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当前共找到 40356 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-06-10 |
Single-cell RNA sequencing identifies M2-like macrophage polarization associated with mesenchymal stem cell treatment in a murine sepsis model
2026-Feb-20, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2026.13517
PMID:41718721
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示间充质干细胞治疗脓毒症小鼠模型诱导M2样巨噬细胞极化的机制 | 首次通过单细胞RNA测序在脓毒症模型中揭示MSCs治疗促进巨噬细胞向M2样转录状态转换的细胞机制 | 未探讨MSCs与其他免疫细胞类型的直接相互作用，且研究局限于小鼠模型 | 阐明间充质干细胞在脓毒症病理过程中与免疫细胞互作的具体机制 | 脂肪来源的间充质干细胞及小鼠脓毒症模型中的CD45阳性免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 脓毒症小鼠模型（具体数量未明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics Single Cell 3' 试剂盒 |
| 302 | 2026-06-10 |
Intratumoral Parvimonas micra promotes esophageal squamous cell carcinoma via p-cresol-induced Treg differentiation
2026-Feb-20, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady1644
PMID:41719397
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研究论文 | 本研究通过宏基因组测序和单细胞RNA测序，发现肿瘤内微小单胞菌通过分泌p-甲酚诱导调节性T细胞分化，从而促进食管鳞状细胞癌的进展 | 首次揭示了肿瘤内微生物（微小单胞菌）与食管鳞状细胞癌免疫微环境之间的直接机制联系，阐明了其通过代谢物p-甲酚诱导Treg分化的具体途径 | 未提及研究的具体局限性 | 探究肿瘤内微生物群在食管鳞状细胞癌发生与发展中的组成和功能影响 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤与配对正常组织，以及调节性T细胞 | 机器学习 | 食管癌 | 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 119对肿瘤-正常组织样本，45个单细胞RNA测序样本 | Illumina | 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 303 | 2026-06-10 |
Calibrating tissue level PDE models of ligand dynamics using single cell and spatial transcriptomics data
2026-Feb-19, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00657-8
PMID:41714655
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据校准组织水平的配体动力学偏微分方程模型 | 提出了一个计算流程，将有限体积求解器、生物信息学预处理、近似贝叶斯计算和基于梯度的优化相结合，利用单细胞和空间转录组数据校准组织尺度上的反应扩散模型参数 | 该方法依赖于高质量的空间转录组和单细胞数据，公开数据集的可用性和质量可能限制其广泛应用；此外，校准过程计算成本较高 | 开发一种灵活且严谨的方法，利用现代转录组学数据校准组织层次的机械模型参数 | 转化生长因子β的亚型，这是组织修复和纤维化的关键调节因子 | 机器学习, 数字病理学 | 纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 反应扩散偏微分方程, 近似贝叶斯计算, 梯度优化 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 两个公开的人类皮肤数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 304 | 2026-06-10 |
SCMO: a deep learning model integrating the single-cell resolution TME ecosystem and multi-omics for survival prediction in CRC patients
2026-Feb-19, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07417-y
PMID:41715092
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研究论文 | 构建了一个整合单细胞分辨率肿瘤微环境（TME）生态系统与多组学数据的深度学习模型SCMO，用于结直肠癌患者的生存预测 | 首次将单细胞RNA测序解析的TME特征与多组学数据通过自归一化神经网络融合，显著提高生存预测准确性，并利用空间转录组数据和积分梯度算法增强模型可解释性 | 研究未提及外部验证队列的独立验证；模型依赖EcoTyper算法解卷积bulk RNA-seq数据可能引入参考图谱偏差 | 开发一种结合单细胞分辨率TME和多组学数据的深度学习模型，提高结直肠癌患者生存预测的准确性 | 213例结直肠癌单细胞RNA测序样本及TCGA-CRC队列的bulk RNA-seq数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 自归一化神经网络 | 基因表达数据 | 213例结直肠癌样本，339,060个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 305 | 2026-06-10 |
Poly-l-lactic acid electrospun membrane with specific morphology promotes bone regeneration through macrophage reprogramming
2026-Feb-19, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04182-y
PMID:41715106
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研究论文 | 通过巨噬细胞重编程促进骨再生的特定形态聚左旋乳酸电纺膜研究 | 首次揭示不同形貌（取向与随机）和尺寸（纳米与微米）的聚左旋乳酸电纺膜通过调控巨噬细胞亚型转化促进骨再生的分子机制，特别是发现取向600nm组具有最佳骨修复效果 | 仅在大鼠颅骨缺损模型中验证，缺乏临床人体样本研究；单细胞RNA测序分析主要聚焦免疫微环境，其他细胞类型的作用未充分探讨 | 探究聚左旋乳酸电纺膜的物理形貌对骨免疫微环境的影响及其促进骨再生的分子机制 | 大鼠颅骨缺损模型中的骨组织及巨噬细胞与骨髓间充质干细胞共培养体系 | 数字病理学, 机器学习 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 大鼠骨组织样本（各组数量未明确提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2026-06-10 |
In situ electrospinning at the operating table to immobilise mesenchymal stem cells on the bony wall for the regeneration of osteoporotic bone defects
2026-Feb-19, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04165-z
PMID:41715169
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研究论文 | 利用手持静电纺丝装置在手术中将间充质干细胞直接固定于骨缺损部位，促进骨质疏松性骨缺损再生 | 提出一种新型干细胞递送策略，通过手持静电纺丝装置在体内骨缺损部位原位固定间充质干细胞，解决了现有方法依赖支架等载体、细胞难以直接粘附于复杂骨壁表面的问题 | 未提及具体限制，可能与样本量较小或动物模型局限性有关 | 开发一种改进的间充质干细胞递送策略，以增强骨质疏松性骨缺损的骨修复 | 骨质疏松大鼠的颅骨缺损模型及间充质干细胞 | 机器学学 | 骨质疏松性骨缺损 | 单细胞测序、组织mRNA测序、流式细胞术 | NA | 测序数据 | 骨质疏松大鼠（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 307 | 2026-06-10 |
From modality-specific to compositional foundation models for cell biology
2026-Feb-18, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2026.101534
PMID:41713397
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评论 | 探讨了组合式AI作为模块化设计方法，用于构建多模态基础模型，统一生物模态（如染色质可及性、蛋白质丰度、空间转录组学、显微镜成像和文本注释）成为细胞行为的统一表示 | 提出了组合式AI作为模块化设计方法构建多模态基础模型，并介绍了基于Transformer的注意力策略来实现这些模型 | 面临数据可用性有限和模态表示之间的结构差异等挑战 | 利用多模态AI解码细胞系统的复杂性，并展望代理虚拟细胞模型的发展 | 细胞生物学中的多模态数据 | 数字病理学 | 不适用 | NGS | Transformer | 图像、文本 | 不适用 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 308 | 2026-06-10 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Cellular and Molecular Differences Between Myxofibrosarcoma and Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma
2026-Feb-10, Medical sciences (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/medsci14010077
PMID:41718124
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤之间的细胞和分子差异 | 首次通过单细胞RNA测序比较这两种亚型的肿瘤细胞簇、细胞组成及配体-受体相互作用，揭示了淋巴样细胞组成和细胞间相互作用的差异 | 需进一步验证发现的差异 | 阐明黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤的细胞和转录组差异，以改善鉴别诊断 | 黏液纤维肉瘤和未分化多形性肉瘤的肿瘤样本 | 数字病理学 | 其他癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 每种亚型5个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 309 | 2026-06-10 |
Tissue-Specific High-Quality Protoplast Isolation for Single-Cell Analyses in Arabidopsis
2026-Feb-06, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69330
PMID:41729799
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研究论文 | 提出一种从拟南芥多种组织中分离高质量原生质体的稳健且可重复的方案，用于单细胞分析 | 针对不同组织类型优化酶解条件和纯化步骤，确保高产量和广泛细胞类型代表性，支持多种单细胞应用 | NA | 开发高效、可重复的原生质体分离方法，以应用于植物单细胞RNA测序等分析 | 拟南芥地上组织（叶片、茎、花）和根组织 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术，瞬时基因表达分析 | NA | 单细胞 | 拟南芥多种组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 310 | 2026-06-10 |
Metformin inhibits proliferation of residing fibroadipogenic progenitor cells from failing human hearts
2026-Feb-03, ESC heart failure
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/eschf/xvag001
PMID:41711740
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研究论文 | 二甲双胍抑制衰竭人类心脏中驻留的纤维脂肪祖细胞增殖 | 首次在HFrEF患者体内研究了心肌二甲双胍分布，并通过单细胞RNA测序识别出心脏纤维脂肪祖细胞（FAPs） | 样本量较小（7例患者和4例对照），可能影响结果的普遍性 | 探究二甲双胍在射血分数降低的心力衰竭（HFrEF）中的心肌分布及其对心脏纤维生成祖细胞的作用 | 7名HFrEF患者和4个对照人类心脏组织的纤维脂肪祖细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 正电子发射断层扫描, 荧光激活细胞分选 | NA | 图像, 文本 | 7名HFrEF患者进行PET成像, 4个HFrEF和4个对照心脏用于单细胞RNA测序 | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 311 | 2026-06-10 |
Tensor-cell2cell v2 unravels coordinated dynamics of protein- and metabolite-mediated cell-cell communication
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf667
PMID:41719185
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研究论文 | Tensor-cell2cell v2是一种计算工具，通过耦合张量成分分析联合分析蛋白质和代谢物介导的细胞间通讯，揭示其在脑类器官发育中的动态协调程序 | 首次将蛋白质和代谢物介导的通讯信号联合分析，利用耦合张量成分分析同时保留各模态独立性和数据结构分布 | NA | 开发能动态解析蛋白质和代谢物介导的细胞间通讯协调活动的计算方法 | 脑类器官发育中的细胞间通讯动态变化 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | 张量成分分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 312 | 2026-06-10 |
Heat shock response-driven signature and DNAJB11 in HCC: A multifaceted role in prognosis, immune microenvironment, ferroptosis and therapeutic sensitivity
2026-Feb, Journal of thermal biology
IF:2.9Q1
DOI:10.1016/j.jtherbio.2026.104415
PMID:41713042
|
研究论文 | 基于热休克反应相关基因构建肝细胞癌预后风险模型，并揭示其在免疫微环境、铁死亡和治疗敏感性中的多重作用 | 首次基于热休克反应相关基因对肝细胞癌进行分子分型，并构建预后风险模型，整合铁死亡机制分析，为个体化治疗提供新工具 | 未提及验证队列或外部数据集验证，且机制研究限于体外实验，缺乏体内模型验证 | 探索热休克反应在肝细胞癌预后、免疫微环境、铁死亡及治疗敏感性中的作用，并开发预后预测模型 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织样本及细胞系 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA测序，免疫组织化学，单细胞RNA测序，空间转录组学 | 机器学习模型，风险评分模型 | 基因表达数据，免疫组织化学图像，单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 基于公开数据集，样本量未具体说明 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 313 | 2026-06-10 |
Identifying cell-type-specific marker genes of dental epithelial cells using single-cell RNA sequence: A review
2026-Feb, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2026.100757
PMID:41714012
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综述 | 系统整合单细胞RNA测序数据与实验验证，构建牙上皮细胞类型特异性标记基因分子图谱 | 首次整合scRNA-seq、组织学验证、表型数据库和CAGE-seq数据，对成釉细胞和非成釉细胞谱系进行全面的分子标记鉴定 | 主要基于小鼠模型数据进行整合分析，缺乏人类牙发育数据的直接验证 | 建立牙上皮细胞类型的更新分子图谱，为解释牙釉质表型和指导未来牙发育研究提供综合基础 | 牙上皮细胞，包括内釉上皮、外釉上皮、星网层、中间层等细胞类型 | 数字病理学 | 牙发育相关疾病 | 单细胞RNA测序, CAGE测序 | NA | 基因表达数据 | 整合多个已发表的scRNA-seq牙发育研究数据集，以及小鼠牙组织免疫染色/原位杂交实验验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 314 | 2026-06-10 |
Microbiota-dependent transcriptional priming of lung innate immune cells in a mouse model of LPS-induced sepsis-associated lung injury
2026-Feb, Journal of oral biosciences
IF:2.6Q1
DOI:10.1016/j.job.2026.100742
PMID:41714041
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研究论文 | 研究无特定病原体和传统饲养小鼠在正常和脂多糖诱导脓毒症条件下肺免疫细胞的单细胞转录组，揭示共生微生物对肺先天免疫细胞转录成熟和功能的影响 | 首次通过单细胞RNA测序揭示共生微生物对肺先天免疫细胞（中性粒细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞）转录状态和成熟轨迹的启动作用，发现微生物信号缺失导致中性粒细胞成熟受阻及炎症反应减弱 | 仅基于小鼠模型和LPS诱导的脓毒症条件，结果可能不完全适用于人类或其他感染模型；未能详细阐明微生物信号的具体分子机制 | 探究共生微生物如何通过转录启动影响肺先天免疫细胞的成熟和炎症响应能力 | 无特定病原体（GF）和传统饲养（CV）小鼠的肺先天免疫细胞（中性粒细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞） | 单细胞转录组学 | 脓毒症相关肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | GF和CV小鼠在正常和LPS诱导脓毒症条件下的肺免疫细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用标准单细胞RNA测序流程进行细胞类型注释和通路分析 |
| 315 | 2026-06-10 |
Identification of a Potential Biomarker PDGFRA for Endometriosis Based on Comprehensive Analysis of Multiple Omics Data
2026-Feb, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-025-02049-5
PMID:41721175
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研究论文 | 基于多组学数据综合分析，确定PDGFRA为子宫内膜异位症的潜在生物标志物 | 结合批量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组数据分析，首次发现PDGFRA在异位病灶中心区域过表达，并通过虚拟敲除实验揭示其在间质细胞分化、黏附和凋亡中的作用 | PDGFRA作为生物标志物的临床验证尚需进一步实验，且其具体调控机制未完全阐明 | 探索子宫内膜异位症的发病机制并识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 子宫内膜异位症患者的异位内膜组织和间质细胞 | 机器学习和多组学分析 | 子宫内膜异位症 | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组分析、差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据和空间转录组数据 | 未在标题和摘要中明确提供具体样本数量 | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 316 | 2026-06-10 |
Decoding hepatocellular carcinoma prognosis: a machine learning-derived methylation signature integrating transcriptomic and tumor microenvironment insights
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003942
PMID:41731861
|
研究论文 | 通过整合转录组、甲基化组和肿瘤微环境信息，利用机器学习开发并验证了一种用于肝细胞癌预后预测的多维度甲基化特征 | 首次结合数百种机器学习算法系统整合转录组、甲基化组和临床数据，构建并验证了一个包含10个甲基化相关差异表达基因的稳健预后特征，并联合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示其与肿瘤微环境的关联 | NA（摘要未明确提及研究局限性） | 开发一种基于甲基化的多组学预后工具，提高肝细胞癌风险分层和预后预测的准确性，为个体化治疗决策提供框架 | 肝细胞癌患者的转录组、甲基化组和临床数据，以及配对肿瘤和癌旁组织样本 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 甲基化测序、RNA-seq、单细胞RNA测序、空间转录组学、定量实时PCR、Western blotting | 机器学习算法（数百种） | 转录组数据、甲基化数据、临床数据、单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据、qPCR和Western blotting验证数据 | 来自TCGA的大型样本数据，外加10对配对肝细胞癌肿瘤和癌旁非肿瘤组织 | Illumina | bulk RNA-seq, 甲基化测序, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Illumina NovaSeq（推测） | NA（未提供平台具体配置细节） |
| 317 | 2026-06-10 |
Screening Biomarkers for Nerve Injury Using Weighted Gene Co-Expression Network Analysis and Machine Learning
2026-Feb, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.71279
PMID:41733593
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研究论文 | 利用加权基因共表达网络分析和机器学习筛选神经损伤的生物标志物 | 结合多转录组数据集和三种机器学习算法，鉴定出Atf3、Bin2、Fcgr2b和Ucn四个具有诊断潜力的关键基因，并揭示其在神经免疫串扰中的双重作用 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，缺乏大规模临床样本验证，且对Fcgr2b促进神经突起生长的机制探讨尚不深入 | 识别并验证神经损伤的新型生物标志物，阐明其功能角色 | 神经损伤和假手术样本 | 机器学习 | 神经损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 318 | 2026-06-10 |
huSA: a comprehensive database for multi-dimensional resolution of bulk, single cell and spatial transcription profiles in skin diseases
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baag009
PMID:41719583
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研究论文 | 构建了一个名为人类皮肤图谱（huSA）的综合数据库，整合了多维度皮肤转录组数据，包括批量、单细胞和空间转录数据，以促进皮肤疾病研究 | 首次构建了涵盖17种皮肤疾病、63个独立数据集、超过3000个样本的多维度转录组数据库，提供标准化细胞类型注释、跨数据集整合分析和交互式可视化平台 | 未在摘要中明确说明局限性 | 构建一个全面、整合且用户友好的皮肤转录组数据图谱，实现多疾病、多模态数据的系统探索 | 皮肤疾病转录组数据，包括单细胞RNA测序、空间转录组和批量RNA-seq数据 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本, 基因表达数据 | 1434个单细胞RNA-seq样本、63个空间转录组样本、1502个批量RNA-seq样本，共17种皮肤疾病 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 319 | 2026-06-10 |
An unsupervised method for spatial transcriptomics analysis based on adversarial autoencoder
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag070
PMID:41712686
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研究论文 | 提出一种基于对抗自编码器的无监督空间转录组学分析方法DACN，整合改进的对抗自编码器与图卷积网络，以鲁棒分析不同分辨率和通量的空间转录组数据 | 创新性地将改进的对抗自编码器与图卷积网络集成在统一框架中，通过混合编码器（多注意力机制与残差连接）捕获精细局部表达模式同时保留关键全局信息，实现去噪与稳定潜在表征学习 | 未在文中明确提及局限性 | 开发一种无监督方法用于空间转录组学分析，以应对数据噪声和复杂性挑战 | 空间转录组学数据集 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 对抗自编码器（AAE），图卷积网络（GCN） | 基因表达数据 | 多个空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 320 | 2026-06-10 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals ISG15 as a Key Regulator of Macrophage-Mediated Inflammation Driving Primary Sjögren's Syndrome Progression
2026, Critical reviews in immunology
IF:0.8Q4
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示ISG15作为巨噬细胞介导的炎症驱动原发性干燥综合征进展的关键调控因子 | 整合批量RNA-seq与单细胞RNA-seq数据，结合三种机器学习算法筛选免疫代谢生物标志物，并首次实验验证ISG15在pSS中通过NF-κB通路调控炎症的功能 | 未提及明确的局限性 | 识别原发性干燥综合征的诊断生物标志物并表征单核-巨噬细胞分化轨迹 | 原发性干燥综合征患者的唾液腺细胞和THP-1巨噬细胞 | 机器学习 | 干燥综合征 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 伪时间分析, 机器学习 | LASSO回归, SVM-RFE, 随机森林, Monocle3, CellChat | 基因表达数据 | 42,157个唾液腺细胞 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |