单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3161 - 3180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3161 | 2025-07-30 |
Single cell transcriptomic analysis reveals transcriptome differences of different cells between eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps and non-eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0328241
PMID:40720416
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉与非嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉之间不同细胞的转录组差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术比较了eCRSwNP和neCRSwNP的细胞异质性和分子机制 | 样本量较小（3例健康对照和6例患者） | 探索eCRSwNP和neCRSwNP的发病机制差异 | 嗜酸性和非嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 3例健康对照和6例患者（3例eCRSwNP和3例neCRSwNP） | NA | NA | NA | NA |
| 3162 | 2025-07-30 |
Single-Cell Data and Weighted Correlation Network Analysis Revealed the Regulatory Mechanisms of Macrophages in Carotid Plaques
2025, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/9987367
PMID:40727388
|
研究论文 | 通过单细胞数据和加权相关网络分析揭示巨噬细胞在颈动脉斑块中的调控机制 | 在单细胞水平上发现影响颈动脉斑块进展和巨噬细胞调控的潜在生物标志物，并研究其在免疫调控、程序性细胞死亡（PCD）和炎症因子调节中的作用 | NA | 理解基于巨噬细胞异质性的颈动脉斑块形成机制，为临床干预提供有价值的见解 | 颈动脉斑块中的巨噬细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序、bulk RNA-seq、WGCNA、随机森林、LASSO回归、qRT-PCR、Western blot、ssGSEA | 随机森林、LASSO回归 | 单细胞转录组数据、bulk RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3163 | 2025-07-30 |
Identifying and Diagnosing Lytic Cell Death Genes in Atherosclerosis Using Machine Learning and Bioinformatics
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S520039
PMID:40727462
|
研究论文 | 本研究利用机器学习和生物信息学方法，探讨了溶解性细胞死亡（LCD）在动脉粥样硬化（AS）中的作用和机制 | 结合机器学习和生物信息学方法筛选LCD相关基因，并开发了人工神经网络（ANN）模型用于AS的诊断和分期 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受到样本来源和数量的限制 | 探讨溶解性细胞死亡在动脉粥样硬化中的作用和机制 | 动脉粥样硬化相关基因和细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、机器学习、生物信息学分析 | ANN | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的基因表达数据和单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3164 | 2025-07-29 |
Exploring the comorbidity mechanisms of ITGB2 in rheumatoid arthritis and membranous nephropathy through integrated bioinformatics analysis
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2536730
PMID:40697036
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析探索ITGB2在类风湿性关节炎和膜性肾病中的共病机制 | 首次发现ITGB2是RA和MN的共同致病基因，并揭示了其在M1巨噬细胞极化和B细胞成熟分化中的作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探索类风湿性关节炎和膜性肾病的共同发病机制 | 类风湿性关节炎和膜性肾病患者 | 生物信息学 | 类风湿性关节炎, 膜性肾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 分子对接 | 随机森林算法, Monocle3, CellChat | 基因表达数据 | 从Gene Expression Omnibus和ImmPort数据库获取的批量及单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 3165 | 2025-07-29 |
Potential regulatory mechanism of overexpression of phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U on the glycolytic pathway in hepatocellular carcinoma
2025-Sep-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149603
PMID:40473062
|
研究论文 | 探讨磷脂酰肌醇聚糖锚定生物合成U类（PIGU）在肝细胞癌（HCC）糖酵解中的潜在分子调控机制 | 首次综合运用多种组学数据（包括RNA测序、蛋白质组学和单细胞RNA测序）结合CRISPR敲除筛选分析，揭示了PIGU在HCC糖酵解途径中的调控作用 | 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析，缺乏体内动物模型验证 | 阐明PIGU在HCC糖酵解途径中的分子调控机制 | 肝细胞癌细胞系（SMMC-7721和Huh7）及临床样本 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序（bulk RNA-seq和scRNA-seq）、CRISPR敲除筛选、免疫组化（IHC）、蛋白质组学 | NA | 组学数据（转录组、蛋白质组）、细胞实验数据 | 3773例HCC样本（RNA数据）、234例HCC样本（IHC和蛋白质组数据）、22861个HCC细胞（单细胞RNA测序） | NA | NA | NA | NA |
| 3166 | 2025-07-29 |
Identification of inflammation-related biomarkers and therapeutic targets for neurogenic bladder fibrosis via multi-omics analysis
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110721
PMID:40618693
|
研究论文 | 通过多组学分析识别炎症相关生物标志物和治疗靶点，用于神经源性膀胱纤维化的诊断和治疗 | 首次通过单细胞和批量RNA测序结合机器学习方法，识别出HIF-1α、IL-1β、CD40和IL10RA作为神经源性膀胱纤维化的诊断标志物，并发现MEK抑制剂PD-0325901作为潜在治疗药物 | 研究主要基于大鼠模型，临床转化需进一步验证 | 识别神经源性膀胱纤维化的炎症相关生物标志物并探索潜在治疗药物 | 神经源性膀胱纤维化大鼠模型和患者组织样本 | 生物医学 | 神经源性膀胱纤维化 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、WGCNA、机器学习、分子对接模拟 | 机器学习 | RNA测序数据 | 大鼠模型和患者组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3167 | 2025-07-29 |
Leveraging machine learning and single-cell RNA sequencing strategies to develop a risk prognosis scoring based on liquid-liquid phase separation feature genes in pediatric hepatoblastoma
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110685
PMID:40618698
|
研究论文 | 本研究结合机器学习和单细胞RNA测序技术，分析肝母细胞瘤中液-液相分离相关基因的分子特征，并建立首个基于液-液相分离的预后预测模型 | 首次在肝母细胞瘤中探索液-液相分离的作用，并开发基于机器学习的风险评分模型和可视化诊断工具 | 研究依赖于公开数据库的RNA-seq数据，未进行实验验证 | 探索液-液相分离在肝母细胞瘤中的作用并开发预后预测模型 | 肝母细胞瘤患者 | 机器学习 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | Random Forest, SVM-RFE, Lasso回归 | RNA-seq数据 | 多个GEO数据集(GSE133039, GSE75271, GSE81928, GSE132037, GSE186975) | NA | NA | NA | NA |
| 3168 | 2025-07-29 |
PANoptosis-driven molecular stratification in esophageal squamous cell carcinoma: A multi-omics prognostic model and FGFR-Targeted therapeutic validation
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110688
PMID:40628169
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析构建了一个基于PANoptosis的食管鳞状细胞癌预后模型，并验证了FGFR抑制剂AZD4547的治疗潜力 | 首次基于PANoptosis构建了食管鳞状细胞癌的预后模型，并发现FGFR抑制剂通过抑制EMT和调控MYC/E2F通路具有治疗潜力 | 研究结果需要在更大规模的临床队列中进一步验证 | 探索PANoptosis在食管鳞状细胞癌预后和治疗中的作用 | 食管鳞状细胞癌患者 | 数字病理 | 食管癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 基因集富集分析(GSEA) | LASSO Cox回归模型 | RNA-seq数据, 微阵列数据 | 一个外部微阵列队列和一个独立RNA-seq队列 | NA | NA | NA | NA |
| 3169 | 2025-07-29 |
Single-cell transcriptional landscape of peripheral myeloid cells in autoimmune diseases
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113026
PMID:40703454
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析自身免疫性疾病中外周髓系细胞的转录组景观 | 首次在14种自身免疫性疾病中大规模分析髓系细胞的单细胞转录组，并鉴定出13个具有独特免疫学特征的髓系细胞亚群 | 研究仅关注外周髓系细胞，未涉及其他免疫细胞类型或组织特异性髓系细胞 | 揭示自身免疫性疾病中髓系细胞的异质性和功能失调 | 375个单细胞RNA测序样本中的351,905个髓系细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 伪时间分析(pseudotime analysis) | 单细胞转录组数据 | 375个样本(涵盖14种自身免疫性疾病)中的351,905个髓系细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 3170 | 2025-07-29 |
METAB-HTX: prospective, longitudinal cohort study evaluating cardiac and systemic metabolism after heart transplantation
2025-Aug, ESC heart failure
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/ehf2.15330
PMID:40375600
|
研究论文 | METAB-HTX是一项前瞻性、纵向队列研究，旨在评估心脏移植后的心脏和全身代谢情况 | 该研究首次全面评估心脏移植后代谢恶化与心脏功能及生存率的关系，并采用多种先进技术进行深度表型分析 | 样本量相对有限（400例），且为单中心研究 | 改善心脏移植患者的长期生存率 | 心脏移植患者 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 心脏磁共振成像和光谱学(cMRI/MRS)、第三代和第四代测序(短读长和长读长测序)、单细胞测序 | NA | 临床数据、影像数据、基因组数据 | 400名心脏移植术后患者 | NA | NA | NA | NA |
| 3171 | 2025-07-29 |
Adverse effects of progestin-primed ovarian stimulation: combination of clinical study and single-cell analysis
2025-Aug, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2025.104833
PMID:40467355
|
研究论文 | 本研究通过临床研究和单细胞分析探讨了孕激素引发的卵巢刺激（PPOS）对生殖结果的负面影响 | 结合临床数据和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析，首次揭示了PPOS与线粒体DNA基因表达增加及卵母细胞质量下降的关联 | 研究为回顾性队列设计，样本量有限，且单细胞分析仅基于16名患者的数据 | 比较PPOS与GnRH拮抗剂方案在体外受精（IVF）中的生殖结局差异 | 907名卵巢储备正常的IVF患者（PPOS组299人，GnRH拮抗剂组608人）及16名患者的卵泡壁颗粒细胞（mGC） | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、逆概率处理加权（IPTW） | NA | 临床数据、单细胞基因表达数据 | 临床研究907人（PPOS组299人，GnRH拮抗剂组608人），单细胞分析16人（每组8人） | NA | NA | NA | NA |
| 3172 | 2025-07-29 |
ACACA depletion activates the cPLA2-arachidonic acid-NF-κB axis to drive inflammatory reprogramming in androgen receptor-independent prostate cancer
2025-Jul-25, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02363-0
PMID:40713618
|
研究论文 | 本研究探讨了ACACA在雄激素受体非依赖性前列腺癌(ARIPC)中的作用，揭示了ACACA缺失通过cPLA2-花生四烯酸-NF-κB轴驱动炎症重编程的机制 | 首次揭示了ACACA缺失在ARIPC中的促肿瘤作用及其通过花生四烯酸介导的NF-κB信号通路激活的机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床相关性有待进一步验证 | 探究ACACA在雄激素受体非依赖性前列腺癌中的作用机制 | 雄激素受体非依赖性前列腺癌细胞系和小鼠模型 | 癌症研究 | 前列腺癌 | shRNA基因沉默、转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序、qPCR、Western blotting、免疫荧光 | 小鼠尾静脉注射转移模型 | 组学数据、分子生物学数据、细胞功能实验数据 | 多个转移性去势抵抗性前列腺癌数据集和ARIPC细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 3173 | 2025-07-29 |
FCGBP promotes ovarian cancer progression via activation of IL-6/JAK-STAT signaling pathway
2025-Jul-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06854-z
PMID:40713656
|
研究论文 | 本研究探讨了FCGBP在卵巢癌进展中的临床相关性、功能作用及其潜在机制 | 首次揭示了FCGBP通过激活IL-6/JAK-STAT信号通路促进卵巢癌进展的分子机制 | 研究主要基于体外和动物模型，临床样本验证仍需扩大 | 探索FCGBP在卵巢癌中的生物学功能及其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 卵巢癌组织和SKOV3、ES-2卵巢癌细胞系 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 定量PCR、Western blotting、免疫组化、双荧光素酶报告基因检测、共免疫沉淀、ELISA | 小鼠异种移植模型 | 基因表达谱、单细胞RNA测序数据、蛋白质数据 | 多个公共数据集和临床组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3174 | 2025-07-29 |
Functional Diversity of Two Novel Embryonic Microglial Subpopulations and Their Developmental Trajectories in Developing Mouse Brains
2025-Jul-25, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70064
PMID:40714978
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了小鼠胚胎大脑中两种新型胚胎小胶质细胞亚群的功能多样性及其发育轨迹 | 发现了两种新型胚胎小胶质细胞亚群（EM1和EM2），并阐明了它们的功能差异和发育轨迹 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探索胚胎小胶质细胞的功能多样性和发育轨迹 | 小鼠胚胎大脑中的小胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 胚胎第14天（E14）小鼠大脑细胞，以及出生后第1、14和90天的小鼠大脑 | NA | NA | NA | NA |
| 3175 | 2025-07-29 |
Spatial transcriptomics reveals macrophage domestication by epithelial cells promotes immunotherapy resistance in small cell lung cancer
2025-Jul-24, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01005-5
PMID:40702109
|
研究论文 | 通过空间单细胞转录组学揭示上皮细胞驯化巨噬细胞促进小细胞肺癌免疫治疗耐药性的机制 | 发现Epi-I和Epi-II两种上皮细胞亚型及其在免疫化疗耐药性中的作用，揭示了MIF-SPP1-PI3K-AKT信号轴在细胞转化中的关键作用 | 样本量较小（18例患者），需要在更大规模队列中验证发现 | 阐明小细胞肺癌肿瘤微环境中免疫化疗耐药性的机制 | 广泛期小细胞肺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 18例广泛期小细胞肺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 3176 | 2025-07-29 |
Interpretable machine learning-guided single-cell mapping deciphers multi-lineage pancreatic dysregulation in type 2 diabetes
2025-Jul-24, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-025-02865-8
PMID:40707916
|
研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序和机器学习框架，解码了胰腺细胞异质性，并揭示了2型糖尿病中的多谱系胰腺失调 | 开发了PanSubPred和PSC-Stat两种新型工具，用于多谱系注释和星状细胞激活分析，并识别了64种细胞类型特异性标记物（其中38种为新型标记物） | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能未涵盖所有胰腺细胞类型的复杂性 | 解码胰腺细胞异质性并揭示2型糖尿病中的病理变化 | 胰腺细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | XGBoost | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3177 | 2025-07-29 |
Neoadjuvant immune checkpoint inhibition improves protection against hepatic melanoma metastasis
2025-Jul-24, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217950
PMID:40714065
|
research paper | 本研究探讨了新辅助免疫检查点抑制（ICI）在预防肝黑色素瘤转移中的作用 | 发现新辅助ICI比辅助治疗更能有效预防肝转移，并与T细胞扩增和TH1免疫反应增强相关 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 评估新辅助ICI在预防肝黑色素瘤转移中的效果 | 小鼠模型中的肝黑色素瘤转移 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | scRNA-Seq, 流式细胞术, 免疫荧光, 原位杂交, 多重细胞因子检测 | 小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞组成数据, 细胞因子数据 | 使用WT31或B16F10 luc2黑色素瘤细胞的小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 3178 | 2025-07-29 |
RBM17 promotes hepatocellular carcinoma progression by regulating lipid metabolism and immune microenvironment: implications for therapeutic targeting
2025-Jul-23, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02642-2
PMID:40702000
|
研究论文 | 本研究探讨了可变剪接因子RBM17在肝细胞癌（HCC）进展中的作用，特别是其对脂质代谢和免疫微环境的调控机制 | 首次揭示了RBM17通过调控CSAD和HACD3前体mRNA的外显子剪接，促进M2巨噬细胞浸润和脂肪酸代谢，进而影响HCC进展的新机制 | 研究主要基于实验室数据，尚未进行临床验证 | 阐明RBM17在HCC进展中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌（HCC）组织和细胞 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 无标记蛋白质组学、单细胞测序（scRNA-seq）、高通量测序、流式细胞术（FCM）、液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）、多参数免疫荧光（mIF）和染色质免疫沉淀（ChIP） | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3179 | 2025-07-29 |
Single-cell perspective on the Monocyte-to-HDL cholesterol ratio as a metastasis biomarker in papillary thyroid cancer
2025-Jul-23, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14373-9
PMID:40702447
|
research paper | 该研究通过单细胞视角探讨了单核细胞与高密度脂蛋白胆固醇比值（MHR）作为甲状腺乳头状癌（PTC）转移生物标志物的潜在作用 | 首次从单细胞角度揭示了MHR在PTC中的潜在作用，并证实了单核/巨噬细胞和胆固醇稳态对PTC淋巴结转移的显著促进作用 | 研究结果需要进一步的大样本临床验证，以确认MHR作为术前淋巴结转移预测标志物的可靠性 | 探讨MHR作为炎症标志物在PTC淋巴结转移中的作用及其机制 | 甲状腺乳头状癌（PTC）患者及其淋巴结转移（LNM）情况 | digital pathology | thyroid cancer | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化、共培养实验、Transwell实验 | NA | 临床数据、单细胞RNA测序数据 | 整合了GSE191288和GSE193581数据集的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 3180 | 2025-07-29 |
TNF drives aberrant BMP signaling to induce endothelial and mesenchymal dysregulation in pulmonary hypertension
2025-Jul-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174456
PMID:40569693
|
研究论文 | 研究探讨了肿瘤坏死因子α（TNF）如何通过异常BMP信号传导导致肺动脉高压（PH）中内皮细胞和间充质细胞的失调 | 揭示了TNF通过内皮NF-κB激活和随后的内皮SMAD2/3信号传导导致BMP信号传导异常的新机制 | 研究主要基于TNF-Tg小鼠模型，可能无法完全反映人类PH的复杂性 | 阐明肺动脉高压发病机制中内皮细胞和间充质细胞间的分子互作 | 野生型和TNF-Tg小鼠的肺内皮细胞和间充质细胞 | 病理生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、配体-受体相互作用分析、转录因子结合分析、RNA速度评估 | TNF-Tg小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | 野生型和TNF-Tg小鼠的肺内皮细胞和间充质细胞 | NA | NA | NA | NA |