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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3141 - 3160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3141 | 2025-10-06 |
Renal Single-Cell RNA Sequencing and Digital Cytometry in Dogs with X-Linked Hereditary Nephropathy
2025-Jul-12, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15142061
PMID:40723524
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和数字细胞计数技术研究犬类X连锁遗传性肾病的肾脏细胞特征 | 首次在犬类XLHN模型中应用单细胞RNA测序技术，并利用机器学习驱动的数字细胞计数解析肾脏细胞组成变化 | 样本量较小（仅2只犬），仅使用死后肾脏皮质组织 | 探究犬类慢性肾脏病的细胞机制 | 患有X连锁遗传性肾病的犬类肾脏组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 数字细胞计数, 批量mRNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 2只犬（1只患病雄性，1只杂合子雌性），共13,190个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 3142 | 2025-10-06 |
Integrated Single-Cell Analysis Dissects Regulatory Mechanisms Underlying Tumor-Associated Macrophage Plasticity in Hepatocellular Carcinoma
2025-Jul-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16070817
PMID:40725473
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq和ATAC-seq分析，揭示肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的表观遗传异质性和调控机制 | 首次在肝细胞癌中构建了TAMs的高分辨率染色质可及性图谱，揭示了SPP1 TAMs亚型的预后意义及其表型转换的调控轨迹 | 样本量相对有限，需要更大规模队列验证发现 | 解析肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的表观遗传调控机制 | 肝细胞癌患者的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞多组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多区域分析, 伪时序分析 | 调控网络分析 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 3143 | 2025-10-06 |
Gut Microbiome Alterations in Colorectal Cancer: Mechanisms, Therapeutic Strategies, and Precision Oncology Perspectives
2025-Jul-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17142294
PMID:40723178
|
综述 | 探讨肠道微生物组改变在结直肠癌发病机制中的作用及微生物调控治疗策略 | 整合人工智能、单细胞/空间转录组学等新技术，提出微生物组衍生生物标志物用于结直肠癌精准诊疗的新视角 | 存在个体间差异性、因果推断困难和监管障碍等挑战 | 阐明肠道微生物组在结直肠癌发生发展中的作用机制及治疗策略 | 结直肠癌患者肠道微生物组 | 精准医学 | 结直肠癌 | 基因测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 人工智能 | NA | 微生物组数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3144 | 2025-10-06 |
Precision Medicine in Hematologic Malignancies: Evolving Concepts and Clinical Applications
2025-Jul-07, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13071654
PMID:40722725
|
综述 | 概述精准医学在血液系统恶性肿瘤中的基础技术、疾病特异性进展及新兴发展方向 | 系统整合分子分析技术、液体活检和微小残留病监测等工具，提出单细胞测序、空间转录组学和AI算法等新兴发展方向 | 存在成本高昂、可及性差异、标准化缺失及临床整合障碍等挑战 | 推动精准医学在血液肿瘤领域的临床转化与应用 | 急性髓系白血病、急性淋巴细胞白血病、慢性髓系白血病、慢性淋巴细胞白血病、弥漫大B细胞淋巴瘤、多发性骨髓瘤等血液恶性肿瘤 | 自然语言处理 | 血液系统恶性肿瘤 | 下一代测序(NGS)、全外显子组测序(WES)、RNA测序(RNA-seq)、表观基因组学分析、蛋白质组学分析、液体活检、单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、液体活检 | NA | NA |
| 3145 | 2025-10-06 |
Identification of Glycolysis-Related Genes in MAFLD and Their Immune Infiltration Implications: A Multi-Omics Analysis with Experimental Validation
2025-Jul-03, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13071636
PMID:40722708
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研究论文 | 本研究通过多组学分析识别了MAFLD中与糖酵解相关的关键基因，并探索了它们与免疫浸润的关系 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组数据，识别MAFLD中糖酵解相关关键基因及其与免疫浸润的相互作用 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；实验验证主要在动物模型中进行 | 识别驱动MAFLD进展的糖酵解相关关键基因，阐明其与免疫浸润的相互作用 | MAFLD患者和对照组的多组学数据，以及蛋氨酸胆碱缺乏饮食小鼠模型 | 生物信息学 | 代谢相关脂肪肝病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 机器学习 | 多种机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | MAFLD患者和对照组的多组学数据集 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3146 | 2025-10-06 |
RGCN-BA: relational graph convolutional network with batch awareness for single-cell RNA sequencing clustering
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf378
PMID:40728858
|
研究论文 | 提出一种结合批次感知的关系图卷积网络RGCN-BA，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 将细胞聚类和批次效应校正整合到统一深度学习框架中，通过关系图卷积网络处理批次信息作为不同边类型 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 开发能够同时处理单细胞RNA测序数据聚类和批次效应校正的统一方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 关系图卷积网络(RGCN) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3147 | 2025-10-06 |
Dynamic changes of synergy relationship between lncRNA and immune checkpoint in cancer progression
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf370
PMID:40728857
|
研究论文 | 本研究通过整合免疫检查点和lncRNA-mRNA相互作用数据，构建了lncRNA-免疫检查点协同网络，揭示了在癌症进展中的动态协同关系 | 首次系统性地分析了lncRNA与免疫检查点在癌症进展中的阶段特异性协同关系，并验证了其在空间转录组数据中的一致性 | 研究基于计算预测和已有数据库，需要进一步实验验证具体的分子机制 | 探索lncRNA与免疫检查点在癌症进展中的协同作用机制 | 癌症患者和相关的lncRNA-免疫检查点协同网络 | 生物信息学 | 癌症 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析，阶段特异性协同评分，空间转录组学验证 | 网络分析模型 | 基因表达数据，蛋白质相互作用数据，空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3148 | 2025-10-06 |
PU.1 regulation of type 1 dendritic cell function via NF-κB pathway in inhibition of non-small cell lung cancer progression
2025-Jul, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2024.101154
PMID:40727943
|
研究论文 | 本研究探讨转录因子PU.1通过NF-κB通路调控1型常规树突状细胞功能抑制非小细胞肺癌进展的机制 | 首次揭示PU.1通过NF-κB通路调控cDC1细胞功能在非小细胞肺癌中的抑癌作用 | 未明确说明样本数量和实验模型的具体类型 | 研究PU.1转录因子调控cDC1细胞功能及其在非小细胞肺癌治疗中的潜力 | 非小细胞肺癌组织中的1型常规树突状细胞(cDC1) | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序, CIBERSORT算法 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3149 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Unveils Key Regulators and Signaling Pathways in Lung Adenocarcinoma Progression
2025-Jun-30, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13071606
PMID:40722679
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌进展中的关键调控因子和信号通路 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘肺腺癌进展过程中上皮细胞特异性转录程序及肿瘤微环境内细胞间通讯的动态变化 | 研究基于多个患者队列但样本量有限，且未进行功能验证实验 | 解析肺腺癌进展过程中的细胞特异性转录调控机制和肿瘤微环境动态变化 | 肺腺癌患者肿瘤组织中的上皮细胞、免疫细胞和基质细胞 | 单细胞组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析、谱系轨迹分析、转录调控网络重建 | 单细胞转录组数据 | 多个肺腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3150 | 2025-10-06 |
Identification of Immune Hub Genes in Obese Postmenopausal Women Using Microarray and Single-Cell RNA Seq Data
2025-Jun-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16070783
PMID:40725440
|
研究论文 | 本研究通过整合微阵列和单细胞RNA测序数据，识别了绝经后肥胖女性脂肪组织中的免疫枢纽基因 | 首次结合WGCNA、PPI网络分析和单细胞RNA测序技术系统鉴定绝经后肥胖女性的免疫枢纽基因，并在斑马鱼模型中实验验证 | 基因名称在摘要中未完整显示，样本来源和数量信息不明确 | 阐明肥胖相关免疫失调的分子机制，寻找绝经后肥胖女性的潜在治疗靶点 | 绝经后肥胖女性的脂肪组织 | 生物信息学 | 肥胖症 | 微阵列, 单细胞RNA-seq, WGCNA, PPI分析, ssGSEA, RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 微阵列, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3151 | 2025-10-06 |
Dissecting the Cellular Heterogeneity Underlying Liver Diseases Through the Integration of GWASs and Single-Cell RNA Sequencing
2025-Jun-27, Biology
DOI:10.3390/biology14070777
PMID:40723338
|
研究论文 | 通过整合GWAS和单细胞RNA测序技术解析肝脏疾病的细胞异质性 | 首次将六种肝脏疾病的GWAS数据与约16.8万个人类肝细胞的单细胞转录组数据整合，使用scDRS方法揭示疾病相关遗传信号在非实质细胞中的特异性分布 | 研究主要关注遗传风险与细胞状态的关联，未涉及功能验证实验 | 解析肝脏疾病遗传风险的细胞特异性机制 | 人类肝脏细胞 | 生物信息学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序, GWAS | scDRS | 基因组数据, 转录组数据 | 约168,000个肝细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3152 | 2025-10-06 |
Cell-Type Annotation for scATAC-Seq Data by Integrating Chromatin Accessibility and Genome Sequence
2025-Jun-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15070938
PMID:40723810
|
研究论文 | 提出了一种整合染色质可及性和基因组序列的深度学习框架scAttG，用于单细胞ATAC测序数据的细胞类型注释 | 首次将图注意力网络和卷积神经网络结合，同时利用染色质可及性信号和基因组序列特征进行细胞类型注释 | 未明确说明模型在特定细胞类型或组织中的性能限制 | 开发更准确和稳健的单细胞ATAC测序数据细胞类型注释方法 | 单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq | GAT, CNN | 基因组序列, 染色质可及性数据 | 多个scATAC-seq数据集 | NA | single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 3153 | 2025-10-06 |
Integrating Bulk RNA and Single-Cell Sequencing Data Reveals Genes Related to Energy Metabolism and Efferocytosis in Lumbar Disc Herniation
2025-Jun-24, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13071536
PMID:40722613
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA和单细胞测序数据，识别了与腰椎间盘突出症中能量代谢和胞葬作用相关的关键基因 | 首次将能量代谢和胞葬作用相关基因整合分析，并通过机器学习方法识别出6个关键枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探索腰椎间盘突出症的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 腰椎间盘突出症患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 腰椎间盘突出症 | RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3154 | 2025-10-06 |
scQTLtools: An R/Bioconductor Package for Comprehensive Identification and Visualization of Single-Cell eQTLs
2025-Jun-23, Biology
DOI:10.3390/biology14070743
PMID:40723304
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研究论文 | 开发了一个用于单细胞eQTL分析的综合R/Bioconductor软件包 | 提供端到端的单细胞eQTL分析流程，支持多种输入格式和统计模型，能够识别细胞类型特异性调控变异 | 目前仅支持顺式eQTL分析，尚未包含反式eQTL检测功能 | 开发一个功能全面、可扩展且用户友好的单细胞eQTL分析工具 | 单细胞RNA测序数据和基因型数据 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 线性回归、泊松回归、零膨胀负二项回归 | 基因表达数据、基因型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3155 | 2025-10-06 |
Pig meniscus single-cell sequencing reveals highly active red zone chondrocyte populations involved in stemness maintenance and vascularization development
2025-Jun-18, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2400388
PMID:40722245
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研究论文 | 通过猪半月板单细胞测序揭示了具有高度活性的红区软骨细胞亚群在干细胞特性维持和血管化发育中的作用 | 首次构建猪半月板单细胞转录组图谱，发现红区特异性软骨细胞亚群具有间充质干细胞特性和血管化诱导能力 | 研究基于猪模型，虽然与人类具有可比性但仍需进一步验证 | 探索半月板细胞组成特征及红区软骨细胞的生物学功能 | 猪半月板组织 | 单细胞组学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3156 | 2025-10-06 |
Single cell transcriptomic analysis reveals transcriptome differences of different cells between eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps and non-eosinophilic chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0328241
PMID:40720416
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析比较嗜酸性和非嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉的细胞差异 | 首次在单细胞水平系统揭示两种鼻息肉亚型的细胞组成、代谢特征和免疫细胞功能差异 | 样本量较小（3例健康对照+6例患者），需更大队列验证 | 探索嗜酸性和非嗜酸性慢性鼻窦炎伴鼻息肉的发病机制差异 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者（包括嗜酸性和非嗜酸性亚型）的鼻腔组织细胞 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析、功能富集分析 | 单细胞转录组数据 | 9例样本（3健康对照+3 eCRSwNP+3 neCRSwNP） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3157 | 2025-10-06 |
Single-Cell Data and Weighted Correlation Network Analysis Revealed the Regulatory Mechanisms of Macrophages in Carotid Plaques
2025, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/jimr/9987367
PMID:40727388
|
研究论文 | 通过单细胞数据和加权基因相关网络分析揭示颈动脉斑块中巨噬细胞的调控机制 | 在单细胞水平识别影响颈动脉斑块进展的潜在生物标志物，并研究其在免疫调节、程序性细胞死亡和炎症因子调控中的作用 | NA | 探索颈动脉斑块形成机制，重点关注巨噬细胞异质性 | 颈动脉斑块中的巨噬细胞和血管平滑肌细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq, WGCNA, 随机森林, LASSO回归, qRT-PCR, Western blot, ssGSEA | 随机森林, LASSO回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3158 | 2025-10-06 |
Identifying and Diagnosing Lytic Cell Death Genes in Atherosclerosis Using Machine Learning and Bioinformatics
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S520039
PMID:40727462
|
研究论文 | 本研究结合机器学习和生物信息学方法，识别和诊断动脉粥样硬化中的裂解性细胞死亡基因 | 首次将人工神经网络模型应用于动脉粥样硬化中裂解性细胞死亡基因的诊断，并识别出CYBB作为潜在生物标志物 | 数据来源于公共数据库GEO，缺乏独立验证队列 | 研究裂解性细胞死亡在动脉粥样硬化中的作用机制和诊断价值 | 动脉粥样硬化患者基因表达数据和单细胞测序数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞测序，生物信息学分析，机器学习 | 人工神经网络(ANN) | 基因表达数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3159 | 2025-10-06 |
Roles of central nervous system resident and recruited macrophages in the brain barrier system
2026-Mar-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00986
PMID:39885670
|
综述 | 本文综述了大脑屏障系统中驻留和募集巨噬细胞的起源、发育、分子特征和功能 | 重点关注小胶质细胞和边界相关巨噬细胞，并强调单细胞测序技术的最新进展 | NA | 探讨大脑屏障系统中巨噬细胞的作用机制 | 大脑屏障系统中的巨噬细胞（包括小胶质细胞、边界相关巨噬细胞和募集巨噬细胞） | 神经免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3160 | 2025-10-06 |
A novel immunocompetent transgenic mouse model of DHF reveals Syk-mediated Th2-polarized cytokine storm as a key driver of vascular leakage
2025-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2025.2531178
PMID:40623122
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研究论文 | 本研究建立了一种新型免疫活性转基因小鼠DHF模型，揭示Syk介导的Th2极化细胞因子风暴是血管渗漏的关键驱动因素 | 首次建立具有完整先天/适应性免疫的免疫活性小鼠DHF模型，发现hTim4作为DENV-2功能性受体，揭示Syk介导的Th2极化细胞因子风暴新机制 | 研究主要基于转基因小鼠模型，人类组织验证仍需进一步扩展 | 研究登革出血热（DHF）的发病机制和血管渗漏机制 | hTim4转基因C57BL/6J小鼠模型和人类DHF组织 | 数字病理学 | 登革热 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据,空间转录组数据 | 转基因小鼠模型和人类DHF组织 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |