单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 41079 篇文献,本页显示第 301 - 320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
301 2026-06-26
SLC39A13 Defines Myofibroblastic Activation and Immunosuppressive Tumor Microenvironment in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-May-18, Current oncology (Toronto, Ont.)
研究论文 探究锌转运蛋白SLC39A13在头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境中对肌成纤维细胞激活和免疫抑制的作用 首次揭示锌转运蛋白SLC39A13在癌症相关成纤维细胞中富集,并与肌成纤维细胞激活及免疫抑制微环境密切相关,提出其作为潜在治疗靶点 依赖公开数据集,缺乏功能性实验验证SLC39A13的分子机制及临床样本的直接验证 研究锌转运蛋白在头颈部鳞状细胞癌肿瘤微环境中的角色 头颈部鳞状细胞癌患者的肿瘤组织、原代成纤维细胞培养物及大规模患者队列的转录组和生存数据 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、转录组分析 NA 基因表达数据 大规模患者队列的转录组和生存数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
302 2026-06-26
The USP19-DnaJC7 Axis Stabilizes p53 in Cisplatin-Treated Epithelial Ovarian Cancer
2026-May-18, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究分析了上皮性卵巢癌患者的转录组数据,发现去泛素化酶USP19在无复发患者中表达升高,并通过单细胞RNA测序确认其在上皮细胞中与凋亡通路激活相关 首次揭示USP19-DnaJC7轴通过去泛素化稳定DnaJC7,进而干扰p53与MDM2相互作用,增强p53稳定性并提升顺铂疗效 未提供具体样本量和体内实验验证结果 探索上皮性卵巢癌复发的分子机制,特别是USP19在无复发患者中的作用及其对顺铂治疗的影响 上皮性卵巢癌患者的转录组数据及单细胞RNA测序数据 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
303 2026-06-26
Single-cell RNA sequencing reveals IgM + B cell differentiation and protective responses after DNA vaccination and Vibrio anguillarum challenge in flounder ( Paralichthys olivaceus)
2026-May-18, Zoological research IF:4.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示DNA疫苗免疫及鳗弧菌感染后牙鲆IgM+ B细胞的分化与保护性反应 首次在硬骨鱼类中解析了IgM+ B细胞的功能异质性和分化架构,并鉴定T细胞相关B细胞亚群为DNA疫苗保护性的关键细胞介质 未说明具体局限性 评估DNA疫苗诱导的硬骨鱼类B细胞保护性免疫的细胞学程序 牙鲆(Paralichthys olivaceus)头肾IgM+ B细胞 单细胞转录组学 鳗弧菌感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 DNA疫苗免疫35天后攻毒,攻毒后7天分离头肾IgM+ B细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
304 2026-06-26
Prognostic Genes Linked to Asparagine Metabolism in Hepatocellular Carcinoma: Identification, Validation, and Regulatory Mechanisms Based on Transcriptome and Single-Cell RNA Sequencing
2026-May-15, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 基于转录组和单细胞RNA测序,鉴定与肝细胞癌中天冬酰胺代谢相关的预后基因,并验证其调控机制 首次通过天冬酰胺代谢相关共表达模块而非典型代谢基因识别预后标志物,构建包含BOP1、SAC3D1和PDE2A的三基因风险评分模型,并利用单细胞测序揭示NK细胞和内皮细胞在疾病进展中的核心作用 缺乏实验和临床验证,研究仅基于公开数据库,需进一步验证发现 探索天冬酰胺代谢在肝细胞癌进展中的调控机制,并识别预后标志物和潜在化疗靶点 肝细胞癌患者,包括TCGA和GEO数据集中的样本 数字病理学, 自然语言处理 肝癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, LASSO算法 Cox回归模型, LASSO算法 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 TCGA和GEO数据集(GSE14620)中的肝细胞癌样本 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
305 2026-06-26
Integrated Network Pharmacology and Single-Cell Transcriptomics Reveal Transketolase as a Potential Target for the DanShen-DaHuang Herb Pair in Acute Kidney Injury
2026-May-15, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 整合网络药理学与单细胞转录组学揭示丹参-大黄药对在急性肾损伤中潜在靶点转酮醇酶 首次将网络药理学、WGCNA与多算法机器学习(LASSO、Boruta、随机森林等)结合,筛选出转酮醇酶(TKT)作为丹参-大黄药对治疗急性肾损伤的核心靶点,并通过单细胞RNA测序解析其与巨噬细胞M2极化的关联 研究基于计算预测和理论分析,缺乏实验验证;单细胞数据来自公开数据集,样本来源有限 探索丹参-大黄药对在急性肾损伤中的分子靶点及其作用机制 丹参-大黄药对作用于急性肾损伤的分子靶点及肾脏微环境中的巨噬细胞亚群 机器学习 急性肾损伤 单细胞RNA测序,网络药理学,分子对接 LASSO、Boruta、随机森林、GBM、XGBoost、决策树 基因表达数据 77,593个高质量细胞(来自GSE197266数据集) NA 单细胞RNA测序 NA NA
306 2026-06-26
NFE2L2-Associated Ferroptosis Resistance Reshapes the Tumor Immune Microenvironment and Guides Therapeutic Strategies in Prostate Cancer
2026-May-15, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合多组学数据(包括大量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学),分析了前列腺癌中NFE2L2相关的铁死亡抵抗如何重塑肿瘤免疫微环境,并提出了潜在治疗策略 首次综合应用大量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学系统解析前列腺癌中铁死亡抵抗与免疫微环境之间的相互作用,并鉴定出16基因铁死亡特征预测生化复发,同时利用药物反应建模和分子对接优先筛选出RSL3、阿托伐醌和索拉非尼等具有铁死亡调节活性的药物 研究主要基于回顾性公共数据,铁死亡特征和治疗策略需在更大前瞻性队列中进行验证;虚拟敲除分析虽提示因果关系,但缺乏直接的体外或体内功能验证 阐明NFE2L2相关铁死亡抵抗在前列腺癌免疫逃逸中的作用,并探索通过靶向铁死亡调节剂重塑肿瘤免疫微环境以增强免疫检查点阻断治疗效果的可能性 前列腺腺癌(PRAD)的肿瘤样本(包括498个大量RNA-seq样本、68,322个单细胞RNA-seq细胞和19,483个空间转录组点) 机器学习 前列腺癌 大量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学、药物响应建模、分子对接 NA 基因表达数据、图像(空间转录组) 498例大量RNA-seq样本、68,322个单细胞RNA-seq细胞、19,483个空间转录组斑点 NA 大量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
307 2026-06-26
A Multi-Omics Framework Reveals Tumor Heterogeneity and Predicts Therapeutic Targets in Renal Cell Carcinoma
2026-May-15, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 该研究开发了一个整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和临床数据的计算框架,用于识别与癌症进展相关的细胞亚群,并在肾细胞癌中揭示了肿瘤异质性和潜在的治疗靶点 开发了CPcellsubpopulation计算框架,整合多组学数据识别癌症进展相关细胞亚群,在肾细胞癌中发现保守代谢性癌细胞与不良预后相关,并揭示了NK细胞、浆细胞和巨噬细胞在晚期阶段的关联 未明确提及局限性 识别与癌症进展相关的细胞亚群,预测潜在相互作用和关键转录因子,并预测候选抗癌药物 九种癌症的细胞亚群,重点是肾细胞癌的肿瘤细胞和免疫细胞 机器学习 肾细胞癌 scRNA-seq, 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据、临床数据、空间转录组数据 九种癌症数据集 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
308 2026-06-26
PI3Kδ inhibition alters CD8 T cell differentiation and reprograms the tumor microenvironment following adoptive immunotherapy
2026-May-14, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本文研究了PI3Kδ抑制剂CAL-101通过改变CD8 T细胞分化并重编程肿瘤微环境来增强过继性免疫治疗效果 首次揭示PI3Kδ抑制在体外处理T细胞能增强其干性和代谢适应性,并在肿瘤微环境中优先分化为祖细胞耗竭T细胞,维持抗肿瘤免疫应答 仅基于B16黑色素瘤小鼠模型,临床转化尚需验证 阐明PI3Kδ抑制改善过继性细胞治疗在实体瘤中疗效的机制 CD8 T细胞、B16黑色素瘤肿瘤微环境 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 B16黑色素瘤肿瘤样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
309 2026-06-26
Super-resolution multimodal spatial transcriptomics reveals an ovoid stem cell niche structuring de novo shoot regeneration
2026-May-14, Molecular plant IF:17.1Q1
研究论文 利用超分辨率多模态空间转录组学揭示番茄茎再生过程中的卵形干细胞巢结构 首次通过超分辨率多模态空间转录组学识别出植物茎再生中以前未知的卵形干细胞巢结构,并阐明EPFL8b信号在组织干细胞巢和促进再生中的作用 未提及具体局限性 阐明植物茎细胞再生过程中从创伤到器官发生的细胞重编程的架构原理 番茄茎再生过程中的约120万个细胞 数字病理学 NA 超分辨率多模态空间转录组学, 遗传分析, 肽处理, 蛋白质相互作用分析 NA 空间转录组数据 约120万个细胞 NA 空间转录组学 NA 超分辨率多模态空间转录组学技术
310 2026-06-26
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomics Analyses Delineate a BAG3-Associated Macrophage Program with Microenvironmental and Prognostic Relevance in Hepatocellular Carcinoma
2026-May-11, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过整合单细胞和空间转录组学分析,揭示了肝细胞癌中BAG3相关巨噬细胞程序的微环境和预后意义 首次鉴定出BAG3肿瘤相关巨噬细胞亚群及其应激适应、蛋白质稳态和基质重塑程序,并利用空间转录组学揭示其空间分布和微环境相互作用 空间转录组学样本量较小且来自治疗暴露队列,验证数据集的重复性有待进一步评估 评估BAG3相关肿瘤相关巨噬细胞程序在肝细胞癌中的生物学和预后相关性 肝细胞癌肿瘤相关巨噬细胞 机器学习 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 多个公开单细胞RNA测序数据集及一个小型治疗暴露队列 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
311 2026-06-26
SIRT1 in Cardiac Diseases: Molecular Mechanisms, Therapeutic Potential, and Future Directions
2026-May-09, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 综述SIRT1在心脏疾病中的分子机制、治疗潜力和未来研究方向 系统整合了SIRT1在多种心脏疾病中的多重保护机制概述,并指出了其双向调节作用及精准调控的必要性 挑战包括实现心脏特异性靶向、优化NAD可用性和将临床前发现转化为临床实践 总结SIRT1在心脏疾病中的保护作用机制及潜在治疗策略 SIRT1蛋白 NA 心血管疾病 NA NA NA NA NA NA NA NA
312 2026-06-26
Unfolding Immune Dysregulation in COPD: Identification of a Three-Gene Signature and Functional Validation of TCF7 in Human Lung Tissue and T Lymphocytes
2026-May-09, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过机器学习和单细胞RNA测序鉴定COPD免疫失调的3个基因特征,并验证TCF7在肺组织和T淋巴细胞中的功能 首次结合机器学习和单细胞RNA测序识别COPD免疫失调的3个基因特征(CD79A、FCER1G、TCF7),并通过体外和离体实验验证TCF7在T细胞凋亡中的关键作用 未提及具体局限性 揭示慢性阻塞性肺疾病免疫失调的分子机制并识别潜在生物标志物 COPD患者的肺组织、T淋巴细胞、巨噬细胞以及Jurkat细胞系 机器学习 慢性阻塞性肺疾病 RNA-seq、单细胞RNA测序、qRT-PCR、ELISA、Western blotting、免疫荧光 机器学习模型 转录组数据、单细胞测序数据 公共转录组数据集和外部验证队列 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
313 2026-06-26
Exploration of the Role of M2 Macrophages in Hepatocellular Carcinoma: Insights into Disulfidptosis and Cellular Interactions
2026-May-09, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 通过多组学与单细胞RNA测序数据,系统探究M2巨噬细胞在肝癌中与二硫下垂相关的调控作用及细胞间相互作用 首次在单细胞分辨率下揭示肝癌中二硫下垂与铁下垂通过GPX4-RAC1轴的关联,并阐明M2巨噬细胞参与的双向通讯网络 NA 阐明肝癌中二硫下垂与免疫微环境的关系,特别是M2巨噬细胞的角色 肝细胞癌患者样本 机器学习 肝癌 单细胞RNA测序 非负矩阵分解 多组学数据、单细胞RNA测序数据 315个TCGA样本和21个HCC样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
314 2026-06-26
Single-Cell Transcriptomic Profiling Uncovers a Metastasis-Associated MUCL3+ Signet-Ring Cell Subpopulation in Gastric Cancer
2026-May-08, Cells IF:5.1Q2
研究论文 通过单细胞转录组学分析,揭示胃癌中与转移相关的MUCL3+印戒细胞亚群 首次在胃癌印戒细胞癌中鉴定出MUCL3标记的印戒细胞亚群,并揭示其与转移相关的分子特征 研究样本数量有限,功能验证仅涉及TFF1对胃癌细胞迁移的影响,缺乏更大规模的临床验证 比较胃癌印戒细胞癌与胃腺癌,鉴定特异性生物标志物并阐明印戒细胞癌侵袭行为的分子基础 胃癌印戒细胞癌和胃腺癌患者的原发肿瘤组织 单细胞转录组学 胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 手术切除的原发性胃癌组织样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
315 2026-06-26
Integrated Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Identifies Macrophage Heterogeneity and Mitophagy-Related Biomarkers in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-May-08, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 整合单细胞和批量RNA测序,识别特发性肺纤维化中巨噬细胞异质性和线粒体自噬相关生物标志物 首次整合单细胞与批量RNA测序分析,揭示巨噬细胞-线粒体自噬轴在特发性肺纤维化发病机制中的新框架 基于公共数据库和计算分析,缺乏独立外部验证队列 阐明特发性肺纤维化中巨噬细胞与线粒体自噬之间的关联,并筛选潜在生物标志物用于早期诊断和临床管理 巨噬细胞亚群(M2型巨噬细胞)和特发性肺纤维化患者样本 机器学习 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序、批量RNA测序、机器学 加权基因共表达网络分析 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
316 2026-06-26
Regenerative potential of Schneiderian membrane-derived mesenchymal stem cells in sinus floor elevation model and calvarial defect model
2026-May-08, Journal of Zhejiang University. Science. B
研究论文 本研究评估了上颌窦黏膜间充质干细胞在窦底提升和颅骨缺损模型中的骨再生潜力 首次在体内验证了SMMSCs的成骨能力,并通过单细胞RNA测序揭示了其分子特征 未在文中明确提及 评估施耐德膜对窦底提升的贡献并验证SMMSCs在颅骨缺损中的功能 上颌窦黏膜间充质干细胞(SMMSCs)和骨髓间充质干细胞(BMSCs) 数字病理学 骨缺损 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 兔子(双侧窦底提升)和人类施耐德膜样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
317 2026-06-26
Multi-omics reveals CXCR4 drives immune escape in colorectal cancer via metabolic reprogramming and immune microenvironment remodeling
2026-May-04, Cell death & disease IF:8.1Q1
research paper 采用整合单细胞转录组学和代谢组学分析,揭示CXCR4通过代谢重编程和免疫微环境重塑驱动结直肠癌免疫逃逸的机制 发现CXCR4通过调节PI3K-Akt-SMAD4通路介导代谢重编程,并通过谷氨酰胺代谢-免疫微环境双轴调控促进免疫逃逸,靶向CXCR4可增强PD-1抑制剂疗效 NA 揭示CXCR4在结直肠癌免疫抑制微环境和谷氨酰胺代谢重编程中的关键作用 结直肠癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、CD8 T细胞 machine learning 结直肠癌 单细胞转录组学、代谢组学、基因敲除、共培养实验 NA 单细胞转录组数据、代谢组数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
318 2026-06-26
Identifying batch-integrated domains from spatial transcriptomics via graph autoencoder with contrastive learning based on cross-modality and data augmentation
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
research paper 提出GCAST框架,一种基于图对比自编码器的空间转录组学方法,通过跨模态对比学习和数据增强识别批次整合的组织域 首次将跨模态对比学习与图自编码器结合,利用组织学和基因权重特征增强生物学可解释性,并自动对齐多数据集实现批次效应校正 NA 开发一种统一的、生物学信息引导的框架,以整合多模态空间转录组数据,识别组织域并实现批次效应校正 空间转录组学数据及其对应的组织学图像 computer vision, machine learning NA 空间转录组学 图对比自编码器 基因表达数据, 组织学图像 NA NA spatial transcriptomics NA NA
319 2026-06-26
AnnQ: reference-based quantification of cellular abnormality at single-cell resolution
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 AnnQ是一种基于参考的量化方法,能够在单细胞分辨率下评估细胞异常性 将细胞注释中的不确定性转化为量化指标,用于检测异常细胞状态,这是传统聚类和差异丰度分析无法实现的 未提及 提出一种利用参考数据集量化单细胞RNA测序中细胞异常性的方法 遗传扰动和耐药性数据集中的单细胞 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
320 2026-06-26
scTumorDrug: predicting cell-type-specific drug responses for heterogeneous tumors
2026-May-04, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 开发了scTumorDrug工具,整合单细胞RNA测序、批量RNA和药物响应数据,预测异质性肿瘤中细胞类型特异性药物反应 首次在来自小鼠模型和临床人类样本的真实肿瘤上直接验证细胞类型特异性药物反应预测,结合空间转录组学进行交叉验证 缺乏来自肿瘤亚群药物响应的直接实验验证,仅通过小鼠模型和空间转录组学间接验证 预测异质性肿瘤中细胞类型特异性药物反应,以实现精准医疗 细胞系、小鼠模型和临床人类样本中的肿瘤细胞 机器学习 膀胱肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学 NA 基因表达数据、药物响应数据 公开数据集(细胞系、小鼠模型、临床人类样本)及小鼠膀胱肿瘤模型 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
回到顶部