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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3161 | 2026-03-14 |
Transcriptome profiling of peripheral blood for inflammatory subtype classification and diagnostic model construction in asthma
2026-Mar-13, The Journal of asthma : official journal of the Association for the Care of Asthma
DOI:10.1080/02770903.2026.2633354
PMID:41732097
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研究论文 | 本研究利用外周血转录组学数据识别哮喘的炎症亚型,并通过多层次验证推导候选生物标志物 | 整合了bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,结合WGCNA和共识聚类方法识别哮喘炎症亚型,并通过单细胞水平映射和qRT-PCR验证关键基因 | 研究主要基于公开数据集,且qRT-PCR验证仅在LPS刺激的THP-1衍生巨噬细胞样模型中进行,未涉及临床样本验证 | 识别哮喘的炎症亚型并构建诊断模型 | 哮喘患者的外周血转录组数据 | 自然语言处理 | 哮喘 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR | LASSO回归, SVM-RFE | 转录组数据 | 基于公开数据集GSE69683和GSE172495,具体样本数量未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3162 | 2026-03-14 |
Cytoskeletal remodeling promotes tunneling nanotube formation and drives cardiac resident cell mitochondrial transfer in sepsis
2026-Mar-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz3266
PMID:41811940
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研究论文 | 本研究揭示了脓毒症中隧道纳米管(TNTs)作为促进线粒体转移的动态纳米结构,及其在心脏重塑中的关键作用 | 首次发现Drp1驱动的细胞骨架重塑调控TNT形成,并阐明其在脓毒症心脏细胞间线粒体转移中的核心机制 | 研究主要基于小鼠CLP模型,人类临床样本验证尚需进一步开展 | 探究脓毒症诱导心脏功能障碍的纳米尺度细胞间通讯机制 | 小鼠心脏内皮细胞、成纤维细胞、巨噬细胞及其亚群 | 细胞生物学与纳米医学 | 脓毒症相关心脏功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠CLP模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3163 | 2026-03-14 |
miR-203 facilitates timely cell fate transitions via epigenetic modulation during early embryogenesis
2026-Mar-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr1776
PMID:41811946
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示了miR-203在小鼠早期胚胎植入前发育中作为关键调节因子,通过表观遗传调控促进细胞命运及时转变 | 首次在严格体内方法中识别miR-203为早期哺乳动物胚胎发生中发育过渡的关键调节因子,并揭示其通过靶向组蛋白乙酰化酶如EP300来调控表观遗传重编程 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他哺乳动物中的普适性尚未验证,且机制探索可能仅部分解释了miR-203的作用 | 探究microRNAs在早期哺乳动物胚胎发生中如何调节最早的发育过渡,特别是细胞命运获取和谱系分离 | 小鼠早期胚胎,特别是植入前胚胎,以及相关的基因工程小鼠模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,表观遗传分析 | NA | 转录组数据,表观遗传数据 | 未明确指定样本数量,但涉及基因工程小鼠模型和早期胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3164 | 2026-03-14 |
A global screen for magnetically induced neuronal activity in the pigeon brain
2026-Mar-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aea6425
PMID:41264677
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研究论文 | 本研究通过全脑活动图谱、组织透明化和光片显微镜技术,揭示了鸽子大脑中由磁场刺激激活的神经元群体及其分子机制 | 首次在全脑范围内无偏倚地识别了鸽子大脑中受磁场激活的神经元群体,并发现半规管嵴中存在表达电磁感应检测分子机制的特化II型毛细胞 | 研究主要聚焦于鸽子模型,其发现是否适用于其他磁感应动物仍需进一步验证 | 探究动物感知地球磁场的神经环路和分子机制 | 鸽子大脑神经元群体及半规管嵴毛细胞 | 神经生物学 | NA | 全脑活动图谱、组织透明化、光片显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 图像数据、转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3165 | 2026-03-14 |
Integrated intraocular-plasma proteomics reveals conserved biomarkers for diabetic retinopathy progression: a multi-fluid biopsy study
2026-Mar-12, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-026-06708-3
PMID:41817688
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研究论文 | 本研究通过整合眼内液和血浆蛋白质组学,识别了糖尿病视网膜病变进展的保守生物标志物,特别是神经丝轻链(NFL) | 首次结合多流体活检(眼内液和血浆)和高通量蛋白质组学,识别出跨阶段保守的生物标志物NFL,并验证其在血浆中的可检测性和临床预测价值 | 样本量相对较小(发现数据集n=32),且主要基于特定人群(广东和美国数据集),可能需要更广泛验证 | 识别糖尿病视网膜病变进展的微创生物标志物,以跟踪疾病全程 | 糖尿病患者的眼内液、血浆样本以及氧诱导视网膜病变小鼠模型 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 高通量蛋白质组学(SomaScan v4.1)、单细胞RNA-seq、时间轨迹软聚类 | NA | 蛋白质组数据、单细胞RNA-seq数据、临床数据 | 发现数据集32例(广东DR多组学研究),验证数据集来自UK Biobank(n=2495) | SomaLogic | 高通量蛋白质组学 | SomaScan v4.1 | SomaScan v4.1平台用于蛋白质组分析 |
| 3166 | 2026-03-14 |
Heterogeneity and regulatory mechanisms of ALK-mutant and wild-type epithelial cells in non-small-cell lung cancer: Single-cell transcriptomics and chromatin accessibility
2026-Mar-12, Pharmacology
IF:2.9Q2
DOI:10.1159/000550967
PMID:41818350
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和染色质可及性数据,揭示了ALK突变与非小细胞肺癌上皮细胞异质性及调控机制的差异 | 首次在单细胞多组学水平上整合分析ALK突变与野生型NSCLC,发现了CEACAM6通过AKT-EGR1轴促进恶性进展的新机制 | 样本量较小(5个WT和4个ALK突变样本),且为回顾性分析,需要更大队列和体内实验验证 | 解析ALK突变与非小细胞肺癌中上皮细胞的异质性及表观遗传调控机制,以克服ALK-TKI耐药 | 非小细胞肺癌(NSCLC)中的上皮细胞,特别是ALK突变型与野生型细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, qRT-PCR, CCK-8, 克隆形成, 伤口愈合实验 | Seurat, Harmony, Monocle, CellChat, Signac | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 9个NSCLC样本(5个野生型,4个ALK突变型) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 3167 | 2026-03-14 |
From Cell-Free Transcriptomes to Single-Cell Landscapes: Biomarker Discovery and Originating Cell Alteration Analysis via Graph Matrix Factorization
2026-Mar-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.74814
PMID:41818613
|
研究论文 | 提出了一种名为CellFreeGMF的工具,用于基于图矩阵分解对临床样本进行诊断分类、识别cfRNA生物标志物并分析其来源细胞的改变 | 开发了首个通过图矩阵分解将细胞游离RNA(cfRNA)转录组数据映射到单细胞景观的工具,能够同时识别生物标志物并追溯其细胞来源及功能改变 | 方法依赖于外部单细胞参考数据集的质量和完整性,且在当前验证中主要应用于胰腺导管腺癌 | 整合cfRNA分析到临床工作流程和精准医疗策略中,解析cfRNA的细胞起源及疾病驱动的动态变化 | 细胞游离RNA(cfRNA)转录组数据及其来源细胞 | 生物信息学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序,细胞-细胞通讯分析 | 图矩阵分解 | 转录组数据(bulk cfRNA和单细胞RNA-seq) | 多个细胞游离RNA转录组临床数据集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3168 | 2026-03-14 |
Cryoablation Activates the cGAS-STING-CXCL10 Axis in Macrophages to Enhance Anti-Tumor Immunity in NSCLC
2026-Mar-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202521931
PMID:41818612
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研究论文 | 本研究探讨了冷冻消融通过激活cGAS-STING-CXCL10轴在巨噬细胞中增强非小细胞肺癌抗肿瘤免疫的机制 | 首次在免疫治疗时代比较冷冻消融与热消融的疗效,并揭示冷冻消融通过释放肿瘤DNA激活巨噬细胞cGAS-STING通路,增加CXCL10巨噬细胞和CXCL10分泌,从而增强系统性抗肿瘤免疫 | 研究主要基于患者和小鼠模型,临床样本量可能有限,且机制细节需进一步验证 | 探究冷冻消融在非小细胞肺癌治疗中优于热消融的免疫机制 | 非小细胞肺癌患者和小鼠肿瘤模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 患者外周血单核细胞和小鼠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3169 | 2026-03-14 |
Single-cell activation screen identifies hepatic maturation regulators with zonal resolution
2026-Mar-11, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.10.014
PMID:41270741
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研究论文 | 本研究通过单细胞激活筛选,识别了具有区域分辨率的肝脏成熟调控因子 | 利用dCas9激活筛选结合单细胞转录组学,在原发性小鼠胚胎肝细胞中系统评估了晚期转录调控因子的效应,并发现Nr1i3和Nfix在肝脏区域化代谢基因表达中的关键作用 | 研究基于小鼠胚胎肝细胞,结果在人类或其他物种中的普适性需进一步验证,且体外培养系统可能无法完全模拟体内微环境 | 旨在识别调控胚胎肝细胞成熟的关键转录因子,以改善体外衍生肝细胞的功能性 | 原发性小鼠胚胎肝细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学,dCas9激活筛选 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3170 | 2026-03-14 |
Single-cell profiling of the subgingival bacteria reveals transcriptional heterogeneity and niche-specific programs
2026-Mar-11, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.01.017
PMID:41720093
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序框架分析了牙周炎患者与健康个体龈下细菌的转录异质性,揭示了功能集群和病原体特异性代谢特征 | 首次在单细胞水平上对低生物量、高宿主污染的龈下细菌群落进行高分辨率转录组分析,构建了包含285个物种的单细胞图谱 | 样本量有限(16个样本),且单细胞RNA测序技术对低生物量微生物存在技术挑战 | 探究牙周炎发病机制中龈下细菌群落的单细胞水平功能异质性 | 龈下细菌群落(包括核心活跃物种和关键病原体如T. denticola、P. gingivalis、P. intermedia) | 微生物组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16个龈下样本,133,458个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3171 | 2026-03-14 |
Cell type-specific network analysis in Diversity Outbred mice identifies genes potentially responsible for human bone mineral density GWAS associations
2026-Mar-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.100832
PMID:41811178
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研究论文 | 本研究利用多样性远交小鼠的单细胞转录组数据,构建细胞类型特异性网络,以解析人类骨密度全基因组关联研究中的基因功能 | 首次结合单细胞转录组数据和细胞状态轨迹分析,识别出21个网络驱动基因,这些基因可能通过间充质细胞分化调控骨密度,为骨质疏松症提供新的遗传靶点 | 研究基于小鼠模型数据,其结论在人类中的直接适用性需进一步验证,且样本来源和数量可能限制网络分析的普适性 | 解析骨密度全基因组关联研究中的因果基因及其在细胞类型特异性网络中的功能,以优先筛选骨质疏松症的潜在遗传靶点 | 多样性远交小鼠的骨髓来源基质细胞在成骨条件下培养的样本 | 单细胞转录组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | 网络分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3172 | 2026-03-14 |
Toward a multiomics framework for understanding symbiotic nitrogen fixation
2026-Mar-11, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2026.01.008
PMID:41820103
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综述 | 本文综述了利用多组学框架理解共生固氮的进展,并提出人工智能指导的路线图以促进非豆科作物中的应用 | 整合了端粒到端粒基因组、单细胞转录组、空间转录组、表观基因组和3D基因组数据,提出人工智能指导的路线图,从描述性目录转向可测试模型和迭代验证 | NA | 理解共生固氮机制,并开发在非豆科作物中部署固氮能力的策略 | 豆科植物和放线菌根共生系统 | 自然语言处理 | NA | 端粒到端粒基因组测序、单细胞转录组学、空间转录组学、表观基因组学、3D基因组映射 | 人工智能模型 | 基因组序列、染色质可及性数据、表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3173 | 2026-03-14 |
Integrative spatial profiling pipeline for determining TME architectures in archival clinical specimens using CmTSA superplex technology
2026-Mar-10, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-026-00874-9
PMID:41807362
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研究论文 | 本文开发了一种结合HOC-FD技术和CmTSA超多重技术的空间分析平台,用于在FFPE组织样本中同时标记30-60个生物标志物,并利用计算机视觉流程和RNN分析定义肿瘤微环境中的功能性生态位 | 开发了混合光化学荧光淬灭技术,整合了自发荧光淬灭和循环多重酪胺信号放大,实现了在FFPE组织中高信噪比的多重标记;结合深度学习细胞分割和RNN分析,系统性地定义和验证了功能性生态位的空间特征 | 未明确提及样本量限制或技术适用范围的具体局限性 | 克服空间转录组学和空间蛋白质组学在临床样本中的限制,开发一个集成平台以可视化和量化肿瘤微环境中的多细胞功能性状态 | 人类结肠癌和宫颈癌的FFPE组织样本 | 数字病理学 | 结肠癌, 宫颈癌 | 循环多重酪胺信号放大, 混合光化学荧光淬灭, 深度学习, 半径约束邻域网络分析 | 深度学习 | 图像 | NA | NA | 空间蛋白质组学 | CmTSA平台 | 整合HOC-FD技术和CmTSA超多重技术,用于FFPE组织的高通量处理 |
| 3174 | 2026-03-14 |
Phenotypically similar but functionally distinct NK cell populations within the human maternal-fetal interface
2026-Mar-10, ImmunoHorizons
DOI:10.1093/immhor/vlag001
PMID:41808348
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研究论文 | 本研究探讨了人类足月妊娠中母胎界面NK细胞的功能差异,揭示了在解剖学相邻组织中存在功能不同的组织驻留NK细胞群体 | 首次在健康足月妊娠中,通过高参数流式细胞术和单细胞测序,发现母胎界面中表型相似但功能不同的NK细胞群体,特别是在细胞因子激活响应方面存在显著差异 | 研究主要关注足月妊娠,未涵盖妊娠早期或病理状态下的NK细胞功能变化,且样本量有限 | 探究人类足月妊娠中母胎界面NK细胞是否维持效应功能及其功能特性 | 从人类足月妊娠的蜕膜-胎盘界面和蜕膜组织中分离的NK细胞 | 免疫学 | NA | 高参数流式细胞术,单细胞测序 | NA | 流式细胞数据,单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及足月妊娠组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3175 | 2026-03-14 |
Prospective study of patients with immune checkpoint inhibitor-induced hepatitis; characterization of liver injury, outcome of therapy, and management of steroid-unresponsive and steroid-dependent hepatitis
2026-Mar-05, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013861
PMID:41786454
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研究论文 | 一项前瞻性研究,旨在描述免疫检查点抑制剂诱导的肝炎(ir-hepatitis)的肝脏损伤特征、治疗结果以及对类固醇无反应和类固醇依赖性肝炎的管理 | 首次前瞻性地结合肝脏活检的多重免疫组化(mIHC)和外周血样本的单细胞RNA测序(scRNA-seq),系统地表征了ir-hepatitis的免疫表型、治疗反应及预后,并确定了类固醇反应不足的危险因素(如饮酒)和不同药物性肝损伤(DILI)表型(混合型、肝细胞型、胆汁淤积型)的预后差异 | 样本量较小(n=34),单细胞RNA测序仅在少数患者中进行,结果需要更大规模的研究验证 | 研究免疫检查点抑制剂(ICIs)引起的严重(3-4级)免疫相关性肝炎(ir-hepatitis)的临床特征、对类固醇治疗的反应、管理策略及潜在的免疫机制 | 接受ICIs治疗并出现3-4级ir-hepatitis的患者 | 数字病理学 | 肝损伤(药物性肝损伤) | 多重免疫组化(mIHC),单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 组织图像(肝脏活检),基因表达数据(外周血单细胞RNA测序) | 34名ir-hepatitis患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3176 | 2026-03-14 |
Nuclear condensates of BZU2/ZmMUTE modulate transcription to realize structural heterogeneity of the maize stomatal complex
2026-Mar-03, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag040
PMID:41718014
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研究论文 | 本文探讨了BZU2/ZmMUTE通过液-液相分离调控玉米气孔复合体结构异质性的机制 | 揭示了ZmMUTE通过其液-液相分离特性调控细胞类型特异性转录程序,从而影响气孔发育的多样性 | NA | 研究转录因子ZmMUTE在玉米气孔发育中的作用机制 | 玉米(Zea mays)气孔复合体 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA-seq分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3177 | 2026-03-14 |
Genetic Regulation of Wnt/PCP Components Through Fgf10/Fgfr2/Sox9 Module in Tear Duct Development
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.3.30
PMID:41823500
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型和分子生物学技术,揭示了Fgf10/Fgfr2/Sox9模块在泪管发育中通过调控Wnt/PCP通路成分的遗传机制 | 首次发现了Fgf信号通路与Wnt/PCP通路在泪管形成中的直接遗传联系,并确定Sox9作为Prickle1基因的转录激活因子 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;未全面评估所有Wnt/PCP成分在泪管发育中的作用 | 阐明泪管发育的发育生物学和分子遗传学机制,特别是Fgf与Wnt/PCP通路的遗传互作 | 小鼠泪管发育过程及相关基因突变模型(Fgf10、Fgfr2、Sox9、Prickle1突变鼠) | 发育生物学 | 先天性鼻泪管阻塞 | 单细胞RNA测序,CUT&Tag分析,免疫组化,原位杂交,荧光素酶报告基因检测,电泳迁移率变动分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质-DNA互作数据,组织切片图像 | 未明确说明具体样本数量,涉及多种基因型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3178 | 2026-03-14 |
Busulfan plus cyclophosphamide induced spermatogenic dysfunction and recovery: A dynamic change perspective
2026-Mar, Toxicology letters
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.toxlet.2026.111833
PMID:41587595
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型,系统性地描述了白消安联合环磷酰胺(BuCy)诱导的睾丸损伤与恢复的长期动态变化,并利用单细胞转录组测序在细胞水平提供了补充观察 | 首次在小鼠中应用BuCy联合治疗方案,并进行了睾丸损伤与恢复的纵向多时间点动态表征,相比单独使用白消安的模型更贴近临床实际 | 研究基于小鼠模型,可能无法完全反映人类患者的复杂情况 | 探究BuCy预处理方案对雄性生殖系统的毒性作用及恢复过程 | 小鼠睾丸组织及生殖细胞 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3179 | 2026-03-14 |
stVCR: spatiotemporal dynamics of single cells
2026-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03010-3
PMID:41820580
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研究论文 | 提出了一种名为stVCR的生成式深度学习框架,用于从单细胞分辨率的时间序列空间转录组学快照中重建连续的细胞分化、增殖、迁移和空间对齐 | 首次开发了能够端到端重建单细胞时空动态的生成式深度学习框架,整合了非平衡设置下的动态最优传输、对刚性变换不变的密度匹配以及保留空间结构的生物学先验 | 未明确说明模型对数据规模或噪声水平的敏感性,也未讨论计算资源需求 | 研究单细胞在物理空间随时间变化的动态过程,包括分化、增殖和迁移 | 单细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 生成式深度学习框架 | 时间序列空间转录组学数据 | 模拟和真实数据集(包括蝾螈大脑再生和果蝇胚胎发育数据) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3180 | 2026-03-14 |
Dermatofibrosarcoma protuberans: A clinical review of diagnosis and management
2026-Feb-23, Journal of the American Academy of Dermatology
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.jaad.2026.02.072
PMID:41740895
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综述 | 本文综述了隆突性皮肤纤维肉瘤(DFSP)的诊断与临床管理策略 | 强调了Mohs显微外科手术作为首选治疗、分子靶点(如EGFR、PD-L1、PRAME)的识别,以及单细胞RNA测序和类器官模型在理解肿瘤微环境中的进展 | 未提及具体研究样本量或数据限制,且基于现有文献综述,可能缺乏原创性实验数据 | 回顾DFSP的诊断方法和治疗策略,以改善临床管理 | 隆突性皮肤纤维肉瘤(DFSP)患者及其肿瘤生物学 | 数字病理学 | 皮肤软组织肉瘤 | 组织病理学评估、CD34染色、磁共振成像、计算机断层扫描、分子分析、单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、影像数据、分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |