单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 31421 - 31440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 31421 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic analysis of oligodendrocyte lineage cells
2017-12, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2017.10.005
PMID:29126015
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在揭示少突胶质细胞系细胞异质性方面的最新进展 | 提出少突胶质细胞及其前体细胞在中枢神经系统中具有不同的形态和区域功能差异，并涉及其他功能过程如与轴突的代谢耦合 | NA | 探讨少突胶质细胞系细胞的异质性及其与功能状态的关系 | 少突胶质细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31422 | 2024-08-09 |
Simultaneous enumeration of cancer and immune cell types from bulk tumor gene expression data
2017-11-13, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.26476
PMID:29130882
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研究论文 | 本文提出了一种高效算法，用于从大量肿瘤基因表达数据中同时估计癌症和免疫细胞类型的比例 | 该方法整合了来自肿瘤中主要非恶性细胞类型的新型基因表达谱，基于细胞类型特异性mRNA含量的重整化，并能够考虑未表征和可能高度可变的细胞类型 | NA | 提高从肿瘤基因表达数据中预测细胞绝对比例的准确性和范围 | 癌症和免疫细胞类型的比例 | 生物信息学 | 皮肤癌，结直肠癌 | 基因表达分析 | 算法 | 基因表达数据 | 人类黑色素瘤和结直肠肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31423 | 2024-08-09 |
Characteristics of allelic gene expression in human brain cells from single-cell RNA-seq data analysis
2017-Nov-10, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-017-4261-x
PMID:29126398
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研究论文 | 本研究重新分析了先前发表的来自多个尸检人脑的单细胞RNA测序数据集，观察到个体细胞中普遍存在单等位基因表达，主要以随机方式进行 | 首次在单细胞和全基因组水平上研究人类脑细胞中的单等位基因表达，并发现许多脑细胞类型特异性的单等位基因表达基因 | NA | 探讨人类脑细胞中单等位基因表达的普遍性及其在细胞身份和神经多样性中的作用 | 人类脑细胞中的单等位基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个尸检人脑的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 31424 | 2024-08-09 |
Phylogenomic analysis of Balantidium ctenopharyngodoni (Ciliophora, Litostomatea) based on single-cell transcriptome sequencing
2017, Parasite (Paris, France)
DOI:10.1051/parasite/2017043
PMID:29134943
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，对来自草鱼后肠的Balantidium ctenopharyngodoni进行了转录组数据分析，并基于超矩阵和SSU rDNA进行了系统发生分析 | 首次为Trichostomatia亚纲的Balantidium ctenopharyngodoni提供了omics数据，并为纤毛虫的系统发生分析及相关omics分析提供了良好的基础 | NA | 揭示六种纤毛虫类群（Colpodea、Oligohymenophorea、Litostomatea、Spirotrichea、Heterotrichea和Protocruziida）之间的进化关系 | Balantidium ctenopharyngodoni的转录组数据 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 来自草鱼后肠的Balantidium ctenopharyngodoni样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31425 | 2024-08-09 |
Application of single-cell sequencing in human cancer
2018-07-01, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elx036
PMID:29106464
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在人类癌症研究中的应用，并讨论了该领域当前面临的挑战 | 单细胞测序技术能够揭示肿瘤内部的细胞异质性，有助于识别影响临床结果的关键分子特性 | 单细胞测序技术在实验室中的应用仍面临一些挑战，包括数据分析的复杂性和成本问题 | 探讨单细胞测序技术在精准医学中的应用，以提供基于个体分子表型的靶向治疗 | 人类癌症细胞的分子表型和异质性 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 大量细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31426 | 2024-08-09 |
Constructing cell lineages from single-cell transcriptomes
2018-02, Molecular aspects of medicine
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.mam.2017.10.004
PMID:29107741
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研究论文 | 本文比较和对比了现有的计算方法，并展示了如何应用这些方法从大规模并行RNA单细胞测序数据中构建小鼠髓系祖细胞谱系 | 本文开发了计算算法来推断细胞类型之间的谱系关系，并构建沿着细胞重新排序的发展轨迹，以最大化连续细胞对之间的相似性 | NA | 揭示细胞分化过程中存在的细胞异质性水平，并构建细胞谱系 | 小鼠髓系祖细胞的谱系关系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算算法 | 转录组数据 | 大规模并行RNA单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 31427 | 2024-08-09 |
IRF3 and type I interferons fuel a fatal response to myocardial infarction
2017-Dec, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/nm.4428
PMID:29106401
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研究论文 | 研究揭示了心肌梗死（MI）中IRF3和I型干扰素通过激活炎症反应导致致命后果的机制 | 首次展示了心肌梗死后，缺血细胞死亡和细胞碎片被巨噬细胞摄取激活IRF3和I型干扰素产生的过程，并发现这一机制在心肌梗死后的炎症反应中起关键作用 | 研究主要在老鼠模型上进行，需要进一步在人类中验证这些发现 | 探讨心肌梗死后的炎症反应机制及其潜在的治疗靶点 | 心肌梗死后的炎症反应及其分子驱动因素 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 4215个从梗死和非梗死心脏分离的白细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31428 | 2024-08-09 |
Raman-Activated Droplet Sorting (RADS) for Label-Free High-Throughput Screening of Microalgal Single-Cells
2017-11-21, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.7b03884
PMID:29099582
|
研究论文 | 本文介绍了一种集成化的拉曼激活液滴分选（RADS）微流控系统，用于无标记和高通量地筛选活细胞 | 该系统通过使用AXT合成的工业微藻Haematococcus pluvialis作为模型，实现了比现有RACS系统更高的吞吐量，并保持了细胞的活力 | NA | 开发一种无标记和高通量的活细胞筛选方法 | 工业微藻Haematococcus pluvialis的单细胞 | 微流控技术 | NA | 拉曼微光谱分析 | NA | 细胞 | 混合了不同AXT水平的Haematococcus pluvialis细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31429 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals a signature of sexual commitment in malaria parasites
2017-11-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature24280
PMID:29094698
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，揭示了疟原虫在性分化过程中的转录变化特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术，分析了AP2-G调控的性分化相关基因表达变化 | 研究仅限于特定的AP2-G敲降株系和NF54野生型疟原虫，可能不适用于所有疟原虫株系 | 探究疟原虫性分化过程中的转录调控机制 | 疟原虫的性分化过程及其相关基因表达 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 超过18,000个单个疟原虫转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 31430 | 2024-08-09 |
Inferring Relevant Cell Types for Complex Traits by Using Single-Cell Gene Expression
2017-Nov-02, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2017.09.009
PMID:29106824
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为RolyPoly的回归型多基因模型，用于从全基因组关联研究（GWAS）汇总统计数据和基因表达数据中优先考虑与复杂性状相关的细胞类型和基因 | RolyPoly模型能够利用来自批量组织或单细胞RNA测序的表达数据，为理解常见变异对复杂性状贡献细胞类型的影响提供了一个强大的框架 | 以往研究受限于难以表征或稀有细胞群体的功能注释缺乏，导致细胞分辨率受限 | 解决单细胞RNA测序与感兴趣表型之间联系的不足 | 复杂性状相关的细胞类型和基因 | 基因组学 | 阿尔茨海默病，精神分裂症 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | 回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31431 | 2024-08-09 |
Combating subclonal evolution of resistant cancer phenotypes
2017-11-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-01174-3
PMID:29093439
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研究论文 | 本研究追踪了四种乳腺癌在多年治疗过程中的遗传和表型亚克隆进化，以更好地理解乳腺癌如何变得耐药 | 通过批量和单细胞RNA测序揭示了治疗后恶性表型的获得，包括增强的间质和生长因子信号传导，这可能促进耐药性，以及减少的抗原呈递和TNF-α信号传导，这可能使免疫系统逃避 | 研究仅追踪了四种乳腺癌样本，可能无法完全代表所有乳腺癌的耐药性进化情况 | 理解乳腺癌如何通过亚克隆进化变得耐药，并探索针对性的治疗策略 | 乳腺癌的遗传和表型亚克隆进化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 四种乳腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31432 | 2024-08-09 |
The trajectory of microbial single-cell sequencing
2017-Oct-31, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4469
PMID:29088131
|
综述 | 本文综述了过去十年中微生物单细胞测序技术的发展及其在微生物群落研究中的应用 | 强调了单细胞基因组学相对于宏基因组学的新优势，并展示了其在细菌和古菌生命基因组树中的新发现 | NA | 探讨单细胞基因组测序的技术方面和挑战，并讨论其启发的科学研究 | 微生物单细胞的基因组 | 基因组学 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组数据 | 从深海热液喷口到昆虫肠道等各种环境样本中的单个微生物细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31433 | 2024-08-09 |
A Targetable EGFR-Dependent Tumor-Initiating Program in Breast Cancer
2017-Oct-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.10.015
PMID:29091754
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研究论文 | 本文通过筛选三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型（PDXs），识别出对EGFR抑制剂吉非替尼有反应的亚群，并利用单细胞RNA测序深入分析了这些细胞的生物学特征 | 发现EGFR表达升高的间质/干细胞样细胞簇在响应EGFR抑制剂的亚群中显著富集，并揭示了EGFR依赖的肿瘤扩展和状态转换机制 | NA | 研究EGFR依赖的肿瘤启动程序在乳腺癌中的作用及其对治疗反应的影响 | 三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型中的EGFR表达亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 3,500个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 31434 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis of Infiltrating Neoplastic Cells at the Migrating Front of Human Glioblastoma
2017-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.10.030
PMID:29091775
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人胶质母细胞瘤浸润性肿瘤细胞的基因表达特征 | 首次在单细胞水平上揭示了胶质母细胞瘤细胞在肿瘤核心及周边区域的基因表达差异，并识别出浸润性肿瘤细胞的共同基因特征 | 研究样本仅限于四名患者，可能影响结果的普遍性 | 探究胶质母细胞瘤细胞的基因表达特征及其在肿瘤形成和迁移中的作用 | 人胶质母细胞瘤的浸润性肿瘤细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3,589个细胞，来自四名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 31435 | 2024-08-09 |
SFRP2/DPP4 and FMO1/LSP1 Define Major Fibroblast Populations in Human Skin
2018-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2017.09.045
PMID:29080679
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析正常人皮肤中的不同成纤维细胞群体 | 发现了两个主要的成纤维细胞群体，分别由SFRP2和FMO1基因定义，并进一步定义了每个群体内的亚群 | NA | 探索人皮肤中不同成纤维细胞群体的特征 | 人皮肤中的成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个皮肤活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31436 | 2024-08-09 |
Polysome-profiling in small tissue samples
2018-01-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx940
PMID:29069469
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研究论文 | 本文优化了一种非线性蔗糖梯度方法，用于在小组织样本中富集高效翻译的mRNA，减少了样本处理量，并结合smart-seq2单细胞RNA测序技术，实现了小组织样本的翻译组分析。 | 提出了一种优化的非线性蔗糖梯度方法，减少了样本处理量，适用于大规模研究设计、原代细胞和生物库中收集的冷冻组织样本。 | NA | 优化polysome-profiling技术，使其适用于小组织样本和大规模实验设计。 | 小组织样本中的高效翻译mRNA。 | NA | NA | polysome-profiling, smart-seq2单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31437 | 2024-08-09 |
Neuromedin B Expression Defines the Mouse Retrotrapezoid Nucleus
2017-11-29, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2055-17.2017
PMID:29066557
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研究论文 | 本文通过多重杂交和单细胞RNA测序技术，研究了小鼠延髓旁面部区域的RTN神经元的表型多样性，发现Neuromedin B mRNA可以作为RTN神经元的单一特异性标记物。 | 本文首次证明了Neuromedin B mRNA可以作为小鼠RTN神经元的单一特异性标记物，并揭示了RTN神经元的表型多样性。 | 本文主要集中在小鼠模型上，未涉及其他物种，且对于高表达Neuromedin B mRNA的RTN神经元的功能尚未明确。 | 研究小鼠RTN神经元的表型多样性及其特异性标记物。 | 小鼠RTN神经元及其表型多样性。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，多重杂交 | NA | RNA | 雄性和雌性小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 31438 | 2024-08-09 |
Cardiovascular homeostasis dependence on MICU2, a regulatory subunit of the mitochondrial calcium uniporter
2017-10-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1711303114
PMID:29073106
|
研究论文 | 本研究通过比较人类和小鼠心血管病理学中的转录组特征，发现MICU2（线粒体钙单向转运体复合物的调节亚单位）表达升高，并通过产生和表征MICU2突变小鼠，探讨其对心脏保护作用的影响。 | 本研究揭示了MICU2在调节血管紧张素II介导的高血压反应中的新作用，对保护腹主动脉免受损伤至关重要。 | NA | 探讨MICU2表达在心血管疾病中的保护作用及其机制。 | 人类和小鼠的心血管病理学转录组特征及MICU2突变小鼠的心脏功能。 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA测序（RNA-seq） | NA | 转录组数据 | MICU2突变小鼠和野生型小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 31439 | 2024-08-09 |
Transcriptomic correlates of neuron electrophysiological diversity
2017-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1005814
PMID:29069078
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研究论文 | 本文通过整合池化和单细胞转录组学与细胞内电生理学，研究了基因表达与神经元电生理多样性之间的关系 | 本文首次编译了包含34种神经元类型的脑部数据集，并识别了420个与生理参数变异性显著相关的基因，这些发现有助于理解神经元功能多样性的生成机制 | 本文的研究主要基于公开可获取的数据，且模型预测能力需要在更多不同类型的细胞中进一步验证 | 探讨神经元多样性如何从复杂的基因表达模式中产生 | 神经元的基因表达与电生理特性 | 神经科学 | NA | 转录组学、电生理学 | 统计模型 | 基因表达数据、电生理数据 | 34种神经元类型，12种视觉皮层细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 31440 | 2024-08-09 |
Recent Advances in the Systems Biology of Aging
2018-10-01, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2017.7367
PMID:29020802
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综述 | 本文综述了系统生物学在衰老研究中的最新进展，特别是通过饮食限制、神经退行性疾病和衰老生物标志物的研究 | 介绍了新的技术如单细胞测序、超越甲基化的表观遗传学进展以及多组学网络研究，这些技术扩展了系统生物学家的研究范围 | 尽管系统生物学方法取得了进展，但仍不完全理解影响衰老的个体基因和通路 | 旨在通过系统生物学方法深化对衰老机制的理解，并探索可能的干预措施以延缓与年龄相关的疾病 | 衰老的基本生物学机制，特别是通过饮食限制、神经退行性疾病和衰老生物标志物的研究 | 系统生物学 | 衰老 | 单细胞测序、高通量测序的转座酶可及染色质分析、多组学网络研究 | NA | 基因组数据、表观遗传数据 | NA | NA | NA | NA | NA |