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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-06-04 |
PAX6 Deficiency Compromises the Ability of Limbal Epithelial Stem Cells to Properly Differentiate Into Mature Corneal Epithelial Cells
2026-Jan-05, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.1.56
PMID:41590604
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析PAX6杂合子小鼠角膜缘干细胞分化缺陷,揭示无虹膜相关角膜病变的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下解析PAX6半倍剂量不足导致角膜缘干细胞异常分化的转录组图谱,发现静止态干细胞和早期瞬时放大细胞簇的异常扩增 | 仅基于小鼠模型,人体样本验证不足;未阐明PAX6调控下游通路的完整分子机制 | 阐明PAX6基因缺陷如何影响角膜缘干细胞的分子特征及其分化能力 | Pax6杂合子小鼠和野生型小鼠的角膜及角膜缘组织 | 数字病理学 | 眼部疾病(无虹膜相关角膜病变) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据(单细胞转录组) | 野生型和Pax6杂合子小鼠角膜/角膜缘组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 302 | 2026-06-04 |
Intrahepatic Lymphangiogenesis Is Associated with Early Post-Hepatectomy Liver Regeneration, in Part via IL-6/STAT3 Signaling
2026, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.106849
PMID:41583514
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研究论文 | 该研究探讨了肝内淋巴管生成在部分肝切除术后早期肝再生中的作用及其通过IL-6/STAT3信号通路的机制 | 首次揭示肝内淋巴管生成对肝再生的促进作用及其部分依赖于IL-6/STAT3信号通路 | 仅使用小鼠模型,需进一步在人类研究中验证;未探索其他潜在信号通路 | 阐明肝内淋巴管生成在部分肝切除术后肝再生中的角色和机制 | 小鼠部分肝切除模型中的肝内淋巴内皮细胞和淋巴管 | 生物医学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blotting、免疫荧光染色、AAV载体 | 小鼠模型 | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 小鼠样本,具体数量未明确 | 未明确 | 单细胞RNA测序 | 未明确 | 未明确 |
| 303 | 2026-06-04 |
IPO9 Promotes Ovarian Cancer Progression by Suppressing HMOX1-Dependent Ferroptosis
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/8545131
PMID:41584724
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研究论文 | 该研究整合多组学数据,发现MALAT1上皮细胞是卵巢癌核心细胞亚群,并揭示IPO9通过抑制HMOX1依赖性铁死亡促进肿瘤进展 | 首次将单细胞RNA测序、scPagwas、BayesPrism和WGCNA相结合,鉴定出MALAT1上皮细胞作为卵巢癌免疫抑制的关键驱动亚群,并发现IPO9作为治疗靶点调控铁死亡机制 | 未说明具体限制 | 探索卵巢癌的新型治疗靶点及免疫微环境动态 | 卵巢癌细胞、MALAT1上皮细胞亚群、IPO9基因 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | 基因表达数据, 突变数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 304 | 2026-06-04 |
Exploring the Dynamic Changes of Intercellular Connections in Cervical Cancer: Insights From Transcriptomic Data Combined With Single-Cell Sequencing
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/8140041
PMID:41584728
|
研究论文 | 通过转录组数据与单细胞测序结合,探索宫颈癌细胞间连接的动态变化 | 首次利用单细胞测序揭示宫颈癌细胞亚群间的PTN信号通路通讯,并基于标志基因构建预后模型,发现COL4A1作为治疗新靶点 | 未提及临床样本验证及体内实验,且单细胞数据来源的局限性可能影响泛化性 | 阐明宫颈癌肿瘤微环境中细胞间相互作用的动态变化,并建立预后模型及寻找治疗靶点 | 宫颈癌细胞及肿瘤微环境中的细胞亚群 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序 | LASSO回归,Cox比例风险模型 | 转录组数据,单细胞测序数据 | 未提及具体样本数量(基于公开数据集) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 305 | 2026-06-04 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals Correlation Between Immune Cell Composition and Gene Expression in Cervical Cancer
2026-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70998
PMID:41588920
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析揭示宫颈癌免疫细胞组成与基因表达之间的相关性 | 首次通过单细胞RNA测序全面描绘宫颈癌肿瘤微环境中免疫细胞亚群的分布模式,并揭示TNFRSF18等关键基因表达与免疫细胞比例的直接或反向关系 | 局限在于样本量可能有限,且单细胞RNA测序数据分析方法的选择可能影响结果的鲁棒性 | 基于单细胞RNA测序数据研究宫颈癌患者免疫细胞亚群的分布模式及其与某些基因表达的相关性 | 宫颈癌患者的单细胞RNA测序数据及免疫细胞亚群 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组化,GO富集分析 | UMAP聚类,t-SNE聚类 | RNA测序数据,图像数据 | 宫颈癌样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2026-06-04 |
Unveiling the molecular mechanisms of burn injury through integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0341725
PMID:41592030
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析,揭示烧伤分子机制 | 首次利用单细胞RNA测序解析烧伤微环境的细胞景观,并发现巨噬细胞在免疫信号传导中的关键作用,以及AP2A2、CCL7和TF等关键标记基因 | 样本量较小且缺乏实验验证 | 研究烧伤微环境的免疫学机制,为靶向免疫治疗策略奠定基础 | 烧伤微环境中的细胞,包括中性粒细胞、巨噬细胞、T细胞等14个亚群 | 机器學习 | 烧伤 | 单细胞RNA测序、LASSO回归、随机森林选择 | LASSO回归、随机森林 | 单细胞转录组数据 | 9,248个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 307 | 2026-06-04 |
Tissue-resident macrophage and dendritic cells drive type I IFN immunity to enteroviruses in the liver
2026-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013891
PMID:41592119
|
研究论文 | 该研究结合小鼠模型和单细胞RNA测序揭示了库普弗细胞和树突状细胞在肝脏中驱动I型干扰素免疫应答以抵抗埃可病毒感染的细胞类型特异性机制 | 首次利用单细胞RNA测序在体内模型中准确定位了埃可病毒感染的肝细胞类型,并揭示了库普弗细胞和树突状细胞是早期I型干扰素应答的主要驱动者,而非肝细胞自身 | 该研究主要在转基因小鼠模型中进行,可能不完全反映人类新生儿的免疫反应;另外,I型干扰素对肝细胞的保护作用机制尚需进一步验证 | 阐明在埃可病毒感染肝脏过程中,不同类型固有免疫细胞对I型和III型干扰素抗病毒信号启动的相对贡献 | 表达人类新生儿Fc受体(hFcRn)且缺乏Ifnar1、Ifnlr1或两者的小鼠模型,以及肝细胞特异性Ifnar1基因敲除小鼠 | NA | 埃可病毒感染相关肝衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种基因敲除小鼠模型(具体样本量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 308 | 2026-06-04 |
Revealing the Best Strategies for Rare Cell Type Detection in Multi-Sample Single-Cell Datasets
2025-Dec-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010031
PMID:41595450
|
研究论文 | 系统评估多样本单细胞数据集中稀有细胞类型检测方法,提出最优分析策略 | 首次系统评估多样本设置下稀有细胞检测方法,比较个体样本、合并样本及批次校正后合并样本三种策略,明确批次校正合并分析的最佳效果 | 仅评估五种检测方法及一种基于scGPT的方法,未涵盖所有可用工具;数据集规模有限,可能影响结果泛化性 | 系统评估多样本单细胞RNA测序数据中稀有细胞检测方法,确定最有效分析策略 | 稀有细胞类型检测方法(CellSIUS、GapClust、GiniClust、scCAD、SCISSORS及基于scGPT的离群森林方法) | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 隔离森林(Isolation Forest)、scGPT | 单细胞转录组数据 | 多个公开可用的单细胞RNA测序数据集(具体样本数未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 309 | 2026-06-04 |
scSelector: A Flexible Single-Cell Data Analysis Assistant for Biomedical Researchers
2025-Dec-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010002
PMID:41595423
|
研究论文 | 开发了一个名为 scSelector 的交互式软件工具包,帮助生物医学研究人员灵活地选择和分析单细胞 RNA 测序数据中的细胞群体 | 通过集成套索选择工具和大语言模型(如DeepSeek/Gemini)辅助的细胞类型自动预测,突破了传统依赖聚类的单细胞分析流程的局限性 | 未明确提及 | 开发一个灵活的单细胞数据分析平台,使研究人员能基于专业知识直接从低维嵌入中选择细胞群体,并结合AI辅助解释增强分析精度 | 单细胞RNA测序数据,包括胰腺组织、外周血单核细胞(PBMC)和肝组织等多个公共数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 大语言模型(DeepSeek/Gemini) | 基因表达数据 | 公共数据集,具体样本量未明确,包括PBMC中极低丰度的血小板和肝组织中仅53个内皮细胞等稀有群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 310 | 2026-06-04 |
ULMnet: inferring physical cell-cell communication networks from scRNAseq data using univariate linear models
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1722504
PMID:41583424
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研究论文 | 开发ULMnet方法,利用单变量线性模型从scRNAseq数据推断物理细胞-细胞通信网络 | 通过识别多重细胞(双细胞)来推断物理细胞相互作用,而非传统的配体-受体分析;方法在预测FACS分选双细胞时灵敏度约56%,精确度达99%,优于现有方法 | 方法依赖多重细胞的检测,可能无法覆盖所有物理相互作用;灵敏度(56%)仍有提升空间 | 从scRNAseq数据中推断物理细胞-细胞通信网络 | scRNAseq数据集,包括细胞对、部分解离组织以及健康和癌症组织的常规scRNAseq数据 | 计算机视觉 | NA | scRNAseq(单细胞RNA测序) | 单变量线性模型 | 基因表达数据(scRNAseq) | 多种数据集:FACS分选双细胞对(已知成分)、部分解离组织、常规scRNAseq数据集 | NA | scRNAseq(单细胞RNA测序) | NA | NA |
| 311 | 2026-06-04 |
Liquid-liquid phase separation-driven molecular subtyping and prognostic modeling in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1741979
PMID:41583431
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研究论文 | 本研究探讨液-液相分离在结直肠癌进展中的作用,并构建基于LLPS的预后模型 | 首次系统分析液-液相分离相关基因在结直肠癌中的表达和预后价值,并构建风险评分模型 | 研究主要基于公共数据库和体外实验验证,缺乏大规模临床队列和体内实验验证 | 阐明液-液相分离在结直肠癌进展中的作用机制,并开发预后预测工具 | 结直肠癌患者样本的基因表达数据和临床信息 | 机器学习, 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序, 空间转录组学 | LASSO回归, Cox比例风险模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 566个结直肠癌样本和19个正常对照 | NA | NA | NA | NA |
| 312 | 2026-06-04 |
Advances in the identification of novel cell signatures in benign prostatic hyperplasia and prostate cancer using single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1684895
PMID:41583437
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序技术在前列腺增生和前列腺癌中发现新型细胞特征的最新进展 | 利用scRNA-seq技术揭示BPH和PCa共享的细胞亚群和分子特征,为理解疾病机制提供新视角 | 由于依赖已有研究,可能未涵盖所有新发现,且scRNA-seq技术的成本和分析复杂性限制了广泛应用 | 探讨BPH和PCa中由scRNA-seq揭示的新型细胞亚群和分子标志物,以改进疾病诊断和治疗 | 良性前列腺增生和前列腺癌的细胞亚群及分子特征 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 313 | 2026-06-04 |
Cuproptosis-driven reprogramming of fibroblast communication by GK is associated with the immune microenvironment in diabetic foot ulcers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1687806
PMID:41583446
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,发现铜死亡相关基因GK与糖尿病足溃疡中成纤维细胞与免疫细胞的通讯重编程及免疫微环境改变有关 | 首次揭示铜死亡在糖尿病足溃疡中通过成纤维细胞为中心的细胞通讯网络调控免疫微环境,并鉴定出GK作为潜在的诊断生物标志物 | 缺乏对GK基因功能机制的深入验证,仅基于生物信息学分析和动物实验,需进一步功能研究确认 | 探究铜死亡相关基因在糖尿病足溃疡中成纤维细胞-免疫细胞通讯中的作用,并鉴定诊断生物标志物 | 糖尿病足溃疡患者皮肤组织样本及SD大鼠模型(正常、伤口、糖尿病伤口组) | 机器学习 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | 单细胞转录组数据及批量转录组数据 | 33,095个细胞(质量控制后25,198个),9只SD大鼠(每组3只) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 314 | 2026-06-04 |
The role of 5-methylcytosine regulator-related genes in diagnostic and immune regulatory functions in atherosclerosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1636323
PMID:41583468
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研究论文 | 研究5-甲基胞嘧啶调控相关基因在动脉粥样硬化诊断和免疫调节中的作用 | 首次系统分析m5C修饰及其调控基因在AS中的诊断和免疫调控功能,并通过单细胞RNA测序和体外实验验证NSUN3在巨噬细胞功能中的关键作用 | 研究主要基于公开微阵列数据集,样本量有限且缺乏大规模临床验证;ceRNA网络仅通过数据库预测,未进行实验验证 | 探究m5C修饰和相关基因在动脉粥样硬化诊断和免疫调节中的功能 | 动脉粥样硬化患者样本和THP-1巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,实时定量PCR,RNA干扰 | LASSO逻辑回归模型,WGCNA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 四个GEO数据集(GSE90074、GSE27034、GSE59421、GSE159677) | NA | 转录组测序 | NA | 来自GEO数据库的微阵列平台相关数据 |
| 315 | 2026-06-04 |
PANoptosis in urological diseases: molecular mechanisms, pathological roles, and emerging therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1729348
PMID:41583472
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综述 | 本文综述了PANoptosis在泌尿系统疾病中的分子机制、病理作用及新兴治疗机会 | PANoptosis是一种新发现的炎症性程序性细胞死亡途径,整合了凋亡、焦亡和坏死性凋亡的特征,超越传统单模式死亡机制,标志着细胞死亡研究的重要进展 | NA | 概述PANoptosis在泌尿系统疾病中(包括急慢性肾损伤、前列腺癌、肾癌和睾丸病变)的分子机制和调控网络,强调其在组织损伤和抗肿瘤免疫中的双重作用 | 泌尿系统疾病,包括急性肾损伤、慢性肾损伤、前列腺癌、肾癌和睾丸病变 | NA | 前列腺癌, 肾癌, 泌尿系统疾病 | 单细胞测序, 空间转录组学, 多组学 | NA | 多组学数据, 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 316 | 2026-06-03 |
Experimental upregulation of Lancl1 promotes axon regeneration after optic nerve injury in vivo
2026-Aug, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2026.115789
PMID:42002019
|
研究论文 | 实验上调Lancl1促进视神经损伤后轴突再生 | 首次发现Lancl1作为一种新型轴突再生促进因子,在视神经损伤后通过AAV2载体靶向视网膜神经节细胞可促进神经保护和轴突再生 | 未发现Lancl1转基因激活mTOR通路的pS6标记,其下游机制需进一步研究 | 探究Lancl1是否直接修复受损的中枢神经系统轴突,并评估其治疗潜力 | 小鼠视网膜神经节细胞(RGCs)及视神经损伤模型 | 神经科学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、AAV2载体介导的基因过表达 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 317 | 2026-06-03 |
Molecular Characterization and Immune Modulation of Schwann Cells in Vestibular Schwannoma
2026-Aug, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70179
PMID:42226390
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序研究前庭神经鞘瘤中施万细胞的分子特征及其免疫调控作用 | 首次鉴定出前庭神经鞘瘤中一种新型施万细胞亚群Schwann 4,该亚群高表达MHC II类分子并与PI3K信号通路、粘着斑和细胞粘附通路相关,揭示了其在肿瘤免疫调控中的潜在功能 | 实验均基于体外和生物信息学分析,药物敏感性分析确定的候选药物在前庭神经鞘瘤中的适用性需要专门的验证 | 阐明前庭神经鞘瘤中施万细胞的分子特征及其对肿瘤微环境的免疫调控机制 | 前庭神经鞘瘤组织中的施万细胞 | 机器学习 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞转录组测序, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 318 | 2026-06-03 |
Integrated single-cell multi-omics analysis identifies fibroblast-like smooth muscle cells as a key driving phenotypic switching during aortic aneurysm progression
2026-Jul, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2026.05.006
PMID:42140576
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研究论文 | 利用单细胞多组学分析鉴定出成纤维细胞样平滑肌细胞是主动脉瘤进展中表型转换的关键驱动因素 | 首次通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据,鉴定出成纤维细胞样平滑肌细胞作为祖细胞样群体,驱动平滑肌细胞表型转换,并揭示KAT5介导的代谢-表观遗传调控轴 | 样本量有限,主要基于公共数据集和体外实验验证,缺乏大规模临床队列验证 | 研究主动脉瘤进展中平滑肌细胞异质性和表型转换的调控机制 | 人类主动脉组织中的平滑肌细胞亚群 | 单细胞多组学 | 主动脉瘤 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、免疫荧光染色、动物模型、体外实验 | NA | 单细胞基因表达数据、单细胞染色质开放性数据 | 健康与主动脉瘤人类主动脉组织样本(具体数量未在摘要中提及) | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 319 | 2026-06-03 |
MOTS-c, a mitochondrial-derived peptide, ameliorates lysosomal membrane permeability and improves survival of soft tissue transplantation
2026-Jun-02, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2026.2677180
PMID:42153537
|
研究论文 | 本研究发现线粒体衍生肽MOTS-c通过抑制PLA2G4A磷酸化,减少溶酶体膜通透性,改善缺血皮瓣的存活 | 首次揭示MOTS-c通过MAPK1-MAPK3-NFKB信号级联调控PLA2G4A-LMP轴,促进自噬并减少内皮细胞焦亡,从而改善组织移植生存率 | 未明确MOTS-c在其他缺血组织模型中的效果以及长期治疗效果 | 研究MOTS-c在缺血皮瓣中的保护作用及其分子机制 | 缺血皮瓣模型和人脐静脉内皮细胞 | 数字病理学 | 缺血性坏死 | RNA-seq, Western blotting, ELISA, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 320 | 2026-06-03 |
Ferroptosis promotes aortic stenosis through 5-lipoxygenase
2026-Jun-02, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehag397
PMID:42227114
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研究论文 | 铁死亡通过5-脂氧合酶促进主动脉瓣狭窄的机制研究 | 首次鉴定ALOX5-ACSL4轴为钙化性主动脉瓣疾病中铁死亡的关键介质,并验证其作为临床干预靶点的转化潜力 | 未说明具体局限性 | 探索铁死亡在钙化性主动脉瓣疾病中的通路机制并验证其临床转化相关性 | 人类主动脉瓣组织样本、手术患者的瓣膜间质细胞、小鼠模型(阿霉素诱导铁死亡模型和钢丝损伤模型) | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据、图像数据 | 212个手术患者主动脉瓣、4874名SCAPIS参与者、273550名UK Biobank参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |