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当前共找到 41240 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-07-02 |
Rexiao Kuining decoction ameliorates ulcerative colitis by restoring immune homeostasis via the protein kinase C alpha-FMS-like tyrosine kinase 3 ligand axis: multi-omics evidence
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121985
PMID:42264446
|
论文 | 通过多组学证据揭示热泻快宁汤通过蛋白激酶Cα-FMS样酪氨酸激酶3配体轴恢复免疫稳态，改善溃疡性结肠炎 | 整合网络药理学、药物靶点孟德尔随机化、中介孟德尔随机化、转录组机器学习及单细胞RNA测序的多组学策略，系统揭示了热泻快宁汤通过PKCα-FLT3L轴治疗溃疡性结肠炎的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，缺乏大样本临床试验验证，且机制研究侧重树突状细胞，其他免疫细胞的作用未充分探讨 | 探究热泻快宁汤治疗溃疡性结肠炎的治疗效果和分子机制 | 溃疡性结肠炎患者结肠组织样本、DSS诱导结肠炎小鼠模型、LPS刺激的树突状细胞 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | 超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱质谱、单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 多组学数据（转录组、单细胞转录组、蛋白质组） | 小鼠实验：DSS诱导结肠炎小鼠；体外实验：LPS刺激的树突状细胞；临床样本：溃疡性结肠炎患者及健康对照（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 302 | 2026-07-02 |
Qishen Yiqi dripping pills alleviate myocardial ischemia-reperfusion-induced fibrotic injury by inhibiting fibroblast activation via the transforming growth factor-beta/Periostin pathway
2026-Nov-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.122012
PMID:42269799
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研究论文 | 通过多组学分析结合实验验证，揭示芪参益气滴丸通过抑制TGF-β/Periostin信号通路减轻心肌缺血再灌注后纤维化损伤的机制 | 首次整合单细胞测序、转录组学、网络药理学和分子动力学模拟，系统阐明QSYQ通过靶向TGF-β/Postn轴逆转成纤维细胞活化，并鉴定出毛蕊异黄酮-7-O-β-D-葡萄糖苷和人参皂苷R2为有效成分 | 未提及 | 研究芪参益气滴丸是否通过调节TGF-β/Periostin信号通路抑制成纤维细胞活化，从而减轻心肌缺血再灌注后的纤维化重构 | C57BL/6N小鼠及HL-1心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞测序、转录组测序、网络药理学、分子动力学模拟 | LASSO回归 | 单细胞转录组数据、转录组数据 | 动物实验：C57BL/6N小鼠；细胞实验：HL-1细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 303 | 2026-07-02 |
Gain of function NOTCH4 variants disrupt angiogenesis in systemic sclerosis
2026-Jul, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.12.015
PMID:41644364
|
研究论文 | 本研究结合遗传学、单细胞RNA测序、功能实验和小鼠模型，探讨NOTCH4基因功能获得性变异如何影响系统性硬化症（SSc）患者的血管生成 | 首次在非裔美国人SSc患者中发现NOTCH4基因罕见变异与严重血管病变相关，并揭示其通过增强NOTCH4信号传导抑制血管生成和促进内皮-间质转化（EndoMT）的机制 | 未明确提及研究局限性，但可能包括样本规模有限、种族特异性变异推广性不足以及需要进一步临床试验验证治疗策略 | 探究非裔美国人SSc患者中严重血管表型的遗传病因，并评估NOTCH4通路作为治疗靶点的潜力 | 非裔美国人系统性硬化症患者及其血管病变相关NOTCH4基因功能获得性变异 | 机器学习 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 基因检测 | 小鼠模型 | 基因测序数据, 细胞功能数据 | 非裔美国人SSc患者与对照组人群（具体样本量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 304 | 2026-07-02 |
NT-I7, a Long-Acting Interleukin 7, Increases Lymphocyte Counts and Induces CD8+ T-cell Clonotype Expansion in Patients with Newly Diagnosed High-Grade Gliomas
2026-Jul-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2953
PMID:41880597
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研究论文 | NT-I7（一种长效白细胞介素7）在新诊断高级别胶质瘤患者中增加淋巴细胞计数并诱导CD8+ T细胞克隆型扩增 | 首次在一期临床试验中评估NT-I7在高级别胶质瘤患者中的安全性和最大耐受剂量，并揭示其对CD8+ T细胞选择性克隆型扩增的作用 | 样本量较小，且仅在一部分患者进行了单细胞RNA测序分析 | 评估NT-I7在新诊断高级别胶质瘤患者中的安全性、最大耐受剂量及其对免疫细胞的影响 | 新诊断高级别胶质瘤患者 | 临床试验 | 高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床数据 | 一期临床试验纳入的患者（具体数量未在摘要中给出） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 305 | 2026-07-02 |
Multiomics Analysis Reveals Stromal Cell State Changes and INHBA-Associated Remodeling in Calcific Aortic Valve Disease
2026-Jul, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.126.324799
PMID:42059080
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研究论文 | 通过多组学分析揭示钙化性主动脉瓣疾病中基质细胞状态变化及INHBA相关的重塑机制 | 首次整合全基因组关联研究、单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据，系统描绘了胎儿、健康成人和CAVD瓣膜中基质细胞（VIC和VDSC）的阶段性变化，并发现VDSC1亚群在CAVD中显著富集，同时鉴定出INHBA在VIC成骨重塑中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 阐明钙化性主动脉瓣疾病中细胞和分子机制，特别是基质细胞状态变化及INHBA的作用 | 人胎儿、健康成人和CAVD患者的主动脉瓣膜组织，以及体外培养的瓣膜间质细胞（VICs） | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、全基因组关联研究 | NA | 基因表达数据 | 包含胎儿、健康成人和CAVD瓣膜样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2026-07-02 |
PRECISE: A Prognostic Thyrocyte-Derived Gene Signature for Papillary Thyroid Carcinoma
2026-Jul-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-4488
PMID:42008746
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序开发了一种甲状腺细胞来源的基因特征PRECISE，用于甲状腺乳头状癌的预后评估 | 首次结合单细胞和单核RNA测序数据，开发出甲状腺上皮细胞特异性基因签名，并验证其独立于TNM分期的预后价值 | 未提及具体局限性 | 开发甲状腺乳头状癌的预后生物标志物和风险分层方法 | 甲状腺乳头状癌患者 | 机器学习 | 甲状腺乳头状癌 | 单细胞RNA测序， 单核RNA测序， 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 发现队列109例（含11个肿瘤和4个正常甲状腺样本的snRNA-seq），验证队列65例和370例 | NA | 单细胞RNA测序， 单核RNA测序， 批量RNA测序 | NA | NA |
| 307 | 2026-07-02 |
Therapeutic effect of intranasal nicotinamide adenine dinucleotide in the restoration of olfactory dysfunction
2026-Jul-01, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01761-9
PMID:42380286
|
研究论文 | 探索鼻内烟酰胺腺嘌呤二核苷酸给药在恢复嗅觉功能障碍中的治疗效果 | 首次证明鼻内NAD给药可促进嗅觉感觉神经元再生并恢复嗅觉功能，结合单细胞RNA-seq数据识别了六种神经元标志基因 | 研究仅基于小鼠模型和体外细胞实验，临床转化需进一步验证 | 评估鼻内NAD给药在恢复嗅觉功能障碍中的疗效 | 人嗅觉干细胞和锌诱导的嗅觉缺失小鼠模型 | 机器学习 | 嗅觉功能障碍 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 原位杂交 | NA | 转录组数据 | 人嗅觉干细胞培养样本和小鼠模型样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 308 | 2026-07-02 |
Ablation of the renal tubular gluconeogenic enzyme PCK1 drives AKI-to-CKD transition by negatively regulating the TGF-β/Smad3 signaling pathway
2026-Jul-01, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06310-1
PMID:42380498
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研究论文 | 揭示肾小管糖异生关键酶PCK1通过负调控TGF-β/Smad3信号通路驱动急性肾损伤向慢性肾病转变的机制 | 首次阐明PCK1作为Smad3内源性负调控因子，其缺失释放对Smad3磷酸化和核转位的抑制，导致肾小管上皮特性丧失和纤维化进程 | NA | 探究PCK1在急性肾损伤向慢性肾病转变中的作用及其分子机制 | 急性肾损伤患者及肾小管上皮细胞 | 机器学习 | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类单细胞RNA测序数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 309 | 2026-07-02 |
A hypoxia-responsive migrasome-related lncRNA signature predicts prognosis and suggests the MSC-AS1/ITGA5 axis as a potential therapeutic target in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Jul-01, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01956-3
PMID:42380675
|
研究论文 | 构建了一个低氧响应的迁移体相关长链非编码RNA特征，用于预测头颈鳞状细胞癌预后，并发现MSC-AS1/ITGA5轴作为潜在治疗靶点 | 首次系统性地分析了迁移体相关lncRNA在HNSCC中的临床意义与调控机制，构建了一个10个MRL的预后模型，并揭示了低氧响应的MSC-AS1/ITGA5轴与迁移体相关分子特征的潜在关联 | 研究主要基于TCGA数据库的分析结果，MSC-AS1/ITGA5轴与迁移体相关分子特征的关联尚需直接实验验证 | 探索迁移体相关长链非编码RNA在头颈鳞状细胞癌中的预后意义及其调控机制 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）患者的转录组和临床数据 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO-Cox回归模型 | 转录组数据, 临床数据 | TCGA数据库中的HNSCC样本（具体数量未给出） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 310 | 2026-07-02 |
Hydrogel-Encapsulated Primed MSCs Enhance Regeneration in Full-Thickness Porcine Burn Wounds
2026-Jun-30, Tissue engineering. Part A
DOI:10.1177/19373341261460268
PMID:42377040
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研究论文 | 该研究通过将胰岛素分泌细胞预处理的间充质干细胞封装在水凝胶中，显著加速了猪模型全层烧伤创面的愈合 | 首次将胰岛素分泌细胞预处理与水凝胶封装相结合，优化间充质干细胞的再生功能，并通过单细胞RNA测序揭示其促进细胞外基质稳定、免疫调节和氧化应激抗性的机制 | 研究仅在猪模型中进行，未涉及人体临床试验，且限于5周的观察期，长期效果和安全性有待进一步验证 | 评估胰岛素分泌细胞预处理并封装于水凝胶中的间充质干细胞对全层烧伤创面愈合的治疗效果 | 全层烧伤猪模型 | 数字病理学 | 烧伤 | 单细胞RNA测序、差异丰度测序分析 | NA | 单细胞基因表达数据 | 猪模型，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 311 | 2026-07-02 |
The clinical and molecular landscape of thalamic glioma
2026-Jun-30, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag146
PMID:42377275
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研究论文 | 整合临床病理和多组学数据，明确丘脑胶质瘤的分子特征和手术治疗策略 | 发现H3F3A突变与CDKN2A/B（9p21）缺失的显著互斥性，并确立9p21缺失作为非DMG型丘脑胶质瘤的高度特异性辅助标志物；通过严格因果推断显示显微外科第三脑室造瘘术可将术后脑积水风险降低超过60% | 单中心回顾性研究，样本量相对有限（106例），且多变量分析中术后KPS评分未达到独立预后显著性 | 通过整合临床病理和多组学数据改善丘脑胶质瘤的分子诊断和手术治疗方案 | 106例丘脑胶质瘤患者，包括65例弥漫性中线胶质瘤和41例非弥漫性中线胶质瘤 | 机器学习 | 丘脑胶质瘤 | 基因组测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，单细胞转录组数据 | 106例丘脑胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 312 | 2026-07-02 |
Integrating single-cell RNA sequencing with multi-omics to decode disease microenvironments
2026-Jun-30, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12250-7
PMID:42377616
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序与多组学整合在解码疾病微环境中的应用 | 通过整合单细胞RNA测序与表观基因组学、空间转录组学和时间谱分析等多组学方法，并引入人工智能驱动的深度学习和图模型，提升了数据去噪、聚类和细胞类型注释的能力 | 技术噪声、缺失事件和计算挑战仍然存在 | 强调单细胞RNA测序与多组学整合在解码疾病微环境中的作用 | 疾病微环境中的细胞异质性 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 多组学整合 | 深度学习, 图模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序系统 |
| 313 | 2026-07-02 |
A single-cell atlas identifies oncogenic transcriptional programs and immune escape mechanisms in CTCL
2026-Jun-30, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025032507
PMID:42378251
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研究论文 | 构建单细胞图谱鉴定皮肤T细胞淋巴瘤的致癌转录程序与免疫逃逸机制 | 首次构建最大规模皮肤T细胞淋巴瘤单细胞RNA测序图谱，包含116名患者的超过200万个皮肤和血液细胞，并识别出与GATA-3依赖性转录程序相关的复发转录程序，以及治疗可靶向的弱点 | 未提及具体局限性 | 阐明恶性T细胞中的致癌转录程序及其与肿瘤微环境的相互作用，揭示潜在治疗靶点 | 116名皮肤T细胞淋巴瘤患者的皮肤和血液细胞 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 116名患者的超过200万个皮肤和血液细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 314 | 2026-07-02 |
CAdir: Joint clustering of cells and genes for single-cell transcriptomics with visualization-driven cluster quality assessment
2026-Jun-30, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014418
PMID:42378259
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研究论文 | 提出了一种名为CAdir的聚类算法，用于单细胞RNA-seq数据的细胞和基因联合聚类，并通过可视化驱动的聚类质量评估提升结果的可解释性 | 利用对应分析的几何特性同时聚类细胞和基因，并通过方向角度自动推断聚类数目，提供易于解释的诊断图 | 文中未具体说明局限性，但可能依赖对应分析的假设或在高噪声数据中表现受限 | 改进单细胞转录组聚类结果的可解释性，自动推断聚类数目并提供聚类质量评估工具 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞和基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | CAdir聚类算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 315 | 2026-07-02 |
Rheumatoid factor production is genetically and molecularly distinct from rheumatoid arthritis
2026-Jun-30, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI208390
PMID:42378266
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研究论文 | 本研究定义了类风湿因子（RF）产生及其进展为类风湿关节炎（RA）的遗传、表型和分子结构，发现RF的产生受HLA II类和B细胞调控基因座控制，与黏膜炎症相关，且在遗传和分子层面与RA截然不同 | 首次大规模整合遗传学、蛋白质组学和单细胞转录组学，揭示RF产生与RA进展的分子分化机制，明确RF阳性者携带与粘膜炎症相关的特征而非RA多基因风险 | 未提及具体局限性 | 探究类风湿因子（RF）产生及其向类风湿关节炎（RA）进展的遗传、表型和分子决定因素 | RF阳性无自身免疫疾病的个体和RF阴性对照个体 | 自然语言处理 | 类风湿关节炎、自身免疫性疾病 | 全基因组关联分析（GWAS）、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因型数据、蛋白质表达数据、单细胞转录组数据 | 469,036名英国生物库参与者（其中24,216名RF阳性）和76名ALTRA队列个体 | Illumina | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 316 | 2026-07-02 |
Tranquillyzer: A Neural Network Framework for Long-read Annotation and Demultiplexing
2026-Jun-30, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag055
PMID:42378444
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研究论文 | 提出了 Tranquillyzer，一种基于深度学习的框架，用于长读长单细胞 RNA 测序数据的结构注释和拆分 | 采用全局上下文感知的深度学习模型进行长读长分子的结构推断，实现了高准确度的分子条形码和 UMI 识别，并可快速适配自定义文库结构 | 未明确提及，但可能在处理极端复杂的文库结构或实际大型数据集时仍有性能挑战 | 解决长读长单细胞 RNA 测序中结构复杂读取的解释难题，提高条形码和 UMI 检测的准确性和鲁棒性 | 长读长单细胞 RNA 测序数据中的测序读取（分子） | 机器学习, 生物信息学 | 不适用 | 长读长 RNA 测序, 单细胞 RNA 测序 | 深度学习（卷积神经网络或其他神经网络） | 测序数据（长读长） | 不适用（基于模拟基准测试） | 不适用 | 单细胞 RNA 测序（长读长） | 不适用 | 支持标准长读长单细胞 protocol 和自定义文库架构 |
| 317 | 2026-07-02 |
Molecular mechanisms of erectile dysfunction in type 1 and type 2 diabetic rats: a multiomics approach
2026-Jun-30, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja20267
PMID:42378462
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研究论文 | 通过多组学方法揭示1型和2型糖尿病大鼠勃起功能障碍的共同分子机制 | 首次整合转录组和单细胞RNA测序分析，识别出糖尿病勃起功能障碍中共享的炎症-细胞外基质信号轴，并定位关键基因到基质细胞和神经细胞 | 未明确提及局限性 | 揭示1型和2型糖尿病勃起功能障碍的共同分子机制 | 1型和2型糖尿病大鼠模型的海绵体组织 | 机器学习 | 糖尿病, 勃起功能障碍 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, qPCR, Western blot | 机器学习（用于优先级排序） | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 大鼠模型（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2026-07-02 |
CSCN: Inference of Cell-Specific Causal Networks Using Single-Cell RNA-Seq Data
2026-Jun-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag480
PMID:42378449
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研究论文 | 提出 CSCN 框架，利用单细胞 RNA-seq 数据推断细胞特异的因果网络模型 | 首次将因果发现技术与 kd-tree 和位图索引结合，在单细胞水平推断有向因果基因调控网络，有效抑制间接和虚假关联 | 未提及在高噪声或低覆盖度单细胞数据上的性能表现，以及因果发现计算复杂度可能随细胞数量增加而快速增长 | 开发一种能够推断单细胞水平有向因果基因调控关系的方法，以揭示细胞间的调控异质性 | 单细胞 RNA-seq 数据，涵盖多个数据集及多组学场景 | 机器学习 | NA | 单细胞 RNA-seq | 因果发现模型 | 基因表达数据 | 九个 scRNA-seq 数据集及多个跨模态数据集 | NA | 单细胞 RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 319 | 2026-07-02 |
conMItion: an R package adjusting confounding factors for associations in multi-omics
2026-Jun-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag472
PMID:42378451
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研究论文 | 介绍了一个用于多组学数据中调整混杂因素进行关联分析的R包conMItion | 开发了计算条件互信息及其统计显著性的R包，能够灵活调整一个或两个混杂因素，适用于多组学数据 | 仅能调整一个或两个混杂因素，对更多混杂因素的处理能力有限 | 开发一个调整混杂因素的互信息关联分析方法，用于癌症多组学数据中识别癌症相关基因、基因特征和基因调控网络 | 癌症多组学数据，包括膀胱癌的染色体拷贝数变异表达数据和肺癌肿瘤微环境的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 膀胱癌, 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 320 | 2026-07-02 |
Single-Cell Transcriptomics and Mendelian Randomization Analysis Reveal Key Genes in Atrial Fibrillation
2026-Jun-30, Journal of cardiovascular electrophysiology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/jce.70432
PMID:42378484
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和孟德尔随机化分析识别心房颤动的关键基因 | 首次结合单细胞转录组学与孟德尔随机化分析，发现SPP1阳性巨噬细胞在心房颤动中的关键作用，并鉴定LRCH1、RSRC2和VAMP2为新的因果基因 | 未在独立队列或功能实验中验证因果基因的机制 | 识别心房颤动中关键的细胞亚型和治疗靶点 | 心房颤动患者的心脏组织细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |