单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32005 篇文献，本页显示第 31701 - 31720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 31701 | 2024-08-09 |
Genomic Aberrations in Multiple Myeloma
2016, Cancer treatment and research
DOI:10.1007/978-3-319-40320-5_3
PMID:27696256
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综述 | 本文综述了多发性骨髓瘤的基因组异常情况 | 介绍了下一代测序技术在多发性骨髓瘤研究中的应用，包括全外显子、全基因组、RNA和单细胞测序以及全基因组关联研究 | NA | 全面回顾多发性骨髓瘤的基因组景观 | 多发性骨髓瘤的基因组异常 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31702 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Bioinformatics and Computational Challenges
2016, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2016.00163
PMID:27708664
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-Seq）技术的生物信息学工具和方法，并讨论了该领域面临的关键分析挑战 | NA | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在疾病和生物过程理解中的应用及其分析方法 | 单细胞RNA测序数据及其分析方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31703 | 2024-08-09 |
Robust classification of single-cell transcriptome data by nonnegative matrix factorization
2017-01-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw607
PMID:27663498
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研究论文 | 本文通过非负矩阵分解（NMF）方法对单细胞转录组数据进行分类，以识别细胞亚群 | 采用细胞中心的NMF方法，识别细胞亚型（'metacells'），而不是传统的基因中心的NMF方法 | NA | 研究如何通过非负矩阵分解（NMF）方法准确且稳健地识别单细胞转录组数据中的细胞亚群 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解（NMF） | 非负矩阵分解（NMF） | 转录组数据 | 数千个单细胞转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 31704 | 2024-08-09 |
Computational methods for trajectory inference from single-cell transcriptomics
2016-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.201646347
PMID:27682842
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学中用于轨迹推断的计算方法，并分析了这些方法的优缺点 | 提出了一种新的方法分类框架，并概述了这些方法在细胞分化中的应用 | 轨迹推断领域仍处于起步阶段，存在进一步发展的空间 | 探讨单细胞转录组学在免疫学动态过程中的应用 | 单细胞转录组学数据及其在细胞发育路径重建中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31705 | 2024-08-09 |
A Single-Cell Transcriptomic Map of the Human and Mouse Pancreas Reveals Inter- and Intra-cell Population Structure
2016-10-26, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2016.08.011
PMID:27667365
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研究论文 | 本文采用基于液滴的单细胞RNA测序方法，分析了来自四个人类供体和两种小鼠品系的超过12,000个胰腺细胞的转录组 | 首次详细描绘了人类和小鼠胰腺的单细胞转录组图谱，揭示了细胞间和细胞内的群体结构 | NA | 揭示胰腺中不同细胞类型的复杂相互作用及其基因表达模式 | 人类和小鼠的胰腺细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12,000个胰腺细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31706 | 2024-08-09 |
Protein C receptor (PROCR) is a negative regulator of Th17 pathogenicity
2016-10-17, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20151118
PMID:27670590
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析病原性与非病原性Th17细胞，发现蛋白C受体（PROCR）作为Th17细胞表面分子，通过调控Th17细胞分化和病原性基因表达，影响Th17细胞在自身免疫疾病中的作用 | 首次揭示PROCR作为Th17细胞的负调控因子，通过调控Th17细胞分化和病原性基因表达，影响Th17细胞在自身免疫疾病中的作用 | NA | 探讨蛋白C受体（PROCR）在Th17细胞分化和病原性中的作用 | Th17细胞及其在自身免疫疾病中的作用 | NA | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 病原性与非病原性Th17细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31707 | 2024-08-09 |
RNA Sequencing of Single Human Islet Cells Reveals Type 2 Diabetes Genes
2016-10-11, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2016.08.018
PMID:27667665
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了1,492个人类胰腺α、β、δ和PP细胞的转录组，以揭示2型糖尿病相关的基因 | 本研究发现的245个在2型糖尿病中表达失调的基因中，92%的基因此前未与胰岛细胞功能或生长相关联 | NA | 揭示2型糖尿病相关的基因 | 人类胰腺α、β、δ和PP细胞 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 1,492个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31708 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals dynamic changes in A-to-I RNA editome during early human embryogenesis
2016-Sep-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-016-3115-2
PMID:27687780
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了人类早期胚胎发育过程中A-to-I RNA编辑组的动力学变化 | 首次揭示了人类早期胚胎发育中A-to-I RNA编辑活动的动态变化及其阶段特异性 | NA | 探究人类早期胚胎发育过程中A-to-I RNA编辑活动的变化 | 人类早期胚胎从卵母细胞到桑葚胚阶段的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 68个单细胞，来自29个人类胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 31709 | 2024-08-09 |
Single-cell SNP analyses and interpretations based on RNA-Seq data for colon cancer research
2016-Sep-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep34420
PMID:27677461
|
研究论文 | 本研究利用单细胞和批量结肠癌样本的RNA-Seq数据进行单细胞SNP分析，并探讨了与结肠癌相关通路的SNP富集模式及基因表达 | 本研究不仅重现了批量样本的SNP分析结果，还检测了细胞间和细胞与批量样本间的变异，有助于早期诊断和识别单细胞水平上癌症的确切机制 | 由于获取、扩增和分析单细胞遗传材料的困难，单细胞多样性评估如单核苷酸多态性（SNP）分析仍存在障碍 | 探索单细胞水平上的SNP分析在结肠癌研究中的应用 | 结肠癌样本的单细胞和批量RNA-Seq数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA-Seq | NA | RNA-Seq数据 | 单细胞和批量结肠癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31710 | 2024-08-09 |
Identifying and removing the cell-cycle effect from single-cell RNA-Sequencing data
2016-Sep-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep33892
PMID:27670849
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ccRemover的新方法，用于识别并去除单细胞RNA测序数据中的细胞周期效应 | ccRemover方法能够可靠地识别细胞周期效应并将其去除，同时保留数据中其他感兴趣的生物信号 | NA | 开发一种有效的方法来去除单细胞RNA测序数据中的细胞周期效应，以提高下游分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞周期效应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用模拟数据和三个真实的单细胞RNA测序数据集进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 31711 | 2024-08-09 |
The Homeobox Transcription Factor RHOX10 Drives Mouse Spermatogonial Stem Cell Establishment
2016-09-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2016.08.090
PMID:27681428
|
研究论文 | 本文报道了转录因子RHOX10在鼠精子干细胞（SSCs）初始建立中的关键作用 | 首次识别出X连锁同源异型盒基因Rhox10在SSCs初始生成中的作用，揭示了X连锁基因簇进化的意义及影响成体干细胞生成的调控机制 | NA | 探究成体干细胞的发育起源，特别是精子干细胞的初始建立 | 鼠精子干细胞（SSCs）及转录因子RHOX10的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括Rhox10在内的33个基因的X连锁同源异型盒基因簇的条件性缺失实验 | NA | NA | NA | NA |
| 31712 | 2024-08-09 |
MERVL/Zscan4 Network Activation Results in Transient Genome-wide DNA Demethylation of mESCs
2016-09-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2016.08.087
PMID:27681430
|
研究论文 | 本文研究了小鼠胚胎干细胞中MERVL/Zscan4网络激活导致的短暂全基因组DNA去甲基化现象 | 首次详细描述了MERVL/Zscan4状态下的单细胞转录组动态变化及其对全基因组DNA甲基化和染色质可及性的影响 | NA | 探讨MERVL/Zscan4网络激活对小鼠胚胎干细胞全基因组DNA甲基化的影响 | 小鼠胚胎干细胞中的MERVL/Zscan4网络及其对DNA甲基化的影响 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31713 | 2024-08-09 |
Differences and similarities between human and chimpanzee neural progenitors during cerebral cortex development
2016-09-26, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.18683
PMID:27669147
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研究论文 | 本文通过分析人类和黑猩猩的脑类器官，使用免疫荧光组织化学、活体成像和单细胞转录组学方法，探讨了大脑皮层发育过程中神经前体细胞的差异和相似性。 | 发现人类和黑猩猩的细胞类型组成和神经发生基因表达程序非常相似，但在活体成像中观察到人类顶端前体细胞有丝分裂前期-中期的延长。 | NA | 研究人类和黑猩猩大脑皮层发育过程中神经前体细胞的差异和相似性。 | 人类和黑猩猩的神经前体细胞。 | 神经科学 | NA | 免疫荧光组织化学、活体成像、单细胞转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 人类和黑猩猩的脑类器官样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31714 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Lineage and X Chromosome Dynamics in Human Preimplantation Embryos
2016-Sep-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2016.08.009
PMID:27662094
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31715 | 2024-08-09 |
Attention to Detail by Single-cell Sequencing
2017-01, European urology
IF:25.3Q1
DOI:10.1016/j.eururo.2016.09.005
PMID:27633437
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31716 | 2024-08-09 |
Transcriptome sequencing of HER2-positive breast cancer stem cells identifies potential prognostic marker
2016-Nov, Tumour biology : the journal of the International Society for Oncodevelopmental Biology and Medicine
DOI:10.1007/s13277-016-5351-0
PMID:27629143
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术对HER2阳性乳腺癌干细胞进行转录组测序，并鉴定出潜在的预后标志物CA12 | 首次对HER2阳性乳腺癌干细胞进行单细胞转录组测序，并发现新的预后标志物CA12 | 研究样本仅来自两名HER2阳性患者，可能影响结果的普遍性 | 发现新的乳腺癌干细胞标志物，并探索其作为治疗靶点和预后标志物的潜力 | HER2阳性乳腺癌干细胞及其转录组特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 两名HER2阳性患者的乳腺癌组织及其邻近正常乳腺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 31717 | 2024-08-09 |
High-throughput single-cell gene-expression profiling with multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization
2016-09-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1612826113
PMID:27625426
|
研究论文 | 本文报道了通过改进多重错误鲁棒荧光原位杂交（MERFISH）技术，大幅提高单细胞基因表达分析的通量 | 通过使用化学切割代替光漂白去除荧光信号、扩大成像视野和采用多色成像等方法，将MERFISH的通量提高了两个数量级 | NA | 提高基于图像的单细胞转录组学方法的通量 | 人类细胞的RNA表达 | 数字病理学 | NA | 多重错误鲁棒荧光原位杂交（MERFISH） | NA | 图像 | 超过100,000个人类细胞，单次测量最多可达40,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31718 | 2024-08-09 |
nbCNV: a multi-constrained optimization model for discovering copy number variants in single-cell sequencing data
2016-Sep-17, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-016-1239-7
PMID:27639558
|
研究论文 | 本文开发了一种基于读取深度的方法nbCNV，用于检测单细胞测序数据中的拷贝数变异 | nbCNV方法利用稀疏性和平滑性两个约束条件，假设读取信号呈负二项分布，将CNV检测问题转化为二次优化问题，并通过基于经典交替方向最小化方法的有效数值解决方案来解决 | NA | 开发一种新的方法来检测单细胞测序数据中的拷贝数变异 | 单细胞测序数据中的拷贝数变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 二次优化模型 | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31719 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptome and epigenomic reprogramming of cardiomyocyte-derived cardiac progenitor cells
2016-09-13, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/sdata.2016.79
PMID:27622691
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研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组和全基因组DNA甲基化分析数据，研究了心肌细胞衍生的心脏前体细胞（mCPCs）的表观基因组重编程机制 | 首次详细描述了mCPCs的表观基因组重编程过程，并展示了其与转录组变化的相关性 | NA | 理解心肌细胞表观基因组重编程机制，为未来临床治疗设计提供基础 | 心肌细胞衍生的心脏前体细胞（mCPCs）的表观基因组和转录组变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析，全基因组DNA甲基化分析 | NA | 转录组数据，甲基化数据 | 小鼠mCPCs样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31720 | 2024-08-09 |
L1-associated genomic regions are deleted in somatic cells of the healthy human brain
2016-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/nn.4388
PMID:27618310
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研究论文 | 本研究使用基于机器学习的单细胞测序方法，发现健康人脑体细胞中L1相关变异（SLAVs）包括L1逆转录转座插入和非逆转录转座依赖的L1相关变异，并证明部分SLAVs是由L1内切酶切割活性产生的体细胞缺失 | 首次揭示了L1相关基因组区域在健康人脑体细胞中的缺失现象，并发现这些区域是体细胞拷贝数变异的热点，对体细胞嵌合现象有遗传贡献 | NA | 探究健康人脑中L1相关变异的类型及其对体细胞嵌合现象的影响 | 健康人脑体细胞中的L1相关变异 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | 机器学习 | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |