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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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3161 | 2025-10-06 |
The potential role of BCL2A1⁺ tissue-resident macrophages in the prognosis of Wilms tumor
2025-Jul-25, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02935-3
PMID:40707992
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研究论文 | 本研究首次在Wilms肿瘤中发现BCL2A1⁺组织驻留巨噬细胞亚群并揭示其在肿瘤进展中的关键作用 | 首次在Wilms肿瘤中鉴定出BCL2A1⁺组织驻留巨噬细胞亚群,并发现其高表达与晚期肿瘤和不良预后相关 | 样本量相对有限(120例患者),需要更大规模研究验证结果 | 探索Wilms肿瘤进展的关键机制和免疫治疗靶点 | Wilms肿瘤患者及其肿瘤和癌旁组织 | 数字病理学 | Wilms肿瘤 | 单细胞RNA测序, CIBERSORT分析, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 组织图像数据 | 120例Wilms肿瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3162 | 2025-10-06 |
Combined bulk and single-cell transcriptomic analysis reveals cell-type-specific inflammatory crosstalk in pancreatic cancer
2025-Jul-25, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01815-8
PMID:40711603
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研究论文 | 通过整合批量转录组和单细胞转录组分析,揭示胰腺癌中细胞类型特异性的炎症信号串扰 | 结合批量转录组和单细胞RNA测序数据,首次系统解析了胰腺癌中非编码RNA与关键基因的细胞类型特异性表达模式及细胞间通讯网络 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;数据来源于公共数据库,样本来源可能存在异质性 | 阐明胰腺导管腺癌的分子和细胞景观,发现预后生物标志物和治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)组织及癌旁正常组织 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 生物信息学分析 | ceRNA网络, PPI网络, CellChat细胞通讯模型 | 转录组数据(mRNA, miRNA, lncRNA, circRNA) | 来自NCBI GEO数据库的多个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
3163 | 2025-10-06 |
Decoding epithelial-fibroblast interactions in lung adenocarcinoma through single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jul-24, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-025-06250-6
PMID:40705084
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学技术,解析肺腺癌中上皮细胞与成纤维细胞的相互作用机制 | 首次系统识别肺腺癌中8种上皮细胞和9种成纤维细胞亚群,并揭示其空间共定位特征及代谢互作网络 | 样本量相对有限(21例患者),需要在更大队列中验证发现 | 阐明肺腺癌肿瘤微环境中上皮-基质细胞的相互作用及其在疾病进展中的作用 | 肺腺癌患者组织样本中的上皮细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CNV分析, 轨迹推断 | Seurat, Harmony, CellChat, MEBOCOST, CellTrek, Cox回归 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 21例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
3164 | 2025-10-06 |
Identification of key targets and exploration of therapeutic molecular mechanisms of natural compound tangeretin in osteosarcoma
2025-Jul-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03221-8
PMID:40705154
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证探索天然化合物桔皮素在骨肉瘤治疗中的关键靶点和分子机制 | 首次结合WGCNA和网络药理学方法系统鉴定桔皮素治疗骨肉瘤的关键靶点,并通过单细胞测序深入探索其作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索天然化合物桔皮素在骨肉瘤治疗中的分子机制和潜在靶点 | 骨肉瘤细胞系和相关的基因靶点 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | WGCNA, 网络药理学, RT-qPCR, 分子对接, 单细胞测序 | 多基因诊断模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3165 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics identifies PDGFRA+ progenitors orchestrating angiogenesis and periodontal tissue regeneration
2025-Jul-24, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-025-00384-6
PMID:40707447
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学识别了PDGFRA+祖细胞在协调血管生成和牙周组织再生中的关键作用 | 首次发现PDGFRA+间充质干细胞与内皮细胞通过VEGFA和PDGFBB-PDGFRA相互信号传导介导血管生成-成骨耦合的新机制 | 研究主要聚焦于牙齿模型,机制在其他组织再生中的普适性需要进一步验证 | 解析牙周组织再生过程中的细胞协调机制 | 人牙囊和牙乳头细胞 | 单细胞生物学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3166 | 2025-10-06 |
A Bayesian nonparametric method for jointly clustering multiple spatial transcriptomic datasets and simultaneous gene selection
2025-Jul-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11693-5
PMID:40707561
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研究论文 | 提出一种贝叶斯非参数聚类算法,能够整合多个供体的空间转录组数据进行联合聚类和基因选择 | 能够同时处理多个供体的空间转录组数据,自动确定聚类数量,识别跨供体的共有聚类和供体特异性聚类,并进行信息基因的变量选择 | NA | 解决现有空间转录组聚类算法的局限性,开发能够整合多供体数据的聚类方法 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯非参数模型 | 基因表达数据和空间位置数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
3167 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing analysis revealed the immunosuppressive remodeling of tumor-associated macrophages mediated by the MIF-CD74 axis in gastric cancer
2025-Jul-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-10301-w
PMID:40707596
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了胃癌中MIF-CD74轴介导的肿瘤相关巨噬细胞免疫抑制重塑 | 首次在胃癌中系统鉴定出四种不同的TAM亚群,并发现TAM-APOE亚群通过MIF-CD74轴与肿瘤细胞发生最强相互作用 | 样本量相对有限(11例胃癌组织),需要在更大队列中验证研究结果 | 探究胃癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其与肿瘤细胞的代谢相互作用机制 | 胃癌组织和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 11例胃癌组织中的75,743个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3168 | 2025-10-06 |
Interpretable machine learning-guided single-cell mapping deciphers multi-lineage pancreatic dysregulation in type 2 diabetes
2025-Jul-24, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-025-02865-8
PMID:40707916
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研究论文 | 本研究开发了基于机器学习的单细胞分析框架,系统解析了2型糖尿病中胰腺多谱系细胞的失调机制 | 开发了PanSubPred和PSC-Stat两种新型机器学习工具,实现了胰腺细胞多谱系注释和星状细胞激活动态量化,发现了38个新型细胞类型特异性标志物 | 未明确说明样本来源和具体样本量,研究结果需要在更大规模数据集中验证 | 解析2型糖尿病中胰腺细胞异质性的病理重塑机制 | 胰腺单细胞转录组数据 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | XGBoost | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3169 | 2025-10-06 |
Evolution of SARS-CoV-2 T cell responses as a function of multiple COVID-19 boosters
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115907
PMID:40580476
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研究论文 | 本研究通过3年追踪调查78名无新冠肺炎症状感染者,探讨了多次疫苗接种对适应性免疫的长期影响 | 首次系统揭示多次新冠加强针接种后T细胞反应的长期动态变化特征,发现无症状感染者存在独特的T细胞亚群特征 | 样本量相对有限(78人),且无法完全排除未报告的无症状感染情况 | 评估多次COVID-19疫苗接种对适应性免疫系统的长期影响 | 78名无报告新冠肺炎症状感染的个体 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、免疫反应数据 | 78名个体,追踪3年 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3170 | 2025-10-06 |
Lymph node fibroblast phenotypes and immune crosstalk regulated by podoplanin activity
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115908
PMID:40581928
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研究论文 | 本研究探讨了podoplanin在淋巴结成纤维网状细胞中对免疫细胞通讯和炎症信号调控的作用 | 首次直接验证了PDPN信号在成年淋巴结成纤维网状细胞中的功能,揭示了其对基质-免疫细胞相互作用和炎症信号调控的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人类淋巴结中的适用性需要进一步验证 | 研究podoplanin信号在淋巴结成纤维网状细胞免疫调节功能中的作用机制 | 淋巴结成纤维网状细胞和免疫细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
3171 | 2025-10-06 |
Controlling mitochondrial membrane architecture via MIC60 determines viral replication to promote anti-viral immunity
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115922
PMID:40628273
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体内膜结构通过MIC60复合体调控病毒复制并促进抗病毒免疫的机制 | 首次将FF ATP合酶和MICOS复合体与病毒复制及免疫激活联系起来,阐明了线粒体结构-代谢与抗病毒免疫反应之间的新关联 | 研究主要聚焦于树突状细胞和VSV病毒感染模型,在其他细胞类型和病毒中的普适性有待验证 | 探索线粒体内膜和嵴结构在病毒复制中的作用及其对抗病毒免疫的影响 | 骨髓来源的树突状细胞和Mic60CD11c-Cre基因工程小鼠 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3172 | 2025-10-06 |
Horizontal gene transfer-mediated enhancement of gut antifungal defense facilitates host plant adaptation in an invasive pest
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115970
PMID:40638393
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研究论文 | 本研究揭示了入侵害虫美国白蛾通过水平基因转移获得几丁质酶基因HcuChiA,增强肠道抗真菌防御能力,从而促进对新寄主植物水杉的适应 | 首次证明水平基因转移获得的细菌源几丁质酶基因通过增强肠道抗真菌免疫促进害虫寄主适应性扩张 | 研究主要聚焦于单一基因功能,对其他可能参与适应机制的基因关注较少 | 探究水平基因转移在入侵害虫寄主适应性扩张中的作用机制 | 美国白蛾(Hyphantria cunea)及其五种寄主植物和水杉(Metasequoia glyptostroboides) | NA | NA | 比较转录组学、单细胞转录组学、系统发育分析、RNA干扰、重组蛋白表达 | NA | 转录组数据、基因表达数据、系统发育数据 | 五种寄主植物和人工饲料饲养的幼虫 | NA | NA | NA | NA |
3173 | 2025-10-06 |
TNF drives aberrant BMP signaling to induce endothelial and mesenchymal dysregulation in pulmonary hypertension
2025-Jul-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.174456
PMID:40569693
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析TNF-Tg肺动脉高压模型中内皮细胞和间充质细胞的分子互作机制 | 首次揭示TNF信号通过激活内皮细胞NF-κB和SMAD2/3信号通路导致BMP信号传导异常的新机制 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证 | 阐明肺动脉高压发病过程中内皮细胞与间充质细胞的分子互作机制 | 野生型和TNF-Tg转基因小鼠的肺内皮细胞和间充质细胞 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,免疫荧光染色,配体-受体相互作用分析,转录因子结合分析,RNA速率评估 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | WT和TNF-Tg小鼠的肺细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3174 | 2025-10-06 |
Pathogenesis of Graves' Disease Determined Using Single-Cell Sequencing with Thyroid Autoantigen Peptide Stimulation in B Cells
2025-Jul-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14141102
PMID:40710355
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析格雷夫斯病患者B细胞对甲状腺自身抗原肽刺激的免疫反应 | 首次在单细胞水平上比较了格雷夫斯病患者外周血和甲状腺内B细胞对多种甲状腺自身抗原的差异反应 | 样本量有限,仅分析了接受甲状腺切除术的患者 | 阐明格雷夫斯病中B细胞对甲状腺自身抗原的免疫应答机制 | 格雷夫斯病患者的B细胞 | 单细胞测序 | 格雷夫斯病 | 单细胞RNA测序,B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 接受甲状腺切除术的格雷夫斯病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3175 | 2025-10-06 |
A pluripotent stem cell atlas of multilineage differentiation
2025-Jul-15, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05549-w
PMID:40664685
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人多能干细胞多谱系分化的综合图谱 | 首次提供了从多能性到所有胚层细胞类型的全面单细胞转录组时间序列数据,涵盖从原肠胚形成到祖细胞和定型细胞状态 | 研究基于体外分化系统,可能与体内发育存在差异 | 研究发育信号通路在多谱系分化中的作用,推进对分化信号调控的理解 | 人多能干细胞及其分化产生的各类细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过60,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3176 | 2025-10-06 |
Regulation of Hindbrain Vascular Development by rps20 in Zebrafish
2025-Jul-13, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14141070
PMID:40710323
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研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型揭示了rps20基因在后脑血管发育中的关键作用及其与衰老相关脑血管缺陷的关联 | 首次发现rps20基因在衰老过程中下调,并通过CRISPR/Cas9技术证明其对后脑中央动脉发育和血管稳态维持的关键作用 | 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探究衰老相关基因在脑血管发育中的作用机制 | 斑马鱼胚胎和成年个体 | 发育生物学 | 神经系统疾病 | scRNA-seq, CRISPR/Cas9, qPCR, 整体原位杂交 | 斑马鱼体内模型 | 基因表达数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
3177 | 2025-10-06 |
Computational and Imaging Approaches for Precision Characterization of Bone, Cartilage, and Synovial Biomolecules
2025-Jul-09, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm15070298
PMID:40710415
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综述 | 本文综述了用于精确表征骨骼、软骨和滑膜生物分子的计算与成像方法的最新进展 | 整合了先进成像技术、计算建模和测序方法,实现关节组织的高分辨率非侵入性表征 | 临床广泛应用需要健全的数据基础设施、监管合规性和医生教育 | 通过多学科方法实现肌肉骨骼疾病的精准诊断和治疗 | 骨骼、软骨和滑膜组织的生物分子和微观结构 | 医学影像分析 | 退行性关节疾病 | RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学, 影像组学 | CNN, 有限元模型, 基于代理的模型 | 医学影像, 分子数据 | NA | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3178 | 2025-10-06 |
An amphiregulin reporter mouse enables transcriptional and clonal expansion analysis of reparative lung Tregs
2025-Jul-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187245
PMID:40626358
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研究论文 | 本研究开发了一种能够检测活细胞中双调蛋白表达的报道小鼠模型,用于研究修复性肺Treg细胞的转录组特征和克隆扩增 | 首次创建了能够分离活的双调蛋白产生细胞的报道小鼠模型,实现了对修复性Treg细胞的功能性分析 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的转化价值需要进一步验证 | 研究修复性肺Treg细胞的转录特征和克隆扩增机制 | 小鼠肺组织中的调节性T细胞 | 单细胞生物学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 使用流感A和博来霉素诱导的肺损伤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3179 | 2025-10-06 |
Allergen induces pulmonary neuroendocrine cell hyperplasia in a model of asthma
2025-Jul-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187018
PMID:40626365
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研究论文 | 本研究揭示了过敏原通过诱导肺神经内分泌细胞增生加剧哮喘反应的机制 | 首次发现过敏原暴露可导致肺神经内分泌细胞通过增殖和俱乐部细胞转分化两种途径发生增生 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类哮喘患者中验证 | 探究肺神经内分泌细胞在过敏原诱导哮喘反应中的调控机制 | 小鼠肺神经内分泌细胞 | 呼吸疾病研究 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
3180 | 2025-10-06 |
The Integrated Function of the Lateral Hypothalamus in Energy Homeostasis
2025-Jul-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14141042
PMID:40710295
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综述 | 本文整合近期分子与功能研究发现,系统阐述外侧下丘脑区在能量稳态调控中的核心作用 | 通过单细胞转录组学揭示LHA中30余种神经元亚型的分子异质性,并建立其与代谢信号感知-行为响应的完整调控网络 | 作为综述文章未提供原始实验数据,主要基于现有研究进行整合分析 | 阐明外侧下丘脑区在能量稳态和动机行为中的整合功能 | 外侧下丘脑区神经元亚型及其神经环路 | 神经科学 | 肥胖及相关代谢疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |