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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3161 | 2026-02-19 |
STCF: Multi-View Clustering for Spatial Transcriptomics Based on Cross-View Fusion
2026-Feb-17, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence
IF:20.8Q1
DOI:10.1109/TPAMI.2026.3665779
PMID:41701605
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研究论文 | 本文提出了一种名为STCF的空间转录组学多视图聚类框架,通过交叉视图融合策略整合高变基因和低变基因,以提升空间域识别的精度 | STCF首次将高变基因和低变基因作为两个独立的基因表达视图,并采用即插即用的交叉视图融合策略,通过反向缩放余弦误差损失平衡基因嵌入的对齐与分离,从而增强对细粒度空间结构的解析能力 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种能够整合不同全局变异性基因信息以改进空间转录组学聚类的方法 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 多视图聚类框架 | 空间转录组学数据 | 三个基准数据集(DLPFC、HBC、MBA),具体样本数量未在摘要中提供 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3162 | 2026-02-19 |
A CD57+ CD8 T cell subset links cytotoxic T cell cytotoxicity to fibrotic lung disease in systemic sclerosis
2026-Feb-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194288
PMID:41701649
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研究论文 | 本研究通过分析系统性硬化症相关间质性肺病患者的血液和肺组织样本,鉴定了一个扩增的CD57+ CD8 T细胞亚群,并揭示了其通过CD155-CD226通路增强细胞毒性,可能驱动肺纤维化损伤 | 首次在SSc-ILD患者中鉴定出CD57+ CD8 T细胞亚群的扩增,并阐明其通过CD155-CD226共刺激通路增强细胞毒性功能,连接了免疫细胞与肺纤维化疾病 | 研究主要基于观察性数据和公共数据集分析,缺乏直接的体内功能验证实验来证实该T细胞亚群在肺损伤中的因果作用 | 探究系统性硬化症相关间质性肺病的免疫病理机制,特别是T细胞在肺损伤中的作用 | 系统性硬化症伴或不伴间质性肺病患者的血液T细胞、肺组织样本以及公共单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | 系统性硬化症相关间质性肺病 | 免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 血液样本、肺组织样本、单细胞RNA测序数据 | SSc-ILD患者、SSc无ILD患者及对照组的血液样本,以及独立SSc-ILD患者的肺活检或移植组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3163 | 2026-02-19 |
Deubiquitinase USP2 promotes hepatic stellate cell activation via p300 stabilization
2026-Feb-17, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70301
PMID:41703985
|
研究论文 | 本研究通过去泛素化酶抑制剂筛选和单细胞RNA测序,发现USP2通过稳定p300蛋白促进肝星状细胞活化,从而驱动肝纤维化 | 首次鉴定出USP2是p300的去泛素化酶,并揭示了其在肝纤维化中调控肝星状细胞活化的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验和单细胞测序分析,体内功能验证和临床转化潜力需进一步探索 | 探究肝纤维化过程中肝星状细胞活化的上游调控机制 | 肝星状细胞、p300蛋白、USP2去泛素化酶 | 分子生物学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、去泛素化酶抑制剂筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 纤维化人肝组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3164 | 2026-02-19 |
NK Cell Activation by Platinum Boosts Immunotherapy in HR+/HER2- Breast Cancer
2026-Feb-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202518978
PMID:41691453
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研究论文 | 本研究通过多组学和单细胞RNA测序揭示了NK细胞在HR+/HER2-乳腺癌中对免疫治疗反应的关键作用,并发现铂类药物可通过增强NK细胞活性来提升免疫治疗效果 | 首次在HR+/HER2-乳腺癌中系统阐明NK细胞介导免疫治疗反应的机制,并发现铂类药物通过NF-κB通路增强NK细胞毒性的新协同作用 | 临床队列分析样本量未明确说明,铂类药物增强NK细胞活性的具体分子机制仍需进一步验证 | 探究HR+/HER2-乳腺癌中免疫治疗应答机制及铂类药物的协同增效作用 | HR+/HER2-乳腺癌肿瘤微环境、NK细胞、铂类药物 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、多组学分析、药物筛选 | NA | 单细胞转录组数据、临床队列数据 | 未明确说明(包含临床队列、细胞系和患者来源肿瘤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3165 | 2026-02-19 |
Single-cell profiling reveals FAM117A as a key regulator linking macrophage-epithelial crosstalk with the progression of lung adenocarcinoma
2026-Feb-15, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-026-00745-9
PMID:41692823
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了FAM117A作为连接巨噬细胞-上皮细胞串扰与肺腺癌进展的关键调节因子 | 首次识别出FAM117A作为SPP1+巨噬细胞与基底上皮细胞通信模块的主要抑制因子,并揭示其通过调控细胞周期和免疫微环境影响肿瘤进展 | 研究主要基于单细胞转录组数据,需要进一步实验验证FAM117A的具体作用机制 | 探究肺腺癌肿瘤微环境中巨噬细胞与上皮细胞间的通信网络及其对肿瘤进展的影响 | 肺腺癌组织中的巨噬细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 转录组建模 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3166 | 2026-02-16 |
Correction to: Comprehensive analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals the non-cardiomyocytes heterogeneity and novel cell populations in dilated cardiomyopathy
2026-Feb-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07741-x
PMID:41691271
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3167 | 2026-02-19 |
Mendelian randomization followed by single-cell RNA sequencing exploration identifies effector memory CD4+ T cells as a risk factor for myasthenia gravis
2026-Feb-13, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000047588
PMID:41686610
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析结合单细胞RNA测序,识别出效应记忆CD4+ T细胞是晚发型重症肌无力的风险因素 | 首次将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序数据整合,系统性地探索了免疫细胞亚群在重症肌无力发病机制中的作用,并识别出效应记忆CD4+ T细胞的关键角色 | 研究依赖于现有的单细胞RNA测序数据集,样本量可能有限;功能机制推测需要进一步的实验验证 | 探究不同免疫细胞亚群在重症肌无力发病机制中的贡献,特别是区分早发型和晚发型疾病 | 重症肌无力患者,特别是早发型和晚发型患者的外周血免疫细胞 | 生物信息学 | 重症肌无力 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,单细胞转录组数据 | 涉及731个外周免疫表型的孟德尔随机化分析,以及来自重症肌无力患者外周血的现有单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3168 | 2026-02-19 |
Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily B member 1 expression defines CD8+ T cell exhaustion in acute myeloid leukemia
2026-Feb-09, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag016
PMID:41622032
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、批量转录组数据和机器学习算法,揭示了急性髓系白血病中CD8+ T细胞耗竭的关键机制,并识别了LILRB1作为核心免疫抑制枢纽 | 首次将LILRB1鉴定为AML中CD8+ T细胞和NK细胞耗竭的中央免疫检查点,并构建了一个稳定的九基因预后特征模型 | 样本量相对较小(20名AML患者和20名健康供者),且主要依赖生物信息学分析,实验验证部分有限 | 阐明急性髓系白血病中免疫细胞毒性受损的机制,并探索预后生物标志物和治疗靶点 | 急性髓系白血病患者的免疫细胞,特别是CD8+ T细胞和NK细胞 | 生物信息学与机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、RT-qPCR、多色流式细胞术 | 岭回归等多种机器学习算法 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、临床数据 | 20名AML患者和20名健康供者的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3169 | 2026-02-19 |
Integrated multicenter single-cell atlas of bladder cancer reveals tumor heterogeneity associated with immunotherapy
2026-Feb-03, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003830
PMID:41632017
|
研究论文 | 本研究通过整合多中心单细胞数据构建了膀胱癌的单细胞图谱,揭示了与免疫治疗相关的肿瘤异质性 | 构建了大规模多中心膀胱癌单细胞图谱,通过伪批量分析评估了传统分类器的局限性,并定义了新的肿瘤间和肿瘤内异质性亚型,特别是发现了TGF-β1-PTHLH轴在免疫检查点抑制剂耐药中的作用 | 研究主要基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证来确认PTHLH作为治疗靶点的有效性 | 克服传统批量转录组分析在膀胱癌分子分型中的局限性,解析肿瘤异质性并探索免疫治疗反应的分子特征 | 膀胱癌患者肿瘤样本中的细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析 | 无监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 123个样本,842,127个细胞(其中265,962个肿瘤上皮细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3170 | 2026-02-19 |
Scalable spatial transcriptomics through computational array reconstruction
2026-Feb, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02612-0
PMID:40181168
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研究论文 | 本文提出了一种无需成像的空间转录组学方法,通过计算重建空间条形码位置 | 利用分子扩散和降维技术实现成像自由的空间转录组学,提高了可扩展性和通量 | NA | 开发可扩展的空间转录组学技术,以克服成像限制 | 厘米级组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 降维算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3171 | 2026-02-19 |
MBOAT1 Promotes Glioma Progression Through Enhancing Ferroptosis Resistance and Immunosuppressive Microenvironment
2026-Feb, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70785
PMID:41696943
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研究论文 | 本研究探讨了MBOAT1在胶质瘤中通过增强铁死亡抵抗和促进免疫抑制微环境来驱动肿瘤进展的作用 | 首次在胶质瘤中系统研究了MBOAT家族成员MBOAT1在铁死亡抵抗和免疫抑制微环境中的作用,并验证了其作为独立预后因子和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于数据库分析和体外/体内实验,缺乏临床样本的直接验证,且具体分子机制有待进一步阐明 | 探究MBOAT1在胶质瘤进展中的功能机制及其临床意义 | 胶质瘤细胞系、患者样本数据(来自TCGA、CGGA、GEO、GTEx数据库) | 生物信息学与肿瘤生物学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、免疫浸润分析、细胞通讯分析、富集分析、体外/体内实验 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞RNA-seq数据 | 多个公共数据库(TCGA、CGGA、GEO、GTEx)的胶质瘤患者样本数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3172 | 2026-02-19 |
Dissecting clonal hematopoiesis in the myeloid compartment of chronic lymphocytic leukemia and Richter transformation
2026-Feb, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70322
PMID:41704549
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研究论文 | 本研究通过深度测序技术,首次系统性地探究了慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者骨髓区室中克隆性造血(CH)的临床与生物学意义 | 首次在CLL的骨髓区室中全面研究CH的临床与生物学意义,揭示了CH与患者总生存期、治疗相关毒性、继发血液恶性肿瘤风险以及Richter转化风险的独立关联,并发现CH对T细胞免疫区室的影响 | 研究为观察性研究,样本量相对有限(488例),单细胞测序样本数较少(13例),且主要基于回顾性分析 | 探究CLL患者骨髓区室中克隆性造血的临床意义、生物学特征及其对疾病预后和治疗的影响 | 488例新诊断的慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者 | 血液肿瘤学 | 慢性淋巴细胞白血病 | CAPP-seq(深度靶向测序)、单细胞DNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组DNA、单细胞DNA、单细胞RNA | 488例新诊断CLL患者(其中231例检出CH),57份连续样本,13例单细胞RNA测序样本(7例CH阳性,6例CH阴性) | NA | 靶向深度测序, 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 使用28基因panel对粒细胞基因组DNA进行CAPP-seq |
| 3173 | 2026-02-19 |
Imputing missing values in single-cell RNA-sequencing data: a statistical and machine learning-based approach
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag072
PMID:41697922
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研究论文 | 本文提出了一种名为scDDI的新方法,用于检测和填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 结合泊松-负二项混合模型进行缺失事件检测,并使用决策树回归模型进行填补,优于现有单细胞填补技术 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序数据中因RNA含量有限导致的缺失值问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 决策树回归模型 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3174 | 2026-02-19 |
Introduction to Oral Immunity
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03176-1_1
PMID:41225090
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综述 | 本章节全面概述了口腔免疫系统的组成、功能及其在维持局部耐受与启动保护性反应中的双重作用,并探讨了其与全身免疫的关联 | 强调了口腔免疫在连接局部黏膜防御与全身免疫反应中的关键作用,并综述了单细胞RNA测序、空间转录组学等新技术如何推动口腔免疫学向更精确的诊断和治疗发展 | 作为综述章节,未报告原始研究数据,主要基于现有文献进行总结 | 概述口腔免疫系统的组成、功能及其在健康和炎症状态下的作用机制,并探讨相关治疗策略和技术进展 | 口腔免疫系统,包括上皮屏障、唾液抗菌因子、固有及适应性免疫成分、口腔组织中的常驻免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 空间转录组学, 宏基因组学, 多组学整合 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3175 | 2026-02-19 |
Inflammatory Mediators in Peri-Implantitis: From Pathophysiology to Therapeutic Targets
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-03176-1_21
PMID:41225110
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综述 | 本文综述了种植体周围炎的炎症介质,从病理生理学角度探讨了其作为治疗靶点的潜力 | 整合了基因多态性、蛋白质组学和单细胞RNA测序等先进视角,揭示了种植体周围炎特有的细胞相互作用和炎症通路,并展望了基于基因组数据和计算工具的精准医学管理趋势 | NA | 探讨种植体周围炎的病因和发病机制,为开发有效的靶向治疗提供依据 | 种植体周围炎相关的炎症介质、生物标志物及细胞相互作用 | 数字病理学 | 种植体周围炎 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 唾液、种植体周围龈沟液中的生物标志物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3176 | 2026-02-19 |
Development of an in situ small intestinal injection technique for targeted macromolecule delivery and in vivo functional studies in mice
2026-Jan, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70123
PMID:41577652
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研究论文 | 本研究开发了一种小鼠小肠原位注射技术,用于靶向递送大分子并进行体内功能研究 | 提出了一种微创、原位的小肠注射方法,能够绕过胃部屏障,实现局部腔内递送,避免了传统口服灌胃导致的大分子降解问题 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在更大动物或人类中验证;长期效应和潜在并发症需进一步评估 | 开发一种靶向递送生物大分子至小肠的技术,并评估其在生理环境中的功能应用 | 小鼠小肠组织,特别是肠上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量,但涉及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3177 | 2026-02-19 |
Single-cell RNA sequencing of platelets: challenges and potential
2026-Jan, Journal of thrombosis and thrombolysis
IF:2.3Q2
DOI:10.1007/s11239-025-03153-8
PMID:40745405
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研究论文 | 本研究首次使用10X Genomics平台对全血来源的血小板进行单细胞RNA测序,探索其转录组特征 | 首次在全血来源的血小板富集血浆上应用10X Genomics平台进行scRNA-seq,成功识别出血小板特异性标记基因簇 | 血小板RNA含量有限、细胞尺寸小、高反应性易激活、处理敏感性高、线粒体RNA占比高(约14%)等技术挑战 | 探索血小板单细胞转录组测序的技术可行性及其生物学意义 | 健康供体的外周全血及从中纯化的血小板富集血浆 | 单细胞组学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序 | UMAP聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 1名健康供体的外周全血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10X Chromium | 10X Genomics单细胞测序平台(具体型号未说明) |
| 3178 | 2026-02-19 |
Single-cell transcriptomics of Pacific white shrimp (Litopenaeus vannamei) hepatopancreas reveal immune and metabolic responses to AHPND-causing Vibrio parahaemolyticus
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1713369
PMID:41694335
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术分析了太平洋白虾肝胰腺在健康状态和AHPND致病性副溶血弧菌感染下的免疫与代谢反应 | 首次构建了太平洋白虾肝胰腺的单细胞转录组图谱,并在单细胞分辨率下揭示了宿主对AHPND致病菌的免疫应答机制 | 样本量相对较小(健康虾3只,感染虾3只,模拟处理虾2只),且仅针对一种病原体进行研究 | 探究AHPND致病性副溶血弧菌感染下虾肝胰腺的细胞类型组成及宿主免疫反应机制 | 太平洋白虾(Litopenaeus vannamei)的肝胰腺组织 | 单细胞转录组学 | 急性肝胰腺坏死病(AHPND) | 单细胞RNA测序 | Seurat, clusterProfiler | 单细胞转录组数据 | 健康虾3只,感染虾3只,模拟处理虾2只,共27,374个质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium X | 10x Genomics Chromium X控制器配合GEM-X 3'基因表达试剂 |
| 3179 | 2026-02-19 |
Hepatocyte growth factor as a driver of synovial inflammation and therapeutic resistance in rheumatoid arthritis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1718591
PMID:41694341
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研究论文 | 本研究阐明了肝细胞生长因子(HGF)通过作用于滑膜成纤维细胞驱动IL-6介导的炎症放大环路,从而在类风湿关节炎的滑膜炎症和治疗抵抗中发挥关键作用,并评估了靶向HGF-c-Met轴的治疗潜力 | 揭示了HGF-c-Met轴在滑膜成纤维细胞中驱动IL-6介导的炎症反馈环路的具体机制,并首次在体内关节炎模型中验证了c-Met抑制剂savolitinib的治疗效果 | 研究样本量有限(66例RA患者),且体内实验仅在小鼠模型中进行,其结论在人类患者中的普适性仍需进一步验证 | 阐明HGF在类风湿关节炎滑膜炎症和治疗抵抗中的机制作用,并评估靶向HGF-c-Met轴的治疗潜力 | 类风湿关节炎患者(血浆、滑膜组织)、滑膜成纤维细胞、单核细胞以及小鼠关节炎模型 | NA | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序、免疫染色、bulk RNA测序、定量PCR | NA | RNA测序数据、免疫染色图像、基因表达数据 | 66名RA患者、公开可用的单细胞RNA测序数据、小鼠关节炎模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3180 | 2026-02-19 |
The prognostic significance of JAML and its role in remodeling the immune microenvironment via the cGAS-STING pathway in endometrial cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1738596
PMID:41694334
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据、临床队列与实验模型,揭示了JAML蛋白在子宫内膜癌中的表达下调与不良预后相关,并通过调控cGAS-STING通路影响肿瘤免疫微环境 | 首次系统阐明JAML在子宫内膜癌中的抑癌作用及其通过cGAS-STING通路调控巨噬细胞极化的新机制,并构建了整合JAML的临床预后预测模型 | 研究主要基于回顾性临床数据和体外/体内实验,缺乏前瞻性临床验证;cGAMP恢复效应的具体分子机制仍需进一步探索 | 探究JAML在子宫内膜癌中的表达特征、临床意义及其调控肿瘤进展的分子机制 | 子宫内膜癌患者组织样本、癌细胞系、动物模型 | 癌症生物学 | 子宫内膜癌 | 免疫组化、qRT-PCR、Western blot、shRNA敲低、Transwell/划痕实验、CCK-8检测、流式细胞术、生物信息学分析 | Cox回归模型、列线图 | 多组学数据(转录组、单细胞转录组)、临床病理数据、实验数据 | TCGA数据集和机构队列的双独立临床队列,具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |