性肝硬化预后生物标志物的潜力 首次在独立队列中验证suPAR水平≥14.0 ng/ml可独立预测失代偿性肝硬化患者的90天死亡率,并通过单细胞RNA测序揭示了HBV相关肝硬化中免疫细胞PLAUR表达的增加 需要进一步研究阐明表达uPAR的细胞在疾病进展中的具体作用机制 评估suPAR作为慢性肝病预后标志物的临床价值及其在疾病进展中的作用 健康对照者、肝硬化患者、急性失代偿患者和慢加急性肝衰竭患者,以及小鼠模型 NA 肝硬化 单细胞RNA测序 NA 临床数据、实验室检测数据、单细胞RNA测序数据 推导队列178例,验证队列197例,加上小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3188 2026-02-19
Direct detection of rare circulating tumor cells in peripheral blood mononuclear cells by scRNA seq: Spike-in strategy based feasibility study
2026-Mar, The journal of liquid biopsy
研究论文 本研究评估了基于计算spike-in框架的单细胞RNA测序在检测外周血中罕见循环肿瘤细胞中的可行性和性能 提出了一种计算spike-in策略来评估scRNA-seq检测罕见CTC的敏感性和特异性,避免了传统富集方法的选择偏差 研究基于模拟数据,未在真实临床样本中验证,且仅针对宫颈癌细胞,可能不适用于其他肿瘤类型 评估scRNA-seq在检测外周血中罕见循环肿瘤细胞的可行性和准确性 外周血单核细胞和宫颈癌细胞 单细胞测序 宫颈癌 单细胞RNA测序 k-means聚类 单细胞转录组数据 三个PBMC数据集(共约49,000个细胞)和宫颈癌细胞数据集 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium Cell Ranger分析流程
3189 2026-02-19
ISL1 Restricts Progenitor Programs and Promotes β-Cell Maturation, Revealing Sex Differences in Diabetes Progression
2026-Feb-17, Diabetes IF:6.2Q1
研究论文 本研究揭示了转录因子ISL1在胰腺内分泌细胞命运决定和成熟中的关键作用,及其缺失如何导致糖尿病相关缺陷 首次通过单细胞多组学分析揭示了ISL1在抑制祖细胞程序、促进β细胞成熟中的分子机制,并发现了糖尿病进展中的性别差异 研究主要基于小鼠模型,人类胰岛中的验证尚需进一步研究 阐明ISL1转录因子在胰腺内分泌细胞发育和成熟中的分子功能 小鼠胰腺内分泌前体细胞和成熟胰岛细胞 发育生物学 糖尿病 条件性基因敲除、单细胞RNA测序、染色质分析(H3K27ac和H3K27me3) Isl1条件性敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、表观基因组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq、染色质分析 NA NA
3190 2026-02-19
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Impaired CHIP-Mediated Heat Stress Response in SCA3 Pathogenesis
2026-Feb-17, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CHIP介导的热应激反应在SCA3发病机制中的受损作用 首次利用单细胞RNA测序技术系统分析SCA3小鼠小脑的细胞应激反应失调,并发现CHIP-HSF1/DNAJB1轴在疾病进展中的关键作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;CHIP过表达的长期治疗效果和安全性尚未明确 阐明SCA3进展的关键病理生理级联反应并确定潜在治疗靶点 SCA3细胞模型和转基因小鼠 数字病理学 神经系统疾病 单细胞RNA测序,原生凝胶电泳 NA 单细胞转录组数据 SCA3转基因小鼠的小脑组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3191 2026-02-19
ERBB2 as a Prognostic Biomarker in Prostate Cancer: Integration of Single-Cell Transcriptomics, Deep Learning, and Immunohistochemical Validation
2026-Feb-17, Biochemical genetics IF:2.1Q3
研究论文 本研究整合单细胞转录组学、深度学习和免疫组化验证,揭示了ERBB2作为前列腺癌生化复发关键预后生物标志物的作用 首次整合单细胞转录组测序、深度学习模型构建和免疫组化验证三种方法,系统性地识别并验证了ERBB2在前列腺癌预后中的关键作用 未在摘要中明确说明研究的局限性,例如样本队列的规模、单细胞数据的来源或深度学习模型的可解释性等 识别与前列腺癌生化复发相关的关键基因,并验证其临床意义 前列腺癌患者,特别是与生化复发、T细胞耗竭和转移相关基因相关的患者 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序,免疫组织化学,深度学习 深度学习神经网络模型 单细胞转录组数据,临床病理数据,免疫组化图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3192 2026-02-19
PGST: A prototype-guided parameter-efficient network for spatial transcriptomics prediction
2026-Feb-17, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 本文提出了一种用于空间转录组学基因表达预测的原型引导参数高效网络PGST 提出了PEST极性嵌入策略处理空间特异性,采用原型引导聚合保留全局共表达特征,通过共享解码器与重构损失增强全局一致性,并设计了轻量级架构 NA 解决现有空间转录组学基因表达预测方法在空间特异性建模、跨域共表达模式利用、噪声鲁棒性和参数效率方面的不足 空间转录组学数据 数字病理学 NA 空间转录组学 图神经网络, 对比学习 基因表达数据, 空间位置信息 NA NA 空间转录组学 NA NA
3193 2026-02-19
STCF: Multi-View Clustering for Spatial Transcriptomics Based on Cross-View Fusion
2026-Feb-17, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence IF:20.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为STCF的空间转录组学多视图聚类框架,通过交叉视图融合策略整合高变基因和低变基因,以提升空间域识别的精度 STCF首次将高变基因和低变基因作为两个独立的基因表达视图,并采用即插即用的交叉视图融合策略,通过反向缩放余弦误差损失平衡基因嵌入的对齐与分离,从而增强对细粒度空间结构的解析能力 未在摘要中明确提及 开发一种能够整合不同全局变异性基因信息以改进空间转录组学聚类的方法 空间转录组学数据中的基因表达模式 空间转录组学 NA 空间转录组学 多视图聚类框架 空间转录组学数据 三个基准数据集(DLPFC、HBC、MBA),具体样本数量未在摘要中提供 NA 空间转录组学 NA NA
3194 2026-02-19
A CD57+ CD8 T cell subset links cytotoxic T cell cytotoxicity to fibrotic lung disease in systemic sclerosis
2026-Feb-17, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过分析系统性硬化症相关间质性肺病患者的血液和肺组织样本,鉴定了一个扩增的CD57+ CD8 T细胞亚群,并揭示了其通过CD155-CD226通路增强细胞毒性,可能驱动肺纤维化损伤 首次在SSc-ILD患者中鉴定出CD57+ CD8 T细胞亚群的扩增,并阐明其通过CD155-CD226共刺激通路增强细胞毒性功能,连接了免疫细胞与肺纤维化疾病 研究主要基于观察性数据和公共数据集分析,缺乏直接的体内功能验证实验来证实该T细胞亚群在肺损伤中的因果作用 探究系统性硬化症相关间质性肺病的免疫病理机制,特别是T细胞在肺损伤中的作用 系统性硬化症伴或不伴间质性肺病患者的血液T细胞、肺组织样本以及公共单细胞RNA测序数据集 数字病理学 系统性硬化症相关间质性肺病 免疫染色、单细胞RNA测序 NA 血液样本、肺组织样本、单细胞RNA测序数据 SSc-ILD患者、SSc无ILD患者及对照组的血液样本,以及独立SSc-ILD患者的肺活检或移植组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3195 2026-02-19
Deubiquitinase USP2 promotes hepatic stellate cell activation via p300 stabilization
2026-Feb-17, FEBS letters IF:3.0Q3
研究论文 本研究通过去泛素化酶抑制剂筛选和单细胞RNA测序,发现USP2通过稳定p300蛋白促进肝星状细胞活化,从而驱动肝纤维化 首次鉴定出USP2是p300的去泛素化酶,并揭示了其在肝纤维化中调控肝星状细胞活化的新机制 研究主要基于体外细胞实验和单细胞测序分析,体内功能验证和临床转化潜力需进一步探索 探究肝纤维化过程中肝星状细胞活化的上游调控机制 肝星状细胞、p300蛋白、USP2去泛素化酶 分子生物学 肝纤维化 单细胞RNA测序、去泛素化酶抑制剂筛选 NA 单细胞转录组数据 纤维化人肝组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3196 2026-02-19
NK Cell Activation by Platinum Boosts Immunotherapy in HR+/HER2- Breast Cancer
2026-Feb-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过多组学和单细胞RNA测序揭示了NK细胞在HR+/HER2-乳腺癌中对免疫治疗反应的关键作用,并发现铂类药物可通过增强NK细胞活性来提升免疫治疗效果 首次在HR+/HER2-乳腺癌中系统阐明NK细胞介导免疫治疗反应的机制,并发现铂类药物通过NF-κB通路增强NK细胞毒性的新协同作用 临床队列分析样本量未明确说明,铂类药物增强NK细胞活性的具体分子机制仍需进一步验证 探究HR+/HER2-乳腺癌中免疫治疗应答机制及铂类药物的协同增效作用 HR+/HER2-乳腺癌肿瘤微环境、NK细胞、铂类药物 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多组学分析、药物筛选 NA 单细胞转录组数据、临床队列数据 未明确说明(包含临床队列、细胞系和患者来源肿瘤) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3197 2026-02-19
Single-cell profiling reveals FAM117A as a key regulator linking macrophage-epithelial crosstalk with the progression of lung adenocarcinoma
2026-Feb-15, Experimental hematology & oncology IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了FAM117A作为连接巨噬细胞-上皮细胞串扰与肺腺癌进展的关键调节因子 首次识别出FAM117A作为SPP1+巨噬细胞与基底上皮细胞通信模块的主要抑制因子,并揭示其通过调控细胞周期和免疫微环境影响肿瘤进展 研究主要基于单细胞转录组数据,需要进一步实验验证FAM117A的具体作用机制 探究肺腺癌肿瘤微环境中巨噬细胞与上皮细胞间的通信网络及其对肿瘤进展的影响 肺腺癌组织中的巨噬细胞和上皮细胞 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 转录组建模 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
3198 2026-02-16
Correction to: Comprehensive analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals the non-cardiomyocytes heterogeneity and novel cell populations in dilated cardiomyopathy
2026-Feb-14, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
3199 2026-02-19
Mendelian randomization followed by single-cell RNA sequencing exploration identifies effector memory CD4+ T cells as a risk factor for myasthenia gravis
2026-Feb-13, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序,识别出效应记忆CD4+ T细胞是晚发型重症肌无力的风险因素 首次将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序数据整合,系统性地探索了免疫细胞亚群在重症肌无力发病机制中的作用,并识别出效应记忆CD4+ T细胞的关键角色 研究依赖于现有的单细胞RNA测序数据集,样本量可能有限;功能机制推测需要进一步的实验验证 探究不同免疫细胞亚群在重症肌无力发病机制中的贡献,特别是区分早发型和晚发型疾病 重症肌无力患者,特别是早发型和晚发型患者的外周血免疫细胞 生物信息学 重症肌无力 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 NA 基因组数据,单细胞转录组数据 涉及731个外周免疫表型的孟德尔随机化分析,以及来自重症肌无力患者外周血的现有单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
3200 2026-02-19
Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily B member 1 expression defines CD8+ T cell exhaustion in acute myeloid leukemia
2026-Feb-09, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量转录组数据和机器学习算法,揭示了急性髓系白血病中CD8+ T细胞耗竭的关键机制,并识别了LILRB1作为核心免疫抑制枢纽 首次将LILRB1鉴定为AML中CD8+ T细胞和NK细胞耗竭的中央免疫检查点,并构建了一个稳定的九基因预后特征模型 样本量相对较小(20名AML患者和20名健康供者),且主要依赖生物信息学分析,实验验证部分有限 阐明急性髓系白血病中免疫细胞毒性受损的机制,并探索预后生物标志物和治疗靶点 急性髓系白血病患者的免疫细胞,特别是CD8+ T细胞和NK细胞 生物信息学与机器学习 急性髓系白血病 单细胞RNA测序、批量RNA测序、RT-qPCR、多色流式细胞术 岭回归等多种机器学习算法 单细胞转录组数据、批量转录组数据、临床数据 20名AML患者和20名健康供者的样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
回到顶部