单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
301	2025-09-19	Endothelial-adipocyte Cx43 Mediated Gap Junctions Can Regulate Adiposity 2024-Sep-10, Function (Oxford, England) DOI:10.1093/function/zqae029 PMID:38984993	研究论文	研究内皮细胞与脂肪细胞间Cx43介导的间隙连接在调节肥胖中的作用	首次揭示内皮细胞Cx43通过间隙连接调控脂肪组织功能的具体机制，并发现Ser368磷酸化修饰的关键作用	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证	探究脂肪毛细血管内皮细胞与脂肪细胞相互作用的机制及其对代谢功能的影响	小鼠模型、人类scRNAseq数据、体外共培养系统	代谢疾病研究	肥胖症	scRNAseq、TEM、遗传敲除、体外共培养	NA	基因表达数据、显微图像、代谢参数	高脂饮食小鼠模型及相应遗传修饰小鼠
302	2025-09-19	Vascular heterogeneity of tight junction Claudins guides organotropic metastasis 2024-Sep, Nature cancer IF:23.5Q1 DOI:10.1038/s43018-024-00813-1 PMID:39289595	研究论文	本研究揭示了血管内皮紧密连接蛋白Claudins的器官特异性异质性在决定乳腺癌器官趋向性转移中的关键作用	发现Ang2介导的Claudin 5抑制促进肺转移，而非Ang2响应的Claudin 2和10阻止肾转移，首次证明血管异质性独立于癌细胞内在机制指导转移	主要关注乳腺癌症模型，其他癌症类型的普适性尚未验证	探究器官特异性转移的机制，特别是乳腺癌向肺而非肾转移的原因	转移性乳腺癌症模型，包括自发和植入模型，以及炎症组织纤维化	癌症生物学	乳腺癌	单细胞测序分析，功能研究，抗体阻断实验	NA	测序数据，功能实验数据	NA
303	2025-09-19	Obesogenic diet disrupts tissue-specific mitochondrial gene signatures in the artery and capillary endothelium 2024-Feb-01, Physiological genomics IF:2.5Q2 DOI:10.1152/physiolgenomics.00109.2023 PMID:37982169	研究论文	本研究探讨了肥胖饮食对动脉和毛细血管内皮中线粒体基因表达的组织特异性影响	揭示了PPAR-γ在肥胖诱导的内皮细胞表型转换中的驱动作用，并通过人类数据验证了发现	NA	理解肥胖如何影响内皮细胞代谢表型，特别是线粒体基因表达	小鼠和人类的内皮细胞，特别是脂肪和肠系膜血管床	分子生物学	肥胖相关代谢疾病	bulk RNA测序, single-cell RNA测序, single-nuclei RNA测序	NA	RNA测序数据	小鼠脂肪和肠系膜血管内皮细胞，以及人类内脏脂肪单核RNA测序数据
304	2025-09-19	Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12 PMID:38622400	研究论文	本章介绍了从狼疮易感MRL/lpr小鼠中分离调节性B细胞（Breg）并进行单细胞RNA测序分析的实验方案	提供了针对狼疮模型小鼠的Breg细胞分离方案，并采用单细胞转录组分析技术深入表征Breg细胞	NA	研究调节性B细胞在自身免疫疾病和癌症免疫中的生物学功能与分子特征	狼疮易感MRL/lpr小鼠的调节性B细胞	NA	自身免疫疾病（狼疮）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
305	2025-09-19	Hyperactive mTORC1 in lung mesenchyme induces endothelial cell dysfunction and pulmonary vascular remodeling 2023-12-20, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI172116 PMID:38127441	研究论文	本研究探讨肺间质中过度活跃的mTORC1如何通过旁分泌信号导致内皮细胞功能障碍和肺血管重塑	首次揭示LAM中间质细胞通过旁分泌信号与内皮细胞对话，驱动血管重塑的机制，并建立特异性Tsc2敲除小鼠模型模拟人类疾病	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；长期效应和临床转化需进一步研究	探究淋巴管平滑肌瘤病（LAM）中肺血管重塑的分子机制	肺间质细胞和内皮细胞，使用Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl基因工程小鼠模型和LAM患者肺组织	分子病理学	肺疾病	单细胞RNA测序（scRNA-Seq），基因敲除模型	NA	转录组数据，组织形态学数据	基因工程小鼠模型（年龄8周至1年）和人类LAM终末期肺移植样本
306	2025-09-19	Retrospective pharmacogenetic study of psoriasis highlights the role of KLK7 in tumour necrosis factor signalling 2023-12-20, The British journal of dermatology DOI:10.1093/bjd/ljad332 PMID:37672660	研究论文	一项回顾性药物遗传学研究，探索银屑病治疗反应相关的遗传通路，并揭示KLK7基因在肿瘤坏死因子信号通路中的作用	发现两个新型遗传标记与治疗反应相关，并首次通过整合多组学数据验证KLK7在抗TNF治疗响应中的生物学机制	回顾性研究设计，样本量相对有限（1942例），自我评估的治疗反应可能存在偏倚	探索银屑病药物反应相关的遗传通路，寻找预测治疗效果的生物标志物	1942例基因分型的银屑病患者	药物遗传学	银屑病	基因分型、表观基因组学、转录组学、免疫组化、单细胞RNA测序	线性回归	遗传数据、临床数据、表达数据	1942例银屑病患者
307	2025-09-19	Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease 2023-12-11, The EMBO journal DOI:10.15252/embj.2023113898 PMID:37962490	研究论文	本研究通过单细胞转录组学评估了三种代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）的人肝类器官模型，比较了它们在炎症和纤维化模拟方面的差异	首次系统评估不同诱导条件（油酸、棕榈酸和TGF-β1）下MASLD类器官模型的翻译潜力，并建立单细胞参考基准	研究仅基于体外类器官模型，尚未进行体内验证或临床相关性研究	评估和分层MASLD肝类器官模型的疾病模拟能力	人肝类器官	数字病理学	代谢功能障碍相关脂肪性肝病	单细胞转录组学分析	类器官模型	单细胞基因表达数据	三种不同诱导条件下的肝类器官模型
308	2025-09-19	GPNMB+ Gal-3+ hepatic parenchymal cells promote immunosuppression and hepatocellular carcinogenesis 2023-12-11, The EMBO journal DOI:10.15252/embj.2023114060 PMID:38009297	研究论文	通过单细胞转录组测序揭示GPNMB+ Gal-3+肝实质细胞在肝细胞癌免疫抑制微环境形成和恶性进展中的关键作用	首次在单细胞层面鉴定出肝细胞癌进展过程中的三种肝实质细胞亚群，并发现GPNMB+ Gal-3+ MT细胞兼具恶性和免疫抑制特性	NA	探究肝细胞癌发生发展过程中特定细胞群体及其在肿瘤免疫微环境形成中的作用	毒素诱导的肝肿瘤大鼠模型和肝细胞癌患者样本	数字病理学	肝细胞癌	单细胞转录组测序	NA	单细胞RNA测序数据	大鼠模型和HCC患者样本（具体数量未明确说明）
309	2025-09-19	Hemorrhage-activated NRF2 in tumor-associated macrophages drives cancer growth, invasion, and immunotherapy resistance 2023-12-07, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI174528 PMID:38060331	研究论文	本研究揭示了肿瘤内出血通过激活NRF2通路促进肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的促癌功能，从而驱动癌症进展和免疫治疗抵抗	首次将肿瘤内出血与NRF2激活的TAMs促癌功能直接关联，并阐明血红素作为关键微环境因子通过NRF2信号轴调控巨噬细胞表型	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类临床相关性仍需进一步验证	探索肿瘤内出血如何通过调控巨噬细胞功能影响癌症进展和治疗响应	肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、MC38结肠腺癌细胞系、小鼠模型	肿瘤免疫学	结肠癌	单细胞RNA测序、空间转录组学、3D细胞培养球体功能实验	NA	转录组数据、空间基因表达数据	MC38肿瘤小鼠模型及体外培养系统
310	2025-09-19	IL-27 produced during acute malaria infection regulates Plasmodium-specific memory CD4+ T cells 2023-12-07, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1 DOI:10.15252/emmm.202317713 PMID:37855243	研究论文	本研究揭示急性疟疾感染期间产生的IL-27通过抑制独特Th1记忆前体CD4+T细胞的发育来调控免疫应答	发现IL-27在急性感染期靶向CD4+T细胞应答的关键时间窗口，并鉴定出两个具有独特功能特征的CD4+T细胞亚群	研究局限于啮齿类疟原虫感染模型，人类中的适用性需进一步验证	阐明IL-27在疟疾感染中对CD4+T细胞记忆形成的调控机制	疟原虫特异性记忆CD4+T细胞	免疫学	疟疾	单细胞RNA测序，细胞因子中和实验	NA	基因表达数据，流式细胞术数据	使用疟原虫感染的小鼠模型进行研究
311	2025-09-19	DNA methylation-mediated Rbpjk suppression protects against fracture nonunion caused by systemic inflammation 2023-12-05, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI168558 PMID:38051594	研究论文	本研究揭示了系统性炎症通过DNA甲基化调控Rbpjk表达影响骨折不愈合的机制，并提出了表观遗传修饰的祖细胞局部治疗策略	首次发现NF-κB/Dnmt3b/Rbpjk轴在炎症性骨再生中的作用机制，并验证了表观遗传干预的治疗潜力	研究主要基于小鼠模型，临床转化效果仍需进一步验证	探究系统性炎症导致骨折不愈合的分子机制并开发治疗策略	骨折愈合过程中的祖细胞及其表观遗传调控	骨再生医学	骨折不愈合	单细胞RNA测序、遗传动物模型、表观遗传修饰	转基因小鼠模型（Ikk2ca、Dnmt3b功能缺失/过表达）	基因表达数据、表观遗传数据	多种遗传修饰小鼠模型，具体数量未明确说明
312	2025-09-19	Modelling the distinct roles of epithelial and stromal androgen receptor in the regulation of prostate epithelial dynamics 2023-11, The FEBS journal DOI:10.1111/febs.16900 PMID:37424435	研究论文	本文提出一个概念框架和数学模型，描述雄激素依赖的前列腺上皮动态调节机制	区分上皮和基质雄激素受体的不同功能，并提出IGF1作为关键协调因子，建立能模拟健康与疾病状态的数学模型	基于现有文献推导，模型相对简化，可能需要更全面的实验验证	阐明雄激素调控前列腺上皮细胞动态的分子机制	前列腺上皮细胞和基质细胞	计算生物学	前列腺癌	单细胞RNA-seq数据分析，数学建模	数学模型	基因表达数据	NA
313	2025-09-19	Spatial transcriptomics reveals the distinct organization of mouse prefrontal cortex and neuronal subtypes regulating chronic pain 2023-Nov, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-023-01455-9 PMID:37845544	研究论文	利用空间转录组学揭示小鼠前额叶皮层在慢性疼痛调节中的独特细胞与环路组织	首次通过空间分辨单细胞转录组分析揭示前额叶皮层细胞类型组成、基因表达模式及神经元亚型靶向特性的区域特异性	研究局限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证	解析前额叶皮层调控多种功能（包括慢性疼痛）的细胞与环路机制	成年小鼠前额叶皮层组织	空间转录组学	慢性疼痛	空间分辨单细胞转录组测序	NA	空间转录组数据	未明确样本数量（成年小鼠前额叶皮层）
314	2025-09-19	Myelin dysfunction drives amyloid-β deposition in models of Alzheimer's disease 2023-06, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-06120-6 PMID:37258678	研究论文	本研究探讨髓鞘功能障碍如何通过影响淀粉样前体蛋白加工和分散小胶质细胞清除能力，驱动阿尔茨海默病模型中β淀粉样蛋白沉积	首次揭示髓鞘完整性丧失是AD上游风险因素，发现髓鞘损伤会分散斑块清除小胶质细胞至髓鞘病变部位	基于小鼠模型研究，人类年龄相关性髓鞘变化与AD的直接关联仍需进一步验证	探究年龄相关髓鞘功能障碍与阿尔茨海默病β淀粉样蛋白沉积的因果关系	阿尔茨海默病小鼠模型	神经科学	阿尔茨海默病	bulk and single-cell transcriptomics（批量与单细胞转录组学）	小鼠疾病模型	基因表达数据	NA
315	2025-07-22	Nonlesional lupus skin contributes to inflammatory education of myeloid cells and primes for cutaneous inflammation 2022-04-27, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.abn2263 PMID:35476593	研究论文	本文通过单细胞RNA测序和空间RNA测序技术，研究了狼疮性皮肤病的免疫发病机制，特别关注了非病变皮肤在疾病中的作用	首次全面描述了狼疮患者病变和非病变皮肤的特征，并揭示了CD16树突状细胞在皮肤中的促炎表型获得过程	研究样本量有限，且未探讨发现的分子机制如何转化为临床表型	探究皮肤性红斑狼疮(CLE)的免疫发病机制	狼疮患者的正常外观皮肤、病变皮肤和循环免疫细胞	数字病理学	红斑狼疮	单细胞RNA测序, 空间RNA测序	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量的狼疮患者皮肤和免疫细胞样本
316	2025-09-19	Single cell RNA sequencing of AML initiating cells reveals RNA-based evolution during disease progression 2021-10, Leukemia IF:12.8Q1 DOI:10.1038/s41375-021-01338-7 PMID:34244611	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究AML起始细胞在疾病进展过程中的RNA水平演化	首次在AML起始细胞中发现RNA克隆演化现象，揭示了代谢、凋亡和趋化因子信号通路的共同演化网络	研究样本量有限，需要在更大队列中验证发现	探究急性髓系白血病（AML）复发机制和起始细胞的演化规律	AML患者的白血病起始细胞（LICs）	单细胞组学	急性髓系白血病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据	匹配的诊断和复发患者样本（具体数量未明确说明）
317	2024-08-07	Single-cell RNA sequencing identifies macrophage transcriptional heterogeneities in granulomatous diseases 2021-06, The European respiratory journal DOI:10.1183/13993003.03794-2020 PMID:33602861	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
318	2025-09-19	Beta-Poisson model for single-cell RNA-seq data analyses 2016-07-15, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btw202 PMID:27153638	研究论文	提出一种针对单细胞RNA测序数据的beta-Poisson混合模型，用于捕获基因表达的双峰分布特性并进行差异表达分析	开发了能捕捉单细胞RNA-seq数据双峰分布特征的beta-Poisson模型，优于传统的gamma-Poisson模型	NA	改进单细胞RNA测序数据的统计建模和差异表达分析方法	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	beta-Poisson混合模型，广义线性模型	基因表达数据	多个真实单细胞RNA-seq数据集
319	2025-09-18	Targeting CLK1/SRSF7 axis-dependent alternative splicing sensitizes pancreatic ductal adenocarcinoma to chemotherapy and immunotherapy 2025-Nov, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2025.101292 PMID:40840404	研究论文	本研究揭示了环状RNA cALG8通过调控选择性剪接促进胰腺导管腺癌化疗耐药和免疫抑制的分子机制	首次发现cALG8作为蛋白支架促进CLK1磷酸化SRSF7，从而形成ATM203变体增强DNA损伤修复能力	研究主要基于临床前模型，尚未进行人体临床试验验证	阐明胰腺导管腺癌吉西他滨耐药机制并开发靶向治疗策略	胰腺导管腺癌细胞系、患者来源类器官(PDO)和异种移植模型(PDX)	肿瘤生物学	胰腺癌	环状RNA测序、液相色谱-质谱联用(LC-MS)、单细胞测序、反义寡核苷酸(ASO)	NA	基因组数据、蛋白质组数据、单细胞数据	化疗敏感与耐药肿瘤样本、PDO/PDX模型
320	2025-09-18	Environmental nano-particulates induced pre-implantation embryonic toxicity in pluripotent stem cell-derived blastoids 2025-Oct-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987) DOI:10.1016/j.envpol.2025.126809 PMID:40645264	研究论文	本研究利用多能干细胞衍生的胚状体评估环境纳米颗粒污染物对早期胚胎发育的毒性作用	首次建立灵长类多能干细胞来源的胚状体平台，构建了多层面、多维度的早期胚胎暴露组数据集，并发现与暴露剂量线性相关的滋养层细胞群和分子事件	研究基于体外胚状体模型，与体内真实胚胎发育环境存在差异	评估环境纳米颗粒污染物对早期胚胎发育的毒性效应	灵长类多能干细胞衍生的胚状体	发育生物学	生殖发育疾病	10X scRNA-seq, DIA-MS	胚状体模型	单细胞转录组数据、蛋白质组数据	未明确说明具体样本数量，但采用高通量研究模型