单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 32540 篇文献,本页显示第 301 - 320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
301 2025-11-12
Precision and Accuracy in Quantitative Measurement of Gene Expression from Single-Cell/Nuclei RNA Sequencing Data
2025-Apr-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究系统评估了单细胞/单核RNA测序数据中基因表达定量测量的精确度和准确性 建立了基于大量数据的数据驱动阈值来优化研究设计,并开发了VICE工具评估数据质量和估计差异表达真阳性率 研究主要关注单细胞水平的精确度和准确性,可能未涵盖所有技术变异来源 评估单细胞/单核RNA测序数据的定量测量性能并建立优化指南 单细胞和单核RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序,单核RNA测序 NA 基因表达数据 3,682,576个细胞来自339个样本 NA 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq NA NA
302 2025-11-12
BDNF augmentation reverses cranial radiation therapy-induced cognitive decline and neurodegenerative consequences
2024-12-18, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究探讨了利鲁唑通过增加BDNF水平逆转颅脑放疗诱导的认知衰退和神经退行性后果 首次证明FDA批准的ALS药物利鲁唑可通过增加BDNF水平逆转放疗诱导的认知功能障碍,并利用空间转录组学揭示其神经保护机制 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体验证;未评估神经发生的影响 评估利鲁唑对放疗诱导认知功能障碍的治疗效果 成年小鼠模型(颅脑照射9 Gy) 神经科学 神经系统疾病 空间转录组学,双重免疫荧光染色,生化评估 动物模型 基因表达数据,免疫荧光图像,行为学数据 未明确说明具体样本数量的小鼠实验 NA 空间转录组学 NA NA
303 2025-11-12
Structural and functional properties of mSWI/SNF chromatin remodeling complexes revealed through single-cell perturbation screens
2023-04-20, Molecular cell IF:14.5Q1
研究论文 通过单细胞扰动筛选揭示mSWI/SNF染色质重塑复合物的结构和功能特性 首次结合Perturb-seq、CRISPR-Cas9敲除和单细胞多组学技术系统解析mSWI/SNF亚基功能 NA 解析mSWI/SNF染色质重塑复合物各亚基对基因表达的贡献 哺乳动物SWI/SNF染色质重塑复合物亚基 表观遗传学 癌症 Perturb-seq, CRISPR-Cas9敲除, 单细胞RNA-seq, SHARE-seq NA 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
304 2025-11-11
Harnessing Arginase-2-specific CD8+ T cells to target immunosuppressive Cutaneous T cell Lymphoma
2025-Nov-10, The British journal of dermatology
研究论文 本研究证明ARG2特异性CD8⁺ T细胞能够靶向识别并杀伤表达ARG2的皮肤T细胞淋巴瘤细胞 首次发现ARG2特异性CD8⁺ T细胞可靶向识别恶性CTCL细胞,揭示了ARG2作为CTCL免疫治疗新靶点的潜力 研究仅使用了8个CTCL细胞系和公共单细胞RNA测序数据集,样本量有限 探索ARG2特异性CD8⁺ T细胞靶向治疗皮肤T细胞淋巴瘤的新免疫治疗策略 皮肤T细胞淋巴瘤细胞系和患者病灶中的恶性T细胞 免疫治疗 皮肤T细胞淋巴瘤 western blotting, 单细胞RNA测序, IFN-γ ELISPOT, CRISPR-Cas9基因敲除 NA 蛋白质印迹数据, 单细胞RNA测序数据, 细胞因子分泌数据 8个CTCL细胞系和公共单细胞RNA测序数据集中的CTCL患者病灶 NA 单细胞RNA测序 NA NA
305 2025-11-11
Selenomethionine alleviates aortic dissection via PGC-1α/NRF2/TFAM-mediated mitochondrial biosynthesis against ferroptosis: an experimental study
2025-Nov-10, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究探讨了硒代蛋氨酸通过PGC-1α/NRF2/TFAM轴调控线粒体生物合成抑制铁死亡,从而缓解主动脉夹层的机制 首次揭示硒代蛋氨酸通过PGC-1α/NRF2/TFAM轴调控线粒体生物合成抑制铁死亡的新机制 动物模型和细胞实验仍需临床验证 探究硒代蛋氨酸治疗主动脉夹层的疗效及其分子机制 小鼠主动脉夹层模型和血管平滑肌细胞 分子生物学 心血管疾病 单细胞测序,转录组分析,siRNA敲低 动物模型,细胞模型 基因表达数据,病理数据 小鼠模型和细胞样本 NA 单细胞RNA测序,转录组测序 NA NA
306 2025-11-11
LMO7 Suppresses Tumor-Associated Macrophage Phagocytosis of Tumor Cells Through Degradation of LRP1
2025-Nov-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了LMO7通过降解LRP1抑制肿瘤相关巨噬细胞吞噬肿瘤细胞的机制 首次发现LMO7通过促进LRP1的K48连接多聚泛素化降解来抑制巨噬细胞吞噬功能,并证明LMO7缺失与SIRPα阻断联合治疗的协同抗肿瘤效果 NA 探究LMO7在肿瘤相关巨噬细胞功能调控中的作用机制 肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤细胞 肿瘤免疫学 实体肿瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
307 2025-11-11
A cell-type-specific regulon controlling monoterpene indole alkaloid biosynthesis with feedback and feedforward activation loops
2025-Nov-09, The New phytologist
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了两种星形植物中单萜吲哚生物碱生物合成的细胞类型特异性调控网络 发现了控制单萜吲哚生物碱生物合成的细胞类型特异性调控子,包含反馈和前馈激活回路,并证明了两物种间转录因子的共同选择 研究聚焦于特定细胞类型,可能不适用于其他生物碱生物合成系统 研究植物次生代谢产物生物合成的细胞类型特异性调控机制 长春花和喜树的单萜吲哚生物碱生物合成系统 植物分子生物学 NA 单细胞RNA测序 基因调控网络 RNA测序数据 两种星形植物物种的干细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
308 2025-11-11
Integrative SMR and single cell & spatial analysis reveals the spatial heterogeneity and prognostic value of CASP9-mediated apoptotic pathways in clear cell renal cell carcinoma
2025-Nov-07, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化分析,揭示了CASP9介导的凋亡通路在透明细胞肾细胞癌中的空间异质性及其预后价值 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学与孟德尔随机化方法结合,系统解析了CASP9驱动的凋亡程序在肾癌中的空间组织和免疫抑制功能 研究主要基于回顾性队列数据,需要进一步实验验证CASP9在肿瘤-巨噬细胞相互作用中的具体机制 阐明凋亡相关基因程序在透明细胞肾细胞癌中的空间动态、转录异质性和预后相关性 透明细胞肾细胞癌患者肿瘤组织中的恶性细胞亚群 数字病理学 肾癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化分析 LASSO Cox回归, DeepSurv 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 基因组数据 TCGA和E-MTAB-1980队列的透明细胞肾细胞癌患者样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
309 2025-11-11
EGR4 transcriptionally upregulates GDF15 to promote gastric cancer metastasis
2025-Nov-07, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现EGR4通过转录上调GDF15促进胃癌转移的新机制 首次发现EGR4/GDF15轴在胃癌转移中的关键作用,并揭示了其通过ErbB受体异源二聚化和CAF激活的双重促转移机制 样本量较小(仅6例患者),需要更大规模研究验证 探究胃癌转移的分子驱动机制 胃癌患者原发肿瘤和匹配的转移淋巴结 单细胞测序 胃癌 单细胞RNA测序, ChIP-seq, 荧光素酶报告实验 NA 单细胞RNA测序数据, ChIP-seq数据 6例胃癌患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
310 2025-11-11
Targeting the ac4C 'Writer' NAT10 enhances pancreatic cancer immunotherapy via dual modulation of CD8+ T cells and tumor cells
2025-Nov-07, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究探索了NAT10介导的ac4C RNA修饰在胰腺癌进展和免疫逃逸中的作用机制 首次揭示NAT10通过ac4C乙酰化稳定ETS2和KRT8 mRNA,形成正反馈环上调PD-L1表达,促进胰腺癌免疫逃逸 NA 探索NAT10在胰腺癌免疫治疗耐药中的作用机制及治疗潜力 胰腺癌细胞、CD8+T细胞、肿瘤微环境 癌症免疫学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
311 2025-11-11
The transcription factor ZEB2 mediates the antitumor efficacy of tumor-infiltrating lymphocytes in non-small cell lung cancer
2025-Nov-07, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析发现转录因子ZEB2在非小细胞肺癌中驱动CD8+T细胞向细胞毒性效应轨迹分化 首次通过metaVIPER单细胞RNA测序分析揭示ZEB2作为主调节子在CD8+T细胞分化中的关键作用,并发现T-bet/ZEB2轴在肺癌免疫治疗中的新机制 研究样本量较小(14例初治患者),且动物模型结果需要进一步临床验证 探索非小细胞肺癌中CD8+肿瘤浸润淋巴细胞功能调节机制,寻找改善免疫检查点阻断治疗效果的策略 非小细胞肺癌患者CD8+肿瘤浸润淋巴细胞、小鼠肺癌模型 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA测序,metaVIPER分析,体外细胞实验,动物模型 NA 单细胞RNA测序数据 14例初治非小细胞肺癌患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
312 2025-11-11
Single-cell analysis unravels divergent gene signatures shaping seminoma stemness and metastasis
2025-Nov-07, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞分析揭示精原细胞瘤干性与转移的分子特征 首次整合单细胞RNA测序、TCGA数据挖掘和细胞生物学实验,发现DPPA4/PSMA7高表达细胞具有高干性和转移特性,而PAGE5/SAT1高表达细胞特性相反 研究样本量有限,主要基于Tcam-2和NCCIT细胞系,需要更多临床样本验证 探索精原细胞瘤转移机制并开发转移风险分层工具 精原细胞瘤肿瘤细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 数字病理学 睾丸癌 单细胞RNA测序, TCGA数据挖掘, 细胞生物学实验 NA 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 细胞实验数据 Tcam-2和NCCIT两种细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
313 2025-11-11
Single-cell RNA sequencing identifies potential critical prognostic biomarkers in bladder carcinoma
2025-Nov-07, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序技术识别膀胱癌的潜在关键预后生物标志物 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据识别膀胱癌预后相关基因,并发现IGFBP5、KRT14和SERPINF1与不良生存结局相关 研究样本来源于公共数据库,需要进一步实验验证和临床队列验证 识别能够预测膀胱癌患者预后的遗传标志物 膀胱癌患者样本和膀胱癌细胞系 生物信息学 膀胱癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 蛋白质印迹 LASSO-Cox回归模型 RNA测序数据, 基因表达数据 GSA-Human数据库中的膀胱癌样本和6种膀胱癌细胞系 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
314 2025-11-11
Laminar CD34+ membranous cells with mechanosensitive properties in subcutaneous fascia of the abdominal midline
2025-Nov-07, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序在腹部中线皮下筋膜中发现了一种新型CD34+膜性细胞群 首次识别出具有机械敏感特性的CD34+膜性细胞群,揭示了其在筋膜中作为机械装置和信号枢纽的新功能 研究仅限于大鼠腹部中线皮下筋膜,人类样本和其他解剖部位尚未验证 探索筋膜精细结构和细胞组成,揭示新型细胞群的功能特性 大鼠腹部中线皮下筋膜组织 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序,形态学验证,超微结构分析 NA 单细胞转录组数据,显微图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
315 2025-11-11
Cucurbitacin E inhibits M1 macrophage polarization and attenuates rheumatoid arthritis: a multi-omics analysis and experimental validation
2025-Nov-07, Journal of orthopaedic surgery and research IF:2.8Q1
研究论文 本研究通过多组学分析和实验验证探讨葫芦素E通过抑制M1巨噬细胞极化缓解类风湿性关节炎的作用机制 首次整合转录组学、单细胞测序和网络药理学多组学方法系统研究葫芦素E在类风湿性关节炎中的作用机制 需要进一步临床研究验证葫芦素E的治疗效果 探索葫芦素E在类风湿性关节炎中的治疗机制 类风湿性关节炎患者样本和巨噬细胞极化过程 生物信息学 类风湿性关节炎 转录组学, 单细胞测序, 网络药理学, 流式细胞术 机器学习, WGCNA 基因表达数据, 单细胞数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
316 2025-11-11
Multi-omics analyses identify mannose phosphate isomerase-centered hypoxia-induced angiogenesis signature in colorectal cancer
2025-Nov-07, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了结直肠癌中缺氧诱导血管生成的转录调控机制,并鉴定出甘露糖磷酸异构酶(MPI)在这一过程中的关键作用 首次系统识别了12个HIFs转录激活的HIA相关基因,构建了HIAscore预后评分系统,并发现MPI通过LDHA相互作用激活JAK2/STAT3信号通路促进血管生成的新机制 研究主要基于计算分析和体外实验验证,需要更多临床样本和机制研究进一步证实 探索结直肠癌中缺氧诱导血管生成的调控网络、分子机制和预后价值 结直肠癌患者和细胞系 生物信息学 结直肠癌 ChIP-seq, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 微阵列, RT-qPCR, Co-IP, western blot, 集落形成实验, 管形成实验, 皮下异种移植瘤模型 ssGSEA, SRGA, 共识聚类 多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, ChIP-seq NA NA
317 2025-11-11
The multifaceted roles of non-coding RNAs in cell-cell communication in cardiovascular health and disease
2025-Nov-07, Cell & bioscience
综述 探讨非编码RNA在心血管系统细胞间通讯中的多重作用及其在心脏发育、功能和疾病进展中的调控机制 系统对比已确立的microRNA通讯机制与新兴长链非编码RNA的重要性,并强调测序技术对解析非编码RNA通讯网络的革新性贡献 长链非编码RNA及其载体在心脏细胞间信号传导中的作用研究不足,非编码RNA摄取机制及其影响的理解存在空白 阐明非编码RNA通过细胞外囊泡等载体介导心血管系统细胞间通讯的分子机制 心血管系统中的非编码RNA(包括microRNA和长链非编码RNA)及其载体(细胞外囊泡、RNA结合蛋白、脂蛋白复合物) 自然语言处理 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
318 2025-11-11
Identification of gene modules associated with B cell activation and tissue remodeling in primary Sjögren's syndrome
2025-Nov-07, BMC immunology IF:2.9Q3
研究论文 通过单细胞转录组分析识别与原发性干燥综合征中B细胞激活和组织重塑相关的基因模块 首次应用高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)和scRank方法在单细胞水平解析pSS的基因调控网络 样本量较小(仅3例患者和3例对照), 需要未来功能验证 探索pSS中B细胞相关基因模块并发现新的治疗靶点 原发性干燥综合征患者的唇唾液腺细胞 单细胞转录组学 自身免疫性疾病 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, Gene Ontology富集分析 hdWGCNA, scRank 单细胞基因表达数据 32,337个细胞(来自3例pSS患者和3例健康对照) NA 单细胞RNA-seq NA NA
319 2025-11-11
Endothelial septin 4 reduction contributes to lipopolysaccharide-induced acute lung injury by disrupting endothelial barrier integrity and promoting infiltration of ISG+ cells
2025-Nov-07, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和内皮特异性SEPT4条件性敲除小鼠模型,揭示了内皮细胞中septin 4减少通过破坏内皮屏障完整性和促进ISG+细胞浸润导致急性肺损伤的机制 首次阐明SEPT4在内皮细胞中的特异性分布及其在急性肺损伤中通过调节内皮屏障功能和免疫细胞浸润的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 阐明内皮特异性septins在急性肺损伤中的作用和机制 小鼠肺组织、内皮细胞、成纤维细胞和ISG+免疫细胞 单细胞生物学 急性肺损伤 单细胞RNA测序、条件性基因敲除、组织病理学分析 NA 单细胞转录组数据、组织病理图像、蛋白质表达数据 小鼠模型,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
320 2025-11-11
Transcriptomic plasticity of cholinergic adipose macrophages in the acute thermogenic response
2025-Nov-07, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胆碱能脂肪巨噬细胞在急性冷暴露下的转录组可塑性及其混合起源 首次在单细胞水平系统揭示胆碱能脂肪巨噬细胞的转录组动态特征和混合胚胎/成体骨髓起源 研究仅基于小鼠模型,人类相关性尚需验证;机制性研究不足 探究胆碱能脂肪巨噬细胞在急性产热反应中的转录组特征和细胞起源 小鼠皮下白色脂肪组织中的ChAT-eGFP+胆碱能细胞 单细胞转录组学 代谢疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠皮下白色脂肪组织样本(热中性和急性冷暴露条件) NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部