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当前共找到 39345 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing indicates AP-1 as a potential therapeutic target for autoimmune uveitis
2025-07, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.116945
PMID:40228638
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型，发现AP-1是疾病关键分子并验证其作为治疗靶点的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序揭示AP-1在自身免疫性葡萄膜炎发病机制中的关键作用，并发现其通过GM-CSF/IL-23反馈环路支持Th17细胞致病性 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探索自身免疫性葡萄膜炎的发病机制并寻找新的治疗靶点 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠的脾脏和颈引流淋巴结细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常和EAU小鼠的脾脏及颈引流淋巴结 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 302 | 2026-05-09 |
Female-biased vascular smooth muscle cell gene regulatory networks predict MYH9 as a key regulator of fibrous plaque phenotype
2025-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.28.645955
PMID:40236025
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研究论文 | 利用性别特异性基因调控网络揭示了MYH9作为女性斑块中调节纤维斑块表型的关键因子 | 首次通过性别特异性基因调控网络分析，发现MYH9在女性血管平滑肌细胞中调控纤维斑块形成 | 研究样本量有限（119名男性和32名女性），可能影响结果的普遍性 | 探究动脉粥样硬化中纤维斑块的性别差异分子机制 | 来自心脏移植供体的血管平滑肌细胞和颈动脉斑块 | 机器学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 贝叶斯网络 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 151名心脏移植供体（119名男性和32名女性）的血管平滑肌细胞样本 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 303 | 2025-10-07 |
A Unique Signature for Cancer-Associated Fibroblasts in Melanoma Metastases
2025-03, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.70002
PMID:39924882
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析黑色素瘤原发灶和肺转移灶中的癌症相关成纤维细胞，揭示了转移灶特异性CAF的独特特征 | 首次系统比较黑色素瘤原发灶和转移灶中CAF的转录特征，发现转移灶特异性CAF亚群及其与中性粒细胞的肿瘤依赖性串扰机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探索黑色素瘤转移过程中癌症相关成纤维细胞的异质性和功能特征 | 小鼠黑色素瘤原发灶和肺转移灶中的癌症相关成纤维细胞，以及人类黑色素瘤转移样本 | 单细胞生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约8400个CAF和正常成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 304 | 2026-05-09 |
ProBac-seq, a bacterial single-cell RNA sequencing methodology using droplet microfluidics and large oligonucleotide probe sets
2024-10, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01002-1
PMID:38769144
|
研究论文 | 介绍ProBac-seq这一利用液滴微流控和大寡核苷酸探针集的细菌单细胞RNA测序方法 | 通过使用mRNA特异性探针克服细菌mRNA无poly-A尾、转录本不稳定及细菌形态与现有技术不兼容的问题，实现高质量单细胞基因表达数据 | 未明确提及局限性，但方法依赖探针设计和大规模寡核苷酸合成，可能成本较高 | 提供一种适用于细菌的单细胞RNA测序方法，以研究细菌细胞异质性和基因表达状态 | 细菌细胞，如大肠杆菌或其他可通过原位杂交分析的单细胞生物 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数千个细菌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 液滴微流控 | NA | 基于液滴微流控的细菌单细胞RNA测序平台 |
| 305 | 2026-05-09 |
The transcriptome of CD14 + CD163 - HLA-DR low monocytes predicts mortality in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2024-Sep-11, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.08.07.24311386
PMID:39211854
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析外周血单核细胞中CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的转录组，发现其能够预测特发性肺纤维化患者的死亡率 | 首次发现CD14+CD163-HLA-DRlow单核细胞的230个基因表达特征可独立预测IPF死亡率，并验证了T细胞共刺激基因的低表达与高风险相关 | 样本量相对较小，且研究主要基于外周血和支气管肺泡灌洗液，未全面探索肺组织中其他免疫细胞的贡献 | 确定与特发性肺纤维化（IPF）死亡率相关的免疫细胞特异性转录组特征 | 416例IPF患者来自六个队列，外加一个独立验证队列（38例），包括外周血、支气管肺泡灌洗液和肺组织样本 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归模型 | 基因表达数据（单细胞RNA测序数据） | 初始队列18例（包括IPF、COVID-19、COVID-19后间质性肺病和对照组），验证队列416例来自六个队列，独立验证38例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2026-05-09 |
The aminophospholipid transporter, ATP8B3, as a potential biomarker and target for enhancing the therapeutic effect of PD-L1 blockade in colon adenocarcinoma
2024-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110907
PMID:39074670
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，发现ATP8B3在结肠腺癌中可作为潜在生物标志物，抑制ATP8B3可降低PD-L1表达并增强免疫治疗效果 | 首次揭示ATP8B3在结肠腺癌中调控PD-L1表达及免疫抑制微环境的作用，并提出联合ATP8B3抑制剂与免疫疗法的新策略 | 由于MSS亚型微环境中缺乏免疫杀伤细胞，ATP8B3高表达未能增加该类患者对PD-L1抑制剂的敏感性 | 探究ATP8B3作为结肠腺癌潜在生物标志物及增强PD-L1阻断治疗效果的靶点 | 结肠腺癌患者及细胞系 | 机器学习, 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, siRNA, shRNA, 蛋白质印迹分析, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 免疫浸润数据 | TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 307 | 2026-05-09 |
Multi-omics analysis reveals a pericyte-associated gene expression signature for predicting prognosis and therapeutic responses in solid cancers
2024-09, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2024.110942
PMID:39326641
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示周细胞相关基因表达特征，用于预测实体癌预后和治疗反应 | 首次识别肿瘤来源周细胞中的51个差异表达基因，并基于其中5个关键基因构建预后风险模型，可准确预测肝癌和肺癌的预后及治疗反应 | 仅验证了肝癌和肺癌中的发现，未在其他实体瘤中进行广泛验证 | 探究肿瘤微环境中血管周细胞对癌症进展的影响，并构建基于周细胞的预后预测模型 | 实体癌（肝癌和肺癌）患者 | 机器学习 | 肝癌, 肺癌 | 转录组测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 免疫染色 | 预后风险模型 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA及GEO数据库中的多个样本集（具体数量未在摘要中说明） | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2026-05-09 |
Convergent alterations in the tumor microenvironment of MYC-driven human and murine prostate cancer
2024-08-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51450-2
PMID:39198404
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和分子病理学比较人类前列腺癌与基因工程小鼠模型，揭示MYC驱动的肿瘤微环境变化 | 首次利用单细胞RNA测序结合基因工程小鼠模型，揭示MYC信号激活如何直接或间接重编程肿瘤微环境，以及人类与小鼠模型之间的平行变化 | 未提及具体局限性 | 研究MYC驱动前列腺癌进展中肿瘤微环境的重编程机制 | 人类前列腺癌组织和基因工程小鼠模型的前列腺癌样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类前列腺癌组织样本和基因工程小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 309 | 2026-05-09 |
Innate immune responses against mRNA vaccine promote cellular immunity through IFN-β at the injection site
2024-08-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51411-9
PMID:39191748
|
研究论文 | 通过生成综合的单细胞转录组图谱，研究mRNA疫苗在小鼠注射部位引发的先天免疫反应，特别是IFN-β信号在促进细胞免疫中的作用 | 首次揭示注射部位成纤维细胞在mRNA疫苗免疫反应中的关键作用，发现成纤维细胞特异性对mRNA组分响应产生IFN-β，并证明IFN-β信号对增强抗原特异性细胞免疫至关重要 | 研究仅基于雌性BALB/c小鼠模型，未在人类或其他动物模型中验证；未深入探讨IFN-β信号的持续时间及长期免疫效果 | 阐明mRNA疫苗注射部位早期免疫反应的分子机制，特别是先天免疫与适应性免疫的衔接过程 | 雌性BALB/c小鼠注射部位组织及引流淋巴结 | 数字病理学 | 新型冠状病毒肺炎（COVID-19） | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 雌性BALB/c小鼠注射部位及引流淋巴结样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3‘测序平台 |
| 310 | 2026-05-09 |
Plasma proteomics of acute tubular injury
2024-08-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51304-x
PMID:39191768
|
研究论文 | 利用SomaScan蛋白质组学平台鉴定急性肾小管损伤的血浆生物标志物，并结合多组学分析验证 | 首次在经活检确诊的肾病患者中系统鉴定与急性肾小管损伤严重程度相关的156种血浆蛋白，并阐明骨桥蛋白等关键标志物的生物学通路 | 可能缺乏外部验证队列中差异人群的普适性分析，且单细胞测序与血浆蛋白的相关性需进一步功能验证 | 发现与急性肾小管损伤相关的非侵入性血浆生物标志物 | 急性肾小管损伤患者及对照人群的血浆样本 | 蛋白质组学 | 肾脏疾病 | SomaScan蛋白质组学、区域转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据、转录组数据、临床队列数据 | 434例活检确诊肾病患者（发现队列）、44例（KPMP验证）、4610例（ARIC验证）、268例（CHROME验证） | SomaLogic | 蛋白质组学 | SomaScan | SomaScan蛋白质组学平台用于血浆蛋白定量分析 |
| 311 | 2026-05-09 |
Single-cell transcriptomics reveal transcriptional programs underlying male and female cell fate during Plasmodium falciparum gametocytogenesis
2024-08-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51201-3
PMID:39187486
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示恶性疟原虫配子体形成过程中雄性和雌性细胞命运的转录程序 | 首次利用单细胞RNA-seq解析恶性疟原虫在缺乏性染色体情况下的雄性和雌性配子体分化机制，预测了候选驱动基因，并发现AP2-G5转录因子特异性调控雄性发育 | 未明确提及实验重复次数及统计方法，且结果依赖于报告基因系，可能无法完全反映自然感染条件下的细胞状态 | 阐明恶性疟原虫雄性和雌性配子体分化的转录程序及调控机制 | 恶性疟原虫配子体报告基因系细胞 | 单细胞转录组学 | 疟疾（恶性疟原虫感染） | 单细胞RNA-seq | 基因调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 基于FACS富集的恶性疟原虫配子体细胞（具体细胞数量未在摘要中说明） | 未明确提及 | 单细胞RNA-seq | 未明确提及 | 基于FACS的细胞富集后进行单细胞RNA-seq |
| 312 | 2026-05-09 |
Nephron progenitors rhythmically alternate between renewal and differentiation phases that synchronize with kidney branching morphogenesis
2024-Jan-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568157
PMID:38045273
|
研究论文 | 该文章结合空间转录组数据与分支形态发生的生命周期，发现肾单位祖细胞在Wnt、Hippo-Yap、维甲酸等通路的调控下，节奏性地交替更新与分化阶段，并与肾脏分支形态发生同步 | 首次通过空间转录组学揭示肾单位祖细胞在微环境中节奏性交替更新与分化相，并阐明了Wnt/β-catenin与YAP信号时间重叠将分化信号转化为更新信号的机制 | 未详细说明样本量及体内验证的局限性 | 探究肾单位祖细胞如何协调自我更新与分化以匹配肾脏分支形态发生的节奏 | 小鼠肾脏发育中的肾单位祖细胞及人干细胞衍生的肾单位祖细胞类器官 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 313 | 2026-05-09 |
TooManyCellsInteractive: A visualization tool for dynamic exploration of single-cell data
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae056
PMID:39172544
|
研究论文 | 介绍TooManyCellsInteractive (TMCI)，一种基于浏览器的JavaScript应用，用于交互式探索单细胞数据中的细胞群体 | 提供直观界面可视化径向树表示的分层细胞亚群，支持多分辨率覆盖、过滤和比较生物学特征 | NA | 开发一种用户友好的可视化工具，促进大规模单细胞测序数据的探索 | 药物耐受持久性细胞中的泛癌分析数据 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 314 | 2026-05-09 |
StereoSiTE: a framework to spatially and quantitatively profile the cellular neighborhood organized iTME
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae078
PMID:39452614
|
研究论文 | 提出StereoSiTE框架，结合开源生物信息学工具和自定义算法，从空间转录组数据中推断免疫肿瘤微环境（iTME）中细胞邻域（CN）的功能性空间细胞相互作用强度（SCII） | 首次提供综合性分析框架，充分利用空间信息来精确推断细胞邻域内的空间细胞相互作用强度，并成功识别出由中性粒细胞主导的细胞邻域及其在治疗后的免疫肿瘤微环境重塑作用 | 仅应用于异种移植模型，可能需要在临床样本中进一步验证；框架的通用性和可扩展性尚未在多种数据类型和条件下全面测试 | 开发一种能够全面利用空间转录组数据、精确分析免疫肿瘤微环境中细胞邻域和空间细胞相互作用的分析框架 | 异种移植模型中的空间转录组数据集 | 计算生物学, 生物信息学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 多个样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 315 | 2026-05-09 |
demuxSNP: supervised demultiplexing single-cell RNA sequencing using cell hashing and SNPs
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae090
PMID:39607981
|
研究论文 | 提出一种名为demuxSNP的监督算法，结合细胞哈希和单核苷酸多态性进行单细胞RNA测序的多重样本拆分 | 首次使用监督学习方法，同时利用细胞哈希和SNP两种数据模态进行样本拆分，提高了低质量哈希数据的分类准确性并克服了类别不平衡问题 | 要求生物学样本具有遗传差异，且依赖高质量哈希数据初步推断基因型 | 改进单细胞RNA测序多重样本拆分的准确性和稳健性 | 模拟数据和肾细胞癌真实数据 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 细胞哈希, SNP分析 | 最近邻算法 | 单细胞基因表达数据, 基因型数据 | 模拟数据（含5-50%双细胞率）及真实肾细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 316 | 2026-05-09 |
GPU-accelerated Kendall distance computation for large or sparse data
2024-01-02, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae088
PMID:39658191
|
研究论文 | 本文介绍了GADES，一个GPU加速的Kendall距离计算软件包，适用于大型或稀疏数据 | 提出利用GPU进行大规模并行Kendall-τ距离矩阵计算，通过特定内存管理突破GPU容量限制，并针对稀疏数据设计了额外加速算法 | 未提及具体局限性，可能依赖GPU硬件资源 | 开发高性能Kendall距离矩阵计算方法，实现大数据的高效处理 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | 数值数据 | 模拟数据集和真实单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 317 | 2026-05-09 |
Identification and experimental validation of cuproptosis regulatory program in a sepsis immune microenvironment through a combination of single-cell and bulk RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1336839
PMID:38947313
|
研究论文 | 结合单细胞和批量RNA测序技术，识别并实验验证脓毒症免疫微环境中的铜死亡调控程序 | 首次在脓毒症中构建基于铜死亡的风险模型，并利用单细胞测序揭示铜死亡活性评分与单核细胞的关联及免疫微环境特征 | 未提及具体局限性，但可能包括模型验证样本量有限或体外实验的临床相关性需进一步验证 | 建立基于铜死亡的风险模型以诊断和预测脓毒症风险，并鉴定用于靶向治疗的铜死亡相关基因 | 脓毒症患者的免疫微环境及铜死亡相关基因 | 机器学习和数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、LASSO回归、Cox回归、流式细胞术、蛋白质印迹法、ELISA | LASSO回归模型、Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据 | 三个外部队列用于模型验证，具体样本量未在摘要中提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析 |
| 318 | 2026-05-09 |
Interstitial macrophage phenotypes in Schistosoma-induced pulmonary hypertension
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1372957
PMID:38779688
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术，鉴定了血吸虫诱导肺动脉高压中三种间质巨噬细胞亚群，并揭示了其功能串扰机制 | 首次阐明了血吸虫诱导肺动脉高压中常驻FOLR2+间质巨噬细胞分泌单核细胞招募配体，而招募的CCR2+间质巨噬细胞表达血小板反应蛋白-1（TSP-1）驱动肺动脉高压病理的细胞间对话机制 | 未在人体样本中验证，且仅关注小鼠模型中的间质巨噬细胞亚群，未涉及其他免疫细胞类型 | 探究血吸虫诱导肺动脉高压中间质巨噬细胞亚群的功能分化及其在病理中的作用 | 血吸虫暴露后的小鼠肺间质巨噬细胞亚群 | 机器学习和数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未暴露组及血吸虫暴露后第1、3、7天的小鼠肺间质巨噬细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 319 | 2026-05-09 |
Activation of TLR9 signaling suppresses the immunomodulating functions of CD55lo fibroblastic reticular cells during bacterial peritonitis
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1337384
PMID:38827745
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研究论文 | 本文研究了TLR9信号激活对细菌性腹膜炎期间CD55低表达成纤维网状细胞免疫调节功能的抑制作用 | 首次通过单细胞RNA测序发现肠系膜脂肪相关淋巴簇中两种成纤维网状细胞亚型（CD55高表达和CD55低表达），并揭示TLR9信号特异性抑制CD55低表达亚型的增殖、细胞因子产生和类维生素A代谢 | 仅在小鼠模型和人类脂肪组织来源的成纤维网状细胞中验证，未在临床患者中直接验证治疗效果 | 探索TLR9信号在不同成纤维网状细胞亚型中的调控作用及其对腹膜炎免疫应答的影响 | 小鼠肠系膜脂肪相关淋巴簇的成纤维网状细胞亚型及人类脂肪组织来源的成纤维网状细胞 | 免疫学 | 细菌性腹膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及人类脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 320 | 2026-05-09 |
Elucidating the causal associations and mechanisms between circulating immune cells and idiopathic pulmonary fibrosis: new insights from Mendelian randomization and transcriptomics
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1437984
PMID:39896814
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和转录组学分析阐明循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关系及机制 | 首次结合双向孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序验证，识别出CTSB、IL10和AGER作为特发性肺纤维化的潜在生物标志物 | 孟德尔随机化分析依赖公开数据库，可能受人群分层影响；单细胞分析样本量有限，需要进一步实验验证 | 阐明循环免疫细胞与特发性肺纤维化之间的因果关联并探索潜在生物标志物 | 循环免疫细胞表型和特发性肺纤维化 | 自然语言处理 | 特发性肺纤维化 | 孟德尔随机化分析、转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 公开数据库来源，未明确样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |