单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-02 |
Cancer Growth and Invasion Are Increased in the Tight Skin (TSK) Mouse
2025-Sep-09, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17182943
PMID:41008788
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研究论文 | 本研究通过对比TSK小鼠与野生型小鼠的肿瘤形成能力，揭示了系统性硬化症微环境促进癌症进展的机制 | 首次探索TSK小鼠作为癌症研究模型的潜力，发现其微环境能促进多种癌症的侵袭性生长 | 研究仅使用小鼠模型，结果向人类临床应用的转化需要进一步验证 | 探究TSK小鼠改变的微环境对癌症进展的影响 | TSK小鼠和野生型小鼠，使用乳腺癌、黑色素瘤和卵巢癌细胞系 | 癌症研究 | 系统性硬化症 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 使用三种癌症细胞系在TSK和WT小鼠中进行皮下和腹腔内注射实验 |
| 302 | 2025-10-02 |
Tick Extracellular Vesicles Alter Epidermal Keratinocyte Function
2025-Sep-05, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.037
PMID:40915408
|
研究论文 | 本研究揭示了蜱类通过细胞外囊泡改变表皮角质形成细胞功能以促进吸血生存的新机制 | 首次发现蜱类通过细胞外囊泡干扰皮肤伤口愈合过程，揭示了吸血节肢动物生存的新策略 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类系统中验证 | 探索蜱类如何通过细胞外囊泡调控宿主伤口愈合反应以维持长期附着和吸血 | 三种医学相关蜱种（包括肩板硬蜱）及其与小鼠表皮角质形成细胞的相互作用 | 寄生虫学与宿主-病原体相互作用 | 节肢动物传播疾病 | 单细胞RNA测序、小鼠遗传学、体外划痕实验 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据 | 使用野生型小鼠和特定蜱种进行实验 |
| 303 | 2025-10-02 |
Single-Cell Sequencing of Human Neural Organoids in a Model of Intracerebral Hemorrhage Reveals Temporally Dynamic Responses to Blood
2025-Sep-04, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.125.051788
PMID:40905149
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析人脑类器官在脑出血模型中对血液暴露的时序动态反应 | 首次在可扩展的人脑类器官模型中系统表征血液诱导的继发性损伤对不同脑细胞类型的时序特异性影响 | 研究基于体外类器官模型，可能与体内真实脑出血环境存在差异 | 阐明脑出血后血液暴露对不同脑细胞类型的时序特异性转录组影响 | 人脑类器官包含兴奋性神经元、抑制性神经元、神经祖细胞、星形胶质细胞、内皮细胞和小胶质细胞 | 单细胞测序 | 脑出血 | 单细胞RNA测序 | 人脑类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 18个类器官中的96,725个细胞 |
| 304 | 2025-10-02 |
Predictors of response to CD19 chimeric antigen receptor T-cell therapy in large B-cell lymphoma: a consolidated review
2025-Sep-04, Current opinion in oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1097/CCO.0000000000001188
PMID:41029962
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综述 | 本文对CD19 CAR-T细胞疗法在弥漫大B细胞淋巴瘤中的疗效预测因子进行了系统性综述 | 整合了患者特异性、肿瘤内在性和治疗相关因素对CAR-T疗效影响的最新研究进展，并探讨了免疫分析、影像组学和单细胞转录组学等新型预测方法 | 作为综述文章，主要基于现有文献分析，缺乏原始研究数据的验证 | 深入理解CD19 CAR-T疗法在弥漫大B细胞淋巴瘤中的疗效预测因素，以指导患者选择和治疗优化 | 接受CD19 CAR-T细胞治疗的复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者 | 肿瘤免疫治疗 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 免疫分析、影像组学、单细胞转录组学 | NA | 临床数据、基因组数据、影像数据、转录组数据 | NA |
| 305 | 2025-10-02 |
Identification of ATG4B and NLRP1 as M1 Macrophage-Activating-Related Plasma Proteins in Systemic Lupus Erythematosus via Multi-Omics Approaches
2025-Sep-02, International archives of allergy and immunology
IF:2.5Q3
DOI:10.1159/000548167
PMID:40892678
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研究论文 | 通过多组学方法鉴定系统性红斑狼疮中与M1巨噬细胞活化相关的血浆蛋白ATG4B和NLRP1 | 首次整合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、贝叶斯共定位分析和体外M1巨噬细胞实验，系统性鉴定SLE相关血浆蛋白 | 未发现这些蛋白与其他复杂性状的显著关联，研究范围主要集中于M1巨噬细胞相关机制 | 鉴定系统性红斑狼疮相关的血浆蛋白，特别是与M1巨噬细胞活化相关的蛋白质 | 系统性红斑狼疮患者血浆样本、原代人外周血单核细胞、THP-1细胞系 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 多组学方法、孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、贝叶斯共定位、分子动力学模拟 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 使用GWAS数据和FinnGen SLE数据进行验证，具体样本数量未明确说明 |
| 306 | 2025-10-02 |
Identification of conserved gene expression changes across common glomerular diseases by spatial transcriptomics
2025-Sep, Journal of nephrology
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s40620-025-02233-5
PMID:40067649
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析多种肾小球疾病的共同基因表达变化 | 首次使用空间转录组学技术系统比较多种肾小球疾病的共同基因表达特征，发现35个一致下调基因 | 样本量相对有限，仅分析了五种肾小球疾病类型 | 探索不同肾小球疾病共有的分子机制和基因表达通路 | 肾小球疾病患者和肾脏捐赠者的肾活检标本 | 空间转录组学 | 肾小球疾病 | GeoMx Digital Spatial Profiler空间转录组分析，Xenium和免疫荧光染色验证 | NA | 空间转录组数据，基因表达数据 | 肾小球疾病患者和肾脏捐赠者（平均年龄49.5岁），具体样本数未明确说明 |
| 307 | 2025-10-02 |
NAT10 regulates tumor progression and immune microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma via the N4-acetylated LAMB3-mediated FAK/ERK pathway
2025-Sep, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.70045
PMID:40540648
|
研究论文 | 本研究揭示了NAT10通过N4-乙酰化修饰LAMB3增强其mRNA稳定性，进而激活FAK/ERK通路促进胰腺导管腺癌进展和免疫抑制微环境形成的机制 | 首次发现NAT10在PDAC中通过LAMB3/FAK/ERK通路调控肿瘤进展和免疫微环境，并证明PD-1/PD-L1抑制剂可逆转NAT10介导的免疫抑制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证相对有限 | 阐明NAT10在PDAC肿瘤恶性进展和肿瘤微环境中的作用机制 | 胰腺导管腺癌组织和细胞系，小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 生物信息学分析、乙酰化RNA免疫沉淀、定量PCR、Western blot、单细胞RNA测序、多重免疫荧光、流式细胞术 | 小鼠皮下肿瘤模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、单细胞测序数据、免疫细胞分型数据 | PDAC组织和细胞系，小鼠模型 |
| 308 | 2025-10-02 |
Single-dose cathepsin L CRISPR nanotherapy mitigates PASC-like lung damage in hamsters
2025-Sep, Nano research
IF:9.5Q1
DOI:10.26599/NR.2025.94907695
PMID:41019839
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研究论文 | 开发了一种靶向宿主酶组织蛋白酶L的单剂量CRISPR纳米疗法，可减轻仓鼠的COVID-19长期肺损伤 | 首次使用CRISPR-CasRx纳米疗法同时实现宿主导向的病毒抑制和促进肺泡上皮修复的双重机制 | 目前仅在叙利亚仓鼠模型中进行验证，尚未进行人体临床试验 | 开发针对COVID-19急性感染和长期肺损伤的新型治疗方法 | 叙利亚仓鼠模型 | 基因治疗 | COVID-19后遗症 | CRISPR-CasRx基因编辑技术、单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据、病理学数据 | 叙利亚仓鼠实验模型 |
| 309 | 2025-10-02 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal Keratinocytes as Key Players in Vulvar Lichen Sclerosus Pathogenesis
2025-Aug-29, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.022
PMID:40886965
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学技术揭示角化细胞在外阴硬化性苔藓发病机制中的核心作用 | 首次整合空间和单细胞转录组学技术系统解析外阴硬化性苔藓的分子病理机制，发现角化细胞在疾病中的双重作用 | 未明确说明样本规模和研究人群特征 | 探索外阴硬化性苔藓的分子发病机制并寻找潜在生物标志物和治疗靶点 | 外阴硬化性苔藓患者的病变、非病变皮肤组织及健康外阴皮肤组织 | 数字病理学 | 外阴硬化性苔藓 | 空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 310 | 2025-10-02 |
APOBEC3B Promotes SARS-CoV-2 Through Activation of PKR/eIF2⍺ and AMPD2 Dysregulation
2025-Aug-28, Viruses
DOI:10.3390/v17091176
PMID:41012606
|
研究论文 | 本研究揭示了APOBEC3B通过激活PKR/eIF2α通路和调控AMPD2表达促进SARS-CoV-2感染的机制 | 首次发现A3B在重症COVID-19患者中过表达并通过双重机制（PKR/eIF2α通路和AMPD2调控）促进病毒感染的分子机制 | 在不同细胞系中A3B的作用机制存在差异，具体分子细节仍需进一步阐明 | 探究APOBEC3B在SARS-CoV-2感染过程中的作用机制 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞、Caco-2细胞、A549-ACE2细胞 | 分子生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、基因敲低、机器学习预测 | Transformer | 基因表达数据、临床样本数据 | 重症和轻症COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液细胞样本 |
| 311 | 2025-10-02 |
IL-6-Mediated Neurogenic Inflammation Regulated by the Dorsal Root Ganglion Macrophages Exacerbates Imiquimod-Induced Psoriasis-Like Skin Lesions in Mice
2025-Aug-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.07.018
PMID:40784595
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研究论文 | 本研究揭示了外周神经系统通过IL-6调控银屑病发展的神经免疫机制 | 首次发现背根神经节中特定神经元群能分泌IL-6，并阐明巨噬细胞通过IL-1β/MAPK信号通路调控神经元IL-6表达的互作机制 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探讨神经免疫相互作用在银屑病发病机制中的具体作用 | 小鼠背根神经节组织及银屑病样皮肤病变 | 神经免疫学 | 银屑病 | 单细胞测序分析 | 咪喹莫特诱导的小鼠银屑病模型 | 基因表达数据 | NA |
| 312 | 2025-10-02 |
Perturb-seq reveals distinct responses to pluripotency regulator dosages underlying the control of self-renewal and differentiation
2025-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.07.669196
PMID:41031011
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研究论文 | 通过Perturb-seq技术研究转录因子剂量对人类胚胎干细胞自我更新和分化的调控机制 | 首次系统性地定量分析关键转录因子剂量梯度对细胞表型的影响，发现谱系特异性基因的非单调响应模式 | 研究仅限于人类胚胎干细胞模型，未在其他细胞类型中验证 | 探究转录因子表达水平梯度如何调控细胞身份维持和分化命运 | 人类胚胎干细胞 | 单细胞基因组学 | NA | CRISPR干扰、单细胞RNA测序、Perturb-seq | 定量建模 | 单细胞转录组数据 | 人类胚胎干细胞在不同转录因子剂量梯度下的单细胞样本 |
| 313 | 2025-10-02 |
Spatial determinants of tumor cell dedifferentiation and plasticity in primary cutaneous melanoma
2025-Jun-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.21.660851
PMID:40667360
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研究论文 | 通过整合多重循环免疫荧光成像、空间转录组学和传统组织学技术，揭示早期皮肤黑色素瘤中肿瘤细胞去分化和真皮侵袭的空间决定因素 | 首次在早期黑色素瘤中系统分析肿瘤细胞可塑性和空间异质性，发现微环境特征对肿瘤异质性的影响 | 早期疾病的空间分析仍然有限，样本量相对较小 | 揭示黑色素瘤早期发展过程中肿瘤细胞去分化和可塑性的空间决定机制 | 原发性皮肤黑色素瘤早期阶段肿瘤组织 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 多重循环免疫荧光成像(CyCIF)、空间转录组学、常规组织学 | NA | 图像、空间转录组数据 | 多个原发性癌症样本，包含100-300个细胞的微区域分析 |
| 314 | 2025-10-02 |
Deep learning inference of cell type-specific gene expression from breast tumor histopathology
2025-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.04.652089
PMID:41030996
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研究论文 | 开发了一种直接从乳腺癌组织病理学全切片图像推断细胞类型特异性基因表达的深度学习工具 | 首次实现直接从常规组织病理学图像预测细胞类型特异性基因表达，无需进行RNA测序 | 在TCGA乳腺癌队列上训练，需要在其他癌症类型中进一步验证 | 开发低成本、快速的细胞类型特异性基因表达推断方法 | 乳腺癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 深度学习 | 图像 | TCGA乳腺癌队列和160例独立队列 |
| 315 | 2025-10-02 |
Niche Macrophages Recycle Iron to Tumor Cells and Foster Erythroblast Mimicry to Promote Bone Metastasis and Anemia
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.23.650120
PMID:41031013
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研究论文 | 本研究揭示了骨转移微环境中巨噬细胞通过铁循环促进肿瘤生长并导致贫血的新机制 | 首次发现VCAM1+CD163+CCR3+巨噬细胞在骨转移微环境中被肿瘤细胞劫持用于铁获取，并发现肿瘤细胞通过GATA1调控产生血红蛋白的类红细胞拟态现象 | NA | 探究骨转移与贫血之间的机制联系及肿瘤细胞在骨髓微环境中的适应策略 | 骨髓微环境中的巨噬细胞、肿瘤细胞和红细胞前体细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌骨转移 | 生态位标记、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA |
| 316 | 2025-10-02 |
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2025-Apr-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6248794/v1
PMID:40321776
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现转录因子HHEX在肾上腺糖皮质激素生成细胞中高度富集，并揭示其在维持糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导脂质耗竭中的关键作用 | 首次发现HHEX是雄激素受体靶基因，在青春期抑制雌性转录程序并维持肾上腺皮质胆固醇酯含量，保护脂滴免受雄激素诱导的自噬降解 | 研究主要基于小鼠模型，在雄性动物中观察到糖皮质激素不足的表型 | 探究维持肾上腺皮质细胞差异反应性的分子机制 | 小鼠肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞 | 分子生物学 | 肾上腺功能障碍 | scRNA-seq，遗传小鼠模型 | NA | 基因表达数据 | 使用报告基因小鼠进行单细胞RNA测序分析 |
| 317 | 2025-10-02 |
Single-cell multi-omics analysis reveals the mechanism of action of a novel antioxidant polyphenol nanoparticle loaded with STAT3 agonist in mediating cardiomyocyte ferroptosis to ameliorate age-related heart failure
2025-Mar-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03317-x
PMID:40158134
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析开发了一种装载STAT3激动剂的抗氧化多酚纳米颗粒(PN@Col)，用于改善年龄相关性心力衰竭 | 首次结合单细胞多组学分析和纳米技术，开发新型STAT3激动剂纳米颗粒靶向心肌细胞铁死亡机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索新型纳米颗粒疗法对年龄相关性心力衰竭的治疗机制 | 心肌细胞和老年心力衰竭小鼠模型 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、AUCell分析、体外细胞实验 | NA | 基因表达数据、实验数据 | 基于GEO数据库分析和老年心力衰竭小鼠模型 |
| 318 | 2025-10-02 |
Chronic inflammation deters natural killer cell fitness and cytotoxicity in myeloid leukemia
2025-Feb-25, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024014592
PMID:39571169
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研究论文 | 本研究探讨慢性炎症如何通过TNFα信号通路损害自然杀伤细胞在髓系白血病中的功能 | 首次在CML小鼠模型中揭示TNFα诱导的炎症信号通过上调Cish等检查点基因抑制NK细胞功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需扩大 | 阐明髓系白血病微环境中NK细胞功能受损的机制 | CML小鼠模型、健康供体NK细胞、CML患者血浆和NK细胞 | 肿瘤免疫学 | 髓系白血病 | 单细胞RNA测序、体外功能实验 | 嵌合BCR::ABL1+ CML小鼠模型 | 基因表达数据、功能实验数据 | CML小鼠模型、健康供体NK细胞、未治疗CML患者血浆和新诊断患者NK细胞 |
| 319 | 2025-10-02 |
Identifying differentiation markers between dermal fibroblasts and adipose-derived mesenchymal stromal cells (AD-MSCs) in human visceral and subcutaneous tissues using single-cell transcriptomics
2025-Feb-11, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04185-w
PMID:39934849
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研究论文 | 通过单细胞转录组学鉴定人类内脏和皮下组织中脂肪来源间充质基质细胞与真皮成纤维细胞的分化标志物 | 首次使用单细胞RNA测序技术从同一供体的不同组织中比较AD-MSCs和成纤维细胞，以高分辨率揭示细胞类型特异性标志物 | 样本来源仅限于人类特定组织类型，需要进一步验证在其他物种或组织中的适用性 | 识别能够区分脂肪来源间充质基质细胞和成纤维细胞的分子标志物 | 人类皮下和内脏脂肪组织来源的AD-MSCs以及皮肤成纤维细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术、定量PCR | NA | 基因表达数据 | 来自同一供体的多种组织样本（具体数量未明确说明） |
| 320 | 2025-01-23 |
Finding and Profiling Renal Cells with Spatial Transcriptomics
2025-Jan-22, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000632
PMID:39836482
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |