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当前共找到 39637 篇文献，本页显示第 3141 - 3160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3141 | 2026-04-14 |
Macrophage-associated prognostic modeling uncovers immunotherapy response mechanisms and defines HAGHL as a novel oncogenic driver in breast cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1776875
PMID:41972161
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研究论文 | 本研究基于巨噬细胞相关基因构建了一个预后模型，用于预测乳腺癌患者的生存和免疫治疗反应，并鉴定HAGHL为新的致癌驱动因子 | 首次整合多组学数据开发基于巨噬细胞相关基因的预后模型，并发现HAGHL作为乳腺癌的潜在致癌基因 | 研究主要依赖公共数据库数据，实验验证部分有限，模型需进一步外部验证 | 探究巨噬细胞相关基因在乳腺癌中的表达模式、预后价值及与免疫微环境的关系 | 乳腺癌患者样本及细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 预后模型 | RNA测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3142 | 2026-04-14 |
Tumor lactate metabolism shapes immune suppression and therapeutic resistance revealed by integrative multi-omics and digital pathology
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1797798
PMID:41972178
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和数字病理学，开发了一种深度学习框架，能够直接从常规H&E全切片图像推断肿瘤乳酸代谢状态 | 首次开发了基于常规H&E病理切片的深度学习模型来推断肿瘤乳酸代谢状态，为临床提供了一种可扩展且成本低的代谢生物标志物评估方法 | 研究中使用的乳酸相关基因特征（59个基因）可能无法完全捕获乳酸代谢的复杂性，且模型性能在不同癌症类型间存在差异 | 开发一种临床可及且低成本的方法来评估肿瘤内乳酸活性，并研究其与肿瘤免疫微环境和治疗抵抗的关系 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，空间分析，计算分析 | 深度学习框架 | 图像，基因表达数据，蛋白质表达数据 | TCGA、GEO和单细胞RNA-seq数据集中的多个队列，以及独立的SAZHU-HNSCC真实世界队列 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3143 | 2026-04-14 |
Molecular insights into CRIP1 as an immunometabolic regulator revealed by CRIP1 knockout and single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1762474
PMID:41972184
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研究论文 | 本研究通过CRIP1基因敲除小鼠模型和单细胞转录组学分析，首次系统揭示了CRIP1在免疫调节和代谢中的基本功能 | 首次全面解析CRIP1在非恶性条件下的基本生物学功能，整合了代谢调控和免疫调节的双重视角，并利用单细胞转录组学在人类样本中验证其与炎症基因表达的关系 | 研究主要基于小鼠模型和体外分析，人类样本验证仅限于单细胞转录组数据分析，缺乏直接的体内功能验证 | 阐明CRIP1在免疫代谢调控中的基本生物学功能和作用机制 | CRIP1基因敲除小鼠、野生型小鼠、健康人和牙周炎患者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 牙周炎、肝癌、急性髓系白血病、多发性骨髓瘤、黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | 基因敲除小鼠模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | CRIP1敲除和野生型小鼠的肝组织、健康人和牙周炎患者的外周血单个核细胞单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3144 | 2026-04-14 |
Correction: Mast cell marker gene signature: prognosis and immunotherapy response prediction in lung adenocarcinoma through integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1827500
PMID:41972190
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correction | 本文是对一篇关于肥大细胞标记基因特征在肺腺癌预后和免疫治疗反应预测中作用的研究文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | lung cancer | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3145 | 2026-04-14 |
Tissue-resident memory CD8 T cell diversity is spatiotemporally imprinted
2025-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08466-x
PMID:39843748
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研究论文 | 本研究探讨了小肠中组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的空间和时间印记机制 | 利用空间转录组学、小鼠模型和新型光学编码基因扰动策略，揭示了肠道结构区域化信号支持两种不同T细胞状态，并开发了计算方法来可视化细胞类型和基因表达的空间时间分布 | NA | 研究组织驻留记忆CD8 T细胞多样性的起源和机制 | 人类样本和小鼠模型中的病原体特异性CD8 T细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 单转录本分辨率分析 | NA | 转录组数据, 空间位置数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3146 | 2026-04-14 |
Cell motility influences microfluidics capturing in scRNA-seq
2025, Open research Europe
DOI:10.12688/openreseurope.19781.2
PMID:41971304
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研究论文 | 本研究探讨了微流体捕获方法在单细胞RNA测序中对运动性细胞（如鞭毛寄生虫）的适用性，并提出了一种快速冷却策略以提高封装效率 | 首次系统研究了微流体系统对运动性细胞的捕获偏差，并开发了一种通过快速冷却至0°C来降低细胞运动性、避免转录组变化的优化方法 | 研究仅针对鞭毛寄生虫在10x Genomics平台上的应用，未涵盖其他运动性细胞类型或微流体系统，且样本规模可能有限 | 优化微流体单细胞RNA测序协议，以更准确地捕获和分析运动性细胞，避免因细胞运动性导致的亚群丢失偏差 | 鞭毛寄生虫（具体物种未在摘要中明确说明） | 单细胞测序技术 | 寄生虫感染（未指定具体疾病） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium（推断，基于平台描述） | 10x Genomics微流体单细胞RNA测序平台（具体配置未详细说明） |
| 3147 | 2026-04-14 |
The periosteum provides a stromal defence against cancer invasion into the bone
2024-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07822-1
PMID:39169177
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研究论文 | 本研究揭示了骨膜通过形成基质屏障来抵御头颈部鳞状细胞癌骨侵袭的机制 | 首次证明骨膜反应是抵御癌症骨侵袭的天然防御机制，并发现HIF1α-TIMP1信号轴在此过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证相对有限 | 探究骨膜在癌症骨侵袭过程中的生理功能和分子机制 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）的骨侵袭过程 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，组织学分析，基因编辑小鼠模型 | 基因可调控小鼠模型 | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 人类HNSCC病变样本和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3148 | 2026-04-14 |
Diversity of group 1 innate lymphoid cells in human tissues
2024-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01885-y
PMID:38956380
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术研究人类组织中第1组先天淋巴样细胞（ILC1s）的多样性，揭示了不同组织中ILC1亚型的高度可变性 | 首次通过单细胞RNA测序和流式细胞术系统性地描绘了人类组织中ILC1s的多样性，并识别出肠道上皮中富含成熟的EOMES ILC1s以及其他组织中表达ZNF683的NK细胞，这些发现为理解ILC1-NK谱系在疾病中的表型和功能变化奠定了基础 | NA | 研究人类组织中第1组先天淋巴样细胞（ILC1s）的多样性和分布 | 人类组织中的第1组先天淋巴样细胞（ILC1s）和自然杀伤（NK）细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3149 | 2026-04-14 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Immunomodulatory Effects of Stem Cell Factor and Granulocyte Colony-Stimulating Factor Treatment in the Brains of Aged APP/PS1 Mice
2024-07-10, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070827
PMID:39062541
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了干细胞因子和粒细胞集落刺激因子联合治疗在老年APP/PS1小鼠大脑中的免疫调节作用 | 首次在单细胞水平上揭示了SCF+G-CSF治疗如何调节小胶质细胞和外周髓系细胞以减轻阿尔茨海默病病理 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证；样本量较小（仅使用APP/PS1小鼠） | 探究SCF+G-CSF治疗在老年阿尔茨海默病大脑中的修复机制 | 28月龄APP/PS1小鼠大脑中的CD11b细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 28月龄APP/PS1小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3150 | 2026-04-14 |
DeepIMAGER: Deeply Analyzing Gene Regulatory Networks from scRNA-seq Data
2024-06-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14070766
PMID:39062480
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DeepIMAGER的先进计算工具，通过深度学习和数据整合来推断细胞特异性基因调控网络 | DeepIMAGER采用监督学习方法，将基因对的共表达模式转化为类图像表示，并整合转录因子结合信息进行模型训练，显著提高了基因调控网络推断的准确性和鲁棒性 | NA | 开发一种能够从单细胞RNA测序数据中准确推断细胞特异性基因调控网络的工具 | 基因调控网络，涉及多种细胞类型，包括多发性骨髓瘤树突状细胞 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | scRNA-seq, ChIP-seq | 深度学习 | 图像表示（由基因对共表达模式转化而来） | 六种细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3151 | 2026-04-14 |
Exploring the Molecular Mechanism of Comorbidity of Type 2 Diabetes Mellitus and Colorectal Cancer: Insights from Bulk Omics and Single-Cell Sequencing Validation
2024-06-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060693
PMID:38927096
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研究论文 | 本研究首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，探索2型糖尿病与结直肠癌共病的共享分子机制，并识别出核心共病基因EVPL和ENTPD3作为潜在的免疫生物标志物和药物靶点 | 首次整合bulk组学和单细胞测序验证来系统揭示T2DM与CRC共病的分子机制，识别出核心共病基因EVPL和ENTPD3，并发现ENTPD3阳性的癌症相关成纤维细胞亚群具有独特的肿瘤抑制特征和免疫治疗预测价值 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏体内外实验验证；样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探索2型糖尿病与结直肠癌共病的共享分子机制和免疫学基础 | 2型糖尿病和结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, Connectivity Map, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3152 | 2026-04-14 |
Single-Nucleus RNA-Seq Reveals Spermatogonial Stem Cell Developmental Pattern in Shaziling Pigs
2024-05-21, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14060607
PMID:38927011
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了沙子岭猪睾丸中精原干细胞（SSCs）的发育模式 | 首次在沙子岭猪中应用单细胞RNA测序技术构建睾丸组织细胞发育图谱，并识别了调控SSCs自我更新和维持的潜在标记基因及信号通路 | 研究样本仅来自沙子岭猪，可能限制了结果的普适性；且未进行功能验证实验 | 探究沙子岭猪睾丸发育，特别是精原干细胞的发育模式 | 沙子岭猪睾丸组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 来自9只沙子岭猪睾丸的82,027个单细胞，覆盖三个关键出生后发育阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3153 | 2026-04-14 |
GTADC: A Graph-Based Method for Inferring Cell Spatial Distribution in Cancer Tissues
2024-04-03, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14040436
PMID:38672453
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研究论文 | 提出一种基于图深度学习的GTADC方法，用于推断癌症组织中细胞的空间分布 | 利用Silhouette分数精确捕获每种细胞类型内具有显著表达差异的基因，并引入图结构有效整合空间转录组学和单细胞测序数据的空间关系与拓扑结构 | 未明确说明方法在特定癌症类型或数据规模下的验证局限性 | 实现癌症组织中不同细胞类型空间组成的精确解析，以支持早期癌症检测与理解 | 癌症组织中的细胞空间分布与相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学（ST），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 基于图的深度学习方法（GTADC） | 空间转录组数据，单细胞基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3154 | 2026-04-14 |
Colorectal Cancer-Associated Myofibroblasts Exhibit Enhanced Angiogenin Expression and Signaling via the PLXNB2 Receptor
2024-04, The Journal of surgical research
IF:1.8Q2
DOI:10.1016/j.jss.2023.12.036
PMID:38295715
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了结直肠癌相关肌成纤维细胞中血管生成素及其受体PLXNB2表达上调，并参与肿瘤-基质细胞通讯 | 首次在人类结直肠癌组织中，利用单细胞RNA测序数据定量推断细胞间通讯网络，发现CRC相关肌成纤维细胞特异性上调血管生成素和PLXNB2受体表达 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源为公开数据库和独立数据集，但具体样本数量未明确说明 | 探究血管生成素在人类结直肠癌肿瘤微环境中细胞间通讯的作用 | 人类正常结肠组织和结直肠癌组织中的细胞，特别是肌成纤维细胞和CRC细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | CellChat | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3155 | 2026-04-14 |
SPINK1 Overexpression Correlates with Hepatocellular Carcinoma Treatment Resistance Revealed by Single Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics
2024-02-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14030265
PMID:38540686
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了SPINK1过表达与肝细胞癌治疗耐药性之间的关联 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统阐明了SPINK1在肝细胞癌治疗耐药中的作用机制，并发现其通过上调药物代谢调节因子（如CYP3A4和ABCB1）来促进耐药性 | 研究主要基于相关性分析和体外实验，缺乏体内动物模型验证SPINK1作为治疗靶点的直接疗效 | 探究SPINK1对肝细胞癌治疗耐药性的影响及其分子机制 | 肝细胞癌（HCC）细胞及患者样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 两个肝细胞癌队列的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 3156 | 2026-04-14 |
Peripheral Lymphocytes in Primary Liver Cancers: Elevated NK and CD8+ T Cells and Dysregulated Selenium Metabolism
2024-02-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom14020222
PMID:38397459
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞测序技术，探讨了原发性肝癌（HCC和ICC）对外周血淋巴细胞（PBLs）的影响，发现NK细胞和CD8+ T细胞数量升高且与复发风险相关，并揭示了硒代谢异常 | 首次系统评估原发性肝癌对外周血淋巴细胞的影响，结合单细胞测序发现CD8+ T细胞中TGFβ信号下调及硒代谢通路异常，并通过蛋白质组学验证SELENBP1和SEPP1的表达变化 | 样本来源可能有限，未详细说明具体样本量或患者队列特征，且依赖公共数据库（GEO）数据，可能影响结果普适性 | 探究原发性肝癌（HCC和ICC）对外周血淋巴细胞组成和功能的影响，并分析其与临床预后的关联 | 原发性肝癌患者（包括肝细胞癌和肝内胆管癌）及良性肝病患者的外周血淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，生物信息学分析，蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞术数据，蛋白质组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序技术 |
| 3157 | 2026-04-14 |
Transcriptomic research in atherosclerosis: Unravelling plaque phenotype and overcoming methodological challenges
2023-Dec, Journal of molecular and cellular cardiology plus
DOI:10.1016/j.jmccpl.2023.100048
PMID:39802625
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综述 | 本文综述了转录组学在动脉粥样硬化研究中的应用，重点探讨了其在揭示斑块表型、克服方法学挑战以及未来研究方向方面的价值 | 系统总结了转录组学在动脉粥样硬化斑块表型研究中的最新进展，包括单细胞测序等新技术的应用价值，并强调了研究方法标准化与多组学数据整合的重要性 | 作为综述文章，未提出新的实验数据或模型，主要基于现有文献进行总结和展望 | 探讨转录组学如何帮助理解动脉粥样硬化斑块的不同表型，并解决该领域研究方法可重复性低、缺乏标准化等挑战 | 动脉粥样硬化斑块 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 转录组测序 | 机器学习 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 3158 | 2026-04-14 |
CD73-generated extracellular adenosine promotes resolution of neutrophil-mediated tissue injury and restrains metaplasia in pancreatitis
2023-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201537R
PMID:36468677
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研究论文 | 本研究探讨了CD73通过生成细胞外腺苷在胰腺炎中促进中性粒细胞介导的组织损伤消退和抑制化生的作用 | 首次揭示了CD73在胰腺炎中通过腺苷信号通路调控中性粒细胞浸润和化生过程的具体机制，并提出了CD73增强剂作为潜在治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中得到验证；未详细探讨不同病因（如酒精性、胆源性）胰腺炎中CD73作用的异质性 | 阐明CD73在胰腺炎炎症消退和组织修复中的作用机制 | CD73基因敲除小鼠和野生型C57BL/6小鼠 | 单细胞组学 | 胰腺炎 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | CD73敲除小鼠和野生型小鼠的胰腺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3159 | 2026-04-14 |
Cerebrospinal fluid immune cells appear similar across neuropathic and non-neuropathic pain conditions
2023, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.20153.1
PMID:38707493
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研究论文 | 本研究通过分析脑脊液免疫细胞，探讨其作为神经病理性疼痛中微胶质细胞激活的替代指标的可能性 | 首次结合FACS、RNA测序和CITE测序技术，系统比较神经病理性与非神经病理性疼痛患者脑脊液免疫细胞的相似性，并挑战了脑脊液作为微胶质功能生物标志物的直接应用 | 样本量较小，且无法明确区分脑脊液蛋白质来源是循环单核细胞还是脊髓实质中的微胶质细胞 | 评估脑脊液是否可作为人类微胶质细胞激活的生物标志物，以研究神经病理性疼痛的病理机制 | 神经病理性疼痛患者（如带状疱疹后神经痛和背部手术失败后神经痛）的脑脊液免疫细胞 | NA | 神经病理性疼痛 | 荧光激活细胞分选（FACS）、RNA测序、CITE测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 包括神经病理性疼痛患者及与已发表单细胞RNA测序数据的比较，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3160 | 2026-04-14 |
Mast cell marker gene signature: prognosis and immunotherapy response prediction in lung adenocarcinoma through integrated scRNA-seq and bulk RNA-seq
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1189520
PMID:37256127
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发了一个基于肥大细胞相关基因的预后特征，用于预测肺腺癌患者的生存和免疫治疗反应 | 结合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据构建了包含九个肥大细胞相关基因的预后特征，并验证了其在预测免疫治疗反应方面的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于SYAP1基因的体外功能研究，缺乏临床样本的广泛验证 | 探究肥大细胞在肺腺癌预后和免疫治疗反应中的作用 | 肺腺癌患者和肿瘤细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个外部队列（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |