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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3141 | 2026-02-20 |
Macrophage Hypoxia Signaling Pathways and Their Roles in Sepsis
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S562619
PMID:41709969
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综述 | 本文综述了巨噬细胞缺氧信号通路(特别是HIF-1α)在脓毒症中的作用机制及潜在治疗策略 | 结合最新的单细胞转录组学数据和分子机制研究,系统性地探索了脓毒症的潜在治疗靶点和干预策略 | 关于缺氧信号通路影响巨噬细胞功能及疾病进展的具体机制和临床意义仍有许多未解之谜 | 总结缺氧相关信号通路对巨噬细胞功能及脓毒症病理过程的影响,为脓毒症精准治疗提供理论基础和研究方向 | 巨噬细胞 | 自然语言处理 | 脓毒症 | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3142 | 2026-02-20 |
The interaction between dendritic cells and T follicular helper cells drives inflammatory bowel disease: a review
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1725349
PMID:41710888
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综述 | 本文综述了树突状细胞与滤泡辅助性T细胞之间的双向相互作用在炎症性肠病发病机制中的核心作用 | 提出了DC-TFH细胞相互作用形成的自放大炎症回路是IBD发病的关键,并系统阐述了其分子机制及在不同疾病亚型中的特异性 | 该轴在疾病起始阶段的时间作用、与其他免疫通路的串扰以及从动物模型到人类疾病的转化仍存在挑战 | 阐明炎症性肠病的免疫发病机制,并探讨针对DC-TFH相互作用轴的治疗策略 | 树突状细胞、滤泡辅助性T细胞及其在肠道炎症微环境中的相互作用 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3143 | 2026-02-20 |
Integrative bulk and single-cell transcriptomics link EZH2 to immunosuppressive programs and tumor-Treg crosstalk in castration-resistant prostate cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1725097
PMID:41710887
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,系统描绘了EZH2在去势抵抗性前列腺癌中与免疫抑制程序及肿瘤-Treg细胞互作的关联 | 首次在晚期前列腺癌中系统整合bulk和单细胞转录组数据,揭示EZH2高表达与恶性细胞增殖状态、免疫抑制微环境及肿瘤-Treg细胞互作增强的关联,并通过EZH2抑制剂实验验证了其对相关转录程序的调控作用 | 研究主要基于转录组数据分析,功能性和因果机制尚需进一步实验验证,且样本队列可能受限于现有公共数据集 | 探究EZH2在去势抵抗性前列腺癌中的免疫调控作用及其与肿瘤微环境的相互作用 | 前列腺癌患者样本(包括TCGA-PRAD队列、转移性CRPC队列)及C42细胞系 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR | NMF, 惩罚Cox模型, CellPhoneDB | 转录组数据 | 多个bulk队列(TCGA-PRAD和独立转移性CRPC队列)及单细胞队列(GSE264573和独立CRPC队列),具体样本数未明确 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3144 | 2026-02-20 |
m6A demethylase-driven reprogramming of leukemia-associated macrophages predicts improved outcomes in acute myeloid leukemia
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1739959
PMID:41710900
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,揭示了m6A修饰调控因子在急性髓系白血病(AML)相关巨噬细胞重编程中的作用及其与患者预后的关联 | 首次在单细胞水平系统性地描绘了AML中巨噬细胞的m6A调控图谱,并阐明了不同m6A调控因子(写入器、擦除器、读取器)对巨噬细胞命运和功能极化的特异性影响,将m6A系统与肿瘤免疫微环境及临床预后联系起来 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证m6A调控因子的具体作用机制;样本量虽整合了多个队列,但异质性可能影响结论的普适性 | 探究m6A修饰调控因子在AML肿瘤免疫微环境中对巨噬细胞重编程的影响及其临床意义 | 急性髓系白血病(AML)患者的巨噬细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RT-qPCR、生物信息学分析(Seurat、Harmony、Monocle3、CellChat、Metascape) | NA | 单细胞转录组数据、批量RNA测序数据、临床样本基因表达数据 | 整合了来自129个患者队列的公共scRNA-seq数据集,并包含临床AML样本的验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3145 | 2026-02-20 |
CXCR6 defines a distinct resident state in γδ T cells for protecting from liver cirrhosis
2025-Dec-11, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001643
PMID:41380134
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,揭示了肝脏中CD69+CXCR6+ γδ T细胞在健康状态下富集并产生IFN-γ和IL-2,但在肝硬化组织中显著减少,且其缺失与疾病严重程度相关,这些细胞通过FasL-Fas信号诱导肝星状细胞凋亡来限制纤维化进展 | 首次识别并表征了肝脏中CD69+CXCR6+ γδ T细胞作为组织驻留记忆T细胞的一个独特亚群,并证明其在肝硬化中具有保护性作用,通过FasL-Fas信号通路抑制纤维化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本的验证可能有限,且具体调控机制和临床应用潜力需进一步探索 | 探究γδ T细胞在肝纤维化发生和发展中的作用,特别是组织驻留记忆T细胞亚群的功能 | 肝脏中的γδ T细胞,特别是CD69+CXCR6+亚群,以及肝星状细胞 | 免疫学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | RNA序列数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3146 | 2026-02-20 |
Targeting tumor microenvironment with biomimetic nanovesicles for non-small cell lung cancer gene therapy
2025-Oct-01, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03684-5
PMID:41035023
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研究论文 | 本文开发了一种仿生纳米囊泡,通过靶向肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)进行非小细胞肺癌(NSCLC)的基因治疗 | 首次构建了CAF膜包被的siRNA系统,靶向CAFs中高表达的ACTN1基因,用于NSCLC治疗 | CAFs与癌细胞相互作用的精确机制仍不明确,且研究主要基于体外和体内实验,临床转化潜力待验证 | 开发一种靶向肿瘤微环境的新型基因治疗策略,以改善非小细胞肺癌的治疗效果 | 非小细胞肺癌(NSCLC)及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3147 | 2026-02-20 |
Upregulation of interferon-γ activation in patients with anti-interferon-γ autoantibodies immunodeficiency syndrome: insights from single-cell analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659383
PMID:41710026
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析了抗干扰素-γ自身抗体免疫缺陷综合征的免疫图谱,揭示了其Th1偏向、IFN-γ驱动的疾病机制 | 首次对AIGAs免疫缺陷综合征进行单细胞RNA测序分析,绘制了其免疫细胞亚群图谱,并揭示了CD4+ Tem与CD14+单核细胞间的交互作用驱动持续Th1炎症的新机制 | 样本量较小(8名患者和3名健康对照),且研究主要基于外周血单核细胞,可能未完全反映组织特异性免疫变化 | 阐明抗干扰素-γ自身抗体免疫缺陷综合征的致病机制和免疫景观 | 抗干扰素-γ自身抗体免疫缺陷综合征患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 免疫缺陷综合征 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 8名AIGAs患者(4名感染期,4名稳定期)和3名健康对照用于scRNA-seq;扩展队列包括15名患者和10名对照用于流式验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3148 | 2026-02-20 |
A novel multi-omics approach for identifying key genes in intervertebral disc degeneration
2024-12, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2024.100223
PMID:39528158
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研究论文 | 本研究采用多组学方法结合单细胞RNA测序、差异基因表达分析和孟德尔随机化,揭示了椎间盘退变的关键基因和遗传结构 | 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,识别出与椎间盘退变相关的关键调控基因SLC40A1、PTGS2和GABARAPL1,并揭示了软骨细胞的动态基因表达模式 | 研究依赖于公开可用的单细胞数据集,样本来源和数量可能有限,且未进行实验验证 | 阐明椎间盘退变的遗传结构和关键基因,为治疗提供潜在靶点 | 椎间盘退变相关的细胞类型和基因 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3149 | 2026-02-20 |
Patient-derived organoid biobank identifies epigenetic dysregulation of intestinal epithelial MHC-I as a novel mechanism in severe Crohn's Disease
2024-Aug-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332043
PMID:38857990
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研究论文 | 本研究通过构建患者来源的肠道上皮类器官生物库,揭示了克罗恩病中肠道上皮MHC-I表观遗传失调的新机制 | 首次在克罗恩病中鉴定出肠道上皮MHC-I的表观遗传调控机制,并开发了基于机器学习的疾病预后表观遗传分子标志物 | 研究样本量相对有限(168名患者),且主要基于类器官模型,需进一步在人体内验证 | 探究肠道上皮DNA甲基化在克罗恩病发病机制中的作用 | 克罗恩病、溃疡性结肠炎患者及健康对照的肠道黏膜活检样本 | 表观遗传学 | 克罗恩病 | DNA甲基化分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、基因编辑、类器官-淋巴细胞共培养、小鼠模型 | 机器学习 | 表观遗传数据、转录组数据 | 168名患者(72名克罗恩病、23名溃疡性结肠炎、73名健康对照),共生成312个肠道上皮类器官 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 3150 | 2026-02-20 |
Perivascular cells induce microglial phagocytic states and synaptic engulfment via SPP1 in mouse models of Alzheimer's disease
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01257-z
PMID:36747024
|
研究论文 | 本研究揭示了在阿尔茨海默病小鼠模型中,血管周围细胞通过分泌SPP1诱导小胶质细胞的吞噬状态并促进突触吞噬的机制 | 首次发现血管周围细胞分泌的SPP1是驱动小胶质细胞异常吞噬突触的关键信号分子,并阐明了其在AD病理中的作用机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类AD患者中得到验证 | 探究阿尔茨海默病中驱动小胶质细胞异常吞噬突触的分子信号 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的血管周围细胞、小胶质细胞和突触 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、细胞间相互作用分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3151 | 2026-02-20 |
LIM-Nebulette Reinforces Podocyte Structural Integrity by Linking Actin and Vimentin Filaments
2020-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019121261
PMID:32737144
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研究论文 | LIM-nebulette通过连接肌动蛋白和波形蛋白丝来增强足细胞结构完整性 | 揭示了LIM-nebulette在足细胞中作为多功能细胞骨架蛋白的新作用,通过主动重组黏着斑、肌动蛋白细胞骨架和中间丝来维持结构完整性 | NA | 研究足细胞结构完整性的细胞骨架机制 | 大鼠、小鼠和人类的足细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、免疫金标记、高内涵成像、超分辨率显微镜、原子力显微镜、活细胞钙成像 | NA | 图像、文本、视频 | 大鼠、小鼠和人类细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3152 | 2026-02-20 |
Integrative analyses of single-cell transcriptome and regulome using MAESTRO
2020-08-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02116-x
PMID:32767996
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研究论文 | 本文介绍了MAESTRO,一个用于整合分析单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据的开源计算工作流程 | 通过建模单细胞水平的染色质可及性来预测基因调控潜力,在整合scRNA-seq和scATAC-seq细胞聚类方面优于现有方法 | NA | 开发一个综合性的计算工作流程,用于整合分析来自多个平台的单细胞转录组和调控组数据 | 单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 3153 | 2026-02-19 |
Targeting perilipin 5 ameliorates diabetic cardiomyopathy via regulating glycolysis and mitochondrial dynamics
2026-Mar-11, Clinical science (London, England : 1979)
DOI:10.1042/CS20256032
PMID:41666343
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研究论文 | 本研究探讨了脂滴相关蛋白perilipin 5在高糖条件下如何调节糖酵解、细胞凋亡和线粒体功能,并评估其在糖尿病心肌病中的治疗潜力 | 首次系统揭示了Plin5在糖尿病心肌病中调节糖酵解和细胞凋亡的双重作用,并利用单细胞RNA测序技术明确了其在心肌细胞中的特异性表达 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,尚未在人体中进行验证;高糖条件下对成纤维细胞的作用机制仍需进一步阐明 | 探究Plin5在糖尿病心肌病发病机制中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 | AC16人心肌细胞、人心脏成纤维细胞、野生型和Plin5敲除小鼠 | 分子生物学与心血管疾病研究 | 糖尿病心肌病 | 单细胞RNA测序、分子生物学技术、心脏超声、免疫染色 | NA | 基因表达数据、影像数据、蛋白质检测数据 | 细胞系(AC16和HCFs)及小鼠模型(野生型和Plin5敲除型) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3154 | 2026-02-19 |
Mendelian randomization analysis identifies HLA-A and AP2M1 as genetic biomarkers linked to immune-endocytic crosstalk in intervertebral disc degeneration
2026-Mar, Journal of cell communication and signaling
IF:3.6Q3
DOI:10.1002/ccs3.70062
PMID:41696752
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研究论文 | 本研究通过整合转录组数据、单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,系统研究了与椎间盘退变相关的内吞作用相关基因,并确定了HLA-A和AP2M1作为潜在的生物标志物 | 首次通过整合孟德尔随机化分析、单细胞测序和功能实验,系统性地揭示了HLA-A和AP2M1在椎间盘退变中连接免疫失调与内吞功能障碍的作用 | NA | 探究内吞作用在椎间盘退变发病机制中的作用,并识别相关的遗传生物标志物 | 椎间盘退变 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 差异表达分析, 功能富集分析, 免疫浸润分析 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3155 | 2026-02-19 |
Soluble urokinase plasminogen activator receptor is a prognostic biomarker in decompensated cirrhosis
2026-Mar, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101677
PMID:41704423
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研究论文 | 本研究评估了可溶性尿激酶纤溶酶原激活物受体(suPAR)作为失代偿性肝硬化预后生物标志物的潜力 | 首次在独立队列中验证suPAR水平≥14.0 ng/ml可独立预测失代偿性肝硬化患者的90天死亡率,并通过单细胞RNA测序揭示了HBV相关肝硬化中免疫细胞PLAUR表达的增加 | 需要进一步研究阐明表达uPAR的细胞在疾病进展中的具体作用机制 | 评估suPAR作为慢性肝病预后标志物的临床价值及其在疾病进展中的作用 | 健康对照者、肝硬化患者、急性失代偿患者和慢加急性肝衰竭患者,以及小鼠模型 | NA | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据、实验室检测数据、单细胞RNA测序数据 | 推导队列178例,验证队列197例,加上小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3156 | 2026-02-19 |
Direct detection of rare circulating tumor cells in peripheral blood mononuclear cells by scRNA seq: Spike-in strategy based feasibility study
2026-Mar, The journal of liquid biopsy
DOI:10.1016/j.jlb.2026.100457
PMID:41705229
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研究论文 | 本研究评估了基于计算spike-in框架的单细胞RNA测序在检测外周血中罕见循环肿瘤细胞中的可行性和性能 | 提出了一种计算spike-in策略来评估scRNA-seq检测罕见CTC的敏感性和特异性,避免了传统富集方法的选择偏差 | 研究基于模拟数据,未在真实临床样本中验证,且仅针对宫颈癌细胞,可能不适用于其他肿瘤类型 | 评估scRNA-seq在检测外周血中罕见循环肿瘤细胞的可行性和准确性 | 外周血单核细胞和宫颈癌细胞 | 单细胞测序 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | k-means聚类 | 单细胞转录组数据 | 三个PBMC数据集(共约49,000个细胞)和宫颈癌细胞数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | Cell Ranger分析流程 |
| 3157 | 2026-02-19 |
ISL1 Restricts Progenitor Programs and Promotes β-Cell Maturation, Revealing Sex Differences in Diabetes Progression
2026-Feb-17, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db25-0673
PMID:41700921
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子ISL1在胰腺内分泌细胞命运决定和成熟中的关键作用,及其缺失如何导致糖尿病相关缺陷 | 首次通过单细胞多组学分析揭示了ISL1在抑制祖细胞程序、促进β细胞成熟中的分子机制,并发现了糖尿病进展中的性别差异 | 研究主要基于小鼠模型,人类胰岛中的验证尚需进一步研究 | 阐明ISL1转录因子在胰腺内分泌细胞发育和成熟中的分子功能 | 小鼠胰腺内分泌前体细胞和成熟胰岛细胞 | 发育生物学 | 糖尿病 | 条件性基因敲除、单细胞RNA测序、染色质分析(H3K27ac和H3K27me3) | Isl1条件性敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、表观基因组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq、染色质分析 | NA | NA |
| 3158 | 2026-02-19 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Impaired CHIP-Mediated Heat Stress Response in SCA3 Pathogenesis
2026-Feb-17, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-026-05726-x
PMID:41701293
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CHIP介导的热应激反应在SCA3发病机制中的受损作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统分析SCA3小鼠小脑的细胞应激反应失调,并发现CHIP-HSF1/DNAJB1轴在疾病进展中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证不足;CHIP过表达的长期治疗效果和安全性尚未明确 | 阐明SCA3进展的关键病理生理级联反应并确定潜在治疗靶点 | SCA3细胞模型和转基因小鼠 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,原生凝胶电泳 | NA | 单细胞转录组数据 | SCA3转基因小鼠的小脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3159 | 2026-02-19 |
ERBB2 as a Prognostic Biomarker in Prostate Cancer: Integration of Single-Cell Transcriptomics, Deep Learning, and Immunohistochemical Validation
2026-Feb-17, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-026-11333-1
PMID:41701406
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学、深度学习和免疫组化验证,揭示了ERBB2作为前列腺癌生化复发关键预后生物标志物的作用 | 首次整合单细胞转录组测序、深度学习模型构建和免疫组化验证三种方法,系统性地识别并验证了ERBB2在前列腺癌预后中的关键作用 | 未在摘要中明确说明研究的局限性,例如样本队列的规模、单细胞数据的来源或深度学习模型的可解释性等 | 识别与前列腺癌生化复发相关的关键基因,并验证其临床意义 | 前列腺癌患者,特别是与生化复发、T细胞耗竭和转移相关基因相关的患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,深度学习 | 深度学习神经网络模型 | 单细胞转录组数据,临床病理数据,免疫组化图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3160 | 2026-02-19 |
PGST: A prototype-guided parameter-efficient network for spatial transcriptomics prediction
2026-Feb-17, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3666148
PMID:41701590
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研究论文 | 本文提出了一种用于空间转录组学基因表达预测的原型引导参数高效网络PGST | 提出了PEST极性嵌入策略处理空间特异性,采用原型引导聚合保留全局共表达特征,通过共享解码器与重构损失增强全局一致性,并设计了轻量级架构 | NA | 解决现有空间转录组学基因表达预测方法在空间特异性建模、跨域共表达模式利用、噪声鲁棒性和参数效率方面的不足 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络, 对比学习 | 基因表达数据, 空间位置信息 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |