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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3161 | 2025-10-31 |
Decoding Dendritic Cell Subtypes via Integrated Radiogenomics: A Stacked Ensemble Model for Predicting Immunotherapy Response in NSCLC
2025-Nov-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501990R
PMID:41160086
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、影像组学和深度学习技术,开发了一个多模态框架来预测非小细胞肺癌患者对免疫治疗的应答 | 首次将单细胞转录组学、影像组学和深度学习相结合,通过堆叠集成学习方法识别树突状细胞亚型与免疫治疗应答的关联 | 样本量相对有限,需要在更大规模队列中验证模型的泛化能力 | 预测非小细胞肺癌患者对PD-1抑制剂免疫治疗的应答 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本和影像数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 影像组学, 深度学习 | LSTM, ResNet50, 堆叠集成学习 | 转录组数据, 临床数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3162 | 2025-10-31 |
Single-cell RNA sequencing reveals the ameliorative effects of Kai-Xin-San on depression via regulating neuroplasticity and inflammation in the hypothalamus of rats
2025-Nov-10, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示开心散通过调节下丘脑神经可塑性和炎症改善大鼠抑郁的分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统阐明开心散通过抑制前驱活性、恢复星形胶质细胞线粒体代谢和重塑神经-星形胶质细胞相互作用网络来增强突触可塑性的抗抑郁机制 | 研究仅针对大鼠下丘脑区域,未涉及其他脑区;样本数量相对有限 | 探究开心散改善抑郁症状的分子机制 | 慢性不可预见轻度应激诱导的抑郁模型大鼠 | 单细胞转录组学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序,行为学实验,分子生物学实验 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,行为学数据 | 45,482个下丘脑细胞,来自对照组、CUMS模型组、开心散治疗组和氟西汀治疗组大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3163 | 2025-10-31 |
CRISPLD2, a novel insulin-sensitizing adipokine that alters adipocyte size
2025-Nov, Obesity (Silver Spring, Md.)
DOI:10.1002/oby.24342
PMID:40855979
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研究论文 | 本研究探讨新型脂肪因子CRISPLD2在调节脂肪组织纤维化和改善胰岛素敏感性方面的功能 | 首次发现CRISPLD2能够改变脂肪细胞大小并改善胰岛素敏感性,同时揭示其通过调节胶原转录和纤维化发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床意义尚需进一步验证 | 探索CRISPLD2脂肪因子在脂肪组织结构和功能调节中的作用机制 | 脂肪特异性过表达CRISPLD2的小鼠模型和3T3-L1脂肪细胞 | 分子生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序, 质谱分析, transwell实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质互作数据 | 脂肪特异性CRISPLD2过表达小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3164 | 2025-10-31 |
Targeting MAT2A synergistically induces DNA damage in osteosarcoma cells through EZH2-mediated H3K27me3 modification
2025-Nov, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.09.007
PMID:41146859
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研究论文 | 本研究通过靶向MAT2A与EZH2抑制联合治疗,协同诱导骨肉瘤细胞DNA损伤并抑制肿瘤生长 | 首次发现MAT2A抑制与EZH2抑制在骨肉瘤治疗中的协同作用机制,通过代谢与表观遗传双重干预策略 | NA | 探索代谢与表观遗传联合干预在骨肉瘤治疗中的潜在价值 | 骨肉瘤细胞 | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,高通量化合物筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3165 | 2025-10-31 |
Single-cell RNA profiling of blood CD4+ T cells identifies distinct helper and dysfunctional regulatory clusters in children with SLE
2025-Nov, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02297-2
PMID:41120754
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童系统性红斑狼疮患者血液CD4⁺ T细胞的异质性 | 首次在儿童SLE患者中通过单细胞RNA测序识别出独特的辅助性T细胞和功能失调调节性T细胞亚群,并发现TLR5和FCRL3在SLE初始T细胞中的上调 | 研究样本仅限于儿童患者,未包含成人队列;样本量相对有限 | 表征系统性红斑狼疮患者CD4⁺ T细胞区室的复杂性 | 儿童系统性红斑狼疮患者和健康供体的血液CD4⁺ T细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 儿童SLE患者和健康供体的血液CD4⁺ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3166 | 2025-10-31 |
FXYD3 Promotes Tumor Progression by Binding With IRF7 to Regulate JAK2/STAT5 Signaling in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510782
PMID:41164952
|
研究论文 | 本研究揭示了FXYD3通过结合IRF7调控JAK2/STAT5信号通路促进肝内胆管癌恶性进展的机制 | 首次发现FXYD3通过其60-87aa结构域直接与IRF7相互作用,通过cGAS/STING通路形成正反馈环路持续激活JAK2/STAT5信号 | 未明确说明样本量的具体数值和研究局限性 | 探究FXYD3在肝内胆管癌进展中的作用机制 | 肝内胆管癌细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 肝内胆管癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组分析, 生物信息学分析 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3167 | 2025-10-31 |
CHB-Induced Immune Zonation Chaos Elicited LXRα-mediated Lipid Metabolism Disorders in Kupffer Cells to Induce Cancer Stem Cell Formation
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510275
PMID:41164971
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示了慢性乙型肝炎中Kupffer细胞区室化紊乱通过LXRα介导的脂代谢异常诱导癌症干细胞形成的机制 | 首次揭示了Kupffer细胞区室化在疾病进展中的作用,发现了LXRα在Kupffer细胞中的关键调控功能 | 研究主要基于AAV-HBV小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究慢性乙型肝炎向肝癌转变过程中肝脏微环境的动态分子机制 | AAV-HBV小鼠模型和HBV患者的肝脏组织 | 空间转录组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | AAV-HBV小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | AAV-HBV小鼠模型和HBV患者肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3168 | 2025-10-31 |
Spatially resolved airway niches: mapping epithelial-immune microenvironments in asthma
2025-Oct-29, Expert review of respiratory medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/17476348.2025.2582244
PMID:41146609
|
综述 | 本文综述了空间组学技术在哮喘研究中揭示气道上皮-免疫微环境空间异质性的应用 | 整合多种空间组学技术揭示哮喘中先前被忽视的疾病定义性微环境生态位 | 检测成本较高、RNA扩散问题、FFPE工作流程标准化不足、需要全球队列的多组学整合 | 通过空间组学技术解析哮喘气道上皮-免疫微环境的分子环路和异质性 | 人气道活检组织、离体肺切片、小鼠哮喘模型 | 空间转录组学 | 哮喘 | 空间转录组学、多重成像蛋白质组学、空间代谢组学 | 基于图的人工智能 | 空间分子数据 | NA | 10x Genomics,Nanostring,Akoya Biosciences,Vizgen,Ionpath,Standard BioTools | 空间转录组学,多重成像蛋白质组学,空间代谢组学 | Visium-HD,Xenium,CosMx SMI,MERFISH,Imaging Mass Cytometry,MIBI,MALDI-MSI | 10x Visium HD,10x Xenium,Nanostring CosMx SMI,Vizgen MERFISH,Standard BioTools Imaging Mass Cytometry,Ionpath MIBI,高分辨率MALDI-MSI |
| 3169 | 2025-10-31 |
scCT-DB, an omnibus for cancer patient-derived paired pre- and post-treatment single-cell transcriptomes to reveal drug perturbation and drug resistance mechanisms
2025-Oct-29, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1065
PMID:41160885
|
研究论文 | 开发了一个癌症治疗相关单细胞转录组数据库scCT-DB,用于揭示药物扰动和耐药机制 | 首个全面收集患者治疗前后配对单细胞转录组数据的数据库,采用统一流程处理并提供结构化元数据 | NA | 揭示药物扰动和耐药机制,发现预测治疗反应的生物标志物 | 癌症患者治疗前后的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 619万个细胞,来自1142个原始患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3170 | 2025-10-31 |
DeepSpaceDB: a spatial transcriptomics atlas for interactive in-depth analysis of tissues and tissue microenvironments
2025-Oct-29, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1117
PMID:41160880
|
研究论文 | 介绍DeepSpaceDB空间转录组数据库,提供交互式组织微环境分析工具 | 开发了新一代空间转录组数据库,强调交互性和高级分析功能,支持跨样本比较和用户数据上传 | 当前版本主要聚焦10X Genomics Visium样本,平台覆盖范围有限 | 解决空间转录组数据分析和交互探索的技术挑战 | 组织切片和微环境,如阿尔茨海默病模型小鼠海马区域 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组技术 | NA | 空间基因表达数据 | NA | 10X Genomics | 空间转录组学 | 10X Visium | 10X Genomics Visium样本 |
| 3171 | 2025-10-31 |
Targeting astrocyte-monocyte-neuron crosstalk in spinal cord injury: therapeutic insights from methyl gallate
2025-Oct-29, Spinal cord
IF:2.1Q1
DOI:10.1038/s41393-025-01127-4
PMID:41162682
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法探究没食子酸甲酯在脊髓损伤中的治疗机制 | 首次结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和网络药理学系统解析没食子酸甲酯对星形胶质细胞-单核细胞-神经元通讯的调节作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探究没食子酸甲酯在脊髓损伤中的治疗机制 | 脊髓损伤小鼠模型、星形胶质细胞、单核细胞和神经元 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, bulk transcriptomics, Mendelian randomization, network pharmacology, molecular docking | NA | 基因表达数据、GWAS汇总数据 | 小鼠亚急性脊髓损伤模型(损伤后3-14天) | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3172 | 2025-10-31 |
Mapping disease-specific vascular cell populations responsible for obliterative arterial remodelling during the development of pulmonary arterial hypertension
2025-Oct-28, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf146
PMID:40875786
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别肺动脉高压发展中导致闭塞性动脉重构的疾病特异性血管细胞群 | 首次在肺动脉高压模型中通过多时间点单细胞转录组分析鉴定出两种疾病特异性内皮细胞群,并发现TM4SF1作为动脉重构的新治疗靶点 | 研究基于动物模型,在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 阐明肺动脉高压发展中闭塞性动脉病变形成的细胞机制 | 肺动脉高压大鼠模型和PAH患者的肺组织细胞 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,RNA velocity分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点的肺动脉高压模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3173 | 2025-10-31 |
Changes in neural progenitor lineage composition during astrocytic differentiation of human iPSCs
2025-Oct-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96423
PMID:41150379
|
研究论文 | 本研究通过追踪人类iPSCs分化为星形胶质细胞的过程,揭示了神经祖细胞谱系组成的变化及其对星形胶质细胞区域特性的影响 | 首次证明iPSCs衍生的星形胶质细胞谱系组成不能准确反映原始祖细胞群体,并识别了LMX1A祖细胞来源星形胶质细胞的独特转录组特征 | 研究仅聚焦于LMX1A腹侧中脑祖细胞,未涵盖其他脑区祖细胞类型 | 探究人类iPSCs分化为星形胶质细胞过程中神经祖细胞谱系组成的变化规律 | 人类诱导多能干细胞(iPSCs)及其分化的神经祖细胞和星形胶质细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,细胞谱系追踪 | 人类iPSCs分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 深度单细胞RNA测序 |
| 3174 | 2025-10-31 |
TBXAS1 deficiency causes autoinflammation responsive to IL-6 inhibitor
2025-Oct-28, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.09.014
PMID:41162285
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研究论文 | 本研究揭示了TBXAS1缺陷通过花生四烯酸代谢异常导致自身炎症的新机制,并证实IL-6抑制剂治疗的有效性 | 首次发现TBXAS1缺陷通过PGE2-EP2/cAMP/CREB通路诱导IL-6表达引发自身炎症,并成功应用IL-6抑制剂治疗 | 研究仅纳入2例患者,样本量较小 | 探索TBXAS1缺陷引起自身炎症的分子机制并研究靶向治疗策略 | 2例TBXAS1缺陷患者及其外周血单个核细胞 | NA | Ghosal血骨发育不良 | 全外显子组测序, Sanger测序, qRT-PCR, Western blotting, 细胞因子珠阵列, ELISA, 质谱分析, 飞行时间流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质数据, 代谢物数据, 单细胞转录组数据 | 2例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3175 | 2025-10-31 |
Multi-omics profiling uncovers paradoxical Epstein-Barr virus involvement in autoimmune liver disease pathogenesis
2025-Oct-27, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01975-6
PMID:41144108
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研究论文 | 通过多组学分析揭示EB病毒在自身免疫性肝病发病机制中的复杂作用 | 首次提供EB病毒与自身免疫性肝病关联的遗传学证据,发现EB病毒在疾病中可能扮演双重角色 | 基于观察性研究和数据库分析,因果关系仍需进一步验证 | 探究EB病毒与自身免疫性肝病之间的因果关系和分子机制 | 自身免疫性肝病患者群体和EB病毒相关抗体 | 生物信息学 | 自身免疫性肝病 | 双样本孟德尔随机化分析,GSMR,GWAS,转录组分析,单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞测序数据 | 基于FinnGen数据库的GWAS汇总统计数据 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | NA | NA |
| 3176 | 2025-10-31 |
Deciphering splicing heterogeneity at single-cell resolution by SCSES
2025-Oct-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64517-5
PMID:41145486
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研究论文 | 开发了一种名为SCSES的计算框架,用于在单细胞水平增强选择性剪接分析 | 通过数据扩散在相似细胞和事件间共享信息来推断和补全缺失的剪接变化 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序中准确表征剪接变化的挑战 | 单细胞剪接异质性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数据扩散算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3177 | 2025-10-31 |
Hmox1 expression indicates distinct injury phenotypes of proximal tubule cells in sepsis-associated acute kidney injury
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05764-w
PMID:41145479
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,鉴定Hmox1作为脓毒症相关急性肾损伤中近端小管细胞损伤的特异性生物标志物 | 首次发现Hmox1高表达和低表达的近端小管细胞亚群在SAKI中表现出不同的表型特征 | NA | 识别SAKI诊断的特异性生物标志物并阐明其病理机制 | 肾组织中的近端小管细胞 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3178 | 2025-10-31 |
SPP1+ macrophages promote colorectal cancer progression by activating JAK2/STAT3 signaling pathway
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21420-9
PMID:41145614
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研究论文 | 本研究揭示SPP1+巨噬细胞通过激活JAK2/STAT3信号通路促进结直肠癌进展的机制 | 首次发现SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的极性改变通过JAK2/STAT3通路调控结直肠癌进展 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞极性改变对结直肠癌进展的影响及分子机制 | 结直肠癌细胞(MC38)和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞分选, 细胞共培养, CCK-8检测, TUNEL染色, 蛋白质印迹, 免疫荧光 | 小鼠结直肠癌模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3179 | 2025-10-31 |
Intratumoral plasma cells predict patient prognosis and responsiveness to neoadjuvant immunotherapy in advanced gastric cancer
2025-Oct-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01071-9
PMID:41145683
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研究论文 | 本研究通过多中心数据整合分析,开发了基于肿瘤内浆细胞的MZB1阳性评分系统,用于预测晚期胃癌患者对免疫治疗的预后和反应性 | 首次发现成熟三级淋巴结构是胃癌浸润浆细胞中体细胞超突变和克隆选择的关键位点,并建立了基于浆细胞浸润程度的MZB1阳性评分系统 | 研究依赖于胃镜活检组织,存在组织样本大小的固有局限性 | 开发新的生物标志物来预测胃癌患者对免疫治疗的反应和预后 | 晚期胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,转录组测序 | NA | 组织样本,转录组数据,空间转录组数据 | 来自七个独立医疗中心的胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3180 | 2025-10-31 |
KIAA1429-mediated M6A methylation inhibits osteoclast differentiation via stabilizing Lrp4 mRNA and protects against osteoporosis
2025-Oct-27, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00800-z
PMID:41146006
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研究论文 | 本研究探讨KIAA1429介导的m6A甲基化通过稳定Lrp4 mRNA抑制破骨细胞分化并预防骨质疏松的机制 | 首次揭示KIAA1429通过m6A-YTHDC1-LRP4-TNFAIP3轴抑制NF-κB信号通路的新机制 | 未明确说明样本规模及临床数据的具体来源 | 探究KIAA1429在骨质疏松及破骨细胞分化中的生物学功能及分子机制 | 骨质疏松患者临床样本、卵巢切除小鼠模型、破骨细胞 | 表观遗传学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, m6A甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |