单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 31441 - 31460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 31441 | 2024-08-09 |
Global and targeted approaches to single-cell transcriptome characterization
2018-07-01, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elx025
PMID:29028866
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组表征的两种主要方法：定量逆转录PCR（RT-qPCR）和RNA测序 | 介绍了单细胞转录组分析的新方法，使得对细胞数量有限的样本（如早期胚胎细胞）和细胞群体异质性（如血液细胞或神经元）的研究成为可能 | NA | 探索单细胞转录组表征的新方法，以更好地理解细胞功能 | 单细胞转录组 | 分子生物学 | NA | RT-qPCR, RNA测序 | NA | 转录组 | 单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31442 | 2024-08-09 |
Immune cell type 'fingerprints' at the basis of outcome diversity of human infection
2018-04, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2017.09.012
PMID:29049916
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研究论文 | 本文提出利用单细胞分析技术研究人类感染结果多样性的新视角 | 利用单细胞RNA测序技术识别与宿主清除病原体能力相关的免疫细胞类型指纹 | NA | 探索感染结果多样性的原因，为治疗传染病提供新工具 | 人类感染结果的多样性及免疫细胞类型的作用 | NA | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31443 | 2024-08-09 |
Fluctuation localization imaging-based fluorescence in situ hybridization (fliFISH) for accurate detection and counting of RNA copies in single cells
2018-01-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx874
PMID:29040675
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研究论文 | 本文介绍了一种基于波动定位成像的荧光原位杂交技术（fliFISH），用于准确检测和计数单细胞中的RNA拷贝 | fliFISH技术利用可开关荧光染料的开关周期来设定真实信号和虚假信号之间的定量阈值，从而提高了smFISH技术的精确度 | NA | 开发一种新的技术以提高单细胞中RNA拷贝检测和计数的准确性 | 单细胞中的RNA拷贝 | 分子生物学 | 糖尿病 | 荧光原位杂交（FISH） | NA | 图像 | 小鼠胰岛细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31444 | 2024-08-09 |
SCPortalen: human and mouse single-cell centric database
2018-01-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx949
PMID:29045713
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研究论文 | 本文介绍了单细胞中心数据库'SCPortalen'的开发，该数据库旨在整合和标准化人类和小鼠的单细胞转录组数据，以便于比较和重用。 | SCPortalen数据库通过手动筛选和标准化元数据，以及进行质量评估和数据处理，提供了一个高质量的单细胞数据平台。 | NA | 开发一个能够整合和标准化不同来源的单细胞转录组数据的数据库，以支持研究人员对特定细胞类型或群体异质性的研究。 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据，图像文件 | 涵盖了从INSDC站点公开的人类和小鼠单细胞转录组数据集。 | NA | NA | NA | NA |
| 31445 | 2024-08-09 |
DIMM-SC: a Dirichlet mixture model for clustering droplet-based single cell transcriptomic data
2018-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btx490
PMID:29036318
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研究论文 | 本文开发了一种名为DIMM-SC的Dirichlet混合模型，用于聚类基于液滴的单细胞转录组数据 | DIMM-SC模型能够显式地建模scRNA-Seq实验中的UMI计数数据，并通过Dirichlet混合先验表征不同细胞簇之间的变异 | NA | 开发一种新的统计方法和计算工具，用于分析基于液滴的单细胞转录组数据 | 基于液滴的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 系统性硬化症 | scRNA-Seq | Dirichlet混合模型 | 转录组数据 | 数千个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31446 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals a distinct transcriptome signature of aneuploid hematopoietic cells
2017-12-21, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2017-08-803353
PMID:29030335
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自健康供体和骨髓衰竭患者的骨髓中的造血干细胞和祖细胞，以揭示非整倍体造血细胞的转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了非整倍体细胞与二倍体细胞在转录组水平上的差异，并探讨了染色体增减对细胞功能的影响 | 研究样本量有限，且仅包括健康供体和骨髓衰竭患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨非整倍体细胞在转录组水平上的特征及其对细胞功能的影响 | 健康供体和骨髓衰竭患者的骨髓中的造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | 骨髓衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 共分析了391个对照细胞和588个患者细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31447 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals developmental heterogeneity among early lymphoid progenitors
2017-12-15, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.201797105
PMID:29030486
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术揭示了早期淋巴祖细胞的发育异质性 | 本文首次识别了一个新的亚群，作为B细胞定向分化的直接前体，并揭示了B220CD117CD19NK1.1祖细胞在单细胞水平上的异质性 | NA | 研究早期淋巴祖细胞的发育异质性及其潜在的细胞分化关系 | B220CD117CD19NK1.1未定型的造血祖细胞及其亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个B220CD117CD19NK1.1祖细胞及其亚群的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31448 | 2024-08-09 |
Pathologic Stimulus Determines Lineage Commitment of Cardiac C-kit+ Cells
2017-Dec-12, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究不同病理刺激对心脏c-kit+细胞谱系分化的影响 | 首次揭示了不同病理刺激对心脏c-kit+细胞最终命运的影响，并发现p53在c-kit+细胞向心肌细胞分化中的关键作用 | 心肌细胞从c-kit+细胞形成的总体速率仍低于临床相关水平 | 探讨不同病理刺激对心脏c-kit+细胞谱系分化的影响 | 心脏c-kit+细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 心脏CD45-c-kit+细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31449 | 2024-08-09 |
Accounting for technical noise in differential expression analysis of single-cell RNA sequencing data
2017-Nov-02, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx754
PMID:29036714
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研究论文 | 本文提出了一种名为TASC的统计框架，用于在单细胞RNA测序数据中考虑细胞间的技术差异，以准确估计基因的生物学变异并检测差异表达基因 | TASC框架采用经验贝叶斯方法，通过使用外部RNA spike-ins可靠地建模细胞特异性dropout率和放大偏差，并能调整协变量以进一步消除细胞大小和细胞周期差异带来的混杂影响 | NA | 开发一种方法来调整单细胞RNA测序数据中的技术噪声，以提高差异表达分析的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据中的技术噪声和差异表达基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分层混合模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31450 | 2024-08-09 |
Single-cell gene expression analysis reveals regulators of distinct cell subpopulations among developing human neurons
2017-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.223313.117
PMID:29030469
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了发育中的人类神经元的基因表达，揭示了神经前体细胞亚型的调控机制 | 本研究采用无监督的高分辨率策略，识别细胞发育的分支点，追踪亚群的随机转录动力学，阐明调控网络，并发现关键调控因子 | NA | 揭示个体人类神经前体细胞分化为成熟神经元的随机动力学和调控机制 | 发育中的人类神经元及其神经前体细胞亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 31451 | 2024-08-09 |
powsimR: power analysis for bulk and single cell RNA-seq experiments
2017-Nov-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btx435
PMID:29036287
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研究论文 | PowsimR 是一个灵活的工具，用于模拟和评估批量及单细胞 RNA-seq 数据中的差异表达，适用于事前和事后功效分析 | PowsimR 提供了对批量和单细胞 RNA-seq 数据进行差异表达模拟和评估的功能，这在现有工具中较为少见 | NA | 优化 RNA-seq 实验设计并评估和比较检测差异表达基因的能力 | 批量和单细胞 RNA-seq 数据中的差异表达 | RNA 测序 | NA | RNA-seq | NA | RNA-seq 数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31452 | 2024-08-09 |
The Role of Chromatin Density in Cell Population Heterogeneity during Stem Cell Differentiation
2017-10-17, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-017-13731-3
PMID:29042584
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研究论文 | 本研究结合三维染色体构象（Hi-C）和单细胞RNA测序数据，通过离散随机模拟探索染色质重塑在发育过程中决定基因表达异质性的作用 | 本研究展示了染色质重塑如何通过折叠成不同的拓扑域来决定基因表达分布，并假设分化过程中局部DNA密度的增加会因染色质的拥挤效应而加剧转录爆发 | NA | 探索染色质重塑在发育过程中决定基因表达异质性的作用 | 染色质重塑和基因表达异质性 | 生物信息学 | NA | Hi-C, 单细胞RNA测序 | 离散随机模拟 | 3D构象数据, 测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31453 | 2024-08-09 |
Detecting Activated Cell Populations Using Single-Cell RNA-Seq
2017-Oct-11, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2017.09.026
PMID:29024657
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研究论文 | 本文开发了一种名为Act-seq的技术，用于检测单细胞RNA测序中的活性细胞群，并揭示了特定细胞类型的分子分类和应激反应 | Act-seq技术减少了传统细胞分离过程中人为诱导的转录扰动，能够准确检测基线转录谱和行为/经验驱动活动引起的急性转录变化 | NA | 开发新技术以准确检测单细胞RNA测序中的活性细胞群 | 特定细胞类型的分子分类和应激反应 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 31454 | 2024-08-09 |
Temporal Tracking of Microglia Activation in Neurodegeneration at Single-Cell Resolution
2017-Oct-10, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.09.039
PMID:29020624
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，追踪了在小鼠严重神经退行性模型中，与阿尔茨海默病类似表型的海马体中分离出的超过1600个单个微胶质细胞的转录组，并在多个时间点进行了分析。 | 发现了两种分子上不同的反应性微胶质细胞表型，分别以I型和II型干扰素反应基因的共调控模块为特征，并揭示了微胶质细胞对神经退行性反应的先前未观察到的异质性。 | NA | 研究微胶质细胞在神经退行性疾病中的激活过程。 | 微胶质细胞在神经退行性疾病中的反应和转录程序。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过1600个单个微胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31455 | 2024-08-09 |
SEQUENCING BRAIN CELLS
2017-10-01, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.2144/000114600
PMID:29048266
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评论 | 文章讨论了单细胞测序技术在人类大脑细胞类型分类中的应用潜力 | NA | NA | 探讨单细胞测序技术在解决人类大脑细胞类型分类挑战中的应用 | 人类大脑中的不同细胞类型 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31456 | 2024-08-09 |
Dissecting human gliomas by single-cell RNA sequencing
2018-01-10, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/nox126
PMID:29016805
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术在临床胶质瘤样本中的应用，重点介绍了RNA表达谱分析 | 提供了对胶质瘤生物学、肿瘤异质性、癌细胞谱系、癌症干细胞程序、肿瘤微环境和胶质瘤分类的新见解 | NA | 探讨单细胞分析技术在胶质瘤研究中的应用 | 人胶质瘤 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 临床胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31457 | 2024-08-09 |
Mouse embryonic stem cells can differentiate via multiple paths to the same state
2017-10-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.26945
PMID:28990928
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序比较了两种运动神经元分化协议，探讨直接编程与胚胎分化的关系。 | 发现直接编程路径在分化过程中出现了一个新的过渡状态，该状态具有特定的基因表达特征，并与标准路径最终达到相同的运动神经元状态。 | NA | 研究直接编程与胚胎分化在细胞分化过程中的关系。 | 小鼠胚胎干细胞的运动神经元分化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31458 | 2024-08-09 |
SEGtool: a specifically expressed gene detection tool and applications in human tissue and single-cell sequencing data
2018-11-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbx074
PMID:28981576
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SEGtool的工具，用于从RNA测序数据中自动和自适应地检测特定表达基因（SEGs） | SEGtool基于模糊c均值、Jaccard指数和贪婪退火方法，能够忽略数据分布，优于主要为微阵列数据开发的现有工具 | NA | 研究特定表达基因的识别，以探索基因功能、生物发育、疾病机制和生物标志物的发现 | 人类组织和单细胞测序数据中的特定表达基因 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 模糊c均值、Jaccard指数、贪婪退火方法 | RNA-seq数据、单细胞测序数据 | 在Genotype-Tissue Expression (GTEx)人类组织数据集中检测到3181个SEGs，以及在胚胎细胞的单细胞测序数据中识别出多个SEGs | NA | NA | NA | NA |
| 31459 | 2024-08-09 |
VDJdb: a curated database of T-cell receptor sequences with known antigen specificity
2018-01-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx760
PMID:28977646
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研究论文 | 本文介绍了VDJdb数据库，该数据库收集并整合了已知抗原特异性的T细胞受体序列，为T细胞受体谱数据注释提供了一个通用平台 | VDJdb数据库整合了已发表的T细胞特异性检测结果，将抗原特异性与T细胞受体序列相结合，为T细胞受体谱数据注释提供了一个多功能工具 | NA | 旨在解码T细胞受体基因序列中包含的抗原特异性，以加深对适应性免疫系统的理解，并推动转化医学领域的发展 | T细胞受体序列及其抗原特异性 | 生物信息学 | NA | 免疫谱系测序技术（RepSeq），单细胞RNA测序技术 | NA | 序列数据 | 大量从供体样本中获得的T细胞受体序列 | NA | NA | NA | NA |
| 31460 | 2024-08-09 |
Functional genomics of stromal cells in chronic inflammatory diseases
2018-Jan, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000000455
PMID:28984647
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综述 | 本文综述了利用功能基因组学和单细胞技术研究慢性炎症疾病中基质细胞的最新进展 | 采用高维策略如mRNA测序、质谱流式细胞术和荧光激活细胞分选，提供了对类风湿关节炎、炎症性肠病和癌症中病变组织的详细视图 | NA | 探讨基质细胞在慢性炎症疾病中的功能和病理作用 | 基质细胞，包括成纤维细胞、内皮细胞、周细胞和间充质前体细胞 | 功能基因组学 | 炎症性疾病 | mRNA测序、质谱流式细胞术、荧光激活细胞分选 | NA | 单细胞RNA-seq | 大量患者组织样本 | NA | NA | NA | NA |