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当前共找到 40345 篇文献,本页显示第 301 - 320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
301 2026-06-10
Heat shock response-driven signature and DNAJB11 in HCC: A multifaceted role in prognosis, immune microenvironment, ferroptosis and therapeutic sensitivity
2026-Feb, Journal of thermal biology IF:2.9Q1
研究论文 基于热休克反应相关基因构建肝细胞癌预后风险模型,并揭示其在免疫微环境、铁死亡和治疗敏感性中的多重作用 首次基于热休克反应相关基因对肝细胞癌进行分子分型,并构建预后风险模型,整合铁死亡机制分析,为个体化治疗提供新工具 未提及验证队列或外部数据集验证,且机制研究限于体外实验,缺乏体内模型验证 探索热休克反应在肝细胞癌预后、免疫微环境、铁死亡及治疗敏感性中的作用,并开发预后预测模型 肝细胞癌患者的肿瘤组织样本及细胞系 机器学习 肝细胞癌 RNA测序,免疫组织化学,单细胞RNA测序,空间转录组学 机器学习模型,风险评分模型 基因表达数据,免疫组织化学图像,单细胞转录组数据,空间转录组数据 基于公开数据集,样本量未具体说明 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
302 2026-06-10
Identifying cell-type-specific marker genes of dental epithelial cells using single-cell RNA sequence: A review
2026-Feb, Journal of oral biosciences IF:2.6Q1
综述 系统整合单细胞RNA测序数据与实验验证,构建牙上皮细胞类型特异性标记基因分子图谱 首次整合scRNA-seq、组织学验证、表型数据库和CAGE-seq数据,对成釉细胞和非成釉细胞谱系进行全面的分子标记鉴定 主要基于小鼠模型数据进行整合分析,缺乏人类牙发育数据的直接验证 建立牙上皮细胞类型的更新分子图谱,为解释牙釉质表型和指导未来牙发育研究提供综合基础 牙上皮细胞,包括内釉上皮、外釉上皮、星网层、中间层等细胞类型 数字病理学 牙发育相关疾病 单细胞RNA测序, CAGE测序 NA 基因表达数据 整合多个已发表的scRNA-seq牙发育研究数据集,以及小鼠牙组织免疫染色/原位杂交实验验证 NA 单细胞RNA测序 NA NA
303 2026-06-10
Microbiota-dependent transcriptional priming of lung innate immune cells in a mouse model of LPS-induced sepsis-associated lung injury
2026-Feb, Journal of oral biosciences IF:2.6Q1
研究论文 研究无特定病原体和传统饲养小鼠在正常和脂多糖诱导脓毒症条件下肺免疫细胞的单细胞转录组,揭示共生微生物对肺先天免疫细胞转录成熟和功能的影响 首次通过单细胞RNA测序揭示共生微生物对肺先天免疫细胞(中性粒细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞)转录状态和成熟轨迹的启动作用,发现微生物信号缺失导致中性粒细胞成熟受阻及炎症反应减弱 仅基于小鼠模型和LPS诱导的脓毒症条件,结果可能不完全适用于人类或其他感染模型;未能详细阐明微生物信号的具体分子机制 探究共生微生物如何通过转录启动影响肺先天免疫细胞的成熟和炎症响应能力 无特定病原体(GF)和传统饲养(CV)小鼠的肺先天免疫细胞(中性粒细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞) 单细胞转录组学 脓毒症相关肺损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 GF和CV小鼠在正常和LPS诱导脓毒症条件下的肺免疫细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA 使用标准单细胞RNA测序流程进行细胞类型注释和通路分析
304 2026-06-10
Identification of a Potential Biomarker PDGFRA for Endometriosis Based on Comprehensive Analysis of Multiple Omics Data
2026-Feb, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
研究论文 基于多组学数据综合分析,确定PDGFRA为子宫内膜异位症的潜在生物标志物 结合批量RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组数据分析,首次发现PDGFRA在异位病灶中心区域过表达,并通过虚拟敲除实验揭示其在间质细胞分化、黏附和凋亡中的作用 PDGFRA作为生物标志物的临床验证尚需进一步实验,且其具体调控机制未完全阐明 探索子宫内膜异位症的发病机制并识别潜在生物标志物和治疗靶点 子宫内膜异位症患者的异位内膜组织和间质细胞 机器学习和多组学分析 子宫内膜异位症 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组分析、差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、机器学习 机器学习模型 基因表达数据和空间转录组数据 未在标题和摘要中明确提供具体样本数量 NA 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
305 2026-06-10
Decoding hepatocellular carcinoma prognosis: a machine learning-derived methylation signature integrating transcriptomic and tumor microenvironment insights
2026-Feb-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 通过整合转录组、甲基化组和肿瘤微环境信息,利用机器学习开发并验证了一种用于肝细胞癌预后预测的多维度甲基化特征 首次结合数百种机器学习算法系统整合转录组、甲基化组和临床数据,构建并验证了一个包含10个甲基化相关差异表达基因的稳健预后特征,并联合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示其与肿瘤微环境的关联 NA(摘要未明确提及研究局限性) 开发一种基于甲基化的多组学预后工具,提高肝细胞癌风险分层和预后预测的准确性,为个体化治疗决策提供框架 肝细胞癌患者的转录组、甲基化组和临床数据,以及配对肿瘤和癌旁组织样本 机器学习 肝细胞癌 甲基化测序、RNA-seq、单细胞RNA测序、空间转录组学、定量实时PCR、Western blotting 机器学习算法(数百种) 转录组数据、甲基化数据、临床数据、单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据、qPCR和Western blotting验证数据 来自TCGA的大型样本数据,外加10对配对肝细胞癌肿瘤和癌旁非肿瘤组织 Illumina bulk RNA-seq, 甲基化测序, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Illumina NovaSeq(推测) NA(未提供平台具体配置细节)
306 2026-06-10
Screening Biomarkers for Nerve Injury Using Weighted Gene Co-Expression Network Analysis and Machine Learning
2026-Feb, Brain and behavior IF:2.6Q3
研究论文 利用加权基因共表达网络分析和机器学习筛选神经损伤的生物标志物 结合多转录组数据集和三种机器学习算法,鉴定出Atf3、Bin2、Fcgr2b和Ucn四个具有诊断潜力的关键基因,并揭示其在神经免疫串扰中的双重作用 研究主要基于公共数据库的转录组数据,缺乏大规模临床样本验证,且对Fcgr2b促进神经突起生长的机制探讨尚不深入 识别并验证神经损伤的新型生物标志物,阐明其功能角色 神经损伤和假手术样本 机器学习 神经损伤 RNA-seq, 单细胞RNA测序 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 转录组数据, 单细胞转录组数据 来自GEO数据库的多个数据集 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
307 2026-06-10
huSA: a comprehensive database for multi-dimensional resolution of bulk, single cell and spatial transcription profiles in skin diseases
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
研究论文 构建了一个名为人类皮肤图谱(huSA)的综合数据库,整合了多维度皮肤转录组数据,包括批量、单细胞和空间转录数据,以促进皮肤疾病研究 首次构建了涵盖17种皮肤疾病、63个独立数据集、超过3000个样本的多维度转录组数据库,提供标准化细胞类型注释、跨数据集整合分析和交互式可视化平台 未在摘要中明确说明局限性 构建一个全面、整合且用户友好的皮肤转录组数据图谱,实现多疾病、多模态数据的系统探索 皮肤疾病转录组数据,包括单细胞RNA测序、空间转录组和批量RNA-seq数据 数字病理学 皮肤疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 图像, 文本, 基因表达数据 1434个单细胞RNA-seq样本、63个空间转录组样本、1502个批量RNA-seq样本,共17种皮肤疾病 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
308 2026-06-10
An unsupervised method for spatial transcriptomics analysis based on adversarial autoencoder
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出一种基于对抗自编码器的无监督空间转录组学分析方法DACN,整合改进的对抗自编码器与图卷积网络,以鲁棒分析不同分辨率和通量的空间转录组数据 创新性地将改进的对抗自编码器与图卷积网络集成在统一框架中,通过混合编码器(多注意力机制与残差连接)捕获精细局部表达模式同时保留关键全局信息,实现去噪与稳定潜在表征学习 未在文中明确提及局限性 开发一种无监督方法用于空间转录组学分析,以应对数据噪声和复杂性挑战 空间转录组学数据集 机器学习 NA 空间转录组学 对抗自编码器(AAE),图卷积网络(GCN) 基因表达数据 多个空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
309 2026-06-10
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals ISG15 as a Key Regulator of Macrophage-Mediated Inflammation Driving Primary Sjögren's Syndrome Progression
2026, Critical reviews in immunology IF:0.8Q4
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示ISG15作为巨噬细胞介导的炎症驱动原发性干燥综合征进展的关键调控因子 整合批量RNA-seq与单细胞RNA-seq数据,结合三种机器学习算法筛选免疫代谢生物标志物,并首次实验验证ISG15在pSS中通过NF-κB通路调控炎症的功能 未提及明确的局限性 识别原发性干燥综合征的诊断生物标志物并表征单核-巨噬细胞分化轨迹 原发性干燥综合征患者的唾液腺细胞和THP-1巨噬细胞 机器学习 干燥综合征 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 伪时间分析, 机器学习 LASSO回归, SVM-RFE, 随机森林, Monocle3, CellChat 基因表达数据 42,157个唾液腺细胞 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
310 2026-06-10
Single-Cell Sequencing Combined with RNA Sequencing Reveals the Role of Natural Killer Cells in Prognosis and Immunotherapy Response in Cervical Squamous Cell Carcinoma
2026, Critical reviews in immunology IF:0.8Q4
研究论文 结合单细胞测序和RNA测序揭示自然杀伤细胞在宫颈鳞状细胞癌预后和免疫疗法反应中的作用 首次通过整合单细胞测序和转录组测序数据,鉴定高活性NK细胞相关基因并构建预后风险模型,为宫颈鳞状细胞癌的免疫治疗提供新靶点 未说明明确的局限性(需根据全文推断,但摘要未提及) 探究高活性NK细胞相关基因在宫颈鳞状细胞癌预后和免疫治疗中的潜在价值 宫颈鳞状细胞癌患者的转录组和单细胞测序数据 机器学习 宫颈鳞状细胞癌 RNA-seq, 单细胞测序 Cox回归, LASSO回归, WGCNA 基因表达数据 NA(摘要未明确样本数量) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
311 2026-06-10
Integrated single-cell and transcriptomic profiling identifies machine-learning-based pyroptosis biomarkers in IBD
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合单细胞和转录组数据,利用机器学习方法识别炎症性肠病中与细胞焦亡相关的生物标志物 首次结合单细胞RNA测序和多种机器学习算法(LASSO、GBM、SVM、Boruta、随机森林)筛选出六种具有诊断潜力的细胞焦亡关键基因,并鉴定出巨噬细胞、上皮细胞和中性粒细胞是焦亡最活跃的细胞类型 未提及样本间异质性验证和纵向队列数据支持;单细胞分析仅限于肠道黏膜样本,可能无法完全代表全身性焦亡动态 探索炎症性肠病中细胞焦亡的关键细胞类型和调控基因,并筛选非侵入性诊断生物标志物 炎症性肠病患者的肠道黏膜样本和外周血转录组数据 生物信息学 炎症性肠病 单细胞RNA测序、RNA-seq LASSO, GBM, SVM, Boruta, Random Forest 基因表达数据 未明确提及样本数量(依据单细胞和bulk转录组数据集) NA 单细胞RNA测序 NA NA
312 2026-06-10
UNC93B1 promotes pancreatic cancer progression through modulation of cGAS-STING signaling
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过多组学整合分析,发现UNC93B1通过调控cGAS-STING信号通路促进胰腺癌进展,并验证其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 首次结合单细胞转录组、空间转录组、GWAS和机器学习框架系统鉴定UNC93B1在胰腺癌中的关键作用,并阐明其通过抑制cGAS-STING通路促进免疫抑制微环境和转移的机制 依赖公开数据集中有限的样本量,体外功能验证仅采用部分细胞系,体内模型为皮下移植瘤,未涉及原位模型或患者来源异种移植模型(PDX) 揭示胰腺导管腺癌(PDAC)的分子驱动因素,阐明UNC93B1在肿瘤微环境中的功能及其机制,为精准治疗策略提供依据 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤组织、PDAC细胞系及异种移植瘤模型 数字病理学, 机器学习 胰腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 基因组关联研究(GWAS), 基因敲低, 蛋白质印迹, 流式细胞术 Seurat, Harmony, scPagwas, hdWGCNA, LASSO回归, 随机森林, 支持向量机, GSVA, Monocle2, CellChat 单细胞转录组数据、批量转录组数据、空间转录组数据、GWAS数据、蛋白质表达数据 单细胞RNA测序:22个PDAC样本(GSE154778, GSE212966);批量转录组队列:GSE28735、GSE62452;TCGA-PAAD项目:172例生存数据;GWAS数据:196,187例;体外验证:4个PDAC细胞系;体内模型:皮下异种移植瘤 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 NA NA
313 2026-06-10
Single-cell and spatial transcriptomics reveal transplant-associated T cells and myeloid cells in human liver transplantation
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析人类肝移植中的移植相关T细胞和髓系细胞 首次整合单细胞RNA测序与空间转录组学,高分辨率揭示肝移植排斥反应中免疫细胞的动态变化及空间分布 样本量有限,未提供具体样本数量;机制验证缺乏体内功能实验支持 探究肝移植排斥反应中肝内免疫细胞的动态变化及相互作用 人类肝移植术后不同阶段的移植物组织 数字病理学 肝病 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间转录组数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
314 2026-06-10
Molecular interplay of ASNS and the PI3K-AKT-mTOR pathway in CMV and HIV co-infections: Therapeutic implications
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究揭示了天冬酰胺合成酶(ASNS)在巨细胞病毒(CMV)和HIV共感染中的关键代谢信号枢纽作用及其与PI3K-AKT-mTOR通路的相互作用,为共感染治疗提供了新靶点 首次发现ASNS作为CMV/HIV共感染中的代谢信号枢纽,并验证其与PI3K-AKT-mTOR通路的相互作用,通过分子对接发现西多福韦以高亲和力结合ASNS 研究主要基于生物信息学分析和计算模拟,缺乏体外或体内实验验证,结论尚需进一步实验确认 探究CMV/HIV共感染中ASNS与PI3K-AKT-mTOR通路的分子相互作用及其治疗意义 CMV/HIV共感染患者,转录组数据及单细胞RNA测序数据 计算机视觉 感染性疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 分子对接 NA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
315 2026-06-10
Microglia heterogeneity and therapeutic strategies in Parkinson's disease
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 系统描述了帕金森病中小胶质细胞的异质性及靶向治疗策略的进展与挑战 利用单细胞转录组学技术揭示了小胶质细胞在帕金森病中的功能多样性及表型谱变化 未提供具体的实验数据或大规模临床验证结果 总结帕金森病靶向小胶质细胞的干预和治疗策略,为精准治疗提供指导 小胶质细胞 digital pathology 帕金森病 单细胞转录组学 NA NA NA NA single-cell RNA-seq NA NA
316 2026-06-10
Unique chicken B cell development: species-specific mechanisms and contradictory requirements of B cell receptor for post-hatched B cell development
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 综述了鸡B细胞发育的独特三阶段过程,重点围绕法氏囊及其与哺乳动物B细胞发育的差异 发现鸡B细胞发育依赖于替代进化策略,如通过AID介导的基因转换而非V(D)J重组产生抗体多样性,且RAG1敲除鸡仍能维持B细胞群体,揭示了BCR信号在孵化后B细胞发育中的矛盾需求 未提及具体局限性,主要依赖现有基因敲除和单细胞测序研究,可能缺乏体内功能验证 比较鸡与哺乳动物(尤其是人)B细胞发育的物种特异性机制,阐明法氏囊在B细胞发育中的核心作用 鸡B细胞发育各阶段(前法氏囊期、法氏囊期、后法氏囊期)的细胞和分子机制 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
317 2026-06-10
Blinatumomab-driven T-cell activation in αβ and γδ T-cell subsets: insights from in vitro assays
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 双特异性T细胞衔接器Blinatumomab在αβ和γδ T细胞亚群中驱动T细胞激活的比较研究 系统比较了Blinatumomab在αβ T细胞和γδ T细胞亚群中的效应功能,并发现唑来膦酸扩增的Vγ9Vδ2 γδ T细胞系具有与PHA扩增的αβ T细胞相当的细胞毒性,提示γδ T细胞可能补充Blinatumomab介导的细胞毒性 研究基于健康供体体外实验,未包含患者样本;单细胞转录组学仅分析一名供体,样本量有限 阐明Blinatumomab在常规αβ T细胞和非传统γδ T细胞中介导的免疫机制,为γδ T细胞与Blinatumomab联合治疗策略提供框架 健康成人体外扩增的αβ T细胞和γδ T细胞 生物医学研究 B细胞前体急性淋巴细胞白血病 多参数流式细胞术、靶向单细胞转录组学 NA 基因表达数据、细胞表型数据 来自健康供体的新鲜分离和体外扩增的T细胞,单细胞转录组学仅分析一名供体 NA 单细胞转录组学 NA 靶向单细胞转录组学(未指定具体平台型号)
318 2026-06-10
Diversity and function of tumor-associated macrophages in brain metastases: mechanisms and therapeutic prospects
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了脑转移瘤中肿瘤相关巨噬细胞的多样性、功能及治疗前景 通过单细胞研究揭示了超越传统M1/M2二分类的多种功能性亚群,如脂质相关巨噬细胞,并探讨了靶向TAMs的新策略如CAR-巨噬细胞和纳米技术 TAMs高度异质性、靶向特异性不足及血脑屏障递送障碍等挑战 探讨脑转移瘤中TAMs的多样性、功能及其作为治疗靶点的潜力 脑转移瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 机器学习 脑转移瘤 单细胞测序、空间转录组学 NA 文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 用于单细胞RNA测序和空间转录组学研究的平台
319 2026-06-10
ECM remodeling-associated immune signatures and hub proteins: predictive markers and therapeutic targets for metastatic gastric cancer
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过蛋白质组学和单细胞RNA测序,识别与胃癌转移相关的细胞外基质重塑标志物和枢纽蛋白,并验证其作为预测标志物和治疗靶点的潜力 综合运用蛋白质组学、单细胞RNA测序和轨迹分析,系统揭示细胞外基质重塑在胃癌转移中的复杂机制,并识别RPS29等新枢纽蛋白在转移中的调控作用 具体分子机制理解仍不充分,需要进一步实验验证 识别与胃癌转移相关的细胞外基质重塑免疫特征和枢纽蛋白,探索其作为预测标志物和治疗靶点的价值 胃癌细胞及其细胞外基质蛋白 数字病理学 胃癌 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 轨迹分析 NA 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
320 2026-06-10
Single-cell transcriptome delineating asymmetric dynamics of CD4+ T and CD8+ T cell lineage commitment in human prenatal thymus
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合单细胞转录组数据,解析人类产前胸腺中CD4+和CD8+ T细胞谱系定型的不对称多阶段动态过程 揭示了人类产前胸腺中CD4/CD8细胞谱系定型并非单一事件,而是信号水平、时间维度和微环境水平三个维度上的不对称多阶段动态过程 NA 表征人类产前胸腺中T细胞发育的细胞异质性和分子动力学 人类产前胸腺细胞(7至23孕周) 机器学习 NA 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 来自5个已发表数据集的整合数据,覆盖7至23孕周样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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