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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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301 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptomics in Inherited Retinal Dystrophies: Current Findings and Emerging Perspectives
2025-Sep-16, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16091088
PMID:41010033
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在遗传性视网膜营养不良研究中的应用现状与前景 | 系统总结了单细胞转录组技术如何揭示传统批量RNA测序无法检测的视网膜特定细胞群在疾病进展中的分子变化 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有文献分析 | 探讨单细胞转录组学如何增进对遗传性视网膜营养不良疾病机制的理解并促进新治疗靶点识别 | 遗传性视网膜营养不良疾病模型和视网膜细胞 | 数字病理学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
302 | 2025-10-05 |
Single-cell multiomics identifies Tcf1 and Lef1 as key initiators of early thymic progenitor fate
2025-Sep-12, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adq8970
PMID:40938954
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术鉴定Tcf1和Lef1作为早期胸腺祖细胞命运的关键启动因子 | 首次结合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序揭示Tcf1和Lef1在早期胸腺祖细胞形成中的关键作用 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究调控早期胸腺祖细胞形成的分子机制 | 小鼠早期胸腺祖细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
303 | 2025-10-05 |
Dual Therapeutic Impact of AXL Inhibitor AB-329: Chemotherapy Sensitization and Immune Microenvironment Reprogramming in TNBC
2025-Sep-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26188896
PMID:41009462
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研究论文 | 本研究评估AXL抑制剂AB-329在三阴性乳腺癌中的双重治疗作用:化疗增敏和免疫微环境重编程 | 首次揭示AXL抑制剂AB-329不仅增强化疗疗效,还能通过增加NK细胞浸润重塑肿瘤免疫微环境 | 研究基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 评估AXL抑制剂AB-329在三阴性乳腺癌中的抗肿瘤疗效和免疫调节潜力 | 三阴性乳腺癌临床前模型,包括小鼠同种移植模型和人源化小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
304 | 2025-10-05 |
Innate and adaptive immune features associated with immune-related adverse events
2025-Sep-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012414
PMID:40930749
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研究论文 | 本研究通过多维度方法分析接受免疫检查点抑制剂治疗患者的免疫特征,揭示免疫相关不良事件的生物学机制 | 首次系统揭示irAE患者基线存在的自身免疫样促炎状态特征,并识别出驱动irAE发生的三个关键轴 | 样本量相对有限,研究主要关注外周免疫特征,未深入探讨组织特异性机制 | 探索免疫检查点抑制剂治疗中免疫相关不良事件的生物学基础 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,多重细胞因子检测,抗核抗体分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,细胞因子数据,抗体数据 | 162名患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
305 | 2025-10-05 |
Cancer Growth and Invasion Are Increased in the Tight Skin (TSK) Mouse
2025-Sep-09, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17182943
PMID:41008788
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研究论文 | 本研究通过使用紧皮(TSK)小鼠模型探究系统性硬化症微环境对癌症进展的影响 | 首次发现TSK小鼠可作为研究系统性硬化症与癌症关联的模型,并揭示了微环境中中性粒细胞-淋巴细胞比率升高和促纤维化细胞群富集的关键变化 | 研究仅使用了三种癌症细胞系,且机制研究仍需深入 | 探究系统性硬化症相关微环境对癌症进展的促进作用 | TSK小鼠和野生型小鼠,以及乳腺癌、黑色素瘤和卵巢癌细胞系 | 癌症生物学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | TSK小鼠和野生型小鼠的多组肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
306 | 2025-10-05 |
Tick Extracellular Vesicles Alter Epidermal Keratinocyte Function
2025-Sep-05, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.037
PMID:40915408
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研究论文 | 本研究揭示了蜱通过细胞外囊泡改变表皮角质形成细胞功能以促进吸血生存的新机制 | 首次发现蜱通过细胞外囊泡干扰皮肤伤口愈合回路,揭示了血液喂养节肢动物的新型生存策略 | 研究主要关注三种医学相关蜱种,需要进一步验证是否适用于其他节肢动物 | 探究蜱如何通过细胞外囊泡改变宿主伤口愈合反应以维持长期附着和促进吸血 | 三种医学相关蜱种(包括肩突硬蜱)及其对小鼠表皮细胞的影响 | 单细胞生物学 | 节肢动物传播疾病 | 单细胞RNA测序,小鼠遗传学,体外划痕实验 | NA | 单细胞转录组数据,体外功能实验数据 | 野生型小鼠和特定蜱种 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
307 | 2025-10-05 |
Single-Cell Sequencing of Human Neural Organoids in a Model of Intracerebral Hemorrhage Reveals Temporally Dynamic Responses to Blood
2025-Sep-04, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.125.051788
PMID:40905149
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析人脑类器官在脑出血模型中对血液暴露的时间动态反应 | 首次在可扩展的人脑类器官模型中系统表征血液诱导的继发性损伤对不同脑细胞类型的时间动态影响 | 使用体外类器官模型而非真实脑组织,可能无法完全模拟体内复杂环境 | 研究脑出血后血液诱导的继发性神经毒性对不同脑细胞类型的影响 | 人脑类器官(包含兴奋性神经元、抑制性神经元、神经祖细胞、星形胶质细胞、内皮细胞和小胶质细胞) | 单细胞生物学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18个类器官,96,725个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
308 | 2025-10-05 |
Predictors of response to CD19 chimeric antigen receptor T-cell therapy in large B-cell lymphoma: a consolidated review
2025-Sep-04, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000001188
PMID:41029962
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综述 | 本文系统回顾了CD19 CAR-T细胞疗法在弥漫大B细胞淋巴瘤中的疗效预测因素 | 整合了患者特异性、肿瘤内在性和治疗相关因素对CAR-T疗效影响的综合视角,并引入免疫分析、影像组学和单细胞转录组学等新型预测工具 | 基于现有文献的回顾性分析,缺乏前瞻性验证数据 | 探讨CD19 CAR-T疗法在弥漫大B细胞淋巴瘤中的疗效预测因素 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者 | 医学研究 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 免疫分析、影像组学、单细胞转录组学 | NA | 临床数据、基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
309 | 2025-10-05 |
Identification of ATG4B and NLRP1 as M1 Macrophage-Activating-Related Plasma Proteins in Systemic Lupus Erythematosus via Multi-Omics Approaches
2025-Sep-02, International archives of allergy and immunology
IF:2.5Q3
DOI:10.1159/000548167
PMID:40892678
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研究论文 | 通过多组学方法鉴定系统性红斑狼疮中与M1巨噬细胞活化相关的血浆蛋白ATG4B和NLRP1 | 整合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、贝叶斯共定位分析和体外M1巨噬细胞实验,首次系统鉴定与SLE相关的M1巨噬细胞活化血浆蛋白 | 研究样本来源有限,主要基于现有数据库和体外实验,需要进一步临床验证 | 鉴定系统性红斑狼疮相关的血浆蛋白,特别是与M1巨噬细胞活化相关的蛋白质 | 系统性红斑狼疮患者、原代人外周血单核细胞、THP-1细胞系 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序,贝叶斯共定位分析,分子动力学模拟,分子对接 | NA | 基因组数据,蛋白质组数据,单细胞转录组数据 | 基于GWAS数据库和FinnGen数据库的SLE患者数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
310 | 2025-10-05 |
Identification of conserved gene expression changes across common glomerular diseases by spatial transcriptomics
2025-Sep, Journal of nephrology
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s40620-025-02233-5
PMID:40067649
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研究论文 | 通过空间转录组学分析多种肾小球疾病中保守的基因表达变化 | 首次使用空间转录组技术系统分析多种肾小球疾病共有的基因表达变化模式 | 样本量有限,仅分析了五种肾小球疾病类型 | 探索不同肾小球疾病共同的分子机制 | 肾小球疾病患者和健康捐赠者的肾脏活检样本 | 空间转录组学 | 肾小球疾病 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 肾小球疾病患者和健康捐赠者各约50岁年龄组 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Digital Spatial Profiler空间转录组平台,使用寡核苷酸条形码技术 |
311 | 2025-10-05 |
NAT10 regulates tumor progression and immune microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma via the N4-acetylated LAMB3-mediated FAK/ERK pathway
2025-Sep, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70045
PMID:40540648
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研究论文 | 本研究揭示了NAT10通过N4-乙酰化修饰LAMB3增强其mRNA稳定性,进而激活FAK/ERK通路促进胰腺导管腺癌进展和免疫抑制微环境的机制 | 首次发现NAT10在PDAC中通过乙酰化修饰LAMB3调控FAK/ERK通路和免疫微环境的新机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床样本验证有限 | 阐明NAT10在PDAC肿瘤恶性进展和肿瘤微环境中的作用机制 | 胰腺导管腺癌组织和细胞系,小鼠皮下肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 生物信息学分析,乙酰化RNA免疫沉淀,定量PCR,RNA免疫沉淀,Western blotting,单细胞RNA测序,多重免疫荧光,流式细胞术 | 动物肿瘤模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞测序数据 | PDAC组织和细胞系,小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
312 | 2025-10-05 |
Single-dose cathepsin L CRISPR nanotherapy mitigates PASC-like lung damage in hamsters
2025-Sep, Nano research
IF:9.5Q1
DOI:10.26599/NR.2025.94907695
PMID:41019839
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研究论文 | 开发针对组织蛋白酶L的单剂量CRISPR纳米疗法,可减轻仓鼠COVID-19急性后遗症相关的肺损伤 | 首次利用CRISPR-CasRx纳米疗法靶向宿主酶组织蛋白酶L,兼具抗病毒和促进肺泡修复的双重机制 | 研究仅在叙利亚仓鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发针对COVID-19急性后遗症肺损伤的新型治疗方法 | 叙利亚仓鼠 | 基因治疗 | COVID-19后遗症 | CRISPR-CasRx基因编辑,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
313 | 2025-10-05 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal Keratinocytes as Key Players in Vulvar Lichen Sclerosus Pathogenesis
2025-Aug-29, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.022
PMID:40886965
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学技术揭示角化细胞在外阴硬化性苔藓发病机制中的核心作用 | 首次整合空间和单细胞转录组学技术系统分析外阴硬化性苔藓,发现角化细胞在疾病中的双重作用机制 | 未明确说明样本规模和具体技术平台细节 | 阐明外阴硬化性苔藓的分子发病机制 | 病变、非病变和健康的外阴皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
314 | 2025-10-05 |
APOBEC3B Promotes SARS-CoV-2 Through Activation of PKR/eIF2⍺ and AMPD2 Dysregulation
2025-Aug-28, Viruses
DOI:10.3390/v17091176
PMID:41012606
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研究论文 | 本研究揭示APOBEC3B通过激活PKR/eIF2α通路和调控AMPD2表达促进SARS-CoV-2感染 | 首次发现A3B在严重COVID-19患者中过表达并通过双重机制促进病毒感染的机制 | 不同细胞系中机制存在差异,具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究APOBEC3B在SARS-CoV-2感染中的作用机制 | 严重COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞、Caco-2细胞、A549-ACE2细胞 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因敲低 | Transformer | 基因表达数据 | 严重与轻度COVID-19患者的BALF细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
315 | 2025-10-05 |
IL-6-Mediated Neurogenic Inflammation Regulated by the Dorsal Root Ganglion Macrophages Exacerbates Imiquimod-Induced Psoriasis-Like Skin Lesions in Mice
2025-Aug-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.07.018
PMID:40784595
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研究论文 | 本研究揭示了背根神经节神经元通过IL-6介导神经源性炎症加剧银屑病样皮肤病变的机制 | 首次发现外周神经系统是IL-6的重要来源,并阐明神经元与巨噬细胞通过IL-1β/MAPK信号通路相互调控的神经免疫机制 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究神经免疫相互作用在银屑病发病机制中的具体作用 | 小鼠背根神经节组织和银屑病样皮肤病变 | 神经免疫学 | 银屑病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠背根神经节组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
316 | 2025-10-05 |
Perturb-seq reveals distinct responses to pluripotency regulator dosages underlying the control of self-renewal and differentiation
2025-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.07.669196
PMID:41031011
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研究论文 | 本研究通过Perturb-seq技术揭示了多能性调控因子剂量对自我更新和分化控制的独特响应模式 | 首次系统性地定量研究关键转录因子剂量梯度对hESC表型的影响,发现谱系特异性基因的非单调响应模式 | 研究仅限于hESC模型,未验证其他细胞类型;CRISPRi可能产生脱靶效应 | 研究转录因子表达水平梯度如何影响细胞表型 | 人类胚胎干细胞(hESCs) | 单细胞基因组学 | NA | CRISPR干扰(CRISPRi), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 定量模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
317 | 2025-10-05 |
Spatial determinants of tumor cell dedifferentiation and plasticity in primary cutaneous melanoma
2025-Jun-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.21.660851
PMID:40667360
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研究论文 | 本研究通过整合多重循环免疫荧光成像、空间转录组学和传统组织学技术,探索早期皮肤黑色素瘤中肿瘤细胞去分化和空间异质性的决定因素 | 首次在早期黑色素瘤中系统揭示肿瘤可塑性和空间异质性的微环境决定因素,展示了从单个癌症到微区域再到单细胞水平的多尺度变异性 | 研究样本仅限于早期原发性皮肤黑色素瘤,对其他类型或晚期黑色素瘤的适用性有待验证 | 识别与早期黑色素瘤中肿瘤细胞去分化和真皮侵袭相关的空间决定因素 | 早期原发性皮肤黑色素瘤组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 循环免疫荧光成像, 空间转录组学, 传统组织学 | NA | 图像, 空间转录组数据, 组织学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
318 | 2025-10-05 |
Deep learning inference of cell type-specific gene expression from breast tumor histopathology
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.04.652089
PMID:41030996
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研究论文 | 开发了一种从乳腺癌组织病理学全玻片图像直接预测细胞类型特异性基因表达的深度学习工具 | 首次实现直接从常规组织病理学图像预测细胞类型特异性基因表达,无需进行单细胞或批量RNA测序 | 在9种细胞类型中仅对癌症相关成纤维细胞、癌细胞和髓系细胞的预测效果最佳 | 开发低成本、快速的细胞类型特异性基因表达推断方法 | 乳腺癌组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 深度学习,单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 深度学习模型 | 全玻片图像,基因表达数据 | TCGA乳腺癌队列和160例独立队列 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
319 | 2025-10-05 |
Niche Macrophages Recycle Iron to Tumor Cells and Foster Erythroblast Mimicry to Promote Bone Metastasis and Anemia
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.23.650120
PMID:41031013
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研究论文 | 本研究揭示了骨髓转移微环境中巨噬细胞通过铁循环促进肿瘤生长和贫血的新机制 | 发现VCAM1+CD163+CCR3+巨噬细胞在骨转移微环境中被肿瘤细胞劫持用于铁获取,并首次报道肿瘤细胞通过模仿红系细胞产生血红蛋白的适应性机制 | 人类样本验证仍需进一步扩展,具体分子调控通路需要更深入研究 | 探究骨转移与贫血之间的机制联系及肿瘤微环境中细胞互作 | 骨髓转移微环境中的巨噬细胞、肿瘤细胞和红系细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌骨转移 | 单细胞RNA测序, 微环境标记 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
320 | 2025-10-05 |
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2025-Apr-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6248794/v1
PMID:40321776
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现HHEX转录因子在肾上腺糖皮质激素生成细胞中富集,并揭示其在维持糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导脂质耗竭中的关键作用 | 首次鉴定HHEX为糖皮质激素生成细胞中最富集的转录因子,并阐明其作为雄激素受体靶基因在肾上腺性别二态性和脂质代谢中的新功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类肾上腺中的相关机制仍需进一步验证 | 探索维持肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞分化响应能力的分子机制 | 小鼠肾上腺皮质类固醇生成谱系细胞 | 单细胞生物学 | 肾上腺功能障碍 | 单细胞RNA测序 | 遗传小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |