单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 37441 篇文献,本页显示第 301 - 320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
301 2026-03-14
The landscape of B and plasma cells in breast cancer: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2026-Mar-12, NPJ breast cancer IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,构建了乳腺癌中B细胞和浆细胞的全面图谱,揭示了肿瘤相关B细胞的异质性及其在免疫治疗中的作用 整合了公开的单细胞RNA测序数据集与新生成的单细胞RNA测序及单细胞BCR测序数据,首次系统性地鉴定了乳腺癌中21个不同的肿瘤相关B细胞亚群,并特别强调了CD200 naïve B细胞和ISG15非典型记忆B细胞在肿瘤免疫中的关键作用 研究主要基于已有数据集和新生成数据,样本量相对有限(79个样本来自35名患者),且功能验证主要在鼠类肿瘤模型中进行,人类临床应用的直接转化仍需进一步研究 探究乳腺癌肿瘤微环境中B细胞和浆细胞的异质性、功能角色及其对免疫治疗的影响 乳腺癌患者的肿瘤相关B细胞和浆细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞BCR测序、空间转录组学 NA 单细胞RNA测序数据、单细胞BCR测序数据、空间转录组学数据 79个样本来自35名患者 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞BCR测序, 空间转录组学 NA NA
302 2026-03-14
Artificial intelligence assisted multi-model pathological diagnosis of breast cancer based on multispectral autofluorescence images
2026-Mar-12, NPJ breast cancer IF:6.5Q1
研究论文 本研究提出了一种基于多光谱自发荧光成像与优化深度学习架构的新型框架,用于生成高质量、免标记的H&E等效虚拟染色图像,以辅助乳腺癌病理诊断 通过结合多光谱自发荧光成像与增强的CycleGAN(引入显著性和全局特征一致性损失),实现了无需像素级配对的非配对数据集学习,显著提升了虚拟染色性能 未明确说明样本量的具体规模及模型在不同亚型乳腺癌中的泛化能力评估 开发一种快速、非破坏性的乳腺癌病理诊断虚拟染色技术,以克服传统染色方法的耗时与样本消耗问题 乳腺癌临床标本、小鼠模型及类器官共培养样本 数字病理学 乳腺癌 多光谱自发荧光成像、虚拟染色技术 增强型CycleGAN(生成对抗网络) 多光谱自发荧光图像、H&E染色图像 包含临床标本、小鼠模型和类器官共培养的多模态数据库(具体数量未明确) NA NA NA NA
303 2026-03-14
STHELAR, a multi-tissue dataset linking spatial transcriptomics and histology for cell type annotation
2026-Mar-12, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本文介绍了一个名为STHELAR的大规模数据集,该数据集整合了空间转录组学和H&E全玻片图像,用于细胞类型注释 通过整合空间转录组学和H&E图像,创建了一个包含多组织类型、超过1100万个细胞的参考数据集,并采用基于Tangram的对齐方法进行细胞类型注释 数据集成本和技术复杂性可能限制其广泛应用,且注释依赖于单细胞参考图谱的准确性 为癌症研究提供肿瘤微环境组成的理解,并开发从组织学图像预测细胞类型注释的模型 31个人类Xenium FFPE切片,涵盖16种组织类型,来自22名癌症患者和9名非癌症患者 数字病理学 癌症 空间转录组学,单细胞RNA-seq,H&E染色 Tangram,聚类分析 图像,空间转录组数据 31个FFPE切片,超过1100万个独特生物细胞 10x Genomics 空间转录组学,单细胞RNA-seq Xenium Xenium FFPE切片
304 2026-03-14
scTWAS: a powerful statistical framework for single-cell transcriptome-wide association studies
2026-Mar-12, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为scTWAS的统计方法,用于利用单细胞数据进行细胞类型特异性的转录组范围关联研究 提出首个专门针对单细胞数据挑战(如强噪声、技术变异和高稀疏性)的统计框架,通过潜变量模型和基于矩的估计方法,在细胞类型分辨率下进行TWAS分析 NA 开发一种统计方法,以利用单细胞RNA测序数据进行细胞类型特异性的转录组范围关联研究,从而更精确地识别与复杂性状和疾病相关的基因 血液和脑组织中的细胞类型,以及29种血液学性状和三种免疫相关疾病 生物信息学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 潜变量模型 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
305 2026-03-14
Defining the vascular niche of human adipose tissue across metabolic states
2026-Mar-12, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,绘制了人类皮下脂肪组织血管系统的细胞图谱,揭示了其在代谢疾病中的变化 首次在人类脂肪组织中鉴定出具有内皮、间充质、脂肪生成和免疫转录特征的混合内皮细胞群,并揭示了肥胖和2型糖尿病中的炎症与纤维化血管特征 研究主要关注皮下脂肪组织,未涵盖其他脂肪库;样本量虽较大但可能仍存在个体差异的影响 阐明人类脂肪组织血管微环境的细胞组成及其在代谢状态变化中的作用 人类皮下脂肪组织中的血管细胞 单细胞组学 代谢疾病(肥胖、2型糖尿病) 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、全组织三维成像 NA 单细胞转录组数据、成像数据 65名个体的近70,000个血管细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
306 2026-03-14
Transcriptome combined with single-cell data to construct a prognostic model for glycosylation-related genes in osteosarcoma
2026-Mar-12, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合转录组和单细胞数据,构建了骨肉瘤中糖基化相关基因的预后模型 首次结合单细胞RNA测序数据,系统分析骨肉瘤中糖基化相关基因的预后价值,并识别关键细胞类型 研究基于公共数据集,样本量有限,且未进行实验验证 构建骨肉瘤的糖基化相关基因预后模型并探索其分子机制 骨肉瘤患者样本 生物信息学 骨肉瘤 单细胞RNA测序, 转录组分析 LASSO回归, Cox回归 基因表达数据 来自GSE36001、TARGET-OS和GSE21257数据集的骨肉瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
307 2026-03-14
Single-cell activation screen identifies hepatic maturation regulators with zonal resolution
2026-Mar-11, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞激活筛选,识别了具有区域分辨率的肝脏成熟调控因子 利用dCas9激活筛选结合单细胞转录组学,在原发性小鼠胚胎肝细胞中系统评估了晚期转录调控因子的效应,并发现Nr1i3和Nfix在肝脏区域化代谢基因表达中的关键作用 研究基于小鼠胚胎肝细胞,结果在人类或其他物种中的普适性需进一步验证,且体外培养系统可能无法完全模拟体内微环境 旨在识别调控胚胎肝细胞成熟的关键转录因子,以改善体外衍生肝细胞的功能性 原发性小鼠胚胎肝细胞 单细胞组学 NA 单细胞转录组学,dCas9激活筛选 NA 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
308 2026-03-14
Single-cell profiling of the subgingival bacteria reveals transcriptional heterogeneity and niche-specific programs
2026-Mar-11, Cell host & microbe IF:20.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序框架分析了牙周炎患者与健康个体龈下细菌的转录异质性,揭示了功能集群和病原体特异性代谢特征 首次在单细胞水平上对低生物量、高宿主污染的龈下细菌群落进行高分辨率转录组分析,构建了包含285个物种的单细胞图谱 样本量有限(16个样本),且单细胞RNA测序技术对低生物量微生物存在技术挑战 探究牙周炎发病机制中龈下细菌群落的单细胞水平功能异质性 龈下细菌群落(包括核心活跃物种和关键病原体如T. denticola、P. gingivalis、P. intermedia) 微生物组学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 16个龈下样本,133,458个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
309 2026-03-14
Cell type-specific network analysis in Diversity Outbred mice identifies genes potentially responsible for human bone mineral density GWAS associations
2026-Mar-11, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究利用多样性远交小鼠的单细胞转录组数据,构建细胞类型特异性网络,以解析人类骨密度全基因组关联研究中的基因功能 首次结合单细胞转录组数据和细胞状态轨迹分析,识别出21个网络驱动基因,这些基因可能通过间充质细胞分化调控骨密度,为骨质疏松症提供新的遗传靶点 研究基于小鼠模型数据,其结论在人类中的直接适用性需进一步验证,且样本来源和数量可能限制网络分析的普适性 解析骨密度全基因组关联研究中的因果基因及其在细胞类型特异性网络中的功能,以优先筛选骨质疏松症的潜在遗传靶点 多样性远交小鼠的骨髓来源基质细胞在成骨条件下培养的样本 单细胞转录组学 骨质疏松症 单细胞RNA测序 网络分析 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
310 2026-03-14
Cell-type-specific transposon demethylation and TAD remodeling in aging mouse brain
2026-Mar-11, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过构建小鼠大脑衰老的单细胞多组学图谱,揭示了细胞类型特异的转座子去甲基化和染色质构象变化 首次整合单细胞甲基组、染色质构象、转录组和染色质可及性数据,构建了跨模态的细胞分类系统,并开发了基于深度学习的多模态表观遗传特征预测模型 使用2月龄小鼠作为基线可能无法完全反映更早或更晚生命阶段的衰老过程,且研究主要基于小鼠模型,人类大脑衰老的机制可能有所不同 探究大脑衰老的表观遗传机制及其与神经退行性疾病风险的关系 小鼠大脑多个区域的细胞 数字病理学 神经退行性疾病 单细胞甲基组测序、染色质构象分析、空间转录组学 深度学习模型 单细胞甲基组数据、染色质构象数据、转录组数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 132,551个单细胞甲基组和72,666个联合染色质构象-甲基组细胞核,以及895,296个细胞的空间转录组数据 NA 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 NA NA
311 2026-03-14
Toward a multiomics framework for understanding symbiotic nitrogen fixation
2026-Mar-11, Trends in plant science IF:17.3Q1
综述 本文综述了利用多组学框架理解共生固氮的进展,并提出人工智能指导的路线图以促进非豆科作物中的应用 整合了端粒到端粒基因组、单细胞转录组、空间转录组、表观基因组和3D基因组数据,提出人工智能指导的路线图,从描述性目录转向可测试模型和迭代验证 NA 理解共生固氮机制,并开发在非豆科作物中部署固氮能力的策略 豆科植物和放线菌根共生系统 自然语言处理 NA 端粒到端粒基因组测序、单细胞转录组学、空间转录组学、表观基因组学、3D基因组映射 人工智能模型 基因组序列、染色质可及性数据、表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
312 2026-03-14
Cell confinement initiates a delayed but heritable loss of chromosomes
2026-Mar-10, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文研究了细胞在受限条件下如何引发延迟但可遗传的染色体丢失,并探讨其在癌症进化中的作用 使用染色体报告基因(ChReporters)量化活细胞中罕见的可遗传染色体丢失,并发现仅在一定程度的细胞受限后才显现,揭示了染色体丢失作为受限有丝分裂记忆的新机制 研究主要基于体外细胞实验,可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性;染色体丢失的长期影响和具体分子机制仍需进一步探索 探索细胞受限如何引发可遗传的染色体丢失,以填补机械生物学和癌症进化领域的知识空白 活细胞中的染色体动态和丢失事件 细胞生物学 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
313 2026-03-14
Integrative spatial profiling pipeline for determining TME architectures in archival clinical specimens using CmTSA superplex technology
2026-Mar-10, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本文开发了一种结合HOC-FD技术和CmTSA超多重技术的空间分析平台,用于在FFPE组织样本中同时标记30-60个生物标志物,并利用计算机视觉流程和RNN分析定义肿瘤微环境中的功能性生态位 开发了混合光化学荧光淬灭技术,整合了自发荧光淬灭和循环多重酪胺信号放大,实现了在FFPE组织中高信噪比的多重标记;结合深度学习细胞分割和RNN分析,系统性地定义和验证了功能性生态位的空间特征 未明确提及样本量限制或技术适用范围的具体局限性 克服空间转录组学和空间蛋白质组学在临床样本中的限制,开发一个集成平台以可视化和量化肿瘤微环境中的多细胞功能性状态 人类结肠癌和宫颈癌的FFPE组织样本 数字病理学 结肠癌, 宫颈癌 循环多重酪胺信号放大, 混合光化学荧光淬灭, 深度学习, 半径约束邻域网络分析 深度学习 图像 NA NA 空间蛋白质组学 CmTSA平台 整合HOC-FD技术和CmTSA超多重技术,用于FFPE组织的高通量处理
314 2026-03-14
Phenotypically similar but functionally distinct NK cell populations within the human maternal-fetal interface
2026-Mar-10, ImmunoHorizons
研究论文 本研究探讨了人类足月妊娠中母胎界面NK细胞的功能差异,揭示了在解剖学相邻组织中存在功能不同的组织驻留NK细胞群体 首次在健康足月妊娠中,通过高参数流式细胞术和单细胞测序,发现母胎界面中表型相似但功能不同的NK细胞群体,特别是在细胞因子激活响应方面存在显著差异 研究主要关注足月妊娠,未涵盖妊娠早期或病理状态下的NK细胞功能变化,且样本量有限 探究人类足月妊娠中母胎界面NK细胞是否维持效应功能及其功能特性 从人类足月妊娠的蜕膜-胎盘界面和蜕膜组织中分离的NK细胞 免疫学 NA 高参数流式细胞术,单细胞测序 NA 流式细胞数据,单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但涉及足月妊娠组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
315 2026-03-14
Single-cell transcriptional and epigenomic landscape of human blood immune cells across the lifespan
2026-Mar-10, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,绘制了从胎儿期到成年晚期人类外周血免疫细胞的转录组和表观基因组图谱,揭示了年龄相关的免疫细胞重编程动态 首次在单细胞水平上全面解析了人类整个生命周期中外周血免疫细胞的转录和表观遗传景观,并识别了多个年龄相关的特定细胞亚群及其功能特征 研究仅基于健康供体的外周血单个核细胞,可能未涵盖组织特异性免疫变化或疾病状态的影响 探究人类生命周期中免疫细胞组成的动态变化及其与年龄相关的功能重塑 健康供体的外周血单个核细胞,涵盖从胎儿中期到成年晚期的样本 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 涵盖从胎儿中期到成年晚期的健康供体样本,具体数量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
316 2026-03-14
Ribosomal modifications are associated with mesenchymal fate selection in the neural crest lineage
2026-Mar-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了核糖体RNA修饰与神经嵴细胞间充质命运选择之间的关联,并探讨了其在神经母细胞瘤中的临床意义 首次将rRNA修饰和核糖体组装因子与神经嵴细胞的间充质命运选择直接关联,并发现特定修饰(如m¹acp³ψ)在发育和肿瘤进展中的关键作用 研究主要基于体外和动物模型,人类患者数据分析为相关性,需进一步功能验证;神经母细胞瘤实验仅限于细胞系,缺乏体内肿瘤模型 探究核糖体修饰如何影响神经嵴细胞的命运决定及其在肿瘤进展中的作用 神经嵴细胞、小鼠模型、神经母细胞瘤患者数据及细胞系 单细胞转录组学 神经母细胞瘤 Smart-seq2单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序数据、患者转录组数据 未明确样本数量,包括小鼠神经嵴细胞、神经母细胞瘤患者数据集及细胞系 NA 单细胞RNA-seq Smart-seq2 Smart-seq2单细胞转录组测序技术
317 2026-03-14
Single-cell genomics highlight MYC-associated metabolic activation and altered cell interactions in T-prolymphocytic leukemia progression
2026-Mar-09, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和全基因组测序,揭示了T-前淋巴细胞白血病从惰性阶段向活动阶段转变过程中的分子变化,包括MYC相关代谢激活和细胞互作改变 首次在单细胞水平上解析T-PLL疾病进展的分子机制,结合纵向样本分析,揭示了MYC靶基因上调、能量代谢增强以及细胞互作减少等共同特征 样本量相对较小(28个样本),且需进一步验证这些发现是否可作为可靶向的治疗位点 探究T-前淋巴细胞白血病从惰性阶段向活动阶段转变的分子基础 T-前淋巴细胞白血病患者样本,包括惰性和活动阶段的配对样本 单细胞基因组学 白血病 单细胞RNA测序,全基因组测序 NA 单细胞RNA测序数据,全基因组测序数据 28个未经治疗的样本,包括11对纵向采集的惰性/活动阶段配对样本 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
318 2026-03-14
A proliferative subpopulation of coelomocytes in sea cucumber is identified and characterized by single-cell RNA-seq after evisceration
2026-Mar-06, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,在海参(Apostichopus japonicus)中鉴定并表征了体腔和水管系统中一个与细胞增殖相关的亚群,特别是在去内脏后,揭示了其在细胞恢复机制中的动态变化 首次利用单细胞RNA测序技术对海参体腔和水管系统中的体腔细胞进行分子分类,并识别出一个在去内脏后比例显著增加的增殖性亚群(cluster 10),阐明了其在细胞分化和恢复过程中的作用 研究主要基于单细胞RNA测序数据,可能未涵盖所有细胞类型或功能状态,且依赖于同源物种的细胞标记物进行亚群分配,可能存在物种特异性差异 探究海参去内脏后体腔细胞在体腔和水管系统中的恢复机制,包括细胞亚群的鉴定、增殖和分化动态 海参(Apostichopus japonicus)的体腔细胞,包括体腔和水管系统中的细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫细胞化学染色 NA 单细胞RNA测序数据,图像数据 未明确指定样本数量,但涉及海参体腔和水管系统中的细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
319 2026-03-14
Prospective study of patients with immune checkpoint inhibitor-induced hepatitis; characterization of liver injury, outcome of therapy, and management of steroid-unresponsive and steroid-dependent hepatitis
2026-Mar-05, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 一项前瞻性研究,旨在描述免疫检查点抑制剂诱导的肝炎(ir-hepatitis)的肝脏损伤特征、治疗结果以及对类固醇无反应和类固醇依赖性肝炎的管理 首次前瞻性地结合肝脏活检的多重免疫组化(mIHC)和外周血样本的单细胞RNA测序(scRNA-seq),系统地表征了ir-hepatitis的免疫表型、治疗反应及预后,并确定了类固醇反应不足的危险因素(如饮酒)和不同药物性肝损伤(DILI)表型(混合型、肝细胞型、胆汁淤积型)的预后差异 样本量较小(n=34),单细胞RNA测序仅在少数患者中进行,结果需要更大规模的研究验证 研究免疫检查点抑制剂(ICIs)引起的严重(3-4级)免疫相关性肝炎(ir-hepatitis)的临床特征、对类固醇治疗的反应、管理策略及潜在的免疫机制 接受ICIs治疗并出现3-4级ir-hepatitis的患者 数字病理学 肝损伤(药物性肝损伤) 多重免疫组化(mIHC),单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 组织图像(肝脏活检),基因表达数据(外周血单细胞RNA测序) 34名ir-hepatitis患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
320 2026-03-14
Nuclear condensates of BZU2/ZmMUTE modulate transcription to realize structural heterogeneity of the maize stomatal complex
2026-Mar-03, The Plant cell
研究论文 本文探讨了BZU2/ZmMUTE通过液-液相分离调控玉米气孔复合体结构异质性的机制 揭示了ZmMUTE通过其液-液相分离特性调控细胞类型特异性转录程序,从而影响气孔发育的多样性 NA 研究转录因子ZmMUTE在玉米气孔发育中的作用机制 玉米(Zea mays)气孔复合体 植物生物学 NA 单细胞RNA-seq分析 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部