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当前共找到 39915 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-05-30 |
Loss of cell junctional components and matrix alterations drive cell desquamation and fibrotic changes in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.17.599411
PMID:38948715
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研究论文 | 本文通过对特发性肺纤维化（IPF）患者远端细支气管进行空间转录组学和空间蛋白质组学分析，揭示了细胞连接成分丢失和基质改变导致细胞脱屑和纤维化变化的机制 | 首次结合空间转录组学与空间蛋白质组学，解析了IPF中上皮细胞脱屑的分子机制，并发现了Collagen IV与连接基因之间的调控关系 | 未明确提及样本量及功能实验的详细验证，结论可能受限于组织样本来源的异质性 | 阐明IPF远端细支气管上皮细胞脱屑的分子机制及其在肺纤维化中的作用 | IPF患者和健康对照的远端细支气管上皮细胞及基底膜 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | IPF患者及无肺病史对照者的组织样本，具体数量未说明 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 302 | 2026-05-30 |
MR1-restricted T cell clonotypes are associated with "resistance" to Mycobacterium tuberculosis infection
2024-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.166505
PMID:38716731
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研究论文 | 本研究探讨MR1限制性T细胞克隆型与结核分枝杆菌感染抵抗性的关联 | 首次揭示MR1限制性T细胞克隆型在结核感染抵抗者中富集，并发现其通过TCR依赖方式识别分枝杆菌感染细胞 | 仅涉及8名捐赠者的样本，且未明确功能验证机制 | 阐明供体非限制性T细胞（DURTs）与结核感染抵抗性的关系 | 乌干达结核病例家庭接触者中的抵抗者（RSTRs）和潜伏感染者（LTBIs） | 机器学习 | 结核病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 8名捐赠者的18,251个MR1T细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于MR1T细胞的转录组分析 |
| 303 | 2026-05-30 |
High-Frequency Spinal Stimulation Suppresses Microglial Kaiso-P2X7 Receptor Axis-Induced Inflammation to Alleviate Neuropathic Pain in Rats
2024-05, Annals of neurology
IF:8.1Q1
DOI:10.1002/ana.26898
PMID:38450773
|
研究论文 | 该文章通过建立临床前脊髓刺激模型，发现高频脊髓刺激可通过抑制小胶质细胞中Kaiso-P2X7受体轴介导的炎症反应，从而缓解大鼠神经病理性疼痛 | 揭示了10kHz高频脊髓刺激通过调控小胶质细胞Kaiso-P2X7R通路减轻神经炎症的新机制，并证明靶向该通路可增强传统脊髓刺激的治疗效果 | 研究仅基于大鼠模型，临床转化仍需验证；未深入探讨HF10 SCS对其他类型免疫细胞或长期效应的具体影响 | 探究高频脊髓刺激缓解神经病理性疼痛的潜在机制，为优化临床脊髓刺激治疗方案提供科学依据 | 神经病理性疼痛大鼠模型的脊髓背角组织及小胶质细胞 | 机器学习 | 神经病理性疼痛 | 大量RNA测序, 单细胞RNA测序, 慢病毒系统基因操作 | NA | 测序数据, 行为学数据 | 神经病理性疼痛大鼠模型样本，未明确具体数量 | Illumina | 大量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina测序平台 | 未提供具体平台配置详情 |
| 304 | 2026-05-30 |
Shotgun lipidomics of human subretinal fluids under rod-dominant retina reveals cone-dominated lipids
2024-03, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.109807
PMID:38278468
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研究论文 | 使用鸟枪法脂质组学鉴定孔源性视网膜脱离患者视网膜下液中的脂质分子，发现其与视锥细胞外节脂质谱相似 | 首次对孔源性视网膜脱离患者视网膜下液进行全面的脂质分子鉴定，并通过与公开单细胞测序数据对比，提出视锥细胞外节降解产物持续释放到光感受器间基质的假设 | 样本量只有两例患者，脂质来源的验证主要依赖公开数据库的基因表达数据，缺乏直接证据 | 阐明孔源性视网膜脱离患者视网膜下液中的脂质成分及其来源，为外视网膜相关疾病发病机制提供线索 | 孔源性视网膜脱离患者视网膜下液样本中的脂质分子 | 数字病理学 | 视网膜疾病（孔源性视网膜脱离） | 鸟枪法脂质组学、质谱、串联质谱、电喷雾电离四极杆飞行时间质谱 | NA | 质谱数据、单细胞测序数据 | 2例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 305 | 2026-05-30 |
Single-cell transcriptomics analysis of cellular heterogeneity and immune mechanisms in neurodegenerative diseases
2024-02, The European journal of neuroscience
DOI:10.1111/ejn.16242
PMID:38221677
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学分析在神经退行性疾病中细胞异质性和免疫机制研究中的应用 | 深入探讨了单细胞转录组学技术在揭示神经退行性疾病中细胞异质性和免疫调控机制方面的最新进展 | NA | 强调单细胞转录组学技术的原理及其在神经退行性疾病细胞异质性和免疫机制研究中的最新进展 | 神经退行性疾病中的单细胞转录组 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2026-05-30 |
Deciphering tumor ecosystems at super resolution from spatial transcriptomics with TESLA
2023-05-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2023.03.008
PMID:37164011
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研究论文 | 提出一种名为TESLA的机器学习框架，通过整合组织学信息和基因表达，在空间转录组数据中实现像素级分辨率的组织注释，揭示肿瘤微环境的超分辨率结构 | 首次利用机器学习方法整合组织学图像与基因表达数据，实现空间转录组像素级分辨率组织注释，能够检测三级淋巴结构等独特肿瘤微环境特征 | 主要验证在癌症领域的应用，虽声称可推广至其他疾病但未充分验证；依赖Visium等低分辨率平台数据的空间覆盖问题 | 开发高分辨率空间转录组数据分析工具，解析肿瘤微环境的细胞组成、空间分布及精细组织结构 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞，包括其丰度、组成和空间定位 | 机器学习， 数字病理学 | 肿瘤疾病 | 空间转录组学 | 机器学习框架 | 图像， 基因表达数据 | 未说明具体样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium低分辨率空间转录组平台 |
| 307 | 2026-05-30 |
JAK-STAT activation contributes to cytotoxic T cell-mediated basal cell death in human chronic lung allograft dysfunction
2023-03-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167082
PMID:36946463
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示JAK-STAT信号激活导致细胞毒性T细胞介导的基底细胞死亡，进而参与人类慢性肺同种异体移植物功能障碍的发生机制 | 首次阐明JAK-STAT信号在气道上皮细胞中激活导致MHC-I上调，从而引起基底细胞被细胞毒性T细胞杀伤的细胞间相互作用机制，为CLAD治疗提供新靶点 | 研究基于离体组织样本，尚需在体模型验证；未明确JAK-STAT信号抑制剂的具体疗效 | 探究慢性肺同种异体移植物功能障碍（CLAD）中气道特异性同种免疫损伤的细胞分子机制 | 人类肺移植受者中CLAD患者的移植肺组织 | 数字病理学 | 慢性肺同种异体移植物功能障碍 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 来自人类肺移植受者（具体样本量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 可能使用10x Chromium Single Cell 3'和10x Visium空间转录组试剂盒 |
| 308 | 2026-05-30 |
Human ureteric bud organoids recapitulate branching morphogenesis and differentiate into functional collecting duct cell types
2023-02, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01429-5
PMID:36038632
|
研究论文 | 本文描述了从人类多能干细胞高效、无血清分化成输尿管芽类器官和功能性集合管细胞的过程 | 首次实现从人类多能干细胞高效分化出输尿管芽类器官，展示分支形态发生并分化为功能性集合管细胞类型，通过单细胞RNA测序验证细胞纯度超过95% | NA | 肾脏再生医学中功能性输尿管和集合管上皮的定向分化 | 人类多能干细胞衍生的输尿管芽类器官和集合管细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 309 | 2026-05-30 |
Navigating the Depths and Avoiding the Shallows of Pancreatic Islet Cell Transcriptomes
2019-07, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi18-0019
PMID:31221802
|
评论 | 评述单细胞RNA测序在解析胰岛β细胞异质性方面的进展与挑战，并对比单细胞与批量测序的应用场景 | 系统评估多个单细胞转录组数据集的一致性，揭示单细胞分辨率下检测限对数据质量的影响 | 主要基于已有数据集的再分析，未提出新实验方法或算法 | 评估单细胞RNA测序对胰岛β细胞异质性的理解，比较其与批量测序的适用性 | 小鼠和人类的α、β、δ胰岛细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据（转录组） | 多个公开的人类和单细胞β细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 310 | 2026-05-30 |
Dissecting direct reprogramming from fibroblast to neuron using single-cell RNA-seq
2016-06-16, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature18323
PMID:27281220
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术解析小鼠胚胎成纤维细胞直接重编程为诱导神经细胞的分子路径 | 首次通过单细胞RNA-seq高分辨率解析直接重编程的中间细胞状态，揭示重编程路径的连续性和早期应答的均质性 | 未明确说明研究局限性 | 阐明成纤维细胞直接转化为神经细胞的重编程分子机制 | 小鼠胚胎成纤维细胞及其诱导神经细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个时间点的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 多时间点单细胞RNA-seq分析 |
| 311 | 2026-05-29 |
Single cell RNA sequencing revealed the mechanism underlying the increased osteogenic capacity of porcine BMSCs upon MSTN knockout
2026-Aug-20, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2026.150202
PMID:42106014
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示MSTN基因敲除增强猪骨髓间充质干细胞成骨能力的机制 | 首次构建了早期培养猪BMSCs的单细胞转录组图谱，并在大型动物模型中阐明MSTN基因敲除增强BMSCs增殖和成骨潜能的机制 | 未提及明显局限性 | 研究MSTN基因敲除对猪骨髓间充质干细胞异质性和成骨能力的影响及机制 | 藏猪胫骨骨髓来源的骨髓间充质干细胞 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq, SCENIC, CellChat | NA | 单细胞转录组数据 | 来自野生型和MSTN基因敲除藏猪的BMSCs样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 312 | 2026-05-29 |
Inferring gene regulatory networks via adversarially regularized directed graph autoencoder
2026-Aug, Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.neunet.2026.108762
PMID:41775092
|
研究论文 | 提出一种基于对抗正则化有向图自编码器的基因调控网络推断方法 | 结合一阶和二阶邻近度捕捉基因调控网络的复杂拓扑结构，并通过对抗训练策略保持基因表达数据的生物统计特性 | 未提及具体局限性 | 提高基因调控网络推断的准确性 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 有向图自编码器 | 基因表达数据 | DREAM5数据集和七个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 313 | 2026-05-29 |
Immunoregulatory mechanisms underlying vitexin-mediated attenuation of concanavalin A-induced liver injury
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158231
PMID:42054738
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞技术，揭示了牡荆素通过调节T细胞功能缓解ConA诱导的肝损伤的免疫调控机制 | 首次采用质谱流式与单细胞RNA测序联合策略，系统描绘牡荆素对肝脏免疫景观的重编程作用，特别是对T细胞亚群的转录异质性和通讯网络的精细解析 | 信息来源未提供具体局限性，可能包括动物模型与人类AIH的差异、剂量依赖性效应的明确机制等 | 探究牡荆素在自身免疫性肝炎中的免疫调节机制及治疗潜力 | ConA诱导的AIH小鼠模型中的肝脏免疫细胞，特别是T细胞亚群 | 数字化病理 | 自身免疫性肝炎 | 质谱流式细胞技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 质谱流式细胞数据 | ConA诱导的AIH小鼠模型（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 采用质谱流式（CyTOF）与单细胞RNA测序（scRNA-seq）联合分析 |
| 314 | 2026-05-29 |
Alveolar macrophage subtypes express cholesterol and inflammation genes in cystic fibrosis
2026-Jul, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503482
PMID:42061984
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析囊性纤维化患者肺泡巨噬细胞亚型，发现表达胆固醇和炎症基因的亚型 | 首次在囊性纤维化患者支气管肺泡灌洗液中鉴定出12种肺泡巨噬细胞亚型，并发现CDKN1A和LDLR表达的巨噬细胞在胆固醇代谢和炎症中的新作用 | 囊性纤维化与健康对照之间的细胞相互作用机制尚不完全清楚，研究样本量有限 | 探究囊性纤维化患者肺泡巨噬细胞的亚型组成及其在肺部炎症中的作用 | 囊性纤维化患者和健康对照者的支气管肺泡灌洗液中的巨噬细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类 | 基因表达数据 | 囊性纤维化患者和健康对照者，具体样本数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 315 | 2026-05-29 |
Single-cell profiling uncovers kaempferol-mediated immunoregulation in the protection against experimental autoimmune hepatitis
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158240
PMID:42066574
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示山奈酚在实验性自身免疫性肝炎中的免疫调节保护机制 | 首次利用单细胞RNA测序和CyTOF技术，在单细胞水平全面揭示山奈酚通过调控M2巨噬细胞扩增、上调Acod1和清除致病性CD8+记忆T细胞亚群缓解自身免疫性肝炎的免疫调节机制 | 基于小鼠模型，其结果向人类的转化需进一步验证；且未对山奈酚的剂量-效应关系及长期安全性进行探讨 | 探究山奈酚缓解实验性自身免疫性肝炎的治疗效果和免疫调节机制 | ConA诱导的实验性自身免疫性肝炎小鼠模型及其肝脏免疫微环境中的免疫细胞 | 免疫学，单细胞组学 | 自身免疫性肝炎 | 单细胞RNA测序，CyTOF，抗体微阵列，多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，免疫细胞蛋白标志物数据，细胞因子数据 | 涉及ConA诱导的小鼠模型，具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用单细胞RNA测序和CyTOF技术，但未提及具体平台产品型号 |
| 316 | 2026-05-29 |
Spatially resolved multi-omics reveals that paeoniflorin ameliorates IgA nephropathy via Oat, Aco1 and Fh-mediated metabolic reprogramming and tubuloimmune crosstalk
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158263
PMID:42096999
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研究论文 | 通过空间代谢组学和空间转录组学整合分析，揭示芍药苷通过Oat、Aco1和Fh介导的代谢重塑及肾小管-免疫交互改善IgA肾病的分子机制 | 首次采用空间多组学技术揭示芍药苷在IgA肾病中肾皮质区域特异的代谢重编程和转录调控机制，阐明了其通过干扰三羧酸循环及上调精氨酸和脯氨酸代谢发挥治疗作用 | 研究数据主要来源于大鼠模型，缺乏临床样本验证；空间多组学技术分辨率有限，可能遗漏部分细胞层面的异质性信息 | 阐明中药单体芍药苷治疗IgA肾病的空间分子机制 | IgA肾病大鼠模型及体外细胞实验 | 数字病理学 | IgA肾病 | 空间代谢组学、空间转录组学、多组学整合分析 | NA | 空间代谢数据、空间转录数据 | Wistar大鼠IgA肾病模型（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学、空间代谢组学 | NA | NA |
| 317 | 2026-05-29 |
Aqueous extract of Solanum nigrum L. restrains colorectal cancer progression by blocking cancer-associated fibroblast-induced STAT3-Annexin A2 signaling
2026-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158257
PMID:42097000
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现，龙葵水提物通过抑制STAT3-Annexin A2信号通路，阻断癌症相关成纤维细胞诱导的结直肠癌进展 | 首次整合单细胞RNA测序和TMT蛋白质组学，揭示龙葵活性成分（茄碱和茄边碱）通过直接靶向STAT3调控ANXA2转录，从而抑制结直肠癌转移的分子机制 | 未说明具体局限性 | 系统研究龙葵水提物的生物活性化学成分及其抗结直肠癌转移的分子机制 | 结直肠癌细胞及小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | NGS, RNA-seq | NA | 图像, 文本 | 皮下异种移植瘤模型、APCMin/+小鼠、实验性转移模型等多种小鼠模型 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 散装RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | NA |
| 318 | 2026-05-29 |
The Sig27 multigene stratifies breast cancer fatality risk via reflecting tumor-associated immune suppressive features
2026-Jul, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102820
PMID:42150332
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研究论文 | 本研究评估了源自前列腺癌的27基因面板Sig27在乳腺癌中的生物标志物潜力 | 首次证明Sig27多基因面板能够通过反映肿瘤相关免疫抑制特征来分层乳腺癌致死风险，并发现其预测价值在21种癌症类型中具有普适性 | 未提及具体局限性 | 评估Sig27基因面板在乳腺癌中的预后生物标志物潜力及其与免疫调控的关联 | 小鼠原位乳腺癌肿瘤、13,103例原发性乳腺癌、60例转移性乳腺癌、780例正常乳腺组织、肿瘤相关巨噬细胞、调节性T细胞和耗竭CD8⁺T细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 13,103例原发性乳腺癌、60例转移性乳腺癌、780例正常乳腺组织、6734例批量RNA-seq样本、2716例乳腺癌样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 319 | 2026-05-29 |
Epigenetic Information Loss and Chronosenescence in Liver Aging: From Molecular Mechanisms to Therapeutic Interventions
2026-Jun-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504570RR
PMID:42205070
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综述 | 本文综述了表观遗传信息丢失和生物钟衰退在肝脏老化中的分子机制及治疗干预策略 | 首次提出“染色质衰老”概念，将肝脏老化定义为调控信息和时序协调紊乱，并整合单细胞多组学、空间转录组学和CRISPR表观遗传编辑等前沿技术证据 | 人类直接因果证据有限，大部分抗衰老策略仍处于临床前或早期转化阶段 | 建立肝脏老化的统一框架，确定可干预的关键节点，为转化医学提供路线图 | 肝脏老化过程中的表观遗传变化、生物钟衰退、代谢功能障碍及其相互关系 | 数字病理学 | 老年病 | 单细胞多组学、空间转录组学、CRISPR表观遗传编辑 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学、空间转录组学 | 10x Chromium | 单细胞多组学和空间转录组学技术平台 |
| 320 | 2026-05-29 |
Machine learning identifies key cells and therapeutic targets during ferroptosis after spinal cord injury
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00037
PMID:39104165
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研究论文 | 利用机器学习识别脊髓损伤后铁死亡过程中的关键细胞及治疗靶点 | 首次通过机器学习算法（随机森林和LASSO）从转录组数据中筛选出Atf3和Piezo1作为脊髓损伤后铁死亡的关键基因，并结合单细胞RNA测序揭示其与巨噬细胞/小胶质细胞状态转变的密切关系，验证了低剂量环己酰亚胺的治疗效果 | 未提及明显局限性 | 探索脊髓损伤后铁死亡的细胞机制并寻找潜在治疗靶点 | 脊髓损伤后的巨噬细胞/小胶质细胞及其铁死亡相关基因表达 | 机器学习 | 脊髓损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | 随机森林, LASSO | 批量RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE47681、GSE5296批量RNA测序数据及GSE162610单细胞RNA测序数据；小鼠T8脊髓损伤模型 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |