单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3181 - 3200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3181 | 2025-10-06 |
EVscope: A Comprehensive Bioinformatics Pipeline for Accurate and Robust Analysis of Total RNA Sequencing from Extracellular Vesicles
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660984
PMID:40666973
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研究论文 | 开发了一个专门用于细胞外囊泡RNA测序数据分析的生物信息学流程EVscope | 采用优化的全基因组期望最大化算法，显著提高多映射读段分配精度，并首次生成基于EM的BigWig文件用于下游分析 | NA | 解决细胞外囊泡RNA测序数据分析中的技术挑战，提供标准化计算工作流程 | 细胞外囊泡RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 总RNA测序 | NA | NA |
| 3182 | 2025-10-06 |
Spatial Proofreading Amplification of in situ Transcript and Protein Signals
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.11.659176
PMID:40661487
|
研究论文 | 本文提出了一种受动力学校对原理启发的无酶信号放大方法，用于增强空间转录组学中的原位转录本和蛋白质信号 | 首次将动力学校对原理应用于信号放大，通过短寡核苷酸探针在靶位点的迭代沉积和光交联形成高度稳定的DNA组装体 | NA | 开发更明亮的信号放大方法以提高空间转录组学实验的检测效率和缩短成像时间 | 原位转录本和蛋白质信号 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，信号放大技术 | NA | 图像信号 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3183 | 2025-10-06 |
Uncovering Heterogeneous Effects via Localized Feature Selection
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.03.657761
PMID:40661389
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研究论文 | 提出一种利用局部化特征选择方法识别疾病相关特征的创新框架 | 开发了基于局部化检验统计量的特征选择框架，能够针对个体特征识别疾病相关特征，并利用knockoffs方法控制选择集的噪声水平 | 未明确说明方法在更大规模数据集上的可扩展性和计算效率 | 开发能够识别个体层面异质性的疾病相关特征选择方法 | 阿尔茨海默病的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 局部化特征选择框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3184 | 2025-10-06 |
Genetic and genomic insights into male reproductive tract development
2025-Jun, Fertility and sterility
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.fertnstert.2025.03.024
PMID:40174856
|
综述 | 通过遗传和基因组学方法探讨男性生殖道发育机制的研究综述 | 整合单细胞测序数据构建发育图谱，首次系统识别269个MRT相关基因及其在关键发育阶段的表达模式 | 人类与小鼠模型表型术语存在差异，知识体系需要进一步统一 | 解析男性生殖道发育的遗传基础及其与成年疾病的关系 | 男性生殖道发育相关基因与细胞类型 | 基因组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间分子测量 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 人类表型本体35个术语对应269个基因，含小鼠对比数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3185 | 2025-10-06 |
Immune cell type divergence in a basal chordate
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.20.655184
PMID:40661343
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术定义了基础脊索动物血细胞状态的身份 | 首次在基础脊索动物中发现循环血液中存在至少八种主要形态类型的分化层次结构 | 无脊椎动物免疫细胞的分子特征研究有限，与脊椎动物免疫细胞类型的同源性仍不明确 | 研究基础脊索动物免疫细胞类型的分化与进化 | 基础脊索动物的血细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,原位杂交,活体报告基因 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3186 | 2025-10-06 |
A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and innovations
2025-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序技术的应用与创新，重点关注胰岛细胞研究 | 全面总结了scRNA-seq在理解细胞类型、基因活性和细胞相互作用方面的最新进展 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要基于现有文献分析 | 系统评估单细胞RNA测序技术的应用、创新和挑战 | 胰岛细胞及复杂组织中的细胞多样性 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3187 | 2025-10-06 |
Graph neural networks for single-cell omics data: a review of approaches and applications
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf109
PMID:40091193
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综述 | 系统回顾图神经网络在单细胞组学数据分析中的应用方法和研究成果 | 首次系统综述了107个图神经网络及其六种变体在单细胞组学中的成功应用，并总结了77个常用公开数据集 | 当前研究存在潜在不足，未来需要进一步探索改进方向 | 探讨图神经网络在单细胞组学数据分析中的应用现状和发展前景 | 单细胞组学数据及其分析任务 | 机器学习 | NA | 单细胞测序技术 | 图神经网络(GNN)及其六种变体 | 单细胞组学数据 | 77个公开数据集 | NA | 单细胞表观基因组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 蛋白质组学, 多组学 | NA | NA |
| 3188 | 2025-10-06 |
Retinoic acid antagonizes estrogen signaling to maintain adult uterine cell fate
2025-Feb-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416089122
PMID:39874292
|
研究论文 | 本研究揭示了视黄酸通过拮抗雌激素信号维持成年小鼠子宫上皮细胞命运的重要机制 | 首次发现视黄酸与雌激素信号通路在维持成年子宫上皮细胞命运中的拮抗平衡机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类子宫中的类似机制需要进一步验证 | 探究成年子宫上皮细胞命运维持的分子机制 | 小鼠子宫上皮细胞 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序，基因敲除模型 | 遗传学小鼠模型 | 基因表达数据，组织学图像 | 三种相关基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3189 | 2025-10-06 |
Intercellular TIMP-1-CD63 signaling directs the evolution of immune escape and metastasis in KRAS-mutated pancreatic cancer cells
2025-Jan-18, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02207-4
PMID:39825392
|
研究论文 | 本研究揭示了KRAS突变胰腺癌细胞通过TIMP-1-CD63信号通路逃避免疫清除和促进转移的机制 | 首次发现早期浸润巨噬细胞通过TIMP-1-CD63信号维持ERKactiveDUSP2low癌细胞群体，形成恶性循环促进胰腺癌进展 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究KRAS突变上皮细胞如何获得逃逸衰老和免疫清除能力，进展为晚期胰腺导管腺癌 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞、巨噬细胞、基因工程小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 数字空间转录组分析 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 体内实验数据 | 原发PDAC肿瘤样本、人和小鼠原代胰腺癌细胞系、免疫健全小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3190 | 2025-10-06 |
FGFR2 directs inhibition of WNT signaling to regulate anterior fontanelle closure during skull development
2025-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204264
PMID:39775862
|
研究论文 | 本研究通过小鼠遗传学和单细胞转录组学揭示了FGFR2通过调控WNT信号通路影响前囟闭合的机制 | 首次发现FGFR2通过非自主性调控WNT信号通路影响前囟细胞分化，揭示了FGF-WNT信号回路在颅缝形成中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用需进一步验证 | 探究FGFR2如何调控前囟闭合的分子机制 | 小鼠前囟细胞和颅骨成骨前沿细胞 | 发育生物学 | 颅缝早闭综合征 | 单细胞转录组测序, 遗传学分析 | 小鼠遗传模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3191 | 2025-10-06 |
Immune cell single-cell RNA sequencing analyses link an age-associated T cell subset to symptomatic benign prostatic hyperplasia
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1585446
PMID:40692782
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现与年龄相关的T细胞亚群与症状性良性前列腺增生的关联 | 首次鉴定出与年龄相关的GZMKhi GZMBlow CD8+ T细胞亚群（Taa），并揭示其通过颗粒酶K介导的机制促进前列腺基质细胞衰老相关分泌表型 | 样本量有限，仅分析了少量年轻和老年前列腺样本 | 探究年龄相关免疫细胞变化在良性前列腺增生发病机制中的作用 | 人类前列腺组织中的免疫细胞和BPH患者来源的成纤维细胞 | 单细胞组学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序，ELISA，速度分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，细胞因子测量数据 | 老年男性大小前列腺样本（≤40g和≥90g）及3个年轻器官捐赠者前列腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3192 | 2025-10-06 |
Mapping the immunological landscape and emerging immunotherapeutic strategies in cervical cancer: a comprehensive review
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1620501
PMID:40708940
|
综述 | 本文全面综述宫颈癌免疫景观特征及新兴免疫治疗策略 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学等前沿技术解析肿瘤免疫微环境异质性 | 缺乏预测免疫治疗疗效的可靠生物标志物，患者间免疫景观存在高度异质性 | 开发针对宫颈癌的有效个体化免疫疗法 | 宫颈癌肿瘤免疫微环境（肿瘤细胞、免疫浸润细胞、基质成分） | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重成像 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3193 | 2025-10-06 |
Gut-tropic α4β7+CD8+ T cells contribute to pancreatic β cell destruction in type 1 diabetes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1623428
PMID:40709181
|
研究论文 | 本研究揭示了肠道归巢CD8+ T细胞通过整合素α4β7介导迁移至胰岛并促进1型糖尿病β细胞破坏的新机制 | 首次发现肠道归巢CD8+ T细胞在1型糖尿病胰岛破坏中的关键作用，建立了肠道免疫系统与胰腺自身免疫的新联系 | 样本量有限，动物模型与人类疾病存在差异，机制研究仍需深入验证 | 阐明非特异性T细胞在1型糖尿病胰岛破坏中的机制和作用 | 1型糖尿病患者、健康对照者、NOD小鼠模型 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、细胞因子检测、细胞毒性分析 | NA | 基因表达数据、临床数据、实验数据 | 99例T1D患者、57例健康对照、10例T1D供体胰腺、11例自身抗体阳性供体、15例非糖尿病对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3194 | 2025-10-06 |
Itaconate facilitates viral infection via alkylating GDI2 and retaining Rab GTPase on the membrane
2024-12-27, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-02077-8
PMID:39730330
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研究论文 | 本研究揭示了衣康酸通过烷基化GDI2并保留Rab GTPase在膜上促进病毒感染的机制 | 首次发现衣康酸通过直接烷基化GDI2蛋白的多个半胱氨酸位点，调节Rab GTPases的膜分布，从而促进病毒感染 | NA | 探究衣康酸在病毒感染中的作用机制 | 巨噬细胞、上皮细胞、中性粒细胞、VSV和IAV病毒 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3195 | 2025-10-06 |
A phase 2 pilot study of umbilical cord blood infusion as an adjuvant consolidation therapy in elderly patients with acute myeloid leukemia
2024-12-20, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-02065-y
PMID:39702351
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研究论文 | 评估脐带血输注作为老年急性髓系白血病患者辅助巩固治疗的安全性和有效性 | 首次将脐带血作为抗衰老疗法应用于老年AML患者的辅助治疗，并通过单细胞RNA测序揭示其抗肿瘤和抗衰老机制 | 单臂二期临床试验，样本量有限（51例），缺乏对照组 | 探索脐带血输注在老年AML患者巩固治疗中的疗效和安全性 | 51例年龄60-75岁的老年急性髓系白血病患者 | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、基因表达数据 | 51例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3196 | 2025-10-06 |
Mechanism exploration and model construction for small cell transformation in EGFR-mutant lung adenocarcinomas
2024-10-02, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01981-3
PMID:39353908
|
研究论文 | 探索EGFR突变肺腺癌小细胞转化的分子机制并构建预测模型 | 首次系统比较转化前后肿瘤的转录组特征，发现表观遗传改变驱动转化过程，并构建了高准确度的4标志物预测模型 | 样本量相对有限，需要更大规模验证 | 阐明EGFR突变肺腺癌小细胞转化的分子机制并开发预测方法 | 肺腺癌患者样本（包括未转化、转化前和转化后）以及原发性小细胞肺癌样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组分析，多重免疫荧光 | 预测模型 | 转录组数据，免疫组织化学数据 | 训练队列和测试队列（具体数量未明确说明） | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3197 | 2025-10-06 |
Single-cell exome sequencing reveals polyclonal seeding and TRPS1 mutations in colon cancer metastasis
2024-09-23, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01960-8
PMID:39307879
|
研究论文 | 通过单细胞外显子测序揭示结肠癌转移中的多克隆播散和TRPS1基因突变机制 | 首次在单细胞水平证明结肠癌肝转移和淋巴转移均来源于多克隆循环肿瘤细胞，并发现TRPS1 R544Q突变通过TRPS1/ZEB1轴促进癌症侵袭转移 | 研究仅基于一例IV期结肠癌患者，样本量有限 | 探索结肠癌转移的克隆演化和遗传异质性机制 | 结肠癌患者的原发肿瘤、肝转移灶和淋巴转移灶 | 癌症基因组学 | 结肠癌 | 单细胞外显子测序，单细胞转录组分析 | NA | 基因组测序数据，转录组数据 | 来自1例IV期结肠癌患者的150个单细胞（包括原发肿瘤、肝转移和淋巴转移） | NA | 单细胞外显子测序，单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 3198 | 2025-10-06 |
A new paradigm for generating high-quality cardiac pacemaker cells from mouse pluripotent stem cells
2024-09-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-01942-w
PMID:39237509
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过双起搏细胞标记物和模拟发育路径从小鼠多能干细胞生成高质量心脏起搏细胞的新方法 | 采用双标记物Shox2和Hcn4建立报告细胞系，并通过FSK方法显著提高起搏细胞产量，同时通过单细胞RNA测序绘制分化轨迹并鉴定关键调控因子ZFP503 | 研究仅使用小鼠多能干细胞，尚未在人类细胞中验证 | 开发高质量心脏起搏细胞的分化策略以推进心脏生物起搏技术 | 小鼠多能干细胞及其分化的心脏起搏细胞 | 干细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，干细胞分化 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3199 | 2025-10-06 |
FGF Signaling Regulates Development of the Anterior Fontanelle
2024-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.14.603452
PMID:39071418
|
研究论文 | 本研究通过小鼠遗传学和单细胞转录组学揭示了FGF信号通过调控WNT信号通路调节前囟门闭合和额缝形成的机制 | 首次在前囟门中发现FGF-WNT信号回路，揭示了SCX+细胞区域选择性分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究FGF信号如何调控前囟门闭合和额缝形成的发育过程 | 小鼠前囟门发育过程中的细胞分化和信号通路 | 发育生物学 | 颅缝早闭症 | 单细胞转录组学，小鼠遗传学 | NA | 基因表达数据，空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3200 | 2025-10-06 |
NDC80/HEC1 promotes macrophage polarization and predicts glioma prognosis via single-cell RNA-seq and in vitro experiment
2024-07, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.14850
PMID:39021287
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体外实验探讨NDC80/HEC1在胶质瘤中的作用机制及其预后价值 | 首次发现HEC1通过促进巨噬细胞从M1向M2表型转化来调控肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内动物模型验证 | 探索HEC1在胶质瘤发生发展中的功能及其作为预后标志物的潜力 | 胶质瘤组织和细胞系 | 单细胞测序分析 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 体外实验, 共培养实验 | NA | RNA测序数据, 实验数据 | 人类胶质瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |