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当前共找到 32005 篇文献，本页显示第 31661 - 31680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 31661 | 2024-08-09 |
Quantitative approaches for investigating the spatial context of gene expression
2017-03, Wiley interdisciplinary reviews. Systems biology and medicine
DOI:10.1002/wsbm.1369
PMID:28001340
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研究论文 | 本文探讨了现代原位和单细胞遗传方法的基本原理，量化影响细胞决策的内在和外在力量的挑战，以及制作基因调控、形态和功能可视化图谱的技术要求 | 介绍了荧光原位测序（FISSEQ）等原位测序技术，尝试直接在显微镜图像中可视化遗传特征 | 量化影响细胞决策的内在和外在力量存在技术障碍 | 研究生长、发育和癌症进展过程中调控序列的功能进化 | 基因表达的空间信息及其在发育中的转录调控 | NA | NA | 荧光原位测序（FISSEQ）、单细胞RNA测序结合荧光原位杂交（FISH） | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31662 | 2024-08-09 |
Falco: a quick and flexible single-cell RNA-seq processing framework on the cloud
2017-03-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btw732
PMID:28025200
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研究论文 | 介绍了一种基于云的单细胞RNA测序处理框架Falco，利用Apache Hadoop和Apache Spark技术实现大规模并行分析 | Falco框架能够使现有的RNA测序处理流程并行化，处理速度比在高度优化的独立计算机上运行快2.6至145.4倍，并能利用亚马逊网络服务的低成本现货实例降低分析成本约65% | NA | 开发一种快速且灵活的单细胞RNA测序处理框架 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两个公开的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 31663 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptomics reveals unanticipated features of early hematopoietic precursors
2017-02-17, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkw1214
PMID:28003475
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了小鼠造血干细胞及其后代MPP1细胞在不同细胞周期阶段的分子特征 | 揭示了早期造血前体细胞的意外特征，并发现贫血诱导下细胞周期进展对前体细胞谱系特异性基因表达的影响 | NA | 探究干细胞分化过程中的分子变化 | 小鼠造血干细胞及其后代MPP1细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 多个小鼠造血干细胞及其后代MPP1细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31664 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptomic profiling of mouse pancreatic progenitors
2017-02-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了胚胎期13.5天的小鼠胰腺，并结合成熟胰腺的单细胞数据，识别了新的胰腺前体细胞标记基因和潜在的α细胞前体。 | 首次使用单细胞RNA测序技术在胚胎期13.5天的小鼠胰腺中识别出新的胰腺前体细胞标记基因和潜在的α细胞前体，并发现了SLC38A5作为早期α细胞系分化的标记基因。 | 研究仅限于胚胎期13.5天的小鼠胰腺，未涉及其他发育阶段或物种。 | 识别早期发育组织中的特征基因，特别是胰腺前体细胞和α细胞前体。 | 小鼠胚胎期13.5天的胰腺组织。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 胚胎期13.5天的小鼠胰腺细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31665 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis of differences in transcriptomic profiles of oocytes and cumulus cells at GV, MI, MII stages from PCOS patients
2016-12-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep39638
PMID:28004769
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研究论文 | 本文比较了多囊卵巢综合征（PCOS）患者与非PCOS患者的卵母细胞和卵丘细胞在GV、MI、MII阶段的转录组差异，并评估了辅助生殖技术（ARTs）对PCOS患者的治疗效果 | 通过单细胞RNA测序技术，首次详细分析了PCOS患者卵母细胞和卵丘细胞在不同成熟阶段的转录组差异，并探讨了这些差异基因在PCOS发病机制中的潜在作用 | 研究样本量较小，且仅限于特定阶段的卵母细胞和卵丘细胞，可能无法全面反映PCOS的复杂性 | 比较PCOS患者与非PCOS患者的卵母细胞和卵丘细胞的转录组差异，并评估ARTs的治疗效果 | PCOS患者和非PCOS患者的卵母细胞及卵丘细胞 | NA | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 16名PCOS患者和非PCOS患者 | NA | NA | NA | NA |
| 31666 | 2024-08-09 |
acdc - Automated Contamination Detection and Confidence estimation for single-cell genome data
2016-Dec-20, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-016-1397-7
PMID:27998267
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研究论文 | 本文介绍了一种名为acdc的工具，用于自动检测和评估单细胞基因组数据中的污染 | acdc工具结合了监督和非监督方法，能够可靠地检测已知和新出现的污染物，并提供了无参考的检测方法 | NA | 开发一种新的工具，用于提高单细胞基因组数据质量控制过程中的污染检测效率 | 单细胞基因组数据中的污染检测 | 生物信息学 | NA | 16S rRNA基因预测、超快速精确比对技术、机器学习技术 | 机器学习模型 | 基因组数据 | 大量来自不同测序项目的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31667 | 2024-08-09 |
Dissecting Immune Circuits by Linking CRISPR-Pooled Screens with Single-Cell RNA-Seq
2016-Dec-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2016.11.039
PMID:27984734
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CRISP-seq的集成方法，结合单细胞RNA测序和CRISPR池筛选技术，用于解析多细胞生物中的免疫调节电路 | CRISP-seq方法能够在同一细胞中同时分析基因组扰动和转录组，从而揭示多个因子及其相互作用的功能 | NA | 探索多细胞生物中免疫调节电路的功能和相互作用 | 先天免疫调节电路中的发育和信号依赖因子 | 基因编辑 | NA | CRISPR-Pooled Screens, 单细胞RNA-seq | NA | RNA | 数万个体外和鼠类扰动细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31668 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing identifies diverse roles of epithelial cells in idiopathic pulmonary fibrosis
2016-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.90558
PMID:27942595
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了特发性肺纤维化（IPF）中的上皮细胞类型及其在疾病发病机制中的生物学过程 | 研究首次识别了IPF中三种不同的上皮细胞亚型，并揭示了这些细胞在病理过程中的作用 | 研究主要集中在细胞水平，未涉及更广泛的组织或器官层面的分析 | 探索特发性肺纤维化中上皮细胞的多样性和其在疾病发展中的作用 | 特发性肺纤维化中的上皮细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及正常人肺上皮细胞和IPF细胞的单细胞RNA测序分析 | NA | NA | NA | NA |
| 31669 | 2024-08-09 |
Mapping heterogeneity in patient-derived melanoma cultures by single-cell RNA-seq
2017-Jan-03, Oncotarget
DOI:10.18632/oncotarget.13666
PMID:27903987
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了来自三位不同患者的黑色素瘤转移样本的细胞异质性 | 首次应用单细胞RNA测序技术分析黑色素瘤患者来源培养物的细胞异质性，并发现与患者生存相关的基因表达模块 | 研究仅限于短期培养的黑色素瘤细胞，可能无法完全反映肿瘤的长期动态 | 探索黑色素瘤细胞的异质性及其对患者生存的影响，并寻找新的治疗靶点 | 来自三位不同患者的黑色素瘤转移样本的单细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 自组织映射 | 基因表达数据 | 307个单细胞，来自三位患者的三个活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31670 | 2024-08-09 |
Single-cell barcoding and sequencing using droplet microfluidics
2017-Jan, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/nprot.2016.154
PMID:27929523
|
research paper | 本文介绍了一种名为inDrops的方法，利用液滴微流控技术进行单细胞RNA测序，能够高效地捕获和处理数千个单个细胞进行全转录组或基因组分析。 | inDrops方法能够在短时间内索引超过15,000个细胞，并且能够捕获和分析高达75%的细胞，即使在非常小的样本中也能进行大规模的细胞分析。 | NA | 开发一种高效、可扩展的单细胞RNA测序方法，用于捕获和分析细胞的多样性。 | 单个细胞的RNA测序。 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | text | 数千至数万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31671 | 2024-08-09 |
High-performance multiplexed fluorescence in situ hybridization in culture and tissue with matrix imprinting and clearing
2016-12-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1617699113
PMID:27911841
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研究论文 | 本文开发了一种用于FISH测量的样本清除方法，通过嵌入样本于聚丙烯酰胺中，固定RNA并清除细胞蛋白和脂质，以减少非特异性探针结合和细胞自发荧光，从而提高检测效率和灵敏度 | 提出了通过矩阵印迹和清除技术来减少FISH探针的非特异性结合和细胞自发荧光，从而提高多重荧光原位杂交技术的性能 | NA | 旨在提高多重荧光原位杂交技术在细胞培养和组织样本中的性能 | 研究对象包括FISH探针的非特异性结合、细胞自发荧光以及RNA的检测 | 数字病理学 | NA | 多重荧光原位杂交（FISH） | NA | 图像 | 在清除样本中测量了130种RNA物种的拷贝数，并使用矩阵印迹和清除方法对小鼠大脑复杂组织样本进行了MERFISH测量 | NA | NA | NA | NA |
| 31672 | 2024-08-09 |
Macrophage Colony Stimulating Factor Derived from CD4+ T Cells Contributes to Control of a Blood-Borne Infection
2016-Dec, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1006046
PMID:27923070
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研究论文 | 本文研究了CD4+ T细胞分泌的巨噬细胞集落刺激因子（MCSF）在控制血液传播感染中的作用 | 首次揭示了CD4+ T细胞作为体内生理相关的MCSF来源，并阐明了T辅助细胞通过调节髓系细胞限制血液传播的细胞内病原体生长的机制 | NA | 探讨CD4+ T细胞和MCSF在控制血液传播感染中的作用 | CD4+ T细胞、MCSF、髓系细胞和血液传播的病原体 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及感染P. chabaudi的CD4+ T细胞和髓系细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 31673 | 2024-08-09 |
Neurogenic Radial Glia-like Cells in Meninges Migrate and Differentiate into Functionally Integrated Neurons in the Neonatal Cortex
2017-03-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2016.10.020
PMID:27889318
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研究论文 | 本文报道了围产期小鼠脑膜中含有在胚胎发育期间形成的一群神经发生性前体细胞，这些细胞迁移到尾侧皮质并分化为皮质II-IV层的Satb2神经元 | 首次发现脑膜中的胚胎来源的放射状胶质样细胞能在新生期的大脑皮质中迁移并分化为功能性神经元 | NA | 探讨出生后大脑皮质是否会增加新的神经元 | 围产期小鼠的脑膜和新生期大脑皮质中的神经发生性前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 围产期小鼠的脑膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31674 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals lincRNA expression differences in Hela-S3 cells
2017-Mar, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-016-2260-7
PMID:27878653
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析Hela-S3细胞中的长链非编码RNA（lincRNA）表达差异 | 首次在单细胞水平上揭示了Hela-S3细胞中lincRNA的表达特异性及其在细胞功能网络中的作用 | NA | 研究宫颈癌发展中lincRNA的功能验证和临床应用 | Hela-S3细胞中的lincRNA | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 37个Hela-S3细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31675 | 2024-08-09 |
Cancer genomics: Single-cell RNA-seq to decipher tumour architecture
2017-01, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg.2016.151
PMID:27890926
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31676 | 2024-08-09 |
TRACING CO-REGULATORY NETWORK DYNAMICS IN NOISY, SINGLE-CELL TRANSCRIPTOME TRAJECTORIES
2017, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
DOI:10.1142/9789813207813_0053
PMID:27897008
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SCIMITAR的框架，用于从静态单细胞转录组数据中推断进展轨迹及其相关调控 | SCIMITAR通过在高维曲线中采用高斯混合的连续参数化，从数据中生成丰富的模型，突出与推断进展相关的基因表达和共表达模式 | NA | 探索复杂生物过程如分化和肿瘤发生的分子基础 | 单细胞转录组数据中的基因调控网络重构 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | 高斯混合模型 | 转录组数据 | 单细胞人类胎儿神经元数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 31677 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing maps gene expression to mutational phylogenies in PDGF- and EGF-driven gliomas
2016-Nov-25, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20166969
PMID:27888226
|
研究论文 | 本文通过单细胞测序技术，将基因表达与突变系统发育联系起来，研究了PDGF和EGF驱动的胶质瘤 | 开发了一种新方法，将单细胞表达谱映射到从外显子测序中识别的顺序获得的突变上 | NA | 评估克隆异质性对基因表达的影响 | PDGF和EGF驱动的胶质瘤 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 288个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31678 | 2024-08-09 |
Measuring intratumor heterogeneity by network entropy using RNA-seq data
2016-11-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep37767
PMID:27883053
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研究论文 | 本文利用RNA测序数据，通过生物网络状态测量肿瘤内异质性（ITH）水平 | 提出了一种基于熵的距离度量nJSD，用于测量两个网络之间的ITH，并在多个数据集上验证了其有效性 | NA | 研究肿瘤内异质性的测量方法及其在临床应用中的重要性 | 肿瘤样本的RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 分析了TCGA泛癌6,320名患者的数据，并使用了人类癌细胞系和单细胞测序数据进行验证 | NA | NA | NA | NA |
| 31679 | 2024-08-09 |
p53 Regulates Progenitor Cell Quiescence and Differentiation in the Airway
2016-11-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2016.11.007
PMID:27880895
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研究论文 | 本文研究了肿瘤抑制因子p53在气道上皮祖细胞的增殖和分化中的调控作用 | 首次证明了p53在气道上皮祖细胞的静止和分化中的关键作用，并揭示了p53水平对祖细胞行为的紧密调控 | NA | 探究p53在气道上皮祖细胞静止和分化中的调控机制 | 气道上皮祖细胞的增殖和分化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31680 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomes identify human islet cell signatures and reveal cell-type-specific expression changes in type 2 diabetes
2017-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.212720.116
PMID:27864352
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组分析，揭示了人类胰岛细胞的特征以及2型糖尿病中细胞类型特异性的表达变化 | 首次报道了来自非糖尿病和2型糖尿病人类胰岛样本的638个细胞的单细胞转录组，并识别了delta和PP/gamma细胞类型中与胰岛功能障碍和糖尿病相关的基因 | 研究主要集中在胰岛细胞的转录组分析，未涉及细胞功能的具体实验验证 | 识别胰腺胰岛功能障碍的基本细胞类型特异性特征，并提供理解胰岛生物学和糖尿病发病机制的关键资源 | 人类胰岛细胞及其在2型糖尿病中的表达变化 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 638个细胞 | NA | NA | NA | NA |