单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
301	2025-06-18	Advances in epigenetic studies of plant cadmium stress 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1489155 PMID:40520647	综述	本文综述了植物对镉胁迫的表观遗传响应及其机制，旨在为分析主要作物重金属胁迫的表观遗传机制提供理论见解	结合基因组学、单细胞测序、stereo-seq等先进技术与表观基因组学、植物遗传学和分子生物学技术，全面深入研究植物在镉暴露后的表观遗传变化	NA	分析植物对镉胁迫的表观遗传机制，为可持续农业和重金属污染土壤的生物修复提供理论支持	植物对镉胁迫的表观遗传响应	植物生物学	NA	基因组学、单细胞测序、stereo-seq、表观基因组学、植物遗传学和分子生物学技术	NA	NA	NA
302	2025-06-18	Glutamine antagonist DRP-104 suppresses tumor growth and enhances response to checkpoint blockade in KEAP1 mutant lung cancer 2023-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.06.27.546750 PMID:37425844	research paper	研究新型谷氨酰胺拮抗剂DRP-104在KEAP1突变肺癌中抑制肿瘤生长并增强检查点阻断反应的效果	首次证明DRP-104通过抑制谷氨酰胺依赖性核苷酸合成和增强抗肿瘤T细胞反应来抑制KEAP1突变肿瘤生长，并与抗PD1疗法联合使用	研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证	开发针对KEAP1突变肺癌的靶向治疗方法	KEAP1突变肺癌	肿瘤学	肺癌	多模态单细胞测序和功能实验	NA	NA	患者来源的异种移植模型和抗原性原位肺癌模型
303	2025-06-17	Astrocytic AEG-1 drives neuroinflammation and enhances seizure susceptibility 2025-Aug, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2025.106957 PMID:40383165	研究论文	本研究探讨了星形胶质细胞中AEG-1基因在神经炎症和癫痫易感性中的作用	首次揭示了AEG-1通过NF-κB信号通路介导神经炎症和癫痫易感性的机制	研究主要基于小鼠模型和体外培养的星形胶质细胞，人类临床相关性尚待验证	探究AEG-1在神经炎症和癫痫发病机制中的作用	小鼠模型和体外培养的星形胶质细胞	神经科学	癫痫	单细胞RNA测序	小鼠炎症模型	基因表达数据	NA
304	2025-06-17	Multi-omics characterization of oncosis in spinal cord injury 2025-Aug, Neurobiology of disease IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.nbd.2025.106982 PMID:40467009	研究论文	本研究通过多组学方法描述了脊髓损伤后细胞肿胀性坏死的特征	首次绘制了脊髓损伤后肿胀性坏死相关基因的时空表达图谱	研究主要基于动物模型，人类样本验证不足	阐明肿胀性坏死在脊髓损伤中的作用机制	脊髓损伤后的细胞死亡过程	生物医学研究	脊髓损伤	RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qRT-PCR, 免疫荧光, TEM	NA	基因表达数据, 图像数据	大鼠脊髓损伤模型和LPS处理的PC12细胞系
305	2025-06-17	FCGR2A contributes to M2 macrophages polarization in HCC through IL-4/JAK/STAT6 axis 2025-Aug, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102429 PMID:40482466	研究论文	本文研究了FCGR2A在肝细胞癌（HCC）中通过IL-4/JAK/STAT6轴促进M2巨噬细胞极化的机制	揭示了FCGR2A通过IL-4/JAK/STAT6轴促进M2巨噬细胞极化的新机制，为HCC治疗提供了新的靶点	研究主要集中在体外和动物模型，临床样本验证有待进一步研究	探究FCGR2A在HCC肿瘤微环境中对巨噬细胞极化的调控机制	肝细胞癌（HCC）肿瘤微环境中的巨噬细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	单细胞测序	NA	基因表达数据	NA
306	2025-06-17	Single-cell sequencing and machine learning reveal the role of dioxin-interacting genes in HCC prognosis and immune microenvironment 2025-Jul-15, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118484 PMID:40483782	研究论文	通过单细胞测序和机器学习揭示了二恶英相互作用基因在肝细胞癌预后和免疫微环境中的作用	结合单细胞和批量转录组分析及机器学习，识别了与免疫逃逸、代谢重编程和细胞周期调控相关的二恶英相互作用差异表达基因（DI-DEGs），并构建了预后模型	分子机制仍需进一步研究，实验验证仅限于体外	探究二恶英在肝细胞癌（HCC）发展中的分子机制及其对预后和免疫微环境的影响	肝细胞癌（HCC）患者和二恶英相互作用基因	数字病理学	肝癌	单细胞测序、批量转录组分析、机器学习、分子对接	机器学习模型	转录组数据	未明确提及具体样本数量
307	2025-06-17	Plaque erosion risk and JAK2 V617F variant 2025-Jun-16, European heart journal IF:37.6Q1 DOI:10.1093/eurheartj/ehaf114 PMID:40053703	research paper	该研究探讨了JAK2 V617F变异与心肌梗塞（MI）两种机制——斑块侵蚀和斑块破裂之间的具体关联	首次明确了JAK2 V617F变异与斑块侵蚀风险之间的显著关联，并通过单细胞RNA测序揭示了中性粒细胞激活的潜在机制	研究样本主要来自单一中心，可能限制结果的普遍性	探究JAK2 V617F变异与心肌梗塞不同机制之间的关联	728例斑块侵蚀患者、919例斑块破裂患者和804例对照个体	心血管疾病研究	心血管疾病	数字滴PCR、单细胞RNA测序	逻辑回归分析	基因测序数据、临床数据	728例侵蚀病例、919例破裂病例和804例对照
308	2025-06-17	An Efficient Organoid Cutting Method for Long-Term Culture and High-Throughput Analyses 2025-Jun-16, Tissue engineering and regenerative medicine IF:4.4Q2 DOI:10.1007/s13770-025-00731-y PMID:40522442	research paper	该研究介绍了一种高效的类器官切割方法，用于增强长期培养并实现高通量分析	采用3D打印技术制造切割夹具，提高了切割效率和一致性，同时设计了模具方法用于创建密集排列的类器官阵列和冷冻切片	未提及具体样本量或实验重复次数，可能影响结果的普遍性	解决类器官长期培养中的缺氧和营养限制问题，提高培养效率和样本制备一致性	人多能干细胞（hPSC）衍生的类器官	生物医学工程	NA	3D打印技术，类器官培养技术	NA	生物样本	NA
309	2025-06-17	Decoding meningioma prognosis with multi-omics: macrophage diversity, immune-CNV interplay, and novel SPP1-targeted strategies 2025-Jun-16, Journal of neuro-oncology IF:3.2Q2 DOI:10.1007/s11060-025-05116-8 PMID:40522564	研究论文	通过多组学方法解码脑膜瘤预后，探索巨噬细胞多样性、免疫-CNV相互作用及新型SPP1靶向策略	首次结合DNA甲基化和单细胞转录组学对脑膜瘤进行分子分型，揭示了SPP1在巨噬细胞功能和预后中的关键调控作用	样本量相对有限（302对样本），且需要进一步实验验证SPP1靶向治疗的效果	探索脑膜瘤的分子分型及其与预后的关系，寻找潜在治疗靶点	302对脑膜瘤样本	数字病理	脑膜瘤	DNA甲基化测序、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq(scRNA-seq)	SCISSOR、scRank	基因组数据、转录组数据	302对脑膜瘤样本
310	2025-06-17	Multiomics identifies tumor-intrinsic SREBP1 driving immune exclusion in hepatocellular carcinoma 2025-Jun-15, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2025-011537 PMID:40518290	研究论文	通过多组学分析鉴定出肝细胞癌中肿瘤内在的SREBP1驱动免疫排斥	发现SREBP1作为免疫排斥的中心调控因子，并通过脂质生物合成途径影响肿瘤微环境	研究样本量虽大，但实验验证主要基于体外模型，临床前研究需进一步验证	寻找克服肝细胞癌免疫检查点抑制剂耐药的新治疗靶点	肝细胞癌患者样本及体外培养的肿瘤细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	RNA-seq, 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq, 成像质谱细胞术, 空间脂质组学	3D共培养模型	多组学数据（转录组、蛋白质组、单细胞转录组、脂质组）	900+人类样本（RNA-seq, 蛋白质组学）, 31个肿瘤单细胞RNA-seq样本
311	2025-06-17	Identification of potential drug targets for erectile dysfunction with single-cell RNA sequencing: A Mendelian randomization study 2025-Jun-15, Andrology IF:3.2Q1 DOI:10.1111/andr.70082 PMID:40518741	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，识别了勃起功能障碍（ED）的潜在药物靶点	结合孟德尔随机化和单细胞RNA测序技术，发现了两个新的ED药物靶点，并验证了它们在特定细胞类型中的表达	研究依赖于现有的eQTL数据和ED统计摘要，可能受到样本来源和数量的限制	识别勃起功能障碍的新药物靶点，以改善当前治疗效果不佳的问题	勃起功能障碍患者	生物医学研究	勃起功能障碍	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、孟德尔随机化（MR）、分子对接	NA	基因表达数据、SNP数据	eQTLGen Consortium的31,684个体；两个ED队列共325,158个体（7,329 ED病例，317,829对照）
312	2025-06-17	Advances in single-cell omics: Transformative applications in basic and clinical research 2025-Jun-14, Current opinion in cell biology IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.ceb.2025.102548 PMID:40517461	综述	本文综述了单细胞组学技术在基础和临床研究中的变革性应用	展示了单细胞组学技术在揭示细胞互作、疾病机制和治疗反应中的新见解，特别是在癌症和神经发育障碍等异质性疾病中	NA	探讨单细胞组学技术在生物学和临床应用中的关键作用	单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学整合技术在复杂组织解析中的应用	生物信息学	癌症、神经发育障碍	单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合	NA	单细胞组学数据	NA
313	2025-06-17	ISLR knockdown enhances radiotherapy-induced anti-tumor immunity by disrupting the Treg-mregDC-lymphoid niche in triple-negative breast cancer 2025-Jun-14, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114988 PMID:40517736	研究论文	本研究探讨了放疗如何通过调节ISLR表达影响三阴性乳腺癌的免疫治疗效果	揭示了ISLR通过调控MIF/CD74信号通路在免疫逃逸中的关键作用，并证明靶向ISLR可增强放疗和免疫治疗的协同效应	研究主要基于细胞系和小鼠模型，尚未在临床患者中验证	探索放疗对ISLR表达的调节作用及其对三阴性乳腺癌免疫治疗的影响	三阴性乳腺癌细胞系(MDA-MB-231)和小鼠移植瘤模型	肿瘤免疫学	三阴性乳腺癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学分析	小鼠异种移植模型	基因表达数据、细胞功能数据	细胞系实验和小鼠模型(具体数量未明确说明)
314	2025-06-17	Chemokine CCL12 in trigeminal ganglion contributes to CFA-induced mechanical allodynia in mice 2025-Jun-13, Neuroscience IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.neuroscience.2025.06.026 PMID:40517940	研究论文	本研究探讨了CCL12在三叉神经节中对CFA诱导的小鼠机械性异常性疼痛的作用	揭示了CCL12通过促进巨噬细胞浸润及IL-6和TNF-α的产生，在CFA诱导的口面部异常性疼痛中的作用	研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类样本	研究CCL12在慢性炎症性疼痛中的作用机制	小鼠三叉神经节	神经科学	慢性疼痛	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫荧光	小鼠疼痛模型	基因表达数据, 行为数据	未明确说明小鼠数量
315	2025-06-17	Single cell RNA-sequencing reveals BHLHE40 and NDRG1 as key regulatory molecules modulating the trophoblastic senescence in preeclampsia 2025-Jun-11, Placenta IF:3.0Q2 DOI:10.1016/j.placenta.2025.06.009 PMID:40517485	研究论文	通过单细胞RNA测序技术揭示了BHLHE40和NDRG1在调节子痫前期滋养层细胞衰老中的关键作用	首次发现BHLHE40和NDRG1是调节子痫前期滋养层细胞衰老的关键分子，并验证了其临床预测价值	研究主要基于生物信息学分析和体外实验，需要更多体内实验验证	探究子痫前期滋养层细胞衰老的分子机制和关键调控靶点	子痫前期患者的胎盘组织和LPS诱导的子痫前期大鼠模型	生物信息学	子痫前期	单细胞RNA测序(scRNA-seq), ChIP检测, 批量转录组测序, WGCNA分析	nomogram预测模型	基因表达数据	多个GEO数据集(GSE173193, GSE24129, GSE75010)和实验验证样本
316	2025-06-17	Specificity protein 1 suppresses prohibitin 1 to induce macrophage M1 polarization and impair phagocytosis, exacerbating sepsis-associated acute lung injury 2025-Jun-05, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.05.434 PMID:40482976	研究论文	本研究探讨了特异性蛋白1（SP1）和抑制蛋白1（PHB1）轴在脓毒症相关急性肺损伤（ALI）中调控巨噬细胞极化和功能的作用	首次揭示了SP1通过转录抑制PHB1表达，促进巨噬细胞M1极化并损害吞噬功能，从而加剧脓毒症诱导的ALI	未来研究需要探索针对调节巨噬细胞极化和改善脓毒症相关ALI免疫稳态的靶向治疗	研究脓毒症相关急性肺损伤的分子机制及潜在治疗靶点	巨噬细胞极化和功能	分子生物学与免疫学	脓毒症相关急性肺损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、高通量测序（HTS）、机器学习（ML）算法、免疫荧光、ELISA、RT-qPCR、Western blot	NA	基因表达数据、蛋白质数据	使用盲肠结扎穿孔（CLP）诱导的小鼠模型进行体内外研究
317	2025-06-17	Role and Validation of Lactylation-Related Gene Markers in Postmenopausal Osteoporosis 2025-Jun, Applied biochemistry and biotechnology IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s12010-025-05216-1 PMID:40131629	研究论文	本研究探讨了乳酰化相关基因标记在绝经后骨质疏松症中的作用及其验证	首次结合单细胞RNA测序和转录组数据，利用多组学数据和机器学习算法识别与PMOP因果相关的基因及诊断基因	研究样本来源和数量未明确说明，可能影响结果的普适性	探究乳酰化相关基因在绝经后骨质疏松症发展中的具体作用及其作为诊断标志物的潜力	绝经后骨质疏松症患者	数字病理学	骨质疏松症	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 转录组分析, 孟德尔随机化(MR)分析	多种机器学习算法组合	单细胞RNA测序数据, 转录组数据	NA
318	2025-06-17	Genetic and genomic insights into male reproductive tract development 2025-Jun, Fertility and sterility IF:6.6Q1 DOI:10.1016/j.fertnstert.2025.03.024 PMID:40174856	综述	本文回顾了男性生殖道（MRT）发育的遗传和基因组分析，强调了单细胞测序在发现细胞类型和细胞过程中的应用	利用单细胞测序技术揭示了MRT发育中的细胞类型和过程，并系统性地整理了与MRT发育相关的表型术语和基因	小鼠数据与人类数据在表型术语和基因关联上存在差异，需要进一步的知识协调	理解男性生殖道发育的遗传基础及其与成年后医疗结果的关系	男性生殖道发育相关的基因和表型	基因组学	男性生殖系统疾病	单细胞RNA测序	NA	基因组数据	涉及269个独特基因和35个表型术语
319	2025-06-17	Pathological α-synuclein dysregulates epitranscriptomic writer METTL3 to drive neuroinflammation in microglia 2025-May-27, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.115618 PMID:40279247	research paper	该研究探讨了m6A甲基转移酶复合物中的METTL3在α-突触核蛋白和锰诱导的神经炎症中的作用	揭示了METTL3在α-突触核蛋白和锰诱导的神经炎症中的新作用，特别是在小胶质细胞中的调控机制	研究主要基于体外和动物模型，人类组织样本的分析仍需进一步验证	探究m6A RNA修饰在神经退行性疾病中的作用机制	人类小胶质细胞、星形胶质细胞、阿尔茨海默病（AD）、帕金森病（PD）和路易体痴呆（DLB）患者的死后组织	神经科学	神经退行性疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据、组织样本	人类死后组织样本及体外培养的细胞模型
320	2025-06-17	Transcription factors that define the epigenome structures and transcriptomes in microglia 2025-May-25, Experimental hematology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.exphem.2025.104814 PMID:40425139	研究论文	本文探讨了转录因子如何通过定义小胶质细胞的表观基因组结构和转录组来维持大脑健康	识别了PU.1、IRF8、SALL1和SMAD4这四个转录因子作为小胶质细胞身份的决定因素，并揭示了它们如何与其他转录因子协同作用	未提及具体实验的样本量或研究范围限制	研究小胶质细胞转录组程序的调控机制及其在神经炎症和神经退行性疾病中的作用	小胶质细胞及其转录因子	表观遗传学	神经退行性疾病	ATAC-seq, ChIP-seq/CUT&RUN, 单细胞RNA-seq	NA	基因组数据	NA