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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-05-18 |
Maternal obesity induces activator protein 1-mediated inflammatory response to impair embryonic neurogenesis
2026-04, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP289326
PMID:41823327
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和ATAC测序揭示母体肥胖通过激活蛋白1介导的炎症反应损害胚胎神经发生的机制 | 首次通过单细胞多组学技术揭示母体肥胖通过AP-1转录因子促进炎症基因染色质可及性进而抑制神经发生的分子机制 | 仅在小鼠模型中验证,缺乏人类胚胎数据验证;未涉及长期神经发育表型分析 | 探究母体肥胖影响胚胎神经发生的分子机制 | 高脂饮食诱导肥胖母鼠的E11.5和E13.5胚胎 | NA | 母体肥胖相关神经发育障碍 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 对照组和肥胖组母鼠各10只,每窝取E11.5和E13.5胚胎各3-5只 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于scRNA-seq,10x Chromium Single Cell ATAC 试剂盒用于scATAC-seq |
| 302 | 2026-05-18 |
Single Cell Analysis Reveals Dynamic Changes of Distinct Cell Populations in Human Nickel Allergy
2026-Apr, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70108
PMID:41090989
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类镍过敏中不同细胞群体的动态变化 | 首次在单细胞水平揭示镍过敏反应中内皮细胞、基底上角质形成细胞、成纤维细胞和CCR7+树突状细胞的特异性激活,并发现KLF2+中枢记忆T细胞的浸润是镍过敏和布地奈德过敏的共同特征 | 未提供具体局限性信息 | 阐明人类镍过敏反应中不同细胞类型的作用及其动力学变化 | 镍过敏捐赠者的皮肤样本 | 单细胞转录组学 | 镍过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 镍过敏捐赠者经表皮暴露于稀释液和镍8或72小时的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 303 | 2026-05-18 |
Gene regulatory network determinants of rapid recall in human memory CD4+ T cells
2026-Mar-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117103
PMID:41865369
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研究论文 | 利用单核多组学测序揭示记忆CD4+ T细胞快速回忆的基因调控网络决定因素 | 首次通过单核多组学测序(基因表达和染色质可及性)解析记忆CD4 T细胞快速回忆的基因调控网络,并鉴定了五个关键转录因子(MAF、PRDM1、RUNX2、SMAD3和KLF6) | 仅基于单细胞RNA测序数据和染色质免疫沉淀测序验证,未在功能上进一步验证这些转录因子在体内快速回忆中的作用 | 探究记忆CD4 T细胞快速回忆的基因调控网络及其转录因子决定因素 | 人CD4+ T细胞(幼稚细胞和记忆细胞) | 机器学习 | 免疫介导性疾病 | 单核多组学测序、染色质免疫沉淀测序、单细胞RNA测序、全基因组关联研究 | 基因调控网络模型 | 基因表达数据、染色质可及性数据 | NA | NA | 单核多组学测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 304 | 2026-05-18 |
Dynamics of phage-host interactions in Bacteroides fragilis resolved by single-cell transcriptomics
2026-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70381-8
PMID:41839859
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研究论文 | 利用细菌单细胞RNA测序技术解析了脆弱拟杆菌与烈性噬菌体相互作用的动态过程 | 首次将细菌单细胞转录组学应用于噬菌体-宿主互作研究,从单细胞分辨率揭示了感染的非同步性进程及未感染表型亚群的分子机制 | 未提供具体方法的可扩展性讨论及其他宿主-噬菌体系统的验证 | 探究噬菌体感染过程中细菌群体的异质性及防御机制 | 人源共生菌脆弱拟杆菌及其烈性噬菌体 | 微生物组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 约50,000个细菌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 305 | 2026-05-16 |
Spatially defined danger zone shapes gastric cancer progression through CCDC80+ fibroblast-induced CD8+ T cell dysfunction
2026-03-07, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02287-1
PMID:41793512
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研究论文 | 通过空间转录组学鉴定胃癌进展中的“危险区域”,揭示CCDC80+成纤维细胞驱动的CD8+ T细胞功能障碍机制 | 首次定义并表征胃癌中的“危险区域”空间结构,结合非负矩阵分解和XGBoost模型进行亚型分类和预后预测,并利用LightGBM模型直接从H&E切片预测危险区域评分 | 未明确提及,但可能包括样本量有限、机制验证依赖体外共培养体系、模型泛化性需进一步验证 | 探究胃癌肿瘤微环境的空间异质性及其对免疫治疗反应和预后的影响机制 | 侵袭性小鼠肿瘤和人类胃癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学 | XGBoost, LightGBM, 非负矩阵分解 | 空间转录组数据、H&E染色图像 | 小鼠肿瘤样本和人类胃癌样本(具体数量未在摘要中明确) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 306 | 2026-05-18 |
Chromatin accessibility landscapes define stromal cell identities across tissues
2026-Feb-25, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09720-w
PMID:41735542
|
研究论文 | 利用单细胞ATAC-seq技术绘制小鼠多组织染色质可及性图谱,揭示基质细胞的组织特异性身份 | 首次通过整合9种小鼠组织的51,248个单细胞染色质可及性数据,鉴定出28种主要细胞类型,并发现染色质可及性特征可用于追溯基质细胞(如内皮细胞、成纤维细胞和巨噬细胞)的组织来源 | NA | 探索不同组织间染色质可及性景观,理解其如何定义细胞身份和组织特异性调控 | 小鼠九种组织的51,248个细胞 | 数字病理学 | NA | scATAC-seq | NA | 单细胞染色质可及性数据 | 9种小鼠组织,51,248个细胞 | NA | 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 307 | 2026-05-18 |
Male obesity causes adipose mitochondrial dysfunction in F1 mouse progeny via a let-7-DICER axis
2026-Feb-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69686-5
PMID:41735303
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研究论文 | 本文发现雄性小鼠肥胖通过let-7-DICER轴导致F1子代脂肪线粒体功能障碍,并揭示了let-7 microRNA在精子中传播代谢健康的作用机制 | 首次证明肥胖雄鼠精子中的let-7d/e microRNA通过表观遗传机制传递给子代,抑制DICER1并损害脂肪线粒体功能,且通过显微注射实验验证了因果关系 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自精液中let-7的表达变化,缺乏对人类子代代谢表型的直接证据 | 探究雄性肥胖通过精子microRNA对后代代谢和线粒体功能的影响机制 | 雄性肥胖小鼠及其F1子代、人类肥胖男性精液样本 | 表观遗传学 | 肥胖及相关代谢疾病 | 单细胞RNA测序、显微注射、基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(具体数量未说明)及人类精液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics平台 | 单细胞RNA测序分析早期胚胎卵裂球 |
| 308 | 2026-05-18 |
A spatial transcriptomics comparison of the adult versus metamorphosed axolotl brain
2026-Feb-24, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06917-w
PMID:41735337
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研究论文 | 通过空间转录组学比较成年与变态后蝾螈脑的细胞类型和分子特征,揭示变态相关的脑区变化 | 首次系统比较成年与变态后蝾螈全脑多个脑区的空间转录组,揭示变态过程中细胞类型和分子图谱的区域性变化 | 未涉及变态过程中不同时间点的动态变化分析,样本量相对有限 | 探究变态对蝾螈脑的细胞类型和分子特征的影响 | 成年和变态后的墨西哥蝾螈(Ambystoma mexicanum)脑部 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 5个脑区(嗅球、端脑、间脑/中脑、菱脑和垂体)来自成年和变态后个体 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 309 | 2026-05-18 |
Gain of function NOTCH4 variants disrupt angiogenesis in systemic sclerosis
2026-Feb-04, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.015
PMID:41644364
|
研究论文 | 该研究通过遗传学、单细胞RNA测序、功能实验和小鼠模型,探讨NOTCH4功能获得性变异在系统性硬化症血管生成障碍中的作用 | 首次发现NOTCH4功能获得性变异与非洲裔美国人系统性硬化症的严重血管表型相关,并揭示NOTCH4信号通路抑制可逆转血管生成障碍和内皮-间质转化 | 研究主要聚焦于非洲裔美国人群体,样本量有限,且未完全阐明NOTCH4变异在其他人种中的作用机制 | 探究系统性硬化症中严重血管表型的遗传病因及NOTCH4信号通路作为治疗靶点的潜力 | 非洲裔美国系统性硬化症患者及其血管表型 | 数字病理学 | 硬皮病 | NGS,单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据、单细胞转录组数据 | 非洲裔美国系统性硬化症患者与对照组的基因型数据,以及相应的小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 310 | 2026-05-18 |
In vivo CRISPR screen reveals regulation of macrophage states in neuroinflammation
2026-Feb, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02151-6
PMID:41345278
|
研究论文 | 利用体内CRISPR筛选技术,揭示细胞因子在神经炎症中对巨噬细胞状态的调节作用 | 建立了结合可编辑祖细胞的体内CRISPR筛选流程,实现了对多发性硬化小鼠模型中巨噬细胞调控的规模化分析,并联合单细胞转录组学与生物传感器监控细胞因子效应 | NA | 解析细胞因子在神经炎症中调控巨噬细胞状态的分子机制 | 小鼠多发性硬化模型中的巨噬细胞及血源性中枢神经系统髓系细胞 | 机器学习 | 多发性硬化 | CRISPR筛选、单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 超过100种细胞因子受体和信号分子 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 311 | 2026-05-18 |
Suppression of endothelial cell PANoptosis: qingyi decoction targets the TMAO-HMGB1 pathway to mitigate lung injury in acute pancreatitis rats
2026-01-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02212-y
PMID:41518397
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研究论文 | 本研究探讨了清胰汤通过抑制TMAO-HMGB1通路介导的内皮细胞PANoptosis来减轻重症急性胰腺炎相关肺损伤的作用与机制 | 首次揭示了TMAO诱导内皮细胞PANoptosis的机制,并阐明清胰汤通过调节TMAO-HMGB1通路发挥保护作用 | 主要基于动物模型和体外实验,临床转化尚需进一步验证 | 评估清胰汤通过调节肠道菌群代谢物TMAO减轻重症急性胰腺炎相关肺损伤的作用机制 | 重症急性胰腺炎大鼠模型及人脐静脉内皮细胞 | 机器翻译 | 急性胰腺炎 | LC-MS/MS, RNA-seq, scRNA-seq, ELISA, RT-qPCR, Western blot, 流式细胞术 | NA | 文本 | 大鼠模型及体外细胞实验,具体样本数未提及 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | RNA-seq及scRNA-seq分析 |
| 312 | 2026-05-18 |
LncRNA PVT1 drives macrophage polarization and triple-negative breast cancer progression via PPARγ-mediated transcriptional activation
2026-01-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02232-8
PMID:41518478
|
研究论文 | 本研究揭示了lncRNA PVT1通过PPARγ介导的转录激活驱动巨噬细胞极化和三阴性乳腺癌进展的分子机制 | 首次阐明PVT1作为表观遗传支架协调NOP56-E2F1复合体调控PPARγ表达,从而驱动巨噬细胞向促肿瘤M2表型极化 | 未提及具体局限性 | 探讨lncRNA PVT1与PPARγ在三阴性乳腺癌进展中调控巨噬细胞重编程的分子相互作用 | 三阴性乳腺癌小鼠模型、THP-1/U937巨噬细胞、MDA-MB-231和MCF-7乳腺癌细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、RNA/DNA pull-down、荧光素酶报告基因实验、流式细胞术、TUNEL检测 | NA | 基因表达数据 | 原位三阴性乳腺癌小鼠肿瘤组织(含9种细胞类型) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 313 | 2026-05-18 |
Digital twins for in vivo metabolic flux estimations in patients with brain cancer
2026-Jan-06, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.10.022
PMID:41330373
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研究论文 | 开发两种机器学习框架,实现脑癌患者体内代谢通量估算的数字孪生模型 | 首次将数字孪生框架与单细胞代谢通量分析相结合,实现人类患者体内代谢通量估算,突破传统仅限于临床前模型的限制 | 未提及临床应用验证和模型泛化能力评估 | 开发基于机器学习的体内代谢通量估算框架,用于脑癌患者 | 脑癌患者肿瘤样本及小鼠模型 | 机器学习 | 脑癌 | 单细胞RNA测序、同位素示踪 | 卷积神经网络 | 基因表达数据、代谢通量数据 | 脑癌患者及小鼠样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 314 | 2026-05-18 |
Hepatic Arterial Flow-Induced Portal Tract Fibrosis in Portal Hypertension: The Role of VCAM-1 and Osteopontin-Expressing Macrophages
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101728
PMID:41565157
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研究论文 | 研究门静脉高压中肝动脉血流诱导的门管束纤维化,重点关注VCAM-1和表达骨桥蛋白的巨噬细胞的作用 | 首次揭示了肝动脉缓冲反应通过VCAM-1介导的Spp1+巨噬细胞招募驱动门管束纤维化的分子机制 | 未明确说明,但基于动物模型(大鼠)可能需在人体中验证 | 探究门静脉高压时肝动脉血流增加如何通过分子机制诱导门管束病理性重塑 | Sprague-Dawley大鼠门静脉高压模型 | 数字病理学 | 门静脉高压 | 微CT、单细胞RNA测序、RNA荧光原位杂交 | NA | 图像数据(微CT)、转录组数据 | 大鼠模型(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据集GSE171904 |
| 315 | 2026-05-18 |
Molecular and Chromatin Accessibility Programs Underlying Epithelial Injury and Impaired Regeneration in Neonatal Necrotizing Enterocolitis
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101730
PMID:41571092
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研究论文 | 利用多组学方法绘制新生儿坏死性小肠结肠炎中上皮损伤和再生障碍的分子与染色质可及性图谱 | 整合了单核RNA测序、单核ATAC测序和空间转录组学等多组学数据,揭示了Ezh2作为LGR5+肠道干细胞身份和再生的关键调控因子,并发现WNT信号通路在维持上皮完整性中的重要作用 | 主要基于新生儿小鼠模型,人类NEC的验证尚需进一步研究 | 阐明新生儿坏死性小肠结肠炎中上皮再生缺陷的分子机制并识别治疗靶点 | 新生儿坏死性小肠结肠炎小鼠模型的小肠组织及肠道干细胞 | 数字病理学 | 新生儿坏死性小肠结肠炎 | bulk RNA测序, 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 多重容错荧光原位杂交 | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 | 多个新生小鼠样本 | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 316 | 2026-05-18 |
Tuft Cells in the Gut Limit Cognitive Disorders by Regulating Gut Homeostasis
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101747
PMID:41621641
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研究论文 | 该文章研究了肠道簇细胞通过调节肠道稳态来限制认知障碍的机制 | 首次揭示了肠道簇细胞在认知障碍中的作用,并阐明了其通过调节肠道菌群和2型免疫来影响认知功能的机制 | 未提及具体局限性,但研究仅在动物模型中进行,尚未验证在人类中的相关性 | 探究肠道簇细胞在认知障碍中的作用及其机制 | 小鼠(缺簇细胞小鼠Pou2f3-/-和野生型WT小鼠,阿尔茨海默病模型小鼠) | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 16S rRNA测序、FITC-葡聚糖实验、流式细胞术、单细胞RNA测序、荧光成像、结肠类器官 | NA | 序列数据、图像数据 | 10月龄小鼠(缺簇细胞小鼠和野生型小鼠),阿尔茨海默病模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 317 | 2026-05-18 |
Spatial Analysis of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Defines a Paradoxical Keratin 17-Positive, Low-Grade Epithelial Population Harboring Malignant Features
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101749
PMID:41638478
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序,发现导管内乳头状黏液性肿瘤中组织学低级别上皮细胞中存在表达恶性转录特征的角蛋白17阳性亚群 | 首次在组织学低级别IPMN中识别出表达恶性特征(KRT17、S100A10、CEACAM5)的上皮细胞亚群,挑战了传统组织学分级对恶性潜能的判断 | 未明确说明样本量大小和外部验证集的代表性,可能影响结论的普适性 | 探究IPMN进展过程中的转录组变化,识别高风险恶变亚群 | 包含低级别异型增生、高级别异型增生和IPMN来源癌变的患者组织样本 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 包含多个患者样本的大型队列及外部空间转录组数据集 | Nanostring | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | Nanostring GeoMx | Nanostring GeoMx空间转录组学系统 |
| 318 | 2026-05-18 |
Uncovering core stemness biomarkers in HBV-HCC through integrated multi-omics
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0349171
PMID:42133686
|
研究论文 | 通过整合多组学分析揭示HBV相关肝细胞癌的核心干性生物标志物 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据,识别出与HBV感染相关的肝细胞癌干性内皮亚群,并发现SSR2和UBE2D3作为候选诊断和预后生物标志物 | 基于计算机模拟分析,缺乏实验验证;样本量有限,需进一步在更大队列中验证 | 鉴定HBV相关肝细胞癌中与癌症干细胞特征相关的核心调控因子 | HBV相关肝细胞癌患者的单细胞和批量转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 随机森林 | 转录组数据 | 多个独立队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 319 | 2026-05-18 |
Unraveling the significance of decorin in endometriosis development through single cell sequencing and experimental approaches
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0349505
PMID:42139232
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2026-05-18 |
GLP-1R Agonism Directly Improves the Pumping Capacity of Murine Collecting Lymphatic Vessels
2025-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.26.696603
PMID:41509291
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研究论文 | GLP-1R激动剂直接提高小鼠集合淋巴管的泵血能力 | 首次发现GLP-1R激动剂(如semaglutide)可直接作用于淋巴管内皮细胞(LECs),通过血管舒张增加淋巴管泵血能力,且该作用独立于体重减轻带来的系统性益处 | 机制中除一氧化氮、活性氧和血管舒张性前列腺素外,其他信号成分尚待阐明 | 研究GLP-1R激动剂对淋巴管功能的直接作用及其分子机制 | 健康野生型小鼠、饮食诱导肥胖小鼠和高胆固醇血症ApoE KO小鼠的淋巴管 | 数字病理学 | 继发性淋巴水肿 | 单细胞RNA测序、荧光共聚焦显微镜、压力肌动描记术 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠淋巴管样本,具体数量未报告 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于淋巴管细胞转录组分析 |