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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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301 | 2025-10-05 |
Molecular signatures of alveolar type II cell differentiation in acute respiratory distress syndrome
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1649108
PMID:41041455
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了急性呼吸窘迫综合征中肺泡II型细胞分化的分子特征 | 首次发现AT2细胞在ARDS中存在两种不同分化轨迹:纤维化程序和上皮修复程序 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本,需要更大规模临床验证 | 探究ARDS中AT2细胞分化轨迹及其对疾病进展的影响 | 小鼠ARDS模型和ARDS患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞组学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序, 微阵列, 通路富集分析 | 轨迹分析 | 转录组数据, 蛋白质数据 | 小鼠ARDS模型和患者BALF样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
302 | 2025-10-05 |
Stiff Hydrogel Encapsulation Retains Mesenchymal Stem Cell Stemness for Regenerative Medicine
2024-Oct-02, Matter
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.matt.2024.05.041
PMID:39553898
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研究论文 | 本研究通过调控水凝胶壳层刚度增强间充质干细胞的增殖能力和干性维持 | 首次发现较硬的水凝胶壳层能促进间充质干细胞增殖并维持其干性特征 | 水凝胶封装对MSC亚群的影响尚未完全阐明 | 探索水凝胶封装对间充质干细胞干性维持的影响机制 | 间充质干细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
303 | 2025-10-05 |
Single cell RNA sequencing of human eosinophils from nasal polyps reveals eosinophil heterogeneity in chronic rhinosinusitis tissue
2024-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.05.014
PMID:38797240
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鼻息肉组织中的嗜酸性粒细胞,揭示其在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中的异质性 | 首次在慢性鼻窦炎伴鼻息肉组织中通过单细胞RNA测序发现嗜酸性粒细胞存在四种不同亚型 | 样本量较小(5例患者),对照组鼻窦组织嗜酸性粒细胞数量过少未纳入分析 | 揭示鼻息肉组织中嗜酸性粒细胞的角色和异质性 | 鼻息肉组织和外周血中的嗜酸性粒细胞 | 单细胞组学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 5名对照患者和5名CRSwNP患者的鼻窦组织和匹配外周血样本 | BD Biosciences | 单细胞RNA测序 | BD Rhapsody | 基于微孔板的单细胞RNA测序技术 |
304 | 2025-10-05 |
Refined and benchmarked homemade media for cost-effective, weekend-free human pluripotent stem cell culture
2024, Open research Europe
DOI:10.12688/openreseurope.18245.2
PMID:41040810
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研究论文 | 本研究开发并评估了两种自制无周末培养基B8+和hE8,用于人类多能干细胞培养 | 优化了B8培养基配方使其适用于常氧培养,并使用商业可得的生长因子提高了可重复性 | B8+培养基存在谱系启动效应,可能影响分化结果 | 开发成本效益高、实用且可重复的人类多能干细胞培养方法 | 人类多能干细胞(hPSCs),包括WTC11人诱导多能干细胞系和H1、H9人胚胎干细胞系 | 细胞生物学 | NA | 流式细胞术、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 多个人类多能干细胞系(WTC11、H1、H9) | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
305 | 2025-10-05 |
CD34+ cell-derived fibroblast-macrophage cross-talk drives limb ischemia recovery through the OSM-ANGPTL signaling axis
2023-04-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add2632
PMID:37043578
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研究论文 | 本研究揭示了CD34+细胞通过OSM-ANGPTL信号轴促进肢体缺血恢复的细胞机制 | 首次结合单细胞RNA测序和遗传谱系追踪技术,提供了正常和缺血肢体组织的精确单细胞图谱,发现CD34+细胞作为成纤维细胞前体促进组织再生 | 未明确说明样本规模和技术重复次数 | 探究CD34+细胞在缺血肌肉微环境中的分化潜能和功能作用 | 人类和小鼠的正常及缺血肢体组织 | 单细胞生物学 | 肢体缺血 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
306 | 2025-10-05 |
Irf4 participates in benzene-induced hematopoietic senescence through mitochondrial ROS-dependent BCAA catabolism
2025-Dec, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2025.154271
PMID:40885242
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研究论文 | 本研究揭示了环境剂量苯通过Irf4介导线粒体ROS依赖性BCAA代谢异常诱导造血祖细胞衰老的新机制 | 首次报道环境剂量苯通过Irf4-Bcat1-BCAA代谢轴诱导造血祖细胞衰老的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人体样本中验证 | 探究苯暴露诱导造血祖细胞衰老的分子机制 | C57BL/6J雄性小鼠和FDC-P1小鼠造血祖细胞系 | 单细胞组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质组数据 | 小鼠暴露实验(0,10,50ppm苯蒸气12周),细胞系暴露实验(0,5,10μM 1,4-BQ 24h) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
307 | 2025-10-05 |
Fueling fibrosis: metabolic dysregulation in systemic sclerosis
2025-Nov-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000001123
PMID:40916994
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综述 | 本综述探讨代谢重编程如何驱动系统性硬化症的纤维化和免疫失调 | 系统阐明系统性硬化症中从分解代谢向合成代谢转变的分子机制,揭示代谢通路与纤维化信号的新型关联 | NA | 研究代谢重编程在系统性硬化症发病机制中的作用 | 系统性硬化症患者的代谢通路和纤维化过程 | NA | 系统性硬化症 | 代谢组学分析、单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
308 | 2025-10-05 |
TargetPair: A Single Cell-omics Resource of Clinical Trials-derived Therapeutical Target Combinations for Cancer Therapy
2025-Nov-01, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169399
PMID:40840587
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研究论文 | 建立TargetPair数据库,提供临床试验来源的癌症治疗靶点组合及其单细胞组学特征 | 首次系统整合临床相关癌症靶点组合并计算其单细胞水平组学特征 | 数据来源依赖于已发表的临床试验和文献,可能存在选择偏差 | 开发癌症多靶点治疗的理性设计资源 | 癌症治疗靶点组合及其单细胞组学特征 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞组学数据 | 3,022,556个单细胞,588名患者,16种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
309 | 2025-10-05 |
Ptgs2+ CPTC Function as a "Force-Immune Axis" by Responding to Acupuncture and Mediating M2 Macrophage Activation for Anti-Inflammatory Effects
2025-Oct-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501175RR
PMID:41017691
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现Ptgs2+ CPTC作为“力-免疫轴”响应针刺刺激并通过Il6-Il6st-Stat3通路激活M2巨噬细胞发挥抗炎作用 | 首次确立Ptgs2+ CPTC作为连接机械刺激与免疫调节的关键“力-免疫轴”,揭示了针灸抗炎的细胞机制 | 研究局限于腹部中线筋膜组织,未验证其他筋膜区域的普适性 | 探索筋膜组织中特络细胞的细胞景观及其在针灸抗炎中的作用机制 | 大鼠腹部中线筋膜组织和特络细胞亚群 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞测序, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 细胞形态学数据 | 痢疾大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
310 | 2025-10-05 |
The acute myeloid leukemia microenvironment impairs neutrophil maturation and function through NF-κB signaling
2025-Oct-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024028199
PMID:40663784
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研究论文 | 本研究揭示了急性髓系白血病微环境通过NF-κB信号通路损害中性粒细胞成熟和功能的机制 | 首次使用非辐照中性粒细胞报告小鼠模型结合单细胞转录组学,系统揭示了AML微环境对中性粒细胞发育和功能的全面影响 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限;未详细探讨不同AML亚型对中性粒细胞影响的异质性 | 探究急性髓系白血病微环境对健康中性粒细胞成熟和功能的影响机制 | AML暴露的中性粒细胞和健康中性粒细胞 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学,细胞因子筛选,染色质重塑分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 临床前AML小鼠模型和AML患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
311 | 2025-10-05 |
Pharmacological Inhibition of Ferroptosis Attenuates Experimental Abdominal Aortic Aneurysm Formation
2025-Oct-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.323269
PMID:41036562
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研究论文 | 本研究通过药理学方法抑制铁死亡,证明可减轻实验性腹主动脉瘤的形成 | 首次揭示铁死亡在腹主动脉瘤形成中的关键作用,并证明liproxstatin-1通过抑制巨噬细胞铁死亡来减轻主动脉炎症和重塑 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究铁死亡在腹主动脉瘤形成中的作用机制 | 人类AAA组织、C57BL/6小鼠、巨噬细胞和平滑肌细胞 | 病理学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序、质谱分析、组织学分析 | NA | 基因表达数据、组织图像、质谱数据 | 人类AAA组织数据库、雄性雌性C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
312 | 2025-10-05 |
Comprehensive bioinformatics evaluation uncovers the possible oncogenic contribution of acrylamide to endometrial cancer
2025-Oct-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03612-x
PMID:41037154
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研究论文 | 通过生物信息学方法评估丙烯酰胺在子宫内膜癌中的潜在致癌机制 | 首次整合转录组数据和单细胞RNA测序数据,结合机器学习方法系统揭示丙烯酰胺通过关键基因介导子宫内膜癌发生的分子机制 | 需要进一步的实验验证才能将这些发现转化为预防和治疗策略 | 探索丙烯酰胺在子宫内膜癌发生发展中的致癌机制 | 子宫内膜癌转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 分子对接 | LASSO回归, 支持向量机, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据集(GSE17025, GSE63678, GSE106191, GSE115810)和单细胞RNA测序数据(PRJNA786266) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
313 | 2025-10-05 |
CD34+CLDN5+ tumor associated senescent endothelial cells through IGF2-IGF2R signaling increased cholangiocellular phenotype in hepatocellular carcinoma
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.008
PMID:39674501
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现肝癌中CD34+CLDN5+衰老内皮细胞通过IGF2-IGF2R信号通路招募间充质干细胞,促进胆管细胞表型形成 | 首次鉴定出肝癌中特定的衰老内皮细胞亚群,并阐明其通过IGF2-IGF2R信号通路招募MSCs促进胆管细胞表型形成的机制 | 研究主要基于动物模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 阐明肝癌中胆管细胞表型形成的细胞机制和分子通路 | 肝癌组织、内皮细胞、间充质干细胞、肝癌细胞 | 单细胞生物学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 体外分析, 体内分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
314 | 2025-10-05 |
Insulin-like growth factor binding protein 7 identified in aged dental pulp by single-cell RNA sequencing
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.018
PMID:39674503
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究年轻与衰老牙髓组织的异质性,并鉴定出衰老牙髓的新标志物IGFBP7 | 首次在单细胞水平系统揭示牙髓衰老的细胞异质性,发现IGFBP7作为衰老牙髓的新标志物及其延缓细胞衰老的作用机制 | 需要更全面的研究来阐明IGFBP7影响牙髓衰老的确切机制 | 探索年轻与衰老牙髓组织的异质性,寻找衰老牙髓的新标志物并研究其机制 | 年轻和衰老的牙髓组织样本、过氧化氢诱导的牙髓成纤维细胞衰老模型 | 单细胞组学 | 牙髓衰老 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 免疫组织化学染色, SA-β-Gal染色, γ-H2AX染色, F-肌动蛋白细胞骨架染色 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据, 图像数据 | 8个牙髓样本,共32,012个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
315 | 2025-10-05 |
Comprehensive analysis of heterogeneity and cell-cell interactions in Crohn's disease reveals novel location-specific insights
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.042
PMID:39732334
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析克罗恩病结肠和回肠的异质性及细胞间相互作用 | 发现表达高水平DUOX2和DUOXA2的新型上皮细胞亚群(DUOX2-epi),揭示其在结肠和回肠中通过不同机制触发炎症反应 | 研究仅针对未接受治疗的克罗恩病患者,样本来源有限 | 系统阐明克罗恩病结肠和回肠的异质性,为个体化治疗提供依据 | 克罗恩病患者的结肠和回肠组织 | 单细胞测序分析 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未接受治疗的克罗恩病患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
316 | 2025-10-05 |
Multi-omics approach reveals TGF-β signaling-driven senescence in periodontium stem cells
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.037
PMID:39743213
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了TGF-β信号通路通过DNA甲基化调控牙周膜干细胞衰老的机制 | 首次绘制小鼠颌骨组织的空间转录组图谱,并发现TGF-β1通过DNA甲基化介导的PRKAG2基因沉默诱导牙周膜干细胞衰老的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验,需要进一步在体内模型中验证 | 阐明TGF-β1在牙周膜干细胞衰老中的作用及其分子机制 | 小鼠颌骨组织和人类牙周膜干细胞 | 空间转录组学 | 牙周疾病 | 空间转录组学, 假时序分析, DNA甲基化分析 | NA | 空间转录组数据, 表观遗传数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
317 | 2025-10-05 |
Parkin modulates the hepatocellular carcinoma microenvironment by regulating PD-1/PD-L1 signalling
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.045
PMID:39755271
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研究论文 | 本研究揭示了Parkin通过调控PD-1/PD-L1信号通路影响肝癌免疫微环境的机制 | 首次发现Parkin作为E3泛素连接酶可诱导PD-1泛素化降解,并阐明其在调节肝癌免疫抑制微环境中的新功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探讨Parkin在肝癌免疫微环境调控中的作用机制 | 四氯化碳诱导的肝肿瘤模型小鼠 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, Western blot, 免疫荧光, 免疫共沉淀, 定量蛋白质组学分析 | Park2-/-基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 免疫组化数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学 | NA | NA |
318 | 2025-10-05 |
Mechanisms of dexamethasone-induced bone toxicity in developing bone: a single-cell perspective
2025-Oct, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf146
PMID:41025095
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示地塞米松对发育中骨骼毒性的分子机制 | 首次从单细胞层面系统揭示地塞米松对发育骨骼中成骨细胞、软骨细胞和B细胞谱系的影响 | 研究仅使用C57BL/6JRj雄性小鼠模型,未涉及其他品系或雌性动物 | 阐明地塞米松诱导发育骨骼毒性的分子机制 | 骨骼未成熟的C57BL/6JRj雄性小鼠 | 单细胞生物学 | 骨骼发育障碍 | 单细胞RNA测序,微计算机断层扫描 | NA | 单细胞转录组数据,影像数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
319 | 2025-10-05 |
Highly accurate reference and method selection for universal cross-dataset cell type annotation with CAMUS
2025-Oct-01, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280821.125
PMID:41034048
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研究论文 | 提出一种跨数据集细胞类型注释方法CAMUS,通过通用参考数据和方法选择策略实现高精度细胞注释 | 首次提出通用参考数据和方法选择策略,显著提高跨数据集细胞注释准确性 | NA | 开发高精度的跨数据集细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据 | 672对跨物种scRNA-seq数据集,80个scST数据集,5个scATAC-seq数据集 | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
320 | 2025-10-05 |
Tracking clonal evolution during treatment in ovarian cancer using cell-free DNA
2025-Oct-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09580-0
PMID:41034582
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研究论文 | 开发CloneSeq-SV方法追踪卵巢癌治疗期间克隆演化过程 | 利用肿瘤克隆特异性结构变异作为高灵敏度内源性循环DNA标记,实现克隆群体相对丰度测量和进化分析 | 样本量有限(18例患者),需要更大规模验证 | 研究高级别浆液性卵巢癌治疗过程中耐药性的克隆演化机制 | 18例高级别浆液性卵巢癌患者 | 基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞全基因组测序,靶向深度测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据,循环DNA | 18例HGSOC患者从诊断到复发的多年时间序列样本 | NA | 单细胞全基因组测序,靶向深度测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |