单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 32005 篇文献，本页显示第 31681 - 31700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 31681 | 2024-08-09 |
Reply from Authors re: Xue-Ru Wu. Attention to Detail by Single-cell sequencing. Eur Urol 2017;71:13-4
2017-01, European urology
IF:25.3Q1
DOI:10.1016/j.eururo.2016.11.003
PMID:27842721
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31682 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing for Drug Discovery and Drug Development
2017, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在药物发现和药物开发中的应用现状 | 单细胞测序技术提供了更强大和精确的方法来分析药物对处理过的细胞和组织的影响 | NA | 探讨单细胞测序技术在药物发现和药物开发中的潜在应用 | 单细胞全基因组/外显子测序、单细胞转录组测序、单细胞亚硫酸氢盐测序等 | 基因组学 | NA | NGS（下一代测序技术） | NA | 基因组、表观基因组和转录组数据 | 单细胞级别 | NA | NA | NA | NA |
| 31683 | 2024-08-09 |
Genome evolution in ductal carcinoma in situ: invasion of the clones
2017-Jan, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.4840
PMID:27861897
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综述 | 本文综述了导管原位癌（DCIS）向浸润性导管癌（IDC）进展过程中肿瘤内异质性的作用及其在诊断和治疗中的相关性 | 讨论了新兴技术如单细胞测序、STAR-FISH和成像质谱技术在理解DCIS演化中的潜在应用 | NA | 探讨DCIS向IDC进展的分子和基因组基础 | 导管原位癌（DCIS）及其向浸润性导管癌（IDC）的进展 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31684 | 2024-08-09 |
Pinpointing Cancer Stem Cells in Oligodendroglioma
2017-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-NB2016-149
PMID:27864226
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究低级别少突胶质瘤，识别出具有神经干细胞和祖细胞基因表达特征的细胞群体 | 首次通过单细胞RNA测序技术在低级别少突胶质瘤中识别出具有神经干细胞特征的癌症干细胞 | NA | 识别并研究少突胶质瘤中的癌症干细胞 | 低级别少突胶质瘤中的单个细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 31685 | 2024-08-09 |
Single-cell isolation by a modular single-cell pipette for RNA-sequencing
2016-11-29, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/c6lc01241h
PMID:27841430
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research paper | 本文报道了一种模块化单细胞移液管（mSCP），由SCP-Tip、空气置换移液管（ADP）和ADP-Tips三个模块化组件组成，可快速、方便且可靠地从细胞悬液中分离单个活细胞，并适用于单细胞转录组测序。 | mSCP通过组装含有流体动力陷阱的SCP-Tip，能够从每微升5-10个细胞的悬液中分离单细胞，并实现100%的单细胞分离效率。 | NA | 开发一种方便、快速且高效的单细胞分离方法，以满足单细胞转录组测序的需求。 | 单细胞分离技术及其在单细胞转录组测序中的应用。 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | text | 每微升5-10个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31686 | 2024-08-09 |
An automated approach to prepare tissue-derived spatially barcoded RNA-sequencing libraries
2016-11-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep37137
PMID:27849009
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研究论文 | 本文介绍了一种在机器人工作站上运行的保留转录本空间信息的自动化方法 | 该方法通过减少技术变异性和提高吞吐量，实现了比标准协议更高的效率 | NA | 开发一种稳健、可扩展且自动化的文库制备协议，以保留或推断空间上下文 | 牙龈组织活检样本的RNA序列 | 数字病理学 | 牙周病 | RNA测序 | NA | RNA | 六个牙龈组织活检样本的重复切片 | NA | NA | NA | NA |
| 31687 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing of the small-RNA transcriptome
2016-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.3701
PMID:27798564
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研究论文 | 本文介绍了一种单细胞水平的小RNA转录组测序方法，并应用于人类胚胎干细胞和癌细胞中，分析了microRNA及tRNA和snoRNA片段，揭示了microRNA作为不同细胞类型和状态标记的潜力 | 首次开发了一种单细胞水平的小RNA转录组测序方法 | NA | 研究小RNA表达的异质性及其在不同细胞类型和状态中的作用 | 人类胚胎干细胞和癌细胞中的小RNA | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | RNA | 多种人类胚胎干细胞和癌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31688 | 2024-08-09 |
Laminin-guided highly efficient endothelial commitment from human pluripotent stem cells
2016-11-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep35680
PMID:27804979
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研究论文 | 本文研究了从人多能干细胞（hPSCs）通过定向分化获得高度纯化的内皮祖细胞（PSC-EPCs）的方法，特别关注了细胞外基质（ECM）在分化过程中的作用。 | 使用短片段的层粘连蛋白411（LM411-E8）作为ECM，成功引导hPSCs高效分化为纯度超过95%的PSC-EPCs，无需细胞分选，并通过单细胞RNA测序分析揭示了其对细胞转录异质性的解决作用。 | NA | 探索和优化从hPSCs定向分化为内皮细胞的条件，特别是ECM的作用。 | 人多能干细胞（hPSCs）及其定向分化为内皮祖细胞（PSC-EPCs）的过程。 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31689 | 2024-08-09 |
Embryo genome profiling by single-cell sequencing for successful preimplantation genetic diagnosis in a family harboring COL4A1 c.1537G>A; p.G513S mutation
2016 Jul-Sep, Journal of human reproductive sciences
DOI:10.4103/0974-1208.192072
PMID:27803589
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术对携带COL4A1基因c.1537G>A; p.G513S突变家庭的胚胎进行基因组分析，实现了成功的植入前遗传诊断 | 这是印度首次报道通过IVF程序使用单细胞测序技术避免潜在致病性COL4A1等位基因，成功诞生正常儿童 | NA | 筛查不携带COL4A1基因c.1537G>A; p.G513S突变的胚胎，以避免选择性妊娠终止 | 12个胚胎的滋养层活检样本 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | DNA | 12个胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 31690 | 2024-08-09 |
De Novo MS/MS Sequencing of Native Human Antibodies
2017-01-06, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.6b00608
PMID:27779884
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研究论文 | 本研究展示了一种新的MS/MS抗体发现方法，该方法仅需要血清抗体，无需基因材料测序 | 首次证明了仅通过MS/MS技术直接从血清中纯化和测序抗体的可行性 | NA | 探索一种新的抗体发现方法，以简化从感染个体中获取治疗性单克隆抗体的过程 | 来自巨细胞病毒暴露个体的血清多克隆抗体 | 生物技术 | NA | MS/MS | NA | 血清 | 单个巨细胞病毒暴露个体 | NA | NA | NA | NA |
| 31691 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of Human T Cells
2017, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-6548-9_16
PMID:27787803
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研究论文 | 本文描述了一种生成人类血液CD4和CD8 T细胞单细胞转录组文库的协议，并介绍了处理由此产生的序列数据以进行进一步计算分析的基本生物信息学步骤 | 本文采用单细胞RNA测序技术，通过转录组分析无假设地评估细胞状态和亚群，这种方法在研究T细胞时尤为重要，因为它可以识别传统表型标准无法区分的不同T细胞亚型和过渡状态 | NA | 研究人类T细胞如何利用细胞异质性、可塑性和多样性在动态过程中（如发育、分化和抗原反应）实现广泛的功能灵活性 | 人类血液中的CD4和CD8 T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 31692 | 2024-08-09 |
Cells Respond to Distinct Nanoparticle Properties with Multiple Strategies As Revealed by Single-Cell RNA-Seq
2016-11-22, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6b05452
PMID:27788331
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了不同纳米颗粒（NP）属性对肺泡上皮细胞反应的影响 | 首次采用单细胞RNA测序技术研究不同负荷的纳米颗粒对细胞反应的独特影响 | 研究仅限于特定的纳米颗粒类型和细胞类型 | 揭示纳米颗粒属性对细胞反应和人类健康的具体影响 | 肺泡上皮细胞与不同负荷的氨基化或羧基化量子点（QDs） | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 特定负荷的肺泡上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31693 | 2024-08-09 |
Single Cell Total RNA Sequencing through Isothermal Amplification in Picoliter-Droplet Emulsion
2016-11-15, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.6b02581
PMID:27783484
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研究论文 | 本文开发了一种名为“easier-seq”的新型RNA扩增方法，用于从单个细胞中逆转录和扩增总RNA，包括有和没有多聚腺苷酸尾的RNA，以实现高效率、可重复性和准确性的转录组测序。 | 该方法通过在油中将逆转录的cDNA分子分配到1.5 × 10的65-pL反应器中，使用随机引物在每个反应器中进行等温扩增，大大简化了单细胞RNA测序的实验步骤，并减少了引入错误的机会。 | NA | 开发一种新的RNA扩增方法，以提高单细胞RNA测序的效率和质量。 | 单个细胞中的总RNA，包括有和没有多聚腺苷酸尾的RNA。 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31694 | 2024-08-09 |
A statistical approach for identifying differential distributions in single-cell RNA-seq experiments
2016-10-25, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-016-1077-y
PMID:27782827
|
研究论文 | 本文提出了一种新的统计方法，用于在存在不同表达状态的情况下，表征生物条件内和之间的表达差异 | 该方法能够检测到比均值偏移更复杂的基因表达分布的细微差异，并能表征这些差异 | NA | 旨在量化细胞异质性，并表征在不同生物条件下的表达差异 | 单细胞RNA测序实验中的基因表达差异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计方法 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31695 | 2024-08-09 |
Massive and parallel expression profiling using microarrayed single-cell sequencing
2016-10-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/ncomms13182
PMID:27739429
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MASC-seq的新技术，该技术通过微阵列基础的条形码技术实现单细胞表达模式的并行大规模分析 | MASC-seq技术能够在低成本（0.13美元/细胞）下实现高吞吐量和稳健性的单细胞分析，比商业系统成本低两个数量级 | NA | 加速对微妙克隆动态的研究，并提供对疾病发展和其它生物过程的关键见解 | 单细胞转录组 | NA | NA | 微阵列技术 | NA | 转录组数据 | 每天可分析数千个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31696 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of Human Pancreatic Islets-New Kids on the Block
2016-10-11, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2016.09.012
PMID:27732832
|
研究论文 | 本文报道了从非糖尿病和2型糖尿病供体中分离出的单个胰腺细胞的转录组 | 首次对人类胰腺胰岛的单细胞进行RNA测序，提供了对胰岛转录组的深入了解 | NA | 探索人类胰腺胰岛中单个细胞的转录组 | 非糖尿病和2型糖尿病供体的胰腺细胞 | 基因组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 31697 | 2024-08-09 |
Dynamic ASXL1 Exon Skipping and Alternative Circular Splicing in Single Human Cells
2016, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0164085
PMID:27736885
|
研究论文 | 本研究通过靶向删除、高分辨率剪接检测和单细胞测序技术，深入探究了ASXL1环状剪接的机制 | 发现环状剪接的有效性依赖于典型的转录起始位点和倒置的AluSx元件，并揭示了环状和线性ASXL1异构体在单细胞中的偏好表达 | NA | 探究环状RNA的生成机制及其在细胞生物学中的作用 | ASXL1环状剪接及其异构体 | 分子生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | RNA序列 | 单个人类细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31698 | 2024-08-09 |
Predicting the functional states of human iPSC-derived neurons with single-cell RNA-seq and electrophysiology
2016-11, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/mp.2016.158
PMID:27698428
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和电生理学技术，预测人诱导多能干细胞衍生的神经元的功能状态 | 本文提出了一种多模态机器学习策略，用于识别预测单个神经元生理状态的新分子特征，无需考虑其在体外培养的时间 | 尽管电生理学是功能评估的金标准，但它通常缺乏疾病模型研究所需的扩展性 | 定义分化神经元的电生理功能状态的连续体，并探索其在体外脑疾病研究中的应用 | 人诱导多能干细胞衍生的神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，电生理学 | 机器学习 | 基因表达数据，电生理数据 | 单个人神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 31699 | 2024-08-09 |
Je, a versatile suite to handle multiplexed NGS libraries with unique molecular identifiers
2016-Oct-08, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-016-1284-2
PMID:27717304
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研究论文 | 本文介绍了Je工具套件，用于处理带有唯一分子标识符（UMI）的多种NGS文库，支持复杂的条码策略，提取UMI并过滤考虑UMI的读取重复 | Je工具套件能够处理复杂的条码配置，提取UMI并过滤读取重复，这在现有工具中是不支持的 | NA | 开发一个能够处理复杂条码策略的工具套件，以提高NGS数据分析的准确性 | 带有UMI的多种NGS文库 | 生物信息学 | NA | NGS | NA | 序列数据 | 使用公开可用的scRNA-seq和iCLIP数据进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 31700 | 2024-08-09 |
Out of Many, One: Computational Reconstruction of Mouse Skin using Single-Cell Transcriptomics
2016-10-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2016.09.009
PMID:27716520
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学技术对小鼠皮肤进行计算重建 | 揭示了不同皮肤区域转录程序的空间和伪时间差异，以及皮肤干细胞群体中的共同基础程序 | NA | 全面重建哺乳动物皮肤的复杂性 | 小鼠皮肤及其干细胞群体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |